第六章核酸的化学
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一、填空题1.核酸的基本结构单位是。
2.20世纪50年代,Chargaff等人发现各种生物体DNA碱基组成有的特异性,而没有的特异性3.DNA双螺旋中只存在种不同碱基对。
T总是与配对,C总是与配对。
4.核酸的主要组成是,和。
5.两类核酸在细胞中的分布不同,DNA主要位于中,RNA主要位于中。
6.核酸分子中的糖苷键均为型糖苷键。
糖环与碱基之间的连键为键。
核苷与核苷之间通过键连接形成多聚体。
7.嘌呤核苷有顺式,反式二种可能,但天然核苷多为。
8.X射线衍射证明,核苷中与平面相互垂直。
9.核酸在260nm附近有强吸收,这是由于。
10.给动物食用3H标记的,可使DNA带有放射性,而RNA不带放射性。
11.双链DNA中若含量多,则T m值高。
12.双链DNA热变性后,或在pH2以下,或pH12以下时,其OD260,同样条件下,单链DNA的OD260。
13.DNA样品的均一性愈高,其熔解过程的温度范围愈。
14.DNA所处介质的离子强度越低,其熔解过程的温度范围越,溶解温度越,所以DNA应保存在较浓度的盐溶液中,通常为mol/L的NaCl溶液。
15.DNA分子中存在于三类核苷酸序列:高度重复序列、中度重复序列和单一序列。
tRNA,rRNA以及组蛋白等由编码,而大多数蛋白质由编码。
16.硝酸纤维素膜可结合链核酸。
将RNA变性后转移到硝酸纤维素膜上再进行杂交,称印迹法。
17.变性DNA的复性与许多因素有关,包括,,,,等。
18.DNA复性过程符合二级反应动力学,其Cot1/2值与DNA的复杂程度成比。
19.双链DNA螺距为3.4nm,每匝螺旋的碱基数为10,这是型DNA的结构。
20.RNA分子的双螺旋区以及RNA-DNA杂交双链具有与型DNA相似的结构,外形较为。
21.NAD+,FAD和CoA都是的衍生物。
22.维持DNA双螺旋结构稳定的主要因素是,其次,大量存在于DNA分子中的弱作用力如,和也起一定作用。
23.tRNA的三级结构为形,其一端为,另一端为。
生物化学核酸讲解核酸是遗传物质1868年瑞士Miesher.从脓细胞的细胞核中分离出可溶于碱而不溶于稀酸的酸性物质。
间接证据:同一种生物的不同种类的不同生长期的细胞,DNA含量基本恒定。
直接证据:T2噬菌体DNA感染E.coli用35S标记噬菌体蛋白质,感染E.coli,又用32P标记噬菌体核酸,感染E.coliDNA、RNA的分布(DNA在核内,RNA在核外)。
第一节核酸的化学组成核酸是一种线形多聚核苷酸,基本组成单位是核苷酸。
结构层次:核酸核苷酸组成核酸的戊糖有两种::D-核糖和D-2-脱氧核糖,据此,可以将核酸分为两种:核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)P330 表5-1 两类核酸的基本化学组成一、碱基1. 嘌呤碱:腺嘌呤鸟嘌呤2. 嘧啶碱:胞嘧啶尿嘧啶胸腺嘧啶P331 结构式3. 修饰碱基植物中有大量5-甲基胞嘧啶。
E.coli噬菌体中,5-羟甲基胞嘧啶代替C。
稀有碱基:100余种,多数是甲基化的产物。
DNA由A、G、C、T碱基构成。
RNA由A、G、C、U碱基构成。
二、核苷核苷由戊糖和碱基缩合而成,糖环上C1与嘧啶碱的N1或与嘌呤碱的N9连接。
核酸中的核苷均为β-型核苷P332 结构式腺嘌呤核苷胞嘧啶脱氧核苷DNA 的戊糖是:脱氧核糖RNA 的戊糖是:核糖三、核苷酸核苷中戊糖C3、C5羟基被磷酸酯化,生成核苷酸。
1、构成DNA、RNA的核苷酸P333表5-32、细胞内游离核苷酸及其衍生物①核苷5’-多磷酸化合物A TP、GTP、CTP、ppppA、ppppG在能量代谢和物质代谢及调控中起重要作用。
②环核苷酸cAMP(3’,5’-cAMP)cGMP(3’,5’-cGMP)它们作为质膜的激素的第二信使起作用,cAMP调节细胞的糖代谢、脂代谢。
③核苷5’多磷酸3’多磷酸化合物ppGpp pppGpp ppApp④核苷酸衍生物HSCoA、NAD+、NADP+、FAD等辅助因子。
GDP-半乳糖、GDP-葡萄糖等是糖蛋白生物合成的活性糖基供体。
一、粘度大分子溶液比普通溶液粘度大,线形大分子又比球形大分子粘度大。
DNA是线形大分子,人类二倍体DNA总量3.3×109bp,全长可达1.75米,DNA分子平均长度在4cm以上,而双螺旋直径只有2nm,长度与直径之比高达107。
因此,DNA粘度极高,也极易在机械力作用下折断。
双链DNA解链成为单链DNA时,由较伸展的双螺旋变成较紧凑的线团结构,粘度明显下降。
RNA因为分子量小,且呈线团结构,所以其粘度低得多。
二、密度利用密度梯度离心可以测定大分子的浮力密度。
CsCl溶解度大,可制成8M 溶液。
DNA的浮力密度一般在1.7以上,RNA为1.6,蛋白质为1.35-1.40。
分子量相同结构不同的DNA沉降系数不同,线形双螺旋DNA、线形单链DNA、超螺旋DNA沉降系数之比为1:1.14:1.4。
因此通过测定沉降系数可以了解DNA的结构及其变化。
三、紫外吸收嘌呤和嘧啶因其共轭体系而有强紫外吸收。
核酸在260nm有紫外吸收峰,蛋白质在280nm。
利用紫外吸收可测定核酸的浓度和纯度。
一般测定OD260/OD280,DNA=1.8,RNA=2.0。
如果含有蛋白质杂质,比值明显下降。
不纯的核酸不能用紫外吸收法测定浓度。
紫外吸收改变是DNA结构变化的标志,当双链DNA解链时碱基外露增加,紫外吸收明显增加,称为增色效应。
双链、单链DNA与核苷酸的紫外吸收之比是1:1.37:1.6。
四、DNA的变性在一定条件下,双链DNA解链变成单链DNA的现象称为变性或熔化。
加热引起的变性称为热变性;碱性条件(pH>11.3)下,DNA发生碱变性。
此外,尿素、有机溶剂、甚至脱盐都可引起DNA变性。
除去变性因素后,互补的单链DNA 又可以重新结合为双链DNA,称为复性或退火。
DNA复性由局部序列配对形成双链核心的慢速成核反应开始,然后经过快速的所谓拉链反应而完成。
DNA变性后粘度降低,密度和吸光度升高。
变性后的单链DNA与具有同一性序列的DNA链或RNA分子结合形成双链的DNA-DNA或DNA-RNA杂交分子的过程称为杂交或分子杂交。
第一章 核酸的结构与功能1、种类:脱氧核糖核酸(DNA),存在于细胞核和线粒体内。
核糖核酸(RNA),存在于细胞质和细胞核内。
2、核酸的分子组成:基本组成单位是核苷酸,而核苷酸则由碱基、戊糖和磷酸三种成分连接而成。
戊糖:DNA分子的核苷酸的糖是β-D-2-脱氧核糖,RNA中为β-D-核糖。
3、核酸的一级结构核苷酸在多肽链上的排列顺序为核酸的一级结构,4、 DNA的二级结构DNA双螺旋结构是核酸的二级结构。
双螺旋的骨架由糖和磷酸基构成,两股链之间的碱基互补配对,是遗传信息传递者,DNA半保留复制的基础,结构要点: a.DNA是一反向平行的互补双链结构亲水的脱氧核糖基和磷酸基骨架位于双链的外侧,而碱基位于内侧,碱基之间以氢键相结合,其中,腺嘌呤始终与胸腺嘧啶配对,形成两个氢键,鸟嘌呤始终与胞嘧啶配对,形成三个氢键。
b.DNA是右手螺旋结构螺旋直径为2nm。
每旋转一周包含了10个碱基,每个碱基的旋转角度为36度。
螺距为3.4nm,每个碱基平面之间的距离为0.34nm。
c.DNA双螺旋结构稳定的维系横向靠互补碱基的氢键维系,纵向则靠碱基平面间的疏水性堆积力维持,尤以后者为重要。
5、RNA的空间结构与功能mRNA:1. 真核生物mRNA的5'-端有特殊帽结构2. 真核生物mRNA的3'-末端有多聚腺苷酸尾3. mRNA碱基序列决定蛋白质的氨基酸序列tRNA:1、3′末端为—CCA-OH 2、含10~20% 稀有碱基3、其二级结构呈“三叶草形”4. tRNA的反密码子能够识别mRNA密码子rRNA:rRNA的结构为花状,rRNA 与核糖体蛋白结合组成核糖体(ribosome),为蛋白质的合成提供场所。
rRNA单独存在不执行其功能。
tRNA功能是在细胞蛋白质合成过程中作为各种氨基酸的戴本并将其转呈给mRNA。
6、核酸的理化性质在某些理化因素作用下,如加热,DNA分子互补碱基对之间的氢键断裂,使DNA双螺旋结构松散,变成单链,即为变性。
核苷(nucleoside):是嘌呤或嘧啶碱通过共价键与戊糖连接组成的化合物。
核糖与碱基一般都是由糖的异头碳与嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之间形成的β-N-糖键连接。
核苷酸:核苷的戊糖成分中的羟基磷酸化形成的化合物。
cAMP(cycle AMP):3ˊ,5ˊ-环腺苷酸,是细胞内的第二信使,由于某部些激素或其它分子信号刺激激活腺苷酸环化酶催化ATP环化形成的。
磷酸二脂键:一种化学基团,指一分子磷酸与两个醇(羟基)酯化形成的两个酯键。
该酯键成了两个醇之间的桥梁。
例如一个核苷的3ˊ羟基与别一个核苷的5ˊ羟基与同一分子磷酸酯化,就形成了一个磷酸二脂键。
脱氧核糖核酸(DNA):含有特殊脱氧核糖核苷酸序列的聚脱氧核苷酸,脱氧核苷酸之间是是通过3ˊ,5ˊ-磷酸二脂键连接的。
DNA是遗传信息的载体。
核糖核酸(RNA):通过3ˊ,5ˊ-磷酸二脂键连接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。
核糖体核糖核酸:作为组成成分的一类RNA,rRNA是细胞内最丰富的RNA .信使核糖核酸:一类用作蛋白质合成模板的RNA .转移核糖核酸:一类携带激活氨基酸,将它带到蛋白质合成部位并将氨基酸整合到生长着的肽链上RNA。
TRNA含有能识别模板mRNA上互补密码的反密码。
转化(作用)(transformation):一个外源DNA 通过某种途径导入一个宿主菌,引起该菌的遗传特性改变的作用。
转导(作用)(transduction):借助于病毒载体,遗传信息从一个细胞转移到另一个细胞。
碱基对(base pair):通过碱基之间氢键配对的核酸链中的两个核苷酸,例如A与T或U , 以及G与C配对。
夏格夫法则:所有DNA中腺嘌呤与胸腺嘧啶的摩尔含量相等(A=T),鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔含量相等(G=C),既嘌呤的总含量相等(A+G=T+C)。
DNA的碱基组成具有种的特异性,但没有组织和器官的特异性。
另外,生长和发育阶段`营养状态和环境的改变都不影响DNA的碱基组成。
第二章糖类1、判断对错,如果认为错误,请说明原因。
(1)所有单糖都具有旋光性。
答:错。
二羟酮糖没有手性中心。
(2)凡具有旋光性的物质一定具有变旋性,而具有变旋性的物质也一定具有旋光性。
答:凡具有旋光性的物质一定具有变旋性:错。
手性碳原子的构型在溶液中发生了改变。
大多数的具有旋光性的物质的溶液不会发生变旋现象。
具有变旋性的物质也一定具有旋光性:对。
(3)所有的单糖和寡糖都是还原糖。
答:错。
有些寡糖的两个半缩醛羟基同时脱水缩合成苷。
如:果糖。
(4)自然界中存在的单糖主要为D-型。
答:对。
(5)如果用化学法测出某种来源的支链淀粉有57个非还原端,则这种分子有56个分支。
答:对。
2、略3、乳糖是葡萄糖苷还是半乳糖苷,是α-苷还是β-苷?蔗糖是什么糖苷,是α-苷还是β-苷?两分子的D-吡喃葡萄糖可以形成多少种不同的二糖?答:乳糖的结构是4-O-(β-D-吡喃半乳糖基)D-吡喃葡萄糖[β-1,4]或者半乳糖β(1→4)葡萄糖苷,为β-D-吡喃半乳糖基的半缩醛羟基形成的苷因此是β-苷。
蔗糖的结构是葡萄糖α(1→2)果糖苷或者果糖β(2→1)葡萄糖,是α-D-葡萄糖的半缩醛的羟基和β- D -果糖的半缩醛的羟基缩合形成的苷,因此既是α苷又是β苷。
两分子的D-吡喃葡萄糖可以形成19种不同的二糖。
4种连接方式α→α,α→β,β→α,β→β,每个5种,共20种-1种(α→β,β→α的1位相连)=19。
4、某种α-D-甘露糖和β-D-甘露糖平衡混合物的[α]25 D为+ 14.5°,求该平衡混合物中α-D-甘露糖和β-D-甘露糖的比率(纯α-D-甘露糖的[α]25D为+ 29.3°,纯β-D-甘露糖的[α]25 D为-16.3°);解:设α-D-甘露糖的含量为x,则29.3x- 16.3(1-x)= 14.5X=67.5%该平衡混合物中α-D-甘露糖和β-D-甘露糖的比率:67.5/32.5=2.085、略6、水解仅含D-葡萄糖和D-甘露糖的一种多糖30g,将水解液稀释至平衡100mL。
一、填空题1.核酸的基本结构单位是。
2.20世纪50年代,Chargaff等人发现各种生物体DNA 碱基组成有的特异性,而没有的特异性3.DNA双螺旋中只存在种不同碱基对。
T总是与配对,C总是与配对。
4.核酸的主要组成是,和。
5.两类核酸在细胞中的分布不同,DNA主要位于中,RNA主要位于中。
6.核酸分子中的糖苷键均为型糖苷键。
糖环与碱基之间的连键为键。
核苷与核苷之间通过键连接形成多聚体。
7.嘌呤核苷有顺式,反式二种可能,但天然核苷多为。
8.X射线衍射证明,核苷中与平面相互垂直。
9.核酸在260nm附近有强吸收,这是由于。
10.给动物食用3H标记的,可使DNA带有放射性,而RNA不带放射性。
11.双链DNA中若含量多,则T m值高。
12.双链DNA热变性后,或在pH2以下,或pH12以下时,其OD260,同样条件下,单链DNA的OD260。
13.DNA样品的均一性愈高,其熔解过程的温度范围愈。
14.DNA所处介质的离子强度越低,其熔解过程的温度范围越,溶解温度越,所以DNA应保存在较浓度的盐溶液中,通常为mol/L 的NaCl溶液。
15.DNA分子中存在于三类核苷酸序列:高度重复序列、中度重复序列和单一序列。
tRNA,rRNA以及组蛋白等由编码,而大多数蛋白质由编码。
16.硝酸纤维素膜可结合链核酸。
将RNA变性后转移到硝酸纤维素膜上再进行杂交,称印迹法。
17.变性DNA的复性与许多因素有关,包括,,,,等。
18.DNA复性过程符合二级反应动力学,其Cot1/2值与DNA的复杂程度成比。
19.双链DNA螺距为3.4nm,每匝螺旋的碱基数为10,这是型DNA的结构。
20.RNA分子的双螺旋区以及RNA-DNA杂交双链具有与型DNA相似的结构,外形较为。
21.NAD+,FAD和CoA都是的衍生物。
22.维持DNA双螺旋结构稳定的主要因素是,其次,大量存在于DNA分子中的弱作用力如,和也起一定作用。
23.tRNA的三级结构为形,其一端为,另一端为。
第一章绪论1.生物化学:是生命的化学,是研究生物体的化学组成和生命过程中的化学变化规律的一门科学,它是从分子水平来研究生物体内基本物质的化学组成、结构与生物学功能,阐明生物物质在生命活动变化中的化学变化规律及复杂生命现象本质的一门学科。
2.新陈代谢:生物体不断与外环境进行有规律的物质交换。
是通过消化、吸收、中间代谢和排泄四个阶段来完成的。
3.分子生物学:是现代生物学的带头学科,它主要研究遗传的分子基础,生物大分子的结构与与功能和生物大分子的人工设计与合成,以及生物膜的结构与功能等。
第二章糖的化学4.糖类:多羟基醛或多羟基酮及其聚合物和衍生物的总称。
5.单糖:凡不能被水解成更小分子的糖称为单糖。
是糖类中最简单的一种,是组成糖类物质的基本结构单位。
6.寡糖:是由单糖缩合而成的短链结构,一般含2~6个单糖分子。
7.多糖:由许多单糖分子缩合而成的长链结构,分子量都很大,均无甜味,也无还原性。
8.粘(黏)多糖:粘多糖是一类含氮的不均一多糖,其化学组成通常为糖醛酸和氨基已糖或其衍生物,有的含有硫酸。
如透明质酸,硫酸软骨素,肝素等。
(07年药综二真题)9.结合糖:是指糖和蛋白质、脂质等非糖物质结合的复合分子。
10.糖脂:糖和脂类以共价键结合成的复合物,组成和总体性质以脂为主,糖类通过其还原末端的糖苷键与脂连接。
11. 糖蛋白:是糖与蛋白质以共价键结合的复合分子,其中糖的含量一般小于蛋白质,糖和蛋白质结合的方式有O连接和N连接。
12.脂多糖:是糖与脂类结合形成的复合物,以糖为主体成分,革兰氏阴性菌细胞壁内的脂多糖一般由外低聚糖链、核心多糖及脂质三部分组成。
13.糖苷键:一个糖半缩醛羟基与另一个分子的羟基、氨基或巯基之间缩合形成的缩醛或缩酮键,常见的糖苷键有O-糖苷键和N-糖苷键。
14.Smith降解:将过碘酸氧化产物进行还原,进行酸水解或部分酸水解。
15.糖基化工程:是在深入研究糖蛋白中糖链结构与功能关系的基础上,通过人为的改变(包括增加,删除)调整糖蛋白的表面的糖链而达到改变糖蛋白的生物学功能的目的。
7-3 核酸的物理化学性质上册P502一一一核酸的水解:所有糖苷键和磷酸酯键都能被水解。
一1一酸水解:糖苷键比磷酸二酯键易被水解,嘌呤碱糖苷键比嘧啶碱更易水解。
一2一碱水解:磷酸酯键易水解,RNA比DNA易水解,因为RNA核糖上有2‘-OH,水解过程见P502。
一3一酶水解:为水解磷酸二酯键的酶,专一水解核酸的为核酸酶。
1.核酸酶的分类:按底物专一性分为RNase(核糖核酸酶)和DNase(脱氧核糖核酸酶)。
按对底物作用方式分为内切酶(作用点在核糖核酸酶内部)和外切酶(作用点在末端)。
2.RNase:如牛胰核糖核酸酶(EC 2.7.7.16),内切酶,作用位点为嘧啶核苷(Py)-3‘-磷酸与其他核苷酸之间的连键。
3.限制性内切酶:为DNase。
剪裁DNA的工具,可用于核酸测序和基因工程。
在细菌中发现,目前已找到限制性内切酶数千种。
限制性内切酶往往与甲基化酶成对存在,自身酶作用位点的碱基被甲基化,内切酶不再降解,因而可识别和降解外源DNA。
断裂位点处常有二重旋转(轴)对称性(回文结构,正读反读相同),在特定位点两条链切断后形成粘末端或平末端。
限制性内切酶命名:如E. coRⅠ,第1个字母E(大写),为大肠杆菌(E.coli)属名的第一个字母,第2、3两个字母co(小写)为种名头两个字母,第4个字母R,表示菌株,最后一个罗马字为该细菌中已分离这一类酶的编号。
一一一核酸的酸碱性质:核苷和核苷酸都是兼性离子,碱基和磷酸基均能解离,见P505,具有酸碱性。
由于DNA酸碱变性,使酸碱滴定曲线不可逆。
一一一核酸的紫外吸收:嘌呤环与嘧啶环具有共轭双键,核苷和核酸的吸收波段在240~290nm,最大吸收值在260nm附近(蛋白质最大吸收值280nm)。
一1一可用于测样品纯度(测吸光度A):A260/A280比值,纯DNA应大于1.8,纯RNA应达到2.0,若样品混有杂蛋白,比值明显降低。
对于纯样品,从260nm的A值即可算出含量。