3种炭疽菌P型ATP酶基因家族分析
孙董董1，2，林春花1，李博勋1，黄贵修1* 1中国热带农业科学院环境与植物保护研究所海南海口571101海南省热带农业有害生物检测监控重点实验室2华中农业大学植物科学技术学院，湖北武汉430070
【摘要】P型ATP酶是一类可以被ATP驱动其发生磷酸化的阳离子泵。利用TCDB（Transporter Classification Database）网站数据库中的P型ATP酶氨基酸序列对3种炭疽菌（禾谷炭疽、希金斯炭疽、胶孢炭疽）全基因组数据库进行搜索，结合结构域分析和进化树聚类分析，共找出候选P型ATP酶基因禾谷炭疽菌26个，希金斯炭疽菌37个，胶孢炭疽菌29个。对这些候选基因进行基因功能预测发现其主要参与转运Na+/K+、Ca2+、重金属离子以及磷脂的功能。利用MEME程序分析，从3种炭疽菌中均鉴定获得20个基序，其中有6个基序相同。这为深入研究炭疽菌P型ATP酶家族基因生物学功能奠定了基础。
【期刊名称】热带作物学报
【年(卷),期】2015(036)004
【总页数】9
【关键词】炭疽菌；P型ATP酶基因；生物信息；功能预测
doi10.3969/j.issn.1000-2561.2015.04.017
炭疽菌（Colletotrichum spp.）是一类重要的植物病原真菌，广泛分布于热带、亚热带和温带地区[1]，其种内变异较多，寄主范围广泛，包括蔬菜、牧草、果树、花卉等数十种重要的经济作物[2]。炭疽菌主要出现在春季和初夏,侵害木本植物的叶、花、枝、果实，其主要以分生孢子侵染,分生孢子依靠雨水传播,或者