全基因组选择在猪育种中的应用
王晨1，秦珂1，薛明2，莫德林1，陈瑶生1，刘小红1*
【摘要】摘要：全基因组选择(Genomic selection，GS)是一种全基因组范围内的标记辅助选择方法。利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估，能够更加准确地早期预测估计育种值，降低近交系数，大大提高猪育种的遗传进展。随着猪全基因组测序的完成和猪60k SNP芯片的商业化，全基因组选择已经成为猪育种研究领域的新热点。本文综述了全基因组选择的分析方法、计算方法和影响因素，并阐述了全基因组选择在猪育种中的应用情况和发展趋势。【期刊名称】畜牧兽医学报
【年(卷),期】2016(047)001
【总页数】9
【关键词】全基因组选择；猪；育种；SNP芯片
中国是养猪大国，地方猪种资源丰富。据2012年最新统计，中国拥有猪品种125个，其中地方品种88个[1]，约占世界猪品种总数的1/3。中国地方猪种具有诸多优点，例如耐粗饲、适应性强、肉质好、高繁殖力等。同时，中国也是种猪的进口大国，长期依赖进口国外优秀的瘦肉型品种，如杜洛克、长白猪、大白猪、皮特兰猪等。国内的商品猪多以外三元杂交为主、与地方品种杂交为辅进行生产。随着人们生活水平提高，对猪肉品质的要求也越来越高。因此，对于一些地方优良猪种的保护和开发利用需要采取有效措施。但是，传统的育种方法所需周期较长，同时中国地方猪种的选育程度较低[2]，无法短期内培育出优良品种，并长期维持其优良的生产性能。
常规的畜禽育种方法主要利用表型值和系谱信息进行BLUP(Best linear