分子生物学:第七章翻译1
- 格式:ppt
- 大小:4.17 MB
- 文档页数:36
acetyl CoA / 乙酰辅酶A 一种小分子的水溶性代谢产物,由与辅酶A 相连的乙酰基组成,产生于丙酮酸、脂肪酸及氨基酸的氧化过程;其乙酰基在柠檬酸循环中被转移到柠檬酸。
actin / 肌动蛋白,肌纤蛋白富含于真核细胞中的结构蛋白,与许多其他蛋白相互作用。
其球形单体( G2肌动蛋白) 聚合形成肌动蛋白纤丝( F2肌动蛋白) 。
在肌肉细胞收缩时F2肌动蛋白与肌球蛋白相互作用。
activation energy / 活化能(克服障碍以) 启动化学反应所需的能量投入。
降低活化能,可增加酶的反应速率。
active site / 活性中心,活性部位酶分子上与底物结合及进行催化反应的区域。
active transport / 主动转运离子或小分子逆浓度梯度或电化学梯度的耗能跨膜运动。
由ATP 耦联水解或另一分子顺其电化学梯度的转运提供能量。
adenylyl cyclase / 酰苷酸环化酶催化由ATP 生成环化腺苷酸(cAMP) 的膜附着酶。
特定配体与细胞表面的相应受体结合引发该酶的激活并使胞内的cAMP 升高。
allele / 等位基因位于同源染色体上对应部位的基因的两种或多种可能形式之一。
allosteric transition / 变构转换小分子与蛋白质上特定调节部位相结合所引起的蛋白质之三级及(或) 四级结构的改变,其活性随之发生变化。
多亚单位酶的变构调节很普遍。
alpha(α) helix /α螺旋常见的蛋白质二级结构,其氨基酸线性序列叠为右旋螺旋,借助主链上的羧基与酰胺基间的氢键维持稳定。
aminoacyl2tRNA / 氨酰转移核糖核酸用于蛋白合成的氨基酸的激活形式,含有借高能酯键与tRNA 分子上3’2羟基相结合的氨基酸。
amphipathic / 两亲的,兼性的指既有亲水性部分又有疏水性部分的分子或结构。
anaphase / ( 细胞分裂) 后期姐妹染色体(或有丝分裂期的成对同源物) 裂开并分别(分离) 朝纺锤体两极移动的有丝分裂期。
第二章一、名词解释1、DNA的一级结构:四种脱氧核苷酸按照一定的排列顺序以3’,5’磷酸二酯键相连形成的直线或环状多聚体,即四种脱氧核苷酸的连接及排列顺序。
2、DNA的二级结构:DNA两条多核苷酸链反向平行盘绕而成的双螺旋结构.3、DNA的三级结构:DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。
4、DNA超螺旋:DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构,是DNA结构的主要形式,可分为正超螺旋与负超螺旋两大类。
按DNA双螺旋的相反方向缠绕而成的超螺旋成为负超螺旋,反之,则称为正超螺旋。
所有天然的超螺旋DNA均为负超螺旋。
5、DNA拓扑异构体:核苷酸数目相同,但连接数不同的核酸,称拓扑异构体6、DNA的变性与复性:变性(双链→单链)在某些理化因素作用下,氢键断裂,DNA双链解开成两条单链的过程。
复性(单链→双链)变性DNA在适当条件下,分开的两条单链分子按照碱基互补配对原则重新恢复天然的双螺旋构想的现象。
7、DNA的熔链温度(Tm值):DNA加热变性时,紫外吸收达到最大值的一半时的温度,即DNA分子内50%的双链结构被解开成单链。
Tm值计算公式:Tm=69.3+0.41(G+C)%;<18bp的寡核苷酸的Tm计算:Tm=4(G+C)+2(A+T)。
8、DNA退火:热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,称为退火9、基因:编码一种功能蛋白或RNA分子所必需的全部DNA序列。
10、基因组:生物的单倍体细胞中的所有DNA,包括核DNA和线粒体、叶绿体等细胞器DNA11、C值:生物单倍体基因组中的全部DNA量称为C值12、C值矛盾:C值的大小与生物的复杂度和进化的地位并不一致,称为C值矛盾或C值悖论13、基因家族:一组功能相似、且核苷酸序列具有同源性的基因。
可能由某一共同祖先基因经重复和突变产生。
14、假基因:假基因是原始的、有活性的基因经突变而形成的、稳定的无活性的拷贝。
表示方法:Ψα1表示与α1相似的假基因15、转座:遗传可移动因子介导的物质的重排现象。
分子生物学名词解释1.翻译(translation):以mRNA为模板,氨酰-tRNA为原料直接供体,在多种蛋白质因子和酶的参与下,在核糖体上将mRNA分子上的核苷酸顺序表达为有特定氨基酸顺序的蛋白质的过程。
2.密码子(codon):mRNA中碱基顺序与蛋白质中氨基酸顺序的对应关系是通过密码实现的, mRNA中每三个相邻的碱基决定一个氨基酸,这三个相邻的碱基称为一个密码子。
3.密码的简并性(degeneracy):—个氨基酸具有两个以上密码子的现象。
4.同义密码子(synonym codon):为同—种氨基酸编码的各个密码子,称为同义密码了。
5.变偶假说(wobble hypothesis):指反密码子的前两个碱基(3’-端)按照标准与密码子的前两个碱基(5’-端)配对,而反密码子中的第三个碱基那么有某种程度的变动,使其有可能与几种不同的碱基配对。
6.移码突变(frame-shift mutation):在mRNA中,假设插入或删去一个核苷酸,就会使读码发错误,称为移码,由于移码而造成的突变、称移码突变。
7.同功受体(isoacceptor):转运同一种氨基酸的几种tRNA称为同功受体。
8.反密码子(anticodon):指tRNA反密码子环中的三个核苷酸的序列,在蛋白质合成过程中通过碱基配对,识别并结合到mRNA的特殊密码上。
9.多核糖体(polysome):mRNA同时与假设干个核糖体结合形成的念珠状结构,称为多核糖体。
1.中心法那么(central dogma):生物体遗传信息流动途径。
最初由Crick(1958)提出,经后人的不断补充和修改,现包括反转录和RNA复制等内容。
2.半保存复制(简称复制)〔semiconservative replication):亲代双链DNA 以每条链为模板,按碱基配对原那么各合成一条互补链,这样一条亲代DNA双螺旋,形成两条完全相同的子代DNA螺旋,子代DNA分子中都有一条合成的“新〞链和一条来自亲代的旧链,称为半保存复制。
第七章基因的表达与调控(上)——原核基因表达调控模式(一)基本概念1.基因表达:细胞在生命过程中,把蕴藏在DNA中的遗传信息经过转录和翻译,转变成为蛋白质或功能RNA分子的过程称为基因表达。
2.基因表达调控:围绕基因表达过程中发生的各种各样的调节方式都统称为基因表达调控。
rRNA或tRNA的基因经转录和转录后加工产生成熟的rRNA或tRNA,也是rRNA或tRNA 的基因表达,因为rRNA或tRNA就具有在蛋白质翻译方面的功能。
3.组成型表达:指不大受环境变动而变化的一类基因表达。
如DNA聚合酶,RNA聚合酶等代谢过程中十分必需的酶或蛋白质的表达。
管家基因:某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续表达,通常被称为管家基因。
管家基因无论表达水平高低,较少受到环境因素的影响。
在基因表达研究中,常作为对照基因适应型表达:指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因表达。
应环境条件变化基因表达水平增高或从无到有的现象称为诱导,这类基因被称为可诱导的基因;相反,随环境条件变化而基因表达水平降低或变为不表达的现象称为阻遏,相应的基因被称为可阻遏的基因。
4.结构基因:编码蛋白质或功能性RNA的任何基因。
所编码的蛋白质主要是组成细胞和组织基本成分的结构蛋白、具有催化活性的酶和调节蛋白等。
原核生物的结构基因一般成簇排列,真核生物独立存在。
结构基因簇由单一启动子共同调控。
调节基因:参与其他基因表达调控的RNA或蛋白质的编码基因。
①调节基因编码的调节物质通过与DNA上的特定位点结合控制转录是调控的关键。
②调节物与DNA特定位点的相互作用能以正调控的方式(启动或增强基因表达活性调节靶基因,也能以负调控的方式(关闭或降低基因表达活性)调节靶基因。
操纵子:由操纵基因以及相邻的若干结构基因所组成的功能单位,其中结构基因的转录受操纵基因的控制。
(二)原核基因调控的分类和主要特点一、原核生物的基因调控特点:(1)基因调控主要发生在转录水平上,形式主要是操纵子调控.(2)有时也从DNA水平对基因表达进行调控,实质是基因重排。
因此只有在没有葡萄糖的时候,同时又有半乳糖的时候,启动子1才是开放的为什么gal 操纵子需要两个转录起始位点?(涉及半乳糖在细胞代谢中的双重功能)半乳糖两个作用: 可以作为唯一碳源供细胞生长; 与之相关的物质--尿苷二磷酸半乳糖(UDPgal )是大肠杆菌细胞壁合成的前体。
而启动子也有两个: galP1起始的转录——无内源葡萄糖、有外源半乳糖时进行,以保证碳源的供应。
galP2起始的转录——有内源葡萄糖、无外源半乳糖时进行,以保证细胞壁的合成需要。
生理功能(可以理解为生物学意义?)无论从必要性和经济性考虑,都要有一个不依赖于cAMP-CAP 的启动子(s2) 进行本底水平的组成型合成,以及一个依赖于cAMP-CAP 的启动子(s1),进行高水平的调节,这样既可以满足细胞最基本的需要(细胞壁),又可以满足在没有葡萄糖而有半乳糖时,细胞能够利用半乳糖进行生长。
进一步解释:gal P2是不依赖于cAMP-CRP 的,相反: cAMP-CRP 对gal P2还起到一种抑制作用,这是因为其与结合位点的结合,会影响到RNA 聚合酶对gal P2的利用。
因此教材上(page257)认为:只有S2活性完全被抑制时,(S1)的调控作用才是有效的。
7.4.2 阿拉伯糖操纵子(arabinose operon)araB 基因、araA 基因和araD, 形成一个基因簇,简写为araBAD三个基因的表达受到ara 操纵子中araC 基因产物AraC 蛋白的调控。
C 蛋白有三个结合位点O2、O1和 I 。
I BADCRPO2O1C结构基因调节基因P BADaraC 基因是araBAD 的调节基因L核酮糖激酶L阿拉伯糖异构酶L核酮糖-5-磷酸-4-差相异构酶结合到ara I 的时候,由于araBAD的启动子本身与ara I有部分重叠,另外还可以引起上游序列回折弯曲,使得AraC同时与O2结合,从而使CRP 聚合酶也不能结合到启动子上,araBAD基因不转录。