生存分析SPSS单因素和多因素对生存率的可能分析
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生存分析是对生存时间进行统计分析的一种技术,所谓生存时间,就是指从某一时间点起到所关心的事件发生的这段时间。
这里的时间不一定就是钟表日历上的时间,也有可能是其他的度量单位,比如长度单位等。
生存时间有两个特点:1.存在删失,是指由于某种原因导致生存时间没用被准确或完整的记录下来,这种情况很常见,如果不存在删失,那么生存分析和一般统计方法没用太大区别,但是一旦出现删失,就必须考虑其影响,一般统计方法将不再适用。
2.生存时间非负,且分布常常右偏,导致基于正态分布理论的常规统计方法不适用。
用生存分析就可以解决以上问题。
生存分析的几个就基本概念1.事件也称为失效事件,是指由研究者所规定的事件的结局,这在生存分析中是一个非常重要的概念,其定义应该非常明确,并且应该在研究开始阶段就要确定。
失效事件并不一定是消极的,也可以是正面、积极的,这取决于研究目的。
2.生存时间指从某一时间点起到所关心的事件也就是实效事件发生前的这段时间,生存时间的起点需要人为规定3.删失是指观察对象的终止观察并不是由于实效事件的发生,而是由于其他原因导致终止,这种情况往往不知道终止的时间点,因此会造成其时间数据不完整,并且删失需要在各组之间随机,如果删失的出现并不随机,则不能用生存分析4.生存函数用于描述生存时间分布的工具,当t=0时,生存函数取值为1,随着时间推移t 增大,生存函数的取值逐渐减小。
5.风险函数也是用于描述生存时间分布,表示随机变量T已至时点t的条件下,在接下来的一瞬间失效事件发生的概率生存分析的基本内有1.刻画生存时间分布2.生存时间分布的组间比较3.评价生存时间分布影响因子的效果生存分析可以分为参数法、半参数法、非参数法三种,参数法相当于非线性回归,半参数法有Cox回归,非参数法有寿命表法和Kaplan-Meier法,SPSS中的生存分析都集中在生存函数过程中,下面我们分别介绍这几种方法一、Kaplan-Meier法分析—生存函数—Kaplan-Meier例:现在有一组临床实验数据,抽取44名患者,被随机分到新药组和对照组,每组22名,对此进行生存分析研究,数据如下可见记录生存时间数据至少需要两个变量,一个是时间变量,另一个是时间状态变量,用于表示该时间点是失效事件发生的时间还是删失的时间,如果有多个组别,还需要加上组别变量,因此本例中一共有三个变量,分别是时间变量,指示变量,组别变量,指示变量中,0表示没有删失,1表示失访,2表示研究结束时仍未发生失效事件以上数据的组成样本量较小,并且每个观察个体的时间能够被准确记录,因此可以使用Kaplan-Meier法二、寿命表法Kaplan-Meier法仅适用于每个观察个体的时间能够被准确记录,但是有时候我们收集的数据组成为分段记录的,这时应该使用寿命表法分析—生存函数—寿命表例,对114名患者进行随访,数据如下这种类型的数据组成形式非常类似于对计数资料分组之后的频数表,在本例中,time为时间变量,died为指示变量,0为删失,1为失效事件,num为人数。
实战利用SPSS进行生存分析生存分析(Survival Analysis)是一种用于分析个体在一定时间内发生其中一事件的概率的统计方法。
生存分析可以用于疾病的生存时间分析、产品寿命分析、客户流失分析等。
SPSS是一种常用的统计分析软件,可以进行生存分析的实证研究。
生存分析的基本概念包括:生存时间(Survival Time)、生存率(Survival Rate)、累积风险(Cumulative Hazard)以及生存函数(Survival Function)等。
生存时间是指个体从其中一起始点到发生其中一事件所经过的时间。
生存率是指个体在其中一时间点存活下来的概率,也称为存活函数。
累积风险是指个体在其中一时刻前发生其中一事件的风险累积值。
进行生存分析的步骤包括:导入数据、设置生存时间和事件变量、选择合适的生存分析方法、进行分析和结果解释。
首先,在SPSS中导入数据。
可以将数据以Excel格式保存,然后在SPSS中选择File->Open->Data,选择相应的文件导入。
选择合适的生存分析方法。
SPSS提供了多种生存分析方法,如Kaplan-Meier生存曲线、Cox回归模型等。
选择合适的方法可以根据研究目的和数据特点来确定。
例如,如果想了解不同因素对生存时间的影响,可以选择Cox回归模型。
在SPSS中,可以使用Analyze->Survival->Survival,然后选择合适的方法进行分析。
进行生存分析。
根据选择的方法,SPSS会输出相应的结果。
例如,对于Kaplan-Meier生存曲线分析,SPSS会生成生存曲线和相应的生存率表格;对于Cox回归模型,SPSS会输出回归系数、风险比率等统计结果。
可以通过点击Results窗口中的相应选项来查看结果。
结果解释。
根据生存分析结果,可以解读生存曲线、计算生存率、比较不同组别间的生存差异等。
对于Kaplan-Meier生存曲线,可以通过图形来比较不同组别的生存率;对于Cox回归模型,可以根据回归系数和风险比率来解释不同因素对生存时间的影响。
生存分析SPSS生存分析是一种统计分析方法,用于研究个体在其中一种特定事件发生之前的生存时间或其持续时间。
生存数据通常是从健康、病理学或其他研究中收集到的,常见的应用有医学领域的生存率研究、产品的寿命分析等。
SPSS(Statistical Package for the Social Sciences)是一种常用的统计分析软件,它提供了强大的功能和易于使用的界面,可以进行生存分析和其他统计分析。
生存分析的目的是探讨事件发生的概率和时间。
与传统的统计分析方法不同,生存分析考虑了数据中的故障时间,即个体的生存时间。
生存时间可以是不同个体之间的差异,也可以是同一个体在不同时间点的变化。
在SPSS中进行生存分析,首先需要准备生存数据集。
生存数据集通常包括以下几个要素:个体的生存时间,事件是否发生,个体的特征变量等。
个体的生存时间可以是连续的,也可以是离散的。
事件是否发生通常用0表示未发生,1表示发生。
个体的特征变量可以是性别、年龄、治疗方式等。
在SPSS中进行生存分析,主要采用的方法是Kaplan-Meier生存曲线和Cox比例风险模型。
Kaplan-Meier生存曲线是一种非参数方法,用于估计生存时间和生存概率。
它将个体的生存时间按照事件是否发生进行分类,并计算每个时间点上的生存概率。
SPSS中可以通过选择“Analyze”菜单下的“Survival”子菜单中的“Nonparametric Tests”来进行Kaplan-Meier 生存曲线分析。
Cox比例风险模型是一种半参数方法,用于估计生存时间和危险因素对生存的影响。
它可以考虑多个危险因素,并通过估计每个危险因素的风险比来评估其对生存的影响。
SPSS中可以通过选择“Analyze”菜单下的“Survival”子菜单中的“Cox Regression”来进行Cox比例风险模型分析。
除了Kaplan-Meier生存曲线和Cox比例风险模型,SPSS还提供了其他生存分析方法,如Log-rank检验、Proportional Hazard模型等。
将生存时间按从小到大顺序排列如下:
表1 BCG治疗组生存情况
*死亡=1;删失=0
表2 药物和BCG结合治疗组生存情况
*死亡=1;删失=0
按上述二表将数据输入SPSS软件,其中数据编号为i,列(1)即时间为t,列(3)即生存结局为status,表1为group1,表2为group2。
选择Analyze中的Survival里的Kaplan-Meier分析,将Time,Status,Factor依次选定,option和Compare Factor依次设定完成后,得到输出结果,结果分析如下:
Survival Table中:
1为BCG治疗组患者生存率(Estimate)及其标准误(Std. Error)的计算结果。
2为药物与BCG结合治疗组患者生存率(Estimate)及其标准误(Std. Error)的计算结果。
Overall Comparisons
Test of equality of survival distributions for the different levels of group.
两组生存率的log-rank检验
H0:两种疗法患者生存率相同
H1:两种疗法患者的生存率不同
α=0.05
采用SPSS软件对两组生存率进行检验,得到上面Overall Comparisons表,其中第一行为LogRank检验结果。
即X2=0.057,P=0.811。
按α=0.05水准,不拒绝H0,还不能认为用BCG疗法和用药物与BCG结合疗法治疗黑色素瘤患者的生存率有差别。
生存曲线如上图所示,其中生存时间为横轴,生存率为纵轴。
实战利⽤SPSS进⾏⽣存分析⽤SPSS软件进⾏⽣存分析给⼤家介绍3种常⽤⽅法寿命表法、Kaplan-Meier分析法、Cox回归分析⼀、寿命表分析适⽤于⼤数据⽰例:若要研究性别对于肺病⽣存率有⽆区别,收集数据下列信息time:⽣存时间(单位天)status:0=存活,1=死亡sex:1=男,2=⼥操作步骤按步骤将数据导⼊(lung数据集来⾃于R 内置数据)选定寿命表分析⽅法对各选项进⾏设置(其中注意状态设置:选取表⽰事件已发⽣的值)设置完所有选项后确认得到结果(可进⾏导出)1.得到存活表:该表给出了男⼥对应时间内存活和死亡⼈数,并计算了存活率、风险⽐等统计量2.中位数⽣存时间:即⽣存率为50%时,⽣存时间的平均⽔平;可知:⽣存时间的平均⽔平⼥⼠⾼于男⼠3.⽣存函数:男⼠较⼥⼠累计⽣存率下降快⼆、Kaplan-Meier分析适⽤于⼩样本⽰例:若要研究药物治疗对卵巢癌⽣存率有⽆区别,收集数据下列信息futime:⽣存时间(单位天)fustat:0=存活,1=死亡rx:1=未治疗,2=治疗操作步骤:按步骤将数据导⼊(ovarian数据集来⾃于R内置数据)选定Kaplan-Meier分析法,并对选项进⾏设置设置结束后确认,得到结果(可进⾏导出)1.⽣存表的均值和中位数、百分位数:可以看出治疗与未治疗有均值、四分位数略有差异2.整体⽐较:检验结果p值>0.05,证明治疗组与⾮治疗组差异不显著3.存活函数:治疗组较⾮治疗组⽣存结果好,但从假设检验结果来看差异不明显三、Cox回归分析⽰例:若要研究结肠癌治疗⽅式对患者⽣存时间的影响,收集了下⾯所⽰的数据:time:⽣存时间(单位天)status:0=存活,1=死亡rx:治疗⽅式,Obs=观察,Lev=⽅式1,Lev+5FU=⽅式2obstruct:0=⽆阻塞的结肠肿瘤,1=有阻塞的结肠肿瘤perfor:0=⽆结肠穿孔,1=有结肠穿孔extent:传播程度:1 =黏膜下层,2 =肌⾁,3 =浆膜,4 =相邻结构操作步骤:导⼊结肠癌colon数据(R中内置数据)选定cox回归分析参数设置:协变量依次导⼊,⽅法按分析所需进⾏选择点击'分类',协变量依次选⼊分类协变量点击'绘图',勾选⽣存函数,主要变量为rx,将rx变量选⼊单线框中,绘制⽣存曲线点击'选项',设置输出RR的95%置信区间。
第十四章生存分析在临床诊疗工作的评价中,慢性疾病的预后一般不适合用治愈率、病死率等指标来考核,因为其无法在短时间内明确判断预后情况,为此,只能对患者进行长期随访,统计一定时期后的生存或死亡情况以判断诊疗效果。
这就是生存分析。
第一节Life Tables过程14.1.1 主要功能调用此过程时,系统将采用即寿命表分析法,完成对病例随访资料在任意指定时点的生存状况评价。
14.1.2 实例操作[例14-1]用中药+化疗(中药组,16例)和单纯化疗(对照组,10例)两种疗法治疗白血病患者后,随访记录存活情况如下所示,试比较两组的生存率。
中药组对照组随访月数是否死亡随访月数是否死亡10 21213 18 6 19 26 9 8 6 43 9 4 31 24 否是是否否是是否是是是是否否21371161113177是否是是否否否否否14.1.2.1 数据准备激活数据管理窗口,定义变量名:随访月数的变量名为TIME,是否死亡的变量名为DEATH,分组(即中药组与对照组)的变量名为GROUP。
输入原始数据:随访月数按原数值;是否死亡的,是为1,否为0;分组的,中药组为1,对照组为2。
14.1.2.2 统计分析激活Statistics菜单选Survival中的Life Tables...项,弹出Life Tables对话框(图14.1)。
从对话框左侧的变量列表中选time,点击 钮使之进入time框;在Display Time Intervals栏中定义需要显示生存率的时点,本例要求从0个月显示至48个月,间隔为2个月,故在0 through框中输入48,在by框中输入2。
选death,点击 钮使之进入Status框,点击Define Event...钮弹出Life Tables:Define Event for Status Variable对话框,在Single value栏中输入1,表明death = 1为发生死亡事件者;点击Continue钮返回Life Tables对话框。
SPSS生存分析过程SPSS生存分析是一种统计方法,用于分析生存数据,以估计特定事件发生的概率。
生存数据通常指描述个体或物体生存时间的时间数据,以及相关因素对个体生存时间的影响。
生存时间可以是一些事件的发生时间,例如死亡,失业,或者产品的失效时间。
1.数据准备:首先,需要将生存数据导入到SPSS软件中。
生存数据通常包含两列:一列是“时间”变量,表示每个个体从起始时间开始到特定事件发生的时间段;另一列是“事件”变量,表示该事件是否发生(例如,1表示事件已发生,0表示事件未发生)。
如果数据还包含其他相关因素,例如个体特征或处理组别,也需要导入到SPSS中。
2.生存函数估计:在SPSS软件中,选择“生存分析”功能,在对话框中选择合适的数据集和变量。
然后,在“非参数生存估计”选项中,选择适当的方法来估计生存函数。
常见的生存函数估计方法有卡普兰-梅尔法(Kaplan-Meier)估计和纳尔逊-艾伦估计。
此过程将计算每个时间点的生存率和累积生存率。
3.生存曲线绘制:在生存函数估计后,可以选择将生存曲线绘制出来以直观地展示结果。
在SPSS软件中,选择“曲线图”选项,在对话框中选择适当的数据集和变量。
然后,选择“生存曲线”类型,并进行必要的设置,例如选择颜色和样式。
生成的生存曲线可以展示不同组别或条件下的生存状况。
4.半参数模型拟合:半参数模型(如Cox比例风险模型)可以用来研究不同因素对生存时间的影响。
在SPSS软件中,选择“生存分析”功能,在对话框中选择合适的数据集和变量。
然后,在“半参数模型”选项中选择适当的模型,例如Cox比例风险模型。
进行模型拟合后,可以查看各个因素的风险比(Hazard Ratio)和置信区间,了解不同因素对生存时间的影响。
5.结果解释:对于生存分析的结果解释,需要考虑生存率、生存曲线及相关因素的影响。
可以根据生存函数估计结果和生存曲线来比较不同组别、条件或处理下的生存状况。
通过半参数模型拟合的结果,可以解释不同因素对生存时间的影响程度和方向。
SPSS教程第十五课:生存分析信息来源:本站原创更新时间:2004-7-12 21:11:00在临床诊疗工作的评价中,慢性疾病的预后一般不适合用治愈率、病死率等指标来考核,因为其无法在短时间内明确判断预后情况,为此,只能对患者进行长期随访,统计一定时期后的生存或死亡情况以判断诊疗效果。
这就是生存分析。
第一节 Life Tables过程14.1.1主要功能调用此过程时,系统将采用即寿命表分析法,完成对病例随访资料在任意指定时点的生存状况评价。
14.1.2实例操作[例14-1]用中药+化疗(中药组,16例)和单纯化疗(对照组,10例)两种疗法治疗白血病患者后,随访记录存活情况如下所示,试比较两组的生存率。
14.1.2.1 数据准备激活数据管理窗口,定义变量名:随访月数的变量名为TIME,是否死亡的变量名为DEATH,分组(即中药组与对照组)的变量名为GROUP。
输入原始数据:随访月数按原数值;是否死亡的,是为1,否为0;分组的,中药组为1,对照组为2。
14.1.2.2 统计分析激活Statistics菜单选Survival中的Life Tables...项,弹出Life Tables 对话框(图14.1)。
从对话框左侧的变量列表中选time,点击 钮使之进入time框;在Display Time Intervals栏中定义需要显示生存率的时点,本例要求从0个月显示至48个月,间隔为2个月,故在0 through框中输入48,在by 框中输入2。
选death,点击 钮使之进入Status框,点击Define Event...钮弹出Life Tables:Define Event for Status Variable对话框,在Single value栏中输入1,表明death = 1为发生死亡事件者;点击Continue钮返回Life Tables 对话框。
选group,点击 钮使之进入Factor框,点击Define Range...钮,弹出Life Tables:Define Range for Factor Variable对话框,定义分组的范围,在Mininum框中输入1,在Maxinum框中输入2,点击Continue钮返回Life Tables对话框。
SPSS Survival(生存分析)菜单SPSS Survival菜单包括Life Tables过程、Kaplan-Meier过程、Cox Regression过程、Cox w/Time-Dep Cov过程。
这里只介绍Life Tables过程和Kaplan-Meier过程。
Life Tables过程Life Tables过程用于:1、估计某生存时间的生存率。
2、绘制各种曲线如生存函数、风险函数曲线等。
3、对某一研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,控制另一因素后对研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,包括从总体上比较和不同水平之间进行两两比较。
一、建立数据文件定义两个列变量:时间变量:取名“time”,label标上“survival time(week)”。
生存状态变量:取名“status”,并赋值:0=“删失”,1=“死亡”。
二、操作过程从菜单选择1、Analyze==>Survival ==>Life Tables2、Time框:选入time3、Display Time Intervals框:在by前面的框内填入生存时间上限,本例填入20(此区间必须包括生存时间的最大值);在by后面的框内填入生存时间的组距,本例填入5,以保证结果列出“15-”的组段。
4、Status框:选入status;击define events钮,在single value框右边的空格中输入15、单击Option按钮,弹出对话框:●Life Table(s) 输出寿命表,系统默认● Plots: 选Survival(累积生存函数曲线)击Continue6、单击OK钮附:界面说明图1 寿命表主对话框【Time】框选入生存时间变量。
【Display Time Intervals】框欲输出生存时间范围及组距。
在by前面的框内填入生存时间上限,本例填入200(此区间必须包括生存时间的最大值);在by后面的框内填入生存时间的组距,本例填入20,以保证结果列出“100-”的组段。
【1059.】生存分析单因素筛选的困惑生存分析时既考虑结局是否发生,同时又考虑发生时间的统计分析方法,常用有寿命表法、Kplan-meier法和COX回归。
然而在发表SCI论文中,建立多因素模型,一般步骤先单因素筛选变量,然后多因素分析,可是单因素筛选到底用KM法,还是单因素Cox回归,常常有人会困惑,如下面这位?生存分析单因素的困惑我是统计小白,近期看大部分文献做生存分析COX分析都是先做单因素分析,然后做多因素分析。
问题:1.这个单因素分析是用KM做,还是用cox模型一个变量一个变量的做单因素分析?相关查询未有明确结果,看园子里有些评论说不存在单因素COX分析,这里道理如何理解。
2.是否要对所有的变量进行多因素分析,还是对单因素分析有意义的做多因素分析?还是应该如何抉择纳入哪些变量?问题参考1.所谓初级统计说一说,中级统计比一比,高级统计找关系;其实统计最最难的就是找关系,就是建模型;建模目前没有金标准,只有适当的建模策略;2.单因素筛选:KM和单因素COX都可以;但KM法只适用于分类变量,如性别与预后的关系,您可以按照性别分组进行KM,但是如果你研究年龄与预后的关系,年龄是连续性变量,您是无法进行KM 的,但是单因素COX就可以;当然性别也可以进行单因素COX进行筛选;3.关于变量筛选这是一个大话题,目前至少 3种理论,分别为全入法,逐步法和10%变化法,以后有机会再详谈一下!统计思维与统计理论系列[1]---统计思维与理论系列---【1058.】4种最常用的统计设计解读【1057.】SPSS统计软件学习终身不忘之必杀技【1056.】回归家族的书剑恩仇录,高手进阶必经之路【1055.】单因素是危险因素,多因素却保护因素了,想逆天吗?【1054.】这种文章统计套路您一定要学,不管你什么专业通杀【1053.】这个空白对照到底要不要加?【1052.】同一肝癌患者,同时接受CT、超声和磁共振,如何分析?【1051.】来自临床真实问题,有点意思,松哥荐读!【1050.】知道两组数据的样本量均数标准差,怎么算合并统计量呢?【1049.】meta分析软件Revman5.3卡死解决方案【1048.】P>0.05,本身就是没意义还是样本量不够?【1047.】两因素方差分析,如何判断哪个因素对结果影响较大?【1046.】带基线数据数值变量如何进行统计分析辨析【1045.】统计学习之最大困惑!!【1044.】松哥为啥我318样本量统计分析出来确实400样本量?【1043.】这两个是啥图?区别和联系【1042.】变量之间到底是单项转化还是双向转化【1041.】统计水平自我评估表【1040.】基线分析的3个终极目的【1039.】统计小白的学习路径【1038.】SCI论文中Logistic回归模型“门当户对”原则,松哥心得推荐给您【1037.】被我们忽视的生存分析区间删失数据【1036.】Logistic回归文章的SCI审稿人意见解读【1035.】统计学上的2K效应,你发现了没?【1034.】正态分布的3个基因密码,聆听大自然心跳的代码!【1033.】生存分析K-M法与COX回归结论不一致怎么办?【1032.】异常值的处理只有删除?【1031.】没有比较就没有伤害,让咱们互相伤害吧,教你4大类统计伤害方法【1030.】SCI审稿人让我控制2个单因素无意义的变量?【1029.】量表评价是信度重要还是效度重要?【1028.】Meta分析要解决的首要任务【1027.】文章材料与方法中统计方法如何描述【1026.】这个到底是啥统计设计?一起来看看!【1025.】聚类分析稳定性判别的经验总结【1024.】“参数检验与非参数检验”哪个更好?【1023.】干预前后数据统计分析方法【1022.】听完四个小故事,你就明白主成分分析是啥意思了!【1021.】方差分析P>0.05,两两比较LSD法P<0.05,这可咋整?【1020.】等级与等比,可得分清楚!【1019.】频率与概率,如胶又似漆!【1018.】终于发现不用学习,顿悟统计的方法【1017.】倾向性评分后数据,应该采用配对设计还是成组设计?【1016.】统计必学的4个核心思想【1015.】加权最小二乘回归是什么鬼?【1014.】平行性检验到底应该啥时候做?【1013】统计的4维空间(一维一层天)【1012】到底做相关?还是方差分析呢?【1011】这篇文章凭啥这样分组呢?【1010】常用统计分析方法选择图解【1009】P<0.05也别理直气壮,统计也会犯错,还分犯I类和II 类错误?【1008】文章鉴析:这篇文章或许有10处不适!【1007】R×C卡方的Fisher确切概率法为什么会有卡方值【1006】大小优指标如何同时制作ROC曲线[经验技巧]【1005】统计方法与统计思想谁重要?【1004】别说相关太简单,且听松哥说相关【1003】正态分布10种鉴别方法汇总【荐藏】【1002】连续变量变成等级变量后,原来有意义的变量变得没意义了?【1001】SCI论文中的P for trend是什么鬼?为什么高分文章经常采用呢------------------------------。