酚-氯仿抽提DNA
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作者: 渭水凡夫(站内联系TA)发布: 2013-04-06最近在博客上看到的一篇可以作为入门级《分子生物学十万个为什么》和大家分享一下用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
2. 不能完全抑制RNase的活性。
氯仿的作用?氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。
(酚易溶于氯仿中)用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。
异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。
另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或 NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
原理:动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白(DNP)可溶于水或浓盐溶液(如1mol/L氯化钠),但在L氯化钠盐溶液中溶解度最低,而核酸核蛋白(RNP)则在L氯化钠中溶解度最大,利用这一性质可将其分开。
将沉淀物溶解于生理盐水,加入去污剂十二烷基硫酸钠(SDS)溶液,使DNA与蛋白质分离开。
加入固体氯化钠使其浓度达到1mol/L,使DNA溶解。
加氯仿-异戊醇去除蛋白质,也可重复该步操作得较纯DNA。
最后用95%乙醇沉淀DNA。
溶解:将离心后除去RNA的沉淀,用30ml生理盐水溶解,充分搅拌后,匀浆一次。
加4毫升10%SDS溶液,使溶液的SDS浓度达到1%左右,边加边搅拌,放置60 ℃水浴保温10分钟(不停搅拌),冷却。
酚-氯仿法提取DNA时,需要注意以下几点:
1. 在吸取基因组DNA时,需要使用专用的粗口吸头,避免使用普通的吸头,因为这可能会切断或损坏DNA。
2. 在准备实验的过程中,应将DNA样品放在碎冰上,以保持其低温状态。
3. 加缓冲液后,可以轻轻晃动或轻弹试管,以加速DNA的溶解。
4. 加入缓冲液后,可以置于4度过夜,这样也有助于溶解DNA。
5. 将DNA溶液在65度下温育10分钟,可以灭活DNase,防止其降解DNA。
6. 在抽提过程中,如果水相和有机层的界面不太清楚,说明其中蛋白质含量较高,这时可以增加酚/氯仿抽提的次数或适当延长离心的时间。
7. 在酚抽提过程中,如果上清液太粘稠而无法进行水相转移,可以加入适量TES稀释后再抽提。
8. 氯仿的作用是克服酚的缺陷,加快有机相与液相的分层,最后用氯仿抽提出DNA。
由于酚易溶于氯仿中,可以快速去掉核酸溶液中的微量酚。
9. 加入异戊醇能减小分子表面张力,减少抽提流程中的泡沫发生。
通常选用氯仿与异戊醇为24:1的比例,异戊醇可
以帮助分相,使离心后的上层水相、下层有机溶剂相、中层变性蛋白相保持稳定的层次。
以上信息仅供参考,建议咨询专业人士获取准确信息。
酚氯仿法提取DNA原理及方法酚氯仿法是一种常用的DNA提取方法,其原理是利用酚氯仿溶液对细胞和细胞碎片进行破碎,然后通过离心分离DNA。
以下是详细的步骤:1.细胞裂解:将待提取DNA的样本(细胞、组织等)加入含有酚氯仿的裂解缓冲液中,将溶液均匀混合。
酚氯仿是一种有机溶剂,能够破坏细胞膜和核膜,使细胞释放出DNA。
2.蛋白质沉淀:加入混合溶液中的蛋白质会和酚氯仿相互分离,形成一个物理屏障。
离心沉淀后,由于DNA密度比蛋白质低,DNA会上浮到上层,而蛋白质则沉淀在下层。
3.DNA沉淀:将上层液体转移到新的离心管中,加入同等体积的冷乙醇或异丙醇,然后轻轻振荡以促使DNA沉淀。
酒精能够与DNA相互作用,使DNA分子变得更加疏水,从而沉淀下来。
4.清洗:离心沉淀后,将上清液倒掉,加入70%乙醇洗涤沉淀。
乙醇通过去除残留的酚氯仿和其他杂质,使沉淀的DNA纯化。
5. 溶解:将洗涤后的DNA沉淀干燥或用适量的缓冲液溶解,最常用的是TE缓冲液(含有10 mM Tris-HCl和1 mM EDTA),以便后续的DNA浓度测定和实验操作。
总结来说,酚氯仿法利用酚氯仿溶液破坏细胞膜和核膜,将DNA从细胞中释放出来。
离心分离蛋白质和DNA,然后通过酒精沉淀和乙醇洗涤纯化提取的DNA。
这种方法简单快速,并且能够获得较纯的DNA样品。
不过,酚氯仿法在提取DNA时会同时提取到RNA和蛋白质,因此在一些需要高纯度DNA的实验中可能不适用。
在使用酚氯仿法提取DNA时,还需要注意避免DNA的降解,避免污染和交叉污染,以及正确保存提取的DNA样品。
酚氯仿抽提一、DNA抽提试剂:1.酚/氯仿/异戊醇(25:24:1);2.3M NaAc(pH 5.2);3.80%乙醇。
步骤:1. 样品加去离子水至总体积100 μL;2.加入100 μl已配好的酚/氯仿/异戊醇(25/24/1),充分震荡后,10,000 rpm离心10 min;3. 转移上清于新的离心管中,按体积的1/10加入3M NaAc(pH5.2),按体积的2倍加入100%乙醇,轻轻混匀后,-20 ︒C静至至少30 min沉淀DNA;4. 4 ˚C,12,000 rpm离心10 min,弃去上清;5. 1 mL的80%乙醇洗沉淀,10,000 rpm离心2 min;6. 弃去乙醇,风干后,加入适量去离子水或TE溶解质粒。
二、RNA抽提试剂:1.水饱和酚;2.氯仿;3.3M NaAc(pH 5.2,DEPC水配制);4.75%乙醇(DEPC水配制)。
步骤:1. 加入DEPC水至总体积为100 μL;2. 加入水饱和酚/氯仿(1:1),室温混匀;3. 4°C, 12, 000 rpm, 15 min;转移上清至新的离心管中;4. 加入等体积的氯仿,4 ︒C, 12, 000 rpm, 15 min, 取上清;5. 加入上清体积1/10的3M NaAc(pH5.2, DEPC水配制)和2.5倍体积的100%的乙醇,-80 ︒C沉淀过夜;6. 4 ︒C离心,12, 000 rpm, 30 min;7. 去上清,加入100 μL 75%乙醇(DEPC水配制),洗涤沉淀;8. 12, 000 rpm 离心5 min,去乙醇;风干,溶于适量DEPC水中,-20 ︒C保存。
酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿(Phenol-Chloroform)抽提DNA是一种常用的DNA 提取方法。
其原理是基于酚在酸性条件下具有与DNA高度亲和性的特点,可以将DNA从细胞溶液中抽提出来。
具体的步骤如下:
1. 细胞溶解:首先将待提取DNA的细胞样品加入适量的细胞裂解缓冲液中,通过机械或化学方法使细胞壁破裂,释放出细胞内的DNA。
2. 酚抽提:加入相同体积的酚溶液,并进行充分混合。
酚能与DNA形成复合物,并与其他细胞组分(如蛋白质和脂质)发生分层,形成一个DNA上层和一个下层。
3. 脱水:将抽提产物转移至新管中,加入酒精或异丙醇,通过离心将DNA沉淀下来。
脱水过程可以去除溶液中的多余酚,提高DNA沉淀的纯度。
4. 酯化:将DNA沉淀物溶解在适量的TE缓冲液(含有EDTA和Tris)中,经过一定的时间酯化,使DNA变得更为稳定。
5. 沉淀:通过低温离心将DNA沉淀下来,去除上清液。
6. 洗涤:用70%的乙醇洗涤并去除残余的盐、酚和脏物质。
洗涤过程中,可以多次进行离心和上清液倒掉操作。
7. 干燥:最后,将DNA输送液置于干燥器中或者自然风干,以去除溶剂中的残留物质,得到纯度较高的DNA。
通过酚氯仿抽提DNA的方法,可以从复杂的细胞中提取出高质量、高纯度的DNA,以供后续分子生物学研究使用。
基因组DNA的提取方法—酚-氯仿抽提法1. 将95% 酒精浸泡过的标本取出,用吸水纸吸去标本表面的乙醇,用1×TE Buffer浸泡两次,每次20min。
2. 解剖取个体胸部肌肉组织约0.02g,将组织转入1.5mL离心管加入1mL液氮使其迅速冻结, 用玻璃棒迅速有力地将团状组织研磨成细粉末。
3. 加入500uL消化液(消化液成分为NaCl 0.1mol/L, Tris-HCl 0.3mol/L, EDTA 0.01mol/L, SDS 1%, Proteimase K 200ug/mL),于56℃恒稳水浴中消化8-10小时, 每隔两小时摇晃一次。
4. 消化结束后,加入等体积的饱和酚(pH7.6),用封口胶封好,置于混匀器上约12小时,离心10分钟(10000r/m)。
5. 取上清液于另一新的EP管中,加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),缓慢抽提20分钟,离心10分钟(10000r/m)。
6. 取上清液于另一新的EP管中,加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),缓慢抽提20分钟,离心10分钟(10000r/m)。
7. 取上清液于另一新的EP管中,加入2倍体积的预冷的无水乙醇,-20℃放置2小时。
8. 离心后,DNA沉积于管底,用70%的预冷的乙醇洗涤2次,37℃烘干。
烘干的DNA溶于TE中,4℃保存。
9. 于基因组DNA中加入终浓度为50ug/mL的RNase(每次使用前90℃灭活10min),于37℃消化1.0-1.5hr。
10. 用0.8%的琼脂糖凝胶检测,取3μL DNA样品及2μL Load-buffer (含溴酚蓝和缓冲液),加入点样孔。
实验所用Marker是 DNA(EcoR/HindIII),100V电压电泳90分钟。
凝胶成象分析仪进行检测。
11. 用紫外可见分光光度计测定DNA的OD值,判定DNA纯度和浓度。
酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。
每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DN A裂解液(300μl),研磨后再加入300μl DNA裂解液冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56℃,5h)。
4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。
5.离心:12000R,7min,4℃。
离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。
8.在含有上清液的离心管中加入Tri s饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10mi n。
9.离心:12000R,7min,4℃。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。
11.离心:12000R,7min,4℃。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的100%的酒精。
-20℃过夜。
13.将样品取出,12000R,7min,4℃离心。
14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20℃冷冻的酒精,反复吹打溶解。
15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。
16.提取DNA完成。
溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了D Nase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与D NA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
dna分离纯化方法及原理
1. 酚-氯仿抽提法:这是一种传统的 DNA 提取方法。
原理是利用酚和氯仿的混合物来溶解细胞膜和蛋白质,使 DNA 与其他细胞成分分离开来。
然后通过离心和有机溶剂的萃取,将 DNA 从混合物中提取出来。
2. 硅胶柱层析法:该方法基于 DNA 与硅胶柱子之间的吸附和解吸作用。
将待提取的样本加载到硅胶柱上,通过柱子的吸附作用,使 DNA 与其他杂质分离开来。
然后用适当的洗脱缓冲液将 DNA 从柱子上洗脱下来。
3. 磁珠法:这是一种利用磁性颗粒结合 DNA 的方法。
将磁珠与样本混合,使 DNA 与磁珠结合。
通过外部磁场的作用,可以将磁珠与结合的 DNA 分离开来,从而实现 DNA 的纯化。
4. 质粒抽提法:这种方法适用于提取质粒 DNA。
通过碱处理破坏细菌细胞壁和细胞膜,使质粒 DNA 从细菌细胞中释放出来。
然后通过离心和沉淀等步骤,将质粒 DNA 与其他杂质分离开来。
5. 超声波法:利用超声波的能量,将细胞破碎,使 DNA 释放到溶液中。
然后通过离心和沉淀等步骤,将 DNA 与其他杂质分离开来。
这些方法的原理基于不同的物理、化学或生物学原理,旨在从复杂的生物样本中选择性地分离和纯化 DNA。
选择合适的方法取决于样本类型、纯度要求和实验目的等因素。
在 DNA 分离纯化过程中,还需要注意操作规范、防止污染,并进行质量控制和检测,以确保获得高质量的 DNA 用于后续的分析和实验。
酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。
每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DNA裂解液(300μl),研磨后再加入300μlDNA裂解液冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56℃,5h)。
4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。
5.离心:12000R,7min,4℃。
离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。
8.在含有上清液的离心管中加入Tris饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10min。
9.离心:12000R,7min,4℃。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。
11.离心:12000R,7min,4℃。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的100%的酒精。
-20℃过夜。
13.将样品取出,12000R,7min,4℃离心。
14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20℃冷冻的酒精,反复吹打溶解。
15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。
16.提取DNA完成。
溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
2. 不能完全抑制RNase 的活性。
苯酚-氯仿法小提DNA试剂配制:1:细胞裂解液:0.32 M 的蔗糖;5 mM 的MgCl22:DNA稀释缓冲液:0.375 M的NaCl;12 mM的Tris-HCl [PH 7.5]3:10%的SDS [PH 7.2]4:5 M的NaCl5:苯酚-氯仿混合液V/V = 1:16:无水乙醇和70%的乙醇DNA 抽提:1、收集白细胞:500 μl新鲜/冻存全血(EDTA-2Na抗凝),加入1 ml的细胞裂解液充分混匀后孵育10分钟,,13000 rpm离心15 sec/3min;2、洗涤白细胞:离心后弃去上清液,加入1ml双蒸水重悬沉淀,将沉淀充分吹打使起完全溶解后, 13000 rpm离心1 /5min;3、稀释DNA,去除蛋白:弃离心后上清液,加入80 μl DNA 稀释缓冲液,重悬沉淀,完全溶解后,加入10 μl 10% SDS 和5 M NaCl 100μl,用手摇匀,再加双蒸水240 μl稀释DNA;4、加入300 μl苯酚-氯仿-异戊醇溶液(V/V=25:24:1,PH=7.5).盖紧试管,彻底混合均匀后, 13000 rpm离心12 min;5、取上清相转至另一1.5 ml EP管中,加入上清液体积比的1.5-2倍体积的预冷无水乙醇。
反复颠倒数次后,可见有絮状DNA沉淀析出;6、13000 rpm离心5 min,去上清水相。
加入和无水乙醇等量的70%预冷乙醇洗去DNA中的盐后,离心5 min。
用100 μl ddH2O或50 μl TE保存DNA备用。
为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊酵?在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。
加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。
一般采用氯仿与异戊酵为24:1之比。
也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定。
DNA的提取是分子生物学实验技术中的最重要、最基本的操作。
本实验通过植物样品在液氮下研磨以粉碎组织,通过裂解液裂解细胞,有机溶剂反复抽提,使DNA进入水相与蛋白质成分分开,在RNase作用下,降解RNA以纯化DNA。
二、材料以方法1、材料:培养菌体2、仪器设备:超净工作台,培养箱,摇床,恒温水浴锅,高速冷冻离心机,台式离心机,移液枪一套,低温冰箱,冷冻真空干燥机,电泳仪,水平电泳槽,紫外观测仪3、试剂:细胞裂解液100 mM Tris-HCl 5 mM EDTA 500 mM NaCl 1.25% SDS(PH 7.5) 饱和酚氯仿/异戊醇酚/氯仿/异戊醇无水乙醇70%乙醇异丙醇 3 M NaAc(pH5.2) RNase 50×TE缓冲液电泳载样缓冲液三、操作步骤(1)培养菌体(2)加入10 ml裂解液,1/10体积酚,于65℃下20-30 min,然后加入等体积的氯仿,轻摇(3)12000-15000rpm离心15 min(4)取上淸液,加入等体积氯仿,轻摇,12000-15000rpm离心15 min(5)取上淸液,加入0.6倍体积冷异丙醇(-20℃)或2倍体积冷无水乙醇(-20℃)(6)加入1/10体积的3 M NaAc(pH5.2),置于室温下10 min(7)12000-15000rpm离心10 min(8)倒弃液体留下沉淀,用70%乙醇洗涤沉淀(9)加入2倍体积无水乙醇(10)12000-15000rpm离心10 min(11)倒弃液体留下沉淀,真空干燥(12)复溶于2 ml TE(13)加入RNase,65℃或37℃处理10-30 min(14)加等体积酚,酚/氯仿,氯仿各一次,12000-15000rpm离心10 min(15)取上淸液,加入0.6倍体积冷异丙醇(-20℃)或2倍体积冷无水乙醇(-20℃)(16)加入1/10体积的3 M NaAc(PH5.2),置于室温下10 min(17)12000-15000rpm离心10 min(18)倒弃液体留下沉淀,用70%乙醇洗涤沉淀(19)真空干燥沉淀(20)复溶于0.5-1.0 ml的TE或水中,分装成小体积,4℃或-20℃保存。
试验原理:苯酚/氯仿提取DNA是利用酚是蛋白质的变性剂,反复抽提,使蛋白质变性,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子,核蛋白变性降解,使DNA从核蛋白中游离出来。
DNA易溶于水,不溶于有机溶剂。
蛋白质分子表面带有亲水基团,也容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。
当有机溶液存在时,蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏,变性沉淀。
离心后有机溶剂在试管底层(有机相),DNA存在于上层水相中,蛋白质则沉淀于两相之间。
酚-氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。
氯仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去DNA溶液中的酚。
抽提后的DNA溶液用2倍体积的无水乙醇在1/103mol/LNaCl存在下沉淀DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐,真空干燥,用TE缓冲液溶解DNA备用。
试验步骤:1、将1mlEDTA抗凝贮冻血液于室温解冻后移入5ml离心管中,加入1ml磷酸缓冲盐溶液(PBS),混匀,3500rpm离心15min,倾去含裂解红细胞的上清。
重复一次。
用0.7mlDNA 提取液混悬白细胞沉淀,37℃水浴温育1h。
2、将上述DNA提取液混悬白细胞,37℃水浴温育1h后,加入1mg/ml蛋白酶K0.2ml,至终浓度为100-200ug/ml,上下转动混匀,液体变粘稠。
50℃水浴保温3h,裂解细胞,消化蛋白。
保温过程中,应不时上下转动几次,混匀反应液。
3、反应液冷却至室温后,加入等体积的饱和酚溶液,温和地上下转动离心管5-10min,直至水相与酚相混匀成乳状液。
5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。
重复酚抽提一次。
加等体积的氯仿﹕异戊醇(24﹕1),上下转动混匀,5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。
重复一次。
4、加入1/5体积的3mol/LNaAc及2倍体积的预冷的无水乙醇,室温下慢慢摇动离心管,即有乳白色云絮状DNA出现。
酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿抽提DNA原理是一种常用的DNA提取方法,通过该
方法可以从复杂的生物样品中高效地提取纯度较高的DNA样本。
其原理主要包括以下几个步骤:
1. 细胞破碎:首先将待提取的生物样品经过离心等操作,去除无关细胞和组织,然后使用细胞裂解缓冲液将目标细胞破碎,使细胞内部的DNA释放出来。
2. 蛋白酶处理:在细胞裂解的过程中,蛋白酶会释放出来,为了去除其对DNA的影响,可以加入蛋白酶抑制剂来保护DNA。
此步骤的目的是降解蛋白质,同时保持DNA的完整性。
3. 混合酚氯仿:将细胞裂解液与等体积的氯仿混合,产生两相体系。
氯仿主要用来分离DNA和其他细胞成分,如脂质、蛋
白质等。
在混合过程中,DNA溶于水相,而其他成分溶于有
机相。
这样,通过离心使两相分离。
DNA会聚集在水相中。
4. DNA沉淀:将水相转移到新的离心管中,加入冷酒精或异
丙醇,使DNA沉淀出来。
酒精或异丙醇中的离子会中和
DNA上的电荷,从而使DNA不溶于水,形成可见的白色沉淀。
5. 洗涤与溶解:将DNA沉淀用无菌蒸馏水洗涤去除酒精或异
丙醇的残余,并用TE缓冲液溶解DNA,使其得以储存和进
一步应用。
通过酚氯仿抽提DNA,可以将DNA从细胞中高效地提取出
来,纯度较高,适用于许多分子生物学实验和技术的应用,如PCR、酶切、测序等。
法医实验室几种常用DNA提取方法及比较DNA提取是法医学中常用的一项技术,用于获得从犯罪现场或是嫌疑人身上采集的样本中的DNA,从而用于分析和鉴定。
在法医实验室中,有几种常用的DNA提取方法,下面将对其进行介绍和比较。
1. 酚/氯仿提取法(Phenol/Chloroform Extraction Method):酚/氯仿提取法是DNA提取的经典方法之一、它通过将DNA样品与酚和氯仿等有机溶剂混合后,形成两相体系,利用酚的高密度和氯仿的高挥发性质,将DNA转移到有机相中。
通过离心分离DNA和有机溶剂,最终得到纯净的DNA。
该方法能够获得高纯度的DNA,适用于各种样本(血液、组织、唾液等),但操作复杂且耗时较长。
2. 快速提取法(Rapid Extraction Method):快速提取法是一种高效的DNA提取方法,适用于大规模样品的处理。
它利用一种化学试剂,如蛋白酶K,能够迅速裂解细胞并释放DNA。
然后通过简化的步骤,如磁珠吸附或粘附柱,将DNA从溶液中分离。
该方法操作简单、快速,适用于高通量的样本分析,如犯罪现场的大规模检材筛查。
3. 盐析法(Salting out Method):盐析法是一种常用的DNA提取方法,利用高盐浓度可以沉淀DNA。
首先,细胞样本经过溶解后,加入高盐浓度缓冲液,使DNA与其他细胞成分分离。
然后通过离心沉淀DNA,去除上清液。
最后,通过洗涤去除溶剂和杂质,获得纯净的DNA样品。
盐析法操作简单,适用于各类样本,但提取的DNA质量可能稍差。
4. 硅胶柱法(Silica Column Method):硅胶柱法是一种基于硅胶膜或胶珠的DNA提取方法。
这种方法通过将DNA样品与硅胶柱一起离心,使DNA吸附在硅胶上。
随后,通过洗涤去除杂质,最后用低盐缓冲液洗脱DNA,得到纯净的DNA。
硅胶柱法提取的DNA纯度和质量较高,适用于各种样品。
不过,硅胶柱价格较高,操作相对繁琐。
总体而言,这些DNA提取方法各有优劣,选择合适的方法需要考虑实验室的需求和条件。
酚氯仿法提取DNA原理2014年06月06日用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
2. 不能完全抑制RNase的活性。
氯仿的作用?氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。
(酚易溶于氯仿中)用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。
异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。
另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl或NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
相关产品:酚:氯仿:异戊醇=25:24:1 pH<5.0酚:氯仿:异戊醇=25:24:1 pH<5.0酚:氯仿:异戊醇=25:24:1 PH≥7.8酚:氯仿:异戊醇=25:24:1 PH≥7.8酚:氯仿=25:24(PH>7.8)酚:氯仿=25:24(PH>7.8)氯仿:异戊醇=24:1氯仿:异戊醇=24:1酚:氯仿=25:24(PH<5.0)酚:氯仿=25:24(PH<5.0)酚:氯仿:异戊醇125:24:1(PH<5.0)酚:氯仿:异戊醇125:24:1(PH<5.0)。
酚氯仿法提取dna注意事项-回复酚氯仿法是一种常用的DNA提取方法,适用于从多种生物样本中提取高质量的DNA,具有操作简便、成本低廉、提取效果好的优点。
然而,在进行酚氯仿法提取DNA时,有一些注意事项需要遵守,以确保提取到的DNA质量和纯度满足实验要求。
本文将一步一步回答有关这一主题的问题。
第一步:准备实验材料在进行酚氯仿法提取DNA之前,需要准备好以下实验材料:- 酚氯仿:用于沉淀DNA,可以购买现成的酚氯仿溶液。
- 氯仿:用于去除蛋白质等杂质。
- 去离子水:用于配制实验缓冲液和洗涤试剂。
- 各种缓冲液:例如Tris-HCl缓冲液、TE缓冲液等,用于维持溶液的pH 值、维持DNA的稳定性等。
- 乙醇、异丙醇:用于洗涤、沉淀DNA等步骤。
- 高速离心管、离心机:用于离心沉淀DNA。
- 热板:用于DNA溶解步骤中的加热。
- 显微镜:用于观察DNA的溶解情况。
第二步:取样从待提取DNA的生物样本中取样时,需要注意以下几点:- 样本应选择新鲜的、含有丰富DNA的组织或细胞。
- 取样时应尽量避免污染,使用无菌工具,避免有外源DNA的干扰。
第三步:细胞破碎将取得的样本放入离心管中,加入破碎液并充分混匀。
常用的细胞破碎液包括含有洗涤剂(例如SDS或Triton X-100)和蛋白酶K的缓冲液。
注意事项如下:- 破碎液应加入足够量,以确保细胞完全破裂。
- 破碎液的温度和pH值应适宜,通常为室温和中性pH值。
第四步:离心将混合后的细胞溶液进行离心,去除细胞碎片和细胞核。
注意事项如下:- 离心条件应根据细胞大小和沉淀速度进行调整,通常为1,200-2,000 rpm,5-10分钟。
- 应尽量避免将上清液中的沉淀物和底物混合。
第五步:提取DNA将上清液转移到新的离心管中,加入酚氯仿并混合。
注意事项如下:- 酚氯仿的添加量应为样本体积的1/5-1/10,用于沉淀DNA。
- 混合时应充分摇匀,以便酚氯仿与上清液充分接触。
酚氯仿法提取DNA的原理酚氯仿法是一种用于提取DNA的常见方法,它基于DNA与酚氯仿在两相溶液中由于密度差异而发生分离的原理。
下面将详细介绍酚氯仿法提取DNA的原理及步骤。
DNA是一个带有负电荷的双链分子,其溶解度与其环境的离子力有关。
酚氯仿可以形成无水酚、蛋白质和DNA、RNA在其中既不溶于水又不溶于酚氯仿的界面。
当DNA溶液与酚氯仿混合时,DNA会从水相转移到有机相(酚氯仿相)中,实现分离。
1.细胞裂解:将待提取DNA的细胞加入缓冲液中,并通过机械、热力或化学方法使细胞裂解,释放DNA。
2.去除蛋白质:加入蛋白酶K等蛋白酶使蛋白质降解,形成胶冻样物质。
3.DNA溶解:加入盐酸溶解胶冻样物质,使DNA溶于溶液中。
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5.沉淀DNA:加入冰冷的异丙醇或乙醇,在DNA溶液中形成DNA沉淀。
6.制备DNA:将DNA沉淀转移到新的管中,并用乙醇洗涤去除杂质。
7.定量和存储:使用分光光度计测量DNA的浓度,然后将其保存在适当的条件下,以便后续实验中使用。
1.方法成本较低,步骤简单易行。
2.可以提取高纯度的DNA。
3.可以在较短时间内提取大量DNA。
1.操作要注意安全,避免酚氯仿的接触和吸入。
2.使用无菌技术和无菌材料,以避免外源性DNA的污染。
3.避免DNA溶液的过热和过长的暴露于空气中,以避免降解DNA。
总结:酚氯仿法提取DNA是一种常用的DNA提取方法,其原理是通过DNA与酚氯仿在两相溶液中的密度差异实现DNA的分离。
该方法简单易行,可以提取高纯度的DNA,适用于很多生物学实验和研究领域。
在进行实验时,需注意操作安全和避免DNA污染,以保证提取到高质量的DNA。
方法一
细菌沉淀加入567μlTE溶液(10mmol/L Tris- HCl , 1mmol/L EDTA, pH810) 重悬,
加入10%SDS30μl 和20mg/ml 蛋白酶K3μl , 于37 ℃温育1h,
加入5mol/LNaCL100μl , CTAB/NaCl 80μl 溶液, 于65 ℃温育10min,
加入等体积的氯仿/异戊醇, 混匀, 4 ℃12000g/min离心5min。
将上清液转入另1个离心管中加等体积的酚/氯仿/异戊醇, 混匀, 4 ℃12000g/min 离心5min,
提取上清置于另一管中, 加入0.6体积异丙醇, 轻柔混合, 4℃12000g/min离心5min, 弃上清加入70%乙醇洗涤1min, 离心, 弃上清, 将沉淀的DNA溶于100μl 的无菌去离子水中, - 20℃保存备用
方法二
取 1.5 mL 培养至对数生长期的菌液于 2.0 mL 的离心管中,8 000 r/min 离心5 min,弃上清;
加入600 μL 消化液(10 mmol/L Tris-HCl,0.1 mol/L EDTA,1% SDS,200μg/mL蛋白酶K,20μg/mL RNase A),37℃消化30 min ;
加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25 /24/ 1)混合液,轻摇10 min,12 000 r/min 离心 5 min,取上清,重复抽提1次;加入等体积的氯仿/异戊醇(24 /1)混合液抽提 1 次;
加入1/10 体积的 3 mol/L 的醋酸钠和 2 倍体积的冰乙醇混匀,静置10 min,12 000 r/min 离心10 min,弃上清;
沉淀加入 1 mL 70%乙醇洗涤2次,每次8 000 r/min 离心 5 min,弃乙醇,待沉淀中残余乙醇
挥发后,加入50μL 超纯水溶解DNA。
4℃保存备用。
方法三
将预处理后所得沉淀加入300μL细胞裂解液(主要成分:10mmol/L Tris-HCl 缓冲液、1mol /L 氢氧化钠、10mmol/L乙二胺四乙酸、生理盐水、0.2%十二烷基硫酸钠),振荡混匀,于100℃加热15min。
用酚/氯仿法纯化DNA,即加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1),振荡混匀,10000r /min离心5min,
上清液移至加等体积苯酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)的试管中,振荡混匀,10000r/min离心5min,
将上清液再移至新管中,加入等体积异丙醇,颠倒混合,10000r/min离心5min,弃上清液,加入无水乙醇1000μL 洗涤一次,10000r/min离心1min,离心后弃上清液,
将沉淀的DNA溶于60μL 的双蒸水中,-30℃保存备用。
将营养琼脂斜面活化的细菌接种乳糖肉汤(LB),37e培养18h后取菌液1.0mL10,000rmni离心smni,弃上清"沉淀中加入56知L兀缓冲液,3单L10%SDS和知L
20m留mL的蛋白酶K溶液,混匀后37e温育h1"加入等体积的氯仿/异戊醇(2:41) 溶液,混匀后1,4000/rmin离心smni"取上清加等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:2:41)
溶液,混匀后14侧X州min离心smni"取上清加.06倍体积的异丙醇,12赵刃州min 离心smni,沉淀加lmL75%乙醇洗涤305,离心弃上清,自然风干后加5咖L兀溶
解,4e保存备用"。