Evaluation of blast induced ground vibrations from underground excavation at Karoun3area M.Ataei*
Ground vibrations are unavoidable in each rock blasting projects.The prediction of ground vibration components has a great importance in the minimisation of the environmental complaints. Estimating the particle velocity and other components of ground vibration with reliable approaches will be very useful in blast design.Peak particle velocity is the most important criterion for analysing dangers resulting from ground vibration.Up to now,researchers have proposed many different formulae to calculate this parameter,but none of them are applicable for all areas and based upon regional conditions such as geological,technical,geotechnical,rock mechanical and so on.Karoun3Project is located in southwest of Iran.The aim of this study is to predict peak particle velocity in this project.For this purpose,vibrations from the Karoun3 excavations were measured and the recorded data were statistically analysed and two empirical relationships with good correlation were established.
Keywords:Peak particle velocity,Blasting,Ground vibration
Introduction
Blast induced ground vibration from excavations is a fundamental problem in the mining,construction, quarrying pipeline industries.The excavation close to existing substructures or the ground surface presents problems especially when blasting is being carried out. The high intensity waves,which are generated and propagated through the rock medium,may still have large amplitudes when they reach the ground surface. The energy which is exhausted out of explosions causes rocks fragmentation as well as vibrations in nearby areas which lead to substantial harmful effects on human health and safety of nearby structures like buildings, dams,roads,railroads,natural slopes,etc.
With the general trend towards larger blasts,increased population and the spread of urban areas,vibrations problems and complaints have also increased.Con-sequently,litigation cases have developed between the civil and mining projects and the general public at an accelerating rate.
In many of civil and mining projects,controlled blasting is used in order to decrease ground vibrations in neighbouring structures,residual rock mass stability, cost reduction of reclamation,decrease in back break and the produced surface uniformity and pleasantness. Vibrations resulted from blasts in dams and under-ground power plants are very important whether in the construction phase or in the operation phase,and must be controlled in any possible way.In the vibrations resulting from blasting,some of the factors such as distance from blasting site and the geology character-istics of region(discontinuities,type of rocks,strength and quality of rocks,etc.)are uncontrollable.However, some other factors such as drilling and blasting patterns are controllable.1Thus,the drilling and blasting opera-tions must be executed in a way that the vibrations are in the standard range.
Karoun3is one of the national projects in Iran, having the most complexity and a lot of underground excavations in its scale,with more than1200000m3 overall excavations.All of underground excavations including power plant,tunnels,water conducting and access shafts are located in close distances from each other and their drilling operations have been carried out simultaneously.So,the blasts must be performed with careful consideration,and blasting design must be based on nearby installations at allowed vibration level.This paper proposes a method to control blasting by conducting suf?cient number of experiments and mea-surements in different locations of the project region. Standards for blast vibrations
Based on50year studies by scholars and investigators upon blasting,many criteria have been established and implemented with varying degrees of success.A brief review of some important parameters for estimating the damage has been given Table1.Researchers around the world are working hard to provide damage criteria and continue to improve it to increase its reliability.
Peak particle velocity(PPV)is the most accepted criterion to assess the damage potential of structures due to blast vibrations because it can be easily recorded at a site.Various types of research have been carried out in different countries in this context and different stan-dards have been established for damages to different
Department of Mining Engineering,Shahrood University of Technology,
Shahrood,Semnan,Iran
*Corresponding author,email ataei@shahroodut.ac.ir
?2010Institute of Materials,Minerals and Mining and The AusIMM
Published by Maney on behalf of the Institute and The AusIMM
Received14October2007;accepted24November2009
DOI10.1179/037178409X12596677450081Mining Technology2010VOL119NO17
structures.First of all,in 1957,Langefors et al.studied the peak particle velocity index and de?ned some ranges for damage and safety (Table 2).In 1959,Edward and Northwood used the peak particle velocity index and conducted similar studies in Canada (Table 3).In 1977,Bauer and Calder established damage for equipment and structures (Table 4).In 1980,US Bureau of Mines performed some studies on this subject and proposed several standards (Table 5).
In all of these studies,if particle velocity is more than 2in.s 21(50mm s 21),safety conditions will not be met with high probability.
In technical speci?cations of Karoun 3plan’s con-tract,the amount of permissible vibration for construc-tions has been presented as following:
(i)for concretes and grouting that more than 60h
would elapse from performance:permissible
peak particle velocity for armoured structures is 80mm s 21and for unarmoured,it is 60mm s 21
(ii)for concretes and grouting that less than 60h
would elapse from performance:permissible peak particle velocity is 10mm s 21
(iii)for rocks in tunnels and surface excavations:
permissible peak particle velocity is 50mm s 21.
Prediction of peak particle velocity
Peak particle velocity is the most important criterion for analysing destructions resulting from ground vibration.A large amount of research has been carried out in this area and a number of relationships have been developed between the explosive charge and the value of PPV at a certain distance from the blast.Some of these relation-ships are given in Table 6where v is the peak particle velocity,W max is the maximum charge per delay (kg),D is the distance of the measuring transducer from the blasting face (m),K ,B and A are the site constants which can be determined by multiple regression analysis and a is the inelastic attenuation factor.
These equations are mainly based on empirical statistical relations.These are suf?ciently accurate to predict vibration level,but have limitations due to the high degree of non-linearity in the relationships.
Table 1Some important parameters for estimating the damage Parameters
1
2
3
4
567
891011121314Particle velocity N N N
N
N N N N N N
Frequency N N N
N
N N N Damage type N N
N
N N Structure type N
N
N
N
Rock type N
Acceleration N N
Amplitude N N Distance N N
Vibration velocity N Displacement
N
1.United States Bureau of Mines (USBM),194228.Indian Standard Institute,19739
2.Rockwell’s Energy Formula,19343
9.Medearis’s Approach,1976103.Crandell’s Energy Ratio Concept,1949410.Bauer and Calder,https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,ngefors et al.,19575
https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,BM’s Criterion,198012
5.Edwards and Northweed,1959612.German DIN Standard 4150,198613
https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,BM’s Criterion,19717
13.Indian CMRI Standards,https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,ngefors and Kihlstrom’s Chart,19678
14.Rosenthal and Morlock,198715Table 4Particle velocity damage criteria 11Type of structure
Type of damage
Particle velocity at which damage starts,in.s 21Rigidity mounted mercury switches Trip out
0.5Houses
Plaster cracking 2Concrete blocks in a new home Cracks in block 8Cased drill holes
Horizontal offset 15Mechanical equipment,pumps and compressors Shaft misaligned
40Prefabricated metal building on concrete pads
Cracked pads,building twisted and distorted
60
Table 2Particle velocity damage criteria 4Particle velocity,in.s 21Damage
2.8No noticeable damage 4.3Fine cracks and fall plaster
6.3Cracking of plaster and masonry walls 9.1
Serious cracking
Table 3Particle velocity damage criteria 5
Particle velocity,in.s 21Damage
(2Safe,no damage 2–4Caution .4
Damage
Table 5Particle velocity damage criteria 12Particle velocity,in.s 21Damage
(2No damage 2–4Plaster cracking 4–7Minor damage
.7
Major damage to structures
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Typically,these equations are based on only three parameters:quantity of explosive,site constant and distance from blast site to monitoring station.Data sets are analysed for a particular geometry,which may or may not favour understanding of non-linearities among various input and ?eld parameters.23Considerable research has been conducted on the prediction of blast induced vibrations.3,24–29
Measurement of vibrational data
In order to study of the effects of blast vibrations in Karoun 3excavations,data measurement operations were carried out with seismographs device model UVS500made by Nitro Nobel Company.This device includes three parts:main part,geophone and connective
cables.Device power is supplied by one 1?5V battery.The device has a hydrometer that will be activated if humidity of measurement area is higher than allowed
Table 6Different conventional predictors Name Equation USBM 16
v ~K D
W max eT1=2h i {B Langfors–Kihlstrom
17
v ~K
W max
1=2 !B
Davies–Farmer–Attewell 18v ~KR {B W A
max
Ambrases–Hendron 19
v ~K
D
W max eTh i {B
Bureau of Indian Standard 20v ~K W
max
2=3 B
Ghosh–Daemen 21v ~K D
W max eTh i {B
e {a R
Ghosh–Daemen 21v ~K D
W max eT1=3
h i {B
e {a R
CMRI 22
v ~n z K D
W max eT
1=2
h i {
1
1Situation of 11geophones installed in Karoun 3Power Plant and Dam
Table 7Results of ground vibration measurements Peak particle velocity,mm s 21Distance,m Maximum charge
per delay,kg No.11
1739722510.3172.639.521.7100.535.231.3101.43541.3102.33551.5103.43563442.753.7572.576.9832.583.399.4132.591.2117.635104.740.4322.5113.790.9141120.7130.430.5131143.541140.4141.330.25150.6138.925166332.1854177132.3153.5181.1157.454.5191.2161.453.75200.9163.254216533.8358226932.3745236732.8745.2245434.8441255737.440264738.4939.5272344.5934.752816.6
36.93
35
29
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limits.In this condition,the position of installation must be changed.Geophone can measure particles’velocity in three main directions and resultant amplitude.Also variation graph of peak particle velocity in terms of time is accessible.
In order to measure vibrational data at one point,in the ?rst stage,geophone bolt (25cm in length and 20mm in diameter)must be installed.For this purpose,after drilling,the bolts would be put in the holes and the experiments could be started after cement grouting and reaching the 7day strength.Because every weakness will decrease precision of experiments,the place of bolt installation should not have any geological weakness such as alteration,bedding or jointing.After installation of geophone on the bolt,the device must be connected to the geophone by connective cables and should be put in a safe place.The above stages being carried out,the device will be ready for measurement.After turning it on,there are 12min for blast executing and after these 12min,the device will be automatically turned off.For this reason,if the blast is not to be executed up to this time,the device must be turned on again.Installation coordinates of geophone and blast centre must be de?ned by mapping and surveying precisely in advance.Locations of 11installed geophones in Karoun 3Dam and Power Plant have been shown in Fig.1with the
numbers from 1to 11.For each blast,distance from geophone,amount of charge per delay and PPV resulting from blasting are measured and presented in Table 7.
Analysing measured data
As above mentioned at the presented experimental equations,main effective parameters in particle velocity are weight of charge per delay and distance from blast centre.Also,other factors such as geological and geotechnical ones are applied in equations through the coef?cients.For convenience,analyses of scaled distance results have been de?ned as
sd ~
D
(1)
where sd is the scaled distance,D is the distance from the blasting location (m)and W is the maximum charge per delay (kg).In this equation,power of W (m)will be calculated with curve ?tting on measured vibrational data.All of blasts have been executed in subsurface and 20–50kg charges have been consumed per delay.However,distances of measurement places from blast-ings lie within a wide range.Therefore,analysing all measurement data totally would not be logical and the correlation coef?cient of ?tted curvatures will be
low.2Fitted curves for measured data at distances less than 50m
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For resolving this problem,measured data have been divided to two parts:one part with distance less than 50m and the other with more than 50m,and each part have been analysed separately.Variation curvatures of peak particle velocity in terms of scaled distance with various powers for distances less than 50m have bee shown in Fig.2.In addition,curvatures for distances more than 50m are presented in Fig.3.It has been concluded from the ?tted curves that for distances less than 50m,m 51is the best power in equation (1)and for distances more than 50m,m 50?5is more appropriate.
In brief,relation of PPV to charge per delay and distance from blasting place will be as follows PPV ~28:164D W àá{2:139L ?50
PPV ~5157:185D
1=2 {2:808L w 508<:(2)
According to equation (5),some graphs have been
presented in Fig.4.Based on these curves,the maximum charge per delay regarding type of structure can be predicted and calculated.This case study has proven that it can be possible to design reliable blasts using these graphs on the site as an important approach when vibration monitor is not available as a PPV predictor.
Conclusions
Separating rock form its main mass and its fragmenta-tion are the major aims of blasting process.The blast induced ground vibration prediction is a very crucial and critical aspect for safety and productivity,and to protect the surrounding environment in complex geo-mining and civil excavation programmes.Although it is dif?cult to control,its effects can be reduced.
One of the methods to control blasting vibrations is the prediction of peak particle velocity and comparing it with standard values.If the estimated PPV is more than permissible values,it must be decreased to allowed range by varying controllable parameters.
In this paper,some equations have been presented for PPV estimation based on measured data in performed blasts in Karoun 3Dam and Power Plant https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,ing these equations,the authors can plan the blasts with vibrations less than allowed limits.Studies show that the most important factor in PPV is the weight of charge per delay and distance from blast centre.Based on this statistical analysis,it can be concluded that at near distances of the blast centre (,50m),the effect of charge weight per delay on peak particle velocity is much more pronounced than at far distances (.50m).For example,if at near distances,the weight of
charge
3Fitted curves for measured data at distances more than 50m
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per delay is increased twice,the PPV will increase fourfold;however,at far distances,if the weight of charge is increased twice,the PPV will be increased 2?6times.Therefore,in order to decrease blast vibrations at near distances,charge per delay is the more important factor;conversely,at far distances,the distance factor is more signi?cant.Regarding presented equations and graphs,the authors can control the blasts and optimise the blasting patterns.
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一、伺服驱动器外部接线及说明。 SRV-CTRL PLC 外部电源 （DC 24V） SRV-CTRL 说明： 1、SRV-CTRL指PLC的伺服控制模块； 2、以→指向者为输入，以←指向者为输出。 3、各信号含义如下： INH: 禁止输入脉冲指令（开路时禁止）；OZ-: Z相输出；OZ+: Z相输出； S-RDY: 伺服驱动器已准备就绪；ALM: 伺服驱动器故障报警； COIN: 定位已完成；SRV-ON: 伺服驱动器“开”信号； COM-: 电源负极；COM+: 电源正极； PULS1: 指令脉冲输入端； PULS2: 指令脉冲输入端； SIGN1: 指令脉冲符号输入端； SIGN2: 指令脉冲符号输入端； 二、参数说明： 1、参数设置方法。
操作面板上共有5个按键，意义如下： MODE：模式转换键，按此键可在4个模式间切换，这4个模式是： DP-××××: 选择监视项目（共有7个, 在按 MODE键显示DP-××××后先按SET，再按↑或↓选择） ⑴、DP-EPS: 位置偏差；⑵、DP-SPD: 转速； ⑶、DP-TRQ: 转矩；⑷、DP-CNT: 控制方式； ⑸、DP-IO: 输入输出信号状态；⑹、DP-ERR: 错误信息； ⑺、DP_NO: PR-××××: 设定参数。 EE-××××: 写入参数。 AT-××××: 自动增益调整。 SET：为设定及确认键。 ↑：数值增加或移动到下一个选项； ↓：数值减少或移动到上一个选项； ←：数位间移动； 具体设置步骤详见有关Drive r的补充信息
说明： 1、参数号码后加“#“者为需要更改的，如02号参数实际应用中应设为 0; 2、控制方式含义 T：转矩控制 S：速度控制 P：位置控制 3、出厂设定为”*”者为出厂时未设置，需根据实际自行设置； 4、其余参数可使用出厂设置； 5、最后一栏为新Driver与之对应的参数（有些没有）； 6、更详细的说明参见Driver手册（旧）或参考Driver手册（新）中对 应的参数； 7、以下表格为Driver实际参数设置表。
图解blast验证引物教程 1、进入网页：https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,/BLAST/ 2、点击Search for short, nearly exact matches 3、在search栏中输入引物系列： 注：文献报道ABCG2的引物为5’-CTGAGATCCTGAGCCTTTGG-3’; 5’-TGCCCATCACAACATCATCT-3’ （1）输入方法可先输入上游引物，进行blast程序，同样方法在进行下游引物的blast程序。这种方法叫繁琐，而且在结果分析特异性时要看能与上游引物的匹配的系列，还要看与下游引物匹配的系列——之后看两者的交叉。 （2）简便的做法是同时输入上下游引物：有以下两种方法。输入上下游引物系列都从5’——3’。 A、输入上游引物空格输入下游引物
B、输入上游引物回车输入下游引物 4、在options for advanced blasting中： select from 栏通过菜单选择Homo sapiens【ORGN】Expect后面的数字改为10 5、在format中： select from 栏通过菜单选择Homo sapiens【ORGN】Expect后面的数字填上0 10
6、点击网页中最下面的“BLAST！” 7、出现新的网页，点击Format！ 果。
（1）图形格式： 图中①代表这些序列与上游引物匹配、并与下游引物互补的得分值都位于40～50分 图中②代表这些序列与上游引物匹配的得分值位于40～50分，而与下游引物不互补 图中③代表这些序列与下游引物互补的得分值小于40分，而与上游引物不匹配 通过点击相应的bar可以得到匹配情况的详细信息。 （2）结果信息概要： 从左到右分别为： A、数据库系列的身份证：点击之后可以获得该序列的信息 B、系列的简单描述 C、高比值片段对（high-scoring segment pairs, HSP)的字符得分。按照得分的高低由大到小排列。得分的计算公式＝匹配的碱基×2＋0.1。举例：如果有20个碱基匹配，则其得分为40.1。 D、E值：代表被比对的两个序列不相关的可能性。【The E value decreases exponentially as the Score (S) that is assigned to a match between two sequences increases】。E值最低的最有意义，也就是说序列的相似性最大。设定的E值是我们限定的上限，E值太高的就不显示了 E、最后一栏有的有UEG的字样，其中： U代表：Unigene数据库 E代表：GEO profiles数据库 G代表：Gene数据库
Blast 2.4.0+本地化详细流程（基于Windows系统） 1.程序获得。从NCBI上下载Blast本地化程序，下载地址： ftp://https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,/blast/executables/blast+/LATEST/ 64×安装版▲ 64×解压（绿色）版▲ 最好安装或解压到X盘根目录：如X:\blast，尽量简短，方便后边命令输入。 2.原始序列获得。方法1：找到转录组测序数据unigene数据库文件：unigene.fasta 或unigene.fa，若为unigene.fa则直接改后缀为.fasta即可。找到或修改后将数据库文件移动至Blast本地化程序目录“X:\blast\bin”。方法2：从NCBI中的ftp 库下载所需要库，链ftp://https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,/blast/db/FASTA/，其中nr.gz为非冗余的数据库，nt.gz为核酸数据库，month.nt.gz为最近一个月的核酸序列数据。下载的month.nt.gz先用WINRAR解压缩，然后用makeblastdb.exe格式化。方法3：利用新版blast自带的update_blastdb.pl进行下载，这需要安装perl程序。 注释：上述三种方法各有优缺点，前两种下载速度较快，但是每次进行检索都需要对数据库进行格式化（转化成二进制数据），第三种方法下载速度较慢，但是NCBI 中已经格式化好的，在进行本地检索时不需再进行格式化，直接用即可。 3.用文本编辑器（txt文件改名字及后缀）创建一个ncbi.ini文件，文件包含下 面内容：[NCBI]Data="C:\blast\data\" 先新建TXT文件，然后改属性，将ncbi.ini文件存放到C:\Windows 4.将Blast本地化程序目录添加路径中（该步骤非必须，但会给以后的操作带来 方便），方法： a)右击我的电脑选择属性，选择高级，点击环境变量，设置环境变量 b)系统变量中，选择Path，点击“编辑”，在变量值的后面添加Blast本地化 程序所在路径，E:\blast 点击确定，将安装路径添加到path。 5.运行MS-DOC。打开DOC窗口（点击开始，选择运行，打开的输入框中输 入“CMD”，确定），访问Blast本地化程序所在文件夹，依次输入：（1）X: 回车；（2）cd blast\bin，回车。
感谢您使用本产品，本使用操作手册提供LCDA系列伺服驱动器的相关信息。内容包括： ●伺服驱动器和伺服电机的安装与检查 ●伺服驱动器的组成说明 ●试运行操作的步骤 ●伺服驱动器的控制功能介绍与调整方法 ●所有参数说明 ●通讯协议说明 ●检测与保养 ●异常排除 ●应用例解说 本使用操作手册适合下列使用者参考： ●伺服系统设计者 ●安装或配线人员 ●试运行调机人员 ●维护或检查人员 在使用前，请您仔细详读本手册以确保使用上的正确。此外，请将它妥善保存在安全的地点以便随时查阅。下列在您尚未读完本手册时，务必遵守事项： ●安装的环境必须没有水气，腐蚀性气体或可燃性气体。 ●接线时，禁止将三相电源接至马达U、V、W的连接器，因为一旦接错 时将损坏伺服驱动器。 ●接地工程必须确实实施。 ●在通电时，请勿拆解驱动器、马达或更改配线。 ●在通电动作前，请确定紧急停机装置是否随时开启。 ●在通电动作时，请勿接触散热片，以免烫伤。 如果您在使用上仍有问题，请洽询经销商或者本公司客服中心。
安全注意事项 LCDA 系列为一开放型（Open Type ）伺服驱动器，操作时须安装于遮蔽式的控制箱内。本驱动器利用精密的回授控制与结合高速运算能力的数字信号处理器（Digital Signal Processor,DSP ）,控制IGBT 产生精确的电流输出，用来驱动三相永磁式同步交流伺服马达（PMSM ）达到精准定位。 LCDA 系列可使用于工业应用场合上，且建议安装于使用手册中的配线（电）箱环境（驱动器、线材与电机都必须安装于符合环境等级的安装环境最低要求规格）。 在按收检验、安装、配线、操作、维护与检查时，应随时注意以下安全注意事项。 标志[危险]、[警告]与[禁止]代表的含义： ? 意指可能潜藏危险，若未遵守要求可能会对人员造成严 重伤或致命 ? 意指可能潜藏危险，若未遵守可能会对人员造成中度的 伤害，或导致产品严重损坏，甚至故障 ? 意指绝对禁止的行动，若未遵守可能会导致产品损坏， 或甚至故障而无法使用
N C B I在线B L A S T使用方法与结果详解 IMB standardization office【IMB 5AB- IMBK 08- IMB 2C】
N C B I在线B L A S T使用方法与结果详解 BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool）是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。 BLAST采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。 Blast中常用的程序介绍： 1、BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。 2、BLASTX是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译成蛋白序列（一条核酸序列会被翻译成可能的六条蛋白），再对每一条作一对一的蛋白序列比对。 3、BLASTN是核酸序列到核酸库中的一种查询。库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一地核酸序列比对。 4、TBLASTN是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与BLASTX相反，它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列，再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。 5、TBLASTX是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白（每条核酸序列会产生6条可能的蛋白序列），这样每次比对会产生36种比对阵列。 NCBI的在线BLAST： 下面是具体操作方法 1，进入在线BLAST界面，可以选择blast特定的物种（如人，小鼠，水稻等），也可以选择blast所有的核酸或蛋白序列。不同的blast程序上面已经有了介绍。这里以常用的核酸库作为例子。 2，粘贴fasta格式的序列。选择一个要比对的数据库。关于数据库的说明请看NCBI在线blast数据库的简要说明。一般的话参数默认。 3，blast参数的设置。注意显示的最大的结果数跟E值，E值是比较重要的。筛选的标准。最后会说明一下。 4，注意一下你输入的序列长度。注意一下比对的数据库的说明。 5，blast结果的图形显示。没啥好说的。 6，blast结果的描述区域。注意分值与E值。分值越大越靠前了，E值越小也是这样。7，blast结果的详细比对结果。注意比对到的序列长度。评价一个blast结果的标准主要有三项，E值（Expect)，一致性(Identities)，缺失或插入（Gaps）。加上长度的话，就有四个标准了。如图中显示，比对到的序列长度为1405，看Identities这一值，才匹配到1344bp,而输入的序列长度也是为1344bp（看上面的图），就说明比对到的序列要长一
本地blast的详细用法 Posted on 03 四月 2009 by 柳城，阅读 9,626 本地blast的详细使用方法 blast all -p blastn -i myRNA.fasta -d humanRNA.fasta -o myresult.blastout -a 2 -F F -T T -e 1e-10 解释如下： blastall: 这是本地化/命令行执行blast时的程序名字！(Tips:blastall直接回车就会给出你所有的参数帮助，但是英文的) -p: p 是program的简写,program在计算机领域中是程序的意思。此参数是指定要使用何种子程序，所谓子程序，就是针对不同的需要，如核酸序列和核酸序列进行比对、蛋白质序列和蛋白质序列进行比对、假设翻译后核酸序列于蛋白质序列进行比对，选择相应的子程序: blastn 是用于核酸对核酸 blastp 是蛋白质对蛋白质序列等等，一共5个自程序。 -i: i 是input的简写，意思是输入文件，就是你自己的要进行比对的序列文件(fasta格式） -d: d是database的简写,意思是要比对的目标数据库,在例子中就是humanRNA.fasta (别忘了要formatdb) -o: o是output的简写，意思是结果文件名字，这个根据你自己的习惯起名字，可以带路径，(上边两个参数-i -d 也都可以带路径) *注意以上4个参数是必须的，缺一不可，下面的参数是为了得到更好的结果自己可调的参数，如果你不加也没有关系，blastall程序本身会给一个默认值！ -a: 是指计算时要用的CPU个数，我的机器有两个CPU，所以用-a 2，这样可以并行化进行计算，提高速度，当然你的计算机就一个CPU,可以不用这个参数，系统默认值为1,就是一个CPU -F: 是filter的简写，blastall程序中有对简单的重复序列和低复杂度的一些repeats过滤调，默认是T (注意以后的有几种参数就两个选项，T/F T就是ture,真，你可以理解为打开该功能; F就是false，假，理解为关闭该功能) -T: 是HTML的简写，是指blast结果文件是否用HTML格式，默认是F!如果你想用IE看，我建议用-T T -e: 是Expectation value，期望值，默认是10，我用的10-10！ BLASTALL 用法 a.格式化序列数据库 格式化序列数据库— —formatdb formatdb简单介绍: formatdb处理的都是格式为 ASN.1和FASTA，而且不论是核苷酸序列数据库，还是蛋白质序列数据库；不论是使用Blastall ，还是Blastpgp，Mega Blast应用程序，这一步都是不可少的。 formatdb命令行参数: formatdb - 得到formatdb 所有的参数显示（见附录二）和介绍， 主要参数的说明:
伺服驱动器参数设置方法 在自动化设备中，经常用到伺服电机，特别是位置控制，大部分品牌的伺服电机都有位置控制功能，通过控制器发出脉冲来控制伺服电机运行，脉冲数对应转的角度，脉冲频率对应速度（与电子齿轮设定有关），当一个新的系统，参数不能工作时，首先设定位置增益，确保电机无噪音情况下，尽量设大些，转动惯量比也非常重要，可通过自学习设定的数来参考，然后设定速度增益和速度积分时间，确保在低速运行时连续，位置精度受控即可。 1.位置比例增益：设定位置环调节器的比例增益。设置值越大，增益越高，刚度越大，相同频率指令脉冲条件下，位置滞后量越小。但数值太大可能会引起振荡或超调。参数数值由具体的伺服系统型号和负载情况确定。 2.位置前馈增益：设定位置环的前馈增益。设定值越大时，表示在任何频率的指令脉冲下，位置滞后量越小位置环的前馈增益大，控制系统的高速响应特性提高，但会使系统的位置不稳定，容易产生振荡。不需要很高的响应特性时，本参数通常设为0表示范围：0~100% 3.速度比例增益：设定速度调节器的比例增益。设置值越大，增益越高，刚度越大。参数数值根据具体的伺服驱动系统型号和负载值情况确定。一般情况下，负载惯量越大，设定值越大。在系统不产生振荡的条件下，尽量设定较大的值。 4.速度积分时间常数：设定速度调节器的积分时间常数。设置值越小，积分速度越快。参数数值根据具体的伺服驱动系统型号和负载情况确定。一般情况下，负载惯量越大，设定值越大。在系统不产生振荡的条件下，尽量设定较小的值。 5.速度反馈滤波因子：设定速度反馈低通滤波器特性。数值越大，截止频率越低，电机产生的噪音越小。如果负载惯量很大，可以适当减小设定值。数值太大，造成响应变慢，可能会引起振荡。数值越小，截止频率越高，速度反馈响应越快。如果需要较高的速度响应，可以适当减小设定值。 6.最大输出转矩设置：设置伺服驱动器的内部转矩限制值。设置值是额定转矩的百分比，任何时候，这个限制都有效定位完成范围设定位置控制方式下定位完成脉冲范围。本参数提供了位置控制方式下驱动器判断是否完成定位的依据，当位置偏差计数器内的剩余脉冲数小于或等于本参数设定值时，驱动器认为定位已完成，到位开关信号为 ON，否则为OFF。 在位置控制方式时，输出位置定位完成信号，加减速时间常数设置值是表示电机从0~2000r/min的加速时间或从2000~0r/min的减速时间。加减速特性是线性的到达速度范围设置到达速度在非位置控制方式下，如果伺服电机速度超过本设定值，则速度到达开关信号为ON，否则为OFF。在位置控制方式下，不用此参数。与旋转方向无关。7.手动调整增益参数 调整速度比例增益KVP值。当伺服系统安装完后，必须调整参数，使系统稳定旋转。首先调整速度比例增益KVP值．调整之前必须把积分增益KVI及微分增益KVD调整至零，然后将KVP值渐渐加大；同时观察伺服电机停止时足否产生振荡，并且以手动方式调整KVP参数，观察旋转速度是否明显忽快忽慢．KVP值加大到产生以上现象时，必须将KVP 值往回调小，使振荡消除、旋转速度稳定。此时的KVP值即初步确定的参数值。如有必要，经KⅥ和KVD调整后，可再作反复修正以达到理想值。 调整积分增益KⅥ值。将积分增益KVI值渐渐加大，使积分效应渐渐产生。由前述对积分控制的介绍可看出，KVP值配合积分效应增加到临界值后将产生振荡而不稳定，如同KVP值一样，将KVI值往回调小，使振荡消除、旋转速度稳定。此时的KVI值即初步确定的参数值。
图解blast验证引物教程 ——以文献报道的人类的ABCG2的引物为例 1、进入网页：https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,/BLAST/ 2、点击Basic BLAST中的nucleotide blast选项 3、完成2操作后就进入了Basic Local Alignment Search Tool界面 （1）在Enter Query Sequence栏中输入引物序列： 注：文献报道ABCG2的引物为5’-CTGAGATCCTGAGCCTTTGG-3’; 5’-TGCCCATCACAACATCATCT-3’ 简便的做法是同时输入上下游引物。输入上下游引物系列都从5’—3’。输入上游引物后，加上≥20个字母n，再输入下游引物，如下图：
（2）在Choose Search Set栏中： Database根据预操作基因的种属定了，本引物可选Human genomic + transcript或 Others (nr etc.)。本人倾向于选后者，觉得此库信息更多。如下图： （3）在Program Selection中：选择Somewhat similar sequences (blastn)项，如下图： （4）在此界面最下面：如下图 Show results in a new window项是显示界面的形式，可选可不选，在此我们选上了。关键要点击Algorithm parameters参数设置，进入参数设置界面。 4. 参数设置： （1）在General Parameters中：Expect thresshold期望阈值须改为1000，大于1000也可以； 在Word size的下拉框将数字改为7。如下图：
图解blast 验证引物教程 ——以文献报道的人类的ABCG2的引物为例 1、 进入网页：https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,/BLAST/ 2、 点击Basic BLAST 中的nucleotide blast 选项 3、 完成2操作后就进入了Basic Local Alignment Search Tool 界面 （1）在Enter Query Sequence 栏中输入引物序列： 注：文献报道ABCG2的引物为5’-CTGAGATCCTGAGCCTTTGG-3’; 5’-TGCCCATCACAACATCATCT-3’ 简便的做法是同时输入上下游引物。输入上下游引物系列都从5’— 3’。 输入上游引物后，加上≥20个字母n ，再输入下游引物，如下图： 生 物 秀
（2）在Choose Search Set 栏中： Database 根据预操作基因的种属定了，本引物可选Human genomic + transcript 或Others (nr etc.)。本人倾向于选后者，觉得此库信息更多。如下图： （3）在Program Selection 中：选择Somewhat similar sequences (blastn)项，如下图： （4）在此界面最下面：如下图 生物秀-专心做生物 w w w .b b i o o .c o m
Show results in a new window 项是显示界面的形式，可选可不选，在此我们选上了。关键要点击Algorithm parameters 参数设置，进入参数设置界面。 4. 参数设置： （1）在General Parameters 中：Expect thresshold 期望阈值须改为1000，大于1000也可以；在Word size 的下拉框将数字改为7。如下图： （2）Scoring Parameters 无须修改 （3）Filters and Masking 中，一般来说也没有必要改 5．点击最下面一栏的BLAST 按钮，如图： 6.点击BLAST 按钮后，跳转出现如下界面： 7. 等待若干秒之后，自动跳转出现显示BLAST 结果的网页。该网页用三种形式来显示blast 的结果。 生物秀-专心做生物 w w w .b b i o o .c o m
本地Blast使用说明 一、软件的下载安装 1.1安装流程 建议安装在非系统盘，如将下载的 BLAST 程序安装到 E:\blast，生成bin、doc 两个子目录，其中 bin 是程序目录，doc 是文档目录，这样就安装完毕了。 1.2 设置环境变量 右键点击“我的电脑”－“属性”，然后选择“高级系统设置”标签－“环境变量”(图1)，在用户变量下方“Path”随安装过程已自动添加其变量值，即“E:\Blast\bin”。此时点击“新建”－变量名“BLASTDB”，变量值为“E:\Blast\db”(即数据库路径，图2)。 二、查看程序版本信息 点击 Windows 的“开始”菜单下的“运行”，输入“cmd”调出 MS-DOS 命令行，转到 Blast 安装目录，输入命令“blastn -version”即可查看版本，若能显示说明本地blast 已经安装成功。 三、使用 3.1本地数据库的构建 下载所需的数据（Fasta格式），将X 放到E：\blast\db 文件夹下，然后调出MS-DOS 命令行，转到E：\blast\db 文件夹下运行以下命令：格式化
数据库，命令为： makeblastdb -in 数据库文件 -dbtype 序列类型（核酸：nul;蛋白：prot）-title database_title-parse_seqids -out database_name-logfile File_Name 格式化数据库后，创建三个主要的文件——库索引(indices)，序列(sequences)和头(headers)文件。生成的文件的扩展名分别是：.pin、.psq、.phr（对蛋白质序列）或.nin、.nsq、.nhr（对核酸序列）。而其他的序列识别符和索引则包含在.psi和.psd（或.nsi 和.nsd）中。 3.2核酸序列相似性搜索 blastn -db database_name -query input_file -out output_file -outfmt "7 qacc sacc qstart qend sstart send length bitscore evalue pident ppos" 备注：qacc：查询序列Acession号；sacc：目标序列Acession号； qstart qend：分别表示查询序列比对上的起始、终止位置； sstart send：分别表示目标序列比对上的起始、终止位置； length：长度； bitscore：得分； evalue：E-Value值； pident：一致性； ppos：相似性 3.3 查看并获取目标序列： blastdbcmd -db refseq_rna -entry 224071016 -out test.fa 可以从数据库中提取gi号为224071016的序列,并且以fasta格式存入文 件 3.4蛋白质序列相似性搜索 Blastp -db database_name-query input_file -out output_file -outfmt "7 qacc sacc qstart qend sstart send length bitscore evalue pident ppos" 3.5 查看并获取目标序列：重复3.3
核酸BLAST： ?blastn程式——核酸序列比对。 ?MegaBLAST——可搜寻一批EST序列、长序列cDNA或基因体序列。 BLAST——Basic Local Alignment Search Tool——核酸与蛋白质序列比对工具。BLAST网页提供BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）程式、概述、使用说明与常见问题解答（网址：https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,/BLAST/）。 BLAST Program Selection Guide： https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,/blast/producttable.shtml#tab31
在做BLASTn的时候，系统会给出三个程序选项，分别是Highly similar sequences (megablast)， More dissimilar sequences (discontiguous megablast)，Somewhat similar sequences (blastn) 。 第一个选项megablast是对高度相似DNA序列间的比较。鉴别一段未知DNA序列的最好办法就是看看在公共数据库中这段序列是否存在。Megablast就是对那些具有高度相似（相似性95% 以上）的长序列片断所特别设计的一种序列比较工具。Megablast除了提供序列联配的显著性期望值域之外，还提供了一种百分值域。在进行序列比较时，用户可以同时调整这两个参数以优化搜索结果。 第二个选项discontiguous megablast，当序列之间的差异比megablast大时，一般选用这个程序。其算法的基本原理是将查询序列分为一个一个的小片断，我们把它叫做字，通过字与数据库序列相比较，如果能够精确匹配，则以这个字为种子向两边延伸，从而获得符合我们要求的相似性序列。discontiguous megablast所应用的字是不连续的，这使得他的搜索精确性在三种搜索程序中是最高的。其模板类型选项分为三种编码（0），非编码（1），两者都有（2）。在编码模式中，根据第三位碱基的摆动原理，只要第一个和第二个碱基能够精确匹配，那么第三个碱基可以忽略，不做比较。在字的长度相同的情况下，discontiguous megablast的精确度要高于blastn。 第三个选项Somewhat similar sequences (blastn)，这个程序比较的序列其相似程度可以非常低。它采用的算法与discontiguous megablast相同，只不过它的字是连续的。Blastn的字要比megablast短，所以其精确度要高于megablast，但是运算速度要慢一些。 注：字是影响blast灵敏度的一个主要参数，其取值要根据具体情况具体而定。 NCBI BLASTn: https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,/public_documents/vibe/details/NcbiBlastn.html
NCBI中Blast种类及使用简介 NCBI中Blast种类简介 1． Blast Assembled Genomes 在一个选择的物种基因组序列中去搜索。 2．Basic Blast 2.1 nucleotide blast--- 用核酸序列到核酸数据库中进行搜索，包括3个程序 2.1.1 Blastn----核酸序列（n）到核酸序列数据库中搜索，是一种标准的搜索。 2.1.2 megablast----该程序使用“模糊算法”加快了比较速度,可以用于快速比较两大系列序列。可以用来搜索一匹ESTs序列和大的cDNA或基因组序列, 适用于由于测序或者其他原因形成的轻微的差别的序列之间的比较 2.1.3 discontiguous megablast----与megablast不同的是主要用来比较来自不同物种之间的相似性较低的分歧序列。 2.2 Protein Blast 2.2.1 Blastp ---蛋白质序列到蛋白质序列数据库中搜索，是一种标准的搜索。 2.2.2 psi-blast---位点特异迭代BLAST —用蛋白查询来搜索蛋白资料库的一个程式。所有被BLAST发现的统计有效的对齐被总和起来形成一个多次对齐，从这个对齐，一个位置特异的分值矩阵建立起来。这个矩阵被用来搜索资料库，以找到额外的显著对齐，这个过程可能被反复迭代一直到没有新的对齐可以被发现。 2.2.3 PHI-BLAST---以常规的表达模型为特别位置进行PSI - BLAST检索,找出和待查询序列具有一样的表达模型且具有同源性的蛋白质序列。 2.3 Translating BLAST 2.3.1 blastx----先将待查询的核酸序列按6 种读框翻译成蛋白质序列,然后将翻译出的蛋白质序列与NCBI 蛋白质序列数据库比较。 2.3.2 tblastn-----先将核酸序列数据库中的核酸序列按6 种读框翻译成
Blast本地化：window平台下blast软件的安装boyun发表于 2009-07-09 17:08 | 阅读 1 views 1.对于windows 2000/xp 用户，下载blast- 2.2.18-ia32-win32.exe安装文件 ftp://https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,/blast/executables/LATEST/blast- 2.2.18-ia32-win32.exe 2.创建一个新目录，例如C:\blast，将下载的文件blast-2.2.18-ia32-win32.exe复制到该目录，双击这个文件，自解压产生bin、data、doc 三个目录，bin是程序目录，data是程序使用数据的目录，doc是文档目录。 表：bin目录中的程序 程序说明 bl2seq.exe进行两条序列比对 blastall.exe做普通的blast比对 blastclust.exe blastpgp.exe copymat.exe fastacmd.exe通过gi号，接收号等，在数据库中检索序 列 formatdb.exe格式化数据库 formatrpsdb.exe impala.exe makemat.exe megablast.exe megablast程序 rpsblast.exe seedtop.exe 3.用文本编辑器创建一个ncbi.ini文件，文件包含下面内容：[NCBI] Data="C:\blast\data\" 将ncbi.ini文件存放到系统的Windows 或者 WINNT目录。 4.将”C:\blast\bin”目录添加路径中（该步骤非必须，但会给以后的操作带来方便），方法：
N C B I在线B L A S T使用 方法与结果详解 This model paper was revised by the Standardization Office on December 10, 2020
N C B I在线B L A S T使用方法与结果详解 BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。 BLAST 采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。 Blast中常用的程序介绍： 1、BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。 2、BLASTX是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译成蛋白序列（一条核酸序列会被翻译成可能的六条蛋白），再对每一条作一对一的蛋白序列比对。 3、BLASTN是核酸序列到核酸库中的一种查询。库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一地核酸序列比对。 4、TBLASTN是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与BLASTX相反，它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列，再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。 5、TBLASTX是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白（每条核酸序列会产生6条可能的蛋白序列），这样每次比对会产生36种比对阵列。 NCBI的在线BLAST： 下面是具体操作方法 1，进入在线BLAST界面，可以选择blast特定的物种（如人，小鼠，水稻等），也可以选择blast所有的核酸或蛋白序列。不同的blast程序上面已经有了介绍。这里以常用的核酸库作为例子。 2，粘贴fasta格式的序列。选择一个要比对的数据库。关于数据库的说明请看NCBI在线blast数据库的简要说明。一般的话参数默认。 3，blast参数的设置。注意显示的最大的结果数跟E值，E值是比较重要的。筛选的标准。最后会说明一下。 4，注意一下你输入的序列长度。注意一下比对的数据库的说明。 5，blast结果的图形显示。没啥好说的。 6，blast结果的描述区域。注意分值与E值。分值越大越靠前了，E值越小也是这样。7，blast结果的详细比对结果。注意比对到的序列长度。评价一个blast结果的标准主要有三项，E值（Expect)，一致性(Identities)，缺失或插入（Gaps）。加上长度的话，就有四个标准了。如图中显示，比对到的序列长度为1405，看Identities这一值，才匹配到1344bp,而输入的序列长度也是为1344bp（看上面的图），就说明比对到的序
NCBI在线BLAST使用方法与结果详解 BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一套在蛋白质数据库或DNA 数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。 BLAST 采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。 Blast中常用的程序介绍： 1、BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。 2、BLASTX是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译成蛋白序列（一条核酸序列会被翻译成可能的六条蛋白），再对每一条作一对一的蛋白序列比对。 3、BLASTN是核酸序列到核酸库中的一种查询。库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一地核酸序列比对。 4、TBLASTN是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与BLASTX相反，它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列，再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。 5、TBLASTX是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白（每条核酸序列会产生6条可能的蛋白序列），这样每次比对会产生36种比对阵列。 NCBI的在线BLAST：https://www.doczj.com/doc/c41554999.html,/Blast.cgi 下面是具体操作方法 1，进入在线BLAST界面，可以选择blast特定的物种（如人，小鼠，水稻等），也可以选择blast所有的核酸或蛋白序列。不同的blast程序上面已经有了介绍。这里以常用的核酸库作为例子。
无刷驱动器DBLS-02 一概述： 本控制驱动器为闭环速度型控制器，采用最近型IGBT和MOS功率器，利用直流无刷电机的霍尔信号进行倍频后进行闭环速度控制，控制环节设有PID速度调节器，系统控制稳定可靠，尤其是在低速下总能达到最大转矩，速度控制范围150~10000rpm。 二产品特征: 1、PID速度、电流双环调节器 2、高性能低价格 3、20KHZ斩波频率 4、电气刹车功能，使电机反应迅速 5、过载倍数大于2，在低速下转矩总能达到最大 6、具有过压、欠压、过流、过温、霍尔信号非法等故障报警功能 三电气指标 标准输入电压：24VDC~48VDC，最大电压不超过60VDC。最大输入过载保护电流：15A、30A两款连续输出电流：15A 加速时间常数出厂值：秒其他可定制 四端子接口说明: 1、电源输入端: 引角序号引角名中文定义 1V+直流+24~48VDC输入 2GND GND输入 引角序号引角名中文定义 1MA电机A相 2MB电机B相
3MC电机C相 4GND地线 5HA霍尔信号A相输入端 6HB霍尔信号B相输入端 7HC霍尔信号C相输入端 8+5V霍尔信号的电源线 G ND：信号地F/R：正、反转控制，接GND反转，不接正转，正反转切换时，应先关断EN E N：使能控制：EN接地，电机转（联机状态），EN不接，电机不转（脱机状态）B K：刹车控制：当不接地正常工作，当接地时，电机电气刹车，当负载惯量较大时，应采用脉宽信号方式，通过调整脉宽幅值来控制刹车效果。S V ADJ：外部速度衰减：可以衰减从0~100%，当外部速度指令接时，通过该电位器可以调速试机P G：电机速度脉冲输出：当极对数为P时，每转输出6P个脉冲（OC门输入）A LM：报警输出：当电路处于报警状态时，输出低电平（OC门输出）+5V：调速电压输出，可用电位器在SV和GND形成连续可调内置电位器：调节电机速度增益,可以从0~100%范围内调速。 五驱动器与无刷电机接线图 六机械安装：
Blast软件的详细使用方法 blastall -p blastn -i myRNA.fasta -d humanRNA.fasta -o myresult.blastout -a 2 -F F -T T -e 1e-10 解释如下： blastall: 这是本地化/命令行执行blast时的程序名字！(Tips:blastall直接回车就会给出你所有的参数帮助，但是英文的) -p: p 是program的简写,program在计算机领域中是程序的意思。此参数是指定要使用何种子程序，所谓子程序，就是针对不同的需要，如核酸序列和核酸序列进行比对、蛋白质序列和蛋白质序列进行比对、假设翻译后核酸序列于蛋白质序列进行比对，选择相应的子程序: blastn 是用于核酸对核酸blastp 是蛋白质对蛋白质序列等等，一共5个自程序。 -i: i 是input的简写，意思是输入文件，就是你自己的要进行比对的序列文件(fasta格式）-d: d是database的简写,意思是要比对的目标数据库,在例子中就是humanRNA.fasta (别忘了要formatdb) -o: o是output的简写，意思是结果文件名字，这个根据你自己的习惯起名字，可以带路径，(上边两个参数-i -d 也都可以带路径) *注意以上4个参数是必须的，缺一不可，下面的参数是为了得到更好的结果自己可调的参数，如果你不加也没有关系，blastall程序本身会给一个默认值！ -a: 是指计算时要用的CPU个数，我的机器有两个CPU，所以用-a 2，这样可以并行化进行计算，提高速度，当然你的计算机就一个CPU,可以不用这个参数，系统默认值为1,就是一个CPU -F: 是filter的简写，blastall程序中有对简单的重复序列和低复杂度的一些repeats过滤调，默认是T (注意以后的有几种参数就两个选项，T/F T就是ture,真，你可以理解为打开该功能; F就是false，假，理解为关闭该功能) -T: 是HTML的简写，是指blast结果文件是否用HTML格式，默认是F!如果你想用IE看，我建议用-T T -e: 是Expectation value，期望值，默认是10，我用的10-10！ BLASTALL 用法 a.格式化序列数据库 格式化序列数据库——formatdb formatdb简单介绍: formatdb处理的都是格式为ASN.1和FASTA，而且不论是核苷酸序列数据库，还是蛋白质序列数据库；不论是使用Blastall ，还是Blastpgp，Mega Blast应用程序，这一步都是不可少的。 formatdb命令行参数: formatdb - 得到formatdb 所有的参数显示（见附录二）和介绍， 主要参数的说明: -i 输入需要格式化的源数据库名称Optional -p 文件类型，是核苷酸序列数据库，还是蛋白质序列数据库 T – protein F - nucleotide [T/F] Optional default = T -a 输入数据库的格式是ASN.1（否则是FASTA） T - True, F - False. [T/F] Optional default = F
气压式血液循环驱动器概述 （一）原理 气压式血液循环驱动器用于在进行间歇式气动压迫的过程中，充气压力带通过压迫肢体从而增强静脉血液的流动。在完一次压迫过程之后，主机将对静脉血管再次充满血液的时间进行测量，从而在经过相应时间段的等待之后，重新启动下一次压迫过程。从而有助于防止出现深静脉血栓和肺部栓塞（DVT/PE)。 （二）适应证 1、高风险手术全髋关节置换术，全膝关节置换术，髋关节骨折。 2、存在发生DVT风险的无禁忌证的患者。 3、可用于对抗凝治疗有禁忌的患者(如神经外科手术、头部创伤的患者等)。 （三）禁忌证 1.任何有可能妨碍充气压力带作用的腿局部情况，例如:皮炎，静脉结扎(在手术后即刻)，坏疽或者刚做完皮肤移植手术。 2.严重的动脉硬化症或其他缺血性血管病。 3.腿部大范围水肿或由充血性心力衰竭引发的肺部水肿。 4.腿部严重畸形。 5.疑似已出现深静脉血栓。 （四）尺寸的选择 腿长<55. 9cm，选择小号充气压力带。 腿长在55. 9~71. 7cm之间，选择中号充气压力带。 腿长>71. 1 cm，选择大号充气压力带。 （五）人员资格 1.具有执业资格证书的护士。 2.经过“气压式血液循环驱动器护理指南”培训合格的护士。 （六）养护要点 1.使用时动作轻柔，保证管路畅通。 2.及时收回，放置固定地点保存。 3.将充气压力带、连接管整理好，管路勿打折保存。 4.发现污垢及时清理干净。 5.如使用过程中发现异常及时送专业维修部门进行维修。 （七）评估要点 1.评估患者患肢伤口情况、精神状况及配合程度。 2.评估患肢是否有深静脉血栓。 3.评估患者皮肤是否有破损。 （八）宣教要点 1.告知患者使用气压式血液循环驱动器的作用和意义。 2.患者治疗过程中如有不适，及早通知护士。