分子生物学2-10章的名词和简答23页

二核小体：核小体是构成真核生物染色质的基本结构单位，是DNA和蛋白质构成的紧密结构形式染色质由DNA和蛋白质(组蛋白和非组蛋白)组成染色质丝，是细胞核染色体主要存在形式。

内含子/外显子：在初始转录产物mRNA加工产生成熟mRNA时，被切除的非编码序列称为内含子；在成熟的mRNA或蛋白质中存在的相应序列称为外显子正超螺旋：两股以右旋方向缠绕的螺旋，在外力往紧缠的方向捻转时，会产生一个左旋的超螺旋，以解除外力捻转造成的胁变。

这样形成的螺旋为正超螺旋。

负超螺旋：两股以右旋方向缠绕的螺旋在外力向松缠的方向捻转时，产生一个右旋的超螺旋以解除外力捻转造成的胁迫。

这样形成的超螺旋为负超螺旋。

半保留复制DNA复制时亲代DNA的两条链解开，每条链作为新链的模板，从而形成两个子代DNA分子，每一个子代DNA分子包含一条亲代链和一条新合成的链。

复制叉一个正在复制的DNA双螺旋分子复制处解链呈Y形的部位。

滚环复制DNA复制的一种方式。

复制叉沿着环状模板链滚动，每一轮新合成的一圈DNA链取代上一轮合成的DNA链，由此产生线状多联体DNA分子。

校正作用有些基因在突变过程中丢失的遗传信息可能通过RNA的编辑得以恢复ARS酵母细胞基因组中能够充当复制起始位点的DNA序列。

能够支持质粒在真核细胞中进行独立复制。

转座子具有完整转座元件的功能特征并能携带内外源基因组片段思考题：(1)DNA一级结构：是指4种核苷酸的连接及排列顺序，表示了该DNA分子的化学构成。

DNA的二级结构：是指两条脱氧多核苷酸链反向平行盘绕所形成的双螺旋结构。

DNA的三级结构：是指DNA中单链与双链、双链之间的相互作用形成的三链或四链结构。

(2) 原核生物基因组的特点：基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成。

只有一个复制起点。

有操纵子结构。

编码蛋白质的结构基因是单拷贝的，但rRNA基因往往是多拷贝的。

非编码的DNA所占比例很少，类似病毒基因组。

基因组DNA 具有多调控区。

与真核生物类似，具有可移动的DNA序列真核生物基因组的特点：1.基因组较庞大：2.大量重复顺序3.大部分为非编码序列4. 转录产物是单顺反子5.真核基因是断裂基因，有内含子结构6.存在大量的顺式作用元件。

7．存在大量的DNA多态性8.具有端粒结构3) DNA的半保留复制机制；DNA 在进行复制的时候链间氢键断裂，双链解旋分开，每条链作为模板在其上合成互补链，经过一系列酶（DNA聚合酶、解旋酶、链接酶等）的作用生成两个新的DNA分子。

子代DNA分子其中的一条链来自亲代DNA ，另一条链是新合成的，这种方式称半保留复制。

4) DNA复制精确性的分子机理;1.严格的碱基配对2.DNA聚合酶对碱基的选择3.DNA聚合酶的校读功能4.修复（错配修复、切除修复、重组修复、直接修复、SOS）三转录：以DNA的碱基序列为模板,在RNA聚合酶催化下合成互补的单链RNA分子的过程。

模板链：DNA复制或转录时作为模板指导新核苷酸链合成的DNA链。

多顺反子：编码多条多肽链的顺反子。

5’帽：真核生物mRNA的5'端有特殊的帽子(cap)结构。

它由甲基化鸟苷酸经焦磷酸与mRNA的5'末端核苷酸相连，形成5',5'-三磷酸连接(5',5'-triphosphate linkage)。

3’polyA尾巴：通常位于mRNA上的150-200个腺苷酸残基（又称为特殊的尾巴结构）。

UTR（Untranslated Regions)即非翻译区，是信使RNA（mRNA）分子两端的非编码片段。

5'-UTR：从mRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子，3'-UTR从编码区末端的终止密码子延伸至多聚A尾巴（Poly-A）的末端。

启动子：决定RNA聚合酶转录起始位点的DNA序列。

原核-10区(Pribnow box)和-35区(Sexfama box：原核生物基因的-10区含保守的共有序列(consensus sequence)“TATAAT”(Pribnow box或-10序列)，-35区含TTGACA共有序列. -35序列(Sexfama box)与RNA聚合酶对启动子的特异识别有关, -10区富含A-T对，利于DNA局部解链, -10与-35之间的距离明显影响转录速率。

TATA box(Goldberg-Hogness box):在起始位点+1上游约20-30bp处, TATA 盒结合RNA聚合酶参与转录起始.动物和低等真核中的一致序列为TATA(A/T)A；CAAT box:约在启动子的-80处，动物和低等真核中的一致序列为GC(T/C)CAATCT；增强子：增强基因启动子工作效率的顺式作用序列，能够在相对于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)上都发挥作用。

RNA的剪接从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去内含子，并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。

变位剪接：许多基因可进行可变剪接将不同的内含子切除，外显子和内含子均可选择地被切除或保留而产生不同mRNA分子并具有特殊功能。

核酶：一类具有催化活性的核糖核酸RNA编辑：是RNA分子上一种转录后修饰现象，包括插入、缺失或核苷酸的替换思考题：（1）原核生物mRNA的特征1) 半衰期短：转录与翻译同步，翻译没有完成可能mRNA 5’端就开始降解；2) 多顺反子形式：操纵子-功能相关的几个基因一起转录为一条mRNA 分子；3) 无5’帽结构，3’没有或很短polyA尾巴真核生物mRNA的特征mRNA前体长5-10倍以上，加工为成熟mRNA的结构与DNA序列有差异：1) 5’端存在帽结构2) 3’端polyA尾巴真核细胞mRNA结构为：5’cap-5’UTR-coding region-3’UTR-polyA tail，病毒mRNA亦是单顺反子结构。

UTR为DNA转录没有加工的不翻译区。

2)RNA转录的基本过程及加工方式转录的基本过程包括模板识别、转录起始、通过启动子及转录的延伸和终止。

1.模板识别阶段主要指RNA聚合酶与启动子DNA双链相互作用并与之相结合的过程。

转录起始前，启动子附近的DNA双链分开形成转录泡以促使底物核糖核苷酸与模板DNA的碱基配对。

2、转录起始就是RNA链上第一个核苷酸键的产生。

3、转录起始后直到形成9个核苷酸短链是通过启动子阶段，通过启动子的时间越短，该基因转录起始的频率也越高。

4、RNA聚合酶离开启动子，沿DNA链移动并使新生RNA链不断伸长的过程就是转录的延伸。

5、当RNA链延伸到转录终止位点时，RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯键，RNA-DNA杂合物分离，这就是转录的终止。

加工方式:切除内含子(剪接)、加帽、加尾等，以及甲基化、巯基化、异戊烯化、假尿苷形成.3)列举几个RNA转录的顺式作用元件(如TATA box)及其作用方式INR: 转录起始+1上游邻近序列, 确定真正的起始位点, 一致序列为PyAPyTCPyPyPy(HIV-1、ML病毒)；TATA box:在起始位点+1上游约20-30bp处, TATA盒结合RNA聚合酶参与转录起始.动物和低等真核中的一致序列为TATA(A/T)A；四名词解释移码突变：在基因编码区，核苷酸插入或缺失导致三联体密码子阅读方式的改变，从而使该基因的相应编码序列发生改变。

简并密码：一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象称为密码子的简并性（degeneracy）。

具有简并性的密码子就叫作简并密码子。

第二密码系统：结合不同氨基酸的不同tRNA结构被氨酰-tRNA合成酶识别；蛋白质翻译后残基的修饰及多肽的折叠方式氨基酸活化：由氨酰-tRNA合成酶催化氨基酸与其对应tRNA结合形成氨酰-tRNA多核糖体：在蛋白质合成过程中，结合在信使核糖核酸（mRNA）上的一簇正在合成肽链的核糖体。

每个核糖体可以独立完成一条肽链的合成。

信号肽：分泌蛋白新生肽链N端的一段20～30氨基酸残基组成的肽段。

将分泌蛋白引导进入内质网，同时这个肽段被切除。

蛋白质的折叠许多蛋白或多或少的折叠为其最终的三维形状。

半胱氨酸间形成的二硫键(—S—S—)可稳定多肽链的排布。

多肽链的折叠由其氨基酸顺序决定而不是随机折叠为多种形式，折叠的动力学过程非常迅速(1s)，肽链先产生二级结构如螺旋和平面，而后通过疏水区段的堆积连系为“熔球”(molten globule)状态，然后氢键和疏水互作形成域及亚域并进行对接(docking)－扩散-碰撞，成为最终折叠状态。

分子伴侣：存在于原核生物和真核生物细胞质以及细胞器中可协助新生肽链正确折叠的一类蛋白质。

简答题-1)原核生物蛋白质合成机制;机制：1.氨基酸的活化；2.翻译的起始；3.肽键的生成；4.肽链的终止；5.蛋白质前体的加工；6.蛋白质的折叠；7.蛋白质合成的抑制剂；遗传密码的破译及其特征;破译：以均聚物，随机共聚物和特定序列的共聚物为模板指导多肽的合成；2.核糖体结合技术。

特征：1.密码的连续性；2.密码的简并性；3.密码的通用性与特殊性4；密码子与反密码子的相互作用。

原核与真核生物核糖体的组成与结构；原核生物核糖体的组成：由50S和30S大小亚基组成,大亚基含23S rRNA、5S rRNA和蛋白质，小亚基含16S rRNA和蛋白质。

真核生物核糖体的组成：由60S和40S大小亚基组成，大亚基为28S、5.8S 和5S rRNA,小亚基为18S rRNA，及多种蛋白质.蛋白质合成后转运的分子机制。

1.线粒体蛋白质的跨膜运输:(通过线粒体膜的蛋白质是在合成以后再运转的。

这个过程有如下特征：①通过线粒体膜的蛋白质在运转之前大多数以前体形式存在，它由成熟蛋白质和N端延伸出的一段前导肽（leader peptide）共同组成。

②蛋白质通过线粒体内膜的运转是一种需能过程；③蛋白质通过线粒体膜运转时，首先由外膜上的Tom受体复合蛋白识别与Hsp70或MSF等分子伴侣相结合的待运转多肽，通过Tom和Tim组成的膜通道进入线粒体内腔。

)2.叶绿体蛋白质的跨膜运输:(叶绿体定位信号肽一般有两个部分，第一部分决定该蛋白质能否进入叶绿体基质，第二部分决定该蛋白能否进入类囊体。

在这一模型中，蛋白质运转是在翻译后进行的，在运转过程中没有蛋白质的合成。

)五名词解释限制性内切酶: 一种在特殊核甘酸序列处水解双链DNA的内切酶。

Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化，又催化非甲基化的DNA的水解；而Ⅱ型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解。

粘性末端与平末端：限制酶的切口不都是一长一短的, 一长一短的叫黏性末端,一样长的叫平末端.克隆：一个共同前体通过无性繁殖而形成的一群基因结构相同的细胞或个体。