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第四章 蛋白质三维结构-习题

第四章 蛋白质三维结构-习题
第四章 蛋白质三维结构-习题

第四章蛋白质的三维结构

一、选择题

⒈维持蛋白质二级结构的主要化学键是:()

A、盐键;

B、疏水键;

C、二硫键;

D、氢键;

E、范德华力

⒉蛋白质的构象特征主要取决于:()

A、氨基酸的组成、顺序和数目;

B、氢键、盐键、范德华力和疏水作用;

C、温度、离子强度

和pH等环境条件;D、肽链间及肽链内的二硫键;E、各氨基酸之间的肽链

⒊在一个肽平面中含有的原子数为:()

A、4;

B、5;

C、6;

D、7;

E、8

⒋具有四级结构的蛋白质的特征是:()

A、分子中必定含有辅基;

B、含有两条或两条以上的多肽链;

C、每条多肽链都具有独立的生

物学活性;D、依靠肽链维持结构的稳定性;E、以上都不是

⒌下列有关α-螺旋的叙述哪个是错误的?

A、分子内的氢键使α-螺旋稳定;

B、减弱R基团间不利的相互作用使α螺旋稳定;

C、疏水作

用使α螺旋中断;D、在某些蛋白质中,α螺旋是二级结构中的一种类型;E、脯氨酸和甘氨酸残基使α螺旋中断

⒍下列有关β折叠的叙述哪个是错误的?()

A、球状蛋白质中无β折叠的结构;

B、β折叠靠链间氢键而稳定;

C、它的氢键是肽链的C=O

和N-H间形成的;D、α-角蛋白可以通过加热处理而转变成β折叠的结构;E、β-折叠有平行的β折叠和反平行的β折叠

⒎具有四级结构的蛋白质特征是:()

A、分子中必定含有辅基;

B、含有两条或两条以上的肽链;

C、每条多肽链都具有独立的生物

学活性;D、依靠肽链维持结构的稳定性;E、以上都不是

⒏具有四级结构的蛋白质是:()

A、胰岛素;

B、核糖核酸酶;

C、血红蛋白;

D、肌红蛋白;

E、胰凝乳蛋白

⒐在四级结构的蛋白质分子中,每个具有三级结构的多肽链是:()

A、辅基;

B、辅酶;

C、亚基;

D、寡聚体;

E、肽单位

⒑关于蛋白质亚基的描述,其中正确的是:()

A、一条多肽链卷曲成螺旋结构;

B、两条以上多肽链卷曲成二级结构;

C、两条以上多肽链与

辅基与辅基结合成蛋白质;D、每个亚基都有各自的三级结构;E、以上都是正确

⒒胶原蛋白组成中出现的不寻常氨基酸是()

A、乙酰氨基酸;

B、羟基氨基酸;

C、甲基氨基酸;

D、D赖氨酸

⒓一种非常稳定的小分子量蛋白质的化学结构中,经常是()

A、含有大量的二硫键;

B、含有丰富的甘氨酸;

C、有较多络合金属离子;

D、含有疏水氨基酸⒔形成稳定的肽链空间结构,一个重要原因是肽键中的四个原子以及和它相临的两个α碳原子处于()

A、不断绕动状态;

B、可以相对自由旋转;

C、同一平面;

D、随不同外界环境而变化的状态⒕在寡聚蛋白质中,亚基间的立体排布、相互作用以及接触部位间的空间结构称之为()

A、三级结构;

B、缔合现象;

C、四级结构;

D、变构现象

⒖下列哪种方法是目前研究蛋白质分子空间结构最常用的()

A、圆二色性;

B、荧光光谱;

C、X光衍射;

D、核磁共振

二、判断是非

⒈从热力学上讲最稳定的蛋白质构象自由能最低。

⒉维持蛋白质三维结构的最重要的力是氢键。

⒊蛋白质的亚基和肽链是同义的。

⒋球蛋白与球状蛋白是不同的。

⒌在多肽分子中只存在一种共价键即肽键。

⒍蛋白质分子的亚基与结构域是同义的。

⒎多数寡聚蛋白质分子其亚基的排列是对称的,对称性是四级结构蛋白质分子最重要的性质之一。

⒏多肽链所以能够折叠、缠绕、卷曲,是由于肽键可以自由的旋转所造成的。

⒐蛋白质二级结构的稳定性是靠链内氢键维持的,肽链上每个肽键都参与氢键的形成。

⒑具有四级结构的蛋白质,它的每个亚基单独存在时仍能保持蛋白质原有的生物活性。

⒒结构域的组织层次介于三级结构和四级结构之间。

⒓胶原蛋白中有重复的疏水性氨基酸顺序出现,所以形成大面积的疏水区,相互作用使三股肽链稳定及整齐排列。

⒔球状蛋白质分子含有极性基团的氨基酸顺序出现,所以能溶于水;片层结构仅能出现在纤维状蛋白中,如丝心蛋白,所以不溶于水。

⒕疏水作用是使蛋白质立体结构稳定的一种重要的次级键。

⒖胶原螺旋和α螺旋是互为镜面对称的蛋白质的两种构象。

⒗蛋白质天然构象是在一定条件下的热力学上最稳定的结构,因此它的高级结构的形成遵循“自我装配”的原则,可见基因工程的产物---伸展的肽链总是自然地装配成天然构象。

⒘蛋白质的四级结构是第四度空间的蛋白质结构,即蛋白质结构因时间而变化的关系。

⒙两条单独肽链经链间二硫键交联,组成蛋白质分子,这两条肽链是蛋白质的亚基。

⒚含有四个二硫键的胰核糖核酸酶,若用巯基乙醇和尿素使其还原和变性,由于化学键遭到破坏和高级结构松散,已经无法恢复其原有功能。

⒛二硫键和蛋白质的三级结构密切有关,因此没有二硫键的蛋白质就没有三级结构。

三、填空题

⒈蛋白质之所以出现各种内容丰富的构象是因为键和键能有不同程度的转动。

⒉在蛋白质分子中相临氨基酸残基的β-碳原子如具有侧链会使α螺旋不稳定。因此当、

和三种氨基酸相临时,回破坏α螺旋。

⒊在α螺旋中C=O和N-H之间形成的氢键最稳定,因为这三个原子以排列。

⒋Pauling等人提出的蛋白质α螺旋模型,每圈螺旋包含个氨基酸残基,高度为,每

个氨基酸残基沿轴上升,并沿轴旋转周,天然蛋白质分子中的α-螺旋大都属于手螺旋。

⒌胶原蛋白是由股肽链组成的超螺旋结构,并含有稀有的与残基。

⒍当蛋白质的非极性侧链避开水时,疏水作用导致自由能;此时环境水的熵。

⒎一般来说,球状蛋白质分子的氨基酸侧链位于分子内部,性氨基酸侧链位于分子

表面。

⒏两条相当伸展的肽链(或同一肽链的两个伸展的片段)之间形成氢键的结构单元称为。

⒐维持蛋白质构象的化学键有、、、、和。

⒑四级结构蛋白质中每个具有三级结构的球蛋白称为,它们之间是靠键联系在一起的。

⒒明胶是的部分水解产物。

⒓蛋白质二级结构的三种基本类型是、和,而胶原蛋白的二级结构是一种。

⒔蛋白质存在的超二级结构的三种基本组合形式为、和。

四、名词解释

⒈肽单位;⒉肽平面;⒊亚基;⒋结构域;⒌超二级结构;⒍桑格反应(Sanger reaction);

⒎艾德曼反应(Edman reaction);

五、问答题

⒈有一球状蛋白质分子,在pH7的水溶液中能折叠成一定的空间结构,通常非极性氨基酸侧链位

于分子内部形成疏水核,极性氨基酸侧链位于分子外部形成亲水面。问:

⑴Val、Pro、Phe、Asp、Lys、Ile和His中哪些氨基酸侧链位于分子内部?哪些氨基酸位于分子外

部?

⑵为什么球状蛋白质分子外部和内部都可发现Gly和Ala?

⑶虽然Ser、Thr、Asn、Gln是极性的,为什么它们位于分子内部?

⑷在球状蛋白质分子的内部还是外部能找到Cys,为什么?

⒉一系列球状的单体蛋白质分子,相对分子量从10,000到100,000,随着相对分子量的增加,亲水

性与疏水性氨基酸的比率将会发生什么变化?

⒊α螺旋的稳定性不仅取决于肽链内部的氢键,而且还与氨基酸侧链的性质有关。室温下,在溶液

中下列多聚氨基酸哪些能形成α螺旋?哪些能形成其他规则的结构?哪些能形成无规则的结构?并说明其理由。

⑴多聚亮氨酸,pH7;⑵多聚异亮氨酸,pH7;⑶多聚精氨酸,pH7;⑷多聚精氨酸,pH13;⑸多

聚谷氨酸,pH1.5;⑹多聚苏氨酸,pH7;⑺多聚羟脯氨酸,pH7

⒋某一蛋白质的多肽链有一些区段为α-螺旋构象,另一些区段为β-折叠构象,该蛋白质的相对分

子质量为240,000,多肽链的外形长度为5.06×10-5cm,试计算多肽链中α螺旋构象占多肽链分子的百分数。(蛋白质的平均分子量按110计算)

⒌什么是蛋白质的二级结构?有哪几种类型?α-螺旋和β折叠各有何特色?

⒍什么是蛋白质的三级结构?有何特点?

⒎胶原蛋白的组成和构象有何特点?

⒏举例说明蛋白质三级结构决定于它的氨基酸顺序。

数据结构习题(,,章)

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第四章串 一.选择题 1.若串S='software',其子串的数目是() A.8 B.37 C.36 D.9 2.设有两个串p和q,求q在p中首次出现的位置的运算称作() A.连接B.模式匹配C.求串长D.求子串 3.设字符串S1=“ABCDEFG”,S2=“PQRST”,则运算: S=CONCAT(SUBSTR(S1,2,LEN(S2));SUBSTR(S1,LEN(S2),2));后的串值为() A.A BCDEF B.BCDEFG C.BCDPQRST D. BCDEFEF 4.下面的说法中,只有()是正确的 A.串是一种特殊的线性表B.串的长度必须大于零 C.串中元素只能是字母D.空串就是空白串 5.两个字符串相等的条件是() A.两串的长度相等 B.两串包含的字符相同 C.两串的长度相等,并且两串包含的字符相同 D.两串的长度相等,并且对应位置上的字符相同 二.填空题 1.串“ababcbaababd”的next函数值为,nextval函数值为。2.子串的长度为。 第五章数组和广义表 一.选择题 1.设有数组A[i,j],数组的每个元素长度为3字节,i的值为1 到8 ,j的值为1 到10,数组从内存首地址BA开始顺序存放,当用以列为主存放时,元素A[5,8]的存储首地址为( ) A. BA+141 B. BA+180 C. BA+222 D. BA+225 2.假设以行序为主序存储二维数组A=array[1..100,1..100],设每个数据元素占2个存储单元,基地址为10,则LOC[5,5]=() A. 808 B. 818 C. 1010 D. 1020 3.对稀疏矩阵进行压缩存储目的是() A.便于进行矩阵运算B.便于输入和输出C.节省存储空间D.降低运算的时间复杂度 4.假设以三元组表表示稀疏矩阵,则与如图所示三元组表对应的4×5的稀疏矩阵是(注:矩阵的行列下标均从1开始)()

生物化学第一章蛋白质习题含答案

蛋白质习题 一、是非题 1.所有蛋白质分子中N元素的含量都是16%。 2.蛋白质是由20种L-型氨基酸组成,因此所有蛋白质的分子量都一样。 3.蛋白质构象的改变是由于分子内共价键的断裂所致。 4.氨基酸是生物体内唯一含有氮元素的物质。 5.组成蛋白质的20种氨基酸分子中都含有不对称的α-碳原子。 6.用凝胶电泳技术分离蛋白质是根据各种蛋白质的分子大小和电荷不同。 7.蛋白质分子的亚基就是蛋白质的结构域。 8.在酸性条件下茚三酮与20种氨基酸部能生成紫色物质。 9.蛋白质变性是其构象发生变化的结果。 10.脯氨酸不能维持α-螺旋,凡有脯氨酸的部位肽链都发生弯转。 11.蛋日质的空间结构在很大程度上是由该蛋白质的一级结构决定的。 12.胶原蛋白在水中煮沸转变为明胶,是各种氨基酸的水溶液。 13.蛋白质和酶原的激活过程说明蛋白顺的一级结构变化与蛋白质的功能无关。 14.利用盐浓度的不同可以提高或降低蛋白质的溶解度。 15.血红蛋白比肌红蛋白携氧能力高.这是因为它有多个亚基。

二、填空题 1.20种氨基酸中是亚氨基酸.它可改变α-螺旋方向。 2.20种氨基酸中除外都有旋光性。 3.20种氨基酸中和分子量比较小而且不含硫,在折叠的多肽链中能形成氢键。 4.20种氨基酸中的一个环氮上的孤对电子,像甲硫氨酸一样,使之在血红蛋白分子中与铁离子结合成为配位体。 5.球蛋白分子外部主要是基团.分子内部主要是基团。 6.1953年英国科学家桑耳等人首次完成牛胰岛素的测定,证明牛胰岛素由条肽链共个氨基酸组成。 7.测定蛋白质浓度的方法有、、 8.氨基酸混合物纸层析图谱最常用的显色方法是 9.用紫外光吸收法测定蛋白质含量的依据是所有的蛋白质分子中都含有、、和三种氨 基酸。 10.1965年中国科学家完成了由53个氨基酸残基组成的的人工合成。 11.目前已知的蛋白质二级结构有、、、和几种基本形式。

数据结构课后习题答案第四章

第四章 一、简述下列每对术语的区别: 空串和空白串;串常量和串变量;主串和子串;静态分配的顺序串和动态分配的顺序串;目标串和模式串;有效位移和无效位移。 答: ●空串是指不包含任何字符的串,它的长度为零。 空白串是指包含一个或多个空格的串,空格也是字符。 ●串常量是指在程序中只可引用但不可改变其值的串。 串变量是可以在运行中改变其值的。 ●主串和子串是相对的,一个串中任意个连续字符组成的串就是这个串的子串,而包含子串的串就称为主串。 ●静态分配的顺序串是指串的存储空间是确定的,即串值空间的大小是静态的,在编译时刻就被确定。 动态分配的顺序串是在编译时不分配串值空间,在运行过程中用malloc和free等函数根据需要动态地分配和释放字符数组的空间(这个空间长度由分配时确定,也是顺序存储空间)。 ●目标串和模式串:在串匹配运算过程中,将主串称为目标串,而将需要匹配的子串称为模式串,两者是相对的。 ●有效位移和无效位移:在串定位运算中,模式串从目标的首位开始向右位移,每一次合法位移后如果模式串与目标中相应的字符相同,则这次位移就是有效位移(也就是从此位置开始的匹配成功),反之,若有不相同的字符存在,则此次位移就是无效位移(也就是从此位置开始的匹配失败)。 二、假设有如下的串说明: char s1[30]="Stocktom,CA", s2[30]="March 5 1999", s3[30], *p; (1)在执行如下的每个语句后p的值是什么? p=stchr(s1,'t'); p=strchr(s2,'9'); p=strchr(s2,'6'); (2)在执行下列语句后,s3的值是什么? strcpy(s3,s1); strcat(s3,","); strcat(s3,s2); (3)调用函数strcmp(s1,s2)的返回值是什么?

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数据结构复习题三

数据结构练习题 第一章绪论 一.选择题 1、在数据结构的讨论中把数据结构从逻辑上分为()。 A.内部结构与外部结构 B.静态结构与动态结构 C.线性结构与非线性结构 D.紧凑结构与非紧凑结构 2、采用线性链表表示一个向量时,要求占用的存储空间地址()。A: 必须是连续的 B 部分地址必须是连续的 C: 一定是不连续的C: 可连续可不连续 3、采用顺序搜索方法查找长度为n的顺序表时,搜索成功的平均搜索长度为()。 A: n B: n/2 C: (n-1)/2 D: (n+1)/2 4、在一个单链表中,若q结点是p结点的前驱结点,若在q与p之间插入结点s,则执行()。 A: s→next = p→next;p→next = s; B: p→next= s; s→next = q; C: p→next = s→next;s→next = p;D: q→next= s;s→next= p; 8.下面程序段的时间复杂度为____________。 for(int i=0; i

二.填空题 1.通常,评价一个算法有正确性、健壮性、_________、时间复杂度、空间复杂度五个方面。 2.在数据结构中,数据的逻辑结构有线性结构、图结构、________________、_______________四种,物理实现上有顺序结构、索引结构、___________、_____________四种。 第三章线性表 一.选择题 1.在一个单链表HL中,若要向q所指结点之后插入一个指针p指向的结点,则执行. A. HL=p; p->next=HL B. P->next=HL; HL=p C. P->next=q->next; q->next=p D. P->next=q->next; q=p->next 2.在一个长度为n的顺序存储线性表中,向第i个元素(1≤i≤n+1)之前插入一个新元素时,需要从后向前依次后移个元素。 A、n-i B、n-i+1 C、n-i-1 D、i 3.在一个长度为n的顺序存储线性表中,删除第i个元素(1≤i≤n+1)时,需要从前向后依次前移个元素。 A、n-i B、n-i+1 C、n-i-1 D、i 4.在一个长度为n的线性表中顺序查找值为x的元素时,查找时的平均查找长度(即x同元素的平均比较次数,假定查找每个元素的概率都相等)为。 A、n B、n/2 C、(n+1)/2 D、(n-1)/2 5.在一个单链表HL中,若要向表头插入一个由指针p指向的结点,则执行。 A、HL = p; p->next = HL; B、p->next = HL; HL = p; C、p->next = HL; p = HL; D、p->next = HL->next; HL->next = p; 6.在一个单链表HL中,若要在指针q所指的结点的后面插入一个由指针p所指的结点,则执行。 A、q->next = p->next ; p->next = q; B、p->next = q->next; q = p;

SWISS-MODEL_蛋白质结构预测教程

SWISS-MODEL 蛋白质结构预测 SWISS-MODEL是一项预测蛋白质三级结构的服务,它利用同源建模的方法实现对一段未知序列的三级结构的预测。该服务创建于1993年,开创了自动建模的先河,并且它是讫今为止应用最广泛的免费服务之一。 同源建模法预测蛋白质三级结构一般由四步完成: 1. 从待测蛋白质序列出发,搜索蛋白质结构数据库(如PDB,SWISS-PROT等),得到许多相似序列 (同源序列),选定其中一个(或几个)作为待测蛋白质序列的模板; 2. 待测蛋白质序列与选定的模板进行再次比对,插入各种可能的空位使两者的保守位置尽量对齐; 3. 建模:调整待测蛋白序列中主链各个原子的位置,产生与模板相同或相似的空间结构——待测蛋白 质空间结构模型; 4. 利用能量最小化原理,使待测蛋白质侧链基团处于能量最小的位置。 最后提供给用户的是经过如上四步(或重复其中某几步)后得到的蛋白质三级结构。 SWISS-MODEL工作模式 SWISS-MODEL服务器是以用户输入信息的最小化为目的设计的,即在最简单的情况下,用户仅提供一条目标蛋白的氨基酸序列。由于比较建模程序可以具有不同的复杂性,用户输入一些额外信息对建模程序的运行有时是有必要的,比如,选择不同的模板或者调整目标模板序列比对。该服务主要有以下三种方式: ?First Approach mode(简捷模式):这种模式提供一个简捷的用户介面:用户只需要输入一条氨基酸序列,服务器就会自动选择合适的模板。或者,用户也可以自己指定模板(最多5条),这些模板可以来自ExPDB 模板数据库(也可以是用户选择的含坐标参数的模板文件)。如果一条模板与提交的目标序列相似度大于25%,建模程序就会自动开始运行。但是,模板的可靠性会随着模板与目标序列之间的相似度的降低而降低,如果相似度不到50%往往就需要用手工来调整序列比对。这种模式只能进行大于25个残基的单链蛋白三维结构预测。 ?Alignment Interface(比对界面):这种模式要求用户提供两条已经比对好的序列,并指定哪一条是目标序列,哪一条是模板序列(模板序列应该对应于ExPDB模板数据库中一条已经知道其空间结构的蛋白序列)。服务器会依据用户提供的信息进行建模预测。 ?Project mode(工程模式):手工操作建模过程:该模式需要用户首先构建一个DeepView工程文件,这个工程文件包括模板的结构信息和目标序列与模板序列间的比对信息。这种模式让用户可以控制许多参数,例如:模板的选择,比对中的缺口位置等。此外,这个模式也可以用于“first approach mode简捷模式”输出结果的进一步加工完善。 此外,SWISS-MODEL还具有其他两种内容上的模式: ?Oligomer modeling(寡聚蛋白建模):对于具有四级结构的目标蛋白,SWISS-MODEL提供多聚模板的模式,用于多单体的蛋白质建模。这一模式弥补了简捷模式中只能提交单个目标序列,不能同时预测两条及以上目标序列的蛋白三维结构的不足。 ?GPCR mode(G蛋白偶联受体模式):是专门对7次跨膜G蛋白偶联受体的结构预测。

【清华】3蛋白质的三维结构习题昶公版

蛋白质的三维结构习题 2004010310 丁昶环41 5 8 22? 24 28 1. 含有685个氨基酸残基的单一一条多肽链的蛋白质的近似相对分子质量是多少? 答:128*685-684*18=75368 2. 氨基酸的定量分析表明牛血清白蛋白含有0.58%的色氨酸(色氨酸的相对分子质量为204)。 (a)试计算牛血清白蛋白的最小分子量(假设每个蛋白分子只含有一个色氨酸残基); (b)凝胶过滤测得的牛血清白蛋白的相对分子质量为70 000,试问血清白蛋白分子含有几个色氨酸残基? 答:(a)最小分子量为204/0.0058=35172。 (b)70000/35172=2,所以有两个色氨酸残基。 3. 胃液(pH=1.5)的胃蛋白酶的等电点约为1,远比其他蛋白质低。试问等电点如此低的胃蛋白酶必须存在大量的什么样的官能团?什么样的氨基酸才能提供这样的基团? 答:存在大量的羧基。谷氨酸和天冬氨酸能提供这样的基团。 4. 组蛋白是真核细胞的核蛋白,它们与具有很多磷酸基团的脱氧核苷酸紧密结合在一起,组蛋白的等电点非常高,约为10.8,试问组蛋白含有大量的什么样的氨基酸?这些氨基酸残基靠什么方法使得组蛋白与DNA紧密结合? 答:含有大量的含碱性基团的氨基酸。可能有以下原因:1、这些氨基酸的碱性基团与脱氧核苷酸的磷酸基团形成酯键,使得二者紧密结合。2、碱性基团和磷酸基团带不同电荷,之间的离子相互作用时二者紧密结合。 5画出三肽谷胱甘肽的化学结构式,其肽健形成中有什么特点?谷胱甘肽的还原型与氧化型之间有什么区别? 答: 甘氨酸的γ羧基与半胱氨酸的α氨基形成肽键,而不是用α羧基。 两个还原型谷胱甘肽的巯基脱氢缩合成二硫键形成一个氧化型的谷胱甘肽。 6. 已知某蛋白是由一定数量的链内二硫键连接的两个多肽链组成的。1.00g该蛋白样品可以与25.0mg还原型谷胱甘肽(GSH,相对分子质量MW=307)反应。 (a)该蛋白的最小相对分子质量是多少? (b)如果该蛋白的真实相对分子质量为98 240,那么每个分子中含有几个二硫键? (c)多少毫克的巯基乙醇(MW=78.0)可以与起始的1.00g该蛋白完全反应?

数据结构第1阶段练习题

江南大学现代远程教育第一阶段练习题及答案 考试科目:《数据结构》第一章至第四章(总分100分) ______________学习中心(教学点)批次:层次: 专业:学号:身份证号: 姓名:得分: 一、选择题(每题3分,共30分) 1、在树形结构中,数据元素间存在()的关系。 A、一对一B、一对多C、多对多D、除同属一个集合外别无关系 2、下列说法中错误的是()。 A、数据对象是数据的子集 B、数据元素间关系在计算机中的映象即为数据的存储结构 C、非顺序映象的特点是借助指示元素存储地址的指针来表示数据元素间逻辑关系 D、抽象数据类型指一个数学模型及定义在该模型上的一组操作 3、下列不属算法特性的是()。 A、有穷性B、确定性C、零或多个输入D、健壮性 4、在长为n的顺序表中删除一个数据元素,平均需移动()个数据元素。 A、n B、n-1 C、n/2 D、(n-1)/2 5、若某线性表最常用的操作是存取任一指定序号的元素和在最后进行插入和删除运算,则利用()存储方式最节省时间。 A、顺序表B、双链表C、带头结点的双向循环链表D、单循环链表 6、在一个可存放n个数据元素的顺序栈中,假设以高地址端为栈底,以top为栈顶指针,当向栈中压入一个数据元素时,top的变化是()。 A、不变B、top=n C、top++ D、top-- 7、设在一不带头结点的链队列中,front和rear分别为其队头和队尾指针,则删除一个结点的操作是()。 A、rear=front->next B、rear=rear->next C、front=front->next D、front=rear->next 8、判定一个栈顶指针为S且不带头结点的链栈为空栈的条件是()。 A、S B、S->next C、S->next==NULL D、!S 9、设在一不带头结点的链队列中,front和rear分别为其队头和队尾指针,则判定该队中只有一个结点的条件是()。 A、front->next B、rear->next C、front==rear D、front!=rear 10、串的长度是指()。

数据结构 习题

绪论和线性表习题 一、选择题 1.在一个单链表中,若p↑结点不是最后结点,在p↑之后插入s↑结点,则实行( )。 A. s->next=p;p->next=s; B、s->next=p->next; p->next=s; C. s->next=p->next;p=s; D. p->next=s;s->next=p; 2.与单链表相比,双链表优点之一( ). A.插入删除操作更简单. B.可随机访问 C.可省略表头指针和表尾指针 D、顺序访问相临结点更灵活 3.在长度为n的顺序表的第i(1≤i≤n+1)个位置上插入一个元素,元素的移动次数为( ) A、 n-i+1 B.n-i C.i D.i-1 4.对于只在表的首、尾两端进行插入操作的线性表,宜采用的存储结构为( ) A.顺序表 B.用头指针表示的单循环链表 C、用尾指针表示的单循环链表 D.单链表 5.在需要经常查找结点的前驱与后继的场合中,使用( )比较合适。 A.单链表B、双链表 C.顺序表 D.循环链

表 6.下面关于线性表的叙述中,错误的为( ) A.顺序表使用一维数组实现的线性表 B.顺序表必须占用一片连续的存储单元 C.顺序表的空间利用率高于链表 D、在链表中,每个结点只有一个链域 7.带头结点head的单链表为空的判断条件是( ) A. head=NUIL B、head->next=NUIL C. head->next=head D. head!=NUIL 8.线性表通常采用两种存储结构是( ) A、顺序存储结构和链式存储结构 B.散列方式和索引方式 C.链表存储结构和数组 D.线性存储结构和非线性存储结构 9.线性表采用链式存储时,结点的存储地址() A.必须是不连续的 B、连续与否均可 C.必须是连续的 D.和头结点的存储地址相连续 10.将长度为n的单链表链接在长度为m的单链表之后的算法的时间复杂度为() A.O(1) B.O(n) C、 O(m) D.O(m+n)

生物化学第一章蛋白质习题含答案

蛋白质习题 一、就是非题 1.所有蛋白质分子中N元素的含量都就是16%。 2.蛋白质就是由20种L-型氨基酸组成,因此所有蛋白质的分子量都一样。 3.蛋白质构象的改变就是由于分子内共价键的断裂所致。 4.氨基酸就是生物体内唯一含有氮元素的物质。 5.组成蛋白质的20种氨基酸分子中都含有不对称的α-碳原子。 6.用凝胶电泳技术分离蛋白质就是根据各种蛋白质的分子大小与电荷不同。 7.蛋白质分子的亚基就就是蛋白质的结构域。 8.在酸性条件下茚三酮与20种氨基酸部能生成紫色物质。 9.蛋白质变性就是其构象发生变化的结果。 10.脯氨酸不能维持α-螺旋,凡有脯氨酸的部位肽链都发生弯转。 11.蛋日质的空间结构在很大程度上就是由该蛋白质的一级结构决定的。 12.胶原蛋白在水中煮沸转变为明胶,就是各种氨基酸的水溶液。 13.蛋白质与酶原的激活过程说明蛋白顺的一级结构变化与蛋白质的功能无关。 14.利用盐浓度的不同可以提高或降低蛋白质的溶解度。 15.血红蛋白比肌红蛋白携氧能力高.这就是因为它有多个亚基。 二、填空题

1.20种氨基酸中就是亚氨基酸.它可改变α-螺旋方向。 2.20种氨基酸中除外都有旋光性。 3.20种氨基酸中与分子量比较小而且不 含硫,在折叠的多肽链中能形成氢键。 4.20种氨基酸中的一个环氮上的孤对电子,像甲硫氨酸一样,使之在血红蛋白分子中与铁离子结合成为配位体。 5.球蛋白分子外部主要就是基团.分子内部主要就是基团。 6.1953年英国科学家桑耳等人首次完成牛胰岛素的测定,证明牛胰岛素由条肽链共个氨基酸组成。 7.测定蛋白质浓度的方法有、、 8.氨基酸混合物纸层析图谱最常用的显色方法就是 9.用紫外光吸收法测定蛋白质含量的依据就是所有的蛋白质分 子中都含有、、与三种 氨基酸。 10.1965年中国科学家完成了由53个氨基酸残基组成的的人工合成。 11.目前已知的蛋白质二级结构有、、、与几种基本形式。 12.维持蛋白质三级结构的作用力就

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当网络不是很畅通时或并不急于得到较多数量的蛋白质序列时,可采用EMAIL方式进行序列检索。? 蛋白质基本性质分析? 蛋白质序列的基本性质分析是蛋白质序列分析的基本方面,一般包括蛋白质的氨基酸组成,分子质量,等电点,亲水性,和疏水性、信号肽,跨膜区及结构功能域的分析等到。蛋白质的很多功能特征可直接由分析其序列而获得。例如,疏水性图谱可通知来预测跨膜螺旋。同时,也有很多短片段被细胞用来将目的蛋白质向特定细胞器进行转移的靶标(其中最典型的例子是在羧基端含有KDEL序列特征的蛋白质将被引向内质网。WEB中有很多此类资源用于帮助预测蛋白质的功能。? 疏水性分析? 位于ExPASy的ProtScale程序(?)可被用来计算蛋白质的疏水性图谱。该网站充许用户计算蛋白质的50余种不同属性,并为每一种氨基酸输出相应的分值。输入的数据可为蛋白质序列或SWISSPROT数据库的序列接受号。需要调整的只是计算窗口的大小(n)该参数用于估计每种氨基酸残基的平均显示尺度。? 进行蛋白质的亲/疏水性分析时,也可用一些windows下的软件如,bioedit,dnamana等。? 跨膜区分析? 有多种预测跨膜螺旋的方法,最简单的是直接,观察以20个氨基酸为单位的疏水性氨基酸残基的分布区域,但同时还有多种更加复杂的、精确的算法能够预测跨膜螺旋的具体位置和它们的膜向性。这些技术主要是基于对已知

第四章蛋白质三维结构

第四章蛋白质的三维结构 一、选择题 ⒈维持蛋白质二级结构的主要化学键是:( A 、盐键; B 、疏水键; C 、二硫键; D 、氢键; E 、范德华力 ⒉蛋白质的构象特征主要取决于:( A 、氨基酸的组成、顺序和数目; B 、氢键、盐键、范德华力和疏水作用; C 、温度、离子强度和 pH 等环境条件; D 、肽链间及肽链内的二硫键; E 、各氨基酸之间的肽链 ⒊在一个肽平面中含有的原子数为:( A 、 4; B 、 5; C 、 6; D 、 7; E 、 8 ⒋具有四级结构的蛋白质的特征是:( A 、分子中必定含有辅基; B 、含有两条或两条以上的多肽链; C 、每条多肽链都具有独立的生物学活性; D 、依靠肽链维持结构的稳定性; E 、以上都不是 ⒌下列有关α-螺旋的叙述哪个是错误的? A 、分子内的氢键使α-螺旋稳定; B 、减弱 R 基团间不利的相互作用使α螺旋稳定; C 、疏水作用使α螺旋中断; D 、在某些蛋白质中, α螺旋是二级结构中的一种类型; E 、脯氨酸和甘氨酸残基使α螺旋中断 ⒍下列有关β折叠的叙述哪个是错误的?( A 、球状蛋白质中无β折叠的结构; B 、β折叠靠链间氢键而稳定; C 、它的氢键是肽链的 C=O和 N-H 间形成的; D 、α-角蛋白可以通过加热处理而转变成β折叠的结构; E 、β-折叠有平行的β折叠和反平行的β折叠

⒎具有四级结构的蛋白质特征是:( A 、分子中必定含有辅基; B 、含有两条或两条以上的肽链; C 、每条多肽链都具有独立的生物学活性; D 、依靠肽链维持结构的稳定性; E 、以上都不是 ⒏具有四级结构的蛋白质是:( A 、胰岛素; B 、核糖核酸酶; C 、血红蛋白; D 、肌红蛋白; E 、胰凝乳蛋白 ⒐在四级结构的蛋白质分子中,每个具有三级结构的多肽链是:( A 、辅基; B 、辅酶; C 、亚基; D 、寡聚体; E 、肽单位 ⒑关于蛋白质亚基的描述,其中正确的是:( A 、一条多肽链卷曲成螺旋结构; B 、两条以上多肽链卷曲成二级结构; C 、两条以上多肽链与辅基与辅基结合成蛋白质; D 、每个亚基都有各自的三级结构; E 、以上都是正确 ⒒胶原蛋白组成中出现的不寻常氨基酸是( A 、乙酰氨基酸; B 、羟基氨基酸; C 、甲基氨基酸; D 、 D 赖氨酸 ⒓一种非常稳定的小分子量蛋白质的化学结构中,经常是( A 、含有大量的二硫键; B 、含有丰富的甘氨酸; C 、有较多络合金属离子; D 、含有疏水氨基酸⒔形成稳定的肽链空间结构, 一个重要原因是肽键中的四个原子以及和它相临的两个α碳原子处于 ( A 、不断绕动状态; B 、可以相对自由旋转; C 、同一平面; D 、随不同外界环境而变化的状态⒕在寡聚蛋白质中,亚基间的立体排布、相互作用以及接触部位间 的空间结构称之为( A 、三级结构; B 、缔合现象; C 、四级结构; D 、变构现象

数据结构课后习题第四章

第四章串 习题4 一、选择题 1.串是一种分外的线性表,其分外性体现在()。 A.可以顺序存储 B.数据元素是一个字符 C.可以连接存储 D.数据元素可以是多个字符 2.有两个串P和Q,求P在Q中首次出现的位置的运算称为()。 A.模式匹配 B.联接 C.求子串 D.求串长 3.设S为一个长度为n的字符串,其中的字符各不相同,则S中的互异的非通俗子串(非空且例外于S本身)的个数为()。 A.n2 B.(n2/2)+(n/2) C.(n2/2)+(n/2)-1 D.(n2/2)-(n/2)-1 4.设串s1=“ABCDEFG”,s2=“PQRST”,函数concat(x,y)返回x和y串的连接串,subString(s,i,j)返回串s的从序号i的字符开始的j个字符组成的子串,Strlength(s)返回串s的长度,则concat(subString(s1,2,Strlength (s2)),subString(s1,Strlength(s2),2)))的结果串是()。 A.BCDEF B.BCDEFG C.BCPQRST D.BCDEFEF 5.顺序串中,根据空间分配方式的例外,可分为()。 A.直接分配和间接分配 B.静态分配和动态分配 C.顺序分配和链式分配 D.随机分配和不变分配 6.设串S=“abcdefgh”,则S的所有非通俗子串(除空串和S自身的串)的个数是()。

A.8 B.37 C.36 D.35 7.设主串的长度为n,模式串的长度为m,则串匹配的KMP算法时间复杂度是()。 A.O(m) B.O(n) C.O(m+n) D.O(n*m) 8.已知串S=“aaab”,其next数组值为()。 A.0123 B.1123 C.1231 D.1211 二丶填空题 1.在空串和空格串中,长度不为0的是()。 2.空格串是指(),其长度等于()。 3.按存储结构的例外,串可分为()、()和()。 4.C语言中,以字符()表示串值的终结。 5.在块链串中,为了提高存储密度,应该增大()。 6.假设每个字符占1个字节,若结点大小为4个字节的链串的存储密度为50%,则其每个指针占()个字节。 7.串操作虽然较多,但都可以通过五中基本操作()、()、()、()和()构成的最小子集中的操作来实现。 8.设串S=“Ilikecomputer.”,T=“com”,则Length(S)=(),Index(S,T,1)=()。 9.在KMP算法中,next[j]只与()串有关,而与()串无关。 10.字符串“ababaaab”的nextval函数值为()。 11.两个字符串相等的充分必要条件是()。 12.实现字符串复制的函数strcpy为:

生物化学试题及答案(1)

生物化学试题(1) 第一章蛋白质的结构与功能 [测试题] 一、名词解释:1.氨基酸2.肽3.肽键4.肽键平面5.蛋白质一级结构6.α-螺旋7.模序 8.次级键9.结构域10.亚基11.协同效应12.蛋白质等电点13.蛋白质的变性14.蛋白质的沉淀15.电泳 16.透析17.层析18.沉降系数19.双缩脲反应20.谷胱甘肽 二、填空题 21.在各种蛋白质分子中,含量比较相近的元素是____,测得某蛋白质样品含氮量为15.2克,该样品白质含量应为____克。 22.组成蛋白质的基本单位是____,它们的结构均为____,它们之间靠____键彼此连接而形成的物质称为____。 23.由于氨基酸既含有碱性的氨基和酸性的羧基,可以在酸性溶液中带____电荷,在碱性溶液中带____电荷,因此,氨基酸是____电解质。当所带的正、负电荷相等时,氨基酸成为____离子,此时溶液的pH值称为该氨基酸的____。 24.决定蛋白质的空间构象和生物学功能的是蛋白质的____级结构,该结构是指多肽链中____的排列顺序。 25.蛋白质的二级结构是蛋白质分子中某一段肽链的____构象,多肽链的折叠盘绕是以____为基础的,常见的二级结构形式包括____,____,____和____。 26.维持蛋白质二级结构的化学键是____,它们是在肽键平面上的____和____之间形成。27.稳定蛋白质三级结构的次级键包括____,____,____和____等。 28.构成蛋白质的氨基酸有____种,除____外都有旋光性。其中碱性氨基酸有____,____,____。酸性氨基酸有____,____。 29.电泳法分离蛋白质主要根据在某一pH值条件下,蛋白质所带的净电荷____而达到分离的目的,还和蛋白质的____及____有一定关系。 30.蛋白质在pI时以____离子的形式存在,在pH>pI的溶液中,大部分以____离子形式存在,在pH

第4章数据结构与算法习题与答案

第四章习题(P111-113) 一、复习题 1、试述数据和数据结构的概念及其区别。 数据是对客观事物的符号表示,是信息的载体;数据结构则是指互相之间存在着一种或多种关系的数据元素的集合。(P93) 2、列出算法的五个重要特征并对其进行说明。 算法具有以下五个重要的特征:有穷性:一个算法必须保证执行有限步之后结束。确切性:算法的每一步骤必须有确切的定义。输入:一个算法有0个或多个输入,以刻画运算对象的初始情况,所谓0个输入是指算法本身定除了初始条件。输出:一个算法有一个或多个输出,以反映对输入数据加工后的结果。没有输出的算法没有实际意义。可行性:算法原则上能够精确地运行,而且人们用笔和纸做有限次运算后即可完成。(P95) 3、算法的优劣用什么来衡量试述如何设计出优秀的算法。 时间复杂度空间复杂度(P97-98) 4、线性和非线性结构各包含哪些种类的数据结构线性结构和非线性结构各有什么特点 线性结构用于描述一对一的相互关系,即结构中元素之间只有最基本的联系,线性结构的特点是逻辑结构简单。所谓非线性结构是指,在该结构中至少存在一个数据元素,有两个或两个以上的直接前驱(或直接后继)元素。树型和图型结构就是其中十分重要的非线性结构,可以用来描述客观世界中广泛存在的层次结构和网状结构的关系。(P99-105) 5、简述树与二叉树的区别;简述树与图的区别。 树用来描述层次结构,是一对多或多对一的关系;二叉树(Binary Tree)是个有限元素的集合,该集合或者为空、或者由一个称为根(root)的元素及两个不相交的、被分别称为左子树和右子树的二叉树组成。二叉树是有序的,即若将其左、右子树颠倒,就成为另一棵不同的二叉树。图也称做网,是一种比树形结构更复杂的非线性结构。在图中,任意两个节点之间都可能相关,即节点之间的邻接关系可以是任意的,图表示的多对多的关系。(P102-P104) 6、请举出遍历算法在实际中使用的例子。 提示:根据实际生活中需要逐个访问处理的情况举例。 7、编写一个算法,统计在一个输入字符串中各个不同字符出现的频度。用适当的测试数据来验证这个算法。 提示:根据查找算法和串中求子串的算法,查找输入串中以单个字符形式的子串。 8、若对有n个元素的有序顺序表和无序顺序表进行顺序搜索,试就下列三种情况分别讨论两者在等搜索概率时的平均搜索长度是否相同 (1) 搜索失败; (2) 搜索成功,且表中只有一个关键码等于给定值k的对象; (3) 搜索成功,且表中有若干个关键码等于给定值k的对象,要求一次搜索找出所有对象。

生物化学第一章蛋白质习题

第一章蛋白质 选择题 1.某一溶液中蛋白质的百分含量为45%,此溶液的蛋白质氮的百分浓度为:E A.8.3% B.9.8% C.6.7% D.5.4% E.7.2% 2.下列含有两个羧基的氨基酸是:D A.组氨酸 B.赖氨酸 C.甘氨酸 D.天冬氨酸 E.色氨酸 3.下列哪一种氨基酸是亚氨基酸:A A.脯氨酸 B.焦谷氨酸 C.亮氨酸 D.丝氨酸 E.酪氨酸 4.维持蛋白质一级结构的主要化学键是:C A.离子键 B.疏水键 C.肽键 D.氢键 E.二硫键 5.关于肽键特点的错误叙述是:E A.肽键中的C-N键较C-N单键短 B.肽键中的C-N键有部分双键性质 C.肽键的羰基氧和亚氨氢为反式构型 D.与C-N相连的六个原子处于同一平面上 E.肽键的旋转性,使蛋白质形成各种立体构象 6.关于蛋白质分子三级结构的描述,其中错误的是:B A.天然蛋白质分子均有这种结构 B.有三级结构的多肽链都具有生物学活性 C.三级结构的稳定性主要是次级键维系 D.亲水基团聚集在三级结构的表面 E.决定盘曲折叠的因素是氨基酸残基

7.具有四级结构的蛋白质特征是:E A.依赖肽键维系四级结构的稳定性 B.在三级结构的基础上,由二硫键将各多肽链进一步折叠、盘曲形成 C.每条多肽链都具有独立的生物学活性 D.分子中必定含有辅基 E.由两条或两条以上具有三级结构的多肽链组成 8.含有Ala,Asp,Lys,Cys的混合液,其pI依次分别为6.0,2.77,9.74,5.07,在pH9环境中电泳分离这四种氨基酸,自正极开始,电泳区带的顺序是:B A.Ala,Cys,Lys,Asp B.Asp,Cys,Ala,Lys C.Lys,Ala,Cys,Asp D.Cys,Lys,Ala,Asp E.Asp,Ala,Lys,Cys 9.变性蛋白质的主要特点是:D A.粘度下降 B.溶解度增加 C.不易被蛋白酶水解 D.生物学活性丧失 E.容易被盐析出现沉淀 10.蛋白质分子在280nm处的吸收峰主要是由哪种氨基酸引起的:B A.谷氨酸 B.色氨酸 C.苯丙氨酸 D.组氨酸 E.赖氨酸 第2章核酸的结构与功能 选择题 1.下列哪种碱基只存在于RNA而不存在于DNA:A A.尿嘧啶 B.腺嘌呤 C.胞嘧啶 D.鸟嘌呤 E.胸腺嘧啶 2.DNA变性是指:D A.分子中磷酸二酯键断裂

蛋白质三维结构预测和结果分析

蛋白质三维结构预测和结果分析 姓名________ 学号______________ 组号_____日期________年___月___日 1.结构预测基本概念 1)参阅王吉龙2007文章,简述蛋白质三维空间结构同源模建的基本原理和步骤。 2)参阅文献(Kelley et al., 2015),说明利用Phyre2进行蛋白质结构预测的原理、方法和 结果分析。 2.癌胚抗原CEAM5_HUMAN结构预测和分析实例 1)搜索网络信息资源,简述癌胚抗原(Carcinoembryonic antigen, CEA)的研究和应 用背景。查看UniProt/Swiss-Prot数据库中人癌胚抗原CEAM5_HUMAN序列注释 信息和相关链接,说明该蛋白质分子的序列特征、功能、组织特异表达。 2)从PDB数据库中下载癌胚抗原CEAM5_HUMAN分子N端结构域二聚体晶体结构 2QSQ,选取A链并保存为2QSQ_A;从PDB数据库中下载免疫球蛋白抗体分子 高可变结构域1REI,选取A链并保存为1REI_A;比较1REI_A和2QSQ_A折叠 方式和二级结构,比较它们疏水内核的相同和差异。 3)根据文献(Bates et al, 1992)图1序列比对,找出2QSQ中与1REI_A中2个半胱 氨酸和1个色氨酸对应的3个残基,以此为基础进行结构叠合,计算均方根误差。 4)查看2QSQ_A分子表面与抗体结合区域三个回环,说明如何利用结构模拟信息为 下一步实验提供参考信息。 3.癌胚抗原CEA21_HUMAN结构预测和分析实例 1)检索UniProt/Swiss-Prot数据库,找出不同亚型CEA序列条目,根据注释信息,参阅 CEA专门网站(http://www.carcinoembryonic-antigen.de/),比较不同亚型CEA结构 域分布特征。 2)浏览UniProt数据库中收录的CEA21_HUMAN注释信息,找出其中恒定结构域。 3)利用Phyre2蛋白质结构预测网站,预测CEA21_HUMAN恒定结构域三维结构。 4)利用Investigator工具,对预测结果进行深入分析,比较不同位点的保守性和突变敏 感性,并与蛋白质预测网站PredictProtein所得结果进行比较。 4.课题相关蛋白质结构预测 1)以本人研究课题相关蛋白质或该蛋白质在其它物种中的同源蛋白为例,利用 Swiss-PDBViewer进行分析。 2)选取本人研究课题相关蛋白质或其中的某个结构域,以Phyre2网站进行结构预测, 并利用Investigator工具,对预测结果进行深入分析,比较不同位点的保守性和突变 敏感性。 参考文献 1.王吉龙,《癌胚抗原CEA三维空间结构同源模建》,2007, (hyttp://https://www.doczj.com/doc/de13805328.html,/reference/wang-jilong-cea.pdf). 2.Bates PA, Luo J, Sternberg MJ. A predicted three-dimensional structure for the

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