质粒提取及琼脂糖凝胶电泳
- 格式:ppt
- 大小:1.92 MB
- 文档页数:33
质粒dna的提取及电泳检测实验报告一、实验目的本实验的主要目的是学习质粒DNA的提取方法和电泳检测技术,并通过实验观察质粒DNA的提取情况和电泳检测结果。
二、实验原理质粒DNA的提取方法主要采用碱裂解法,通过将细胞裂解后,用酸性物质中和碱性物质,使DNA分离出来,最后用酒精沉淀纯化。
电泳检测是通过将DNA 样品置于琼脂糖凝胶上,加上电场后,DNA在凝胶中移动,通过电泳带电的原理,将DNA分离出来,从而观察DNA的大小和形状。
三、实验步骤1.准备样品:将含有目标DNA的菌落挑出放入EP管中,加入100μl TE缓冲液(10mmol/L Tris-HCl,1.0mmol/L EDTA,pH8.0),用微量移液器均匀混合。
2.制备裂解液:取10μl 0.25mol/L NaOH加入菌液中,轻轻摇匀,并立即加入200μl 1%SDS(十二烷基硫酸钠)液,翻转混匀。
3.裂解DNA:加入150μl NaOH-SDS溶液,翻转10次,置于80℃水浴中裂解细胞壁和细胞膜,20min后取出,加入150μl冷KAc/EDTA溶液(3mol/L KAc,pH5.2,0.5mol/L EDTA),翻转混匀,冰上静置5min。
4.离心沉淀:10000r/min离心10min,将上清液移至新的96孔板中,加入0.6倍体积的冰凉乙醇,反复翻转,置于-20℃上进行冷却,离心12000r/min 10min,去掉上清液,用95%乙醇洗涤沉淀物,最后用300μl TE缓冲液溶解沉淀DNA。
5.电泳检测:取相同浓度的DNA样品,加入琼脂糖,混合后加入电泳槽中,通电检测10min。
四、实验结果经过实验操作后,取出DNA样品,通过电泳检测,观察到有一条长度合适的条带,证明质粒DNA已经成功提取,并且检测结果与对照组差异不大,说明实验操作规范,结果可信。
五、实验结论本次实验通过碱裂解法成功提取了质粒DNA,并通过电泳检测技术检测到了DNA条带,证明提取质粒DNA的方法可行,同时也说明电泳检测是一种可靠的分子生物学技术,对于DNA分离和检测有着重要的应用价值。
分子生物学实验报告实验名称:质粒DNA的分离提取与琼脂糖凝胶电泳班级:生工xx姓名:xxx学号:xxxxxxxxx质粒DNA的分离提取与琼脂糖凝胶电泳1引言质粒(plasmid)是存在于细菌染色体外的一个或多个能独立复制并稳定遗传的小型环状双链DNA分子,分子量一般在0.2~10kb范围内[1]。
质粒由于其特殊的性质,已广泛地用作基因工程中的DNA分子无性繁殖的运载体,同时它也是研究DNA结构与功能的较好模型。
我们将通过本次实验了解质粒的特性及其在分子生物学研究中的作用,并掌握质粒DNA分离纯化的原理,学习碱裂解法分离质粒DNA和琼脂糖凝胶电泳分离的方法,同时熟练掌握移液器及离心机的使用。
2材料和方法2.1 实验原理2.1.1质粒DNA分离纯化原理质粒具有复制和控制机构,能够在细胞质中独立自主地进行自身复制,并使子代细胞保持它们恒定的拷贝数。
从细胞生存来看,没有质粒存在,基本上不妨碍细胞的存活,因此质粒是寄生性的复制子。
根据质粒的这种特性,通常采用DNA体外重组技术和微生物转化等基因工程的技术和方法,使重组到质粒的某种基因(如干扰素基因)带进受体细胞(如具有一定特性的大肠杆菌细胞等)表达它的遗传性质,改变或修饰寄主细胞原有的代谢产物,或产生新的物质(如干扰素)。
pMD18-T Vector是一种高效克隆PCR产物 (TA Cloning) 的专用载体。
这种载体是由pUC18载体改建而成,在pUC18载体的多克隆位点处的Xba I和Sal I识别位点之间插入了EcoR V识别位点,用EcoR V进行酶切反应后,再在两侧的3’端添加“T”而成。
因大部分耐热性DNA聚合酶进行PCR反应时都有在PCR产物的3’末端添加一个“A”的特性,所以使用这两种制品可以大大提高PCR产物的连接、克隆效率[2]。
所有分离质粒DNA的方法都包括3个基本步骤:培养细菌使质粒扩增;收集和裂解细菌;分离和纯化质粒DNA。
目前应用于质体DNA的纯化或抽取的方法众多,例如碱溶裂法(alkaline lysis)、热裂解法(boiling method)、氯化铯(CsCl)纯化法,及市售柱层析套管法等。
碱裂法小规模提取质粒DNA及琼脂糖凝胶电泳一.实验原理碱裂解抽提质粒DNA是基于染色体DNA与质粒DNA的变性和复性的差异而达到分离目的。
在碱性条件下,线性大分子细菌染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构互补链变性解开。
质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状结构的两条互补链不会完全分离。
当用pH4.8的NaAc高盐缓冲液调其pH值至中性,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型,保存在溶液中为可溶状态。
而染色体DNA不能复性,形成缠连的网状结构。
通过离心将细胞碎片,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来被除去,质粒DNA及部分RNA,蛋白质则存在于上清中,再用RNaseA 处理,酚/氯仿抽提和乙醇沉淀而获得质粒DNA。
质粒(plasmid)通常指细菌中独立于染色体外,能自主复制的遗传因子,它能够稳定地遗传某些性状。
天然的质粒都是环状双链DNA,大小从5kb到400kb不等。
质粒虽然独立于染色体外自主复制和遗传,但其复制又依赖于宿主编码的酶和蛋白质复制因子。
质粒按照其稳定拷贝数的多少可分为严谨型和松弛型,严谨型质粒在每个细菌细胞中有1~5拷贝,松弛型质粒在每个细菌细胞中可达10~200个,甚至更多拷贝。
1.质粒的结构:(1)抗性基因(Antibiotic resistance gene,such as Ampicillin resistance gene, Kanamycine resistance gene)ori, Origin of replication); (2)启始复制子((3)多克隆位点(MSC, Multiple cloning site or polylinker)2.细菌裂解的方法:(1)碱裂解法:0.2molNaOH+1%SDS(2)煮沸裂解法:沸水煮沸40秒(3)SDS裂解法:10%SDS,一般用于质粒大量提取。
SDS是一种阴离子表面活性剂,它既能使细菌细胞裂解,又能使一些蛋白质变性,所以SDS处理细菌细胞后,会导致细菌细胞壁的破裂,从而使质粒DNA以及基因组DNA从细胞中同时释放出来。
实验题目质粒DNA的提取与琼脂糖凝胶电泳鉴定实验目的掌握质粒提取的原理与各种试剂的作用和琼脂糖凝胶电泳原理和操作实验原理质粒存在于细菌,线粒体等,独立于染色体之外,能够稳定遗传并自我复制,是一个双链环装DNA。
对数期大肠埃希菌含有质粒。
溶液一可使细菌充分重悬,溶液二使细菌裂解,释放质粒和基因组DNA.溶液三起到中和作用,使得质粒DNA迅速复性,而基因组DNA因为分子巨大,复性时间长。
离心后,质粒DNA留在上清液,而基因组DNA和细胞碎片沉淀在离心管。
琼脂糖凝胶电泳蛋白质和核酸会根据pH不同带有不同电荷,在电场中受力大小不同,因此泳动的速度不同,根据这个原理可将其分开。
电泳缓冲液的pH在6~9之间,离子强度0.02~0.05为最适。
常用1%的琼脂糖作为电泳支持物。
用各种浓度的琼脂糖凝胶可以分离长度为200bp至近50bp的DNA。
此外,直接用低浓度的核酸染料进行染色,可以确定DNA 在凝胶中的位置。
实验主要步骤质粒DNA提取1.取4ml细菌平均分两份加入离心管,以12000r/min离心1min,去除上清液2.加100ul用冰预冷溶液I,移液枪打散细菌沉淀使其成为悬浮液3.加入200ul溶液II,盖紧盖口,翻转五次,充分混合,避免振荡,置于冰上4.加入150ul冰预冷溶液III,盖紧盖口,翻转离心管5次,温和摇匀直到粘稠的细菌裂解物出现,放于冰上5min5.离心管以12000r/min离心5min6.取上清液加入等量的酚:氯仿混合液,轻轻摇匀,以12000r/min离心7min7.取上清液加入2倍体积100%乙醇沉淀DNA,轻轻摇匀,12000r/min离心5min,去除上清液,倒置在滤纸上干燥8.用1ml70%乙醇洗涤DNA沉淀,按照步骤7去除上清液,空气干燥10min9.用50ul无菌水溶解质粒DNA琼脂糖凝胶电泳:1.制胶。
将电泳缓冲液和琼脂糖在微波炉中熔化,混匀,冷却至55°℃,加入EB染料,倒入已封好的凝胶灌制平台上,插上样品梳。
1.实验目的:(1)通过本次实验学习和掌握碱裂解法提取质粒;(2)通过本次实验学习琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术;2.实验材料及用品(1)实验仪器(apparatus):恒温培养箱(Constant temperature incubator)、恒温摇床(Constant temperature shaking table)、高速离心机(High speed centrifuge)、漩涡振荡器(Vortex mixer)、超净工作台(Bechtop)、高压灭菌锅(Autoclave)、微量加样器(Pipettes)、烧杯(beaker)、量筒(graduated cylinder)、玻璃棒(stir bar)、微波炉(microwave)、天平(Pan balance)、电泳梳子(comb)、电泳槽(electrophoresis tank)、电泳器(Electro-phoresis System)、紫外灯(Ultraviolet transilluminator )3)、材料与试剂(Reagents):①溶液I(Solution Ⅰ):50mmol/L 葡萄糖;25mmol/L 三羟基甲基氨基甲烷(Tris)Tris-HCl(pH8.0);10mmol/L 乙二胺四乙酸(EDTA)pH8.0溶液I可成批配制,每瓶约100ml,10磅高压蒸气灭菌15分钟,贮存于4℃。
②溶液Ⅱ(Solution Ⅱ):新鲜配制,等体积混合0.2mol/L NaOH(临用前用10mol/L贮存液现用现稀释);1% SDS (可用10%贮存液稀释配制)注意:SDS易产生气泡,不要剧烈搅拌。
③溶液III (Solution Ⅲ,100mL):加上后混匀会形成絮状沉淀60mL 5mol/L KAc,11.5mL 冰醋酸,28.5mL H2O (该溶液钾离子浓度为3mol/L,醋酸根离子浓度为5mol/L)④TE液缓冲液:10 mmol/L Tris-HCl(pH8.0);1 mmol/L EDTA(pH8.0)⑤70% 乙醇;⑥平衡酚:氯仿1:1:将量取25 ml Tris-HCl(pH8.0)平衡苯酚,加入24 ml 氯仿和 1 ml 异戊醇,充分混合后,移入棕色玻璃瓶中,4℃保存。
化工专业实验实验名称质粒DNA的提取与琼脂糖凝胶电泳班级化21 姓名张腾学号成绩实验时间同组成员王乙汀、陈秉伦、梁有向1 实验目的(1)掌握碱裂解法提取质粒的原理和方法(2)掌握琼脂糖凝胶电泳分离鉴定DNA的原理和方法。
2 实验原理2.1质粒质粒(plasmid)是在细菌中以独立于染色体之外的方式存在,是细菌染色体外的小型双链环状DNA复制子。
理论上讲,所有的细菌株系都含有质粒,有些质粒携带有帮助其自身从一个细胞转入另一个细胞的信息,即F质粒,有些则表达对一种抗生素的抗性,即R 质粒,还有一些携带的是参与或控制一些不同寻常的代谢途径的基因即降解质粒。
质粒的大小不定,小的不到1kb,大的超过500kb,每个质粒都有一段DNA复制起始点的序列,它帮助质粒DNA在宿主细胞中复制。
对细菌的某些代谢活动和耐药性表型具有一定的作用。
目前,已发现有质粒的细菌有几百种,已知的绝大多数的细菌质粒都是闭合环状DNA分子(简称cccDNA)。
细菌质粒的相对分子质量一般较小,约为细菌染色体的0.5%~3%。
根据相对分子质量的大小,大致上可以把质粒分成大小两类:较大一类的相对分子质量是40×106以上,较小一类的相对分子质量是10×106以下(少数质粒的相对分子质量介于两者之间)。
每个细胞中的质粒数主要决定于质粒本身的复制特性。
按照复制性质,可以把质粒分为两类:一类是严紧型质粒,当细胞染色体复制一次时,质粒也复制一次,每个细胞内只有1~2个质粒;另一类是松弛型质粒,当染色体复制停止后仍然能继续复制,每一个细胞内一般有20个左右质粒。
一般分子量较大的质粒属严紧型。
分子量较小的质粒属松弛型。
质粒的复制有时和它们的宿主细胞有关,某些质粒在大肠杆菌内的复制属严紧型,而在变形杆菌内则属松弛型。
在基因工程中,常用人工构建的质粒作为载体。
人工构建的质粒可以集多种有用的特征于一体,如含多种单一酶切位点、抗生素耐药性等。
实验一:质粒DNA提取+琼脂糖凝胶电泳*实验目的:1.掌握质粒DNA提取的基本原理和方法2.掌握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法*实验原理:1.DNA提取原理1)DNA提取要求:①保证DNA一级结构的完整性;②排除其他分子的污染,使其纯度尽可能提高。
2)DNA样品来源:①培养细胞;②组织样本;③血液样本。
3)主要试剂和材料及仪器:试剂和材料:RNA酶A、细胞悬浮液(Buffer P1)、细菌裂解液(Buffer P2)、中和液(Buffer P3)、漂洗液PW1、漂洗液PW2、洗脱液、质粒DNA吸附柱、滤液收集管仪器:微量移液器、台式微量高速离心机、电泳仪、水平电泳槽、紫外透射仪或凝胶成像系统。
2.电泳原理:1)概念:电泳是指带电粒子在电场中向电势降低的方向移动的现象,移动速度与粒子大小及所带电荷多少有关。
在一定pH条件下,核酸及蛋白质等生物分子呈带电状态,可以进行电泳分析。
2)迁移方向:DNA由负极向正极迁移3)影响目标物迁移速率的因素:分子大小、构象、凝胶浓度、琼脂糖种类、电泳缓冲液、嵌入染料的存在和使用电压等。
4)荧光强度(得率):荧光的强度是同DNA片段的大小或数量成正比的。
5)琼脂糖凝胶电泳原理:(1)关于电泳技术:电泳常用于分离和纯化那些分子大小电荷性状或分个构象有所不同的生物大分子一尤其是蛋白质和核酸。
正因为如此,电泳已成为生物化学和分子生物学中应用最为广泛的技术之一,其中在分子生物学实验中最为常用的是琼脂糖凝胶电泳。
琼脂糖是一种海藻多糖,琼脂糖胶分离范围很大,但其分辨率却相对较低。
通过改变琼脂糖凝胶的浓度,应用标准的电泳技术可以分离200到50,000 bp大小的DNA片断。
一般琼脂糖胶浓度在0.5%到4%之间,琼脂糖凝胶浓度越大,凝胶就越硬。
较高浓度的琼脂糖胶有利于较小的DNA片断分离,而较低浓度的琼脂糖胶则可以分离较大的DNA片断。
(2)琼脂糖凝胶电泳条带的观察:通过观察示踪染料的迁移距离可以判断DNA的迁移距离。