NanoDrop 2012-01-04
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Nanodrop 2000/2000C 分光光度计V1.0 用户手册基因有限公司仪器应用技术支持亲爱的用户,您好!非常感谢您选购我公司代理的仪器。
我们将竭诚为您提供优质的售后服务及免费的专业应用培训。
为了更好地进行仪器的应用培训,我们根据您所选购的仪器特点,将需要您配合准备的工作敬告如下:1. 应用培训内容:仪器操作培训和软件应用培训。
仪器操作培训包括:仪器的操作、维护和仪器使用注意事项。
软件应用培训包括:用户本次所购买的同仪器配套的所有软件的软件应用培训。
2. 培训时间:仪器正式安装调试后,由安装工程师现场培训仪器操作。
3. 应用培训中所需准备的试剂、耗材和仪器均需由用户提供,并在系统培训开始前准备好。
4. 用户签收售后服务工作报告后,基因公司正式的系统培训内容即完成。
您以后在使用的过程中有任何疑问都可以向我们咨询,我们非常乐意为您们解决应用上遇到的问题。
5. 在仪器的使用过程中,无论遇到您认为多么微小或繁琐的问题,请您及时和我们联系,一个及时的通知能节约您的时间,也能帮助我们更好的了解仪器和软件。
6. 联系我们时请您提供:仪器型号、软件名称,版本、错误代码、实验目的、操作系统(98/2k/xp/NT)、维修历史等相关资料。
本守则提的信息仅供参考,本守则包含的所有信息应该是正确和完整的。
如果对本守则中的描述有疑问,请参考厂家的英文操作说明。
如果由于您的不正当使用而对仪器造成损坏或者导致仪器的性能损伤,本公司将不会对此负责。
1.仪器介绍仪器描述Thermo Scientific NanoDrop 2000/2000C分光光度计可以检测0.5-2ul的样本,而且检测是非常高的准确性和重复性。
ND2000C分光光度计不仅提供了NanoDrop 样品保留专利技术的便利性,也可以使用传统的比色皿来进行样本检测。
样本保留系统应用了表面张力来把样本保留在两根检测光纤中间,这使得仪器可以检测较高浓度的样本而不用稀释。
使用方法:
1.开机,待自检。
2.在主页屏幕上,选择相关选项卡(如蛋白)并点击测试项目(如蛋白A280).
3.将1-2μL空白检测液移取到下基座,然后降下检测臂。
4.点击空白检测并等待检测完成。
5.抬起检测臂,用新的滤纸轻轻吸掉上下基座的残留液体。
6.将2μL样品溶液移取到基座上,然后降下检测臂。
7.开始检测样品,点击检测,并读取数值。
8.抬起检测臂,用新的滤纸轻轻吸掉上下基座的残留液体。
注意事项:
1.检测前需要将样品混匀。
2.一般取1-2μL进行检测,太少无法形成液体柱,太多容易溢出。
3.检测样品前一定要进行空白检测。
4.不要使用氢氟酸等具有腐蚀性的液体。
5.每次使用结束后,使用去离子水清洁上下基座,保持基座干净。
6.使用结束后,将检测臂放下,防止灰尘。
7.如果设置为自动检测,降下检测臂,会自动进行检测。
超微量核酸蛋白测定仪-Nanodrop vs. Qubit 凡是需要做分子生物学实验的lab,肯定逃不了要买一台核酸定量的机器。
目前最为流行的仪器是Nanodrop,只需滴加一两微升的样品,按一下按钮,利用核酸的紫外吸收特性,即可得到浓度数据。
近几年,以Qubit为代表的基于特异荧光染料法的仪器也逐渐进入科研人员的视野。
那么,这两类仪器有什么区别,在使用时需要注意什么,如何根据实验室需求来选购?如下文所示。
(注:以安捷伦公司为代表的毛细管电泳法不在本文的讨论范围内。
) 首先我们需要来理解两台仪器在核酸定量原理上的区别。
正如方才所言,Nanodrop利用了核酸的紫外吸收特性。
(图1:Nanodrop全家福)核酸,包括DNA和RNA,均由核糖、磷酸基以及碱基构成。
其中,由于碱基含有芳香环结构,因此具有紫外吸收的特性。
核酸的特征吸收波长为260 nm。
根据朗伯比尔定律,已知物质的消光系数(几十年前早已测量),液层的厚度(固定的样品室),就能利用其吸光度来计算出物质的浓度。
与此同时,还能通过计算A260/A280和A260/A230的数值,估计核酸的纯度。
(280 nm 吸光通常来自蛋白质,而230 nm则通常来自糖类和苯酚等。
) 而Qubit这一类仪器采用的是荧光染料法。
这些荧光染料可以特异地与不同种类的核酸链相结合,并在特定波长光源的激发下,发出荧光。
其中,结合了核酸的荧光染料,相比那些游离的,信号可增幅数十倍至数百倍,因此可以和背景区分开来。
目前,做测序的实验室基本把Qubit当标配仪器了。
(图2:Qubit 3.0及配套试剂)虽然以Nanodrop为代表的紫外吸收法在科研领域已经沿用了数十年,但由于原理上的限制,这一类仪器有无法避免的缺陷。
1、紫外吸收法无法区分DNA和RNA这一点其实在原理上就很好理解了。
如下图所示,具有紫外吸收的结构是核酸的碱基,而DNA和RNA均含有碱基,因此当一份样品同时含有DNA和RNA 的时候,无论你本意是想测哪一个,均会高估其真实浓度。
Nanodrop 2000简易操作指南1、双击桌面软件图标打开软件2、选择检测功能,如3、对检测样本命名(也可以默认编号,做好实验记录)4、选择对应样品测试类型,如:可点击下拉小箭头选择其它样本类型,如:5、仪器校零,抬起仪器上臂,加样品的缓冲液1ul或2ul到仪器的下基座上,如下图所示:6、加样完毕后,放下仪器上臂:点击软件左上角的Blank图标:大约5秒后,Measure按键由灰色变亮后,才可以抬起上臂,用无尘纸把上下基座擦拭干净,如下图所示:若需重新校零,可点击左上角的Re-Blank图标重复步骤6;7、擦拭完毕,用移液器吸取与缓冲液等量的样品并把样品加到仪器的基座上,并且点击Measure按键进行检测;9、每测完成一次样品检测完后,需用无尘纸清洁上下基座。
样本全部检测完毕后,用移液器吸取蒸馏水约2-5ul到仪器的下基座上,放下仪器上臂,等待几秒,抬起仪器上臂,用无尘纸把上下基座擦拭干净之后再将仪器上臂放下,回到初始状态。
10、数据保存:点击Report,选择需保存的检测数据,保存为excel格式,用光盘刻录数据。
注意事项:1、样本检测量参考:核酸水溶液:1ul ,纯蛋白:2ul,Bradford,BCA,Lowry 或者蛋白Pierce 660nm试验:2ul,微生物细胞悬浮液:2ul。
2、最好使用精确的移液器(0-2ul)和tip头来取样来保证取样的准确。
低精确度的移液器(0-10ul或者更大的)很难准确的加1ul样本到检测基座上。
如果用户对样本的特征或者移液器精确性不太确认,最好使用2ul样本来做检测。
3、对于所有模式检测,检测臂都必须放下。
4、数据只能用光盘刻录。
5、请节约使用擦镜纸,实验垃圾放入垃圾桶内,实验完毕清理台面恢复整洁状态。
6、做好使用记录登记。
Nanodrop分光光度计操作说明1.双击电脑屏幕上的Nanodrop图标,启动软件.2.选择所需的测量模式,屏幕上会弹出初始化仪器的提示.往仪器的加样孔中加入2微升的蒸馏水,合上上盖使形成液柱,然后点击确定以开始初始化,可以听见电磁阀开合的声音.3.五六秒后屏幕上的提示信息消失,表示初始化完成.用擦镜纸将蒸馏水擦干净,加入2-3微升的Buffer,合上上盖并点击Blank.4.Blank完成后,用擦镜纸将Buffer擦干净即可以开始上样,点击Measure开始测量.建议: 在每次测量完毕后,用蒸馏水清洁样品平台,这样可以保证下一次测量的准确性。
每次测量的样品量建议不少于2微升图一图二图三图四5. 测量完成后,点击Show Report查看结果,选择Save进行保存.6. 保存的数据对应地保存在C:\Nanodrop Data文件夹.注: 具体的实验方法如BCA,Bradford等以及标准曲线的建立请参阅生物学资料和说明书名词介绍:Nuclear Acid Measurement: 核酸测量Protein 280: 用280nm波长测量蛋白,选择适当的蛋白类型(如BSA,IgG等),软件将在测量后给出吸光度值并自动计算其浓度MicroArray Measurement: 使用不同的荧光染料来测定核酸浓度UV-vis Measurement: 连续波谱扫描,可用于寻找最大吸收峰Cell Cultures: 用600nm波长测量菌密度Protein BCA: BCA法测蛋白Protein Bradford: Bradford法测蛋白Protein Lowry: Lowry法测蛋白User Preference: 用户对于软件的默认设置做一些修改Utility & Diagnostics: 性能诊断Sample Type: 选择样品的类型λ: 使用者自己输入波长,并查看样品在此波长的OD值Abs: 吸光度值A260 10mm Path : 常规的分光光度计使用的比色杯宽度约为10mm,即测量光程为10mm,与常规分光光度计不同的是,Nanodrop的测量光程是1mm和0.2mm.但是软件会自动将所测得的吸光度值转换成10mm光程对应的值. A260 10mm Path就是指10mm测量光程时样品在260nm波长时的OD值A280 10mm Path: 10mm测量光程时,样品在280nm波长时的OD值Dye: 染料Max Absorbance: 使用者自己输入纵轴的最大量程Hi Abs:点击此钮用于测量高浓度样品(最高至10mm测量光程的75A ),仪器将采用0.2mm光程测量Replicate#: 测量重复样品或重复的标准品时的计数器Reset This Std: 清除所选标准品的所有重复样品。
nanodrop one*微量光度计技术特点Nanodrop是实验室中常见的分光光度计。
与传统需要比色皿的分光光度计相比,Nanodrop所需样品的体积大大减少,只需要2 μL,同时也大大降低了实验准备以及清洗的时间。
这些优势使得科研人员能够在一分钟内检测多个样品。
当然如果你有更多的样品,还嫌效率不够高,你可以选择应用Nanodrop 8000系统,它能够同时检测8个样品。
Nanodrop能够在包括紫外及可见光区域在内的光谱范围内检测样品的吸光度信号。
在实验开始前,需要在仪器的软件内设置检测样品的种类,包括蛋白质,DNA, RNA等。
根据吸光度,能够计算样品的浓度。
DNA及RNA 在260 nm处有大吸收度,蛋白质在280 nm处有大吸收峰值。
浓度与吸光度的对应关系见下表。
当然表中浓度与吸光度对应关系成立的前提是样品必须具有很高的纯度。
样品纯度可以通过A260/280判定,其临界值可参考下表。
大家可能注意到,RNA的A260/280比值要比DNA的值高一些,这是因为碱基U的A260/280的比值要比碱基T的A260/280比值更高。
吸光度样品样品浓度高纯度样品标准(A260/280)A260=1双链DNA50 μg/ml<1.8单链DNA33μg/ml单链RNA40μg/ml>2.0A280= 1蛋白质1 mg/ml<0.6对Nanodrop检测结果产生直接影响的因素就是样品的纯度。
A260/280是检测样品纯度的一个指标,但这个参数只衡量了蛋白质与核酸之间相互污染的情况。
没有考虑DNA 与RNA之间彼此污染以及其他物质污染的情况,比如苯酚在270 nm附近具有较大的吸光值。
因此在利用Nanodrop检测核酸浓度的时候,除了A260/280外,A260/230也是检测样品纯度的一个指标,高纯度DNA和RNA的两个临界值同样是1.8以及2.0。
自2006年热电公司与飞世尔科技公司合并以来,通过一次次的收购,赛默飞世尔成为了全球科学服务领域的领导者。
而Life Technologies自1983年首次作为公司名面世,近年来也通过收购其他公司而发展成为一家年收入达38亿美元,市值约116亿美元的“大鳄”4月15号,赛默飞世尔(Thermo Fisher)和Life Technologies公司宣布,赛默飞以136亿美元的价格收购Life Tech。
Life Tech是赛默飞自2010年以来收购的第11家公司,也是最大的一次收购。
自2006年热电公司(Thermo Electron)与飞世尔科技公司(Fisher Scientific)合并以来,通过一次次的收购,赛默飞世尔成为了全球科学服务领域的领导者。
而Life Technologies自1983年首次作为公司名面世,近年来也通过收购其他公司而发展成为一家年收入达38亿美元,市值约116亿美元的“大鳄”。
赛默飞世尔的收购与出售2013年4月15号,赛默飞世尔以136亿美元收购Life Technologies,并继承Life Technologies的22亿美元净债务。
2012年9月13号,以9.25亿美元收购移植诊断公司One Lambda。
One Lambda公司由器官移植研究专家Paul Terasaki成立于1984年,2011年公司员工总数达到320人,年收入1.82亿美元。
One Lambda被收购后并入赛默飞的专业诊断业务。
2011年8月23号,赛默飞世尔以24.7亿欧元(和32.2亿美元)收购Phadia公司。
赛默飞意欲通过这笔交易提高其在高速发展的专业诊断市场中的份额。
Phadia公司成立于1967年,全球员工1500人,2010年收入为3.67亿欧元(合4.79亿美元)。
Phadia被收购后并入赛默飞的专业诊断业务。
2011年7月18号,以未披露的价格收购收购了Trek诊断系统(Trek Diagnostic Systems)公司。
NanoDrop系列产品使用注意事项
1、待测样品的均质性是NanoDrop的最高要求,一般核酸、蛋白质样品能在侦测前以vortex mixer震匀为最佳,若无vortex mixer也应以pipette吸放数次混匀。
若担心genomic DNA可能因前述动作而断裂,则改以55゚C加热约一分钟,使样品在侦测前呈现均匀状态,以确保2ul 具有代表性
2、侦测后立即使用拭镜纸(Kimwipe类)擦拭台面。
先取一张将上下台面的液体吸走,再将此laboratory wipe吸过样品的面反折到内部,折迭四次后以单方向多次擦拭台面(DNA 擦5次,Protein 擦20次)。
3、同一滴液体只能做一次侦测,欲重复定量同一样品,请擦掉前一滴,重新取出一滴进行侦测。
4、基本上核酸样品可使用1~2ul做测量,随各液体体积特性之不同会有不同体积需求,原则上不超过2ul。
并请使用2ul pipette避免体积不足导致液柱无法完整形成。
唯蛋白质样品因呈色剂与蛋白质本身特性,务必使用2ul进行侦测。
5、当软件跳出错误讯息时,请详细阅读并依指示进行障碍排除。
最常发生的情形是在侦测过程液柱并未正确形成,软件会出现以下讯息。
可先用肉眼观察液柱是否未完整连接上下台面,或样品内有泡泡,将上臂拉起后,擦掉该滴样品,再重新进行侦测,必要时可将样品体积加大至2ul。
正确的液柱应为:
6、不可使用含有Hydrofluoric Acid (HF)之样品,其它无腐蚀性之液体皆可使用。
NANODROP操作注意事项
以下建议非必须,但按此操作可得到更佳测量效果:
1、测量前将样品中度混匀(可采用震荡器或用手指弹震管底)。
2、TIP头插入液面下吸取样品,可避免吸入气泡;TIP头贴着下光纤表面
打出样品,且只按到移液器第一挡尽头,第二挡不要按,可以避免吹出气泡到样品中。
3、每次测量完毕后,用蒸馏水清洁上下光纤端面,这样可以更好地保证下
一次测量的准确性(主要针对超高浓度样品,一般样品无此要求)。
4、每次做BLANK前一定要先用水清洁上下光纤表面,可保证BLANK准
确。
5、每次测量的核酸样品量建议为1.5-2微升,蛋白样品建议2-2.5ul. 过少可
能无法形成水柱,过多可能溢出。
6、加样后尽快测量,以防蒸发浓缩以及灰尘落入,已加样品不能多次
MEASURE,如需重测需重新滴加同一样品。
7、仪器避免阳光直射,避免强风吹拂,以避免蒸发。
8、连续测量一段时间后擦净样品,用水清洁上下光纤表面,然后用水或
BUFFER做RE-BLANK后再MEASURE
9、仪器不用时,将上臂放下,可以防止灰尘。
10、清洁上下光纤表面的方法是:用移液器加2-2.5ul水在下光纤表面,放
下上臂,并顺便按压一下上臂,以使下光纤表面的水滴碰到上光纤表面(ND2000不需要按),然后将上下表面的水都用吸水纸擦去即可。
清除样品时同样是要将上下表面都擦去。
NanoDrop® ND-1000全波长的分光光度计,其波长范围为220nnm~750nm,可以对最少1ul 体积的样本进行精确、重复测量。
一、仪器基本操作吸取1ul 样本放置在接收光纤的末端上,按一下发射光纤,使其和样本接触,在两个光纤之间形成1um 的液柱。
脉冲氙灯提供脉冲光源,利用线性CCD 数组分析通过样本后的光线。
仪器配有专门设计的软件,仪器的操作可以通过计算机来控制,所有的测量数据都可以保存在计算机上。
应用领域✧l 无需稀释即可测量浓度高达3700ng/ul 的dsDNA 样本✧l 基因微数组样本的荧光标记光密度✧l 蛋白质分析(A280)浓度可达100mg/ml(BSA)✧l Bradford 法测量蛋白质✧l BCA 法测量蛋白质✧l 细胞浊度测量✧l 普通的紫外/可见光分光光度测量1.操作步骤下面是仪器操作的基本步骤:1)打开取样臂,吸取待测量样本放在下面测量基座的表面。
2)关闭取样臂,使用计算机上的操作软件来控制仪器,液滴会自动在上下基座之间形成液柱。
3)测量结束时,打开样本测量臂,使用比较柔软的纸,擦去上下基座表面上的样本液。
可以有效防止样本间的交叉干扰,交叉影响小于千分之一(请用擦镜纸擦拭)2.样本体积需求虽然样本的体积并不是测量的关键因素,但关键的是样本溶液必需在上下基座之间形成1um 的液柱,确保光线能完全通过该液柱。
✧l 核酸的水溶性溶液:1ul✧l 染料含量比较高的溶液:2ul✧l 纯化蛋白质溶液:2ul✧l Bradford 或BCA 实验:2ul✧l 水溶性细胞溶液:1ul在实验中最好使用量程为0~2.5ul 的移液器,以确保量程的准确性。
量程为0~10ul 的移液器在转移1ul 的样本时,精确度较2.5ul 量程的移液器低。
为保证充足的样本溶液,在测量时您最好使用2ul 样本溶液。
3.样本均一性从非均一性样本溶液中取样尤其是取样体积较小时,会对测量的结果产生明显的影响。