荧光复合扩增调查北方汉族6个STR基因座遗传多态性

东北汉族群体19个Y-STR基因座多态性和东北亚地区各民族的聚类分析张明龙;张永吉;魏新强;郑立红【摘要】目的研究东北汉族群体的19个Y-STR基因座的遗传多态性和东北亚15个群体间的遗传关系,探讨其法医学和群体遗传学研究的应用价值.方法采用Y-filer复合扩增体系对200例东北汉族无血缘关系的男性个体的19个Y-STR基因座进行扩增,应用ABI310分析仪进行基因分型,采用Arelquin3.11、Mega4.1和SPSS17.0软件进行群体间的AMOVA分析、聚类分析和多维标度分析.结果东北汉族群体的19个Y-STR基因座的基因多态性普遍较高,共检出200个单倍型,单倍型多态性在0.350 9(DYS391)～0.971 1(DYS385a/b),适合应用于法医学个体识别和亲权鉴定;东北亚15个群体间存在差异,遗传距离在0.000 9～0.643 2,群体间聚类分析和多维度分析结果与民族起源和迁徙史基本相一致.结论东北汉族群体的19个Y-STR基因座的基因多态性普遍较高,适合应用于法医学个体识别和亲权鉴定中.%Objective To investigate the polymorphisms of the 19 Y-STR loci in the Han population in Northeast China,and analyze the genetic relationships of 15 ethnic groups in northeast Asia region,and to evaluate their forensic value and population genetic value.Methods The 19 Y-STR unrelated Han males in 200 unrelated Han males in Northeast China were amplified with the Y-filer system,and the PCR products were analyzed by the 310 Genetic Analyzer.The AMOVA analysis,cluster analysis and MDS analysis were calculated by Arelquin3.11,Mega4.1 and SPSS17.0.Results The polymorphisms of 19 Y-STR loci in the Han population in Northeast China had generally higher gene diversity value which were ranged from 0.350 9(DYS391) to 0.971 1 (DYS385a/b),and totally 200 haplotypes were observed.The 19 Y-STR loci displayed high genetic polymorphisms in the Han population in Northeast China,indicating that these 19 loci were useful genetic markers for forensic personal identification and paternity testing.There were distinctions among 15 ethnic groups.The genetic distance between 15 ethnic groups were ranged from 0.000 9 to 0.643 2,and the conclusion of cluster analysis and MDS analysis were similar to the ethnogeny research and ethnic migration history.Conclusion The 19 Y-STR loci displayed high genetic polymorphisms in the Han population in Northeast China,and these 19 loci were useful genetic markers for forensic personal identification and paternity testing.【期刊名称】《重庆医学》【年(卷),期】2017(046)005【总页数】4页(P658-660,664)【关键词】Y染色体;短串联重复序列;多态性;汉族;东北亚【作者】张明龙;张永吉;魏新强;郑立红【作者单位】齐齐哈尔医学院生物遗传教研室,黑龙江齐齐哈尔161000;延边大学法医学教研室,吉林延吉133000;吉林省长春市公安局净月分局 130000;齐齐哈尔医学院生物遗传教研室,黑龙江齐齐哈尔161000【正文语种】中文【中图分类】DF795.2Y染色体短串联重复序列(Y-STR)为男性所特有，呈伴性遗传，并以单倍型的方式进行遗传。

北京汉族群体中6个Y-STR遗传标记多态性调查贾振军;张惠芹;武尉【摘要】@@ 用PCR-PAGE技术调查了6个新的Y-STR基因座(DYS505、DYS533、DYS549、DYS576、DYS578和DYS641)在北京汉族群体中的分布,并评价他们在法医学中的应用价值,旨在筛选适合于法医学应用的新的Y-STR基因座.【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2008(024)003【总页数】4页(P202-205)【关键词】法医生物学;遗传标记;Y-STR基因座;基因多态性【作者】贾振军;张惠芹;武尉【作者单位】中国人民公安大学侦查系,北京,100038;中国人民公安大学刑事科学技术系,北京,100038;无锡中德美联生物技术有限公司,江苏无锡,214174【正文语种】中文【中图分类】DF795.2用PCR—PAGE技术调查了6个新的Y-STR基因座(DYS505、DYS533、DYS549、DYS576、DYS578和DYS641)在北京汉族群体中的分布，并评价他们在法医学中的应用价值，旨在筛选适合于法医学应用的新的Y-STR基因座。

在北京地区汉族群体中，随机抽取无血缘关系120名男性个体和20名女性个体的血液，所有样本EDTA抗凝，-20℃保存，并使用Chelex法[1]提取样本DNA。

6个STR基因座引物序列查自GDB数据库，由上海英骏生物公司合成（表1）。

PCR反应体系总体积37.5 μL，其中DNA模板约3 ng，200 μmol/L dNTP 6 μL，Taq酶1.5 U，10×PCR buffer 3.75 μL(含Mg2+1.5 mmol/L)，引物0.3 μL(0.4 mmol/L)。

采用PE 9600型热循环仪进行扩增，扩增条件见表2。

用7%非变性聚丙酰胺凝胶(交联度为5%)不连续水平电泳分离PCR扩增产物[2]，银染显色，等位基因分型标准物由不同基因型个体PCR产物混合而成。

北京汉族21个STR基因座的群体遗传学调查与法医应用评价郭剑章;路志勇;俞丽娟;刘芳;张庆霞;焦章平;刘雅诚【摘要】目的调查459例北京汉族无关个体21个常染色体非CODIS的STR基因座遗传多态性并评价其应用价值.方法用AGCU21+1荧光标记复合扩增系统对459例无关个体的21个STR基因座(D6S474、D12SATA63、 D22S1045、D10S1248、D1S1677、D11S4463、D1S1627、D3S4529、D2S441、D6S1017、D4S2408、D19S433、D17S1301、D1GATA113、D18S853、D20S482、D14S1434、D9S1122、D2S1776、D10S1435、D5S2500)进行检验.得到STR分型后,用相关软件进行统计分析并计算法医学应用参数.结果获得21个STR基因座的频率分布;相关参数为:H值从0.5894～0.8038,PD值从0.7898～0.9265,PE3值从0.3618～0.6029,PE2值从0.2031～0.4256,PIC值从0.5638到0.7640.结论联合应用Identifiler系统和AGCU21+1系统,有利于亲子关系的认定及对可疑突变的判断.【期刊名称】《刑事技术》【年(卷),期】2010(000)006【总页数】4页(P13-16)【关键词】STR;等位基因频率;群体遗传;北京汉族【作者】郭剑章;路志勇;俞丽娟;刘芳;张庆霞;焦章平;刘雅诚【作者单位】山西省医科大学法医学院,030001;北京市公安局法医检验鉴定中心,100192;山西省医科大学法医学院,030001;山西省医科大学法医学院,030001;北京市公安局法医检验鉴定中心,100192;北京市公安局法医检验鉴定中心,100192;北京市公安局法医检验鉴定中心,100192【正文语种】中文【中图分类】DF795.2本文调查分析了北京汉族人群21个STR基因座的遗传多态性和法医应用价值,报道如下：1 群体遗传学调查1.1 实验方法知情同意采集459例北京汉族无关个体血液样本;在Biomek2000自动工作站上采用磁珠法提取样本DNA;用AGCU 21+1荧光标记复合扩增系统(中德美联生物技术有限公司,无锡)扩增21个常染色体STR基因座和性别基因座(D6S474、D12SA TA 63、D22S1045、D10S1248、D1S1677、D11S4463、D1S1627、D3S4529、D2S441、D6S1017、D4S2408、D19S433、D17S1301、D1GA TA 113、D18S853、D20S482、D14S1434、D9S1122、D2S1776、D10S1435、D5S2500和Amelogenin);用AB-3130xl遗传分析仪进行电泳分离;实验过程参照操作手册和相关文献。

北方汉族人群19个STR基因座遗传多态性于海龙;储国栋;刘建世;李迪【摘要】应用GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统20A试剂盒,对638例北方地区汉族人群19个STR基因座进行遗传多态性调查,为法医学个人识别和亲权鉴定提供基础数据.【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2012(028)001【总页数】3页(P56-58)【关键词】法医遗传学;多态现象,遗传;短串联重复序列;汉族【作者】于海龙;储国栋;刘建世;李迪【作者单位】宿迁市公安局物证鉴定所,江苏宿迁 223800;宿迁市公安局物证鉴定所,江苏宿迁 223800;基点认知技术(北京)有限公司,北京 100190;基点认知技术(北京)有限公司,北京 100190【正文语种】中文【中图分类】DF795.2应用GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A试剂盒，对638例北方地区汉族人群19个STR基因座进行遗传多态性调查，为法医学个人识别和亲权鉴定提供基础数据。

1.1 样本及DNA提取638例北方地区汉族人群无关个体血样（男性401例，女性237例），采用Chelex-100法[1]，提取基因组DNA，4℃保存。

1.2 复合扩增及产物检测按照GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A试剂盒［基点认知技术（北京）有限公司］说明书，在9700型PCR扩增仪（美国AB公司）上，进行19个STR基因座和1个性别位点的多重PCR扩增，PCR扩增体系为10 μL。

扩增产物用3100-Avant型遗传分析仪（美国AB公司）进行毛细电泳检测，电泳结果数据使用GeneMapper ID v3.2软件进行基因型分析。

1.3 统计分析所得群体数据的等位基因频率、杂合度（H）、多态信息含量（PIC）、个人识别率（DP）、非父排除率（PE）等群体遗传学参数使用PowerMarker软件进行计算，并进行Hardy-Weinberg平衡检验。

北方地区汉族人群638例无关个体19个STR基因座的等位基因频率分布见表1。

北方汉族21个常染色体STR基因座和1个Y染色体STR基因座的群体遗传学调查穆豪放;张盾;殷才湧;王丽娜;张博;王志争;王建;陈峰【摘要】目的分析中国北方汉族人群21个常染色体STR基因座和1个Y染色体STR基因座的遗传多态性,为个体识别和亲权鉴定提供遗传学数据.方法用GlobalFiler@PCR Amplification Kit荧光标记试剂盒对1 081例中国北方汉族无关个体的DNA进行PCR扩增,3500XL遗传分析仪电泳分析,用GeneMapper(R) ID-X软件分析等位基因片段大小,用Modified-Powerstates.xls分析软件进行等位基因频率和法医学常用参数统计分析.结果在中国北方汉族人群中,21个常染色体STR基因座的遗传多态性高,杂合度(H)分布在0.604～0.939之间,随机匹配率(MP)分布在0.007～0.206之间,个体识别力(PD)在0.794～0.993之间,非父排除率(PE)在0.296～0.875之间,典型父权指数(TPI)在1.26～8.19之间,多态性息含量(PIC)在0.55～0.94之间;DYS391基因座共检出6个等位基因,GD值为0.4158.结论中国北方汉族人群21个常染色体STR基因座具有较高多态性,可以用于法医学亲权鉴定和个体识别,也可以用于人类学和遗传学研究.1个Y染色体STR基因座和1个Y-InDel遗传标记可以辅助判断被鉴定人性别.【期刊名称】《中国司法鉴定》【年(卷),期】2015(000)002【总页数】5页(P67-71)【关键词】法医遗传学;STR;等位基因频率;汉族人群【作者】穆豪放;张盾;殷才湧;王丽娜;张博;王志争;王建;陈峰【作者单位】北京华大方瑞司法物证鉴定中心,北京101300;北京华大方瑞司法物证鉴定中心,北京101300;南京医科大学法医系,江苏南京210029;北京华大方瑞司法物证鉴定中心,北京101300;北京华大方瑞司法物证鉴定中心,北京101300;北京华大方瑞司法物证鉴定中心,北京101300;北京华大方瑞司法物证鉴定中心,北京101300;南京医科大学法医系,江苏南京210029【正文语种】中文【中图分类】DF795.4短串联重复序列（short tandem repeats，STR）在法医学中的应用已经十分广泛，是法医学个体识别和亲权鉴定常用的工具之一。

河南汉族群体6个STR基因座遗传多态性研究【摘要】目的通过研究6个S'TR基因座FGA，TPOX，D3S1358，vWA，DSS1179，D21S11的遗传多态性，了解它们在河南汉族人群中的多态分布，与其他群体进行比较，得出遗传距离，并了解它在法医学中的应用价值。

方法采用多聚酶链式反应扩增这6个基因座，采用非变性聚丙烯酰氨凝胶电泳银染显色分析。

结果得出这6个基因座在河南汉族人群中的基因频率，并计算得出杂合度、个体识别率、非父排除率，与其他群体比较得出进化距离。

结论这6个基因座有较高的杂合度，并且具有相对遗传稳定性，在人群中的分布符合Hardy—Weinberge平衡，有较高的法医学价值，可以应用于个体识别和亲权鉴定。

【关键词】遗传多态性，短串联重复，聚合酶链式反应【中图分类号】Q75；13919．2【文献标识码】A【文章编号】1007—9297(XX)01—0037—04Genetic polymorphimn of four STR loci in the Han population in Henan province．HAO Bing-tao，LIⅥ．SI Yah—mei。

el a1．Medical Genetic Institute ofHenan Province，thePeople‘S Hospital ofHenan Province， l，450o03 P．R ．China【Abstract】Objective Toinvestigatethe~leles frequencies of six STR loci：FGA。

TPOX。

D3S1358，vwA，DSS1 179，D21S1 1 in Han population in Henan province． Methods DNA was extracted with phenol—chloroformfrmaEDTA ——blood samples ofthe unrelated indM du~s andfamilies inHenanProvince and amplified withPCR tech—nique．The PCR product was analyzed wi th the undenatured PAGE vertical electrophoresis and silver —stain． ResadtsThe freqeneies of the six SWR loci were obtained ，compared the data frown six tx~pulations．The frequencies arein the good agreement wi th Hardy—W einberg equilibrium．The be terozygosity，discrimination power and cum ulationchance of exclusion in six STR loci were calculated ． Conclusion The six STR loci in this study have higher bet—erozygosity and relative genetic stability．It is suggested that these STR loc i can be used in individual identificationan d paternity test in forensic med icine．【Key wordsl Genetic polymorphism，Short tandem repeats。

荧光复合扩增检测3个Y-STR基因座单倍型林晓燕;王磊;原宝龙;冯常俊;黄代新【摘要】目的建立检测3个Y-STR基因座Y-GATA-A7.1、DYS456和DYS443的荧光复合扩增体系,并获取中国汉族人群单倍型频率分布.方法用荧光标记引物对郑州地区203名汉族男性无关个体进行3个基因座复合扩增,ABI 3100型遗传分析仪检测、分型.结果 Y-GATA-A7.1、DYS456和DYS443基因座分别检出5、6和6个等位基因,其基因多样性(GD值)分别为0.6692、0.5839和0.7053.三个基因座构成的单倍型共有44种,单倍型多样性(HD值)为0.9523.结论建立的3个Y-STR基因座荧光标记复合扩增系统具有很高的识别能力,可应用于法医学实践.【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2006(022)002【总页数】3页(P122-124)【关键词】Y-STRs;复合扩增;单倍型;Y-GATA-A7.1;DYS456;DYS443【作者】林晓燕;王磊;原宝龙;冯常俊;黄代新【作者单位】华中科技大学同济医学院法医学系,湖北,武汉,430030;郑州市公安局刑侦支队,河南,郑州,450003;郑州市公安局刑侦支队,河南,郑州,450003;郑州市公安局刑侦支队,河南,郑州,450003;华中科技大学同济医学院法医学系,湖北,武汉,430030【正文语种】中文【中图分类】DF795.2由于Y染色体特殊的结构和遗传特性，使其遗传标记在某些特殊的亲权鉴定和个人识别案中，如涉及父子、兄弟、叔侄和祖孙鉴定、混合斑鉴定以及犯罪现场斑痕的群体来源推断等，具有独特的应用价值。

本文用荧光标记引物建立了检测3个Y-STR基因座Y-GATA-A7.1、DYS456和DYS443的复合扩增体系，并调查3个基因座在郑州汉族群体中的单倍型分布。

1.1 样品郑州地区203份汉族无关健康男性个体血痕及3份女性血样，由郑州市公安局DNA室提供。

荧光标记复合扩增对中国汉族群体8个STR基因座的多态性郭红玲;姜成涛
【期刊名称】《中国法医学杂志》
【年(卷),期】2000(015)001
【摘要】@@ 应用STR复合扩增技术对FBI推荐的8个SFR基因座,即
D5S818,D13S317,D7S820,D16S539,vWA,TH01,TPOX,CSF1PO,进行荧光复合扩增,其产物经ABI377XL序列分析仪检测,对110名中国汉人无关个体进行频率调查,为大规模DNA数据库的建立提供有益探索.
【总页数】3页(P32-34)
【作者】郭红玲;姜成涛
【作者单位】公安部第二研究所,北京,100038;公安部第二研究所,北京,100038【正文语种】中文
【中图分类】D9
【相关文献】
1.24个Y-STR基因座荧光标记复合扩增体系的建立 [J], 刘宏;李越;刘长晖;刘超;葛斌文;陈林丽
2.6个miniSTR基因座荧光标记复合扩增的遗传多态性 [J], 石美森;百茹峰;于晓军;吕俊耀;陈树添
3.荧光标记复合扩增检测4个STR基因座多态性 [J], 李英碧;吴谨;侯一平;张霁;廖淼;张林;陈国弟
4.河南郑州地区汉族群体3个Y-STR基因座荧光复合扩增及遗传多态性 [J], 王克
杰;武红艳;杨卫红;代鹏飞;朱云山;王倩
5.7个Y-STR基因座荧光标记复合分型及在中国汉族群体中遗传多态性的研究 [J], 黄艳梅;祁英杰;朱运良;童大跃;伍新尧
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