现代生物检测技术-第四章 生物芯片检测技术-3蛋白质芯片
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蛋白质芯片的综述摘要蛋白质芯片技术是一种高通量、微型化和自动化的蛋白质分析技术,已在多个领域得到应用,如蛋白质组学研究、新药的开发、酶与底物的相互作用和疾病检测等。
论文详细介绍了蛋白质芯片技术的原理、芯片介质及蛋白质的固定技术,论述了蛋白质芯片在肿瘤研究,食品检验的应用以及传染病检测中的研究概况。
分析了蛋白质芯片的问题以及应用前景。
关键词蛋白质芯片,肿瘤,食品检验,传染病检测,应用蛋白质芯片的研究工作起始于20世纪80年代,到90年代技术日趋成熟。
蛋白质芯片(protein chip)技术因具有高通量平行分析、信噪比较高、所需样品量少,以及可直接关联DNA序列和蛋白质信息等优点,自问世以来,已广泛应用于蛋白质组学、医学诊断学等领域研究,具有广阔的发展。
1.蛋白质芯片介绍1.1 技术原理蛋白质芯片是由固定于不同介质上的蛋白微阵列组成,这些蛋白包括抗原、抗体及标志蛋白,然后用标记的或未经标记的另外一个蛋白,如抗原、抗体或配体进行反应,有的需要经洗涤后再加入标记的二抗进行反应,从而达到放大抗原抗体反应的目的。
所用的标记物有荧光物质,如Cy3(青色素,一种荧光染料)和Cy5等;酶,如辣根过氧化物酶,化学发光物质等;其他分子,如免疫金标记,然后再进行银染对反应结果显色。
反应结果用扫描装置进行检测或用肉眼直接进行观察。
1.2 蛋白质芯片的介质目前作为蛋白芯片的介质有滤膜类、凝胶类和玻璃片类,前2种介质的优点是能够保持所固定的蛋白的三维结构,但缺点是由于其质地较软,所以不能满足机械点样的强度,同时凝胶类的蛋白质芯片所点样品容易发生扩散。
玻璃片的优点是成本低和性能稳定,可满足高强度的机械点样。
此外,20世纪90年代中期发展的液相芯片技术使蛋白芯片技术得到进一步提高。
其被喻为后基因组时代的芯片技术,也可称为灵活的多种被分析物质的检测( flexible multi-analyte profiling,xMAP)技术,xMAP技术是集流式技术、荧光微球、激光、数字信号处理和传统化学技术为一体的一种新型生物分子高通量检测技术,这种技术将流式检测与芯片技术有机地结合在一起,使生物芯片反应体系由固相反应改变为接近生物系统内部环境的完全液相反应体系,因此也被称为液相芯片技术[1]。
蛋白质组学检测方法-概述说明以及解释1.引言1.1 概述蛋白质组学是指研究生物体内所有蛋白质的种类、数量、结构和功能的一门学科,是现代生命科学中重要的研究领域。
蛋白质是生物体中最基本的功能分子之一,参与了几乎所有生命过程,包括细胞信号传导、代谢调节、基因表达调控等。
蛋白质组学的发展与生物学、生物化学、基因组学等学科的深入研究密切相关。
与基因组学关注基因水平的研究不同,蛋白质组学研究的目标是探索蛋白质在细胞和生物体整体层面上的功能及其调控机制。
蛋白质组学研究所得到的信息对于理解生物体的生命活动,揭示疾病的发生机制,以及开发新的诊断和治疗方法具有重要意义。
蛋白质组学检测方法是实现蛋白质组学研究的关键技术。
随着各种高通量技术的不断发展,蛋白质组学检测方法也在不断更新和完善。
目前常用的蛋白质组学检测方法包括质谱分析、蛋白质芯片技术、蛋白质亲和层析等。
这些技术可以对大规模的蛋白质样品进行快速而全面的分析,从而为蛋白质组学研究提供了有力的支持。
然而,蛋白质组学检测方法面临着许多挑战和限制。
样品复杂性、蛋白质之间的差异性以及信号检测的灵敏度等问题都对蛋白质组学检测方法的应用提出了要求。
因此,改进现有方法,提高检测的准确性和灵敏度,开发新的蛋白质组学检测方法成为当前研究的热点。
本文将对蛋白质组学检测方法的分类、原理及其在生命科学研究中的应用前景进行详细探讨。
同时,也将展望蛋白质组学检测方法的发展方向,为进一步推动蛋白质组学研究提供有益的参考和思路。
通过对蛋白质组学检测方法的深入了解,相信我们能够更好地理解蛋白质的功能和调控机制,为生命科学的发展做出更大的贡献。
1.2 文章结构文章结构部分的内容可以包括以下方面:文章的结构是指整篇文章的整体组织框架,它可以帮助读者更好地理解文章的内容和逻辑关系。
为了达到这一目的,本文将按照以下结构进行阐述:1. 引言:本部分主要对文章进行开篇介绍,包括蛋白质组学检测方法的背景和意义,以及本文的目的和重要性。
蛋白组学研究新思路——蛋白芯片技术蛋白芯片是一种用来检测蛋白分子之间相互作用的高通量检测系统。
与传统的基因芯片相比,蛋白芯片是以蛋白质代替核酸作为检测对象,它直接在蛋白质水平上检测表达模式,在基因表达研究中有着更加直接的应用前景。
它的基本原理是将各种蛋白质有序地固定于载玻片等各种介质载体上成为检测芯片,然后,用标记了有特定发光物质的抗体与芯片作用,与芯片上的蛋白质相匹配的抗体将与其对应的蛋白质结合,抗体上的发光物质将指示对应的蛋白质及其表达数量。
在将未与芯片上的蛋白质互补结合的抗体洗去之后利用检测仪测定芯片上各点的光强度,通过光强度分析蛋白质与蛋白之间相互作用的关系,由此达到测定各种基因表达功能的目的。
由于生物细胞中蛋白质的多样性和功能的复杂性,开发和建立具有多功能样品处理能力、能够进行快速分析的高通量蛋白芯片技术将有利于简化和加快蛋白质功能研究的进展。
广义的蛋白芯片产品分为固相和液相两类,目前市场上液相蛋白芯片的产品主要有:BD公司的CBA平台,MEK、R&D和Affymetrix等公司的Luminex xMAP平台,这两个平台的相关信息在本期其他几篇文章中有详细介绍。
固相蛋白芯片产品主要有:R&D的Proteome Profiler 抗体阵列和Mosaic™ ELISA试剂盒,CST的PathScan®抗体芯片。
一.R&D Proteome Profiler TM蛋白芯片Proteome Profiler蛋白芯片作为一种快速、灵敏而又经济的工具,在不需要任何特殊仪器的情况下,能同时检测单个样品中多种蛋白的相对水平。
试剂盒中点在硝酸纤维素膜上或96孔板上的所有捕获抗体均经过精心选择,具有高度特异性。
R&D公司的蛋白芯片能广泛地应用于信号转导、血管再生、细胞凋亡、肿瘤、肥胖、以及干细胞、药物筛选等的研究。
Proteome Profiler TM 蛋白芯片的特点:适用范围广——可用于细胞上清、细胞溶解产物、血清、血浆等样本省时省力——避免重复进行多次免疫沉淀或Western Blot实验,6小时内完成多指标检测高通量——在单一样本中可同时检测最多达119种待测物高灵敏度——比Western Blot灵敏度高20倍简便——不需要任何特殊的仪器,使用化学发光检测其检测原理是:将高度特异的捕获抗体点样在NC膜或96孔板上,形成抗体芯片阵列。
蛋白质芯片是一种高通量的蛋白功能分析技术,可用于蛋白质表达谱分析,研究蛋白质与蛋白质的相互作用,甚至DNA-蛋白质、RNA-蛋白质的相互作用,筛选药物作用的蛋白靶点等。
编辑本段原理蛋白芯片技术的研究对象是蛋白质,其原理是对固相载体进行特殊的化学处理,再将已知的蛋白分子产物固定其上(如酶、抗原、抗体、受体、配体、细胞因子等),根据这些生物分子的特性,捕获能与之特异性结合的待测蛋白(存在于血清、血浆、淋巴、间质液、尿液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等),经洗涤、纯化,再进行确认和生化分析;它为获得重要生命信息(如未知蛋白组分、序列。
体内表达水平生物学功能、与其他分子的相互调控关系、药物筛选、药物靶位的选择等)提供有力的技术支持。
固体芯片的构建常用的材质有玻片、硅、云母及各种膜片等。
理想的裁体表面是渗透滤膜(如硝酸纤维素膜)或包被了不同试剂(如多聚赖氨酸)的载玻片。
外形可制成各种不同的形状。
Lin,SR等人引采用APTS-BS3技术增强芯片与蛋白质的牢固结合。
探针的制备低密度蛋白质芯片的探针包括特定的抗原、抗体、酶、吸水或疏水物质、结合某些阳离子或阴离子的化学集团、受体和免疫复合物等具有生物活性的蛋白质。
制备时常常采用直接点样法,以避免蛋白质的空间结构改变。
保持它和样品的特异性结合能力。
高密度蛋白质芯片一般为基因表达产物,如一个cDNA文库所产生的几乎所有蛋白质均排:列在一个载体表面,其芯池数目高达1600个/cm2,呈微距阵排列,点样时须用机械手进行,可同时检测数千个样品。
生物分子反应使用时将待检的含有蛋白质的标本如尿液、血清、精液、组织提取物等,按一定程序做好层析、电泳、色谱等前处理,然后在每个芯池里点入需要的种类。
一般样品量只要2-10μL即可。
根据测定目的不同可选用不同探针结合或与其中含有的生物制剂相互作用一段时间,然后洗去未结合的或多余的物质,将样品固定一下等待检测即可。
信号的检测及分析直接检测模式是将待测蛋白用荧光素或同位素标记,结合到芯片的蛋白质就会发出特定的信号,检测时用特殊的芯片扫描仪扫描和相应的计算机软件进行数据分析,或将芯片放射显影后再选用相应的软件进行数据分析。
《分子诊断学》课程教学大纲课程名称:分子诊断学(Molecular Diagnose)主讲教师:杨晶(教授),申鹤云(副教授)课程编号:学时:24学分:1.5预修课程:生物化学、细胞生物学、微生物学课程简介:分子诊断学是建立在分子生物学和免疫学基础上的医学诊断技术,在充分借鉴现代基因组学与蛋白质组学的研究成果基础上,通过建立各种适用的检测技术将疾病相关基因、蛋白与临床诊断紧密结合,为疾病预防,疾病预警和疗效评价服务,其核心是基因诊断和以单抗为基础的免疫学诊断。
分子诊断技术以其显著优势和巨大潜力,成为保障人类健康的最重要的生物技术之一。
本课程主要介绍分子诊断的常用技术及在科研和临床上的应用,包括ELISA 技术、免疫胶体金层析技术、化学发光技术、时间分辨技术、分子杂交技术、荧光定量PCR技术以及各种芯片技术等,掌握临床常见感染性疾病、单基因疾病和多基因疾病分子诊断策略和方法。
教材:临床分子诊断学郑芳陈昌杰华中科技大学出版社2014.7第一章绪论(2 学时)shen一、主要内容:(一) 分子诊断学的定义及其研究范畴(二) 分子诊断学的发展简史(三) 分子诊断学在医学中的应用二、学习重点和难点:重点:掌握分子诊断学的定义,了解分子诊断学经历了 3 个阶段的发展历史。
难点:一些新型分子诊断技术在医学中的应用。
第二章免疫学诊断技术(6 学时)shen一、主要内容:(一) 抗原抗体反应(二) 免疫浊度测定(三) 放射免疫分析技术(四) 酶免疫分析技术(五) 荧光抗体分析技术(六) 时间分辨免疫荧光技术(七) 荧光偏振免疫分析技术(八) 化学发光免疫分析技术(九) 金标免疫分析技术(十) 标记免疫分析的质量控制二、学习重点和难点:重点:放射免疫分析、酶免疫分析技术、荧光抗体分析技术和免疫浊度检测等技术原理,各种反应模式的原理及应用。
难点:一些新型示踪物的示踪原理(要求一定的物理学和化学知识)。
第三章分子生物学诊断技术(基因诊断技术)(6 学时)一、主要内容:(一)PCR 及衍生技术 1. PCR 技术的基本原理 2. PCR 衍生技术 3. 荧光定量PCR 技术 4. PCR 方法的标准化(二)核酸分子杂交技术 1. 核酸杂交的基本原理 2. 核酸探针 3. 核酸分子杂交技术二、学习重点和难点:重点:FQ-PCR、原位PCR、PCR-RFLP、PCR-ELISA、PCR-SSCP、Southern blot、 Northern blot、原位杂交等技术的原理及其在临床检测中的实际应用。
蛋白质芯片技术的原理和应用1. 蛋白质芯片技术的原理蛋白质芯片技术是一种高通量、高效率的生物分析技术,它通过在玻璃片或硅片上固定大量的蛋白质,实现对生物分子的快速检测和分析。
蛋白质芯片技术的原理主要包括以下几个方面:1.1 蛋白质的固定蛋白质芯片技术首先需要将目标蛋白质固定在芯片表面。
常用的固定方法包括化学交联、亲和吸附等。
化学交联是利用化学交联剂将蛋白质固定在芯片表面,亲和吸附则是利用蛋白质与芯片表面之间的亲和力将蛋白质吸附在芯片上。
1.2 样品的处理在蛋白质芯片技术中,需要将待测样品与固定在芯片上的蛋白质进行反应。
样品可以是血清、细胞裂解液等生物样品,也可以是化合物溶液等。
1.3 蛋白质的检测蛋白质芯片技术通过适当的检测方法,如荧光标记、化学标记等,来检测样品中与芯片上固定蛋白质的相互作用。
常见的检测方法包括荧光染料法、质谱法等。
2. 蛋白质芯片技术的应用蛋白质芯片技术具有许多重要的应用,以下列举了其中几个主要应用:2.1 蛋白质相互作用的研究蛋白质芯片技术可以用于研究蛋白质与其他生物分子之间的相互作用。
通过固定不同的蛋白质在芯片上,可以快速地筛选出与其相互作用的分子。
这对于研究蛋白质的功能及其调控机制非常重要。
2.2 药物筛选蛋白质芯片技术在药物筛选领域起到了重要的作用。
通过将小分子化合物与芯片上的蛋白质进行相互作用,可以快速筛选出具有药物活性的化合物。
这极大地加速了新药开发的进程。
2.3 临床诊断蛋白质芯片技术在临床诊断中也有广泛的应用。
通过检测血清中的蛋白质芯片,可以快速、敏感地检测出多种疾病标志物,如肿瘤标志物、心脏病标志物等。
这对于早期诊断和个体化治疗非常有价值。
2.4 基因组学研究蛋白质芯片技术在基因组学研究中也有广泛的应用。
通过检测不同基因的表达产物与蛋白质芯片的相互作用,可以揭示基因与蛋白质之间的关系,进而深入研究基因功能和调控机制。
3. 总结蛋白质芯片技术作为一种高通量、高效率的生物分析技术,已经在许多领域展现了巨大的应用潜力。
分子生物学常用检测技术分子生物学是一门研究生物体内分子互动和功能的科学,其研究领域涵盖了基因组学、蛋白质组学、转录组学、代谢组学等。
这些领域的研究需要借助各种检测技术来实现,以下是几种常用的分子生物学检测技术。
1、基因测序技术:基因测序技术是测定DNA序列的技术,它可以直接读出基因序列,是分子生物学研究的重要工具。
基因测序技术可用于基因组学研究,解析物种的基因组结构和功能,也可以用于疾病的诊断和治疗。
2、聚合酶链式反应(PCR):PCR是一种用于快速、灵敏地扩增特定DNA片段的分子生物学技术。
通过PCR,我们可以将微量的DNA片段进行数百万倍的扩增,从而可以进行后续的分析和检测。
PCR技术广泛应用于基因克隆、突变分析、疾病诊断等领域。
3、生物芯片技术:生物芯片是一种高密度DNA阵列技术,可以同时对大量基因进行检测和分析。
生物芯片技术可用于基因表达谱分析、基因多态性研究、疾病预测和诊断等。
4、质谱技术:质谱技术是一种用于分析生物样品中分子质量和组成的技术。
通过质谱技术,我们可以对蛋白质、多糖、脂质等生物分子进行定性和定量分析。
质谱技术广泛应用于蛋白质组学研究、药物发现、疾病诊断等领域。
5、细胞荧光染色技术:细胞荧光染色技术是一种用于观察细胞内生物分子活性的技术。
通过荧光染料对目标分子进行标记,我们可以在显微镜下观察到细胞内分子的分布和活性。
细胞荧光染色技术广泛应用于细胞信号转导、药物筛选等领域。
以上仅是分子生物学领域中的几种常用检测技术,实际上还有许多其他的实验技术和方法如核磁共振技术、双向电泳、免疫沉淀等等,这些技术的发明和发展都为分子生物学的研究提供了强有力的支持。
各种技术的选择和使用主要取决于研究目的和研究样本的类型。
随着科学技术的发展,未来的分子生物学检测技术将更加灵敏、高效和个性化。
分子生物学常用技术及其应用分子生物学是一门研究生物大分子结构和功能的科学,包括DNA、RNA 和蛋白质等。
生物芯片技术第一篇:生物芯片技术的概述生物芯片技术是一种基于微电子技术和生物技术的交叉学科,它集成了传感器、电路、计算机、生物分子等多种元件技术,用于快速、高通量、高灵敏度地检测和分析生物分子信息,广泛应用于疾病诊断、药物研发、基因工程、环境保护等领域。
生物芯片技术最早起源于20世纪70年代,当时研究人员利用硅芯片上的微通道和微阀门实现了血液分离和药物筛选等功能。
随着生物科学、计算机科学和材料科学等领域不断发展,生物芯片技术得到了快速发展和广泛应用。
目前,生物芯片已经成为生命科学和医学领域中最热门的技术之一。
生物芯片技术可以分为两种类型:基于DNA芯片和蛋白质芯片。
基于DNA芯片主要用于检测DNA的序列信息,它可以实现基因诊断、基因表达和SNP分型等功能;而基于蛋白质芯片主要用于检测蛋白质的结构和功能,它可以实现蛋白质诊断、药物筛选和蛋白质相互作用等功能。
此外,生物芯片技术还可以结合其他技术,如质谱、光学、电化学等技术,形成多元化的芯片技术体系。
生物芯片技术与传统的诊断方法相比,具有许多优点。
它可以实现高通量、高灵敏度、快速、可重复、自动化等特点,同时可以减少样品量和时间成本,大大提高疾病的早期诊断和药物研发效率,为人类健康事业做出巨大贡献。
生物芯片技术作为一种新兴的生物诊断技术,在未来将得到更广泛的应用和发展。
同时,生物芯片技术的发展还需要不断地跨学科合作和资源整合,为其实现在临床应用、生物科学等方向上的更大突破提供持续的动力和保障。
第二篇:生物芯片技术在疾病诊断中的应用生物芯片技术在疾病诊断中具有重要的应用价值。
尤其是在肿瘤、传染病和心血管疾病的早期诊断方面,生物芯片技术的应用前景更为广阔。
在肿瘤的早期诊断方面,生物芯片技术可以通过检测体液中肿瘤标志物的变化来实现。
具体来说,生物芯片可以将体液中的微量标志物快速、高通量地筛选和捕捉,准确、高灵敏度地检测它们的变化情况。
基于基因表达、DNA-蛋白质组学等技术平台,生物芯片技术能够将细胞因子、肿瘤标志物、DNA和RNA等分子信息分析整合起来,实现肿瘤的早期诊断和治疗,为肿瘤治疗的个体化和精准化提供了一种新的技术手段。
生物芯片检测技术检测目的采用荧光、生物素或其它方法标记固定在生物芯片基片上的生物分子(如DNA、RNA、蛋白分子、抗原、抗体等)目标,并通过构建一些特殊的检测装置将标记信号转化成可供分析处理的图象数据,以便获得及分析在生物芯片上的生物分子的生物物理化学等各种信息,诊断生物分子的真实状态。
将不可见的生物分子微弱变化通过生物、化学、光学、电子等多学科交叉技术的综合处理,转换成可见的数字图象信号,实现信号的放大、增强和可视化,以便进行研究、疾病诊断分析或其它应用。
样品制备芯片设计芯片制备杂交反应信号检测数据提取与分析生物信息学分析荧光标记检测表面等离子体共振化学发光检测电化学检测磷屏成像系统生物芯片的检测方法两大类型:物理检测方法、化学检测方法1. 荧光扫描显微检测方法2.激光共焦扫描检测方法D(Charge Coupled Device)成像扫描检测方法4.化学发光检测方法5.电化学发光检测方法6.表面等离子体共振吸收检测方法8.磁光检测方法9.纳米技术生物芯片信号检测技术●荧光检测化学发光检测表面等离子体共振检测纳米检测磁光检测光学信号电学信号质量信号●电化学检测光电化学检测●石英晶体微天平检测电信号检测优势仪器结构简单、成本低容易微型化,便于携带响应快速、灵敏功耗低、便于现场使用芯片与仪器连接方便电化学和光电化学检测技术激光共聚焦、CCD扫描技术液态芯片检测技术生物芯片的电化学、光电化学检测技术Xanthon 公司的药物筛选系统Scribner 公司的MMA 多通道分析仪一、电化学检测系统✓电位型✓电导型✓电流型Ro-e +eMotorola 公司的eSensor 芯片问题:灵敏度(信噪比)不够高原因:电极-溶液界面电容充放电导致背景电流过大化学放大电化学检测光电化学检测SN电化学检测的原理电极上电子能量---外加电压决定分子中电子能量---分子结构决定化学放大电化学检测原理电信号产生:标记物(还原态)---→标记物(氧化态)+ e 标记物再生:标记物(氧化态)+ 放大物(还愿态)---→标记物(还原态)+ 放大物氧化产物背景电流:放大物(还原态)---→氧化产物e电极溶液相标记物(氧化态)标记物(还原态)放大物(还原态)放大物(氧化态)特点:标记物分子多次参加电极反应,信号成倍放大;输入输出均为电信号。