(理学)结构化学课件第五章
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§5.0 预备知识5.0.1 数学复习第五章 分子轨道理论 P1055.0.2 线性变分法原理125.0.1 数学复习一、矩阵m×n 个数排成 m 行、n 列的矩形数 表,谓之。
(1) 矩阵相等⎛ a 11 a12 a 13 La 1n ⎞ ⎟ ⎜ ⎜ a a a La 2n ⎟ A m×n= ⎜ 21 22 23 = ( a ij ) m×n LLLLLLL ⎟ ⎟ ⎜ ⎟ ⎜a a ⎝ m1 m2 am3 Lamn ⎠例如:⎛a a ⎞ ⎛b b ⎞ ⎜ ⎟ ⎜ ⎟ A = ⎜ 11 12 ⎟ 和 B = ⎜ 11 12 ⎟ ⎝ a 21 a 22 ⎠ ⎝b 21 b 22 ⎠a ⎞ ⎛b b ⎞ a =b ,a =b ⎛a 所谓 A = B, 或 ⎜ 11 12 ⎟ = ⎜ 11 12 ⎟ 即是 11 11 12 12 ⎜ a a ⎟ ⎜b b ⎟ a 21 = b 21 , a 22 = b 22 ⎝ 21 22 ⎠ ⎝ 21 22 ⎠所谓 AB = C a b +a b ⎞ ⎛ a a ⎞⎛ b b ⎞ ⎛ c c ⎞ ⎛ a b + a b 即 ⎜ 11 12 ⎟⎜ 11 12 ⎟ = ⎜ 11 12 ⎟ = ⎜ 11 11 12 21 11 12 12 22 ⎟ ⎜ a a ⎟⎜b b ⎟ ⎜ c c ⎟ ⎜ a b + a b a b + a b ⎟ 22 22 ⎠ ⎝ 21 22 ⎠⎝ 21 22 ⎠ ⎝ 21 22 ⎠ ⎝ 21 11 22 21 21 12若( ij)×n = bij)×n a m ( mm×n 个等式则 aij = bij (i =1, 2,L, m ; j =1,2,L, n)(2) 矩阵的乘积A = (a ij) m×n 与 B = (b ij) n×P 的乘积,记为 AB = Cm× P = (cij ) m×Pc ij = ∑ a i k b k j = a i1 b 1 j + a i 2 b 2 j +L+ a i n b n j (i =1, 2,L, m ; j =1,2,L, n)k =1 n⎛ a11 a12 ⎞ ⎛ x1 ⎞ ⎛ b1 ⎞ ⎟⎜ ⎟ ⎜ ⎟ 例如:⎜ ⎜ a a ⎟ ⎜ x ⎟ = ⎜b ⎟ ⎝ 21 22 ⎠ ⎝ 2 ⎠ ⎝ 2 ⎠3⎧ a11 x1 + a12 x2 = b1 可写为: ⎨ ⎩a21 x1 + a22 x2 = b24二、m×n 阶线性代数方程组的缩写 二、mm个方程,n个未知数的一次代数方程组: 个方程,n若令系数矩阵A、未知数矩阵X和常数矩阵B 若令系数矩阵A、未知数矩阵X和常数矩阵B⎛ a 11 a12 a 13 La 1n ⎞ ⎜ ⎟ ⎜ a a a La 2n ⎟ A = ⎜ 21 22 23 LLLLLLL ⎟ ⎜ ⎟ ⎜ a a a La ⎟ mn ⎠ ⎝ m1 m2 m3⎛ x1 ⎞ ⎜ ⎟ ⎜x ⎟ X =⎜ 2 ⎟ M ⎜ ⎟ ⎜x⎟ ⎝ n⎠ ⎛ b1 ⎞ ⎜ ⎟ ⎜b ⎟ B =⎜ 2 ⎟ M ⎜ ⎟ ⎜b ⎟ ⎝ m⎠⎧ a11 x1 + a12 x2 +L+ a1n xn = b1 ⎪ a x + a x +L+ a x = b ⎪ 21 1 22 2 2n n 2 ⎨ ⎪ LLLLLLLLLLL ⎪am1 x1 + am2 x2 +L+ amn xn = bm ⎩则,方程组可表示为:AX = B⎛ a 11 a12 a 13 La 1n ⎞ ⎛ x1 ⎞ ⎛ b1 ⎞ ⎟ ⎜ ⎟ ⎜ ⎟ ⎜ ⎜ a 21 a22 a 23 La 2n ⎟ ⎜ x2 ⎟ ⎜ b2 ⎟ ⎜ LLLLLLL ⎟ ×⎜ M ⎟ = ⎜ M ⎟ ⎟ ⎜ ⎟ ⎜ ⎟ ⎜ ⎟ ⎜ ⎟ ⎜ ⎟ ⎜a a ⎝ m1 m2 am3 Lamn ⎠ ⎝ xn ⎠ ⎝ bm ⎠此式可缩写为:∑a xj =1nij j= bii =1, 2, 3,L, m例如:5⎧ a1 x1 + b1 x2 = c1 ⎨ ⎩a2 x1 + b2 x2 = c2⎛ a1 b1 ⎞⎛ x1 ⎞ ⎛ c1 ⎞ ⎟⎜ ⎟ ⎜ ⎟ 可写为: ⎜ ⎜ a b ⎟⎜ x ⎟ = ⎜ c ⎟ ⎝ 2 2 ⎠⎝ 2 ⎠ ⎝ 2 ⎠61三、行列式a 11 a12 a 13 La 1n a 21 a22 a 23 La 2nLLLLLLL行列式给出了各 个元素之间的一 个运算结果。
第五章分子结构Ⅲ计算化学基础(讲座)§5.0 计算化学发展背景5.0.1 计算机的发展—硬件背景计算机的硬件高速发展计算速度高速增长大量原来无法想象的计算可以轻易完成2005.11 TOP51. DOE/NNSA/LLNL 280.62. IBM Thomas J. Watson Research Center 91.293. DOE/NNSA/LLNL 63.394. NASA/Ames Research Center/NAS 51.875. Sandia National Laboratories 38.27 2006.11 TOP51. DOE/NNSA/LLNL 280.62. NNSA/Sandia National Laboratories 101.43. IBM Thomas J. Watson Research Center 91.294. DOE/NNSA/LLNL 75.765. Barcelona Supercomputing Center 62.63 2007.11 Top 51. DOE/NNSA/LLNL BlueGene 478.22. Forschungszentrum Jülich1673. New Mexico Computing Applications Center 1274. Computational Research Lab. TATA SONS 1185. Swedish Government Agency 103 2008.11 Top 51. DOE/NNSA/LANL Roadrunner11052. Oak Ridge National Lab Jaguar10593. NASA/Ames Res Center Pleiades4874. DOE/NNSA/LLNL BlueGene/L4785. Argonne National Laboratory BlueGene/P4502009.11 Top51. Jaguar -Cray XT5-HE Opteron Six Core2.6 GHz (Oak Ridge National Laboratory)17592. Roadrunner -BladeCenter QS22/LS21 Cluster, PowerXCell 8i3.2 Ghz / Opteron DC 1.8 GHz, Voltaire Infiniband (DOE/NNSA/LANL)10423. Kraken XT5 -Cray XT5-HE Opteron Six Core 2.6 GHz (National Institute for Computational Sciences/University of Tennessee)831.74. JUGENE -Blue Gene/P Solution(Forschungszentrum Juelich (FZJ))825.55. Tianhe-1-NUDT TH-1 Cluster, Xeon E5540/E5450, ATI Radeon HD 4870, Infiniband (National SuperComputer Center in Tianjin/NUDT)563.1TOP10 2010.61.Jaguar-Oak Ridge National Laboratory17592.Nebulae-Dawning TC3600 国家超级计算深圳中心12713.Roadrunner-DOE/NNSA/LANL10424.Kraken XT5-Cray XT5-HE National Institute forComputational Sciences/University of Tennessee831.75.JUGENE-Blue Gene Forschungszentrum Juelich825.56.Pleiades-SGI Altix ICE NASA/Ames ResearchCenter/NAS772.77.Tianhe-1国家超级计算天津中心563.18.BlueGene/L-DOE/NNSA/LLNL478.29.Intrepid-Blue Gene Argonne National Laboratory458.610.Red Sky-Sun Blade Sandia National Laboratories433.5TOP10 2010.111.Tianhe-1国家超级计算天津中心25662.Jaguar-Oak Ridge National Laboratory17593.Nebulae-Dawning TC3600 国家超级计算深圳中心12714.TSUBAME 2.0 GSIC Center, Tokyo Institute ofTechnology 11925.Hopper DOE/SC/LBNL/NERSC 10546.Tera-100 Commissariat a l'Energie Atomique(CEA)10507.Roadrunner-DOE/NNSA/LANL10428.Kraken XT5-Cray XT5-HE National Institute forComputational Sciences/University of Tennessee831.79.JUGENE-Blue Gene Forschungszentrum Juelich825.510.Cielo-DOE/NNSA/LANL/SNL816.6Cray XE6 12-core 2.1 GHzHopperHP ProLiant SL390s G7 Xeon 6C X5670,Nvidia GPUTSUBAME 2.0 Dawning TC3600 Blade, Intel X5650,NVidia Tesla C2050 GPUNebulae Cray XT5-HE Opteron 6-core 2.6 GHz JaguarNUDT TH MPP, 14336颗至强X5670处理器(六核,2.93GHz 主频),GPU 7168块Tesla M2050计算卡(1.15GHz ,双精度浮点515Gflops 、单精度浮点1.03Tflops)Tianhe-1A“南开之星”800个Xeon 3.06G CPU, 400个节点,实测计算能力最终达到了3.231万亿次,实测效率达到68.74% TOP 20(预测)Top 42(2004.6)Top 61(2004.11)Top135(2005.11)Top235 (2006.6)Top348 (2006.11)跌出Top500(2007.6 第500名4.005万亿)(2007.11 第500名5.93万亿)(2008.11 第500名12.60万亿)(2009.11第500名20.051万亿)1国家超算中心-天津255-257 Service Provider3国家超算中心-深圳261,262 Engineering Company28中科院过程工程研究所267,268 Telecommunication Company 35上海超算中心344-347 Network Company68中科院网络中心359 Network Company154Engineering Company 368 Telecommunication Company 172Telecommunication Company 394 吉林大学210Telecommunication Company 417-422 Internet Service211Telecommunication Company 438 Telecommunication Company 230Telecommunication Company 441 Telecommunication Company 243-245Engineering Company 442,443 Service Provider246-248Network Company 488 南京大学5.0.2 软件背景•软件的发展→使用户勿需具备高深的理论知识,只要有一般的计算机应用能力,就可以很容易地完成许多计算化学的简单工作。
结构化学第五章多原子分子的结构和性质多原子分子是由两个或更多个原子通过共价键连接在一起的分子。
在结构化学的研究中,对多原子分子的结构和性质进行分析是非常重要的。
本章主要介绍多原子分子的键角、电荷分布、分子极性以及它们的几何结构等方面的内容。
首先,多原子分子的键角是指由两个原子和它们之间的共价键所形成的夹角。
键角的大小直接影响分子的空间构型和立体化学性质。
结构化学家通过分析分子的键角可以确定分子的几何结构。
一般来说,当原子间的键角接近于109.5°时,分子的几何结构为四面体形;当键角接近120°时,分子的几何结构为三角锥形;当键角接近180°时,分子的几何结构为线性形。
其次,多原子分子的电荷分布对分子的性质起着重要的影响。
分子中的原子会通过共价键共享电子,形成电子云密度的分布。
根据电负性差异,原子会对电子云产生一定程度的吸引或排斥,并形成了分子中的正负电荷分布。
根据这种电荷分布,可以判断分子的极性。
当分子的正负电荷分布不平衡时,就会形成极性分子,如水分子;而电荷分布平衡时,就会形成非极性分子,如二氧化碳分子。
另外,多原子分子的分子极性也与分子的几何结构密切相关。
分子的几何结构会影响分子的偶极矩,从而决定分子的极性。
当一个分子的几何结构对称时,分子的偶极矩为零,分子为非极性分子;而当分子的几何结构不对称时,分子的偶极矩不为零,分子为极性分子。
例如,二氧化碳分子由于O=C=O的线性结构使得分子的偶极矩为零,因此二氧化碳是非极性分子;而水分子由于O-H键的角度小于180°,使得分子的偶极矩不为零,是极性分子。
在多原子分子中,还存在着共振现象。
共振是指在分子中一些共价键的原子成键和非键电子位置可以相互交换的现象。
共振的存在使得分子的键长和键能难以准确确定,同时影响分子的稳定性和反应性质。
共振的存在对于解释一些分子性质,如分子的稳定性和电子云的分布具有重要作用。
总之,多原子分子的结构和性质是结构化学研究中的重要内容。