一、会计科目的增设
1、实行财政国库管理制度改革后，行政事业单位会计仍执行现行《行政单位会计制度》、《事业单位会计制度》，并根据支付改革会计核算的需要，在《行政单位会计制度》、《事业单位会计制度》资产类增设“零余额账户用款额度”（行政单位编号107，事业单位编号103，建设单位编号234）会计总账科目。
“零余额账户用款额度”科目用于核算单位在财政下达授权支付额内办理的授权支付业务。本科目借方，登记收到财政下达的授权支付额度；本科目贷方，登记授权支付的支出数；本科目借方余额反映未支用的授权支付额度。
增设“零余额账户用款额度”科目以后，预算单位实行国库集中支付改革前的“银行存款”资金，在“银行存款”科目下设置“特设帐户”、原资产类“银行存款”科目核算内容改变为预算单位的自筹资金收入、以前年度结余和各项往来款等。并按原渠道进行核算。
2、设立“财政应返还额度”科目
在资产类增设“财政应返还额度”（行政单位编号115，事业单位编号125，建设单位编号235）会计总账科目。财政直接支付年终结余资金账务处理时，借方登记单位本年度财政直接支付实际预算指标数与财政直接支付实际支出数的差额，贷方登记下年度实际支出的冲减数；财政授权支付
年终结余资金账务处理时，借方登记单位零余额账户注销额度数，贷方登记下年度恢复额度数（如单位本年度财政授权支付预算指标数大于零余额账户用款额度下达数，借方需同时登记两者差额，贷方登记下年度单位零余额账户用款额度下达数）。
二、行政事业单位日常会计核算
1、对财政直接支付的支出，预算单位根据财政国库集中支付中心委托代理银行转来的《财政直接支付入账通知书》及原始凭证（“工资”支出凭代发工资银行盖章转回的工资发放明细表），区别预算内、外资金进行会计核算，会计分录为：（1）预算内：
行政单位：
借：经费支出、库存材料等
贷：拨入经费——财政直接支付
事业单位：
借：事业支出、材料等
贷：财政补助收入——财政直接支付
（2）预算外：
行政单位：
借：经费支出
贷：预算外资金收入——财政直接支付
事业单位：
借：事业支出
贷：事业收入(财政专户返还收入)——财政直接支付
(3)建设单位：
借：器材采购、建筑安装工程投资等（预算内/外）
贷：基建拨款——本年预算拨款——财政直接支付
基建拨款——本年自筹资金拨款——财政直接支付
如果财政直接支付部分的支出构成新增固定资产的，应同时登记固定资产账，会计分录为：
借：固定资产
贷：固定基金
2、对财政授权支付，预算单位根据代理银行盖章的《财政授权支付额度到账通知单》，与分月用款计划核对，区别预算内、外资金登记入账，会计分录为：
（1）预算内：
行政单位：
借：零余额账户用款额度
贷：拨入经费——财政授权支付
事业单位：
借：零余额账户用款额度
贷：财政补助收入——财政授权支付
（2）预算外：
行政单位：
贷：预算外资金收入——财政授权支付
事业单位：
借：零余额账户用款额度
贷：事业收入(财政专户返还收入)——财政授权支付
（3）建设单位：
借：零余额账户用款额度
贷：基建拨款——本年预算拨款——财政授权支付
基建拨款——本年自筹资金拨款——财政授权支付
3、预算单位从单位零余额账户转账支付时，会计分录为：行政单位：
借：经费支出、库存材料等
贷：零余额账户用款额度
事业单位：
借：事业支出、材料等
贷：零余额账户用款额度
建设单位：
借：器材采购、建筑安装工程投资等（预算内/外）
贷：零余额账户用款额度
4、预算单位从零余额账户提取现金和支用时，会计分录为：行政单位：
借：现金
借：经费支出
贷：现金
事业单位：
借：现金
贷：零余账户用款额度
借：事业支出
贷：现金
建设单位：
借：现金
贷：零余额账户用款额度
借：器材采购、建筑安装工程投资等（预算内/外）
贷：现金
三、年终结余资金账务处理
（一）财政直接支付年终结余资金账务处理
各预算单位年终依据本年度财政直接支付预算指标数与当年财政直接支付实际支出数的差额作相关会计账务处理：1、行政单位
借：财政应返还额度——财政直接支付
贷：拨入经费(预算外资金收入)——财政直接支付
2、事业单位
借：财政应返还额度——财政直接支付
贷：财政补助收入(财政专户返还收入)——财政直接支付3、建设单位
借：财政应返还额度——财政直接支付
贷：基建拨款——本年基建基金拨款等—财政直接支付
下年度恢复财政直接支付额度时单位不做账务处理，单位发生实际支出时，借记支出类科目，贷记“财政应返还额度—财政直接支付”科目。
（二）财政授权支付年终结余资金账务处理
年底额度注销账务处理
1、各预算单位年终依据代理银行提供的对账单作相关注销额度的会计账务处理：
（1）行政单位
借：财政应返还额度——财政授权支付
贷：零余额账户用款额度
（2）事业单位
借：财政应返还额度——财政授权支付
贷：零余额账户用款额度
（3）建设单位
借：财政应返还额度——财政授权支付
贷：零余额账户用款额度
2、如单位本年度财政授权支付预算指标数大于零余额账户用款额度下达数，根据两者间的差额作相关会计分录：
