定量PCR的实验流程及注意事项
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荧光定量PCR实验操作流程1. 检查实验室条件在进行荧光定量PCR实验前,首先要检查实验室的环境是否适合实验。
实验室应该保持干燥、清洁和无菌。
检查PCR仪和读板器是否能正常运转,并准备所有必需的试剂和器械。
2. DNA/RNA的提取和纯化从组织和细胞中提取和纯化DNA/RNA是实验的第一步。
在提取和纯化DNA/RNA的过程中,需要保持无菌和正确的技术。
同时需要注意使用适当的缓冲液和酶切剂,以避免DNA/RNA的损伤和降解。
3. DNA/RNA质量检测检测DNA/RNA的质量和浓度,以确保实验结果的准确性。
可以使用紫外线光谱仪或其他质量检测设备。
同时,需要记录下每个样本的质量和浓度值。
4. 反转录如果需要检测RNA,需要首先进行反转录(Reverse Transcription,RT)。
反转录反应将RNA转录成相应的cDNA,可以使用逆转录酶和随机引物进行反转录反应。
5. 荧光定量PCR反应体系和引物设计荧光定量PCR反应体系包括模板DNA/RNA,荧光探针,引物和PCR反应缓冲液。
引物的设计是至关重要的,需要确保引物与目标序列的特异性和敏感性。
引物的设计可以使用NCBI或其他引物设计软件进行。
6. PCR反应设置PCR反应参数:温度梯度,反应时间和DNA量,浓度和样本装载量等。
注意反应器核心温度的控制,以确保反应的准确性和重复性。
7. 数据分析使用荧光定量PCR的结果进行数据分析。
可以使用数据分析软件,例如GenEx或其他软件。
计算出每个样本的阈值循环数(Ct值),并使用标准曲线法进行定量计算。
总之,荧光定量PCR是一种高灵敏度和高特异性的分子生物学检测技术,不仅可以用于基础研究,还可以用于临床诊断和治疗监测等领域。
在实验前需要认真准备,操作流程中需要注意无菌和正确的技术,以确保实验结果的准确性。
SteponePlus实时荧光定量PCR仪的操作流程及注意事项一、实验流程1.开机。
打开电脑,仪器,软件。
2.实验程序的设定。
参照实验指南,设定程序,具体的要根据不同的实验要求来决定。
3.样品的准备。
根据实际的实验需求处理样品,注意不要漏加或加错,同时注意不要产生荧光污染。
4.上机。
将样品按照程序中设定的顺序放置于RT-PCR仪的反应模块中,将模块推入到位。
注意耗材如果选用96孔板,直接放置在模块上,如果是单管或者8联管则需要使用tray来配合。
5.点击start run,开始运行程序。
二.实验程序的设定1.打开Stepone Plus的软件,进入Set up 的初级向导,按照向导的要求填写参数。
2.注意带红色星号的空为必须填写的内容,finish的时候会注意保存程序,如果需要进行板的重排,点击中间的plate edit 选项。
同时如果不做ROX校正,要把ROX校正的勾选框勾掉。
三、结果分析1.PCR反应结束以后,软件会自动计算标准曲线及Ct值等。
2.如需导出结果,可选择Export导出结果报告。
四、关闭运行仪器1、取出反应样品2、在仪器的触摸屏上进行仪器的关闭,此时仪器会暂时处于待机状态,方便下次实验快速进行。
3、按顺序关闭软件,PCR仪电源,电脑。
五.注意事项1.实验室要是要相关配套的耗材,切忌用不符合实验仪器要求的耗材,SteponePlus使用的是0.1ml反应体系的耗材。
2.每次实验时,注意不要将荧光染料沾染到反应管的管盖、管壁和反应模块上。
如果不小心沾染到反应模块上,应立即用水或70%的酒精清洗,用棉签擦洗干净,待干燥之后,可做一份空白板的实验,直至反应正常。
3.如果实验反应过程中电脑出现异常,此时反应会正常运行,反应结束后,整个实验的数据结果都存在机器中。
待电脑修复之后,可以从机器中将这个数据结果download至电脑中,进行数据的处理分析。
定量PCR实验设计和流程定量聚合酶链反应(quantitative polymerase chain reaction,qPCR)是一种用于测定DNA或RNA的相对或绝对数量的实验技术。
其基本原理是通过PCR扩增目标序列的DNA或RNA,然后利用荧光探针或染料测定PCR产物的数量。
以下是定量PCR实验的一般设计和流程:1.设计引物和探针:首先选择目标序列并设计引物和探针,引物应与目标序列能够特异性结合,而探针能够标记PCR产物并产生荧光信号。
设计引物和探针时需要考虑其长度、碱基组成和Tm值,以确保特异性扩增和最佳PCR反应条件。
2.样本处理:根据实验目的,收集样本并进行必要的处理,如提取DNA或RNA。
对于目标序列低浓度的样本,可能需要进行前处理步骤,如放大或浓缩。
3. 反应体系制备:准备PCR反应的组分,包括DNA或RNA模板、引物、探针、逆转录酶(如果需要进行逆转录反应)和PCR Master Mix(包含聚合酶、缓冲液和核苷酸等)。
4.PCR扩增反应:将反应体系加入PCR管或板中,然后进行PCR扩增反应。
PCR反应一般包括预变性(或逆转录)步骤、热循环扩增步骤和终止步骤。
热循环扩增步骤一般包括一系列温度变化,如变性、退火和延伸,以使DNA或RNA产生扩增。
热循环扩增的温度和时间可以根据实验设置。
5.荧光信号检测:采用荧光实时定量PCR仪检测PCR反应产物的荧光信号。
荧光探针一般会与PCR产物结合并产生荧光信号。
通过监测荧光信号的累积量,可以了解PCR反应的进程以及目标序列的相对或绝对数量。
6.数据分析:利用荧光信号检测得到的数据,进行相对或绝对定量。
相对定量是通过比较不同样本或不同时间点的荧光信号,来推断目标序列的相对数量。
绝对定量则需要使用标准曲线法,根据已知浓度的标准品的荧光信号,来计算未知样本中目标序列的绝对数量。
7.结果解读和验证:根据数据分析的结果来解读实验结果,比较不同样本之间的信号差异,并验证定量PCR实验的可靠性。
荧光定量PCR实验操作流程1、实验器材多样品研磨珠均质仪台式高速冷冻型微量离心机荧光定量PCR仪超净工作台分光光度计离心管TIP头2、主要实验试剂及耗材RNA提取液三氯甲烷异丙醇无水乙醇引物75%乙醇:HyPure TMMolecular Biology Grade Water配制离心管、TIP头均购湿热灭菌40min,干燥。
二、荧光定量PCR实验步骤1、总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶)1)取匀浆器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上预冷。
2)取100mg组织,加入到匀浆器中。
3)充分研磨直至无可见组织块。
4)12000rpm离心10min取上清。
5)加入250 μl三氯甲烷,颠倒离心管15s,充分混匀,静置3min。
6)4℃下12000rpm离心10min。
7)将上清转移到一新的离心管中,加入0.8倍体积的异丙醇,颠倒混匀。
8)-20℃放置15min。
9)4℃下12000rpm离心10min,管底的白色沉淀即为RNA。
10)吸除液体,加入75%乙醇1.5ml洗涤沉淀。
11)4℃下12000rpm离心5min。
12)将液体吸除干净,将离心管置于超净台上吹3min。
13)加入15μl无RNA酶的水溶解RNA。
14)55℃孵育5min。
15)使用UV1800检测RNA浓度及纯度:仪器空白调零后取2.5μl 待测RNA溶液于检测基座上,放下样品臂,使用电脑上的软件开始吸光值检测。
16)将浓度过高的RNA进行适当比例的稀释,使其终浓度为200ng/μl.左右。
2、反转录(枪头和PCR均经过湿热灭菌,无RNA酶)1)取一PCR管,加入含2μg RNA的溶液。
2)加入1μl 逆转录引物。
3)用无核糖核酸酶的去离子水补足至12μl。
4)于PCR仪上65℃保温5min,迅速置冰上冷却。
5)依次加入4μl 5×buffer,2μl 10mM dNTPs,1μl RNA inhibitor和1μl 反转录酶,用枪抽吸混匀。
pcr检测流程PCR(聚合酶链反应)是一种常用的遗传物质检测方法,可以快速、准确地检测出目标物质的存在与否。
下面将详细介绍PCR检测的流程。
一、实验准备在进行PCR检测之前,需要准备相应的实验试剂和设备。
实验试剂包括模板DNA、引物、聚合酶、缓冲液等。
设备包括PCR仪、离心机、电泳仪等。
确保实验室环境干净整洁,仪器设备无故障。
二、PCR反应体系的配制根据实验需求,按照一定的比例将所需试剂加入PCR反应管中。
通常,反应体系包括模板DNA、引物、聚合酶、缓冲液和去离子水。
确保各种试剂按照正确的比例加入,避免出现浓度偏差。
三、PCR反应的程序设置根据实验需求和所使用的PCR仪型号,设置PCR反应的程序。
程序设置包括温度和时间的设定。
一般情况下,PCR反应包括三个步骤:变性、退火和延伸。
变性温度通常在94-98℃之间,退火温度根据引物的Tm值确定,延伸温度通常在72℃左右。
四、PCR反应的进行将配制好的PCR反应体系放入PCR仪中进行反应。
反应过程中,PCR仪会按照预设的程序进行温度的升降,从而使DNA的变性、退火和延伸反应发生。
反应时间一般为数十分钟到数小时不等,具体根据实验需求而定。
五、PCR产物的分析PCR反应结束后,可以通过多种方法对PCR产物进行分析。
常用的方法包括琼脂糖凝胶电泳、荧光定量PCR、实时定量PCR等。
这些方法可以直观地观察PCR产物的大小、数量和纯度,从而判断PCR 反应的结果是否符合预期。
六、PCR结果的解读根据PCR产物的分析结果,可以对目标物质的存在与否进行判断。
如果PCR产物在琼脂糖凝胶电泳中出现了预期大小的条带,说明目标物质存在;如果没有出现预期大小的条带,说明目标物质不存在。
荧光定量PCR和实时定量PCR可以更精确地测量PCR产物的数量,从而判断目标物质的含量。
七、PCR结果的验证为了确保PCR结果的准确性和可靠性,通常需要进行结果的验证。
验证的方法包括重复实验、平行实验和阳性对照实验等。
PCR实验室操作流程PCR(聚合酶链反应,Polymerase Chain Reaction)是一种可以通过体外合成DNA的方法,也是现代生物技术中一项重要的分子生物学技术。
PCR技术的应用广泛,包括基因测序、基因突变检测、表达定量等。
下面是PCR实验室操作的一般流程。
1.设计引物:PCR实验的第一步是设计引物。
引物是用于扩增目标DNA片段的短链DNA序列。
两个引物分别对应目标序列的两端,其长度通常在18-24个碱基对之间。
引物的碱基序列必须与目标序列互补,以确保引物的结合和扩增特异性。
2. 制备PCR反应液:将PCR反应所需的试剂制备成PCR反应液。
PCR 反应液包括模板DNA、引物、聚合酶、反应缓冲液、dNTPs和Mg2+等。
聚合酶可以是常见的Taq聚合酶,也可以是其他高保真度的热稳定聚合酶。
反应缓冲液包含缓冲盐、pH调节剂和聚乙二醇等成分。
3.加热变性:PCR反应开始前,需要对DNA模板进行热变性,将其双链DNA解开成单链DNA,以供引物结合。
一般在95℃左右进行加热变性步骤,持续1-5分钟。
4.循环扩增:PCR实验主要包括循环扩增的步骤。
循环扩增主要分为三个步骤:变性、退火和延伸。
变性温度一般设置在94-98℃,可以使DNA双链变为单链;退火温度根据引物序列的特性来设计,一般设置在50-70℃之间,可以使引物与DNA模板序列结合;延伸温度一般为72℃,此温度下聚合酶能够合成新的DNA链。
5.PCR循环反复:PCR反应通常进行30-40个循环,每个循环包括变性、退火和延伸的三个步骤。
这样可以进行指数级扩增,生成大量目标DNA片段。
6. PCR产物检测:PCR反应结束后,可以通过凝胶电泳等方法对PCR产物进行检测。
将PCR产物与DNA分子量标记物一起电泳,可以通过与标准品比较得知扩增片段的大小。
也可以通过染色剂如SYBR Green等进行荧光定量,或者使用定量PCR方法定量扩增产物的数量。
7.结果分析和数据处理:根据PCR产物的结果进行数据分析和处理。
pcr定量检测流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。
文档下载后可定制随意修改,请根据实际需要进行相应的调整和使用,谢谢!Download Tip: This document has been carefully written by the editor. I hope that after you download, they can help you solve practical problems. After downloading, the document can be customized and modified. Please adjust and use it according to actual needs. Thank you!PCR定量检测流程如下:①样品采集:根据检测需求,采集相应的生物样本,如血液、唾液、组织等,确保样本新鲜且无污染。
②核酸提取:使用磁珠法、酚-氯仿法或盐析法等,从样本中提取纯化的DNA 或RNA,严格控制操作以防核酸降解和污染。
③试剂准备:配置PCR反应液,包括模板核酸、特异性引物、荧光探针、dNTPs、缓冲液及热稳定DNA聚合酶等。
④加样与封管:将配置好的反应液精确加入反应管中,每管含有所需的所有反应组分,密封管盖以防污染。
⑤仪器设置:在实时荧光定量PCR仪上设定实验参数,包括循环次数、退火温度、延伸时间和荧光采集模式等。
⑥循环扩增:仪器自动执行PCR循环过程,包括高温变性、适温退火和中温延伸,每次循环使靶序列呈指数扩增。
⑦荧光检测:在每次循环的延伸阶段,仪器实时监测荧光信号强度,代表扩增产物的累积。
⑧数据分析:通过仪器软件分析荧光信号随循环数增加的变化,计算Ct值(循环阈值),依据标准曲线定量原始模板量。
⑨结果判定:根据Ct值与已知标准品的比较,得出样本中靶基因的绝对或相对定量结果,判断阴阳性或表达水平。
定量PCR的实验流程及注意事项一、实验流程:1. Primer设计:为了进行定量PCR实验,需要设计一对与目标DNA 或RNA序列特异性结合的引物。
确保引物的特异性和互补性,通过使引物的浓度相等可以最大限度地提高PCR反应的扩增效率。
2.模板DNA或RNA提取:从细胞或组织中提取目标DNA或RNA。
可以使用商业化的DNA/RNA提取试剂盒或其他方法进行提取。
注意保持样品的完整性,避免污染和降解。
3.RNA逆转录(如果需要):如果目标是RNA,则需要使用反转录酶将mRNA转换为cDNA。
通常,使用逆转录酶和随机引物进行逆转录反应。
4. qPCR反应体系:准备PCR反应体系,其中包含引物、模板DNA或cDNA、酶(如Taq DNA聚合酶、逆转录酶等)和反应缓冲溶液。
同时还可以加入SYBR Green等荧光染料或探针以实现实时监测PCR反应的进行。
5.PCR反应条件:设置合适的PCR反应条件,如温度和时间等。
通常情况下,PCR反应会进行多个循环,每个循环包括退火、延伸和变性三个步骤。
6.实时检测PCR反应:在PCR反应过程中,使用实时荧光检测系统实时监测PCR产物的积累。
根据荧光信号变化的阈值周期数(Ct值),可以推断出目标DNA或RNA的初始浓度。
7.标准曲线构建:通过使用已知浓度的目标DNA或RNA来构建标准曲线。
将标准曲线与待测样品的Ct值进行比较,可以计算出目标物浓度。
8.数据分析:根据标准曲线和待测样品的Ct值,计算出目标物的相对或绝对浓度。
可以使用专业的数据分析软件对实验结果进行统计分析和解释。
二、注意事项:1.特异性引物设计:确保引物与目标DNA或RNA的特异性结合,避免引物与非目标序列的扩增。
2.制备PCR反应的质量控制:采用无菌、无核酸污染的试剂和实验环境,避免引入杂质干扰PCR反应。
3.避免PCR反应产物的污染:使用专门用品和设备进行PCR实验,避免引入外源性DNA或RNA。
4.逆转录反应的标准化:如果进行RNA定量PCR,应尽量标准化逆转录反应的条件,以获得准确的cDNA模板。
相对定量方法实际操作(三种常用方法)本人用的是相对荧光定量PCR法,在分子水平上比较课题中5 种新基因的表达差异。
实验进行很多次,感受颇深,同时遇到了一些问题:扩增效率、标准品选择(及赋值)、标准曲线、重复性等问题,希望有同行朋友一起探讨和指教。
parative Delta-delta Ct 法定量流程(RG6000 软件设置)1).先对样品中的目的基因与看家基因分别做标准曲线,基因的扩增效率是否一致或接近;将扩增效率优化为一致。
2).同一样品分别进行看家基因和目的基因的扩增,分列在两页中P1 P2公式:通过标准曲线确定两个F=2「待检样品目_待检样品看fJ L的基因平均—家基因平均一Ct值Ct值L对照组目的J基因平均Ct 值对照组看家基因平均Ct 值IComparative Delta-delta Ct 法的特点、注意事项及实际应用1). Comparative Delta-delta Ct法是很常用的一种相对定量方法,其最大特点是,当优化的体系已经建立后,在每次实验中无需再对看家基因和目的基因做标准曲线,而只需对待测样品分别进行PCR扩增即可。
2).其缺点是,每次实验都默认目的基因和看家基因的扩增效率一致,而并非真实扩增情况的反映,这里势必存在一定的误差。
3). Comparative Delta-delta Ct法展开定量实验前,在预实验中,必需对目的基因和看家基因做两组标准曲线。
Rotor-Gene的软件会自动给出两组标准曲线的R值、扩增效率等信息,如果两组标准曲线的斜率,即M值的差小于0.1,那么后续实验中就可以用Comparative Delta-delta Ct法进行相对定量分析。
反之,如果M差值大于0.1,就无法用该方法进行相对定量分析。
此时的解决方法有两种,一是优化实验,使两组标准曲线的斜率差值小于0.1,二是换用其它的相对定量方法。
应用实例:如上图,将标准品进行梯度稀释后,分别对目的基因( Gene of Interest )和看 家基因(Housekeeper Gene )做标准曲线。