毕赤酵母电转化
- 格式:doc
- 大小:28.00 KB
- 文档页数:1
版权声明:本站几乎所有资源均搜集于网络,仅供学习参考,不得进行任何商业用途,否则产生的一切后 果将由使用者本人承担! 本站仅仅提供一个观摩学习与交流的平台, 将不保证所提供资源的完 整性,也不对任何资源负法律责任。
所有资源请在下载后 24 小时内删除。
如果您觉得满意, 请购买正版,以便更好支持您所喜欢的软件或书籍!☆☆☆☆☆生物秀[]☆☆☆☆☆中国生物科学论坛[/bbs/]☆☆☆☆☆生物秀下载频道[/Soft/]生物秀——倾力打造最大最专业的生物资源下载平台!■■■ 选择生物秀,我秀我精彩!!■■■欢迎到生物秀论坛(中国生物科学论坛)的相关资源、软件版块参与讨论,共享您的资源,获 取更多资源或帮助。
毕赤酵母多拷贝表达载体试剂盒用于在含多拷贝基因的毕赤酵母菌中表达并分离重组蛋白综述:基本特征:作为真核生物,毕赤酵母具有高等真核表达系统的许多优点:如蛋白加工、折叠、翻译后修饰等。
不仅如此,操作时与E.coli及酿酒酵母同样简单。
它比杆状病毒或哺乳动物组织培养等其它真核表达系统更快捷、简单、廉价,且表达水平更高。
同为酵母,毕赤酵母具有与酿酒酵母相似的分子及遗传操作优点,且它的外源蛋白表达水平是后者的十倍以至百倍。
这些使得毕赤酵母成为非常有用的蛋白表达系统。
与酿酒酵母相似技术:许多技术可以通用:互补转化基因置换基因破坏另外,在酿酒酵母中应用的术语也可用于毕赤酵母。
例如:HIS4基因都编码组氨酸脱氢酶;两者中基因产物有交叉互补;酿酒酵母中的一些野生型基因与毕赤酵母中的突变基因相互补,如HIS4、LEU2、ARG4、TR11、URA3等基因在毕赤酵母中都有各自相互补的突变基因。
毕赤酵母是甲醇营养型酵母:毕赤酵母是甲醇营养型酵母,可利用甲醇作为其唯一碳源。
甲醇代谢的第一步是:醇氧化酶利用氧分子将甲醇氧化为甲醛,还有过氧化氢。
为避免过氧化氢的毒性,甲醛代谢主要在一个特殊的细胞器-过氧化物酶体-里进行,使得有毒的副产物远离细胞其余组分。
毕赤酵母表达知识归纳1a.配制500×BIOTIN stock solution(0.02%)有这么3种方案:1、懒人是将Biotin直接溶在去离子水中,放过夜,基本就能溶;2、急性子是将溶液配成0.02N的NaOH,就很容易溶解了;3、水浴加热,温度不能高于50度。
D-生物素是具有生物活性的生物素,也就是vitaminH。
在毕赤酵母代谢过程中,作为多种酶的辅基起作用。
天然培养基中一般可以不单独添加,因为YNB中、酵母粉、蛋白胨中均含有一定量的生物素,但是做高密度发酵还是必须要添加的。
b.有几个比较迷惑的问题请教大家:(很典型的小问题)1、制感受态细胞,OD多少比较好?pyrimidine 战友的方法:取1mlGS115过夜培养物(OD约6-10) 分装到1.5ml EP管中。
说明书还有一些文献是说在1.3左右效率高,再高了效率会很低2、关于高效转化法,文献说用(LiAc),而invitrogen的说明书说转化毕赤酵母用(LiAc)没用,要用LiCl。
Lithium acetate does not work with Pichia pastoris. Use only lithium chloride.3、YNB到底能高温灭么?有的说能有的说不能。
过滤灭菌的怎么操作?我是把滤器装好膜绑到瓶口用纱布盖上,报纸包上,瓶盖放烧杯里单灭。
然后把配好的溶液用注射器一点点推进去。
4、葡萄糖为什么在YPD里一起灭颜色很深,单灭则不会。
该115度还是121度灭?网上搜了下,都有人用!5、电转化参数用400欧还是200欧?有的用400,有的还专门说不是用400。
都是从园里看到的!电击参数:1.5KV,25uF,200欧姆(不是400)6、电转后,在MD平板上长的应该就是整合了目的基因的重组子了吧?如果不想筛高拷贝的,是否PCR验证一下即可?网友的回答:ynb最好不灭菌,我是0.22um过滤处理的。
invitrogen手册上可以灭菌的。
毕赤酵母表达知识归纳1a.配制500×BIOTIN stock solution(0.02%)有这么3种方案:1、懒人是将Biotin直接溶在去离子水中,放过夜,基本就能溶;2、急性子是将溶液配成0.02N的NaOH,就很容易溶解了;3、水浴加热,温度不能高于50度。
D-生物素是具有生物活性的生物素,也就是vitaminH。
在毕赤酵母代谢过程中,作为多种酶的辅基起作用。
天然培养基中一般可以不单独添加,因为YNB中、酵母粉、蛋白胨中均含有一定量的生物素,但是做高密度发酵还是必须要添加的。
b.有几个比较迷惑的问题请教大家:(很典型的小问题)1、制感受态细胞,OD多少比较好?pyrimidine 战友的方法:取1mlGS115过夜培养物(OD约6-10) 分装到1.5ml EP管中。
说明书还有一些文献是说在1.3左右效率高,再高了效率会很低2、关于高效转化法,文献说用(LiAc),而invitrogen的说明书说转化毕赤酵母用(LiAc)没用,要用LiCl。
Lithium acetate does not work with Pichia pastoris. Use only lithium chloride.3、YNB到底能高温灭么?有的说能有的说不能。
过滤灭菌的怎么操作?我是把滤器装好膜绑到瓶口用纱布盖上,报纸包上,瓶盖放烧杯里单灭。
然后把配好的溶液用注射器一点点推进去。
4、葡萄糖为什么在YPD里一起灭颜色很深,单灭则不会。
该115度还是121度灭?网上搜了下,都有人用!5、电转化参数用400欧还是200欧?有的用400,有的还专门说不是用400。
都是从园里看到的!电击参数:1.5KV,25uF,200欧姆(不是400)6、电转后,在MD平板上长的应该就是整合了目的基因的重组子了吧?如果不想筛高拷贝的,是否PCR验证一下即可?网友的回答:ynb最好不灭菌,我是0.22um过滤处理的。
invitrogen手册上可以灭菌的。
版权声明:本站几乎所有资源均搜集于网络,仅供学习参考,不得进行任何商业用途,否则产生的一切后 果将由使用者本人承担! 本站仅仅提供一个观摩学习与交流的平台, 将不保证所提供资源的完 整性,也不对任何资源负法律责任。
所有资源请在下载后 24 小时内删除。
如果您觉得满意, 请购买正版,以便更好支持您所喜欢的软件或书籍!☆☆☆☆☆生物秀[]☆☆☆☆☆中国生物科学论坛[/bbs/]☆☆☆☆☆生物秀下载频道[/Soft/]生物秀——倾力打造最大最专业的生物资源下载平台!■■■ 选择生物秀,我秀我精彩!!■■■欢迎到生物秀论坛(中国生物科学论坛)的相关资源、软件版块参与讨论,共享您的资源,获 取更多资源或帮助。
毕赤酵母多拷贝表达载体试剂盒用于在含多拷贝基因的毕赤酵母菌中表达并分离重组蛋白综述:基本特征:作为真核生物,毕赤酵母具有高等真核表达系统的许多优点:如蛋白加工、折叠、翻译后修饰等。
不仅如此,操作时与E.coli及酿酒酵母同样简单。
它比杆状病毒或哺乳动物组织培养等其它真核表达系统更快捷、简单、廉价,且表达水平更高。
同为酵母,毕赤酵母具有与酿酒酵母相似的分子及遗传操作优点,且它的外源蛋白表达水平是后者的十倍以至百倍。
这些使得毕赤酵母成为非常有用的蛋白表达系统。
与酿酒酵母相似技术:许多技术可以通用:互补转化基因置换基因破坏另外,在酿酒酵母中应用的术语也可用于毕赤酵母。
例如:HIS4基因都编码组氨酸脱氢酶;两者中基因产物有交叉互补;酿酒酵母中的一些野生型基因与毕赤酵母中的突变基因相互补,如HIS4、LEU2、ARG4、TR11、URA3等基因在毕赤酵母中都有各自相互补的突变基因。
毕赤酵母是甲醇营养型酵母:毕赤酵母是甲醇营养型酵母,可利用甲醇作为其唯一碳源。
甲醇代谢的第一步是:醇氧化酶利用氧分子将甲醇氧化为甲醛,还有过氧化氢。
为避免过氧化氢的毒性,甲醛代谢主要在一个特殊的细胞器-过氧化物酶体-里进行,使得有毒的副产物远离细胞其余组分。
毕赤酵母表达实验手册作者:Jnuxz 来源:丁香园时间:2007-9-5大肠杆菌表达系统最突出的优点是工艺简单、产量高、周期短、生产成本低。
然而,许多蛋白质在翻译后,需经过翻译后的修饰加工,如磷酸化、糖基化、酰胺化及蛋白酶水解等过程才能转化成活性形式。
大肠杆菌缺少上述加工机制,不适合用于表达结构复杂的蛋白质。
另外,蛋白质的活性还依赖于形成正确的二硫键并折叠成高级结构,在大肠杆菌中表达的蛋白质往往不能进行正确的折叠,是以包含体状态存在。
包含体的形成虽然简化了产物的纯化,但不利于产物的活性,为了得到有活性的蛋白,就需要进行变性溶解及复性等操作,这一过程比较繁琐,同时增加了成本。
大肠杆菌是用得最多、研究最成熟的基因工程表达系统,当前已商业化的基因工程产品大多是通过大肠杆菌表达的,其主要优点是成本低、产量高、易于操作。
但大肠杆菌是原核生物,不具有真核生物的基因表达调控机制和蛋白质的加工修饰能力,其产物往住形成没有活性的包涵体,需要经过变性、复性等处理,才能应用。
近年来,以酵母作为工程菌表达外源蛋白日益引起重视,原因是与大肠杆菌相比,酵母是低等真核生物,除了具有细胞生长快,易于培养,遗传操作简单等原核生物的特点外,又具有真核生物时表达的蛋白质进行正确加工,修饰,合理的空间折叠等功能,非常有利于真核基因的表达,能有效克服大肠杆菌系统缺乏蛋白翻译后加工、修饰的不足。
因此酵母表达系统受到越来越多的重视和利用。
[1]。
同时与大肠杆菌相比,作为单细胞真核生物的酵母菌具有比较完备的基因表达调控机制和对表达产物的加工修饰能力。
酿酒酵母(Saccharomyces.Cerevisiae)在分子遗传学方面被人们的认识最早,也是最先作为外源基因表达的酵母宿主。
1981年酿酒酵母表达了第一个外源基因----干扰素基因[2],随后又有一系列外源基因在该系统得到表达[3、4、5、6]。
干扰素和胰岛素虽然已经利用酿酒酵母大量生产并被广泛应用,当利用酿酒酵母制备时,实验室的结果很令人鼓舞,但由实验室扩展到工业规模时,其产量迅速下降。
毕赤酵母表达实验手册大肠杆菌表达系统最突出的优点是工艺简单、产量高、生产成本低。
然而,许多蛋白质在翻译的修饰加工,如磷酸化、糖基化、酰胺化及蛋白酶水解等过程才能转化成活性形式。
大肠杆菌缺少适合用于表达结构复杂的蛋白质。
另外,蛋白质的活性还依赖于形成正确的二硫键并折叠成高级结表达的蛋白质往往不能进行正确的折叠,是以包含体状态存在。
包含体的形成虽然简化了产物的纯的活性,为了得到有活性的蛋白,就需要进行变性溶解及复性等操作,这一过程比较繁琐,同时增与大肠杆菌相比,酵母是低等真核生物,具有细胞生长快,易于培养,遗传操作简单等原核生物的生物时表达的蛋白质进行正确加工,修饰,合理的空间折叠等功能,非常有利于真核基因的表达,菌系统缺乏蛋白翻泽后加工、修饰的不足。
因此酵母表达系统受到越来越多的重视和利用。
大肠杆菌是用得最多、研究最成熟的基因工程表达系统,当前已商业化的基因工程产品大多是通过其主要优点是成本低、产量高、易于操作。
但大肠杆菌是原核生物,不具有真核生物的基因表达调加工修饰能力,其产物往住形成没有活性的包涵体,需要经过变性、复性等处理,才能应用。
近年程菌表达外源蛋白日益引起重视,主更是因为酵母是单细胞真核生物,不但具有大肠杆菌易操作、化生产的特点,还具有真核生物表达系统基因表达调控和蛋白修饰功能,避免了产物活性低,包涵间题[1]。
与大肠杆菌相比,酵母是单细胞真核生物,具有比较完备的基因表达调控机制和对表达产物的们对酿酒酵母(Saccharomyces.Cerevisiae)分子遗传学方面的认识最早,酿酒酵母也最先作为外宿主.1981年酿酒酵母表达了第一个外源基因一干扰素基因,随后又有一系列外源基因在该系统得素和胰岛素已大量生产并在人群中广泛应用,但很大部分表达由实验室扩展到工业规模时,培养基数的选择压力消失,质粒变得不稳定,拷贝数下降,而大多数外源基因的高效表达需要高拷贝数的量下降。
同时,实验室用培养基复杂而昂贵,采用工业规模能够接受的培养基时,往往导致产量的酵母的局限,人们发展了以甲基营养型酵母(methylotrophic yeast)为代表的第二代酵母表达系甲基营养型酵母包括:Pichia、Candida等.以Pichia.pastoris(毕赤巴斯德酵母)为宿主的外源来发展最为迅速,应用也最为广泛,已利用此系统表达了一系列有重要生物学活性的蛋自质。
毕⾚酵母表达实验⼿册毕⾚酵母表达实验⼿册Jnuxz丁⾹园虚拟社区蛋⽩质技术讨论版⼤肠杆菌表达系统最突出的优点是⼯艺简单、产量⾼、周期短、⽣产成本低。
然⽽,许多蛋⽩质在翻译后,需经过翻译后的修饰加⼯,如磷酸化、糖基化、酰胺化及蛋⽩酶⽔解等过程才能转化成活性形式。
⼤肠杆菌缺少上述加⼯机制,不适合⽤于表达结构复杂的蛋⽩质。
另外,蛋⽩质的活性还依赖于形成正确的⼆硫键并折叠成⾼级结构,在⼤肠杆菌中表达的蛋⽩质往往不能进⾏正确的折叠,是以包含体状态存在。
包含体的形成虽然简化了产物的纯化,但不利于产物的活性,为了得到有活性的蛋⽩,就需要进⾏变性溶解及复性等操作,这⼀过程⽐较繁琐,同时增加了成本。
⼤肠杆菌是⽤得最多、研究最成熟的基因⼯程表达系统,当前已商业化的基因⼯程产品⼤多是通过⼤肠杆菌表达的,其主要优点是成本低、产量⾼、易于操作。
但⼤肠杆菌是原核⽣物,不具有真核⽣物的基因表达调控机制和蛋⽩质的加⼯修饰能⼒,其产物往住形成没有活性的包涵体,需要经过变性、复性等处理,才能应⽤。
近年来,以酵母作为⼯程菌表达外源蛋⽩⽇益引起重视,原因是与⼤肠杆菌相⽐,酵母是低等真核⽣物,除了具有细胞⽣长快,易于培养,遗传操作简单等原核⽣物的特点外,⼜具有真核⽣物时表达的蛋⽩质进⾏正确加⼯,修饰,合理的空间折叠等功能,⾮常有利于真核基因的表达,能有效克服⼤肠杆菌系统缺乏蛋⽩翻译后加⼯、修饰的不⾜。
因此酵母表达系统受到越来越多的重视和利⽤。
[1]。
同时与⼤肠杆菌相⽐,作为单细胞真核⽣物的酵母菌具有⽐较完备的基因表达调控机制和对表达产物的加⼯修饰能⼒。
酿酒酵母(Saccharomyces.Cerevisiae)在分⼦遗传学⽅⾯被⼈们的认识最早,也是最先作为外源基因表达的酵母宿主。
1981年酿酒酵母表达了第⼀个外源基因----⼲扰素基因[2],随后⼜有⼀系列外源基因在该系统得到表达[3、4、5、6]。
⼲扰素和胰岛素虽然已经利⽤酿酒酵母⼤量⽣产并被⼴泛应⽤,当利⽤酿酒酵母制备时,实验室的结果很令⼈⿎舞,但由实验室扩展到⼯业规模时,其产量迅速下降。
很好,需要好好研究一下原文地址:毕赤酵母表达知识01转载于丁香作者:思时尔非a.配制500×BIOTIN stock solution(0.02%)有这么3种方案:1、懒人是将Biotin直接溶在去离子水中,放过夜,基本就能溶;2、急性子是将溶液配成0.02N的NaOH,就很容易溶解了;3、水浴加热,温度不能高于50度。
D-生物素是具有生物活性的生物素,也就是vitaminH。
在毕赤酵母代谢过程中,作为多种酶的辅基起作用。
天然培养基中一般可以不单独添加,因为YNB中、酵母粉、蛋白胨中均含有一定量的生物素,但是做高密度发酵还是必须要添加的。
b.有几个比较迷惑的问题请教大家:(很典型的小问题)1、制感受态细胞,OD多少比较好?pyrimidine 战友的方法:取1mlGS115过夜培养物(OD约6-10) 分装到1.5ml EP 管中。
说明书还有一些文献是说在1.3左右效率高,再高了效率会很低2、关于高效转化法,文献说用(LiAc),而invitrogen的说明书说转化毕赤酵母用(LiAc)没用,要用LiCl。
Lithium acetate does not work with Pichia pastoris. Use only lithium chloride.3、YNB到底能高温灭么?有的说能有的说不能。
过滤灭菌的怎么操作?我是把滤器装好膜绑到瓶口用纱布盖上,报纸包上,瓶盖放烧杯里单灭。
然后把配好的溶液用注射器一点点推进去。
4、葡萄糖为什么在YPD里一起灭颜色很深,单灭则不会。
该115度还是121度灭?网上搜了下,都有人用!5、电转化参数用400欧还是200欧?有的用400,有的还专门说不是用400。
都是从园里看到的!电击参数:1.5KV,25uF,200欧姆(不是400)6、电转后,在MD平板上长的应该就是整合了目的基因的重组子了吧?如果不想筛高拷贝的,是否PCR验证一下即可?网友的回答:ynb最好不灭菌,我是0.22um过滤处理的。
电转化注意事项作者: 发布: 2020-10-20一、制备感受态的菌液搜集时刻:1、准确测定OD值:OD在1.2~1.5之间。
1)为了准确测定OD值,建议将菌液稀释不同浓度测定(1、2、4、8、16倍稀释,看其OD 值是否呈线性关系)。
每个倍数做3-5个重复,应该可以大致推断OD值是否准确!菌液看上去浑浊,但OD值不高,很可能OD稀释倍数不够!2) OD值是否测准也可以这样估算:OD600为40左右时,菌体湿重(6000rpm离心5min)约0. 95g/10ml。
高密度发酵时菌体湿重将相应下降。
2、75ml的菌,经18h左右的培养,最后sorbital洗涤完毕后,50ml离心管里所剩菌体特别浓,需要1ml sorbitol才可溶解为糊状。
正常培养的OD在1.2~1.5之间的500ml菌液,收集的感受态也用1ml稀释的,没那么粘稠。
可以看看降低培养温度(27摄氏度)或缩短培养时间(12h)。
3、甚至不用转接,直接挑单克隆在50-100mlYPD中摇过夜,效果也很好二、制备感受态的菌液量如果只转一个样品,50ml就够了,一般50ml的培养液如果OD值正常的话够做10管感受态的,其他的按比例缩小。
用大试管摇5ml菌液,然后取1ml毫升在1.5mlEP管中制感受态,每一步的离心时间30秒就行。
整个流程时间短,制备好的感受态用来做转化的效率很高。
山梨醇离心,洗涤的过程之后的重悬的时候注意浓度,不要过于粘稠和稀释。
三、感受态的保存感受态细胞做好后由于电转化杯还没有处理好等原因,在冰上放几个小时再做可能有一定的影响,尽量马上制备马上转化。
如果感受态细胞要保存,不需要加甘油,一般80ul EP管分装,-70 或 -80 摄氏度保存。
另附:酵母GS115点种分离纯化接种GS115于5ml YPD液体培养基,30℃,200rpm振荡留宿,涂布 YPD平板,30℃培育48 小时,用 YNB大体培育基和含His的补充培育基作点种分离纯化,挑选在补充培育基生上生长而在大体培育基上不生长的单菌落划YPD平板,4℃保留。
以pPIC9K为例的酵母表达纯化以pPIC9K为例,pPIC9K是用于在毕赤酵母中的多拷贝整合分泌表达蛋白的穿梭载体,利用组氨酸缺陷型标记进行互补筛选。
一、信号肽的2步切割pPIC9K载体带有自身信号肽,在分泌过程中被切除,但是由于切割效率,在目的产物N端带有3,5个左右的信号肽的氨基酸。
设计引物时,为了防止切割不完全,能去掉GluAla两个重复单位,不过文献报道多个Glu会提高kex2的切割效率。
要求目的蛋白中不能含有信号肽酶切割序列:glu-lys-arg-glu-ala-glu-ala。
信号肽的切除分为两步:kex2在glu-lys-arg和glu-ala-glu-ala之间初步切除,STE123在两个glu-ala之间切割。
二、是否在3' 端是带上一些其本来的序列,1,首先,你要保证表达后细胞内信号肽酶能正确识别原来的位点,即此位点是不能随便增减的,否则信号肽不能正常切割,在这个基础上你再决定3' 端其本来序列的去留。
2,一般5'端多出一些氨基酸不会明显影响到你的目的蛋白的活性,我们平时在做酵母表达时,信号肽切割后,目的蛋白往往有几个多余的AA,这对活性好象没什么影响,虽然如此,但你还得注意多余AA的性质,不能过酸或过碱。
三、重组pPIC9K/GS115表达出目的条带后,确定信号肽是否切除完全的方法:1、N端测序2、先查查你的氨基酸序列里有没有糖基化位点,如果有就只能N端测序了。
如果没有,看分子量大小。
信号肽中有kex2和ste13两个酶切位点,现在担心的是kex2的位点酶切完全了,但ste13的两个酶切位点glu, ala重复序列没有切干净,如果这两个氨基酸没有切除完全的话,分子量差异不大,两个氨基酸的差异应该看不出来,一般来说,N端多一两个AA应该对蛋白的活性没有太大影响。
western检测有两个条带的问题,可能是目的蛋白有一部分被降解了。
四、附:信号肽切割原理和优化切割《Expression of Your Recombinant Protein with a Native N-terminus》If you wish to have your protein expressed with a native N-terminus, you should cloneyour gene flush(直接地) with the Kex2 cleavage site. Use PCR to rebuild the sequence from the Xho I site at bp 1184-1189 to the arginine codon at nucleotides 1193-1195. Remember to include the first amino acid of your protein, if necessary, for correct fusion to the Kex2 cleavage site.Signal Sequence ProcessingThe processing of the α-factor signal sequence in pPICZαoccurs in two steps:1. The preliminary cleavage of the signal sequence by the KEX2 gene product,final Kex2 cleavage occurring between arginine and glutamine in the sequenceLys-Arg * Glu-Ala-Glu-Ala, where * is the site of cleavage. 2. The Glu-Ala repeats are further cleaved by the STE13 gene product.Optimization of Signal CleavageIn Saccharomyces cerevisiae, it has been noted that the Glu-Ala repeats are not necessaryfor cleavage by Kex2, but cleavage after Glu-Lys-Arg may be more efficient whenfollowed by Glu-Ala repeats. A number of amino acids are tolerated at site X instead ofGlu in the sequence Glu-Lys-Arg-X. These amino acids include the aromatic amino acids,small amino acids, and histidine. Proline, however, willinhibit Kex2 cleavage. For moreinformation on Kex2 cleavage, please see (Brake et al., 1984).There are some cases where Ste13 cleavage of Glu-Ala repeatsis not efficient, and Glu-Ala repeats are left on the N-terminus of the expressed protein of interest. This isgenerally dependent on the protein of interest. continued on next page五、翻译Genebank所查序列为设计一个引物,在Genebank上查找序列如下:CDS 序列是 57,560, sig_peptide 从 57,119, mat_peptide 从120,557。
几种酵母转化方法酵母转化原理:像酿酒酵母,线性化的转化DNA和Pichiapastoris基因组的同源区域发生同源重组,使得线性化DNA产生稳定的转化子(Cregg et al., 1985; Cregg etal.,1989).这样的整合方式显示极强的稳定性,即使多拷贝转化子在没有选择压力的情况下也很稳定.单交换事件(插入)比双交换事件(置换)发生几率更大.单插入事件中约发生1-10%概率的多插入事件.电转化注意点:一、制备感受态的菌液收集时间:1、准确测定OD值:OD在1.2~1.5之间。
1)为了准确测定OD值,建议将菌液稀释不同浓度测定(1、2、4、8、16倍稀释,看其OD值是否呈线性关系)。
每个倍数做3-5个重复,应该可以大致推断OD值是否准确!菌液看上去浑浊,但OD值不高,很可能OD稀释倍数不够!2) OD值是否测准也可以这样估算:OD600为40左右时,菌体湿重(6000rpm 离心5min)约0.95g/10ml。
高密度发酵时菌体湿重将相应下降。
2、75ml的菌,经18h左右的培养,最后sorbital洗涤完毕后,50ml离心管里所剩菌体特别浓,需要1mlsorbitol才可溶解为糊状。
正常培养的OD在1.2~1.5之间的500ml菌液,收集的感受态也用1ml稀释的,没那么粘稠。
可以看看降低培养温度(27摄氏度)或缩短培养时间(12h)。
3、甚至不用转接,直接挑单克隆在50-100mlYPD中摇过夜,效果也很好二、制备感受态的菌液量如果只转一个样品,50ml就够了,一般50ml的培养液如果OD值正常的话够做10管感受态的,其他的按比例缩小。
用大试管摇5ml菌液,然后取1ml毫升在1.5mlEP管中制感受态,每一步的离心时间30秒就行。
整个流程时间短,制备好的感受态用来做转化的效率很高。
山梨醇离心,洗涤的过程之后的重悬的时候注意浓度,不要过于粘稠和稀释。
三、感受态的保存感受态细胞做好后由于电转化杯还没有处理好等原因,在冰上放几个小时再做可能有一定的影响,尽量马上制备马上转化。
毕赤酵母表达系统前言:所用表达质粒有pPIC3.5K,pAO815用于胞内表达,而pPIC9K用于分泌表达,所有载体均利用AOX1启动子来诱导高水平表达。
抗性选择:最有效的筛选遗传霉素抗性及高抗性克隆的程序需要先对HIS+转化子进行选择,再进行不同水平遗传霉素抗性筛选。
毕赤菌株表型:毕赤酵母菌GS115 及KM71 在组氨酸脱氢酶位点(His4)有突变,因而不能合成组氨酸,所有表达质粒都有HIS4 基因可与宿主进行互补,通过不含组氨酸的培养基来选择转化子。
GS115 及KM71都可在复合培养基如YPD(YEPD)及含组氨酸的最小培养基中生长。
转化之前,GS115 及KM71 都不能在最小培养基中生长,因为它们是His-。
培养温度:毕赤酵母生长温度为28-30度(液体、平板、斜面)。
在32 度以上诱导生长时,对蛋白表达有害,甚至会导致细胞死亡。
贮存:贮存细胞几周或几月,用YPD培养基或YPD 琼脂斜面1 挑取所需菌株单克隆在YPD 平板上划线生长;2 挑取单克隆转移至YPD进行穿刺培养,30 度2 天;3 细胞在4 度可放几周几月或几年,存于-80度1 挑取所需菌株单克隆在YPD 中过夜培养;2 收集细胞,在含15%甘油的YPD 中悬浮至终OD600 为50-100(大约2.5-5.0×109细胞/ml);3 细胞先用液氮或干冰/酒精浴中冰冻再贮存于-80 度。
注意:在4 度或-80 度长期保存后,用之前建议在MM、MD 或MGY 平板上划线培养以检测His+转化子的表型是否正确及其活力。
以质粒pPIC9K,酵母Pichia pastoris GS115为例说明做法。
载体pPIC9K酶切为点线性化质粒DNA:建议使用下列方法线性化载体以获得Mut+及Muts重组子,可能其中一个会比另一个更利于表达多拷贝重组子。
如果只想得到Muts重组子,使用KM71 菌株。
单个十字交换事件可比双重十字交换更容易、更有效地获得Muts重组菌(例如:插入AOX1或his4 而不是取代AOX1)。
由于甲醇营养型酵母菌体内无天然质粒,所以携带外源基因的重组体必须整合于染色体中才能实现外源基因的表达。
整合表达的优点在于保持外源基因稳定性并可产生多拷贝基因。
典型的毕赤氏酵母表达载体含有醇氧化酶基因的调控序列,主要的结构包括:5’AOX1启动子片段、多克隆位点(MCS)、转录终止和polyA形成基因序列(TT)、筛选标记(His4或Zeocin)、3’AOX1基因片段,作为一个能在大肠杆菌中繁殖扩增的穿梭质粒,它还有部分pBR322质粒或COLE1序列。
如果是分泌型表达载体,在多克隆位点的前面,外源基因的5’端和启动子的3’端之间插人了分泌作用的信号肽序列。
在这个分泌信号的引导下,外源蛋白在内质网和高尔基体中经修饰和加工后能够由胞内转移至胞外,将成熟的蛋白质分泌到细胞外。
为方便于操作,通常表达载体都是穿梭质粒。
表达载体与酵母染色体有单交换和双交换整合2种方式,单交换整合时,或插入A0X1位点,或插入his位点。
有文献报道,以his4作为整合位点时,染色体突变株与表达盒间存在基因转换,偶而可使Laz表达盒丢失,故AOX1位点更好。
一般认为,单交换转化效率比双交换效率高,且易得到多拷贝整合,其发生机制可能是重复单交换引起的。
携带外源基因的表达载体可通过电穿孔、原生质体生成法或全细胞法转化酵母细胞。
甲醇酵母转化和大肠埃希氏菌转化不同之处是前者较为复杂。
对于大肠埃希氏菌而言,只要把重组表达载体导入细胞体内即可。
因其载体上携带有自身复制原点,可随染色体复制而复制,重组表达载体能够稳定存在。
在甲醇酵母系统中,所有的表达载体均不含酵母复制原点。
这就是说,导入酵母体内的重组表达载体只有和酵母染色体上的同源区发生重组,整合到染色体上,外源基因才能够稳定存在,外源蛋白才能得到稳定表达,这种整合的转化子一旦形成就非常稳定。
如果转化后的重组表达载体未能整合到染色体上,而是以游离的附加体形式存在,这种转化子就不稳定,重组表达载体极易丢失。
毕赤酵母多拷贝表达载体试剂盒用于在含多拷贝基因的毕赤酵母菌中表达并分离重组蛋白综述:基本特征:作为真核生物,毕赤酵母具有高等真核表达系统的许多优点:如蛋白加工、折叠、翻译后修饰等。
不仅如此,操作时与E.coli及酿酒酵母同样简单。
它比杆状病毒或哺乳动物组织培养等其它真核表达系统更快捷、简单、廉价,且表达水平更高。
同为酵母,毕赤酵母具有与酿酒酵母相似的分子及遗传操作优点,且它的外源蛋白表达水平是后者的十倍以至百倍。
这些使得毕赤酵母成为非常有用的蛋白表达系统。
与酿酒酵母相似技术:许多技术可以通用:互补转化基因置换基因破坏另外,在酿酒酵母中应用的术语也可用于毕赤酵母。
例如:HIS4基因都编码组氨酸脱氢酶;两者中基因产物有交叉互补;酿酒酵母中的一些野生型基因与毕赤酵母中的突变基因相互补,如HIS4、LEU2、ARG4、TR11、URA3等基因在毕赤酵母中都有各自相互补的突变基因。
毕赤酵母是甲醇营养型酵母:毕赤酵母是甲醇营养型酵母,可利用甲醇作为其唯一碳源。
甲醇代谢的第一步是:醇氧化酶利用氧分子将甲醇氧化为甲醛,还有过氧化氢。
为避免过氧化氢的毒性,甲醛代谢主要在一个特殊的细胞器-过氧化物酶体-里进行,使得有毒的副产物远离细胞其余组分。
由于醇氧化酶与O2的结合率较低,因而毕赤酵母代偿性地产生大量的酶。
而调控产生醇过氧化物酶的启动子也正是驱动外源基因在毕赤酵母中表达的启动子。
两种醇氧化酶蛋白:毕赤酵母中有两个基因编码醇氧化酶-AOX1及AOX2。
细胞中大多数的醇氧化酶是AOX1基因产物。
甲醇可紧密调节、诱导AOX1基因的高水平表达,较典型的是占可溶性蛋白的30%以上。
AOX1基因已被分离,含AOX1启动子的质粒可用来促进编码外源蛋白的目的基因的表达。
AOX2基因与AOX1基因有97%的同源性,但在甲醇中带AOX2基因的菌株比带AOX1基因菌株慢得多,通过这种甲醇利用缓慢表型可分离Muts菌株。
表达:AOX1基因的表达在转录水平受调控。
毕赤酵母表达系统前言:所用表达质粒有pPIC3.5K,pAO815用于胞内表达,而pPIC9K用于分泌表达,所有载体均利用AOX1启动子来诱导高水平表达。
抗性选择:最有效的筛选遗传霉素抗性及高抗性克隆的程序需要先对HIS+转化子进行选择,再进行不同水平遗传霉素抗性筛选。
毕赤菌株表型:毕赤酵母菌GS115 及KM71 在组氨酸脱氢酶位点(His4)有突变,因而不能合成组氨酸,所有表达质粒都有HIS4 基因可与宿主进行互补,通过不含组氨酸的培养基来选择转化子。
GS115 及KM71都可在复合培养基如YPD(YEPD)及含组氨酸的最小培养基中生长。
转化之前,GS115 及KM71 都不能在最小培养基中生长,因为它们是His-。
培养温度:毕赤酵母生长温度为28-30度(液体、平板、斜面)。
在32 度以上诱导生长时,对蛋白表达有害,甚至会导致细胞死亡。
贮存:贮存细胞几周或几月,用YPD培养基或YPD 琼脂斜面1 挑取所需菌株单克隆在YPD 平板上划线生长;2 挑取单克隆转移至YPD进行穿刺培养,30 度2 天;3 细胞在4 度可放几周几月或几年,存于-80度1 挑取所需菌株单克隆在YPD 中过夜培养;2 收集细胞,在含15%甘油的YPD 中悬浮至终OD600 为50-100(大约2.5-5.0×109细胞/ml);3 细胞先用液氮或干冰/酒精浴中冰冻再贮存于-80 度。
注意:在4 度或-80 度长期保存后,用之前建议在MM、MD 或MGY 平板上划线培养以检测His+转化子的表型是否正确及其活力。
以质粒pPIC9K,酵母Pichia pastoris GS115为例说明做法。
载体pPIC9K酶切为点线性化质粒DNA:建议使用下列方法线性化载体以获得Mut+及Muts重组子,可能其中一个会比另一个更利于表达多拷贝重组子。
如果只想得到Muts重组子,使用KM71 菌株。
单个十字交换事件可比双重十字交换更容易、更有效地获得Muts重组菌(例如:插入A OX1或his4 而不是取代AOX1)。
电转化注意事项作者: global.wun(站内联系TA)发布: 2009-10-20一、制备感受态的菌液收集时间:1、准确测定OD值:OD在1.2~1.5之间。
1)为了准确测定OD值,建议将菌液稀释不同浓度测定(1、2、4、8、16倍稀释,看其O D值是否呈线性关系)。
每个倍数做3-5个重复,应该可以大致推断OD值是否准确!菌液看上去浑浊,但OD值不高,很可能OD稀释倍数不够!2)OD值是否测准也可以这样估算:OD600为40左右时,菌体湿重(6000rpm离心5min)约0.95g/10ml。
高密度发酵时菌体湿重将相应下降。
2、75ml的菌,经18h左右的培养,最后sorbital洗涤完毕后,50ml离心管里所剩菌体特别浓,需要1ml sorbitol才可溶解为糊状。
正常培养的OD在1.2~1.5之间的500ml菌液,收集的感受态也用1ml稀释的,没那么粘稠。
可以看看降低培养温度(27摄氏度)或缩短培养时间(12h)。
3、甚至不用转接,直接挑单克隆在50-100mlYPD中摇过夜,效果也很好二、制备感受态的菌液量如果只转一个样品,50ml就够了,一般50ml的培养液如果OD值正常的话够做10管感受态的,其他的按比例缩小。
用大试管摇5ml菌液,然后取1ml毫升在1.5mlEP管中制感受态,每一步的离心时间30秒就行。
整个流程时间短,制备好的感受态用来做转化的效率很高。
山梨醇离心,洗涤的过程之后的重悬的时候注意浓度,不要过于粘稠和稀释。
三、感受态的保存感受态细胞做好后由于电转化杯还没有处理好等原因,在冰上放几个小时再做可能有一定的影响,尽量马上制备马上转化。
如果感受态细胞要保存,不需要加甘油,一般80ul EP管分装,-70 或-80 摄氏度保存。
另附:酵母GS115点种分离纯化接种GS115于5ml YPD液体培养基,30℃,200rpm振荡过夜,涂布YPD平板,30℃培养48 小时,用YNB基本培养基和含His的补充培养基作点种分离纯化,挑选在补充培养基生上生长而在基本培养基上不生长的单菌落划YPD平板,4℃保存。
毕赤酵母电转化:
介绍:该方法无需产生去壁细胞,是产生毕赤酵母重组子的简便方法。
与去壁细胞效率相似。
细胞准备:
1 在含5mlYPD 的50ml 离心管中,培养毕赤酵母,30 度过夜
2 取0.1-0.5ml 过夜培养物,接种含500ml 新鲜培养基的2L 摇瓶,过夜生长至OD600=1.3-1.5
3 在
4 度,1500g离心5min收集细胞,用500ml预冷的灭菌水悬浮细胞
4 如上离心,用250 ml预冷的灭菌水悬浮细胞
5 如上离心,用20ml预冷的1M山梨醇悬浮细胞
6 如上离心,用1 ml 预冷的1M山梨醇悬浮细胞,至终体积约1.5ml
注意:可冻存80ul 等量的电感受态细胞,但转化效率会下降很多
转化:
1 取80ul上述细胞与5-20ug线性化DNA(溶于5-10ulTE)混合,转入预冷的0.2cm 电转杯中。
2 在冰上放置5min
3 根据所使用装置推荐的酿酒酵母参数进行电击
4 立即加入1ml 预冷的1M山梨醇至杯中,将内容物转移至灭菌离心管中
5 分成200-600ul等份,涂于MD 或RDB平板上
6 在30 度孵育平板至克隆产生,按P41 筛选Mut+/Muts表型。