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常用试剂培养基 毕赤酵母实验技术

常用试剂培养基 毕赤酵母实验技术
常用试剂培养基 毕赤酵母实验技术

10×YNB(

13.4%酵母氮源,含硫酸铵不含氨基酸):

溶解

13.4gYNB于100mL水中,过滤除菌,加热至YNB完全溶解,存于4℃。

500×B(

0.02%生物素):

溶解20mg生物素于100mL水中,过滤除菌,放于4℃。

100×AA(

0.5%各种氨基酸):

溶解各50mg L-谷氨酸,L-蛋氨酸,L-赖氨酸,L-亮氨酸,L-异亮氨酸于

100mL

水中,过滤除菌,存于4℃。

10×D(20%葡萄糖):

溶解200g D-葡萄糖于1 000mL水中,高压灭菌15min或过滤除菌,可放1 年。

500×生物素(

0.02%):

溶解20mg生物素于100mL水中,过滤除菌,放于4℃,可放1年。

100×H(

0.4%组氨酸):

溶解400mg L-组氨酸于100mL水中,低于50度加热以促溶解,过滤除菌,

可放1年。

10×M(5%甲醇):

混合5mL甲醇与95mL水,过滤除菌存于4℃,可放2个月。

10×GY(10%甘油):

混合100mL甘油与900mL水,过滤或高压灭菌,室温放置,可存放1年以上。

100×AA(

0.5%各种氨基酸):

溶解各50mg L-谷氨酸,L-蛋氨酸,L-赖氨酸,L-亮氨酸,L-异亮氨酸于

100mL

水中,过滤除菌,存于4℃,可放1年。

1mol/L磷酸钾缓冲液pH

6.0:

32mL 1mol/L K2HPO4,868mL 1mol/L KH2PO4,调整pH值为

6.0±

0.1(如

果需调pH值,用磷酸或KOH)。过滤或高压灭菌,室温下可放1年以上。

100mg/mL遗传霉素:

用无菌水制备30mL100mg/mL遗传霉素贮存液,过滤除菌,存于-20℃。

用来制备含不同终浓度遗传霉素平板:

0.25,

0.5,

0.75,

1.0,

1.5,

1.75,

2.0,

3.0,

4.0。5%酵母提取物,10%胰蛋白陈,10%NaCI,pH

7.0;高压灭菌后4℃保存。

LB平板培养基

在LB液体培养基中加入琼脂粉15g,高压灭菌,冷却至45℃左右时倒平皿,4℃保存。

LA平板培养基

待LB液体培养基冷却至45℃左右加入Amp (100μg/mL),摇匀后倒平皿,4℃保存。

YPD培养基:

1%酵母提取物,2%胰蛋白膝,2%葡萄糖;RDB

转化固体培养基:

(Regeneration DextroseMedium+ Histidine)(lmol/L山梨醇,l%葡萄糖,

1.34%YeastNitrogenBasewithAmmoniumSulfate with amino acids(YNB),

0.004%Biotin,

0.005%谷氨酸,

0.005%甲硫氨酸,

0.005%赖氨酸,

0.005%亮氨酸,

0.005%异亮氨酸,

1.5%xx;)100mL:

超纯水80ml,山梨醇18g(186g/L),琼脂糖2g(20g/L)121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 10ml,10*D(20%葡萄糖)10ml,500*B(

0.02%生物素)

0.2ml100*AA(含每种氨基酸

0.5%)1ml.混匀,倒平板。

YPD-遗传霉素平板:

1%酵母浸出物,2%蛋白胨,2%葡萄糖,2%不同量的遗传霉素

4.0,250mL(8-10个遗传霉素平板)。取1gG418溶于1ml1M的HEPES液或PBS中,加蒸馏水至10ml,过滤消毒,4度保存。具体方法如下:1g包装的G418瓶子中,加入10ml HEPES溶液,浓度为100 mg/ml完全溶解后,

0.22 um过滤,-20度保存。HEPES缓冲液配方如下:90 ml水中,

0.8 g NaCl,

0.037 g KCl,

0.0135 g Na2HPO

4.2H2O,

0.1 g葡萄糖,

0.5 g HEPES,溶解,NaOH调PH至

7.05,定容至100ml。

0.50mg/ml,

0.75mg/ml,

1.0mg/ml,

2.0mg/ml,

4.0mg/ml五个梯度MD:

选择培养基:

(MinimalDextroseMedium+Histidine)(

1.34%YNB,

0.004%Biotin,2%葡萄糖,

1.5%琼脂;)待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 10ml, 10*D (20%葡萄糖)

10ml, 500*B(

0.02%生物素)

0.2ml,混匀,倒平板。

MM:

选择培养基:

(Minimal Methanol+ Histidine )(

1.34%YNB,

0.004%Biotin,

0.05%甲醇,

1.5%xx;)

100mL:

向90mL超纯水中加入琼脂糖2g(20g/L),121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 10ml, , 500*B(0.02%生物

素)

0.2ml,5mL甲醇混匀,倒平板。

BMGY:

(1%酵母提取物,2%蛋白陈,100mmol/L磷酸缓冲液(pH

6.0),

1.34% YNB,

0.004% Biotin,l%甘油(V/V);)

1L:

酵母提取物10g/L,蛋白胨20g/L,K2HPO4 3g/L,KH2PO

411.8G/L,

超纯水890Ml,121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 100ml,500*B(

0.02%生物素)1ml,甘油10mL。

BMMY:

0.5%甲醇代替

甘油,其余成分与BMGY相同。

1L:

酵母提取物10g/L,蛋白胨20g/L,K2HPO43g/L,KH2PO4

11.8G/L,超纯水895Ml,121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 100ml,500*B(

0.02%生物素)1ml,5mL甲醇。

主要溶液

2*SDS样品缓冲液:

25mL 4*Tris?HCl,PH

6.8(

0.lmol/L)20mL甘油[20%(w/v)]

4g SDS[4%(w/v)]2mL2-巯基乙醇或

3.1g DTT

1mg溴酚兰[

0.001%(w/v)]

加蒸馏水至l00mL并混匀,等量分装成lmL于-70℃贮存。

5*SDS电泳缓冲液:

15.lgTris碱(

0.125mol/L)

72.0g甘氨酸(

0.96mol/L)

5.0g SDS[

0.5%(w/v)]

使用前稀释至1XSDS电泳缓冲液,贮存液不必调教pH值,稀释后溶液pH

8.3,考xxxx染色

固定液:

50%(v/v)甲醇10%(v/v)乙酸40%重蒸水染色液:

50%(v/v)甲醇

0.05%(v/v)考马斯亮兰R-25040%重蒸水10%(v/v)乙酸配制时先用甲醇溶解考马斯亮兰,再加入乙酸和水。溶液可保存6个月,若出现沉淀,滤除即可。

脱色液:

7%(v/v)乙酸5%(v/v)甲醇88%重蒸水

一、大肠制备感受态细胞需灭菌的设备大离心管:

小离心管:50ml大枪头5mlLB培养基:10%甘油1挑单个大肠接入LB液体培养基,培养过夜37℃摇床,并做抗性对照。

2以1:100比例接菌,进行大摇(2ml接入200ml培养基中37℃摇床)

3OD达到

0.5-

0.7时,冰上放置20min。4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余4加入等体积的10%甘油轻轻重悬。4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余5加入体积的10%甘油轻轻重悬。4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余

6加入体积的10%甘油轻轻重悬。4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余

7加入适量灭菌10%甘油,一般500ml菌液加入2ml甘油,重悬,8分装,每管40ul,先冻与液氮,然后放入-80℃保存

二、毕赤酵母GS115电转化感受态的制备

1.在含5mLYPD的50mL离心管中,培养P. pastoris,30℃过夜;

2.取

0.1-

0.5mL过夜培养物,接种含50mL新鲜培养基的摇瓶,过夜生长至OD

600=1.3-

1.5;

3.在4℃,1 500 r/min离心5min收集细胞,用5mL预冷的灭菌水悬浮细胞;

4.如上离心,用5 mL预冷的灭菌水悬浮细胞;

5.如上离心,用2mL预冷的1mol/L山梨醇悬浮细胞;

6.如上离心,用1 mL预冷的1mol/L山梨醇悬浮细胞,至终体积约

1.5mL(可

冻存80μL等量的电感受态细胞,但转化效率会下降很多)。

三、xx酵母电转化

1.取80μL上述细胞与5-10μL经S线性化DNA(约5-20ug)混合,转入预冷的

0.2cm电转杯中;

2.在冰上放置5min;

3.根据所使用装置推荐的S. cerivisiae参数进行电击(1 500V,5ms);

4.立即加入1mL预冷的1mol/L山梨醇至杯中,将内容物转移至灭菌离心管中;

5.分成200-600μL等份,涂于RDB平板上,进行His营养缺陷筛选;

6.在30℃孵育平板3-5d,至His+克隆产生。

四.G418筛选多拷贝基因

1)取出长有克隆的3块板,可考虑先挑10-20个菌落先表达;

2)第一块加入2ml灭菌的ddH

2o,用涂布棒打匀,洗后,菌液吸入第二块;

3)第二块加入1ml,洗之,吸入第三块;

4)菌液吸入EP管,可适量补充ddH

2o;

5)混匀后取适量稀释约50倍,4ul×50=200ul每块G418板,G418浓度从

0.25-4.0mg/ml各一块;

6)注意涂布均匀,可适量补充ddH

2o,

7)300C烘箱培养,2-5day,其余菌液可40C保存

注:

a)手册推荐方法:

第4)步将菌液转入EP管中,振荡5-10秒,用分光光度计布~105cells;注意agar的存在会干扰分光光度计的读数。

五.表达:1)从G418板挑单克隆入4ml/管MGY接种,300C,250rpm,2天左右至OD=2-6,颜色乳白;2)取1ml菌液于EP管中保种,余3ml菌液离

心,1500g,5min,菌体换3ml BMMY,加千分之五甲醇,300ul/管;3)每隔24小时加千分之五甲醇;4)至表达之日起2天后每天取样80ul,留作电泳分析;5)表达4天结束,1500g离心,5min,分别收集上清和沉淀;6)上清用作蛋白分析,跑SDS-PAGE电泳,WesternBlotting分析,ELISA分析,样品浓缩,纯化分析等

六.质粒提取(碱裂解)

(1)溶液I:50 mmol/L葡萄糖,25 mmol/L Tris-HCl(pH

8.0),10 mmol/L EDTA (pH

8.0),配制200ml。

取葡萄糖(C

6H

12O

6.H

2O)

1.982 g,双蒸去离子水160 ml,

0.5 mol/L EDTA 4ml,1mol/L Tris-HCl(pH

8.0) 5 ml,定容至200 ml,高压灭菌后4℃保存。

(2)溶液II:

0.2 mol/L NaOH, 1%SDS。配制100 ml,现用现配。

10 mol/L NaOH 2 ml,双蒸去离子水80 ml,10%SDS 10 ml,最后用双蒸去离子水定容至100 ml,室温保存。

(3)溶液III:

配制100 ml。

5 mol/L乙酸钾60 ml,冰乙酸

11.5 ml,双蒸去离子水

28.5 ml。

(4)5 mol/L乙酸钾(200 ml)乙酸钾

98.14 g,溶解于160 ml双蒸去离子水中,搅拌溶解后定容至200 ml。

(5)3 mol/L乙酸钠(NaAc)(pH

5.2)取乙酸钠(CH

3COONa.3H

2O)

204.1g,溶解于200 ml双蒸去离子水中,用冰乙酸调pH

5.2,双蒸去离子水定容至500 ml,高压灭菌后4℃保存。

(6)10 mol/L NaOH溶液(100 ml)NaOH晶体40 g,加水至100 ml。称取SDS 10g,溶解于80 ml水中,68℃助溶,加数滴1 mol/L HCl调pH

7.2,定

容至100 ml。

(8)

0.5 mol/L EDTA(pH

8.0)(100 ml)。

Na

2EDT

A.2H

2O

18.61 g, H

2O 70 ml,边搅拌边加入NaOH固体调节pH,接近pH

8.0

时才充分溶解,大约需NaOH 2g。最后加水至100 ml。

2、质粒的提取

(1)吸取

1.5毫升菌液至

1.5 ml Eppendorf离心管中,3 000 rpm离心3分钟,

弃上清液。

(2)加上

1.5毫升菌液,重复操作(1)。

(3)用移液器尽可能除去上清液,加入预冷150微升溶液I,震荡。

(4)加入200微升溶液Ⅱ,缓慢地上下翻转离心管约10次,勿震,混合均匀。

室温下放置5分钟。

(5)加入150微升溶液Ⅲ,上下翻转离心管约10次,混合均匀,冰浴10分钟。

4℃,12,000 rpm离心5分钟。

(6)用移液器将上清液转移到新的

1.5mlEppendorf离心管中,加入1倍体积

(400微升)异丙醇抽提,12 000 rpm离心5分钟。

(7)弃上清,加入1ml70%乙醇洗涤沉淀一次,离心5-10min

(8)弃上清,烘干10min。

(9)加20微升TE缓冲液(含20ul/ml RNase)溶解DNA沉淀,37℃半小时,-20℃

保存。

1.pPIC9K+pulluGene(histag)——GS115(His缺陷筛)——G418筛——GS115-Pullu——酶活性鉴定

2.pulluGene分析——选择tRNA Genes——设计引物以GS115基因组为模板PCR——tRNA Genes

3.pFLDa+ tRNA Genes——GS115-Pullu(zeocin筛)——GS115-Pullu-plus——酶活鉴定——表达量比较

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