耐碳青霉烯类抗菌药物肠杆菌科细菌CRE（对亚胺培南、美罗培南和厄他培南中任一种耐药者）
多重耐药（泛耐药）铜绿假单胞菌
铜绿假单胞菌可以通过获得各种β-内酰胺酶编码基因、广谱或超广谱β-内酰胺酶、氨基糖苷类修饰酶、借助整合子qacEE基因对抗菌药物或消毒剂耐药。对5类抗菌药中的3类及以上药物耐药，为多重耐药株，包括头孢菌素类（如头孢他啶或头孢砒腭）、碳青霉烯类（如亚胺培南）、β-内酰胺酶抑制剂（如头孢哌酮/舒巴坦）、氟奎洛酮类（如环丙沙星）和氨基糖苷类（如阿米卡星）。若对以上抗菌药物均耐药，包括头孢砒腭、头孢他啶、亚胺培南、美罗培南、哌拉西林/三唑巴坦、环丙沙星、左氧氟沙星则称之为泛耐药铜绿假单胞菌（PDR-PA）。铜绿假单胞菌适宜在潮湿环境中生长，氧气湿化瓶、沐浴头、医疗器械等常有铜绿假单胞菌的污染，常常为造成医院内感染暴发的主要原因。
耐万古霉素肠球菌
肠球菌属通常存在于人体肠道和女性生殖道中，而且常常存在于环境中，这类细菌可造成感染。万古霉素常常作为治疗肠球菌属感染的最后有效抗菌药物，某些情况下，肠球菌属对万古霉素产生耐药（若MIC=16ug/ml，则肠球菌对万古霉素中敏；若16ug/ml∠MIC∠64ug/ml,则需应用E试验来确定肠球菌对万古霉素耐药；若MIC≥64ug/ml则确认为肠球菌对万古霉素耐药），这类细菌称为耐万古霉素肠球菌（VRE），大多数的VRE感染通常发生在医院内。
多重耐药（泛耐药）鲍曼不动杆菌
鲍曼不动杆菌通过质粒、转座子或整合子等可移动基因元件，获得对多种抗菌药物的耐药性。多重耐药鲍曼不动杆菌（MDR-AB）是指对5类抗菌药中的3类及以上药物耐药，为多重耐药菌株，包括头孢菌素类（如头孢他啶或头孢吡肟）、碳青霉烯类（如亚胺培南）、β-内酰胺酶抑制剂（如头孢哌酮/舒巴坦）、氟喹诺酮类（如环丙沙星）和氨基糖苷类（如阿米卡星）。若对以上看菌药物均耐药，包括头孢吡肟、头孢他啶、亚胺培南、美罗培南、哌拉西林/三唑巴坦、环丙沙星、左氧氟沙星则称之为泛耐药鲍曼不动杆菌（PDR-AB）（但不包括对多粘菌素及替加环素）。鲍曼不动杆菌科广泛定制与医院内各种干燥或潮湿物体表面（如窗帘、门把手、机械通气设备等）和人体皮肤，往往是造成该菌在医院内传播的重要原因。