materials studio操作手册
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计算机材料设计materialsstudio教程1. 介绍材料科学与工程是一门跨学科领域,涉及到物理、化学、工程等多个学科的知识。
在材料研究中,计算机模拟和设计已经成为一种常见的方法。
材料Studio是一款用于材料设计和模拟的软件,广泛应用于材料科学领域。
本教程将介绍材料Studio的基本使用方法,以及在材料设计方面的应用。
2. 安装和启动在开始使用材料Studio之前,首先需要进行软件的安装。
可以通过官方全球信息湾下载安装包,根据指示进行安装。
安装完成后,双击图标启动软件。
3. 界面介绍材料Studio的界面分为多个模块,如建模模块、分子动力学模块等。
用户可以根据需要选择不同的模块进行操作。
在界面的顶部是菜单栏和工具栏,通过菜单栏可以打开新的文件、保存文件、进行模拟等操作。
在界面的中部是主要的视图区域,用户可以在这里进行模拟的展示和操作。
在界面的底部是状态栏,显示了当前软件的状态信息。
4. 材料建模材料Studio提供了丰富的建模功能,用户可以通过拖拽、旋转等操作来建立各种不同的材料模型。
在建模过程中,可以选择不同的原子结构、周期表元素等,还可以进行原子的排列和连接。
建模完成后,可以对材料进行优化,并进行力场计算等操作。
5. 分子动力学模拟分子动力学模拟是材料研究中常用的方法,可以模拟材料的微观结构和动力学行为。
材料Studio提供了强大的分子动力学模拟功能,用户可以在软件中设置模拟的参数,进行分子动力学的模拟。
在模拟过程中,可以观察材料的变化,了解材料的热力学和力学性质。
6. 导入和导出数据在材料研究中,通常需要对模拟的数据进行分析和处理。
材料Studio 可以方便地导入和导出数据,用户可以将模拟结果导出为文本文件、图像文件等格式,方便后续的数据分析。
还可以导入实验数据进行对比分析,帮助验证模拟的结果。
7. 实例分析为了更好地理解材料Studio的使用方法和应用,下面我们以某一具体材料的模拟和分析为例,进行实例分析。
欢迎欢迎使用Materials StudioMaterials Studio是一个采用服务器/客户机模式的软件环境,它为你的PC机带来世界最先进的材料模拟和建模技术。
Materials Studio使你能够容易地创建并研究分子模型或材料结构,使用极好的制图能力来显示结果。
与其它标准PC软件整合的工具使得容易共享这些数据。
Materials Studio的服务器/客户机结构使得你的Windows NT/2000/XP,Linux和UNIX服务器可以运行复杂的计算,并把结果直接返回你的桌面。
Materials Studio采用材料模拟中领先的十分有效并广泛应用的模拟方法。
Accelry’s的多范围的软件结合成一个集量子力学、分子力学、介观模型、分析工具模拟和统计相关为一体容易使用的建模环境。
卓越的建立结构和可视化能力和分析、显示科学数据的工具支持了这些技术。
无论是使用高级的运算方法,还是简单地利用Materials Studio增强你的报告或演讲,你都可以感到自己是在用的一个优秀的世界级材料科学与化学计算软件系统。
易用性与灵活性Materials Studio可以在Windows 98,Me,NT,2000和XP下运行。
用户界面符合微软标准,你可以交互控制三维图形模型、通过简单的对话框建立运算任务并分析结果,这一切对Windows用户都很熟悉。
Materials Studio的中心模块是Materials Visualizer。
它可以容易地建立和处理图形模型,包括有机无机晶体、高聚物、非晶态材料、表面和层状结构。
Materials Visualizer 也管理、显示并分析文本、图形和表格格式的数据,支持与其它字处理、电子表格和演示软件的数据交换。
Materials Studio是一个模块化的环境。
每种模块提供不同的结构确定、性质预测或模拟方法。
你可以选择符合你要求的模块与Materials Visualizer组成一个无缝的环境。
通过软件Materials Studio对晶体的晶面进行标定
1、前期准备:
(1)可正常使用的Materials Studio软件
(2)晶体的.cif文件
2、双击桌面图标,得到如下窗口:
此时,可以选择Creat a new proj,点击OK,弹出如下窗口(如果选择Open an existing pro,点击OK,会打开之前已经命名好的文件):
输入文件名字,我一般用日期进行命名,例如20200808-1,然后点击OK,如下新窗口:
将.cif文件(以TpPa-1的.cif文件为例)拖入软件界面中打开,得到如下窗口:
放大窗口,找到Reflex Tools图标,单击左键,选择“Powder Diffraction”
弹出一个新窗口:
修改角度范围,对于TpPa-1来说,可以将2-Theta:的Min改为3.000,Max 改为30.000,然后点击Calculate.得到新的窗口:
将鼠标光标放到相应的峰下边的绿色短竖线上,单击左键,在窗口的左下角即可看到晶面数据(Reflection:100,2-Theta:4.7)
备注:如果在点击绿色竖短线后左下角不出现晶面数据,则点击View,再单击Status Bar,使其前边带有对号√,即可。
如下图所示:。
Materials Studio 是一个用于计算材料性质和分子模拟的软件套件。
在 Materials Studio 中,通过设置约束可以对分子构型进行限制,以便进行模拟和分析。
约束可以用于保持分子的特定部分静止、限制原子的运动范围等。
以下是在 Materials Studio 中约束分子构型的一般步骤:1.打开 Materials Studio:启动软件并打开的项目或新建一个项目。
2.导入分子结构:在 Materials Studio 中导入想要约束的分子结构。
可以使用内置的建模工具或导入外部文件。
3.选择约束工具: Materials Studio 提供了一系列约束工具,通常在构建模块中可以找到。
常见的约束工具包括:–Distance Constraint(距离约束):保持两个原子之间的距离固定。
–Angle Constraint(角度约束):保持原子之间的角度不变。
–Dihedral Constraint(二面角约束):保持原子的二面角不变。
–Fixed Atoms(固定原子):将特定的原子固定在空间中的特定位置。
4.设置约束参数:根据的需求设置约束的参数。
例如,选择要约束的原子、设置距离、角度或二面角的值等。
5.应用约束:将约束应用到分子结构上。
这通常涉及选择约束工具并在分子结构上指定约束。
6.运行模拟或分析:在应用约束后,可以运行分子动力学模拟或其他分子结构分析。
约束将影响模拟或分析的结果,因为它们限制了分子结构的自由度。
7.查看结果:完成模拟或分析后,可以查看分子构型的演变以及约束对分子结构和性质的影响。
请注意,具体的步骤和界面可能会根据 Materials Studio 的版本和具体模块而有所不同。
因此,在使用时,最好参考软件的用户手册或在线文档以获取详细的指导。
欢迎欢迎使用Materials StudioMaterials Studio是一个采用服务器/客户机模式的软件环境,它为你的PC机带来世界最先进的材料模拟和建模技术。
Materials Studio使你能够容易地创建并研究分子模型或材料结构,使用极好的制图能力来显示结果。
与其它标准PC软件整合的工具使得容易共享这些数据。
Materials Studio的服务器/客户机结构使得你的Windows NT/2000/XP,Linux和UNIX服务器可以运行复杂的计算,并把结果直接返回你的桌面。
Materials Studio采用材料模拟中领先的十分有效并广泛应用的模拟方法。
Accelry’s的多范围的软件结合成一个集量子力学、分子力学、介观模型、分析工具模拟和统计相关为一体容易使用的建模环境。
卓越的建立结构和可视化能力和分析、显示科学数据的工具支持了这些技术。
无论是使用高级的运算方法,还是简单地利用Materials Studio增强你的报告或演讲,你都可以感到自己是在用的一个优秀的世界级材料科学与化学计算软件系统。
易用性与灵活性Materials Studio可以在Windows 98,Me,NT,2000和XP下运行。
用户界面符合微软标准,你可以交互控制三维图形模型、通过简单的对话框建立运算任务并分析结果,这一切对Windows用户都很熟悉。
Materials Studio的中心模块是Materials Visualizer。
它可以容易地建立和处理图形模型,包括有机无机晶体、高聚物、非晶态材料、表面和层状结构。
Materials Visualizer 也管理、显示并分析文本、图形和表格格式的数据,支持与其它字处理、电子表格和演示软件的数据交换。
Materials Studio是一个模块化的环境。
每种模块提供不同的结构确定、性质预测或模拟方法。
你可以选择符合你要求的模块与Materials Visualizer组成一个无缝的环境。
MaterialsStudio5安装及使用教学Materials Studio 5.0 安裝OS:Sles10sp1 x64Materials Studio 5.0安裝說明可參考安裝光碟內的README_Materials_Studio 及Info目錄內的文件.安裝前準備:1.請先將基本的cluster環境建置完成2.掛載安裝光碟至/mnt3.新建一新帳號”msi”,使用該帳號安裝Materials Studio 5.04.安裝目錄為/opt/app/MS_5.0開始安裝:1.請先手動安裝HPMPI (請選擇適合的版本)/mnt/UNIX/Linux/hpmpi/ hpmpi-2.03.01.00-20090402r.i386.rpm (x86)/mnt/UNIX/Linux_IA64/hpmpi/ hpmpi-2.03.01.00-20090402r.ia64.rpm (IA64)/mnt/UNIX/Linux_x86_64/hpmpi/ hpmpi-2.03.01.00-20090402r.x86_64.rpm (x64)rpm -ivh /mnt/UNIX/Linux_x86_64/hpmpi/hpmpi-2.02.05.01-20070708r.x86_64.rpm 將會安裝HPMPI於/opt/hpmpi若cluster 有將/opt分享出去,則只須安裝於cluster 上。
若否,請每台節點安裝。
2.安裝Materials Studio 5.0*使用一般user權限安裝,不建議使用root權限安裝使用msi 權限安裝,並將MS 5.0安裝於/opt/app/MS_5.0 的家目錄下$cd /mnt/UNIX$./Install --type cluster (Installing Materials Studio on a Linux cluster)1. Please specify an absolute destination path[/home/paul/Accelrys/MaterialsStudio43] /opt/app/MS_5.02. 29. Everything (選29 完全安裝)會依序安裝1.Accelrys License Pack2.Accelrys Materials Studio 4.31.Accelrys License PackDestination Directory [/home/paul/Accelrys] /opt/app/MS_5.0安裝完會檢測系統是否有安裝HPMPIChecking for dependencies for SharedSetup:4Checking for dependencies for IntelRuntime: None Checking for dependencies for HPMPI:1Do HP-MPI Installation -- MesoDyn server selected.Should HPMPI use SSH? [Y/n]:選Yaffect performance [/tmp] :按Enter不變更If you would like the Gateway at /opt/app/MS_5.0/etcto be started automatically when the system is restartedyou will need to get your administrator to place a copy of/opt/app/MS_5.0/etc/Gateway/msgateway_control_18888 in /etc/rc.d/init.d/msgateway_control_18888and run:/sbin/chkconfig --add msgateway_control_18888Would you like to start the Gateway service now? [Y/n]:選Y1) Enter temporary license password2) Set connection to license server3) List command line license administration tools99) Finished with license configurationChoose one of the above options:選99我是使用試用版的license,稍後再設定.安裝完成將license file放到/opt/app/MS_5.0/LicensePack/Licenses/root:#cp/home/paul/Accelrys/MaterialsStudio43/etc/Gateway/msga teway_control_18888 /etc/init.d/#insserv msgateway_control_18888 on#/etc/init.d/msgateway_control_18888 start此時便可瀏覽器連到Gate way server使用瀏覽器連到Gateway介面作修改Gateway Data ->edit (預設密碼為gatekeeper)1.cpucorestotal 數量設為所有計算節點的cpu數量加總save 儲存設定vi /opt/app/MS_5.0/share/data/machines.LINUX為mpirun的machinefile請修改為"可用節點:CPU數"cn1:8cn2:8設定可用的queuecd/opt/app/MS_5.0/etc/Gateway/root_default/dsd/commands/qu eues/Torque vi qstat.outorqstat -Qf >qstat.out (將系統可用的queue name都加入) Windows client完全安裝,但不安裝license,不啟動Gateway功能開始-> Accelrys Materials Studio 5.0 ->Server Console 在Server Gateways新增GatewayURL http://xxx.xxx.xxx.xxx:port number:18888新增完後在新增的gateway上點選Test Gateway 測試(兩項測試都應該要通過)啓動主程式開始-> Accelrys Materials Studio 5.0 ->Materials StudioFile ->Import-> C:\Program Files\Accelrys\Materials Studio 5.0\share\Structures\catalysts\heterogeneous\beta-A.msisample檔目錄C:\Program Files\Accelrys\Materials Studio4.3\share\Structures\catalysts\heterogeneous\使用beta-A.msi測試在視窗左邊點選beta-A.xsd選擇要用的”queue”及CPU個數,按Run開始執行。
Materials studio 使用笔记使用materials studio 首先建一个project (当然也可以打开一个之前的project啦)这里将之命名为NaCl.stp按OK完成新建project操作。
以下是新建project后的materials studio UI界面:这里有几个重要的窗口,可分为这三类:一、job,己完成的、正在跑的;二、project,各种输入与输出文件,可以查看结果、修改输出入的相关设定;三、property,材料的原子及电子结构3D模型等物性数据,例如晶体晶胞边长、原子元素种类等等。
从V eiw的Explorer 可见:jobExploroer、project exploroer、property explorer。
job explorer显示运行的job,近端远程的状态都可以显示。
project explorer默认值是开着的,project的相关对象,如文字输出、3D 结构等等,job相关的目录、文件等。
property explorer,在MS相对Cerius2而言是新的东西。
只要是3D 对象有呈现的状况之下,可以直接在上面显现出各种可以看得见的特性还有可以改得了的选项。
现在,我们需要一个晶胞结构,用于演示CASTEP计算。
这个结构可以是import 的,也可以是自己手动建立。
Import方式可以通过File-import,导入structure内建的结构。
手动建立方式如下:先建立一个3D atomistic Document,方式如上但不限于以上,还有其他几种方式各位按习惯选择。
建完后:Build-crystal-Buildcrystal此时会打开Build crystal 对话框如下,根据icsd查询的NaCl晶体参数,输入进去:space group:225显示出NaCl的FM-3M结构Attice parameter 填写晶格常数,比如a,b,c及三个角度值这里,钠的a=b=c=5.64Options里基本只要用预设值即可按apply或Build即可生成晶格模型添加原子方式很多,这里也仅取一种方便的方式如下选择Na和Cl原子,钠的abc选0,Cl选0.5如下,分别按add,完成原子的添加,完成后三维图如下,是因为没有进行旋转,此时选工具旋转,即可得到从别的角度看见的三维图更改三维显示方式可以在三维图上单击右键,在弹出的菜单中选display style设置3D格式,如atom中我选择stick等就产生了形状的模型。
materials studio操作手册
【实用版】
目录
1.Materials Studio 简介
2.Materials Studio 的功能
3.Materials Studio 的使用方法
4.Materials Studio 的优缺点
正文
1.Materials Studio 简介
Materials Studio 是一款专业的材料科学研究软件,广泛应用于材料模拟、计算和数据分析等领域。
该软件旨在为科研人员和工程师提供一套全面、高效的材料研究解决方案,帮助用户加速材料设计和开发过程。
2.Materials Studio 的功能
Materials Studio 具有以下主要功能:
(1) 材料模拟:可以进行第一性原理、分子动力学、蒙特卡洛等模拟,为用户提供多种材料模拟方案。
(2) 计算分析:提供多种计算方法,包括能量、力、磁性、电子性质等分析,帮助用户深入了解材料性质。
(3) 数据处理与分析:可以处理和分析各种材料数据,包括晶体结构、电子衍射、光学性质等。
(4) 材料设计与优化:通过模拟和计算,可以辅助用户进行材料设计和优化,提高材料性能。
(5) 可视化:提供多种可视化工具,方便用户观察和分析模拟结果。
3.Materials Studio 的使用方法
(1) 安装:首先需要下载并安装 Materials Studio 软件,安装过程中需要输入许可证密钥。
(2) 学习:为了熟练使用 Materials Studio,用户需要学习相关的操作技巧和模拟方法。
可以通过阅读官方教程、参加培训课程或请教有经验的同行来学习。
(3) 创建项目:在 Materials Studio 中创建一个新项目,可以导入所需的材料参数和结构数据。
(4) 设定模拟参数:根据需求选择合适的模拟方法,并设置相关参数,如模拟温度、压力等。
(5) 运行模拟:启动模拟任务,等待模拟结果。
(6) 分析结果:通过可视化工具观察和分析模拟结果,提取所需信息。
4.Materials Studio 的优缺点
优点:
(1) 功能强大:Materials Studio 涵盖了材料研究的各个方面,可以满足科研人员和工程师的多种需求。
(2) 易于上手:软件界面友好,操作相对简单,初学者可以较快地掌握基本操作。
(3) 高效计算:采用高性能计算技术,可以大幅缩短模拟和计算时间。
缺点:
(1) 价格昂贵:对于非商业用户来说,购买许可证可能较为昂贵。
(2) 学习曲线:虽然操作相对简单,但涉及到的材料知识和模拟方法较多,需要较长时间学习和掌握。