功能基因组学主要研究技术共110页
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第29卷第2期作 物 学 报V o l.29,N o.2 2003年3月 194~201页A CTA A GRONOM I CA S I N I CA pp.194~201 M ar.,2003功能基因组学及其研究方法α张祖新 张方东 郑用琏(华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,湖北武汉430070)摘 要 功能基因组学是在结构基因组学丰富信息资源的基础上,应用大通量的实验分析方法并结合统计和计算机分析研究基因的表达、调控与功能以及生物的生长、发育规律的新型交叉学科。
基因功能研究采用从基因到表型和从表型到基因两种策略,使用多种方法创造大量变异及大通量识别并克隆基因和研究基因表达模式的技术。
如基因陷阱、基于差异杂交的基因表达差异研究技术、DNA芯片和蛋白质芯片等。
随着研究技术不断改进和创新,功能基因组研究将成为生命科学研究的重点和热点。
关键词 功能基因组;蛋白质组;从表型到基因;从基因到表型;差异杂交;DNA芯片中图分类号:Q753 文献标识码:AFuncti ona l Geno m i cs and It′sM ethodologyZHAN G Zu2X in ZHAN G Fang2Dong ZH EN G Yong2L ian(N ational K ey L ab of C rop Genetic Im p rove m ent,H uazhong A g ricultural U niversity,W uhan430070,China)Abstract Functi onal genom ics refers to the devel opm en t and app licati on of gl obal experi m en tal app roaches to assess gene functi on,gene exp ressi on p rofile,o rgan is m grow th,devel opm en t and m etabo lic regulati on by m ak ing use of the info r m ati on and reagen ts p rovided by structural genom ics.It is characterized by h igh th roughput experi m en talm ethodo l ogies com bined w ith statistical and computati onal analysis of the results.T he funda m en tal strategies in investigati on of gene functi on are from pheno type to gene and from gene to pheno type.M any large2scale experi m en tal m ethods are used to induce m utati on,iden tify and cl one gene.Fo r exa mp le:gene trap,studying m ethods of differen tial hybidrizati on2based gene exp ressi on,DNA ch i p s,p ro tein ch i p s,etc.W ith advance of i m p rove m en t and innovati on of m ethodo l ogy,w e believe that functi onal genom ics w ill becom e the ho t s po t in the field of life science.Key words Functi onal genom ics;P ro teom ics;F rom pheno type to gene;F rom gene to pheno type;D ifferen tial hybridizati on;DNA ch i p s 基因组(Genom e)的提出已有近80年的历史,它是指生物染色体的全套基因。
Introduction一、分子生物学的概念广义:分子生物学是一门在分子水平上研究生命现象、阐明生命本质的学科。
狭义:分子生物学是研究核酸、蛋白质等生物大分子的结构与功能,并从分子水平上阐述核酸与蛋白质、蛋白质与蛋白质之间相互作用的关系的学科。
二、分子生物学的发展简史历届诺贝尔生理、医学、化学奖,及分子生物学发展的里程碑事件。
三、分子生物学的研究内容1、生物大分子结构与功能2、基因的表达调控3、细胞信号转导4、DNA重组技术四、分子生物学的发展趋势1、功能基因组学研究2、转录组学研究3、蛋白质组学研究4、代谢组学研究5、生物信息学研究问答题:1. 2012诺贝尔的医学与化学奖分别授予了多能干细胞以及G蛋白偶联受体工作,就你目前所学的扩展知识对其中一种进行论述。
2.分子生物学主要研究哪4个方面?Section C:核酸的性质本章基本内容重点、难点:核酸的结构、性质一、核酸结构核酸是由核糖、碱基(嘌呤和嘧啶)、磷酸构成。
碱基与核糖构成核苷,核苷与磷酸形成5’-核苷酸。
碱基是含有N原子的嘌呤或嘧啶的衍生物。
核酸有两类:⑴DNA(脱氧核糖核酸):由脱氧核糖、碱基(A、G、C、T)、磷酸形成的5’-脱氧核苷酸构成。
⑵RNA(核糖核酸):由核糖、碱基(A、G、C、U)、磷酸形成的5’-核苷酸构成。
自然界的核苷酸多为核苷-5’-磷酸。
核苷酸有核苷单磷酸、核苷二磷酸和核苷三磷酸,分别用NMP(rNMP)、NDP(rNDP)和NTP(rNTP)表示;脱氧核苷单磷酸、脱氧核苷二磷酸和脱氧核苷三磷酸分别用dNMP、dNDP、dNTP 表示。
在DNA和RNA分子中,核苷酸之间以3’,5’-磷酸二酯键连接形成长链大分子。
核酸分子都有游离的5’端和游离3’端。
核酸序列从左到右按5’端向3’端方向书写核酸的碱基序列,其中的核苷酸用单个碱基字母A、G、C、T或U代表。
DNA双螺旋:1.1953年沃森和克里克提出两条DNA分子相互缠绕形成右手双螺旋,螺旋有大沟和小沟2.戊糖-磷酸骨架位于分子外侧,双链间对应碱基靠氢键形成碱基对,其中A 与T配对(2个氢键),G与C配对(3个氢键)。
生物技术学科的学习计划一、学科介绍生物技术学科是一门综合性学科,主要研究如何利用生物学和技术手段解决生物领域的问题,涉及生物学、生物化学、分子生物学、微生物学、生物信息学等多个学科的内容。
生物技术已成为当今世界生物科学研究的重要手段,广泛应用于医学、农业、环境保护等领域,对人类社会的发展产生了深远的影响。
二、学习目标1. 熟练掌握生物学、生物化学、分子生物学等基础学科的理论知识;2. 掌握生物技术的基本原理和技术方法;3. 具备运用生物技术解决实际问题的能力;4. 获得相关实验室操作技能,具备科学研究和实验设计能力;5. 学习掌握生物技术的最新进展和科研动态。
三、学习内容1. 基础课程(1)生物学主要学习生物的结构、功能、分类、进化等内容,了解生物的基本特征和生命活动规律。
(2)生物化学主要学习生物大分子的结构、功能、代谢途径等内容,了解生物分子的基本特性和代谢过程。
(3)分子生物学主要学习DNA、RNA的结构、功能、复制、转录、翻译等内容,了解基因表达调控和遗传信息传递的机制。
2. 专业课程(1)生物技术原理与方法主要学习生物技术的基本原理和常用方法,包括基因工程、蛋白质工程、细胞工程、酶工程等内容。
(2)生物信息学主要学习生物信息学的基本原理和技术方法,包括基因组学、蛋白质组学、比较基因组学、功能基因组学等内容。
(3)生物制药技术主要学习生物制药技术的原理和方法,包括常见生物药的生产工艺、质量控制、新型药物研发等内容。
3. 实践课程(1)实验室技能学习和熟练运用分子生物学、细胞生物学、生物化学等实验技术操作方法;(2)科研实训参与科研实验项目,进行科学研究实践,积累科研经验,提高科研能力;(3)实习实训参与相关企业、研究机构的实习实训,了解生物技术在实际生产和应用中的情况。
四、学习方法1. 注重理论学习要认真学习生物学、生物化学、分子生物学等基础学科的理论知识,掌握相关概念、原理和方法,增强基础知识储备。
功能基因组研究内容
功能基因组学(也称为后基因组学)是在基因组静态的碱基序列弄清楚之后转入对基因组动态的生物学功能学研究。
其研究内容包括基因功能发现、基因表达分析及突变检测。
基因的功能包括生物学功能、细胞学功能和发育上功能。
生物学功能是指基因作为蛋白质激酶对特异蛋白质进行磷酸化修饰;细胞学功能是指基因参与细胞间和细胞内信号传递途径;发育上功能是指基因参与形态建成等。
功能基因组学利用结构基因组所提供的信息和产物,发展和应用新的实验手段,通过在基因组或系统水平上全面分析基因的功能,使得生物学研究从对单一基因或蛋白质的研究转向多个基因或蛋白质同时进行系统的研究。
以上内容仅供参考,如需更专业、更详细的解释,建议查阅相关的学术文献或咨询相关专家。
基因组学概论基因:合成有功能的蛋白质或RNA所必需的全部DNA序列,即一个基因不仅包括编码蛋白质或RNA的核酸序列,还应包括为保证转录所必需的调控序列。
基因组(genome):生物所具有的携带遗传信息的遗传物质的总和。
真核生物基因组 1 核基因组2线粒体基因组3叶绿体基因组原核生物基因组1染色体2质粒基因组学(genomics):涉及基因组作图、测序和整个基因组功能分析的一门学科。
分为:结构基因组学,功能基因组学和比较基因组学。
结构基因组学:通过基因组作图、核苷酸序列分析确定基因组成、基因定位的科学。
基因组作图:在长链DNA分子的不同位置寻找特征性的分子标记,绘制基因组图。
根据分子标记可以准确无误地将已测序的DNA小片段锚定到染色体的位置上。
功能基因组学:利用结构基因组学,提供的信息和产物,在基因组系统,水平上全面分析基因功能的科学。
研究内容 1 进一步识别基因以及基因转录调控信息。
2 弄清所有基因产物的功能,这是目前基因组功能分析的主要层次。
3研究基因的表达调控机制,研究基因在生物体发育过程以及代谢途径中的地位,分析基因、基因产物之间的相互作用关系,绘制基因调控网络图。
比较基因组学:研究不同物种之间在基因组结构和功能方面的亲源关系及其内在联系的学科。
研究内容:1通过研究不同生物基因组结构和功能上的相似之处,不仅能勾画出一张详尽的系统进化树,而且将显示进化过程中最主要的变化所发生的时间及特点。
据此可以追踪物种的起源和分支路径。
2了解同源基因的功能。
3对序列差异性的研究有助于认识产生大自然生物多样性的基础。
定位候选克隆通过遗传分析等方法将疾病基因定位到染色体区段上。
对人类基因组图上该区段内的基因进行功能分析,并筛选出疾病基因。
(多用于单基因遗传病的筛查)单核苷酸多态性(SNP)是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。
SNP在人基因组中的发生频率比较高,是最常见的基因组差异。
和人类的健康有着密切的关系。