Nature数据库使用介绍- (ver.2)
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NCBI使用方法
是NCBI最常用的功能之一、用户可以使用栏特定的关键词、序列、基因或其他相关信息。
NCBI提供了多种工具,包括PubMed、BLAST、Entrez等。
PubMed是一个生命科学文献库,用户可以使用关键词相关的科学文献。
BLAST是一种常用的序列比对工具,用户可以将自己的序列与NCBI数据库中的序列进行比对分析。
Entrez是一个综合数据库工具,用户可以使用关键词多种数据库。
对于高级用户,NCBI还提供了一些编程接口和工具,如E-utilities 和APIs(Application Programming Interfaces),允许用户通过编程方式访问和获取NCBI数据库中的数据。
这些接口和工具可以帮助用户自动化数据提取和分析,更好地满足特定研究需求。
总体而言,NCBI是一个非常强大和全面的生物信息资源。
通过熟悉和利用其提供的各种功能和工具,研究人员可以快速访问和分析生物领域的大量数据,推动科学研究的进展。
同时,NCBI还不断更新和扩展其数据库和工具,以迎合不断发展的生物信息学需求。
PubMed 資料庫使用簡介一、資料庫內容簡介PubMed 為美國國家醫學圖書館的美國國家生技資訊中心(NCBI)所製作的生物醫學相關文獻的書目索引摘要資料庫,並提供部分免費及付費全文連結服務,需要收費的全文,讀者可自行與出版社接洽。
較之於MEDLINE 資料以生物醫學、生命科學、生化學、行為科學為主,PubMed 資料庫範圍更涵蓋了如下內容:1. 對於超出學科範圍(如:資訊科學、航太科學) 的特定生命科學、醫學、化學相關之期刊文章都會收錄於本資料庫中;2. 收錄即將出版的醫學論文;3. 已由NLM 審核通過並已由PubMed Central 典藏的全文文獻亦收錄之。
二、 資料庫操作說明主畫面Part I(一)主畫面Part II(十)(九)茲分述其功能及使用方式如下:(一)選擇資料庫美國國家生技資訊中心(NCBI)製作了一系列的生物醫學資料庫如下:1.PubMed:生物醫學文獻書目索引摘要資料庫。
2.Nucleotide:包含GenBank、RefSeq、PDB資料庫中的人類基因序列資料。
3.Protein:整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq資料庫中的資料,並可參照Taxonomy資料庫,瞭解特定種類的蛋白質的在資料庫中分類狀況的相關說明。
4.Structure:分子構造資料庫。
5.Genome:基因組合序列資料庫。
6.PopSet:可查詢某族群的基因序列,瞭解該族群演進之相關資料。
7.OMIM:遺傳學資料庫。
8.Taxonomy:在NCBI基因資料庫中提及的微生物的核酸或蛋白質序列的分類狀況之相關說明。
9.Books:收錄C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology.4th ed.、Retroviruses.等六本書。