Structure Search 化学结构检索
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化合物子结构检索
化合物子结构检索是一种基于化合物的子结构特征进行检索的方法。
通过输入化合物的子结构,系统会在数据库中搜索与该子结构相似的化合物,并返回相关的化合物列表。
进行化合物子结构检索的步骤如下:
1. 确定查询的子结构:首先需要确定想要查询的子结构,可以是一个特定的化学片段、基团或模式。
2. 选择合适的数据库:选择一个包含大量化合物结构的数据库,例如PubChem、ChemSpider等。
3. 提交查询:在数据库的检索界面中,选择“子结构检索”或类似的选项,并输入要查询的子结构。
4. 浏览结果:系统会返回与查询的子结构相似的化合物列表,可以浏览每个化合物的相关信息,例如名称、化学结构、性质等。
5. 筛选结果:可以根据化合物的相关信息进行筛选,找到最符合需求的化合物。
化合物子结构检索的优点是可以快速地找到与特定化学片段相关的化合物,适用于寻找具有特定生物活性或物理性质的化合物。
但是,该方法也有局限性,例如对于复杂的化学结构或非标准化学键的查询可能不太准确。
化学结构式检索化学结构式检索是一种用于查找化合物的方法,通过输入化合物的结构式,可以快速检索到相关的化学信息。
本文将介绍化学结构式检索的原理、应用以及常用的结构式检索工具。
一、化学结构式检索的原理化学结构式检索是基于化合物的结构式进行检索,其原理是根据化合物的结构特征,通过计算机程序对化合物数据库进行搜索,找出与输入结构式相似或相关的化合物。
常用的化学结构式检索方法包括子结构搜索、相似性搜索和精确匹配搜索。
1. 子结构搜索:根据输入的结构式中的子结构进行搜索,找出包含该子结构的化合物。
这种方法适用于已知的化合物结构式。
2. 相似性搜索:根据输入的结构式与已知化合物的结构式进行比较,计算它们之间的相似性指数,找出相似度较高的化合物。
这种方法适用于未知的化合物结构式。
3. 精确匹配搜索:根据输入的结构式与已知化合物的结构式进行完全匹配,找出与输入结构式完全一致的化合物。
这种方法适用于已知的化合物结构式。
化学结构式检索在化学领域有着广泛的应用。
以下是一些常见的应用场景:1. 新药研发:化学结构式检索可以帮助研究人员找到与目标分子结构相似或相关的化合物,从而加快新药研发的速度。
2. 化学品安全评估:化学结构式检索可以用于快速评估化学品的毒性和环境影响,为化学品的安全使用提供参考。
3. 化学教学和研究:化学结构式检索可以用于教学和研究中的化合物的查找和分析,为科学研究提供便利。
4. 化合物命名:化学结构式检索可以用于化合物的命名和标识,避免化学品命名的混淆和错误。
三、常用的结构式检索工具有许多化学结构式检索工具可供使用。
以下是几个常用的结构式检索工具:1. PubChem:PubChem是一个免费的化学结构式检索数据库,提供了大量的化合物信息和结构式搜索功能。
2. ChemSpider:ChemSpider是由皇家化学学会(Royal Society of Chemistry)开发的化学结构式检索系统,提供了全球最大的化学数据库和在线结构式搜索功能。
scifinder化学结构式检索Scifinder化学结构式检索引言:Scifinder是一种常用于化学领域的专业检索工具,它能够帮助化学研究人员快速准确地获取所需的化学结构式信息。
本文将介绍Scifinder化学结构式检索的基本原理和使用方法,以帮助读者更好地利用该工具开展化学研究。
一、Scifinder的基本原理Scifinder是一种基于化学结构式的检索工具,它通过分析和识别化合物的结构式,从庞大的化学数据库中提取与其相关的文献、专利和实验数据等信息。
其基本原理是通过化学结构式的比对和匹配,寻找具有相似结构和性质的化合物,并提供相关的文献和数据资源。
二、Scifinder的使用方法1. 登录与注册用户需要注册一个Scifinder账号并登录。
用户可以通过所在机构或组织的许可获取登录凭证,并按照要求填写个人信息完成注册。
2. 结构式检索在登录后,用户可以利用Scifinder进行化学结构式的检索。
用户可以输入化合物的结构式或者关键词等信息进行查询。
在输入结构式时,可以使用分子编辑器绘制化合物的结构式,或者直接复制粘贴已有的结构式。
3. 结果筛选与分析Scifinder将根据用户的查询条件,在数据库中检索相关的文献和数据信息,并将结果以列表的形式呈现给用户。
用户可以根据需求对结果进行筛选和排序,以获取最相关的信息。
4. 文献获取与下载在获取到相关的文献信息后,用户可以通过Scifinder提供的链接或DOI获取全文文献。
用户还可以将相关文献保存到个人文件夹或导出到其他文献管理工具进行管理和引用。
5. 数据分析与比较Scifinder不仅提供了文献资源,还包括了大量的实验数据和化学信息。
用户可以通过Scifinder进行数据的分析和比较,以支持其研究工作。
三、Scifinder的优势和应用1. 广泛的数据库资源Scifinder拥有庞大的化学数据库资源,包括了全球范围内的文献、专利和实验数据等。
化学结构式搜索原理
化学结构式搜索是一种用于搜索化合物结构的方法。
它基于化学结构式的特征来进行搜索,而不考虑文本标题或其他相关信息。
其原理基于化学结构式的特征匹配,通过比较不同化合物之间的结构式来寻找相似性或相同性。
在化学结构式搜索中,化合物的结构式通常通过线条结构式、键形式等方式表示。
这些结构式所包含的信息可以描述原子的种类、连接方式和空间结构等重要特征。
结构式搜索会根据这些特征来进行匹配和比较。
一种常见的化学结构式搜索方法是基于子结构搜索。
该方法通过识别给定结构式中的特定子结构来进行搜索。
例如,可以搜索所有含有苯环的化合物。
搜索引擎会匹配苯环的结构式,然后在数据库或文献中找到包含该结构的化合物。
另一种常用的化学结构式搜索方法是基于相似性搜索。
相似性搜索通过计算化合物结构式之间的相似性来寻找相似的化合物。
这种方法通常使用化学指纹或分子描述符来量化结构之间的相似性。
通过比较目标化合物与数据库中的化合物,可以找到结构类似或性质相似的化合物。
化学结构式搜索在许多领域中有着广泛的应用,如药物发现、材料科学和化学信息检索等。
它可以帮助化学家快速找到特定结构的化合物,加速研究进程并提供有用的结构信息。
新药研究相关数据库简介及检索方法(四)ChemPrep 数据库简介及检索方法一、数据库简介ChemPrep 数据库是由美国科技信息所(ISI)为世界各地的化学家提供的崭新而强大的有机化学反应光盘数据库,是当今先进的信息技术与迅猛增长的化学反应信息完美结合的典范。
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化学工作者看过来,可以在线查找化学结构式!1./cgi-bin/hsrun/Distributed/HahtShop/HAHTShop.htx;start=HS_SearchCenter中,选择Search Structures,然后,就可以分别根据:Product Name 和CAS登录号,还有Molecular Formula进行查找。
在这里查到的化合物基本都有一些参数和它的结构式(Structure Image),然后将图片保存成Gif即可!当然,如果你只知道化合物的结构式,不知道叫什么,可以选择下面的Sub Structure Search ,然后 Step 1 Choose a Drawing tool. I want to Download Kekule (requires download of Kekv214.exe) Step 2 Install the plug-in you downloaded in step 1 Close this browser. Return to the directory where you saved the plug-in and double click on the file name given in step 1. Step 3 Return to this page and click the "Structure Search"button. 安装好软件即可将画好的图片粘贴上即可查找,非常方便,我用它查了一些结构式,给了我一大堆,呵呵,本人化学方面英语不是很好,一个个查看才找到,不过还好是宽带,呵呵:-)2./大家去这儿看看,查询非常简单3.【推荐】【原创】能查几万个化合物的NMR IR谱图的网址 [精华]4.能查几万个化合物的NMR IR谱图的网址 SDBS Integrated Spectral Data BaseSystem for Organic Compounds http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/sdbs/owa/sdbs_sea.cre_frame_sea NIST WebBook /5.美国专利pdf全文下载的好地方 6.免费在线查合成路线/depts/chemistry/courses/toolkits/247/practice/m edialib/data/7.中科院上海有机化学研究所化学专业数据库http://202.127.145.134/tf123456/6543218.中科院上海有机化学研究所数据库(/lccdb/sjk.htm),免费注册使用,现在已经改版,性能提高许多。
化合物结构检索
化合物结构检索是一种通过输入或绘制化合物的结构式,在数据库中查找和匹配相关化合物的方法。
这种检索方法可以帮助研究人员快速找到具有特定结构的化合物,了解其性质和用途,以及进行化学分析和合成研究。
在进行化合物结构检索时,可以选择不同的数据库和软件进行查询,如SciFinder、Reaxys、ChemDraw等。
这些数据库和软件可以通过输入化合物的名称、分子式、结构式等信息,在数据库中查找和匹配相关化合物,并提供化合物的各种属性和数据。
除了数据库查询外,还可以使用化学结构绘图软件绘制化合物的结构式,并使用软件自带的检索功能进行结构式检索。
这些软件可以根据输入的结构式自动在数据库中查找匹配的化合物,并提供相关的属性和数据。
在进行化合物结构检索时,需要注意以下几点:
1. 确保输入的结构式正确无误,以免检索到错误的化合物。
2. 了解所使用的数据库和软件的属性和限制,以便更好地利用其功能。
3. 注意保护个人隐私和信息安全,避免泄露敏感信息。
4. 在进行化合物结构检索时,应该遵守相关的法律法规和伦理规范。
化学文献查询方法一、检索方法:学化学的人,如果刚进实验室的话,往往是两眼黑,不知道如何下手,要下手往往是漫天刷浆,抓不住重点!那么如何能抓住重点,进行有目的的去读一些论文呢?首先用google来看看你的研究方向,比如你研究某系列的天然物合成,那么你就用这个名字去search,然后先看看有没有中文的介绍,如果有的话,那么先看看它是不是review,最好的是找到中文的review,然后大体看以下,了解你要做的东西当前的进展,有什么人在做,结果如何啊。
然后按图索骥,找到英文的文献,那么可能有很多英文的文献,如何去选呢?选择发表在影响因子高的期刊上的文章来读!!!这个很重要!,因为大牛的教授都是把自己的好结果发在高水平的论文上的。
只要你找一篇比如是JOC上的文章,那么就要看好,里面是否引用了某些review,如果有的话,那么你就去找那个review,一般来说国外的高水平的review都是约稿的,请的是当前的牛教授来写的,有读的价值!依次你可以进行全面的了解相关的研究进展了。
如何对待中文的杂志呢?我的意见可能偏激,我认为完全没有任何读的价值!为什么呢?第一,20%的杂志覆盖了80%的内容,第二,IF太低,低于1的就是垃圾了,没有引起任何人的重视,那么这个结果是没有价值的。
第三,很多中文文献的重复性很差,数据被人为的修改。
那么对待英文呢?同样,低水平的也是很多,对于IF低于1的不要去看,就是看了也不要太当真,原因同中文文献一样,对于化学来说也就是不超过20个有意义的杂志吧,美国化学社的全部,德国的wiley上有几个很好的,sciencedirect上的几个影响因子在2以上的,英国化学社的全部,也就是这些了外加thieme的一个。
完整的检索分为两部分:①寻找相关的文献出处;②找到收录文献的数据库,或者使用相关软件,进行全文下载阅读。
第①步是重要的,第②步是次要的。
可以利用的三大检索工具:Beilstein的CrossFire;ISI的Web of Science;CA on CD。
如何利用化学命名/分子式/结构式来检索化学文献(Searching Chemical Literature:by Chemical Name/MolecularFormula/Chemical Structure)AbstractsSTN International is the online scientific and technical information network dedicated to meeting the information needs of scientists and information professionals throughout the world. The REGISTRY file of the STN database is a chemical dictionary and structure database that contains unique substance records identified by CAS. Records contain CAS Registry Numbers, chemical name, molecular formulas and structure diagrams, all of which are searchable. STN Express is an advanced front-end software package that works with your personal computer to provide streamlined searching of databases on STN. It will guide you through efficient online searches and enable you need more quickly and easily than ever before.一、前言享有『世界化学文献之钥』美名的化学摘要,它是由美国化学摘要服务社( Chemical Abstracts Service, CAS)所出版的,其在化学化工文献上的贡献地位是不容忽视的。
如何利用化学命名/分子式/结构式来检索化学文献(Searching Chemical Literature:by Chemical Name/MolecularFormula/Chemical Structure)AbstractsSTN International is the online scientific and technical information network dedicated to meeting the information needs of scientists and information professionals throughout the world. The REGISTRY file of the STN database is a chemical dictionary and structure database that contains unique substance records identified by CAS. Records contain CAS Registry Numbers, chemical name, molecular formulas and structure diagrams, all of which are searchable. STN Express is an advanced front-end software package that works with your personal computer to provide streamlined searching of databases on STN. It will guide you through efficient online searches and enable you need more quickly and easily than ever before.一、前言享有『世界化学文献之钥』美名的化学摘要,它是由美国化学摘要服务社( Chemical Abstracts Service, CAS)所出版的,其在化学化工文献上的贡献地位是不容忽视的。
化学结构式检索第一部分:学习数据库Dialog系统可以进行结构式检索的数据库:Beilstein Facts (File 390)Derwent Chemistry Resource (File 355)IMS Patent Focus (File 447,947)IMS R&D Focus (File 445,955)Index Chemicus (File 302)Pharmaprojects (Files 128,928)Prous Science Drug Data Report (File 452)Prous Science Drugs of the Future (File 453)390: Beilstein Facts389: (ONTAP Beilstein Facts)Beilstein 贝尔斯坦化学文摘(390,391,393号文档)是世界上最大的关于有机化学事实的数据库,数据来源于175种期刊,已收录9百多万个化合物和9百多万个反应。
作为最基本的化学文献数据库,Beilstein能帮助有机化学研究人员形成新思路、设计合成路径(包括起始原料和中间体)、确定生物活性和物理性质、了解外界环境对化合物的影响,等等。
主要数据的索引分为3部分:其中390 Beilstein Facts即化学物质部分收集了结构信息及相关的事实和参考文献,包括化学、物理和生物活性数据;391 Beilstein Reactions反应部分提供化学物质制备的详细资料,帮助研究人员用反应式检索特定的反应路径;393 Beilstein Abstracts文献部分包括引用、文献标题和文摘,化学物质部分和反应部分的条目与文献部分有超链接。
1771至今,季度更新。
355: Derwent Chemistry ResourceDerwent Chemistry Resource 德温特化学资源(355号文档)可对Derwent世界专利索引(Derwent World Patent Index,DWPI)和Derwent药学文档(Derwent Drug File,DDF)中的化学内容进行结构检索。
绘好化学结构后,便可以随时开始结构检索。
你能使用SciFinder 工具中的绘制功能或引用由其它应用程序所制备的结构文件。
检索例子检索结构如下选择以下其中一项。
(1) 完全相同化学结构检索。
(2) 亚结构检索 (参见第五章) 。
(3)相似结构检索(参考第六章) 。
在此,选择 (1) 的Exact Search。
然后点击确定,将结构导入检索界面。
Characteristic(s):物质类型Classes:物质分类Studies: 有关研究若要缩小检索范围至特定类型,可通过Characteristic(s),Classes,Studies等过滤选项设定。
点击Search继续检索,找出相同物质。
得出的结果会包含以下各类型的化合物。
•与已绘制的结构完全相同的物质•同位素化合物•配位化合物•单体组成的聚合物•离子化合物•原子基和离子基•异构体•互变异构体(包括酮-烯醇)SciFinder的检索所得出的结果,是以智能检索Smart search为基础,一个由CAS 建立的检索方法,并且通常将“完全相同化学结构检索”的结果数目扩至最大,令用户得到最全面的检索结果,减少遗漏。
例如,酮-烯醇互变异构、同位素、和单体组成的聚合物也被包括在检索结果中。
用户可按着个人的研究方向和兴趣改变过滤选项Filters的设定,便可缩小结果范围至理想结果。
有关智能检索Smart search 的详细资料,请参考附录A。
以下是检索到的结果。
显示与物质相关的参考文献(也可以使用Get References 键取得文献)。
显示物质的反应数据 (也可以使用Get Reactions 键) 。
显示物质的供货商数据 。
显示物质管制和注册数据 。
显示物质在SciFinder 里面永久链接。
先点击Substance Detail 可以查看该物质的详细信息,物质记录通常包括了CAS 登记号、化学结构、分子式、名称、物质物性、和相关数据等。
基于甲骨文数据库管理系统的化学结构检索数据库的设计与实现随着化学研究的不断深入,化学结构的检索成为了一项非常重要的工作。
然而,传统的化学结构检索方法往往需要大量的人力和时间,且效率较低。
为了解决这一问题,本文提出了一种基于甲骨文数据库管理系统的化学结构检索数据库的设计与实现方法。
一、研究背景化学结构检索是指通过化学结构的特征来检索相关的化合物信息。
传统的化学结构检索方法往往需要大量的人力和时间,并且效率较低。
为了提高化学结构检索的效率,许多研究者开始探索采用计算机技术来实现化学结构检索。
二、研究目的本文旨在设计一种基于甲骨文数据库管理系统的化学结构检索数据库,以提高化学结构检索的效率。
三、研究方法1. 数据库设计本文采用甲骨文数据库管理系统作为数据库平台,设计了一个化学结构检索数据库。
该数据库包含三个主要表:分子表、原子表和键表。
其中,分子表存储分子的基本信息,原子表存储分子中的原子信息,键表存储分子中原子之间的键信息。
2. 数据录入为了使数据库中的数据能够准确地反映实际化合物的情况,本文采用了两种数据录入方法:手动录入和自动录入。
手动录入是指通过人工输入数据的方式将数据录入数据库中;自动录入是指通过计算机程序自动将数据录入数据库中。
3. 数据检索本文采用了两种数据检索方法:基于结构的检索和基于属性的检索。
基于结构的检索是指通过输入化学结构的结构式来检索相关的化合物信息;基于属性的检索是指通过输入化合物的属性信息来检索相关的化合物信息。
四、研究结果1. 数据库设计本文设计的化学结构检索数据库包含三个主要表:分子表、原子表和键表。
其中,分子表存储分子的基本信息,原子表存储分子中的原子信息,键表存储分子中原子之间的键信息。
该数据库结构清晰,易于维护和更新。
2. 数据录入本文采用了两种数据录入方法:手动录入和自动录入。
手动录入是指通过人工输入数据的方式将数据录入数据库中;自动录入是指通过计算机程序自动将数据录入数据库中。