氨基酸缩写及对应密码子表
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遗传密码表以及氨基酸详
表
Prepared on 24 November 2020
密码子反表
除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:•Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。
•Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。
•Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。
•Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。
结构[]
以下是标准所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。
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(Ala/A)
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(Arg/R)
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(Asn/N)
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(Asp/D)
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(Cys/C)
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(Glu/E)
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(Gln/Q)
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(Gly/G)
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(His/H)
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(Ile/I)
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(Leu/L)
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(Lys/K)
•(Met/M)
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(Phe/F)
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(Pro/P)
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(Ser/S)
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(Thr/T)
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(Trp/W)
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(Tyr/Y)
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(Val/V)
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(Sec/U)
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(Pyl/O)
主要化学性质[]
以下的分子量是根据各元素的在自然界的所做的平均值。
此外由于形成时,会减少一个,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了 Da。
支链性质[]
以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。
基因表达与生物化学[]。
氨基酸的简写符号名称三字母符号单字母符号名称三字母符号单字母符号丙氨酸(alanine)Ala A亮氨酸(leucine)Leu L精氨酸(arginine)Arg R赖氨酸(lysine)Lys K天冬酰胺(asparagine)Asn N甲硫氨酸(methionine)Met M天冬氨酸(aspartic acid)Asp D笨丙氨酸(phenylalanine)Phe F半胱氨酸(cysteine)Cys C脯氨酸(proline)Pro P谷氨酰胺(glutanine)Gln Q丝胺酸(serine)Ser S谷氨酸(glutamic acid)Glu E苏氨酸(threonine)Thr T甘氨酸(Glicine)Gly G色氨酸(tryptophan)Trp W组氨酸(histidine)His H酪氨酸(tyrosine)Tyr Y异亮氨酸(isoleucine)Ile I颉氨酸(valine)Val V几种产生致癌基因的突变类型基因突变产生的致癌基因通常是显性的,并且基因突变可导致细胞分裂的增加。
这是因为致癌基因的突变并不是因为原癌基因编码的产物失去活性造成,恰恰相反,原癌基因所编码的产物活性增加可致使其发生致癌突变。
这种增益功能的突变可能是由于改变了原癌基因所编码的蛋白质或者其编码蛋白质的量有所增多。
因此,原癌基因的野生型副本也无法克服原癌基因的这种作用。
就像其他的基因一样,原癌基因也包含一个调控区和一个能编码蛋白质的结构区域。
一些致癌基因的调控区发生改变可使基因的表达增加,而一些在蛋白质编码区序列发生突变则会产生活性增加的蛋白质。
刺激细胞生长和分裂的途径分为几个阶段,原癌基因编码的蛋白质就参与了这个过程。
令人惊讶的是,突变导致的这些组件的超活化可以使原癌基因转变为致癌基因。
其中参与细胞分裂的主要元件包括:1.生长因子:这些蛋白质或者在血液循环系统中的化学信使可携带促生长信号并将信号传递到细胞表面。
密码子反表除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:● Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。
● Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。
● Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。
● Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。
结构[编辑]以下是标准遗传密码所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。
●L-丙氨酸(Ala / A)●L-精氨酸(Arg / R)●L-天冬酰胺(Asn / N)●L-天冬氨酸(Asp / D)●L-半胱氨酸(Cys / C)●L-谷氨酸(Glu / E)●L-谷氨酰胺(Gln / Q)●甘氨酸(Gly / G)●L-组氨酸(His / H)●L-异亮氨酸(Ile / I)●L-亮氨酸(Leu / L)●L-赖氨酸(Lys / K)●L-蛋氨酸(Met / M)●L-苯丙氨酸(Phe / F)●L-脯氨酸(Pro / P)●L-丝氨酸(Ser / S)●L-苏氨酸(Thr / T)●L-色氨酸(Trp / W)●L-酪氨酸(Tyr / Y)●L-缬氨酸(Val / V)●L-硒半胱氨酸(Sec / U)●L-吡咯赖氨酸(Pyl / O)主要化学性质[编辑]以下的分子量是根据各元素的同位素在自然界的丰度所做的平均值。
此外由于形成肽键时,会减少一个水分子,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了18.01524 Da。
氨基酸分子量(Da)pI pK1(α-COOH)pK2(α-+NH3)支链性质[编辑]以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。
基因表达与生物化学[编辑]。
丙氨酸A l a n i n eA 或A l a 89.079C H 3-脂肪族G C U G C C G C A G C G 终止密码子:U A A U A G U G A精氨酸A r g i n i n e R 或A r g 174.188H N =C (N H 2)-N H -(C H 2)3-碱性氨基酸类C G U C G C C G A C G G A G A A G G天冬酰胺A s p a r a g i n e N 或A s n 132.104H N 2-C O -C H 2-酰胺类A A U A A C 天冬氨酸A s p a r t i c a c i d D 或A s p 133.089H O O C -C H 2-酸性氨基酸G A U G A C 半胱氨酸C y s t e i n e C 或C y s 121.145H S -C H 2-含硫类U G U U G C 谷氨酰胺G l u t a m i n e Q 或G l n 146.131H 2N -C O -(C H 2)2-酰胺类C A A C A G 谷氨酸G l u t a m i c a c i d E 或G l u 147.116H O O C -(C H 2)2-酸性氨基酸G A A G A G甘氨酸G l y c i n eG 或G l y 75.052H -脂肪族G G U G G C G G A G G G终止密码子:U A A U A G U G A 组氨酸H i s t i d i n e H 或H i s 155.141N =C H -N H -C H =C -C H 2-碱性氨基酸类C A U C A C 异亮氨酸I s o l e u c i n e I 或I l e 131.160H 3C -C H 2-C H (C H 3)-脂肪族类A U U A U C A U A 亮氨酸L e u c i n e L 或L e u 131.160(C H 3)2-C H -C H 2-脂肪族类U U A U U G C U U C U C C U A C U G 赖氨酸L y s i n e K 或L y s 146.17H 2N -(C H 2)3-碱性A A A A A G 蛋氨酸M e t h i o n i n eM 或M e t 149.199C H 3-S -(C H 2)2-含硫类A U G 起始苯丙氨酸P h e n y l a l a n i n eF 或P h e 165.177P h e n y l -C H 2-芳香族类U U U U U C 终止密码子:U A A U A G U G A脯氨酸P r o l i n e P 或P r o 115.117H N -(C H 2)3-C H -亚氨基酸C C U C C G C C A C C C 丝氨酸S e r i n e S 或S e r 105.078H O -C H 2-羟基类A G U A G C 苏氨酸T h r e o n i n e T 或T h r 119.105C H 3-C H (O H )-羟基类A C U A C C A C A A C G 色氨酸T r y p t o p h a n W 或T r p 204.213P h e n y l -N H -C H =C -C H 2-芳香族类U G G 酪氨酸T y r o s i n eY 或T y r 181.1764-O H -P h e n y l -C H 2-芳香族类U A U U A C 缬氨酸V a l i n e V 或V a l 117.133C H 3-C H (C H 2)-脂肪族类G U U G U C G U A G U G。
丙氨酸A l a n i n eA 或A l a 89.079C H 3-脂肪族G C U G C C G C A G C G 终止密码子:U A A U A G U G A精氨酸A r g i n i n e R 或A r g 174.188H N =C (N H 2)-N H -(C H 2)3-碱性氨基酸类C G U C G C C G A C G G A G A A G G天冬酰胺A s p a r a g i n e N 或A s n 132.104H N 2-C O -C H 2-酰胺类A A U A A C 天冬氨酸A s p a r t i c a c i d D 或A s p 133.089H O O C -C H 2-酸性氨基酸G A U G A C 半胱氨酸C y s t e i n e C 或C y s 121.145H S -C H 2-含硫类U G U U G C 谷氨酰胺G l u t a m i n e Q 或G l n 146.131H 2N -C O -(C H 2)2-酰胺类C A A C A G 谷氨酸G l u t a m i c a c i d E 或G l u 147.116H O O C -(C H 2)2-酸性氨基酸G A A G A G甘氨酸G l y c i n eG 或G l y 75.052H -脂肪族G G U G G C G G A G G G终止密码子:U A A U A G U G A 组氨酸H i s t i d i n e H 或H i s 155.141N =C H -N H -C H =C -C H 2-碱性氨基酸类C A U C A C 异亮氨酸I s o l e u c i n e I 或I l e 131.160H 3C -C H 2-C H (C H 3)-脂肪族类A U U A U C A U A 亮氨酸L e u c i n e L 或L e u 131.160(C H 3)2-C H -C H 2-脂肪族类U U A U U G C U U C U C C U A C U G 赖氨酸L y s i n e K 或L y s 146.17H 2N -(C H 2)3-碱性A A A A A G 蛋氨酸M e t h i o n i n eM 或M e t 149.199C H 3-S -(C H 2)2-含硫类A U G 起始苯丙氨酸P h e n y l a l a n i n eF 或P h e 165.177P h e n y l -C H 2-芳香族类U U U U U C 终止密码子:U A A U A G U G A脯氨酸P r o l i n e P 或P r o 115.117H N -(C H 2)3-C H -亚氨基酸C C U C C G C C A C C C 丝氨酸S e r i n e S 或S e r 105.078H O -C H 2-羟基类A G U A G C 苏氨酸T h r e o n i n e T 或T h r 119.105C H 3-C H (O H )-羟基类A C U A C C A C A A C G 色氨酸T r y p t o p h a n W 或T r p 204.213P h e n y l -N H -C H =C -C H 2-芳香族类U G G 酪氨酸T y r o s i n eY 或T y r 181.1764-O H -P h e n y l -C H 2-芳香族类U A U U A C 缬氨酸V a l i n e V 或V a l 117.133C H 3-C H (C H 2)-脂肪族类G U U G U C G U A G U G。
遗传密码表以及氨基酸详表Company Document number:WTUT-WT88Y-W8BBGB-BWYTT-19998密码子反表除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:•Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。
•Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。
•Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。
•Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。
结构[]以下是标准所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。
•(Ala/A)•(Arg/R)•(Asn/N)•(Asp/D)•(Cys/C)•(Glu/E)•(Gln/Q)•(Gly/G)•(His/H)•(Ile/I)•(Leu/L)•(Lys/K)•(Met/M)•(Phe/F)•(Pro/P)•(Ser/S)•(Thr/T)•(Trp/W)•(Tyr/Y)•(Val/V)•(Sec/U)•(Pyl/O)主要化学性质[]以下的分子量是根据各元素的在自然界的所做的平均值。
此外由于形成时,会减少一个,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了 Da。
支链性质[]以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。
基因表达与生物化学[]。
密码子表表一:密码子表此表列出了64种密码子以及氨基酸的标准配对。
第二位碱基U C A G第一位碱基UUUU (Phe/F)苯丙氨酸UUC (Phe/F)苯丙氨酸UUA (Leu/L)亮氨酸UUG (Leu/L)亮氨酸UCU (Ser/S)丝氨酸UCC (Ser/S)丝氨酸UCA (Ser/S)丝氨酸UCG (Ser/S)丝氨酸UAU (Tyr/Y)酪氨酸UAC (Tyr/Y)酪氨酸UAA 终止UAG 终止UGU (Cys/C)半胱氨酸UGC (Cys/C)半胱氨酸UGA 终止UGG (Trp/W)色氨酸CCUU (Leu/L)亮氨酸CUC (Leu/L)亮氨酸CUA (Leu/L)亮氨酸CUG (Leu/L)亮氨酸CCU (Pro/P)脯氨酸CCC (Pro/P)脯氨酸CCA (Pro/P)脯氨酸CCG (Pro/P)脯氨酸CAU (His/H)组氨酸CAC (His/H)组氨酸CAA (Gln/Q)谷氨酰胺CAG (Gln/Q)谷氨酰胺CGU (Arg/R)精氨酸CGC (Arg/R)精氨酸CGA (Arg/R)精氨酸CGG (Arg/R)精氨酸AAUU (Ile/I)异亮氨酸AUC (Ile/I)异亮氨酸AUA (Ile/I)异亮氨酸AUG (Met/M)甲硫氨酸, 起始1ACU (Thr/T)苏氨酸ACC (Thr/T)苏氨酸ACA (Thr/T)苏氨酸ACG (Thr/T)苏氨酸AAU (Asn/N)天冬酰胺AAC (Asn/N)天冬酰胺AAA (Lys/K)赖氨酸AAG (Lys/K)赖氨酸AGU (Ser/S)丝氨酸AGC (Ser/S)丝氨酸AGA (Arg/R)精氨酸AGG (Arg/R)精氨酸GGUU (Val/V)缬氨酸GUC (Val/V)缬氨酸GUA (Val/V)缬氨酸GUG (Val/V)缬氨酸GCU (Ala/A)丙氨酸GCC (Ala/A)丙氨酸GCA (Ala/A)丙氨酸GCG (Ala/A)丙氨酸GAU (Asp/D)天冬氨酸GAC (Asp/D)天冬氨酸GAA (Glu/E)谷氨酸GAG (Glu/E)谷氨酸GGU (Gly/G)甘氨酸GGC (Gly/G)甘氨酸GGA (Gly/G)甘氨酸GGG (Gly/G)甘氨酸1标准起始编码,同时为甲硫氨酸编码。
表1 氨基酸中英文对照及缩写(来源于网络)
图1 氨基酸密码子表(来源于网络)
20种氨基酸按理化性质可分为4组:
①非极性、疏水性氨基酸:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸和脯氨酸
②极性、中性氨基酸:色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺和苏氨酸
③酸性的氨基酸:天冬氨酸和谷氨酸
④碱性氨基酸:赖氨酸、精氨酸和组氨酸
1、必须氨基酸:携一本蛋色书来[缬氨酸,异亮(亮)氨酸,苯丙氨酸,蛋氨酸,色氨酸(甲硫氨酸),苏氨酸,赖氨酸,]
2、半必须氨基酸:半斤组[精(斤)氨酸,组氨酸]
3、含硫氨基酸:硫甲硫,胱半胱[甲硫氨酸,半胱氨酸,胱氨酸]
4、芳香族氨基酸:老芳本色[酪氨酸,苯丙氨酸,色氨酸]
5、支链氨基酸:支姐,亮一亮[缬氨酸,亮氨酸,异亮氨酸]
6、非极性疏水性氨基酸:非姐,脯亮一亮,(给你)本饼干[缬氨酸,脯氨酸,亮氨酸,异亮氨酸,苯丙氨酸,丙氨酸,甘氨酸]
7、酸性氨基酸:酸谷天(三伏天)[谷氨酸,天冬氨酸]
8、碱性氨基酸:碱组精赖[组氨酸,精氨酸,赖氨酸]。