关于流式细胞术的学习

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1、MFI和GFI的意义?
Geo Mean,叫做几何均数(geometric mean),常用于等级资料和对数正态分布资料,和常用的算数均数(mean)的计算方法不同。

“ %total或者%gate的结果”代表的是百分率,即细胞占总体细胞或者是门内细胞的百分比;用百分比作为统计指标,适用于荧光表达较强的指标。

我看到你的流式图上,检测样本的荧光强度不是很强,属于弱表达的指标,若用百分率统计,就是会失去一部分弱阳性的数据。

我建议可以用平均荧光强度(也就是 mean值)作为统计指标,比较荧光强度的变化。

2、FCM检测表达结果到底是用百分比还是MFI?我作出是单峰,原本我觉得用MFI表示较好。

但我做的2个蛋白很奇怪,一个表达率高,但MFI值低;另一个表达率低,但MFI值高。

我又作了SYBR GREEN 定量PCR,发现mRNA 的表达基本与百分比相符,而与MFI值不太一致。

个人认为如果有明显阴性细胞群和阳性细胞群,应计算百分比;无明显分群,仅荧光强度发生变化的应该用MFI。

如果是整体峰移(或者叫单峰),那么根本不存在MFI之外的任何合理的指标,不管MFI跟其它指标吻合度如何,这就是客观数据、客观事实。

3、请问下表中流式细胞仪给出的平均值是什么意思,是怎样得到的,有些文献中提到“fluorescence per cell",是下面的mean值吗,还是要用mean值除以第1栏的细胞数events,才能得到fluorescence per cell ?
mean 值就是每个细胞的平均荧光强度,不用再除细胞数。

这只是个相对值,如果求绝对值,应用已知荧光剂浓度值对应仪器给出的mean值,做标准曲线。

以后你得到的mean值,就可以根据这条标准曲线查出真正的荧光浓度值。