Cre-loxP、CRISPR-Cas9技术与病毒载体在基因敲除中的联用[业界研究]
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cre-loxp系统在大脑特定区域进行基因敲除的原理Cre-loxp系统是一种常用的基因敲除技术,用于特定区域的基因敲除。
该系统是通过两种转基因技术相互配合实现的,即Cre重组酶和loxp位点。
Cre重组酶是一种由细菌噬菌体产生的酶,能够识别和剪切含有loxp位点的DNA序列,从而实现特定区域的基因敲除。
Cre-loxp系统的原理如下:1. Cre重组酶的表达:首先,使用基因工程技术将Cre酶的编码基因嵌入到转基因小鼠的基因组中,使其能够在特定的组织或细胞类型中产生。
通过引入特定的启动子或组织特异性表达的促进子,可以实现Cre重组酶在目标组织或细胞中的表达。
2. 基因敲除载体:在目标基因的启动子或内含子区域,插入一对loxp位点。
loxp位点是一种特殊的DNA序列,约有34个碱基对,呈倒向重复,用于诱导Cre重组酶的作用。
3. Cre重组酶的介导:一旦Cre重组酶在目标组织或细胞中表达,它能够识别和结合含有loxp位点的DNA序列,并结合在loxp位点上。
Cre重组酶在loxp位点间发生酶活性,通过识别和切割这两个loxp位点间的DNA链,将目标基因位点裂解。
4. 基因敲除效应:一旦目标基因位点被裂解,无法继续正常转录和翻译,从而导致目标基因的敲除。
这样,就实现了在特定区域的基因敲除。
Cre-loxp系统具有以下特点和优点:1. 灵活性:Cre-loxp系统可以在不同的组织或细胞类型中实现基因敲除,由于Cre重组酶的表达是由特定启动子或组织特异性表达的促进子控制的,因此可以实现组织或细胞特定的基因敲除。
2. 高效性:Cre重组酶的催化作用很高效,能够在较短的时间内进行特定区域的基因敲除。
3. 精确性:Cre重组酶只能识别和剪切含有完整loxp位点序列的DNA链,因此能够实现精确的目标基因敲除,而不会对其他基因产生影响。
4. 可逆性:如果需要在特定的时期或特定的组织中恢复目标基因的表达,只需停止Cre重组酶的表达即可。
Creloxp重组系统介导转基因绒山羊标记基因删除的研究的开题报告一、研究背景和意义转基因绒山羊是一种非常有价值的动物模型,可以用于生物医学研究、基因功能分析等方面。
然而,随着生物医学研究的发展,越来越多的功能基因被发现,需要进行进一步的研究。
这些基因的研究需要建立相应的转基因绒山羊模型,但由于现有的转基因技术都存在一定的局限性,因此需要寻找新的方法来改进这一情况。
Cre-loxP重组系统是一种高效、原理简单的基因编辑技术,具有精准、可控、快速等特点,被广泛应用于哺乳动物基因工程技术中。
利用Cre-loxP重组技术可以实现基因敲除、替换等功能,为研究基因在细胞、组织、器官、器系等不同层次的生理和病理调节机制提供了强有力的工具。
二、研究内容和方法本研究将利用Cre-loxP重组技术对绒山羊进行基因敲除,主要包括以下内容:1. 构建ploxP -neomycin-loxP质粒首先设计、合成ploxP -neomycin-loxP质粒,并纯化得到高质量的DNA。
此质粒在Cre-loxP重组系统中起到重要的作用,是实现基因敲除的关键。
2. 优化Cre-loxP重组体系Cre-loxP重组体系是实现基因敲除的基础,需要建立一个高效、稳定、可重复的体系,才能实现对绒山羊基因的准确编辑。
优化Cre-loxP 重组体系,包括传递Cre重组酶,优化重组载体构建等方面。
3. 运用Cre-loxP重组技术敲除绒山羊标记基因选定目标基因进行敲除后,将构建好的质粒ploxP -neomycin-loxP导入到绒山羊胚胎细胞中,然后通过Cre酶介导基因重组,实现对目标基因的敲除。
随后利用PCR、Western印迹和T7E1等技术验证敲除效果。
三、预期结果本研究的预期结果包括:1. 成功构建Cre-loxP重组体系,实现对绒山羊基因的敲除。
2. 验证基因敲除效果,明确目标基因在绒山羊生长发育、健康状态等方面的影响。
3. 探究Cre-loxP重组体系的优缺点,为之后的研究提供参考。
基于CRISPRCas9技术的基因敲入敲除策略一、本文概述随着生物科技的飞速发展,基因编辑技术已成为现代生物医学研究的重要工具。
其中,CRISPR-Cas9技术以其高效、精确的特性,在基因敲入敲除策略中展现出了巨大的潜力。
本文旨在全面介绍基于CRISPR-Cas9技术的基因敲入敲除策略,包括其原理、应用、优缺点以及未来的发展趋势。
通过对这一技术的深入剖析,我们期望为科研人员提供一个清晰、全面的视角,以更好地理解和应用CRISPR-Cas9技术,推动生物医学领域的研究进展。
二、CRISPR-Cas9技术的基本原理CRISPR-Cas9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats-CRISPR associated protein 9)技术是一种强大的基因编辑工具,它源自细菌的自然防御机制,即CRISPR系统。
这一系统允许细菌存储并记忆过去遭遇过的病毒DNA片段,以便在未来遇到相同病毒时,能够识别并切割这些病毒DNA,从而抵抗病毒感染。
CRISPR-Cas9系统通过这一机制被改造为一种精确的基因编辑工具,用于在真核细胞(如人类细胞)中进行基因敲除和敲入操作。
CRISPR-Cas9技术的基本原理可以分为三个主要步骤:目标识别、DNA切割和修复。
一个由RNA和Cas9蛋白组成的复合物被设计用来识别特定的DNA序列。
这个RNA分子,通常被称为单链导向RNA(sgRNA),能够与Cas9蛋白结合,并指导Cas9蛋白在目标DNA序列上定位。
sgRNA的设计是关键,它必须能够准确地与目标DNA序列配对,以确保Cas9蛋白能够在正确的位置进行切割。
一旦Cas9蛋白在目标DNA序列上定位,它就会切割DNA双链,产生一个双链断裂(DSB)。
细胞对DSB的修复机制有两种主要方式:非同源末端连接(NHEJ)和同源重组(HR)。
NHEJ是一种错误易发的修复方式,它通常会导致DNA序列的插入、删除或替换,从而导致基因功能的丧失,这种机制常被用于基因敲除。
条件性基因敲除的基本原理Cre/loxP重组系统条件性基因敲除的基本原理 Cre / loxP 重组系统条件性基因敲除主要是通过Cre/10xP或者Ftp/FRT重组系统来实现的。
这两个系统都是位点特异性重组酶系统,已发展成为在体内、外进行遗传操作的有力工具。
这两个系统的应用,可以使靶基因的表达或缺失发生在试验动物发育的某一阶段或某一特定的组织器官。
此外,若与控制Cre或Flp表达的其他诱导系统相结合,还可以对某一基因同时实现时空两方面的调控。
1.Cre/loxP系统的原理Cre/loxP系统来源于F1噬菌体,可以介导位点特异的DNA重组。
该系统含有两种成分:①一段长34bp的DNA序列,含有两个13 bp的反向重复序列和一个8 bp的核心序列。
这段34bp序列是重组酶识别的位点,被称为loxP位点(10cus of X―over in P1)。
②Cre重组酶(cyclizationrecombination),它是一种由343个氨基酸组成的单体蛋白,可以引发loxP位点的DNA重组。
任何序列的DNA,当其位于两个loxP位点之间的时候,在Cre重组酶的作用下要么被缺失(两个loxP位点的方向相同),要么方向发生倒转(两loxP位点的方向相反),如图所示。
Cre/loxP系统的作用机制2.Cre/loxP系统优点Cre/10xP系统之所以在基因敲除中获得了非常广泛的应用,是由该系统的诸多优点决定的:①Cre重组酶与具有loxP位点的DNA片断形成复合物后,可以提供足够的能量引发之后的DNA重组过程,因此该系统不需要细胞或者生物体提供其他的辅助因子;②loxP位点是一段较短的DNA序列,因此非常容易合成;③Cre重组酶是一种比较稳定的蛋白质,因此可以在生物体不同的组织、不同的生理条件下发挥作用;④Cre重组酶的编码基因可以置于任何一种启动子的调控之下,从而使这种重组酶在生物体不同的细胞、组织、器官,以及不同的发育阶段或不同的生理条件下产生,进而发挥作用,这一点也是该系统在应用过程中最为重要的一点。
《利用CRISPR-Cas9系统构建DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞系》篇一一、引言在生物学研究中,基因敲除是一种重要的技术手段,能够精确地操控特定基因的表达,进而研究基因在生物体中的功能。
近年来,随着基因编辑技术的发展,尤其是CRISPR-Cas9系统的广泛应用,基因敲除技术得到了极大的推进。
本文旨在探讨利用CRISPR-Cas9系统构建DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞系的方法和步骤,为进一步研究DUSP9基因的功能提供技术支持。
二、CRISPR-Cas9系统简介CRISPR-Cas9系统是一种基于细菌免疫系统的基因编辑技术,具有高效、精确的基因编辑能力。
该系统通过设计特定的RNA 引导序列与Cas9蛋白结合,形成复合物,识别并切割靶点DNA 序列,从而实现基因的敲入、敲除或替换等操作。
三、DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞系的构建1. 靶点设计:首先需要确定DUSP9基因的敲除靶点,设计相应的sgRNA和Cas9蛋白序列。
通过分析DUSP9基因的序列,找到合适的位置作为靶点。
2. 胚胎干细胞系的获取:选取适合的小鼠胚胎干细胞系,确保其处于稳定的生长状态。
3. CRISPR-Cas9系统介导的基因编辑:将设计好的sgRNA和Cas9蛋白通过特定的方式(如质粒转染、病毒载体等)引入小鼠胚胎干细胞中。
在细胞内,sgRNA和Cas9蛋白形成复合物,识别并切割DUSP9基因的靶点。
4. 克隆筛选和鉴定:经过一段时间的培养和筛选,挑选出发生基因突变的小鼠胚胎干细胞克隆。
通过PCR、测序等分子生物学手段,鉴定克隆中DUSP9基因的敲除情况。
5. 细胞系建立:将鉴定成功的DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞进行传代培养,建立稳定的细胞系。
四、实验结果与讨论通过上述步骤,我们成功构建了DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞系。
在实验过程中,我们观察到CRISPR-Cas9系统对DUSP9基因的切割效率较高,成功获得了多株基因敲除克隆。
条件性基因敲除的“时空开关”——Cre-loxP系统介绍基因敲除小鼠是我们研究基因功能必不可少的利器,主要分为全身性基因敲除和条件性基因敲除。
然而,全身性基因敲除的小鼠存在着无法忽视的缺陷,例如:不能特异性地研究特定基因在特定组织内(及特定的时间)的功能;全身性基因敲除小鼠有时因某些基因对胚胎发育的影响而无法正常分娩;或因出生后严重的生理缺陷而过早死亡;或不能产生后代而不能获得纯合子动物模型。
因此,条件性基因敲除小鼠虽然有周期长、费用高、需要配合特定工具鼠使用等劣势,但仍获得了越来越多的选择与喜爱。
今天,就和大家一起来了解下条件性基因敲除方法必用的Cre-loxP重组系统以及应用Cre-loxP进行条件性基因敲除的原则。
概述Cre-loxP重组系统,即对一段特定的DNA序列进行定位并用Cre 重组酶对其进行剪接,由Cre重组酶和loxP位点两部分组成。
其中Cre蛋白,最初由“导致重组(Cause recombination)”命名,也有文献命名为“环化重组酶(Cyclizationrecombinase)”。
Cre重组酶(CyclizationRecombination Enzyme)由大肠杆菌噬菌体P1的Cre基因编码,是由343个氨基酸组成的38kD的蛋白质。
它不仅具有催化活性,而且与限制酶相似,能够特异性识别loxP位点, 从而重组或删除loxP片段间的基因。
loxP(Locus Of X-over P1)是P1噬菌体基因组中34bp的特殊位点序列,包括两个13bp的反向重复序列和一个8bp的间隔区域。
其中,反向重复序列是Cre重组酶的特异识别位点,而间隔区域决定了loxP位点的方向,间隔区中的“N”代表这个碱基是可变的:发展历史1985年,R H Hoess, K AbremskiCre-Lox首次发表了大肠杆菌噬菌体P1的Cre-lox位点特异性重组系统的断裂和交换机制文章。
1987年,Brian Sauer博士把大肠杆菌噬菌体P1的Cre-lox位点特异性重组系统在酿酒酵母中即真核系统中进行了功能表达,提出了Cre介导的位点特异性重组可能是调节真核生物基因组重排的有用工具的预想。