真菌胞内蛋白质提取方法的建立
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真菌蛋白提取方法一TCA/丙酮法1 液氮将菌体研磨为粉末;2 向匀浆中加入10倍体积的丙酮(含13.3% (w/v) TCA和0.093% β巯基乙醇),过夜沉降;3 4 度20,000g 离心15 min;4 移处上清,用冰冷的含0.07% (v/v) β-巯基乙醇的丙酮清洗沉淀两次;5 离心后,沉淀干燥至丙酮挥发完全。
二酚抽提法1 在液氮中将 1g 菌体研磨为粉末2 加入 6 ml 水饱和酚(buffer-saturated phenol)和 2 ml提取液(20mMTris-Cl, pH 7.5, 0.5% Triton X-100 (v/v), 0.5M EDTA, pH 7.5, pH 8.0,0.07% β-巯基乙醇, protease inhibitors)。
3 在4度混合30分钟。
4 12000 rmp 离心1min,使两相分开。
5 弃沉淀,吸取上层的苯酚相,加入5倍体积的冷丙酮,-20度沉降2h。
6 12000 rmp,4度,离心15分钟沉淀蛋白,弃去上清。
7 沉淀干燥至丙酮挥发完全。
三提取液抽提丙酮沉淀法1 预先将研钵置于-20℃的冰箱内冷冻。
2 取液氮冻存的菌体,放入预冷的研钵内研磨至粉末状。
3 向匀浆中加入2倍体积的抽提液(20mM Tris-Cl, pH 7.5, 0.5% Triton X-100(v/v), 0.5M EDTA, pH 7.5, pH 8.0, 0.07% β-巯基乙醇, protease inhibitors)。
4 混匀后4度震荡30分钟,以便蛋白溶解。
5 12000 rmp,4度,离心15分钟,吸取上清于另一EP管中。
7 向上清液中加入5倍体积的预冷丙酮(含有0.07%β-巯基乙醇),混匀,-20℃,2小时沉淀蛋白质。
8 12000 rmp,4度,离心15分钟沉淀蛋白。
弃去上清,沉淀用乙醇洗三次,自然干燥蛋白沉淀。
四甲醇氯仿水沉淀法Chloroform /Methanol/Water Precipitation1 预先将研钵置于-20℃的冰箱内冷冻。
提取蛋白质的具体步骤全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:提取蛋白质是生物科学研究中非常重要的一个步骤,它能够帮助研究人员深入了解蛋白质的结构和功能。
下面将为您介绍一些常用的提取蛋白质的具体步骤,希望能对您有所帮助。
1. 选择样本:在进行蛋白质提取前,首先需要选择合适的样本。
样本可以是动植物组织、微生物、细胞等。
在选择样本时,需要考虑到所需提取的蛋白质种类和含量。
2. 细胞破碎:将样本破碎是提取蛋白质的第一步。
通过机械或化学方法破碎细胞壁,释放出蛋白质。
常用的方法包括超声波破碎、研钵研磨、高压破碎等。
3. 细胞裂解:将破碎后的细胞溶液进行裂解是提取蛋白质的下一步。
裂解可使蛋白质从细胞内释放出来。
常用的裂解方法包括离心、温度变化、酸碱处理等。
4. 蛋白质沉淀:裂解后的细胞溶液含有大量的蛋白质和其他杂质,需要进行沉淀分离。
常用的方法包括盐析、醇沉、酸沉淀等。
5. 蛋白质纯化:通过进一步的分离和纯化步骤,可以得到纯度较高的蛋白质。
常用的方法包括柱层析、凝胶电泳、亲和纯化等。
6. 蛋白质鉴定:最后一步是对提取得到的蛋白质进行鉴定和分析。
常用的鉴定方法包括质谱分析、Western blotting等。
以上就是提取蛋白质的具体步骤。
通过这些步骤,研究人员可以有效地提取并纯化蛋白质,为后续的实验和研究提供重要的支持。
希望以上内容对您有所帮助,谢谢!第二篇示例:蛋白质是生物体中重要的基本分子,具有多种生物学功能,包括结构支持、酶催化、信号传导等。
提取蛋白质是生物学研究中常用的实验方法之一。
下面我将介绍提取蛋白质的具体步骤。
1. 样品的制备首先要准备待提取的生物样品,可以是细胞、组织或者生物体。
样品的制备包括收集、洗涤、离心等步骤,确保样品的纯度和完整性。
2. 细胞破碎对于细胞样品,需要先将细胞破碎以释放蛋白质。
常用的细胞破碎方法包括超声波破碎、高压破碎、冻融破碎等,选择适合样品的方法进行破碎。
3. 蛋白质溶解破碎后的细胞溶液需要进行蛋白质溶解,这可以通过添加盐溶液、表面活性剂或有机溶剂等方法来实现。
真菌蛋白提取方法一TCA/丙酮法1 液氮将菌体研磨为粉末;2 向匀浆中加入10倍体积的丙酮(含13.3% (w/v) TCA和0.093% β巯基乙醇),过夜沉降;3 4 度20,000g 离心15 min;4 移处上清,用冰冷的含0.07% (v/v) β-巯基乙醇的丙酮清洗沉淀两次;5 离心后,沉淀干燥至丙酮挥发完全。
二酚抽提法1 在液氮中将 1g 菌体研磨为粉末2 加入 6 ml 水饱和酚(buffer-saturated phenol)和 2 ml提取液(20mMTris-Cl, pH 7.5, 0.5% Triton X-100 (v/v), 0.5M EDTA, pH 7.5, pH 8.0,0.07% β-巯基乙醇, protease inhibitors)。
3 在4度混合30分钟。
4 12000 rmp 离心1min,使两相分开。
5 弃沉淀,吸取上层的苯酚相,加入5倍体积的冷丙酮,-20度沉降2h。
6 12000 rmp,4度,离心15分钟沉淀蛋白,弃去上清。
7 沉淀干燥至丙酮挥发完全。
三提取液抽提丙酮沉淀法1 预先将研钵置于-20℃的冰箱内冷冻。
2 取液氮冻存的菌体,放入预冷的研钵内研磨至粉末状。
3 向匀浆中加入2倍体积的抽提液(20mM Tris-Cl, pH 7.5, 0.5% Triton X-100(v/v), 0.5M EDTA, pH 7.5, pH 8.0, 0.07% β-巯基乙醇, protease inhibitors)。
4 混匀后4度震荡30分钟,以便蛋白溶解。
5 12000 rmp,4度,离心15分钟,吸取上清于另一EP管中。
7 向上清液中加入5倍体积的预冷丙酮(含有0.07%β-巯基乙醇),混匀,-20℃,2小时沉淀蛋白质。
8 12000 rmp,4度,离心15分钟沉淀蛋白。
弃去上清,沉淀用乙醇洗三次,自然干燥蛋白沉淀。
四甲醇氯仿水沉淀法Chloroform /Methanol/Water Precipitation1 预先将研钵置于-20℃的冰箱内冷冻。
蛋白质的分离提取方法
蛋白质分离提取是生物分析中一种常见的分析方法。
它能够从各种细胞和蛋白溶液中分离提取出有用的蛋白质,并有效地检测蛋白质的结构和功能。
一般来说,蛋白质分离提取的具体工艺如下:
1.抽提溶解:通常,抽提溶解的工艺是将细胞或蛋白溶液抽提成单独的溶液,再通过更细的滤器或繁复的曲折手段将其中的一些蛋白分离提取出来。
抽提的溶液可以是一种细胞因子或去离子水,也可以是添加有特定蛋白的溶液。
抽提的方法包括溶胀(如乳酸钠溶解)、离心离液(如凝胶离心)、沉淀(如滤渣沉淀)和浓缩(如滤渣浓缩)等。
2.冷冻干燥:冷冻干燥的技术是改变物质的温度以及蒸发蒸馏,以将抽提的蛋白质溶解体转变为晶体状态。
冷冻干燥的具体工艺主要有:先冷冻、改变气压、蒸发水份,再加热恢复溶液容量。
3.结构分离:结构分离是指对抽提的蛋白质进行多种物理和化学方法分离提取,通过改变结构和性质来识别和纯化特定蛋白质。
结构分离的方法包括电泳(例如乳糖电泳)、离心离液(例如凝胶离心)、层析(例如膜滤层析)等。
蛋白质提取是一项基础实验,通常用于从组织或细胞中提取纯度较高的蛋白质样品,以便进行各种蛋白质研究。
常规的蛋白质提取步骤包括以下几个主要步骤:
1. 细胞或组织的裂解:将待提取的样品裂解以释放出蛋白质。
裂解方法取决于被裂解的细胞类型,可使用机械法、化学法、超声波或高压等方法进行裂解。
2. 蛋白质的分离:将蛋白质与非蛋白质组分进行分离,常用的方法有沉淀、过滤、离心和柱层析等。
3. 蛋白质的纯化:通过进一步的分离和纯化来获得高纯度的蛋白质。
这些步骤通常需要进行多次,每次都使用不同的方法来分离和纯化蛋白质。
提蛋白质的原理是基于蛋白质的化学和物理特性进行分离和纯化。
蛋白质分子量大小、电荷、亲水性等特性不同,容易与不同化学试剂、柱层析介质或生物酶相互作用。
通过调节这些条件和步骤,就可以使不同的蛋白质与其它组分分离出来,并得到纯度较高的蛋白质样品。
虽然蛋白质提取步骤较多,但因为各种蛋白质的特性不同,所以实验时需要根据需要选择不同的提取和分离方法以获得更理想的效果。
[文章编号] 1671-587Ⅹ(2012)03-0590-05[收稿日期] 2011-08-15[基金项目] 国家自然科学基金资助课题(30910103903,30770120)[作者简介] 王 爽(1976-),女,吉林省长春市人,主治医师,医学博士,主要从事真菌分子学鉴定及耐药机制的研究。
[通信作者] 王 丽(Tel:0431-85619486,E-mail:wli99@jlu.edu.cn)真菌胞内蛋白质提取方法的建立王 爽1,2,姜兰香1,张 宇2,3,贺 丹2,田 庄2,高 嵩2,横山耕治4,王 丽2(1.吉林大学第二医院皮肤科,吉林长春130041;2.吉林大学白求恩医学院病原生物学系,吉林长春130021;3.吉林大学第二医院检验科,吉林长春130041;4.日本千叶大学真菌研究中心,日本千叶260-8673)[摘 要] 目的:研究不同的提取方法对白假丝酵母和茄病镰刀菌胞内蛋白质浓度、种类及数量的影响,为建立一种稳定可靠的真菌胞内蛋白质提取方法提供依据。
方法:分别以白假丝酵母菌和茄病镰刀菌为研究对象,培养时间为36、48和72h,超声波工作时间为20s、3min、5min,10min,超声波功率为332.5和475.0W,通过蛋白质浓度检测和SDS-PAGE蛋白质电泳分析,比较不同条件下提取的蛋白质浓度、种类及数量,观察不同因素对蛋白质提取效果的影响。
结果:2株真菌均在培养36h时提取胞内蛋白质的浓度最大,白假丝酵母在功率332.5W、超声3min时得到胞内蛋白质的数量和种类最多,茄病镰刀菌在功率332.5W、超声10min时得到蛋白质的数量和种类最多。
结论:使用超声波法与玻璃珠研磨法结合提取胞内蛋白质,从菌株的培养时间、超声波工作时间和功率3方面建立了真菌胞内蛋白质的最佳提取方法。
[关键词] 白假丝酵母;茄病镰刀菌;超声波;培养时间[中图分类号] R379.2 [文献标志码] AEstablishment of intracellular protein extractionmethods from fungusWANG Shuang1,2,JING Lan-xiang1,ZHANG Yu2,3,HE Dan2,TIAN Zhuang2,GAO Song2,KOJI Yokoyama4,WANG Li 2(1.Department of Dermatology,Second Hospital,Jilin University,Changchun 130041,China;2.Department of Pathogen Biology,Norman Bethune College of Medicine,Jilin University,Changchun130021,China;3.Department of Laboratory,Second Hospital,Jilin University,Changchun130041,China;4.Medical Mycology Research Center,Chiber University,Chiba 260-8673,Japan)Abstract:Objective To study the effect of different cultivate time,ultrasonic time and ultrasonic power on theconcentration,type and quantity of the intracellular protein from Candida albicans and Fusarium solina and toprovide the theoretical basis for establishing a reliable and stable extraction method for intracellular protein fromfungus.Methods Candida albicans and Fusarium solina were cultured.The different parameters included theculture time(36,48,and 72h),ultrasonic time(20s,3min,5min,and 10min)and ultrasonic power(332.5Wand 475.0W).The concentrations,species and quantities of protein under different factors were detected by theprotein concentration detection and SDS-PAGE electrophoresis analysis.Results Both strains got the most quantityof protein when cultivated for 36h.The most quantity and species of Candida albicans were obtained when theultrasonic power was 332.5Wand ultrasonic time was 3min,but as to Fusarium solina,the correspondingparameters were 332.5Wand 10min,respectively.Conclusion The intracellular protein is extracted bycompositely using ultrasonic method and glass bead transformation method.The optimal extraction method of095第38卷 第3期2012年5月吉 林 大 学 学 报 (医 学 版)Journal of Jilin University(Medicine Edition)Vol.38No.3 May 2012intracellular protein from fungus is developed from the aspects of culture time,ultrasonic power and ultrasonicworking time of strains.Key words:Candida albicans;Fusarium solani;ultrasound;culture time 随着免疫力低下或免疫缺陷患者等易感人群的不断增加,条件致病性真菌感染的发生率呈上升趋势,严重威胁患者的健康和生命[1-2],真菌致病和耐药机制的研究已成为当前研究的热点问题。
蛋白质提取的方法和原理
1、蛋白质提取方法
1.1 热处理法
热处理是一种简单而有效的蛋白质提取方法,通过高温高压或烧
焦来破坏细胞壁和细胞膜,并释放出蛋白质。
如热溶液法、微波法、
热压法等。
1.2 酸碱法
酸碱法是一种常用的蛋白质提取方法,通过改变蛋白质的电荷性质,使其带有正负电荷,从而在特定的pH下沉淀出来。
如硫酸钾法、
亚硫酸盐法、三氯乙酸法等。
1.3 有机溶剂法
有机溶剂法是一种常见的蛋白质提取方法,常用有机溶剂如甲醇、丙酮、氯仿等,通过溶解细胞膜并使蛋白质溶于有机溶剂中,经离心
分离得到蛋白质。
如甲醇法、氯仿法、醋酸纤维素膜法等。
1.4 冻融法
冻融法是一种新兴的蛋白质提取方法,通过冻结细胞后迅速回温,使细胞壁破裂并释放出蛋白质。
该方法不需要使用有机溶剂或酸碱处理,可避免蛋白质的降解和失活。
2、蛋白质提取的原理
蛋白质提取的原理是利用特定的化学物质或物理条件,破坏细胞
膜和细胞壁,从而释放出蛋白质。
蛋白质在细胞内可以存在于细胞膜、细胞壁、细胞质或细胞核中,提取蛋白质需要根据不同的生物学样品
及其组分情况采用不同的方法。
其中,热处理法是利用高温高压或烧焦等方式破坏细胞壁和细胞膜,从而释放出蛋白质;酸碱法是通过改变蛋白质的电荷性质,在特
定的pH值下使其沉淀出来;有机溶剂法是利用有机溶剂溶解细胞膜,
并使蛋白质溶于有机溶剂中;冻融法则是通过冻结细胞后迅速回温,
使细胞壁破裂并释放出蛋白质。
在蛋白质提取过程中,需要注意避免蛋白质的降解和失活,以及
尽量减少对蛋白质的污染。
提取蛋白质的方法一、背景介绍蛋白质是生物体中最基本的组成部分之一,它们在细胞代谢、信号传导和结构支撑等方面起着重要作用。
因此,蛋白质的提取是许多生物学研究的基础。
本文将介绍几种常见的蛋白质提取方法。
二、方法一:机械破碎法1. 原理机械破碎法是通过物理力量将细胞壁破坏,使得蛋白质从细胞内释放出来。
这种方法适用于非常坚硬的样品,如骨头或干燥的植物材料。
2. 步骤(1)将样品加入液氮中冷冻并粉碎成粉末。
(2)向粉末中加入适量缓冲液,并使用超声波或高压均质器进行打碎。
(3)离心样品以除去残留的细胞碎片和其他杂质。
(4)收集上清液进行后续处理。
三、方法二:化学提取法1. 原理化学提取法是利用化学试剂溶解或沉淀细胞,使蛋白质从细胞中释放出来。
这种方法适用于大多数样品,但可能会影响蛋白质的结构和功能。
(1)将样品加入适量缓冲液中,并加入化学试剂(如三氯乙酸、硫酸或氢氧化钠等)。
(2)在恒温条件下搅拌或震荡样品,使细胞完全破裂。
(3)离心样品以除去残留的细胞碎片和其他杂质。
(4)收集上清液进行后续处理。
四、方法三:凝胶层析法1. 原理凝胶层析法是一种基于分子大小和电荷的分离技术。
通过将混合物通入凝胶柱中,不同大小和电荷的分子会在柱中被分离出来。
这种方法可以用于纯化特定的蛋白质。
2. 步骤(1)制备凝胶柱,并加入相应的缓冲液。
(2)将样品加入凝胶柱,并使用缓冲液进行洗涤。
(3)根据需要调整pH值或添加其他试剂,以促进蛋白质的分离。
(4)收集不同分子大小或电荷的蛋白质进行后续处理。
五、方法四:亲和层析法1. 原理亲和层析法是一种基于蛋白质与特定配体之间相互作用的分离技术。
通过将混合物通入带有配体的凝胶柱中,只有与配体具有亲和力的蛋白质才会被捕获。
这种方法可以用于纯化特定的蛋白质。
(1)制备带有配体的凝胶柱,并加入相应的缓冲液。
(2)将样品加入凝胶柱,并使用缓冲液进行洗涤。
(3)根据需要调整pH值或添加其他试剂,以促进蛋白质的分离。
真菌蛋白的制造过程引言:真菌蛋白是一类由真菌合成的蛋白质,具有广泛的生物学功能和应用价值。
其制造过程涉及到菌种选择、发酵培养、蛋白表达、纯化和验证等多个环节。
本文将详细介绍真菌蛋白的制造过程,并探讨其在生物医药和农业领域的应用前景。
一、菌种选择在制造真菌蛋白之前,首先需要选择合适的菌种。
常用的真菌菌种包括酿酒酵母、大肠杆菌、大黄蜂菌等。
选择菌种时需要考虑其生长速度、表达效率、分泌能力以及对外界条件的适应性等因素。
同时,还需考虑目标蛋白所在的真菌菌种,以便在后续的表达和纯化过程中获得较高的产量和纯度。
二、发酵培养选择好菌种后,接下来是进行发酵培养。
发酵培养是真菌蛋白制造的关键步骤之一。
其目的是提供适宜的生长环境,促进菌株的繁殖和蛋白表达。
发酵培养液的组成要根据菌株的需求进行调整,包括碳源、氮源、矿物质和生长因子等。
同时,还需要控制培养液的温度、pH值、氧气和搅拌速度等因素,以优化真菌的生长和蛋白表达。
三、蛋白表达在发酵培养过程中,真菌会合成目标蛋白。
蛋白表达的机制主要包括转录和翻译两个过程。
转录是真菌将基因信息转录成RNA的过程,而翻译则是将RNA翻译成蛋白质。
在蛋白表达过程中,可以通过基因工程技术来优化目标蛋白的表达水平和纯度。
例如,可以通过引入外源基因、调节启动子和增加信号肽等方式来提高蛋白表达的效率。
四、纯化在真菌蛋白表达后,需要对其进行纯化。
纯化是将目标蛋白从其他杂质中分离出来的过程,旨在获得高纯度的蛋白样品。
常用的纯化方法包括离心、过滤、层析和电泳等。
离心和过滤可以用于去除大分子杂质,层析则可以根据蛋白的特性选择合适的分离介质,电泳则可用于分离蛋白的大小和电荷。
在纯化过程中,还需要进行监测和分析,以确保蛋白的纯度和活性。
五、验证对制造的真菌蛋白进行验证是必不可少的一步。
验证的目的是确认蛋白的纯度、活性和功能等。
常用的验证方法包括质谱分析、酶活性测定、免疫印迹和功能性实验等。
通过这些验证手段,可以评估蛋白的质量和性能,并为其后续应用提供可靠的依据。
[文章编号] 1671-587Ⅹ(2012)03-0590-05[收稿日期] 2011-08-15[基金项目] 国家自然科学基金资助课题(30910103903,30770120)[作者简介] 王 爽(1976-),女,吉林省长春市人,主治医师,医学博士,主要从事真菌分子学鉴定及耐药机制的研究。
[通信作者] 王 丽(Tel:0431-85619486,E-mail:wli99@jlu.edu.cn)真菌胞内蛋白质提取方法的建立王 爽1,2,姜兰香1,张 宇2,3,贺 丹2,田 庄2,高 嵩2,横山耕治4,王 丽2(1.吉林大学第二医院皮肤科,吉林长春130041;2.吉林大学白求恩医学院病原生物学系,吉林长春130021;3.吉林大学第二医院检验科,吉林长春130041;4.日本千叶大学真菌研究中心,日本千叶260-8673)[摘 要] 目的:研究不同的提取方法对白假丝酵母和茄病镰刀菌胞内蛋白质浓度、种类及数量的影响,为建立一种稳定可靠的真菌胞内蛋白质提取方法提供依据。
方法:分别以白假丝酵母菌和茄病镰刀菌为研究对象,培养时间为36、48和72h,超声波工作时间为20s、3min、5min,10min,超声波功率为332.5和475.0W,通过蛋白质浓度检测和SDS-PAGE蛋白质电泳分析,比较不同条件下提取的蛋白质浓度、种类及数量,观察不同因素对蛋白质提取效果的影响。
结果:2株真菌均在培养36h时提取胞内蛋白质的浓度最大,白假丝酵母在功率332.5W、超声3min时得到胞内蛋白质的数量和种类最多,茄病镰刀菌在功率332.5W、超声10min时得到蛋白质的数量和种类最多。
结论:使用超声波法与玻璃珠研磨法结合提取胞内蛋白质,从菌株的培养时间、超声波工作时间和功率3方面建立了真菌胞内蛋白质的最佳提取方法。
[关键词] 白假丝酵母;茄病镰刀菌;超声波;培养时间[中图分类号] R379.2 [文献标志码] AEstablishment of intracellular protein extractionmethods from fungusWANG Shuang1,2,JING Lan-xiang1,ZHANG Yu2,3,HE Dan2,TIAN Zhuang2,GAO Song2,KOJI Yokoyama4,WANG Li 2(1.Department of Dermatology,Second Hospital,Jilin University,Changchun 130041,China;2.Department of Pathogen Biology,Norman Bethune College of Medicine,Jilin University,Changchun130021,China;3.Department of Laboratory,Second Hospital,Jilin University,Changchun130041,China;4.Medical Mycology Research Center,Chiber University,Chiba 260-8673,Japan)Abstract:Objective To study the effect of different cultivate time,ultrasonic time and ultrasonic power on theconcentration,type and quantity of the intracellular protein from Candida albicans and Fusarium solina and toprovide the theoretical basis for establishing a reliable and stable extraction method for intracellular protein fromfungus.Methods Candida albicans and Fusarium solina were cultured.The different parameters included theculture time(36,48,and 72h),ultrasonic time(20s,3min,5min,and 10min)and ultrasonic power(332.5Wand 475.0W).The concentrations,species and quantities of protein under different factors were detected by theprotein concentration detection and SDS-PAGE electrophoresis analysis.Results Both strains got the most quantityof protein when cultivated for 36h.The most quantity and species of Candida albicans were obtained when theultrasonic power was 332.5Wand ultrasonic time was 3min,but as to Fusarium solina,the correspondingparameters were 332.5Wand 10min,respectively.Conclusion The intracellular protein is extracted bycompositely using ultrasonic method and glass bead transformation method.The optimal extraction method of095第38卷 第3期2012年5月吉 林 大 学 学 报 (医 学 版)Journal of Jilin University(Medicine Edition)Vol.38No.3 May 2012intracellular protein from fungus is developed from the aspects of culture time,ultrasonic power and ultrasonicworking time of strains.Key words:Candida albicans;Fusarium solani;ultrasound;culture time 随着免疫力低下或免疫缺陷患者等易感人群的不断增加,条件致病性真菌感染的发生率呈上升趋势,严重威胁患者的健康和生命[1-2],真菌致病和耐药机制的研究已成为当前研究的热点问题。
真菌感染性疾病的发生发展和抗真菌药物的作用,多数是在蛋白质水平上进行的[3]。
因此,在蛋白质水平上研究真菌的致病机制和耐药机制具有重大意义。
在真菌蛋白质组学研究中,获取相关胞内蛋白质是研究的首要问题。
真菌的细胞壁坚韧、不易被破碎,胞内蛋白质难以被释放,在破碎细胞壁的同时,如何减少胞内蛋白质损失非常关键。
目前,国内外常用的真菌破壁方法有超声波法、液氮冷冻研磨法和玻璃珠法等,其中超声波破壁操作简便,但是真菌破壁时间较长,超声工作时产生热量易引起蛋白质降解;液氮冷冻研磨在真菌的DNA和蛋白质提取中均可应用,但液氮极易挥发,操作困难;而单纯玻璃珠研磨很难将菌丝体打散使细胞有效裂解。
也有部分研究者[4-6]制备原生质体提取蛋白质,但是其制备过程繁琐,得到数量很少,很难满足蛋白质研究需要。
本研究以2种较为常见的病原真菌白假丝酵母和茄病镰刀菌作为研究对象,联合使用几种破壁方法,在改变菌体培养时间、超声波功率以及工作时间3个条件下,比较不同提取条件下得到的胞内蛋白质浓度、种类及数量,旨在建立一种稳定、可靠的真菌胞内蛋白质提取方法。
1 材料与方法1.1 菌株、试剂与仪器 白假丝酵母JLC 30699和茄病镰刀菌JLC 30879均为临床分离株,由吉林大学真菌研究中心保藏。
HZQ全温震荡培养箱购自哈尔滨市东联电子技术开发有限公司;冷冻高速离心机(Heraeus Biofuge Primor)购自力康生物发展有限公司;电子分析天平(AB204-N)购自梅特勒-托利多仪器上海有限公司;超声波细胞粉碎机(SCIENTZ IID)购自宁波新芝生物科技股份有限公司;紫外分光光度计(Beckman DU 600)购自美国Beckman Coulter公司;马铃薯葡萄糖琼脂培养基(potato dextrose agar,PDA)、马铃薯葡萄糖液体培养基(potato dextrose broth,PDB)购自美国Difco公司;尿素、硫脲、二硫苏糖醇(DTT)、3-[3-(胆酰胺丙基)二甲氨基]丙磺酸内盐(CHAPS)、苯甲基磺酰氟(PMSF)、蛋白纯化试剂盒Clean-upkit等试剂购自美国Amersham-Pharmacia公司。
1.2 菌株的培养 白假丝酵母在PDA斜面培养基上37℃培养24~48h,茄病镰刀菌在PDA斜面培养基上28℃培养3~5d。
用无菌的生理盐水将其制备成浓度为1×107 CFU·mL-1的菌悬液。
各取30μL分别接种于30mL PDB液体培养基中,分别在37℃和28℃振荡培养36~72h。
1.3 胞内蛋白质的提取 分别于培养36、48和72h后,以3 000r·min-1离心10min收集菌体。
无菌蒸馏水洗涤菌体3次,3 000r·min-1离心10min,弃上清。
每200mg菌体(湿重)加100μL蛋白质提取液Ⅰ(7.5mol·L-1尿素、2.5mol·L-1硫脲、20.0mmol·L-1 PMSF、1.5mmol·L-1EDTA、10.0mmol·L-1 Tris、20.0mg·L-1Dnase、5.0mg·L-1 Rnase,pH 7.4),室温作用20min后;降温至0℃后,以332.5W功率超声5min,得到混合液。
再加入300mg酸洗玻璃珠(玻璃珠直径≥0.5mm),充分研磨10min后,1 800r·min-1涡旋振荡10min;然后加入25μL蛋白质提取液Ⅱ(2%CHAPS,1%DTT,pH 9.0),涡旋振荡30s后,置于冰上1min,该步骤重复6次。
14 000r·min-1离心10min,留取上清。