双向凝胶电泳技术原理与应用
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双向电泳技术的原理及应用1. 原理双向电泳技术是一种分离和鉴定蛋白质的常用方法。
它结合了凝胶电泳和电泳移动的优势,可以在同一实验中实现更高的分辨率和更好的分离效果。
双向电泳的原理基于两个关键因素:分子大小和电荷。
在实验中,蛋白质样品首先沿一个方向进行电泳。
由于蛋白质的不同大小和电荷,它们会在凝胶中形成不同的带状图案。
然后,凝胶会旋转90度,使蛋白质在垂直方向上进行电泳。
这样一来,蛋白质会在另一个方向上发生分离。
双向电泳的核心是双向凝胶,其结构类似于二维网络。
在第一个方向上,凝胶中的蛋白质会形成一维图案,而在第二个方向上,蛋白质会形成另一维图案。
通过对这两个图案的分析,可以得到更为准确的蛋白质信息。
2. 应用2.1 蛋白质分离和纯化双向电泳技术在蛋白质分离和纯化中有着广泛的应用。
由于双向电泳可以提供更高的分辨率,可以分离和鉴定更多的蛋白质。
这在研究蛋白质结构和功能以及疾病诊断中具有重要意义。
2.2 蛋白质组学研究双向电泳技术在蛋白质组学研究中发挥着重要作用。
通过双向电泳,可以分离出复杂样品中的蛋白质,并获得其质量和电荷信息。
这些信息可以用于鉴定蛋白质和研究其功能。
2.3 药物研发双向电泳技术在药物研发中也有广泛的应用。
通过双向电泳,可以分离和鉴定药物的靶点,进一步了解药物与蛋白质的相互作用机制。
这对于药物设计和优化具有重要意义。
2.4 分子生物学研究双向电泳技术在分子生物学研究中有着重要的应用。
通过双向电泳,可以鉴定蛋白质的表达变化,从而了解基因表达调控机制。
这对于研究细胞功能和疾病发生机制具有重要意义。
2.5 环境监测双向电泳技术在环境监测中也有着广泛的应用。
通过双向电泳,可以分离和鉴定环境中的污染物,从而评估环境质量和污染程度。
这对于环境保护和治理具有重要意义。
3. 优缺点3.1 优点•分辨率高:双向电泳可以提供更高的分辨率,可以分离和鉴定更多的蛋白质。
•信息丰富:双向电泳可以获得蛋白质的质量和电荷信息,有助于了解蛋白质的结构和功能。
¹双向电泳技术原理及其应用刘上峰 傅俊江 综述 李麓芸 审校(中南大学湘雅医学院人类生殖工程研究室,湖南长沙410078)摘要:双向电泳技术是蛋白质组研究的核心技术之一,本文对其基本原理、分辨率、可重复性、相关数据库、减法分析等作了介绍,并对其今后的发展方向作了展望。
关键词:双向电泳; 蛋白质组; 数据库;减法分析中图分类号:R318133 文献标识码:A 文章编号:100121773(2002)022*******随着后基因组时代的到来,蛋白质组学应运而生。
双向电泳(tw o 2dimensional electrophoresis,22D E)作为蛋白质组研究的三大关键核心技术之一(另二种是质谱技术和计算机图像数据处理与蛋白质组数据库即蛋白质组信息学),仍然是目前分析组份复杂蛋白质分辨率最高的工具,因此日益受到人们的广泛关注。
1 双向电泳的基本原理首先根据蛋白质等电点不同在pH 梯度胶中等电聚焦(isoelec tric f ocusing,IEF)将其分离,然后按照它们的分子量大小在垂直方向或水平方向进行十二烷基磺酸钠2聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS 2PAG E)第二次分离。
根据第一向等电聚焦条件的不同,可将22DE 分为三种系统:第一种系统是在聚丙烯酰胺凝胶中进行,两性电解质在外加电场作用下形成梯度,该系统称为IS O 2D A L T 。
其主要缺点是pH 梯度不稳定,重复性差,上样量低,不利于不同实验室间进行图谱比较;如果第一向电泳使用丙烯酰胺和Immobilines 共聚,形成具有pH 梯度的凝胶,这种系统称为IPG 2D AL T 系统,该系统pH 梯度稳定,不依赖于外加电场,基本上克服了ISO 2D AL T 的主要缺点,无论是重复性和上样量均优于I SO 2D AL T;第三种是非平衡pH 梯度电泳(nonequilibrium pH gradient electrophoresis,NEPhG E),主要用于分离碱性蛋白质,电泳展开时间相对比较短。
双向电泳的原理应用1. 原理介绍双向电泳是一种用于分离和分析蛋白质的技术。
它利用电场的力作用将蛋白质分子根据其大小和电荷分离成不同的带状条带,从而实现对蛋白质的分离和分析。
在双向电泳中,电泳液在两个方向(水平和垂直)上施加电场。
水平的电场用于推动蛋白质分子在凝胶中移动,而垂直的电场用于将蛋白质分子根据其电荷进行分离。
2. 双向电泳的步骤双向电泳通常包括以下几个步骤:2.1 凝胶制备首先制备凝胶,常用的凝胶包括聚丙烯酰胺凝胶和聚酰胺凝胶。
凝胶的选择取决于所要分析的蛋白质的分子量范围。
2.2 样品制备将待分析的蛋白质样品进行处理,通常包括蛋白质提取、蛋白质纯化和蛋白质标记等步骤。
2.3 水平电泳将样品加载到凝胶上,并将凝胶放入水平电泳槽中。
施加水平电场后,蛋白质会根据其分子量在凝胶中移动,形成水平方向上的分离。
2.4 凝胶固定水平电泳后,将凝胶固定,通常使用乙醇或甲醛进行固定,以防止蛋白质在后续步骤中的移动。
2.5 垂直电泳固定后的凝胶被垂直放置,然后施加垂直电场。
此时,蛋白质会根据其电荷进行进一步的分离。
2.6 染色和可视化分离完成后,凝胶通常会被染色,以便观察和分析分离的蛋白质条带。
常用的染色方法包括银染和荧光染色。
3. 双向电泳的应用双向电泳在蛋白质分离和分析方面具有广泛的应用。
3.1 蛋白质组学研究双向电泳可以用于研究蛋白质组学,包括蛋白质的组成、结构和功能等。
通过双向电泳可以分离出不同的蛋白质条带,从而有助于研究蛋白质的表达和变化。
3.2 蛋白质质量测定双向电泳可以用于测定蛋白质的质量。
通过与已知质量的蛋白质进行比较,可以确定待测蛋白质的质量范围。
3.3 蛋白质互作研究双向电泳还可以用于研究蛋白质之间的相互作用。
通过在凝胶中一同加载多个蛋白质样品,可以观察到不同蛋白质之间的相互作用。
3.4 蛋白质标记双向电泳常常与蛋白质标记技术结合使用。
通过将蛋白质样品与荧光染料或同位素标记剂结合,可以在凝胶上可视化和定量分析蛋白质。
简述双向电泳的原理
双向电泳是一种在凝胶电泳中使用的技术,用于分离和分析DNA、RNA、蛋白质等生物分子。
其原理是利用两个方向的电场来推动待分离的生物分子,以便在凝胶中获得更好的分离效果。
在双向电泳中,首先在一个方向上施加电场,使待分离的生物分子向一个方向移动。
然后,改变电场的方向,使其在另一个方向上移动。
这样,生物分子会在两个方向上进行移动,从而实现更好的分离效果。
双向电泳的原理涉及到凝胶电泳和电泳技术。
在凝胶电泳中,待分离的生物分子会在凝胶矩阵中随着电场的作用而移动,根据其大小和电荷的不同而被分离开来。
而双向电泳则是在凝胶电泳的基础上,通过改变电场的方向,使生物分子在两个方向上移动,以获得更好的分离效果。
双向电泳在生物分子分离和分析中具有重要的应用,尤其在蛋白质分离和分析中,可以帮助科研人员更准确地分离和鉴定不同的蛋白质。
通过掌握双向电泳的原理和技术,科研人员可以更好地开展生物分子研究,为生命科学领域的发展做出贡献。
总之,双向电泳的原理是利用两个方向的电场来推动待分离的生物分子,在凝胶中实现更好的分离效果,具有重要的生物分子分离和分析应用。
凝胶电泳的原理及应用1. 基本原理凝胶电泳是一种常用于分离、检测和纯化生物分子的技术,它利用凝胶介质和电场作用下生物分子的电荷和尺寸的不同,将其分离并可视化。
其基本原理如下:•凝胶选择:凝胶用于电泳分离通常包括聚丙烯酰胺凝胶(Polyacrylamide Gel)和琼脂糖凝胶(Agarose Gel),根据目标分子的尺寸选择适当的凝胶类型。
聚丙烯酰胺凝胶适合分析蛋白质、寡核苷酸和核酸片段等小尺寸分子,而琼脂糖凝胶则适用于大尺寸分子的电泳分离。
•凝胶浓度:凝胶电泳中凝胶浓度的选择取决于待分离的分子大小范围。
通常,较低浓度的凝胶适用于分离大分子,而较高浓度的凝胶适用于分离小分子。
•DNA电泳:DNA电泳是凝胶电泳的一种常见应用,其基本原理是根据DNA碱基对对电场的响应来分离DNA分子。
DNA分子在电场中会迁移,根据DNA长度和电泳时间,可以确定目标DNA片段的大小。
2. 应用领域凝胶电泳的应用非常广泛,涉及的领域包括:基因克隆、基因测序、蛋白质分析和病毒检测等。
下面列举几个典型的应用:•基因克隆:凝胶电泳可用于筛选、分离和提取目标基因,通过将DNA片段与载体连接并经过电泳分离,可以获得所需的目标基因。
•基因测序:凝胶电泳在基因测序中起到关键的分析作用。
通过将DNA片段经过凝胶电泳分离,便于进行DNA序列的测定和分析。
•蛋白质分析:凝胶电泳也可用于蛋白质的分析。
通过将蛋白质样品经过凝胶电泳分离,可以确定蛋白质的分子量和纯度,进而进行蛋白质结构和功能的研究。
•病毒检测:凝胶电泳在病毒检测中的应用越来越普遍。
通过将病毒核酸样品经过凝胶电泳分离,可以快速检测病毒的存在和数量。
3. 凝胶电泳操作步骤下面是凝胶电泳的一般操作流程:1.准备凝胶:根据样品大小选择合适的凝胶浓度,并根据需要添加缓冲液和染料等物质。
2.注射样品:将待测样品加入凝胶槽中,确保注射样品量适中。
3.加载标记物:为了确定分子的大小,可以加入标记物,如DNA分子量标记物或蛋白质分子量标记物等。
双向电泳的概念和原理双向电泳是一种采用两个方向的电场同时作用于凝胶电泳系统的技术,用于分离复杂样品中的蛋白质或核酸。
首先,将样品溶解于含有凝胶的电泳缓冲液中。
凝胶是一种聚合物网状结构,可以限制分子的运动,将其分离。
常见的凝胶材料包括聚丙烯酰胺凝胶和琼脂糖凝胶。
第一步是水平电泳。
在水平电泳阶段,一个方向的电场施加在凝胶中,使得带电分子向着相应的电极方向移动。
这个方向通常被称为水平方向,因为它从一个电极移动到另一个电极。
在水平电泳过程中,由于分子的大小和电荷不同,它们将以不同的速度在凝胶中运动。
大分子移动缓慢,小分子移动快速。
这样,分子根据大小按照一定的顺序移动,导致它们在凝胶中排列成一条通常是呈斜角的直线。
这个方向通常被称为水平电泳通道。
第二步是垂直电泳。
在水平电泳结束后,垂直电场被施加在凝胶中,使分子以另一个方向移动。
这个方向通常被称为垂直电泳通道。
在垂直电泳过程中,分子将根据它们的电荷大小被拖曳向上(正电流)或向下(负电流)。
正电流将使分子向上移动,而负电流将使分子向下移动。
这样,分子将根据其电荷被分离并在凝胶中形成一条平行于水平电泳通道的直线。
最终,两个方向的电泳都完成后,在凝胶上会形成一个类似网格的结构,其中分子被分离成不同的带状。
这些带状物可以被染料或放射性示踪剂探测出来,从而确定分离出的分子的位置。
总结起来,双向电泳是一种利用两个方向的电场移动分子的方法。
通过水平电泳和垂直电泳,分子根据其大小和电荷被分离成不同的带状,从而实现复杂样品中蛋白质或核酸的分离和分析。
蛋白质双向凝胶电泳原理及应用一、双向凝胶电泳(2-DE)的原理双向凝胶电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE)的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,蛋白质沿pH梯度分离至各自的等电点;第二向则按分子量的差异用SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶进行分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。
近年来经过多方面改进已成为研究蛋白质组的最有使用价值的核心方法。
二、关键参数分辨率和可重复性。
目前,双向凝胶电泳的一块胶板(16cm×20cm)可分出3~4千个,甚至1万个可检测的蛋白斑点。
采用固定化pH梯度胶,克服了载体两性电解质阴极漂移等许多缺点而得以建立非常稳定的、可以随意精确设定的pH梯度。
建立很窄的pH范围(如0.05U/cm),对意向区域在pH范围内做第二轮分析,从而大大提高分辨率,威斯腾生物实验中心对这方面的研究比较全面和成熟。
灵敏度。
双向凝胶电泳灵敏度较高的银染色法可检测到4ng蛋白,最灵敏的是用同位素标记,20ppm的标记蛋白可通过其荧光或磷光的强度而测定。
双向凝胶电泳用图像扫描仪、莱赛密度仪、电荷组合装置可把用上述方法得到的蛋白图谱数字化,再经过计算机处理,就可以给出所有蛋白斑点的准确位置和强度,得到布满蛋白斑点的图像,即“参考胶图谱”。
三、蛋白质组研究的主要困难对用双向凝胶电泳分离出来的蛋白,进行定性和定量分析。
双向凝胶电泳最常用的方法是先把胶上的蛋白印迹到PVDF膜上后再进行分析,确定是已知还是未知蛋白。
现在的分级分析法是先做快速的氨基酸组成分析,也可先做4~5个循环的N末端微量测序,再做氨基酸组成分析;结合在电泳胶板上估计的等点电和分子量,查对数据库中已知蛋白的数据,即可作出判断。
四、蛋白质的翻译后修饰和加工指在肽链合成完成后进行的化学反应,如磷酸化、羟基化、糖基化、二硫键形成等,可能有一百种以上。
双向凝胶电泳翻译后修饰和加工对蛋白质的正常生理功能是必需的,它们的变化往往和疾病的发生有关。
双向凝胶电泳技术原理与应用Principle and application of two-dimensional gelelectrophoresis姓名:XX班级:检查本科1113班学号:XXX【摘要】人类基因组筹划与美国塞莱拉遗传信息公司于在美国《科学》杂志和英国《自然》杂志联合宣布,她们绘制出了精确、清晰、完整人类基因组图谱,至此,人类基因组筹划已基本完毕,随着后基因组时代到来,蛋白质组学得到了空前发展,蛋白质组研究旨在揭示基因表达真正执行生命活动所有蛋白质表达规律和生物功能。
涉及蛋白质组、蛋白质组学、功能蛋白质组学和构造基因组学等新概念提出,蛋白质组学已成为当今生物领域中极其活跃学科。
其中双向电泳(two-dimensional electrophoresis,2.DE)是蛋白质组研究三大核心核心技术之一【abstract】Human gene group plans and United States sailaila genetic information company Yu in United States Science under magazine and United Kingdom natural under magazine joint announced,they draws out has accurate,and clear,and complete of human gene Group map,at this point,human gene group plans has basic completed,as Hou gene group era of comes,protein group learn get has unprecedented of development,protein group research aimed at reveals gene express of real implementation life activities of all protein of express law and biological function. Includes proteome,proteomics,structural proteomics and functional genomics of new concepts,such as proposed,proteomics has become extremely activein the field of biological sciences. Two-dimensional gel electrophoresis (two-dimensional electrophoresis,2.DE) is one of the three key core technologies of proteome research【核心词】双向电泳;蛋白质组学;后基因组时代【 key words 】two-dimensional electrophoresis,2.DE proteomics Post-genomics era【前言】由于蛋白质等电点和分子量是两个彼此不有关重要性质,而2.DE同步运用了蛋白质间这两个性质上差别分离蛋白质,因而2.DE分离能力非常强大,它甚至能将细胞中5000种蛋白分离开,2.DE在分离蛋白混合样品、比较差别方面有不可代替作用,结合质谱鉴定技术可查明大型蛋白复合物各组组分,与其她生物技术如分子生物学、分子遗传工程、免疫学、微量蛋白质自动氨基酸序列分析相结合,可以迅速精确地发现和鉴定新蛋白质。
双向电泳的原理及应用1. 原理双向电泳是一种重要的分析技术,常用于蛋白质分离与分析。
其原理基于电泳的基本原理,即物质在电场中受到电荷、质量和形状等因素的共同作用,从而在电场中发生运动。
双向电泳通过对样品进行两个方向的电场应用,实现更高分辨率和更好的分离效果。
在双向电泳中,通常使用一种特殊的电泳胶介质,如聚丙烯酰胺凝胶。
这种凝胶具有较低的电导率,在电场作用下可以形成均匀的凝胶基质。
样品中的蛋白质等分子在凝胶中进行移动,并且根据其电荷、大小和形状等特性,会在凝胶中形成不同的运动带。
双向电泳分为两个步骤:水平电泳和垂直电泳。
在水平电泳过程中,样品在水平方向上进行迁移,此时电场垂直于凝胶表面。
水平电泳的主要目的是将样品在水平方向上分离。
在水平电泳完成后,凝胶需要旋转90度,以改变电场的方向。
然后进行垂直电泳,在垂直方向上进行迁移实现更好的分离效果。
2. 应用双向电泳在生化研究、蛋白质分析和疾病诊断等领域有着广泛的应用。
以下是双向电泳的几个主要应用:2.1 蛋白质分离与分析双向电泳被广泛用于蛋白质的分离与分析。
由于双向电泳具有更高的分辨率和更好的分离效果,因此可以更准确地分离出复杂的蛋白质混合物。
通过双向电泳,可以确定蛋白质的分子量、等电点和表达量等参数,从而有助于对蛋白质的功能和调控机制进行研究。
2.2 蛋白质组学研究蛋白质组学是研究生物体内所有蛋白质的组成、结构、功能和相互作用等的科学研究领域。
双向电泳作为蛋白质组学研究中的一种重要技术,可以用于发现新的蛋白质、识别蛋白质变异以及研究蛋白质表达与疾病之间的关系。
2.3 差异蛋白质的筛选差异蛋白质是指在不同生物状态或疾病状态下表达差异显著的蛋白质。
双向电泳技术可以用于筛选并分离出差异蛋白质,通过比较不同样品中的蛋白质模式,可以挖掘出与特定生物过程、疾病发生和进展相关联的差异蛋白质。
2.4 新药研发与药物安全性评价双向电泳技术可以应用于新药研发以及药物安全性评价等领域。
双向凝胶电泳的原理双向凝胶电泳是一种常用的蛋白质分离技术,其原理基于电泳的原理和凝胶电泳的原理。
电泳原理:电泳是利用物质在电场中的带电性质而产生的运动现象。
在电场中,带电的分子或离子会受到电场力的作用而向相对带电性质相反的极移动。
电泳实验中,通常使用平行的电极极板,形成一个电场,分子或离子会在电场中进行迁移和分离。
凝胶电泳原理:凝胶电泳是在分离过程中使用凝胶作为介质,使得被分离物质在凝胶中进行迁移和分离。
凝胶是具有三维网状结构的聚合物或芯粒,可以提供一定的分子筛效应,使得分子按照大小逐渐沉积。
分子越大,迁移速度越慢,分离效果越好。
双向凝胶电泳原理:双向凝胶电泳是在凝胶电泳的基础上,通过在电泳过程中改变电场方向,实现不同方向上的分离。
通常情况下,第一维电泳是水平电场电泳,第二维电泳是垂直电场电泳。
具体步骤如下:1. 首先,将样品加入到凝胶电泳样品槽内,通常是在蛋白质样品中加入还原剂和样品缓冲液,使其在电泳过程中具有一定的带电性质。
2. 准备两个平行的平板凝胶,其中一个用于第一维电泳,另一个用于第二维电泳。
凝胶通常是聚丙烯酰胺凝胶或聚丙烯酰胺-琼脂糖双层凝胶。
第一维电泳凝胶的方向通常是水平的,第二维电泳凝胶的方向通常时垂直的。
3. 将第一维电泳凝胶浸泡在浸泡液中,然后将电泳样品加入到凝胶中定位。
开启电源,施加电场使样品在凝胶中迁移并分离,直至达到预期的分离效果。
可以根据需要调整电场的强度和时间。
4. 当第一维电泳结束后,将凝胶取出并固定,然后将其放入第二维电泳凝胶中。
将电泳样品加入到第一维凝胶的上方定位。
5. 开启电源,施加电场使样品在第二维凝胶中迁移并分离,直至达到预期的分离效果。
6. 最终,根据分子的大小和电荷,样品中的蛋白质会在凝胶中形成一系列分离带,可以通过染色等方法观察和分析分离结果。
通过双向凝胶电泳,可以实现对复杂混合物中的蛋白质的分离和分析,便于进一步的研究和应用。
双向凝胶电泳技术原理与应用Principle and application of two-dimensional gelelectrophoresis姓名:XX班级:检验本科1113班学号:XXX【摘要】人类基因组计划与美国塞莱拉遗传信息公司于2001年在美国《科学》杂志和英国《自然》杂志联合宣布,他们绘制出了准确、清晰、完整的人类基因组图谱,至此,人类基因组计划已基本完成,随着后基因组时代的到来,蛋白质组学得到了空前的发展,蛋白质组研究旨在揭示基因表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物功能。
包括蛋白质组、蛋白质组学、功能蛋白质组学和结构基因组学等新的概念的提出,蛋白质组学已成为当今生物领域中极其活跃的学科。
其中双向电泳(two-dimensional electrophoresis,2.DE)是蛋白质组研究的三大关键核心技术之一【abstract】Human gene group plans and United States sailaila genetic information company Yu 2001 in United States Science under magazine and United Kingdom natural under magazine joint announced, they draws out has accurate, and clear, and complete of human gene Group map, at this point, human gene group plans has basic completed, as Hou gene group era of comes, protein group learn get has unprecedented of development, protein group research aimed at reveals gene express of real implementation life activities of all protein of express law and biological function. Includes proteome, proteomics, structural proteomics and functional genomics of new concepts, such as proposed, proteomics has become extremely active in the field of biological sciences. Two-dimensional gel electrophoresis (two-dimensional electrophoresis,2.DE) is one of the three key core technologies of proteome research【关键词】双向电泳;蛋白质组学;后基因组时代【 key words 】two-dimensional electrophoresis,2.DE proteomics Post-genomics era【前言】由于蛋白质的等电点和分子量是两个彼此不相关的重要性质,而2.DE 同时利用了蛋白质间的这两个性质上的差异分离蛋白质,因此2.DE的分离能力非常强大,它甚至能将细胞中的5000种蛋白分离开,2.DE在分离蛋白混合样品、比较差异方面有不可替代的作用,结合质谱鉴定技术可查明大型蛋白复合物各组组分,与其他生物技术如分子生物学、分子遗传工程、免疫学、微量蛋白质的自动氨基酸序列分析相结合,可以快速准确地发现和鉴定新的蛋白质。
【荧光定量PCR的基本原理】【1-3】双向电泳由于具有高分辨率和高灵敏度已成为分析复杂蛋白混合物的基本工具[1]。
自1975年O'Farrel等[2]建立这种技术后,已有许多改进,使得这一技术日趋完善。
2-DE是利用蛋白质的带点性和分子量大小的差异,通过两次凝胶电泳达到分离蛋白质的技术。
第一向电泳是依据蛋白质的等电点不同,通过等电聚焦电泳(isoelec-tricfocusing,IEF)将不同净电荷的蛋白质在PH梯度介质中外加电场作用形成分离的蛋白质区带。
然后将凝胶包埋在SDS-PAGE 凝胶板上端,根据蛋白质分子量的不同,在垂直或水平方向进行十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),即第二向电泳;在IEF中,蛋白质因等电点不同而被分离;在SDS.PAGE中,不同分子量的蛋白质相互间被分离开,再用考马斯亮兰或银染进行检测[3],经Pdquest等软件对结果进行比对、解析。
【双向电泳技术应用过程中的关键步骤】1、样品制备(蛋白提取)(1)细胞培养、处理和收集;(2)将细胞在IEF裂解缓冲液中溶解;蛋白质的溶解常采用含有8mol/L 尿素、4%[3-(3-胆胺丙基) –丙磺酸](SHAPS)、50~100mmol/L DTT 和40mmol/L Tris的样品缓冲液。
样品溶解得不好会减少分离到的蛋白质数量,同时会造成等电聚焦时某些蛋白质的沉淀,从而减少转移到第二向电泳的蛋白质数量。
(3)将样品离心以去除不溶的细胞碎片和DNA,提取上清,-80℃保存。
2、蛋白质定量和上样(1)第一向电泳——等电聚焦;目前广泛采用的是固相pH梯度(immobiline pH gradient,IPG)水平等电聚焦。
常用固相PH梯度-道尔顿双向电泳法(isoelectricpoint-dalton,ISO-DALT)。
IPG胶的制备主要是利用不同PK固定化电解质的组合可配制不同PH范围的凝胶。
(2)IPG的平衡;由于第一向电泳的缓冲液系统与第二向电泳的缓冲液系统完全不同,因此,胶条由第一转移到第二之前,必须进行平衡。
平衡过程分两步:第一步平衡液的成分主要是Tris缓冲液、SDS、DTT、尿素和甘油。
平衡的主要作用是使第一向胶体上的蛋白质变性。
平衡液中的尿素和甘油可以增加溶液的粘度,减少由固相化的两性电解质造成的电内渗。
SDS用于变性蛋白质,使蛋白质带上负电。
DTT是为了在蛋白质与SDS充分结合的同时,二硫键液得到还原;这对第二向SDS-PAGE来讲是十分重要的。
第二步平衡液是用碘乙酰胺代替DTT。
IPG胶条的平衡目的主要是进行蛋白质的烷基化以及让电泳介质达到与第二向SDS-PAGE相同的缓冲体系。
(3)第二向SDS-PAGE;由于SDS带有大量负电荷,当其与蛋白质结合时,所带的负电荷大大超过了天然蛋白质原有的负电荷,因而消除或掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异,均带有相同密度的负电荷,不再受蛋白质原有的电荷和形状的影响,而取决于椭圆棒的长轴长度,即蛋白质或亚基的分子量大小。
(4)蛋白质检测用考马斯亮兰染色或银染色。
银染法是通过将胶浸泡于含阴离子的溶液内,然后洗掉胶面上非紧密结合的金属离子,加入某些试剂使与胶内蛋白结合的银离子形成金属银来显色。
效果如下图:蛋白质组谱呈满天星状(蛋白质双向图谱中每个点代表样本中的一个或数个蛋白质,根据Cartesin坐标系统,从左到右显示的是PI的增加,从下到上显示的是分子质量的增加)3、图像分析及数据处理将染色后的凝胶放在GS.710光密度扫描仪上,扫描后的图像用PDQUEST2.D 软件分析,选择部分匹配的蛋白质斑点进行比较。
[IPG的优点]【4】(1)pH梯度稳定、聚焦准确、精度高;(2)无阴极漂移及碱性蛋白丢失的现象;(3)蛋白上样量大,可提高低含量成分的分辨效果;(4)样品中盐的干扰少,无边缘效应;(5)pH梯度、分离结果重现性好[4]。
[在双向电泳应用中所面临的问题]许多疏水性蛋白质(如膜蛋白)不溶于样品缓冲液,相对分子质量过大(>200×10 3 ),极端酸性或碱性蛋白在电泳过程中易丢失,2.DE不能分辨。
低含量组分易被高含量组分遮蔽,降低了分辨率。
蛋白在提取和消化过程中的丢失、凝胶的污染、在不影响分辨率情况下的上样量多少等都是尚待解决的问题。
[双向电泳在医学研究中的应用]【5-15】1 人类疾病的蛋白质组研究(1)直肠癌直肠癌的发生是一个多基因突变导致抑癌基因失活、癌基因活化的过程。
Sanchez等[5]对15例结肠癌和13例正常人的结肠上皮进行2.DE,结果发现在相对分子质量为13000和等电点(PI)值为5.6处的蛋白质仅出现在结肠癌的组织中。
其中15例患者的癌细胞中有13例13000.PI5.6蛋白有上调趋势(87%)。
此外,发现此种蛋白不仅在中度、低度分化的结肠癌及有24年病史的溃疡性结肠炎过度表达,而且出现在7例分化程度不同腺瘤的癌前病灶中,但对照组则很少出现,这表明该蛋白的出现对检测早期直肠癌有重要临床意义。
(2)肝癌 Peter等在用N.甲基.N.亚硝基脲诱导的小鼠肝癌中,用2.DE及氨基酸微型测序可分辩出肝癌诱导的醛糖还原酶样的蛋白质(35×10 3 .PI7.4),此种蛋白质在肝癌、胎肝中有高表达。
经免疫组化证实,肝癌诱导的醛糖还原酶样的蛋白质在成人肝脏中不表达,但在小鼠的肝癌中又重新表达,同时发现该蛋白在癌前病变及肝癌中表达强烈,而在肝脏周围的正常组织不表达[6],表明该蛋白可能与肝癌的发病有很大关系。
(3) 膀胱癌丹麦的一个小组利用2.DE,并结合了蛋白印迹法、微型序列分析及质谱技术分析了150例膀胱癌病人的组织,发现角蛋白10、14及银屑病相关的脂肪酸结合蛋白等可作为膀胱癌不同分化程度的标记物[7]。
(4) 肾癌 Sarto等[8]在对肾癌的研究中发现有4种蛋白质存在于正常肾组织而在肾癌细胞中缺失,其中2种分别是辅酶Q蛋白色素还原酶和线粒体泛醌氧化.还原复合物I,这提示线粒体功能低下可能在肿瘤发生过程中起重要作用(5) 扩张型心肌病扩张型心肌病是一种严重的可导致心衰的心脏病,其发病机制尚不明确,推测可能为多种因素所致。
Knecht等[9]采用2.DE取得了3300个心肌蛋白条带,通过氨基酸序列分析,Edman降解法及基质辅助的激光解吸离子化质谱(MALDI.MS)等分析了其中150条,经活检及病理检查证实,有12条为扩张型心肌病特有的蛋白。
(6) 类风湿关节炎(RA)和骨性关节炎(OA) RA是一种常见的慢性炎性关节疾病,常侵犯多个关节,主要累及手足小关节,病情迁延反复,主要的病理变化为关节滑膜的慢性炎症、细胞浸润、血管翳形成、软骨及骨组织侵蚀,导致关节结构的破坏,功能丧失。
而OA的基本病理改变为多种致病因素引起的进行性关节软骨变性、破坏及丧失,关节软骨及软骨下骨边缘骨赘形成,由此引起一系列的关节症状和体征。