亚洲带绦虫成虫谷胱甘肽S-转移酶基因的克隆及生物信息学分析
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l i b r a t o r y o f Ta e n i a a s i a t i c a b y u s i n g t h e b i o i n f o r ma t i c s t o o l s i n b i o i n f o r ma t i c s we b s s i t e s u c h a s NC BI ( h t t p: / / www. n c b i . n l m. n i h . g o v / ) ,Ex Pa S y( h t t p: / / www. e x p a s y . o r g / )a n d s o me e l s e s o f t wa r e p a c k a g e s o f b i o i n f o r ma t i c s . Th e c DNA s e q u e n c e wa s
原应 用前 景 。 关键词 : 亚 洲 带绦 虫 ; 谷胱甘肽 S _ 转移酶 ; c D NA; 生物信息学
中 图分 类 号 : R 3 8 3 . 3 文 献标 识 码 : A
Cl o n i ng a nd b i o i n f o r ma t i c s a na l y s i s o f c DNA e nc o di ng a n o v e l g l u t a t hi o n e S _ t r a ns f e r a s e f r o m Ta e ni a a s i at i c a
H UANG J i a n g,H U Xu — c h u,XU J i n,HUA NG Ya n,YU Xi n - b i n g,
B AO Hu a i — e n ,L ANG S h u — y u a n ,L I A0 X i n g - j i a n g
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2 0 0 7 ,2 3( 1 1 )
中 国 人 兽 共 患 病 学 报
Chi ne s e J oH r n a l o f Zo o no s 1 0 0 2 —2 6 9 4 ( 2 0 0 7 ) 1 1 —1 0 9 3 —0 4
亚洲 带 绦 虫 成 虫 谷 胱 甘肽 S 一 转 移 酶 基 因 的 克 隆 及 生 物信 息 学 分 析 *
黄 江 , 胡 旭初 , 徐 劲 , 黄 艳 , 余新 炳 , 包怀 恩 , 郎 书源 , 廖 兴 江
摘 要 : 目 的 分 析 亚 洲 带 绦 虫成 虫谷 胱 甘 肽 S 一 转移酶( G S T, g l u t a t h i o n e S - t r a n s f e r a s e ) 基 因结 构 并 预 测 其编 码 蛋 白的结 构 和 功 能 。方 法 利 用 生物 信 息 网 站 如 美 国 国家 生 物 技 术 信 息 中 心 ( NC B I ,h t t p : / / ww w. n c b i . n l m. n i h . g o v / ) 和 瑞 士 生物 信 息 学研 究所 的蛋 白分 析 专 家 系统 ( E x P A S Y, h t t p : / / c a . e x p a s y . o r g / ) 中 生物 信 息 学分 析 工 具 , 并 结 合 其 它分 析 软 件 , 从获得 亚 洲 带 绦 虫成 虫全 长 c D NA 质 粒 文 库 的 表 达 序 列 标 签 ( E S T, e x p r e s s i o n s e q u e n c e t a g ) 中 识别 G S T基 因, 分 析 该 基 因 的结 构 并 预 测 其 编 码 的蛋 白质 的结 构 和 功 能特 征 。结 果 该 基 因与 猪 带 绦 虫 G S T 的一 致 性 为 9 4 , 相似性 为 9 7 ; 全长 8 1 0 b p , 编码 区 为2 8 ~6 8 7 b p , 编码 2 1 9个 氨 基 酸 , 无 各 种亚 细 胞 定位 序 列 , 具 有 多个 潜 在 的磷 酸 化 位 点 , 蛋 白 的理 化 性 质 稳 定 ; 预 测 三 个 主 要 的抗 原 表 位 8 9 a a  ̄9 4 a a, 2 7 a a  ̄3 2 a a, 1 1 9 a a~ 1 2 4 a a位 于 空 间结 构 上 相 距 较 远 的分 子表 面 , 前 面 两个 表 位 属 于 绦 虫共 有 的 线 性抗 原 表 位 。结 论 从 亚 洲 带绦 虫 成 虫 c D NA 文 库 中筛 选 出 G S T基 因, 预 测 为 胞 浆 型 蛋 白, 可 能 具 有 较 好 的 免 疫 诊 断抗
( De p a r t me n t o f P a r a s i t o l o g y, G u i y a n g Me d i c a l C o l l e g e 。G u i y a n g 5 5 0 0 0 4 . C h i n a )
ABS T RACT: I n o r d e r t o a n a l y z e a n d p r e d i c t t h e s t r u c t u r a l c h a r a c t e r i s t i c s o f g l u t a t h i o n e S - t r a n s f e r a s e f r o m Ta e n i a a s i a t i c a b y b i o i n f o r ma t i c s , a f u l l - l e n g t h c DNA s e q u e n c e e n c o d i n g g l u t a t h i o n e S - t r a n s f e r a s e wa s i d e n t i f i e d f r o m f u l l - l e n g t h c DNA p l a s mi d