重要病原菌与宿主相互作用分子机制的研究
- 格式:doc
- 大小:205.50 KB
- 文档页数:76
病原体的致病机制及其与宿主相互作用病原体是一种能够引起疾病的生物体,包括细菌、病毒、真菌、寄生虫等。
它们能够通过不同的途径进入宿主体内,例如食物、空气、水或者直接接触感染。
一旦病原体成功进入宿主体内,它们会利用各种机制侵入宿主的组织,开启病理反应,因而引发感染和疾病。
在此背景下,本文就病原体的致病机制及其与宿主相互作用进行详细探讨。
一、病原体的致病机制不同类型的病原体存在着不同的致病机制。
这里面涉及到的一些主要机制如下:1、细菌的致病机制细菌的致病机制比较多,主要包括分泌毒素、激发炎症反应等。
分泌毒素是其中的一种重要的致病机制。
它们可以直接毒害宿主细胞,导致细胞死亡。
例如葡萄球菌可以分泌出协同溶血素和耐药性决定质粒,后者可使得细菌对抗抗生素的能力强化。
激发炎症反应也是一种重要的致病机制。
炎症反应是身体免疫系统的一种应答机制,但是当病原体感染时,免疫系统会受到激发,导致炎症反应过度,对宿主组织造成伤害。
2、病毒的致病机制病毒的致病机制与细菌区别较大,它们可以侵入宿主细胞并同宿主的重要生化机制相互作用,从而实现复制自身。
在此过程中,病毒会破坏宿主细胞,并促使宿主细胞产生更多的病毒。
病毒还会利用宿主的免疫系统防止自身被清除。
例如难以清除的乙型肝炎、HIV等显著体现出了病毒的致病机制。
3、真菌和寄生虫的致病机制真菌和寄生虫侵入宿主体内后的致病机制与细菌和病毒的致病机制类似。
真菌可以通过侵入生物体产生各种病理学过程来感染主人。
寄生虫则可以通过侵入生物体或者使用其它生物为宿主来进行给它人带来病菌,并且常使感染过程更加复杂和难以治愈。
二、病原体与宿主相互作用感染病原体后,宿主与病原体之间的相互作用通常会在免疫系统的应答下发生。
针对于不同的病原体,身体会产生多种类型的免疫反应。
在此,本文将重点介绍病原体与宿主免疫系统相互作用这一方面。
1、天然免疫功能人体的天然免疫功能主要由机体产生的非特异性的防御机制来达成。
它包括中性粒细胞、外泌素、内泌素等免疫活性物质。
病原生物的致病机制和与宿主的相互作用研究病原生物是指能够引起疾病的微生物,包括细菌、病毒、真菌和寄生虫等。
它们在感染宿主后可以通过多种方式引起疾病,包括直接伤害宿主组织、分泌毒性物质、激活宿主免疫系统等。
本文将介绍病原生物的致病机制和与宿主的相互作用研究。
一、细菌的致病机制细菌病原体通过多种途径感染宿主,其致病机制包括:1.分泌毒素:某些细菌能够分泌毒素,如白喉杆菌分泌的白喉毒素、破伤风杆菌分泌的破伤风毒素等,这些毒素会损伤宿主细胞、破坏宿主免疫系统等,导致病变。
2.表面结构:细菌病原体表面结构的变化也能导致疾病。
如肠道病原菌大肠杆菌O157:H7菌株表面的脂多糖(LPS)能够引起内毒素反应,导致病变。
3.细菌的附着和侵入:细菌通过附着在宿主组织表面上后,产生胶质等黏附分子,侵入细胞或深入组织,导致病变。
二、病毒的致病机制与细菌病原体相比,病毒的致病机制更为复杂:1.直接损伤细胞:某些病毒如流感病毒、单纯疱疹病毒、乙型肝炎病毒等可以直接感染并破坏宿主细胞;某些病毒如人免疫缺陷病毒(HIV)可以通过感染宿主免疫系统细胞来影响免疫功能。
2.诱导细胞死亡:某些病毒感染后,诱导宿主细胞发生程序性细胞死亡(凋亡),导致组织功能障碍。
3.激活免疫系统:病毒感染可以激活宿主免疫系统,使免疫细胞释放炎症介质,促进细胞间相互作用,造成炎症反应。
三、真菌和寄生虫的致病机制真菌和寄生虫的感染机制也较为复杂,常见的致病机制包括:1.过敏反应:宿主对真菌或寄生虫感染的过程中会产生过敏反应,如对寄生虫丝虫的感染就会引发过敏反应,丝虫蛋白可以作为抗原刺激体内IgE增加,释放组胺导致瘙痒、发热等过敏反应。
2.分泌毒素:某些真菌和寄生虫也能分泌毒素,如疟原虫的热休克蛋白70(Hsp70)和红细胞过氧化物酶(Prx1)等,这些毒素会直接影响宿主细胞,另外,某些毒素还能激活宿主免疫系统,导致炎症反应。
3.发出衣原体:衣原体是一种类细菌的微生物,在人类体内常相关着心血管疾病、婴儿肺炎以及人类流感。
病原菌与宿主互作机制病原菌是影响人类健康的一大隐患,它们可以侵入宿主机体并引起各种疾病。
而病原菌与宿主之间的相互作用是非常复杂的,因为病原菌在生长和繁殖的过程中,会与宿主的免疫系统展开一场角力,而这场较量的胜负关系直接决定了宿主有无被感染。
病原菌侵入宿主机体的途径主要有两种:一种是通过皮肤、黏膜、呼吸道等直接接触的途径入侵;另一种是通过通过虫媒、水、食物等途径传播到宿主体内。
无论是哪种途径,病原菌都必须首先突破宿主的第一道屏障——免疫防线,才能成功入侵宿主机体。
为了限制病原菌的入侵,宿主机体会启动一系列的免疫反应,以保护自身不受病原菌的侵害。
若病原菌侵犯了宿主机体,则宿主机体会向外释放有趣分子,以启动自身的免疫系统。
这些有趣分子可以引起发热、炎症等症状,以吸引机体内的免疫细胞向病变部位聚集,从而清除病原菌。
病原菌与宿主之间的互作关系是非常复杂的,病原菌在宿主体内并不是单纯地生长和繁殖,还可以通过各种途径干扰和破坏宿主的免疫系统,以逃避宿主的免疫攻击,保障自身生存和繁殖。
病原菌通过分泌外毒素或细菌组织中的内毒素来破坏宿主细胞和组织,进而抑制宿主的免疫反应。
另一方面,病原菌也可以通过操纵宿主免疫系统来把宿主免疫系统“开发”出对病原菌友好的反应,从而给病原菌提供隐蔽的访问通道。
例如,伤寒杆菌(Salmonella typhi)通过改变宿主的免疫系统,让宿主对其他常见细菌逐渐产生免疫反应,同时使宿主免疫系统对它自身所感染的伤寒杆菌麻痹失灵,使伤寒杆菌“藏身”于宿主体内,长时间地存留。
这种恶性互动很容易导致严重的感染和危害宿主的生命健康。
也有一些病原菌的侵犯方式非常狡猾,它们会修改自身的DNA,从而打破免疫系统的故障检查机制,逃避机体的免疫系统,长时间存留于机体内部。
举例来说,结核杆菌(Mycobacterium tuberculosis)通过初始感染后快速进入休眠期,使自己躲避宿主的免疫系统,难以被细胞吞噬和清除。
病毒与宿主细胞相互作用的分子机制病毒是一种具有生物活性的微生物体,它们能够感染宿主细胞并复制自身,一旦复制成功将会对宿主细胞造成不同程度的损害。
而宿主细胞则为病毒的生存和复制提供了重要的保障。
病毒与宿主细胞之间的相互作用是一种非常复杂的生物学现象,关于这个现象,科学家们正在进行深入的研究。
下面我们将从分子机制的角度探讨病毒与宿主细胞之间的相互作用,以期更深入地了解其内在规律。
病毒感染宿主细胞的过程中,病毒基因组通过一系列的机制,影响宿主细胞的基因表达和细胞代谢。
这些机制中存在着一种特殊的分子机制,称为“病毒-宿主相互作用机制”,这种机制在病毒与宿主细胞互动方面发挥了至关重要的作用。
具体来讲,病毒-宿主相互作用机制由三个部分组成:病毒蛋白质、宿主蛋白质和病毒基因组。
这三个部分之间互相调控、相互作用,促进病毒复制与生存。
首先,在病毒感染宿主细胞的过程中,病毒需要利用宿主细胞的细胞质或核质环境,进行基因组转录和复制过程。
病毒基因组中的一些核酸序列,可以结合特定的宿主蛋白,调控基因转录和RNA后加工过程。
例如,在许多RNA病毒感染细胞的过程中,病毒基因组中的5'端和3'端非翻译区域(UTR)序列可以结合机体的核糖核酸结合蛋白(RBPs),从而调控病毒RNA的稳定性、剪接和转录效率。
其次,病毒感染细胞后需要复制自己的基因组。
此时病毒需要利用宿主细胞的细胞器,如核糖体、内质网、高尔基体、线粒体等进行基因组复制。
在这些复制过程中,病毒需要利用一系列的病毒蛋白质,介导宿主细胞细胞器的定向运输、分解和循环。
例如,RNA病毒常常利用宿主细胞细胞质内的核糖体和高尔基体,合成病毒蛋白和复制RNA。
最后,在病毒复制的后期,病毒需要自身基因组和病毒蛋白质,进一步影响细胞的免疫反应和自噬响应。
病毒基因组或表面蛋白质,可以通过多种途径,形成MHC-1抗原复合物,从而介导免疫细胞的杀伤。
而一些病毒蛋白则可以激活或抑制细胞自噬过程,从而影响宿主细胞的生长状态和代谢功能。
病原菌毒力因子的分子机制研究病原菌是一种可以引起疾病的微生物,它们可以通过各种途径感染到人类和动物。
病原菌的毒力因子是导致它们对宿主产生病理反应的分子机制。
因此,研究病原菌毒力因子的分子机制对于预防和治疗由这些病原菌引起的疾病具有重要意义。
一、病原菌毒力因子的分类病原菌毒力因子是指病原菌侵入宿主细胞或组织后产生的分子机制。
根据其模式和功能,病原菌毒力因子可以分为四类:1.毒素:毒素是病原菌分泌的分子,可以直接损害宿主组织或细胞。
它们可以分为内毒素和外毒素两种,并且根据它们作用的方式和目标,可以分为细胞毒素、神经毒素和分解毒素等。
2.外膜组分:病原菌外膜上的分子,可以作为识别和攻击宿主细胞的工具,包括各种血凝素、脂多糖和蛋白质等。
3.反应型组分:病原菌在侵入宿主细胞后产生的分子机制,包括细胞浓缩物和致炎因子等。
4.传递系统:病原菌通过传递系统将毒力因子输送到宿主组织中,包括细菌鞭毛、细菌分泌系统和样式认知受体等。
在不同的病原菌中,毒力因子的种类和数量会不同,这取决于病原菌本身的特性和所感染的宿主类型。
二、病原菌毒力因子的分子机制病原菌毒力因子的分子机制复杂多样,其中一些已经得到了深入的研究。
1.内毒素的分子机制:内毒素包括脂多糖和其他由细胞壁脱落的结构,它们可以在病原菌死亡后释放到宿主体内引发免疫反应。
脂多糖可以结合到宿主细胞表面的Toll样受体(TLRs)上,并激活NF-κB等信号通路,引发炎症反应。
通过治疗病原菌感染的炎症反应,可以有助于缓解疾病的症状。
2.外膜组分的分子机制:病原菌外膜组分包括各种蛋白质和糖类结构,在宿主细胞中的作用也是多种多样的。
例如,E. coli菌的O157血凝素可以结合到小肠表面的肠上皮细胞并形成浸润,导致早期的夏季腹泻。
而沙门氏菌的血清型Vi抗原则通过与巨噬细胞膜上的Fcγ受体结合来协助病原菌侵入宿主细胞。
研究这些作用机制对于发现新的治疗策略具有重要意义。
3.反应型组分的分子机制:反应型组分包括病原菌细胞壁分解物、化学信使分子和氧化剂等,它们可以在宿主体内激活炎症反应和免疫反应。
病原微生物的致病机制与分子生物学研究病原微生物是引起疾病的微小生物,包括细菌、病毒、真菌和寄生虫。
它们可以通过侵入人体的方式,破坏正常的生理功能,导致身体出现一系列的症状。
研究病原微生物的致病机制和使用分子生物学技术进行相关研究,对于预防和治疗疾病具有重要的意义。
一、细菌致病机制与分子生物学研究1. 细菌的感染过程:细菌感染的一般过程包括吸附、侵入、生长和扩散等。
吸附是指细菌通过特异性受体与宿主细胞表面结合;侵入是指细菌进入宿主细胞、组织或器官的过程;生长是指细菌在宿主体内繁殖生长;扩散是指细菌通过血液、淋巴和体液等途径,转移到宿主的不同部分。
2. 病原力相关基因的研究:病原力是指细菌引起疾病的能力,病原力相关基因的研究对于揭示细菌的致病机制具有重要意义。
通过分子生物学手段,可以研究和鉴定与病原力相关的基因,如毒力因子、抗菌素耐药基因等。
这些研究能够揭示细菌的病原力来源、致病机制以及相关的防治策略。
3. 宿主-细菌相互作用的研究:宿主-细菌相互作用是指细菌与宿主之间的相互作用过程,包括宿主免疫反应、细菌逃逸机制以及宿主对细菌感染的抵抗能力等。
分子生物学技术可以研究宿主的免疫反应,如识别和清除细菌的机制以及宿主细胞上参与信号传导的分子等。
这些研究有助于了解细菌感染的机制,为预防和治疗疾病提供理论基础。
二、病毒致病机制与分子生物学研究1. 病毒感染及其复制过程:病毒感染需要通过与宿主细胞表面受体结合,进入细胞内,并依赖于宿主细胞的生物学机制进行复制过程。
分子生物学研究可以揭示病毒感染与复制的分子机理,包括病毒感染所需的宿主细胞因子以及病毒复制所需的核酸酶等。
2. 免疫逃逸机制的研究:病毒感染宿主后,宿主免疫系统会启动一系列的免疫反应。
病毒通过各种机制逃逸免疫识别,维持感染状态。
分子生物学研究可以揭示病毒的免疫逃逸机制,如病毒基因突变、蛋白质抑制宿主免疫等。
3. 病毒感染与宿主细胞相互作用的研究:病毒与宿主细胞的相互作用对于病毒感染的发生和发展起着重要作用。
植物病原菌与宿主互作的分子生物学机制研究植物是地球上一个非常重要的生命体,它们不仅是全球生态系统的基础,还是人类的重要食物来源。
然而,植物在生长过程中常常受到各种病原菌的威胁,这些病原菌可以导致植物生长发育受限、减少产量、破坏植株结构等,严重影响农业生产和生态环境。
因此,深入了解植物与病原菌的互作机制,对防治植物病害具有重要意义。
本文将主要探讨植物病原菌与宿主互作的分子生物学机制研究。
一、病原菌致病的主要途径病原菌通过三种主要的途径致病:直接侵染、进入伤口和感染昆虫等介体。
病原菌通过直接侵染作为入侵途径是指病原菌将其菌丝、孢子或真菌体等结构直接插入到植物的组织中,如土传病原菌的侵染途径。
大多数真菌和细菌利用产生的酶类或毒素类代谢产物直接腐解植物细胞壁,使植物细胞壁破裂,其细胞质也被菌丛所侵入。
这种方式是一种强烈的侵染方式。
进入伤口是指当受损植物部位暴露在环境中时,病原菌通过利用受损的表皮或细胞壁进入植物的机制。
比如,叶片上的虫口或机械裂伤都可以成为病原菌进入的途径。
通常,在植物细胞颈部形成的导管组织内,细菌和真菌会生存繁殖,并引起阻塞。
感染昆虫等介体是指病原菌依托昆虫的基因表达、生理和生态特征以及生物学过程,使用昆虫去传递病原菌,完成其生命周期的一种方式,成为病害传播途径的学说称为“昆虫媒介假说”。
二、植物与病原菌互作的分子生物学机制植物在病原菌感染的最初阶段,通过感染信号调控启动一系列防御物质的合成,主要分为胞内和胞外防御。
胞内防御主要是植物细胞通过识别病原菌的microbe-associated molecular patterns(MAMPs)如聚糖、鞭毛蛋白等,来启动细胞内的内在防御机制,包括MAPK信号转导通路的激活,从而导致防御基因的激活和防御物质的积累。
植物胞外的防御则主要是针对病原菌分泌的effectors,对它们进行直接或抗性猜想,形成壁质反应例外处理(ETI)。
病原菌致病的主要途径中,直接侵染和进入伤口的方式涉及到植物的细胞壁。
植物宿主互作研究寄主植物与病原体互动关系的学科植物宿主互作是研究植物与病原体之间相互作用的学科,该学科主要关注植物作为宿主与各类病原体(如真菌、细菌、病毒等)之间的互动关系。
通过研究寄主植物与病原体相互作用的机制,可以为农业生产中的病害防控提供理论依据和技术支持,从而增进作物产量和品质。
一、植物宿主互作的背景介绍近年来,随着全球气候变化和人类活动的加剧,植物病害问题日益突出,给农业生产和生态平衡带来了严重威胁。
植物与病原体之间的相互作用是病害发生与发展的核心过程,因此研究植物宿主互作显得尤为重要。
二、植物抗病机制的研究在植物宿主互作中,植物通过不同的机制来抵抗病原体的侵袭。
其中,植物免疫系统是最为重要的防御机制之一。
植物免疫系统可以通过识别病原体的特定分子来触发一系列防御反应,从而抵御病原体的入侵。
此外,植物还通过调控与病原体互作的信号通路、生成抗菌物质等方式来增强自身的抵抗能力。
三、寄主植物与病原体互动的分子机制寄主植物与病原体互动的分子机制是植物宿主互作领域的研究热点,通过揭示植物与病原体之间的分子相互作用,可以深入了解宿主植物对抗病原体的机制。
例如,一些研究发现,植物中一些关键基因的表达调控与病原体的互作密切相关,这为我们进一步理解植物抗病机制提供了线索。
四、植物宿主互作研究的意义植物宿主互作研究对农业生产具有重要的意义。
通过深入了解植物与病原体之间的相互作用,可以针对不同的病害制定相应的防控策略,从而减少病害的发生和蔓延。
此外,植物宿主互作研究还可以为农作物的遗传改良提供理论支撑,通过选育抗病品种来提高农作物的产量和品质。
五、研究方法和进展在植物宿主互作的研究中,科学家们运用了多种研究方法来解析植物与病原体之间的相互关系。
例如,利用遗传学、生物化学、细胞生物学等手段,可以分析植物抵抗病原体的分子机制;利用生物信息学、转录组学等技术,可以揭示植物宿主与病原体互作的基因调控网络。
这些研究方法的不断创新和进展,推动了植物宿主互作研究的深入。
病原菌与宿主互作的分子机制研究病原菌与宿主之间的互作是一种复杂的过程,涉及到众多分子机制。
病原菌通过一系列的分子途径侵入宿主细胞,感染并繁殖。
在这个过程中,宿主细胞也会启动一系列生物学反应,试图抵御病原菌。
了解病原菌与宿主之间的互作分子机制,有助于预防和治疗疾病。
1. 病原菌与宿主之间的分子途径病原菌与宿主之间的互作涉及到多种分子途径,包括:1)粘附与识别分子途径;2)侵入细胞途径;3)模拟宿主免疫反应途径。
1.1 粘附与识别分子途径病原菌与宿主之间的互作开始于粘附与识别。
病原菌能够通过表面成分,如细菌毛、黏附分子等与宿主细胞表面的受体结合,实现粘附。
研究表明,大肠杆菌通过匹配宿主肠道细菌的群体,粘附并在肠道中黏附,形成生物膜。
另外一些研究显示,病原菌的外膜包裹的多糖物质,如LPS或LIPOPOLYSACCHARIDES,是参与粘附与识别的关键因子。
1.2 侵入细胞途径疾病的发生与病原菌侵入细胞的能力密切相关。
病原菌能够采用不同的进入途径,包括细胞内途径与胞外途径。
其中,细胞内途径是最为常见的侵入方法。
细胞内途径通常通过细菌蛋白水解酶和胶原酶等蛋白分解酶,分解宿主的组织蛋白质,导致细胞死亡,细胞破裂并加速细菌的侵入。
胞外途径则是病原菌通过直接注射毒素或蛋白质,将活性物质注入宿主细胞,破坏细胞的内部结构,并使细胞死亡。
1.3 模拟宿主免疫反应途径病原菌能够修改其表面表达抗原蛋白和受体,模拟宿主的免疫反应,降低宿主细胞免疫反应。
其他的机制包括抑制T细胞活化、抗菌肽和细胞色素释放等。
2. 宿主细胞的免疫反应宿主细胞对病原菌的感染,在分子层面上也能够激发一系列的免疫反应。
其中,宿主免疫细胞能够通过分泌抗菌物质、细胞色素释放等方式,杀死入侵的病原菌从而维护机体的健康。
2.1 激活宿主免疫细胞宿主的免疫反应可以通过激活免疫细胞来实现。
这些免疫细胞会释放细菌死亡所产生的细胞因子,如IL-1β、IL-6和TNF-α等。
病原体与宿主之间分子互作的机制研究随着科技的进步和研究技术的提高,越来越多的关于病原体与宿主之间分子互作的机制研究成果被公开。
病原体是指能够引起疾病的微生物,而宿主是指被病原体所感染的生物。
在感染过程中,病原体和宿主之间进行着一系列的交互作用和互作,这其中的分子互作机制是非常重要的。
一、病原体感染的分子机制病原体通过感染人体后,会定居在人体内部,并且繁殖和生长。
在这个过程中,要想使病原体得以存活下来,就必须借助于一些分子机制。
1. 细菌的逃避机制细菌通过一些逃避机制,使得人体的免疫系统难以对其进行打击,从而达到隐藏和存活的目的。
例如,一些细菌会产生外膜泡(OMVs),从而难以被人体内分泌系统检测出来。
此外,一些细菌还会产生霍乱毒素(CTX),导致人体自身分泌黏液,从而难以被人体免疫系统检测出来。
2. 病毒的进化机制病毒通过不断的进化和变异,从而逐渐适应人体环境,获取更多的生存资源。
例如,病毒通过不断的变异,会导致不同的亚型。
在这个过程中,有些亚型会变得更具有感染力,从而更容易引起疾病。
二、宿主免疫应答的分子机制宿主的免疫系统对于病原体的入侵具有非常重要的作用。
在感染的过程中,宿主免疫应答的分子机制往往会影响宿主的健康和病原体的生死存亡。
1. 宿主免疫应答的分子机制宿主免疫系统通过两条途径进行免疫应答:先天性免疫系统和获得性免疫系统。
在先天性免疫系统中,宿主通过识别病原体的共同特征进行抵御。
在获得性免疫系统中,宿主通过识别病原体的特异性抗原进行抵抗。
这两个系统在宿主免疫应答中扮演着非常重要的角色。
2. 免疫调节分子在宿主免疫应答的过程中,免疫调节分子在很大程度上会影响免疫系统的发挥。
例如,在感染的早期阶段,如果免疫调节分子过于弱化了免疫系统的反应,就会导致病原体在宿主体内生长和繁殖。
而在感染的后期,如果免疫调节分子过于强化了免疫系统反应,就会导致宿主细胞甚至组织的损伤。
因此,免疫调节分子必须保持在一个平衡状态,从而才能保证宿主的免疫系统正常、有效地工作。
项目名称:重要病原菌与宿主相互作用分子机制的研究首席科学家:起止年限:2012.1-2016.8依托部门:教育部上海市科委一、关键科学问题及研究内容本项目将紧密围绕细菌性传染病防控和国家安全(生物反恐)等国家重大需求,以重要胞内病原菌土拉杆菌,结核杆菌和鼠疫菌为模型,系统地研究病原菌和宿主之间相互作用的分子机制,拟重点研究解决以下关键科学问题:1.胞内病原菌侵入宿主细胞的分子调控机制?2.胞内病原菌在宿主细胞内存活的分子调控机制?3.胞内病原菌因子如何干扰宿主细胞的关键信号通路?主要研究内容为了解决以上三个关键科学问题,本项目拟以重要胞内病原菌土拉杆菌,结核杆菌和鼠疫菌为研究对象,系统地筛选发现鉴定与病原菌侵入及胞内存活相关的病原菌致病因子和宿主因子,研究病原菌和宿主的功能非编码RNA和蛋白质的相互作用,病原蛋白-宿主蛋白之间的相互作用,及泛素及类泛素化蛋白修饰等如何调控病原菌进入宿主细胞并在胞内存活及相关信号通路的分子机制,具体为以下六方面的研究:1. 发现和研究与病原菌侵入及胞内存活相关的宿主细胞因子及分子调控机制:1)研究一些宿主关键免疫分子对病原菌侵入及胞内存活的调控的分子机制;2)筛选与病原菌侵入或存活相关的新的宿主细胞因子并研究其功能机制。
2. 发现和研究与病原菌侵入及胞内存活相关的病原菌因子及分子调控机制:1)利用转座子技术筛选和研究与病原菌侵入或存活相关的病原菌致病因子;2)利用过表达病原菌分泌蛋白组筛选与研究与胞内存活相关的致病因子。
3. 研究非编码RNA-蛋白相互作用调控病原菌侵入及胞内存活的分子机制:1)大规模发现病原菌和宿主新的非编码RNA;2)构建非编码RNA-蛋白相互作用网络;3)研究非编码RNA-蛋白相互作用调控病原菌侵入及胞内存活的分子机制4. 研究病原-宿主蛋白相互作用调控病原菌侵入及胞内存活的分子机制:1)筛选和文献挖掘病原菌-宿主相互作用蛋白;2)构建和分析病原菌-宿主蛋白相互作用网络;3)进行病原和宿主相互作用蛋白的结构免疫学研究;4)研究重要的病原菌和宿主相互作用蛋白调控病原菌侵入及胞内存活的分子机制5. 研究泛素化或类泛素化蛋白等修饰调控病原菌侵入及胞内存活的分子机制;1)研究一类具有重要免疫调控功能的宿主泛素系统中的关键分子在病原菌侵入及胞内存活过程中的调控作用及其分子机制;2)探寻与胞内菌在宿主巨噬细胞中的存活相关的新的泛素连接酶,并研究其免疫调控功能和分子机制;3)发现与宿主泛素及类泛素化系统相关分子相互作用的病原菌蛋白分子,并研究其调控病原菌侵入及胞内存活的分子机制;4)研究胞内菌中含pupylation修饰的蛋白酶体底物蛋白分子与宿主的泛素及类泛素系统相关分子间的相互作用及其调控病原菌侵入及胞内存活的分子机制;;5)泛素及类泛素系统关键分子及其相互作用蛋白的结构免疫学研究6. 研究胞内病原菌干扰宿主免疫细胞的功能及分子机制:1)检测临床结核杆菌感染病人肺巨噬细胞功能的变化及对信号通路的影响;2)研究重要差异分子对巨噬细胞功能的影响及调控病原菌侵入及胞内存活的分子机制;3)检测临床结核菌感染病人CD4+T细胞功能的分化及对信号通路的影响;4)研究重要差异分子对CD4+T细胞功能的影响及通过CD4+T调控病原菌侵入巨噬细胞及胞内存活的分子机制;二、预期目标总体目标以重要胞内病原菌土拉杆菌,结核杆菌和鼠疫菌为模型,阐明胞内病原菌侵入宿主细胞的分子调控机制;阐明胞内病原菌在宿主细胞内存活的分子调控机制;阐明胞内病原菌因子如何与宿主因子相互作用干扰宿主免疫信号通路的分子机制;发现诊断与治疗病原菌的新靶点,为控制病原菌感染和提高病原菌感染相关疾病的治愈率奠定基础。
同时在病原菌-宿主相互作用的研究领域为我国培养一批优秀人才。
五年预期目标1.发现和确定一些新的调控病原菌侵入宿主细胞的分子机制;2.发现和确定一些新的调控病原菌在宿主细胞内存活的分子机制;3.发现和确定一些病原菌和宿主相互作用中的新的关键信号转导分子;4.通过培养硕士、博士研究生和博士后,扶植一批在病原菌-宿主相互作用研究领域具有国际竞争力的优秀中青年科学家,造就一支结构合理的具备攻坚能力的国际先进水平研究队伍。
5.以研究论文和独立开发的技术成果(专利)的形式公布项目研究成果,五年内SCI论文50篇左右,其中影响因子大于5的学术论文30篇左右,争取在国际高水平刊物(影响因子大于10)上发表论文4-6篇, 在国际顶尖杂志Cell, Nature或Science上发表论文,并申报专利3-5项。
三、研究方案学术思路病原菌的感染性和致病力是病原菌-宿主免疫系统间相互作用的结果。
而胞内病原菌侵入宿主细胞,胞内存活及干扰宿主的免疫信号通路的调控机制极其复杂,提示病原细菌必然通过大量与宿主因子的相互作用来干扰免疫细胞的信号通路,从而侵入细胞并抑制宿主细胞吞噬溶酶体途径、炎症小体的形成、自噬、炎症等过程来实现其在胞内存活。
本项目针对国家战略需求,瞄准国际科学前沿和本领域中的关键科学问题,通过发挥我们已有研究工作基础以及各课题组研究队伍的技术特点和优势,在基因水平、蛋白质水平、细胞水平和整体水平上,综合应用分子生物学、分子遗传学、细胞生物学、生物化学、结构免疫学、以及系统生物学等多学科交叉手段,以重要胞内病原菌土拉杆菌,结核杆菌和鼠疫菌为研究对象,系统地筛选鉴定与病原菌侵入细胞,胞内存活相关的病原菌致病因子和宿主因子,并在分子水平上研究病原菌和宿主的功能非编码RNA和蛋白质的相互作用,病原-宿主之间的蛋白的相互作用,及泛素及类泛素化蛋白修饰等如何调控宿主细胞的免疫信号通路从而影响免疫细胞的功能以调控病原菌进入宿主细胞并在胞内存活,及在感染动物水平和临床感染水平上研究这些病原菌因子与宿主因子的相互作用对病原菌的感染性和致病力的调控作用的分子机制(图一),这些研究将不仅能发现其胞内病原菌与宿主互作中的新的作用机制;而且能为诊断和防治传染性病原菌疾病提供新的药物靶点和重要的理论基础。
技术途径及创新性技术途径本项目在总体目标的架构下分为六个主要的课题方向(见课题设置),各课题方向的主要技术途径总结如下:课题一:1)研究分析一些宿主关键免疫分子对胞内病原菌感染的调控的分子机制利用宿主细胞的一些模式识别受体如TLR2, TLR4, TLR7, TLR9,CARD9, NOD2, NLP3等,及宿主免疫系统中的一些关键受体信号转导分子如SHP-1, SHP-2, IL-17, MKP-5, β-arrestin1, β-arrestin2等基因敲除小鼠分离巨噬细胞来图一:重要病原菌与宿主相互作用分子机制的研究示意图感染土拉杆菌,结核杆菌或鼠疫菌以检测分析其对病原菌侵入及存活信号通路机制的影响;进一步利用基因敲除小鼠感染模型来检测分析其感染病原菌后的存活,细胞因子和免疫细胞亚群数量的变化及功能;选择调控胞内菌致病性的关键受体或分子进一步以细胞转染模型,RNA干扰,抗体封闭,Westernblot,酵母双杂交等手段来检测这些宿主分子如何调控胞内菌侵入和存活的免疫信号通路机制;2)基因组RNAi技术筛选和分析与胞内菌侵入或存活相关的宿主细胞因子用转入GFP或报告基因质粒的胞内菌如土拉杆菌或鼠疫菌感染经过基因组NAi 转染的巨噬细胞,然后在30分钟或6小时后通过荧光扫描,报告基因分析或细菌培养和计数分析侵入巨噬细胞中的胞内菌及在巨噬细胞中存活的胞内菌数量;对筛选到的候选基因通过新一轮的RNAi和胞内菌感染实验进行确定;选择3-6个巨噬细胞表面细胞受体或关键信号转导分子进行重点研究;通过RNAi或基因敲除后研究其胞内菌在侵入和胞内存活的作用机制;用基因敲除小鼠感染模型研究其在土拉杆菌或鼠疫菌感染致病过程的作用机制。
课题二: 1)筛选和分析与土拉杆菌侵入或存活相关的病原菌致病因子以土拉杆菌为模型,采用转座子插入突变方法,构建该菌的随机突变文库。
将土拉杆菌突变株文库中突变株分别感染体外培养巨噬细胞,通过细菌培养和计数筛选出有侵入/存活缺陷突变株;选择与细菌侵入/存活有关的细菌外膜蛋白和主要表面结构成分进行重点研究,利用大肠杆菌表达和纯化蛋白制备特异性抗体,采用免疫共沉淀分离宿主细胞膜上相应的受体蛋白电泳分析纯化后进行质谱分析;采用RNA干扰技术、细胞转染技术及共聚焦显微分析技术确定受体表达对细菌感染的影响。
进一步通过基因mRNA检测、免疫组化染色等确定受体分子在小鼠组织和细胞中的分布;通过检测受体相关细胞信号传递和细胞反应,阐明细菌源配体在土拉杆菌感染治病过程中的作用机制;选择主要的细菌黏附蛋白,结合生物信息分析和预测,合成或表达不同长短的多肽片段确定配体分子中与受体结合的关键区域。
2)土拉杆菌致病相关基因的筛选与研究在巨噬细胞感染模型中,采用包括生物信息学、转录组学,蛋白组学和胞内差异荧光筛选等手段,在土拉杆菌基因组范围内,高通量地分析菌体分泌蛋白在宿主细胞中的诱导表达。
针对在宿主细胞内特异表达的靶蛋白,将对其编码基因采用敲除、互补等遗传分析方法,构建相应的基因工程菌株,并结合质粒转染表达以及Microarray等技术,在相关的细胞模型和动物模型中,进一步鉴定和确认靶蛋白与土拉杆菌的胞内生存是否相关;通过细胞转染技术,在宿主细胞模型中表达土拉杆菌致病相关蛋白。
利用RT²Profiler™PCR Arrays技术,研究病原菌致病相关蛋白对宿主细胞不同信号传导途径的影响,包括细胞因子与炎症反应(cytokine and inflammation)、自体吞噬、SHIP、NF B 以及PI3K-AKT 信号传导等途径。
同时采用ELISA、multiplex FACS、ELISPOT以及Western Blot等手段,验证PCR Arrays的分析结果。
结合崭新的"反转录病毒介导的蛋白互补方法”与酵母双杂交系统,在基因组范围内,筛选与土拉杆菌重要致病相关蛋白作用的宿主细胞蛋白。
进一步用蛋白质标记、免疫沉淀以及相关蛋白质组学等方法,验证土拉杆菌蛋白与宿主细胞蛋白间的特异结合反应,并采用RNA干扰和抗体干扰等技术,阐明宿主细胞蛋白在土拉杆菌感染中的应答及信号路调控机制;利用荧光标记、免疫组化以及细胞实时成像(Realtime Imaging)等技术,研究土拉杆菌在胞内所分泌蛋白的定向运输和分布定位,从“时空”角度分析土拉杆菌致病蛋白与宿主细胞相关蛋白的相互作用,从而了解在宿主细胞内生存的机制。
课题三:1)大规模地发现与结核病相关的病原菌(结核菌)和宿主(小鼠)新的非编码RNA以结杆核菌为模型,用结杆核菌标准株H37Rv感染小鼠,分别提取宿主不同组织(肺,淋巴,脾,肝)总RNA,进行RNA-Seq测序分析非编码RNA的差异表达分析和定量蛋白质组学分析蛋白质的差异表达;从生物体内特异提取非编码RNA,并利用纯化的ncRNA建立非编码RNA的文库;通过高通量、快速的短串RNA测序技术对文库进行测序,发现候选的新的非编码RNA。