细菌的分类与命名.球菌119页PPT

种
菌株 是不同来源的某一种细菌的纯培养物。同一种细菌可
以有许多菌株，其主要性状应完全相同，其次要性状 可稍有差异。
二、细菌的 命名 构成：细菌的学名(scientific name)------拉丁文名
命名依据：国际细菌命名法则：双名法（林奈）
兽医微生物学
由“属名+种名”构成，用拉丁文表示，属名在前，
S（沉降系数） rRNA(核糖体RNA)
③16S rRNA碱基序列的相似性
兽医微生物学
细菌分类鉴定的特征和技 术 （一）形态学和生理生化特征
（二）血清学试验与噬菌体分型 （三）氨基酸的顺序和蛋白质的分析 （四）核酸的碱基组成和分子杂交
（一）形态学和生理生化 特征
1．形态学特征
兽医微生物学
（1）细菌形态：形状、大小、排列 （2）培养特征：菌落特征
（3）特殊结构：鞭毛、芽孢、荚膜、孢
子
（4）染色反应：革兰、抗酸
1．血清学试验
（二）血清学试验与噬菌 体分型
兽医微生物学
细菌细胞与病毒等都含有蛋白质、脂白
蛋、脂多糖等有抗原性的物质，由于不
同微生物抗原物质结构不同，赋予它们
同的噬菌型和利用噬菌体裂解这样的特异性进
行细菌鉴定.
（三）氨基酸的顺序和蛋 白质的分析
蛋白质是基因的产物,蛋白质的氨基酸顺
序直接反映mRNA顺序而与编码基因密切相 关。
兽医微生物学
可以通过对某些同源蛋白质氨基酸顺序的
比较来分析不同生物系统发育关系 ,序列 相似性越高,其亲缘关系愈近。
可以根据蛋白质的氨基酸序列资料构建系
兽医微生物学
新名称的发表
根据细菌命名法规的规定，有效发表新 的细菌名称应在公开发行的刊物上进行。 若新名称是在国际系统细菌学杂志（IJSB） 以外的其他杂志上发表的，还必须经过新名称 的合格化发表，被认为合格后，在该杂志上定 期公布，命名日期即从公布之日算起，否则不 算合格发表，也不能取得国际上的承认。 发表新名称时，应在新名称之后加上所属 新分类等级的缩写词，如新目“ord.nov.”、 新属“gen.nov.”、新种“sp.nov.”等。

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科及科以上的划分在细菌不太完善，且随
着研究的深入科属的划分会发生变动
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1、属（genus）性状相近、关系密切的 若干菌种组成一个菌属，与其他属有明 显差异。
2、种（species）是细菌学分类的最基本 单元，生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3、菌株（strain）是不同来源的某一种 细菌的纯培养物。
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二、细菌的分类地位
1、过去属于植物界， 现在划为：原核生物
古菌 细菌
在兽医微生物中，古细菌不占重要 地位
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2、细菌还包括
衣原体、立克次氏体、霉形体、 螺旋体、放线菌等→对动物和人 具有致病作用
蓝细菌、紫色光合细菌等
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细菌分类学包括分类，命名和鉴定
1、细菌分类：根据细菌各自的特征，并 按照亲缘关系分类，以不同等级编排系 统。分类有两种：
①细菌的生理生化分类法，包括有传 统分类法和数值分类法。
②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度 进行分类法，称种系分类或自然分类。
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2、细菌命名：在分类基础上，给每种 细菌一个科学名称，便于交流并保证所 有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则， 确定细菌的分类地位。

界 Kingdom (拉：Regnum)
门 Phylum (拉：Phylum))
纲 Class (拉：Classis)
目 Order (拉：Ordo)

科 Family (拉：Familia)

属 Genus（拉：Genus）

种 Species（拉：Species）
科及科以上的划分在细菌不太完善，且随
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四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的
作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有
应用价值。
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2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
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二、细菌的分类地位
1、过去属于植物界， 现在划为：原核生物
古菌 细菌
在兽医微生物中，古细菌不占重要 地位
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2、细菌还包括
衣原体、立克次氏体、霉形体、 螺旋体、放线菌等→对动物和人 具有致病作用
蓝细菌、紫色光合细菌等
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3、细菌的分类单元
细菌的分类单元与动植物一样，依次为
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例如 大肠埃希菌的学名全名是：
Escherichia coli(Migula) Castellani et
Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。

1. 数值分类法
其分类范畴的基本单位是种，根 据比较细菌在形态、生理和生化 等方面的特性，计算出相似值来 确定种的分类归属。
2．分子生物学分类法 （种系发生）
1）DNA中G+C摩尔百分数(%)含量测定
（G+C）mol%含量：某一生物 DNA中的 G+C配对碱基按摩尔数计算占全部碱基的 百分数。（反映该生物遗传性能的一种本 质特征）。
大家应该也有点累了，稍作休息
大家有疑问的，可以询问和交 Nhomakorabea五、细菌种的划分和种以下的分类单位
(一) 种（Species) 种是生物分类的基本单位。凡属同种 的生物，均具有共同的基本性状特征。 它是生物在一定演化阶段，具有相对稳 定的一定性状特征的实体。
(二) 种以下的分类单位
1.亚种(subspecies)：种内可能存在一些
细菌的分类与命名
二、细菌分类的指征
1. 形态学特性 2. 培养特性
3. 生活方式
4. 生理生化特性
5. 抗原构造
6. 对噬菌体的敏感性
7．对抗生素及其他化学物质的敏感性
8．病原性
9．遗传学特征。
三、细菌分类的方法
1、数值分类法 2．分子生物学分类法 3．血清学方法： 共同抗原 4．化学分类法：比较细菌各种细胞成分
测定方法：梯度密度离心法、解链温度法 (Tm)等。
2）DNA或RNA同源性的测定
DNA-DNA杂交试验(hybridization)
原理：同源DNA单链或非同源DNA单链， 只要它们彼此在核苷酸序列上有相应互 补的部分，就可产生不同程度的结合。
应用：通过在体外测定菌株间DNA的杂 合率，据此推算出DNA的相似程度，判 断它们在亲缘关系上的亲疏，帮助分类 鉴定。

第七章 细菌的分类与命名
主讲：微生物学检验教研室
第七章 细菌的分类与命名
第一节 细菌的分类单位与命名
种、标准株 双命名法
第二节 细菌的分类方法
数值分类法
第一节 细菌的分类单位与命名
一、细菌的分类单位
❖ 分类等级：界、门、纲、目、科、属、种 1）种：细菌分类的基本单位。生物学性状相同的细
菌群体构成一个种；同一菌种的细菌在某些方面有 一些差异可分为亚种、亚种以下分型、亚型 2）株：不同来源的相同菌种称为菌株。其性状可以 完全相同，也可有某些差异。具有某种细菌典型的 生物学特征的菌株为该菌的标准株。标准株作为细 菌分类、鉴定、命名、质量控制的依据和标准
B.stearothermophilus Bacillus.subtilis(Ehreberg) Cohn 1872（在细菌分类
单元的后面附上命名人的姓氏、命名年代，括号 内为原命名人的姓氏。）
第二节 细菌的分类方法
❖ 传统分类方法
以细胞壁的结构特点作为最高一级分类依据，按 细胞形态、革兰氏染色性、鞭毛及生化特性作为 较高一级分类依据
二、细菌的命名
❖ 举例：
芽孢杆菌属（Bacillus原意为小杆菌）中的几个种： 枯草芽孢杆菌： Bacillus. subtilis 或 B.subtilis 蜡样芽孢杆菌： Bacillus.cereus 或 B.cereus 嗜热脂肪芽孢杆菌：Bacillus.stearothermophilus 或
第一节 细菌的分类单位与命名
二、细菌的命名
❖ 双命名法：即种的学名。包括属名、种名加词。它们 都是由拉丁文、希腊文或拉丁化的其他词组成，要求 印刷成斜体或书写时在名称下划线。
1）第一个词是属名，单数主格名词或作为名词的形容 词表示； 第一个字母大写或缩写为大写的单个或几个 字母表示

细菌分类学包括分类，命名和鉴定
1、细菌分类：根据细菌各自的特征，并 按照亲缘关系分类，以不同等级编排系 统。分类有两种：
①细菌的生理生化分类法，包括有传 统分类法和数值分类法。
②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度 进行分类法，称种系分类或种 细菌一个科学名称，便于交流并保证所 有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则， 确定细菌的分类地位。
❖ 学名用拉丁文，遵循“双名法”。 ❖ 每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分
组成如：产气荚膜梭菌（Clostridium
perfringens） ▪ 属名在前，字首字母要大写，其余小写
▪ 整个属名及种名在出版物中应排成斜体
▪ 中文译名，种名在前，属名在后
2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属 名和种名之后，往往还要加上首次定 名人（加括号）、现名定名人和现名 定名年份，这些均用正体排字。 ▪ 一般兽医学及医学微生物学文献中， 属名和种名之后的部分均予省略。 ▪ 如：Escherichia coli
四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。
2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
3）rRNA寡核苷酸编目分析
金黄色葡萄球菌的学名为 命名年份
Staphylococcus aureus Rosenbach
1884 属名葡萄球菌 种名金黄色 命名人的姓

为1
二、微 生 物 的 命 名
微生物的命名按国际命名法命名，即Linna所创 立的“双名法” 每一种微生物都用属与种命名， 由2个拉丁词或希腊词或拉丁化了的其他文字组成。 属名和种名用斜体表达 属名在前，用拉丁名词 表示微生物的构造、形态、某科学家名字等，描 述微生物的主要特征。第一字母大写 种名在后， 第一字母小写。用拉丁形容词表示，描述微生物 的色素、形状、来源、病名、地名、某科学家的 名字等等 在种名后，附上命名者的姓和命名年 份
蛋白质水平 mol%、生态分布等特征为主
鉴定（Identification）：是指确定一个新分离物是否归属于某个已命名的分类单元的过程。 如放线菌中的链霉菌属内的种归为1
基因组水平 真核生物：真菌、藻类、原虫
分离物是指已分离得到但为经鉴定的纯培养物的后代即为分离物 2．培养特性：培养基上的表现，菌落特征 生物变型——表示特殊的生化或生理特征 《伯杰氏系统细菌学手册》 如放线菌中的链霉菌属内的种归为1 第一字母大写 种名在后，第一字母小写。 用拉丁形容词表示，描述微生物的色素、形状、来源、病名、地名、某科学家的名字等等 在种名后，附上命名者的姓和命名年份
《伯杰氏系统细菌学手册》
Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology) second edition 2001 以 生理生化、G + C mol%、系统发育地位等 为主——体现了现代分子生物学的研究成 果 尚未出齐
细菌的分类
一、细菌在生物中分类地位
目前公认“四界分类系统”
分类学的任务
分类（Classification）：是指根据相似性或亲缘 关系，将一个有机体放在一个单元中 命名（Nomenclature）：是按照国际命名法规 给予有机体一个科学的名称 鉴定（Identification）：是指确定一个新分离物 是否归属于某个已命名的分类单元的过程。