运用基因芯片技术筛查人子宫内膜容受性相关基因
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子宫内膜异位症相关基因和microRNA的挖掘及生物信息学分析作者:王蕾欧阳玲来源:《中国医药导报》2017年第10期[摘要] 目的应用生物信息学方法分析和预测子宫内膜异位症(EMs)患者相关基因的表达,为进一步在基因水平上揭示EMs的本质和发现药物治疗靶点、开发新型的治疗药物提供新的依据。
方法在公共基因芯片数据库(GEO)中下载EMs相关基因数据,应用protparam、MotiScan、SignalP 4.0、NetPhos 2.0、TMHMM、GO、KEGG、STRING、BRB-Array Tools软件等生物信息学技术进行数据挖掘和生物信息学分析研究。
结果共筛选出91个EMs相关基因以及54个microRNA。
这些EMs基因主要与细胞增殖调控、细胞凋亡调控、趋化作用等过程有关。
蛋白质网络互作预测得到了19个重要的EMs相关蛋白质靶标,联合靶基因的数据挖掘,发现了134个EMs相关的靶基因。
结论用生物信息学方法分析基因芯片数据可以获取生物的内在信息,为子EMs的早期诊断提供了新的诊断标志物和思路。
[关键词] 基因芯片;子宫内膜异位症;生物信息学分析;靶基因;microRNA[中图分类号] R711.710.46 [文献标识码] A [文章编号] 1673-7210(2017)04(a)-0012-05[Abstract] Objective To analyze and predict the expression of endometriosis (EMs) genes by bioinformatics methods, in order to provide a new basis for revealing the essence of EMs at the gene level and developing new treatment drugs. Methods Download gene dates which were related to EMs in Gene Expression Omnibus(GEO), were mined and analyzed by a series of bioinformatics tools, such as protparam, MotiScan, SignalP 4.0, NetPhos 2.0, TMHMM, GO, KEGG,STRING, BRB-Array Tools. Results 91 EMs related genes and 54 microRNA had been found in this study. These genes mainly involved in the process of cell proliferation regulation, cell apoptosis regulation and chemotaxis. Protein interaction network predicted 19 important EMs-related protein targets. Combined with target gene data mining, 134 EMs-related target genes were found. Conclusion Using bioinformatics method to analyze gene microarray data can acquire inner information of organisms, and provide new diagnostic markers and diagnostic thoughts for the early diagnosis of EMs.[Key words] Microarray; Endometriosis; Bioinformatics; Target gene; MicroRNA子宫内膜异位症(endometriosis,EMs)是一种常见的慢性妇科疾病,在女性人群中,发病率为10%~15%[1],其临床表现为不孕、痛经、慢性盆腔痛、性交痛等[2],给年轻的女性带来巨大的痛苦和经济负担。
表达谱基因芯片筛选子宫内膜异位症相关基因及IL-12受体在子宫内膜异位症中的作用李洁;李亚里;田方;宗利丽;李亭【期刊名称】《现代妇产科进展》【年(卷),期】2004()4【摘要】目的探讨子宫内膜异位症(EM)患者的发病机制和白细胞介素12(IL12)及其受体(IL12R)的水平与疾病进展的关系。
方法应用578点的人类免疫相关表达谱cDNA基因芯片筛选EM相关基因。
酶联免疫吸附测定法(ELISA)测定21例EM 患者及21例对照者血清中IL12水平。
结果(1)用Array3000扫描仪扫描芯片,观察杂交结果,用ImaGene3.0软件分析Cy3和Cy5两种荧光信号的强度和比值。
在对6张芯片的结果分析中,获得EM的相关差异基因9个,共同表现为上调的基因2个,下调的基因7个。
其中下调基因中差异最显著的是IL12R;(2)ELISA检测结果显示EM组与对照组患者血清中IL12水平无明显差异;EM患者血清IL12水平与疾病期别无明显相关;两组患者血清IL12水平与月经周期亦无明显相关。
结论基因芯片技术是一种有效的、高敏感、高通量的技术。
EM患者的异位内膜组织的IL12RmRNA水平表现为下调,表明它可能在此疾病的发生与发展中起重要作用。
【总页数】4页(P255-257)【关键词】子宫内膜异位症;基因表达微序列分析;受体;白细胞介素12【作者】李洁;李亚里;田方;宗利丽;李亭【作者单位】解放军总医院妇产科【正文语种】中文【中图分类】R711.74【相关文献】1.基因芯片表达谱筛选Kaposi肉瘤相关基因 [J], 王慧;吕国栋;王晓东;惠艳;刘辉;林仁勇;王星2.表达谱基因芯片筛选结直肠癌转移中Tiam1相关基因 [J], 肖雨;于莉娜;丁彦青3.基因芯片筛选胶质母细胞瘤放疗前后相关基因表达谱的变化 [J], 姚智强;卢亦成;胡国汉;陈菊祥;骆纯;楼美清;郑鲁;李瑶;郭懿4.应用基因芯片技术筛选乳腺癌阿霉素耐药相关基因表达谱 [J], 彭浩;杨华伟;宋立伟;周正5.应用表达谱基因芯片筛选子宫内膜异位症相关差异基因 [J], 周红辉;李亚里;李洁;关铮;宗利丽因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
用基因芯片技术筛选人子宫内膜癌细胞株中紫杉醇耐药相关基因林凤;郑君;周友珍【期刊名称】《山东医药》【年(卷),期】2015(000)019【摘要】目的:应用基因芯片技术筛选人子宫内膜癌细胞株中获得性紫杉醇( TAX)耐药相关基因。
方法采用大剂量间歇诱导法,用TAX反复冲击诱导培养人子宫内膜癌Ishikawa细胞株,建成Ishikawa/TAX耐药株。
应用Affymetrix Human Genome U133 Plus2.0表达谱芯片检测Ishikawa/TAX与Ishikawa细胞株基因。
通过Gene Ontology ( GO)聚类分析对差异表达的基因予以分类。
采用qRT-PCR对部分差异表达的基因进行验证。
结果与Ishikawa细胞相比,Ishikawa/TAX细胞中有110条基因表达有显著性差异(ratio比值>3),包括87个上调基因、23个下调基因,GO分类涉及细胞信号传导和调控、细胞黏附分子、细胞代谢及转录调控等;其中上调最明显的基因为S100A12,其次有CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下调基因有 TNFAIP3、CD44、DKK1等。
qRT-PCR 检测 S100A12、CYP1B1在耐药细胞中高表达,TNFAIP3、CD44在耐药细胞中低表达,与基因芯片结果一致。
结论采用基因芯片技术筛选出的人子宫内膜癌获得性TAX耐药相关基因的上调基因有S100A12、CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下调基因有TNFAIP3、CD44、DKK1。
%Objective To screen and identify the acquired taxol ( TAX)-resistant related genes in human endometrial carcinoma cell line by applying gene chiptechnology.Methods We established the Ishikawa/taxol ( TAX)-resistantcell line by intermittent and repeated exposure to TAX of a high concentration on the human endometrial carcinoma cell line Ish-ikawa.The genes of Ishikawa/TAX and Ishikawa cells were examined by using Affymetrix Human Genome U133 Plus2.0 expression profile chip.The differentially expressed genes were classified by Gene Ontology ( GO) cluster analysis.Real-time quantitative PCR ( qRT-PCR) was performed to confirm part of the differentially expressed genes.Results Compared with Ishikawa cells, there were 110 significantly differential expression genes in Ishikawa/TAX cells (ratio>3), of which the up-regulated and down-regulated genes were 87 and 23, respectively.The classification of GO involved the cell signal transduction and regulation, cell adhesion molecule, cell metabolism and transcription regulation, etc.S100A12 was up-regulated significantly, followed by CYP1B1, FUBP1 and CEACAM6.TNFAIP3, CD44 and DKK1 were significantly down-regulated.The qRT-PCR showed that S100A12 and CYP1B1 was highly expressed in the drug-resistant cells, and TN-FAIP3 and CD44 was lowly expressed in the drug-resistant cells, which coincided well with the results of cDNA microarray. Conclusion Gene chip technology screens that the up-regulated genes of acquired TAX-resistant related genes in human endometrial carcinoma cell line areS100A12, CYP1B1, FUBP1 and CEACAM6, and the down-regulated genes are TN-FAIP3, CD44 and DKK1.【总页数】4页(P21-24)【作者】林凤;郑君;周友珍【作者单位】首都医科大学附属北京世纪坛医院,北京100038;首都医科大学附属北京世纪坛医院,北京100038;首都医科大学附属北京世纪坛医院,北京100038【正文语种】中文【中图分类】R737.31【相关文献】1.基因芯片技术检测鼻咽癌紫杉醇耐药及耐药逆转相关基因的表达 [J], 彭小伟;谭国林2.应用基因芯片技术筛选曲古菌素A诱导肺腺癌耐药细胞株A549/CDDP差异表达的凋亡基因 [J], 汪亚君;张海涛;熊禹真;刘彬;伍俊3.人结肠癌紫杉醇耐药细胞株的建立及耐药相关基因mRNA表达的研究 [J], 陈一帆;张燕;王强;黄卫东;郭嘉义4.采用基因芯片技术筛选人小细胞肺癌SH77/CDDP多药耐药相关基因表达谱的研究 [J], 周向东;钱桂生;刘凌志5.应用基因芯片技术筛选卵巢癌紫杉醇耐药差异表达基因 [J], 张文晶;李红霞;宋磊;张素梅因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
基因芯片技术筛选宫颈癌相关基因彭敏;赵旻;张力;伍欣星【期刊名称】《数理医药学杂志》【年(卷),期】2005(018)005【摘要】目的:利用基因芯片技术对原发性宫颈癌标本进行分析,以期探讨宫颈癌基因组中存在的癌基因表达的变异,确定与宫颈癌相关的候选原癌或抑癌基因,为宫颈癌致病机理的研究提供新的线索和依据.方法:对原发性宫颈癌标本组织和正常对照组织进行mRNA 抽提,分别给予荧光素Cy5 和Cy3 标记以制备cDNA 探针,并与基因芯片进行杂交和分析.结果:在原发性宫颈癌标本组织中共筛选出存在表达差异的原癌或抑癌基因共11条,占候选基因的3.4%,其中表达明显下降的基因7条,上调基因4条.结论:运用基因芯片技术筛选出与宫颈癌相关的候选原癌或抑癌基因,为宫颈癌致病机理的研究提供新的线索和依据.【总页数】3页(P418-420)【作者】彭敏;赵旻;张力;伍欣星【作者单位】武汉大学医学院病毒学研究所分子病毒室,武汉430071;武汉大学医学院病毒学研究所分子病毒室,武汉430071;武汉大学医学院病毒学研究所分子病毒室,武汉430071;武汉大学医学院病毒学研究所分子病毒室,武汉430071【正文语种】中文【中图分类】R737.33【相关文献】1.基因芯片技术对先天性巨结肠症相关基因的筛选 [J], 史浩;秦克旺;张磊;朱小春2.用基因芯片技术筛选人子宫内膜癌细胞株中紫杉醇耐药相关基因 [J], 林凤;郑君;周友珍3.基因芯片技术筛选前列腺癌雄激素去势抵抗相关基因 [J], 马瑾璐;王丽娟;朱青;金桂花;郭希婧;何晨琛;韩苏夏4.用基因芯片技术检测宫颈癌患者相关基因的差异表达 [J], 张蔚;方芙蓉;徐小霞;洛若愚5.应用基因表达谱芯片技术筛查中国汉族妇女宫颈癌相关基因的研究 [J], 葛崇华;李庭芳;刘开江;李莉;刘青因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
在宫颈癌筛查中应用基因芯片技术检测高危型人乳头瘤病毒的临床价值评析目的对宫颈癌筛查中应用基因芯片技术检测高危型人乳头瘤病毒的临床价值进行探讨。
方法选取我院2012年3月到2013年3月治疗的宫颈癌患者60例,采用基因芯片技术对60例妇女宫颈脱落细胞进行HPV检测。
结果在60例宫颈癌患者中检出57例HPV感染,其中57例HPV感染中鳞癌患者37例,HPV阳性33例,阳性率89.2%,腺癌12例,HPV阳性7例,阳性率58.3,%,鳞腺癌8例,HPV阳性100%。
57例HPV感染检出9种HPV基因型,其中HPV6有6例,检出率为10.5%,HPV11有5例,检出率为8.8%,HPV16有22例,检出率为38.6%,HPV18有9例,检出率为15.8%,HPV31有2例,检出率为3.5%,HPV33有4例,检出率为7.0%,HPV45有1例,检出率为1.8%,HPV58有3例,检出率为5.3%。
HPV59有5例,檢出率为8.8%。
结论在宫颈癌筛查中应用基因芯片技术来检测高危型人乳头瘤病毒能够起到很大的作用,尽可能做到早期发现,及时进行规范性治疗。
标签:宫颈癌;基因芯片技术;高危型人乳头瘤病毒宫颈癌是常见的妇科恶性肿瘤之一,人乳头瘤病毒(HPV)感染已被公认为是引起宫颈癌的主要原因,人乳头瘤病毒在人体中分布广泛,在宫颈癌细胞中都检测到HPV-DNA存在。
近年来宫颈癌发病朝着年轻态的趋势发展,而高危型HPV感染与其有着很大的关系。
1. 资料与方法1.1 一般资料选取我院2012年3月到2013年3月治疗的宫颈癌患者60例,平均年龄在47±11.1岁。
其中经病理诊断鳞癌患者37例,腺癌患者12例,鳞腺癌患者8例。
1.2 试剂与仪器:高危型人乳头瘤病毒(HPV)基因分型检测试剂,采用的扩增仪为DA-7600型PCR,利用基因芯片技术检测高危型人乳头瘤病毒(HPV)。
1.3 采样:采集器的选用专用的宫颈脱落细胞采集器来进行采样,采样好之后立即送检。
前沿综述丨辅助生殖治疗中子宫内膜容受性评估相关临床指标的研究进展摘要OF GRAIN近年来辅助生殖技术(assisted reproductive technology,ART)不断发展,但目前单次移植的临床妊娠率仅为30%~40%。
反复种植失败是困扰患者和临床医生的重要难题,子宫内膜容受性和胚胎质量这两大因素影响着妊娠结局。
如何合理、客观地评价子宫内膜容受性一直是备受关注的问题。
本文主要综述目前用于评估子宫内膜容受性的临床指标、形态学特征、细胞因子及各类受体、子宫内膜容受性芯片评估方法,总结分析各种评估方法目前的临床运用及对辅助生殖助孕结局的预测作用,以期为临床工作者对子宫内膜容受性的评估及改善治疗带来一定的帮助,提高ART妊娠率。
摘要子宫内膜容受性是指子宫内膜允许囊胚定位、黏附、侵入并最终使之着床的能力。
控制性超促排卵技术及胚胎体外培养技术不断进步,但目前单次移植的临床妊娠率仅为30%~40%,仍有部分患者在多次移植优质胚胎后仍未获得临床妊娠,身心及经济上都承受较大压力,反复移植失败(recurrent implantation failure, RIF)阻碍了体外受精(in vitro fertilization,IVF)助孕中妊娠率的进一步提高。
目前RIF的定义是2个或以上的新鲜或冷冻周期内,共移植至少4个优质卵裂期胚胎或不少于2个囊胚后未获临床妊娠,通过对子宫内膜容受性的合理临床评估,可能是突破该瓶颈问题的方法。
因此,本文从评估子宫内膜容受性的角度进行综述,总结目前评价子宫内膜容受性指标的进展。
一.超声检查评估子宫内膜容受性1.子宫内膜厚度:以往研究表明,子宫内膜厚度增加可以显著改善辅助生殖的妊娠结局,随着子宫内膜厚度的增加,妊娠率显著增加[1]。
Gallos等[2]通过对25 767个新鲜周期移植的研究,观察到子宫内膜厚度≥10 mm可以达到最大活产率和最少的妊娠丢失。
但也有研究显示,子宫内膜厚度在7~12 mm之间的妇女自然流产率最低,而子宫内膜厚度超过12 mm的妇女自然流产率较高[3]。
首届赣鄂湘中西医结合(生殖内分泌)学术研讨会专题报告子宫内膜容受性相关因素及研究黄光英(华中科技大学同济医学院中西医结合研究所武汉430000)胚泡着床是处于活化状态的胚泡与处于接受态的子宫内膜相互作用.最后植入到子宫内膜的复杂过程.胚泡着床过程分为:定位.黏附和侵入.成功的着床依赖于子官内膜和胚胎的同步化发育,印子宫内膜达到接受态、胚胎达到植入态。
母胎之间良好的信息交流.母体子宫内膜对胚泡的接受能力又与着床成功与否密切相关,因此对子宫内膜客受性的研究显得尤为重要.子宫内膜客受性指子宫内膜接受胚泡着床的能力.这一概念是由Psychoyos于1977年首先提出的,在啮齿类动物这一时期一般只持续教小时。
从而形成一个狭窄的植人窗口,大约出现于受孕的第4。
5d,以后便进入不应期.人类子宫内膜只在月经周期中特定而短暂的时期具备接受胚胎植入的能力.这个时期叫。
着床窗口期。
,人类的胚泡着床窗口期在月经周期的20一24d.子宫内膜的着床窗是短暂,同时在各个周期出现时是有空间性的,它代表了子宫内膜的容受性.。
影响于官内膜客受性的相关因素:--’ 一.孕澈素受体(PR)PR是一种核受体.多分布于子宫内膜和肌层中,在腺上皮细胞和内膜问质细胞核内表达.PR浓度在月经周期中呈周期性变化,在增生晚期最高,分泌晚期最低.PR在胚泡着床过程中起着重要作用.PR故除小鼠子宫内膜问质细胞不能蜕膜化,胚泡着床障碍.若将野生型小鼠的胚泡移入PR敲除假孕鼠的子宫,胚泡也不能着床.PR可通过影响降钙素,双调蛋白等多种着床相关园子的分泌而影响胚泡着床.临床研究发现子宫内膜PR低下必然导致子宫内膜发育不良。
从而抑制胚泡着床,发生不孕.二.胞饮突(plnopodes)胞饮突(或称羽状突)是着床窗口期在扫描电镜(SEM)下所见子宫内膜上皮细胞顶端出现的大而平滑的胞质突起,为绒毛扶上皮细胞徼绒毛短暂融合而成的单个花状膜突出物.在啮齿类动物,仅出现在子官内膜着床窗口期:在人类若经连续子宫内膜活检及SEM检测可发现胞饮突通常出现在正常月经周期第20r21天,约在排卵后1周,持续时问少于48h,与胚泡着床窗期时间一致.胞饮突的丰度与着床成功与否密切相关,多次着床失败的患者几乎不产生胞饮突.子宫内膜表面胞饮突的存在及发育,表明子宫将进入着床敏感期.已证实胚泡均着床在已出现胞饮突的区域,并黏附在内膜有胞饮突细胞的顶端.因此,内膜上皮的胞饮突不仅可作为子宫内膜容受性的形态学标记。
子宫内膜容受性分析拯救反复种植失败正当对试管婴儿反复种植失败患者一筹莫展之时,西班牙一项基于基因组学大数据分析的子宫内膜容受性的新型评估方法,给我们带来惊喜。
该技术通过移植前子宫内膜转录组基因检测,生物信息学分析,判断精准的着床时间,选择移植的最佳时机,明显改善反复种植失败种植率。
子宫内膜容受性分析拯救反复种植失败人类的精卵结合发生之后的30小时左右,受精卵即随着输卵管蠕动和输卵管上皮纤毛的推动,向着子宫方向移动。
晚期胚胎植入子宫内膜的过程我们称之为受精卵着床(implantation)。
着床成功是妊娠过程的开始。
长久以来,我们都将受精卵作为着床舞台中的“明星”,而将子宫内膜作为“配角”。
往往只能通过子宫内膜的厚度评估着床的机会,而无法真正知道子宫内膜接受胚胎植入的能力——即子宫内膜容受性。
每个月经周期中,子宫内膜只有在特殊的时期才具备对胚胎的接受能力,并且受到多种因素的调节,如卵巢性激素、子宫内膜局部分子、胚胎以及分泌的胚胎性因子等。
以一个正常月经周期(28日)为例,子宫内膜通常在排卵之后6天开始,月经周期的20~24天,允许胚胎的植入,而这几天被称之为子宫内膜容受窗(WOI)。
1950年Noyes, Hertig和Rock三位病理学家创立了子宫内膜的组织学标准,通过对不同时相内膜的组织学特征,将子宫内膜分为增生期和分泌期。
这种标准被沿用至今。
但在进行试管婴儿等不孕不育治疗中,并非每个病人的子宫内膜都是按时间标准生长,每个病人的月经周期中也不可能依靠内膜组织学标准预测个体化的WOI,那么如何通过技术手段提高子宫内膜容受性判断的精准度呢?1超声评估:▪子宫内膜厚度:hCG日测量<8mm时,妊娠率降低▪子宫内膜类型:阴道B超提示为典型的三线型子宫内膜适合着床▪子宫内膜血流指数:搏动指数(PI)<2的时候,容受性最佳2形态特征法:通过电子显微镜观察内膜的胞饮突,但这是有创的检查,个体差异极大,电子显微镜检测的操作性也较低。
DOI:10.12280/gjszjk.20200190白塔吉,何金英,马玉珍△【摘要】良好的子宫内膜容受性是胚胎植入的关键因素,容受期子宫内膜组织的基因表达与容受性密切相关。
通过高通量转录组测序技术可以获得月经不同时期子宫内膜基因表达图谱以及调控基因表达的微小RNA(miRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)序列,结合生物信息学分析,可以更好地了解容受期子宫内膜特异基因表达,并为其调控机制的研究提供技术支持,对于不孕症患者以及反复植入失败患者的诊治具有非常重要的临床应用价值。
对高通量转录组测序在子宫内膜容受性及胚胎植入方面的相关研究进行了综述。
【关键词】高通量核苷酸序列分析;植入窗;基因;子宫内膜;后成说,遗传;体外受精;胚胎移植Application of High-Throughput Transcriptome Sequencing in Evaluation of Endometrial ReceptivityBAI Ta-ji,HE Jin-ying,MA Yu-zhen.Inner Mongolia Medical University,Hohhot010110,China(BAI Ta-ji);Reproductive Center,Inner Mongolia Autonomous Region People′s Hospital,Hohhot010017,China(HE Jin-ying,MA Yu-zhen)Corresponding author:MA Yu-zhen,E-mail:*************.cn【Abstract】The good endometrial receptivity is a key factor for embryo implantation.The gene expressionprofile of endometrial tissue cells in the receptive period is closely related to the endometrial receptivity.High-throughput transcriptome sequencing technology can obtain gene expression profiles of the endometrium at differentperiods of menstruation,as well as microRNA(miRNA)and long non-coding RNA(lncRNA)sequences thatregulate gene bined with bioinformatics analysis,these profiles are very helpful for us tounderstand the expression of specific genes in the endometrium during the receptivity period,and provide technicalsupport for the mechanism study.This high-throughput method may be used for the diagnosis and treatment ofpatients with infertility and repeated implantation failure.This review summarized the research progress of high-throughput transcriptome sequencing in the evaluation of endometrial receptivity and embryo implantation.【Keywords】High-throughput nucleotide sequencing;Implantation window;Genes;Endometrium;Epigenesis,genetic;Fertilization in vitro;Embryo transfer(JIntReprodHealth蛐FamPlan,2021,40:49-52,78)·综述·基金项目:内蒙古自治区科技成果转化项目(CGZH2018178)作者单位:010110呼和浩特,内蒙古医科大学(白塔吉);内蒙古自治区人民医院生殖中心(何金英,马玉珍)通信作者:马玉珍,E-mail:*************.cn△审校者辅助生殖技术应用于人类已有近40年的历史,是不孕不育患者最有效的治疗方法之一。
生物芯片技术在基因检测中的应用生物芯片技术的引入为基因检测带来了革命性的变化。
由于其高通量、高灵敏度和高速度的特点,生物芯片已成为基因检测的首选工具之一。
本文将重点讨论生物芯片技术在基因检测领域中的应用,并探讨其在早期诊断、疾病预测以及个性化医疗中的潜在价值。
一、生物芯片技术在早期诊断中的应用早期诊断对于许多疾病的治疗和预防至关重要。
生物芯片技术的高通量特性使之能够同时检测数百到数千个基因。
通过对患者样本中基因表达的全面分析,生物芯片可以提供早期疾病诊断所需的信息。
例如,在癌症早期诊断中,生物芯片可以检测体内血液中循环肿瘤细胞的存在和数量,从而帮助医生进行早期诊断和治疗决策。
二、生物芯片技术在疾病预测中的应用除了早期诊断,生物芯片技术还可以应用于疾病的预测。
通过对大规模基因表达数据的分析,研究人员可以发现与疾病相关的遗传标记。
这些标记可以用来判断一个人是否有患某种疾病的风险。
例如,通过检测某些特定基因的突变,生物芯片可以帮助医生预测一个人是否会患上遗传性疾病,如囊性纤维化和亨廷顿舞蹈病。
这种预测的准确性可以帮助人们采取相应的措施,如定期体检和生活方式调整,以减少患病的风险。
三、生物芯片技术在个性化医疗中的应用个性化医疗是一种根据个体基因信息和特定疾病特征来制定个性化治疗方案的医疗模式。
生物芯片技术的高灵敏度和高速度使之成为实现个性化医疗的理想工具。
通过对患者基因组的全面分析,生物芯片可以帮助医生了解患者对不同药物的反应,从而指导药物选择和剂量调整。
此外,生物芯片还可以检测个体的药物代谢能力,从而预测患者对某些药物的敏感性和毒副作用的风险。
通过个性化医疗,医生可以为患者提供更安全和有效的治疗方案,提高治疗的成功率。
综上所述,生物芯片技术在基因检测中的应用广泛而重要。
它的高通量、高灵敏度和高速度使之成为早期诊断、疾病预测和个性化医疗的理想工具。
随着技术的不断发展,生物芯片在基因检测领域的应用前景将更加广阔。
应用CSC-GE-80基因芯片筛查人子宫内膜早期异位种植的血管生长相关基因作者:王宁宁,张玉凤,张红霞,谭金凤,谢洪哲,姚书忠,庄广伦,牛刚,黄建昭,何勉【摘要】【目的】探讨子宫内膜异位早期种植的相关基因,特别是与早期种植相关的血管生长基因。
【方法】采用裸鼠人子宫内膜皮下种植的方法,建立裸鼠人子宫内膜异位症模型,在种植后14 d,取出成模病灶与未种植内膜进行CSC-GE-80基因芯片筛查比较。
【结果】在基因表达谱中最有显著性上调基因50个,最有显著性下调基因47个,包括生长因子和细胞因子及其受体的变化,其中生长因子受体结合蛋白10(growth factor receptor-bound protein 10,Grb10)与丁酸盐反应因子1(butyrate response factor 1 )中表皮生长因子(EGF-response factor 1)上调明显,下调明显胰岛素样生长因子结合蛋白7(insulin-like growth factor binding protein 7)。
【结论】通过基因筛查我们初步考虑生长因子结合蛋白10(growth factor receptor-bound protein 10)有可能参与早期异位内膜的血管生长。
【关键词】子宫内膜异位症;早期种植;裸鼠模型;基因芯片;血管生长子宫内膜异位种植的原因,一直是人们是人们关注的热点。
在我们前期的研究中,通过裸鼠进行人子宫内膜的异体异位种植,我们发现血管生成及其相关因子如血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor, VEGF)在异位内膜的早期种植与生长的过程中,起十分重要的作用[1,2]。
但子宫内膜异位种植的早期,究竟是哪些基因发生变化或者在这一过程中起到作用,仍不十分清楚。
我们拟通过基因芯片筛查种植在裸鼠的人子宫内膜异位病灶,为早期的种植相关基因提供了一定的理论依据。
基因芯片筛查子宫内膜容受性相关基因的应用宋晓雯【摘要】胚胎的顺利着床有赖于子宫内膜对其具有良好的容受能力.深入了解子宫内膜容受性的变化,对确定胚胎移植的时机和提高胚胎种植率具有极其重要的意义.新近发展的基因芯片技术可同时检测同一细胞或组织的大量基因,为研究正常或异常内膜的基因变化及其复杂的内在联系提供了高效的途径.综述基因芯片技术在内膜容受性候选基因的筛查、控制性卵巢刺激及不孕相关疾病对内膜容受性相关基因的影响中的应用.【期刊名称】《国际生殖健康/计划生育杂志》【年(卷),期】2011(030)002【总页数】5页(P95-98,107)【关键词】子宫内膜容受性;基因;芯片分析技术;寡核苷酸序列分析;不育,女(雌)性【作者】宋晓雯【作者单位】200001,上海交通大学医学院附属仁济医院生殖医学科【正文语种】中文自1978年首例试管婴儿出生以来,辅助生殖技术(ART)相关研究取得了长足的进步。
但种植失败仍限制了其成功率,其中子宫内膜容受性是影响成功种植的主要因素,因而受到众多研究者和临床工作者的重视。
基因芯片技术是一门新兴的综合性实验技术,为内膜容受性研究提供了生物学研究的新途径。
基因芯片(gene chip)也称微阵列(microarray),是将大量单链DNA(ssDNA)或寡核苷酸探针固定于玻璃、硅片等固相支持物上,或直接在硅片上原位合成寡核苷酸探针,然后用同位素法或化学发光法标记待研究的靶基因,如RNA或ssDNA,在芯片上与探针杂交,通过检测杂交信号,并经计算机比较分析信号强度和分布模式图得到所需信息。
其基本原理与聚合酶链反应(PCR)一样,取决于核酸分子的碱基互补配对。
基因芯片的制备者各异,故其制备方式及性能特点多样,分类繁杂。
目前子宫内膜容受性研究最常用的芯片是照相制版技术原位合成的寡聚核苷酸芯片。
这是一种高密度微阵列,制备技术及设备复杂,目前只有个别公司生产。
这种技术生产的基因芯片,能够在约厘米见方的薄片上排列成千上万个寡聚核苷酸探针,这意味着极小的芯片上即可容纳极大的信息量。
应用基因芯片技术筛查人子宫内膜容受性相关基因
章汉旺;范莉;赖巧红
【期刊名称】《中国优生与遗传杂志》
【年(卷),期】2006(14)4
【摘要】目的探讨人子宫内膜容受性相关基因的差异表达。
方法应用含14000条基因的cDNA表达谱基因芯片分析分泌早期与分泌中期子宫内膜基因的差异表达。
结果所检测的14000个基因中,分泌早期子宫内膜与分泌中期子宫内膜之间存在显著差异表达基因313个。
其中,分泌中期子宫内膜表达上调基因数为175个,下调基因数为138个。
结论子宫内膜容受性的建立受许多因素的调控,应用基因芯片技术
可以快速、高通量的筛查出相关基因,从而有可能找到合适的分子标志物作为子宫
内膜容受性的临床诊断指标。
【总页数】3页(P18-20)
【关键词】子宫内膜;基因表达谱;接受性;着床
【作者】章汉旺;范莉;赖巧红
【作者单位】华中科技大学同济医学院附属同济医院妇产科
【正文语种】中文
【中图分类】R349.7
【相关文献】
1.基因芯片筛查子宫内膜容受性相关基因的应用 [J], 宋晓雯
2.应用基因芯片技术筛查膀胱移行细胞癌相关肿瘤基因 [J], 汪小明;张选志;黄循
3.应用CSC-GE-80基因芯片筛查人子宫内膜早期异位种植的血管生长相关基因[J], 王宁宁;何勉;张玉凤;张红霞;谭金凤;谢洪哲;姚书忠;庄广伦;牛刚;黄建昭
4.应用基因芯片技术筛查大肠癌相关基因 [J], 南清振;张振书;杨希山;肖冰;高蕾;叶方鹏;武金保
5.应用基因芯片对人肝纤维化相关基因的筛查 [J], 罗新华;杨勤;张权;程明亮
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miRNAs及其靶基因在子宫内膜容受性中的作用引言子宫内膜容受性是一种重要的生殖健康指标,它对于女性的生育能力具有重要意义。
在子宫内膜容受性过程中,miRNAs及其靶基因发挥着重要的调控作用。
miRNAs是一类非编码性RNA,能够通过与靶基因的mRNA结合,从而调节基因的表达水平。
在子宫内膜容受性中,miRNAs通过影响细胞增殖、凋亡、分化和细胞信号传导等多个方面的基因表达,对子宫内膜的生理功能发挥着关键作用。
本文将通过综述miRNAs及其靶基因在子宫内膜容受性中的作用,以期对这一领域的研究有所帮助。
miRNAs在子宫内膜容受性中的调控作用miRNAs在子宫内膜容受性中的调控作用主要表现在以下几个方面:1. 细胞增殖和凋亡miRNAs通过调节细胞增殖和凋亡相关基因的表达,影响子宫内膜细胞的生长和存活。
miR-200家族被发现在子宫内膜容受性周期中的表达水平发生变化,并且与子宫内膜细胞的增殖和凋亡密切相关。
miR-200家族通过抑制ZEB1和ZEB2等靶基因的表达,从而调节子宫内膜细胞的增殖和凋亡。
2. 细胞分化miRNAs还参与调控子宫内膜细胞的分化过程。
研究发现,miR-135a通过抑制HOXA10基因的表达,影响子宫内膜细胞向腺泡细胞的分化。
miRNAs还可以通过影响细胞信号传导通路,调节子宫内膜细胞的分化状态。
3. 代谢与激素敏感性miRNAs在调节子宫内膜对激素及代谢物的敏感性方面也发挥着重要的作用。
研究表明,miR-93通过调节LIF(白细胞介素-11)的表达,影响子宫内膜对激素的敏感性,进而调控子宫内膜容受性。
miRNAs靶基因在子宫内膜容受性中的作用miRNAs通过与靶基因的mRNA结合,影响靶基因的表达水平,从而调节细胞的生理功能。
在子宫内膜容受性中,一些重要的靶基因被发现与miRNAs密切相关,影响子宫内膜的生理功能。
1. HOXA10HOXA10是一个在子宫内膜中表达丰富的基因,它在子宫内膜细胞的分化和功能维持中起着重要作用。
基因芯片技术在子宫内膜异位症研究中的应用
周红辉;李亚里
【期刊名称】《中国康复理论与实践》
【年(卷),期】2005(011)003
【摘要】具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔被覆粘膜以外的身体其他部
位时称为子宫内膜异位症(endometriosis,EM)。
EM是一种具有恶性侵袭行为的良性妇科疾病,主要的临床表现为痛经、盆腔包块和不孕等,近年发病率不断上升,严重影响妇女的生殖健康及生活质量。
目前EM的发病机制尚不清楚。
随着2001年2月人类基因组计划(HGP)即全部核苷酸测序工作的完成,
【总页数】2页(P200-201)
【作者】周红辉;李亚里
【作者单位】100853,北京市,中国人民解放军总医院妇产科;100853,北京市,中国
人民解放军总医院妇产科
【正文语种】中文
【中图分类】R711.71
【相关文献】
1.基因芯片技术在水稻抗逆基因表达研究中的应用 [J], 陈玉;刘鹏;陈由强;张建福;
谢华安
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3.抑制性消减杂交和基因芯片技术在牙髓差异表达基因研究中的应用 [J], 吴煜
4.基因芯片技术在子宫内膜异位症中的研究进展 [J], 胡丽燕;李兆艾
5.抑制消减杂交联合基因芯片技术及其在动物基因差异表达研究中的应用 [J], 姜俊芳;宋雪梅;蒋永清
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3.琼脂糖凝胶电泳图谱
通过目测28S和18S的亮度比例可以初步评价总RNA的质量。
一般认为28S:18S兰2可以初步判定总RNA质量较好。
本实验中检测结果如上图所示,经琼脂糖凝胶电泳测定,两个组织样本的18SRNA和28SRNA均条带清晰,且28S:18S兰2说明本实验所抽提的总RNA完整性好,纯度高,符合芯片杂交检验的要求,两个样品均合格。
4.Lab—on—chip检测图谱
样本1(对照组):
华中科技大学同济医学院硕士学位论文样本2(实验组)
二、基因表达图谱
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基因芯冀杂交信号扫槎缝果(见下圈)
上图为对照组和实验组内膜组织样本双色荧光标记叠加图,对于某一点的两耱登宓鞋荧光缤号,懿采Cy3信号较强,该点多显绿色(上璃趋势);懿果Cy5售号较强,该点多显红色(下调趋势):如果强度相似,则显黄色。