代谢组学

－在模式识别方法中，主成分分析法(principal component analysis，PCA) 最为常用、有效。
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研究步骤
第一，生物样品收集与制备。代谢组学的研究 对象很广，常用的有生物体液，包括尿液、血
液、唾液、组织提取液及活体组织等。
生物样品的收集与制备是代谢组学研究的第一
阶段，也是重要环节之一，样品的浓度、pH值
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第四，通过找到一种空间变换方式，把经标准
也会影响实验结果。
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第二，NMR制谱。NMR方法适合研究代谢产物中 的成分，表征和研究海量的代谢信息及其变化
规律，从而得到丰富的生理、病理、药理和毒
理等生物信息。
其中1HNMR对含氢化合物均有响应，能给出精
细的代谢物成分图谱即代谢物指纹图谱。
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不同器官组织具有不同的代谢轮廓，广谱全采集
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代谢组学的发展
• 最早起源于代谢轮廓分析（Metabolic profiling）。早 在二十世纪七十年代，Baylor药学院就已经提出并发表了 代谢轮廓分析的理论。 • 1975年，Thompson 和Markey利用气相色谱和质谱在代谢 轮廓分析的定量方面取得了较大进展；二十世纪七十年代 末期这种方法得到了广泛认同；；八十年代早期应用HPLC 和NMR来对代谢物进行分析。 • 1986年，Joumal of Chromatography A出版了一期关于 代谢轮廓分析的专辑。 • 随着基因组学的提出和迅速发展，Oliver于1997年提出了 代谢组学（metabolomics）的概念，之后很多植物化学家 开展了这方面的研究； • 1999年Jeremy K. Nicholson等人提出metabonomics的概 念。

软件：MATLAB version7.10 主成分分析（PCA） 相关性分析：Pearson相关性系数 马尔距离：MD＝
结果与讨论
1H NMR分析 LCMS分析
标准品的NMR和LCMS响应值
样品LCMS-LCMS信号的相关性 生物学样品NMR-LCMS信号的相关性
1H
NMR分析
样品NMR-NMR信号的相关性
将取准后的蕃茄样品NMR信号强度进行相关性分析来
鉴定品系数据矩阵中有相关的NMR信号。 相关系数|r| ≥ 0.8→有相关 1008个NMR谱峰， >30000相关（置信区间α＝3.0%）
理论上不同样品中同一化合物显著相关，如蕃茄样中
的葫芦巴碱（A）、蔗糖（B）、柠檬酸（C）证明这 点。
前言
NMR和LCMS是代谢学研究的常用的技术手段。
将同一样品的NMR和LCMS谱图分析获取的代谢组学数据
统计结合，这就可以了解同一代谢物的光谱及其性质的关 系。
相关性分析是一种统计学方法，可用于建立一生物系统代
谢物信息的相互关系。 在本文中， 利用1H NMR和精确质量液相—四极杆飞行时 间质谱（LS- QTOF-MS）技术分析50种蕃茄栽培品种成熟 果实的代谢谱图。
Thank you
樱桃番茄与牛肉番茄和圆番茄的代谢差异较大，牛肉
番茄和圆番茄的代谢相似
标准品的NMR和LCMS剂量效应
六种标准品在两种方法的计量效应关系。 在NMR中，仪器响应是呈线性关系（所有共振和被测的
代谢物，相关性系数均值为1）。 新型MS检测范围更广，本实验中，其检测响应在母离子 强度达到20000个/扫描时呈线形的
氯原酸不但与其特异异 构体还和其衍生物高度 相关→蕃茄中有一系列 的氯原酸衍生物；可鉴 定复杂混合物中生物化 学高度相关的化合物； 显著（r>0.8）的LCMSLCMS相关不仅在同一代 谢物中还在化学相关的 代谢物中。 氯原酸 II (353 m/z at 14.9 min)—677 m/z at 40.7 min = [三氯原酸 acid 苯丙氨酸 (164 m/z) (341 —165 m/z) m/z —387 = 2nd m/z = [蔗糖 of +HCOOH [phenylalanine H]-, II - H]-, 677 m/z at蔗糖 39.4 min = [三氯原酸 I -isotope H]-, 515 m/z at 30.7 min =H]-, III - H]-, 683m/z =at [蔗糖 蔗糖 - H]-, [二氯原酸 515 m/z 28.6 + min =[二氯原酸 II - H]-, 515 m/z at [phenylalanine - NH3H]684 Im/z = 353 2nd isotope of [ 蔗糖 + 蔗糖 - IH]-, 27.9 147 minm/z= = [二氯原酸 - H]-, m/z at 13.2 min =[ 氯原酸 - H]-. 1,025 m/z= [蔗糖 + 蔗糖 + 蔗糖- H]-

代谢组学概述代谢组学是一门综合性的生物学研究领域，通过分析生物体内代谢产物的变化，揭示生物体内代谢网络的调控机制和代谢异常与疾病之间的关系。

代谢组学在生命科学研究、医学诊断与治疗、食品安全等领域具有重要的应用价值。

代谢组学的研究对象主要是代谢产物，包括代谢物、代谢酶和代谢途径等。

代谢产物是生物体代谢活动的结果，通过分析代谢产物的种类和含量，可以了解生物体的代谢状态和变化。

代谢酶是催化代谢反应的关键蛋白质，通过研究代谢酶的活性和表达水平，可以揭示代谢途径的调控机制。

代谢途径是一系列相互关联的化学反应，通过研究代谢途径的变化，可以了解生物体的代谢网络和调控机制。

代谢组学的研究方法主要包括代谢物分析、代谢酶活性测定和代谢途径研究等。

代谢物分析是代谢组学的核心技术，目前常用的代谢物分析方法包括质谱技术、核磁共振技术和高效液相色谱技术等。

质谱技术可以用于代谢物的定性和定量分析，核磁共振技术可以用于代谢物的结构鉴定，高效液相色谱技术可以用于代谢物的分离和纯化。

代谢酶活性测定是研究代谢酶功能的重要方法，通过测定代谢酶的催化反应速率，可以了解代谢酶的活性和调控机制。

代谢途径研究是研究代谢途径调控机制的关键方法，通过构建代谢途径模型，可以揭示代谢途径的结构和调控机制。

代谢组学在生命科学研究中具有广泛的应用价值。

通过代谢组学的研究，可以了解生物体在不同生理状态下的代谢特征和代谢网络的调控机制，揭示疾病发生发展的分子机制，为疾病的预防和治疗提供理论依据。

代谢组学在医学诊断与治疗中也有重要的应用，通过分析生物体的代谢产物，可以进行疾病的早期诊断、疾病的分型和预后评估，并为个体化治疗提供依据。

此外，代谢组学还可以用于食品安全的检测和评估，通过分析食品中的代谢产物，可以了解食品的质量和安全性。

代谢组学是一门综合性的生物学研究领域，通过分析生物体内代谢产物的变化，揭示生物体内代谢网络的调控机制和代谢异常与疾病之间的关系。

代谢组学在生命科学研究、医学诊断与治疗、食品安全等领域具有重要的应用价值。

什么是代谢组学？代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是继基因组学和蛋白质组学之后发展起来的新兴的组学技术，是系统生物学的重要组成部分，研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。

代谢组学是对某一生物体组份或细胞在一特定生理时期或条件下所有代谢产物同时进行定性和定量分析，以寻找出目标差异代谢物。

可用于疾病早期诊断、药物靶点发现、疾病机理研究及疾病诊断等。

国内外研究现状简述国际上，代谢组学研究很活跃：美国国家健康研究所(NIH)在国家生物技术发展的路线图计划中制订了代谢组学的发展规划；许多国家的科研单位和公司均开始了代谢组学相关研究及业务，如英国帝国理工大学的Jeremy Nicholson实验室、美国加州大学Davis分校的Oliver Fiehn 实验室、美国Scripps实验室、荷兰莱顿大学的Jan van der Greef实验室等。

其中许多机构已经开始了多组学整合研究工作。

国内多家科研机构已先后开展了代谢组学的研究工作，包括中国科学院大连化学物理研究所许国旺实验室、中国科学院武汉数学物理研究所唐惠儒实验室、上海交通大学贾伟实验室、军科院等。

没有任何一个分析技术能够同时分析代谢组中的所有化合物，只能通过选择性地提取结合各种分析技术的并行分析来解决。

样品之间的变异、仪器动力学范围的局限和分析误差的存在也给代谢组学分析带来巨大的挑战。

因此在取样方法，新型分析仪器和分析技术的研发等方面，都需要进一步深入开发。

代谢组学分析产生出海量的数据，当前我们缺乏适当的代谢组数据库和数据交换版式，需要完善代谢组学数据库，建立代谢产物数据的标准，并且需要开发功能强大的数据分析工具。

代谢组学服务有哪些？一、非靶标代谢组学经过多年发展，BIOTREE现已拥有完善的非靶标代谢组学平台，包括UHPLC-QTOFMS、Orbitrap LC-MS、GC-TOF-MS、GC-Q-MS 等，能够准确、快速地分析各种生物样本（血、尿、动物组织、唾液、羊水、细胞和细胞液、植物、微生物等）中的小分子代谢物。