NTSYS-PC使用说明
1 数据的录入方法：
1.1 利用Ntedit直接录入数据
0、1二元数据中的数据缺失记为2。其中列标可以写为样品编号，在No.rows 栏中写入0、1数据总数，No.cols 栏中写入样品总数。文件另存为*.nts格式。
1.2 从excel表中直接读入数据
Excel表中输入数据格式如下图。A1必须为1，B1为0、1数据总数，C1为样品总数。
打开Ntedit程序，选择从Excel表输入，结果见上图。文件另存为*.Nts格式
1.3 Ntsys-pc可以直接运行*.phy格式的文件（由phylip和phytool产生）
1.4 DNA序列数据Ntsys-PC也可以分析，但好像用的人较少。建议大家使用phylip或者其他的软件。DNA序列数据在Excel 中输入格式如下：
1.5 其他数据的Excel输入如下：
2 聚类分析
Ntsys-pc2.02界面如下：
以下以图中数据为例介绍聚类过程：
2.1 首先用similarity程序组中的SimQual计算形似系数矩阵。Coefficient通常选用SM 或DICE，结果输出到另一文件
2.2 以上步的结果作为input file利用Clustering程序组中的SHAN或者Njoin进行计算，聚类分法选用UPGMA，ties选用FIND，Maximum no. tied trees至少大于样品数。
Njoin程序组界面如下，rooting method可以选用Outgroup，但需输入外元。
2.3 将SHAN或NJoin方法得到的tree file文件输入到Graphics程序组中的tree plot程序中计算
得到树图如下
利用options可以对树图进行描述与处理.在此略去.
2.4 一致性分析：
可以用Clustering中的consens程序进行，两个不同文件分别输入；同一文件中不同的进化树之间的分析，则只输入到input tree1 file即可。通常多选用MAJRUL方法
2.5 其他数据的聚类方法与此类似，在此不再赘述。
平和精工汽车配件有限公司 一：目的 为了指导使用人员正确使用及维护此实验仪器，避免因操作失误而影响测量数据的准确性，特制定本操作手册 二：适用范围 本手册只适用于C2003A型金相显微镜使用 三：测量环境： 温度:18～40℃ / 湿度: 55%以下 四：金相显微镜介绍 ●对观察不透明物体的反射照明显微镜一般通称为金相显微镜. ●电脑型金相显微镜系统是将传统的光学显微镜与计算机通过光电转换有机的结合在一起，不仅可以 在目镜上作显微观察，还能在计算机显示屏幕上观察实时动态图像，电脑型金相显微镜并能将所需要的图片进行编辑、保存和打印 ●金相显微镜的放大原理：显微镜是由两块透镜（物镜和目镜）组成，并借物镜、目镜两次放大、使 物体得到较高的倍数. ●金相显微镜各部件名称 1: 目镜 2：物镜 3：照明推杆4：照明推杆 5：起偏振片 6：视场光栏调节手柄 7：视场光栏调节螺钉 8：滤色片转盘 9：聚光镜调节手柄 10：孔径光栏调节手柄 11：灯箱固定螺钉 12：灯箱
13：三目头 14：粗动手轮 15：微动手轮 16：纵向手轮 17：横向手轮 18：载物台 19：检偏振片推杆 五：照射影像分析前准备 1：确认金相显微镜各配件是否完整无损. 2：确认仪器是否在合格有效期内. 3：试样准备 例如：测量钢材的渗碳层厚度 3-1 对试样进行切割（参照金相切割机操作手册） 3-2 对试样进行镶嵌（参照金相显微镜操作手册） 3-3 对试样进行抛光（参照金相显微镜操作手册） 3-4 对试样进行侵蚀 ( 在某些合金中，由于各相组织物的硬度差别较大，或由于各相本身色泽显著不同，抛光状态下能在显微镜中分辨出它的组织.但大部分的显微组织均需经过不同方向侵蚀，才能显示出各种组织来，常用的 金属组织侵蚀法有化学侵蚀及电解侵蚀法等.)
金相分析软件介绍 检验类别模块名称功能说明 1、金属平均晶粒度【001】金属平均晶粒度测定… GB 6394-2002 自动评级【010】铸造铝铜合金晶粒度测定…GB 10852-89 【019】珠光体平均晶粒度测定…GB 6394-2002 【062】金属的平均晶粒度评级…ASTM E112 【074】黑白相面积及晶粒度评级…BW 2003-01 【149】彩色试样图像平均晶粒度测定…GB 6394-2002 辅助评级【304】钨、钼及其合金的烧结坯条、棒材晶粒度测试方法（面积法）自动评级【305】钨、钼及其合金的烧结坯条、棒材晶粒度测试方法（切割线法）自动评级【322】铜及铜合金_平均晶粒度测定方法…YS/T 347-2004 自动评级【328】彩色试样图像平均晶粒度测定方法２ 2、非金属夹杂物显微评定【002】非金属夹杂物显微评定…GB 10561-89 自动评级【252】钢中非金属夹杂物含量的测定标准评级图显微检验法…GB/T 10561-2005/ISO 4967:1998 3、贵金属氧化亚铜金相检验【003】贵金属氧化亚铜金相检验…GB 3490-83 自动评级 4、脱碳层深度测定【004】脱碳层深度测定…GB 224-87 辅助评级 5、铁素体晶粒延伸度测定【005】铁素体晶粒延伸度测定…GB 4335-84 自动评级 6、工具钢大块碳化物评级【006】工具钢大块碳化物评级…GB 4462-84 自动评级 7、不锈钢相面积含量测定【007】不锈钢相面积含量测定…GB 6401-86 自动评级 ８、灰铸铁金相【008】铸铁共晶团数量测定…GB 7216-87 自动评级【056】贝氏体含量测定…GB 7216-87 【058】石墨分布形状…GB 7216-87 比较评级 【059】石墨长度…GB 7216-87 辅助评级【065】珠光体片间距…GB 7216_87 【066】珠光体数量…GB 7216_87 自动评级【067】灰铸铁过冷石墨含量…SS 2002-01 【185】碳化物分布形状…GB 7216-87 比较评级 【186】碳化物数量…GB 7216-87 自动评级 【187】磷共晶类型…GB 7216-87 比较评级【188】磷共晶分布形状…GB 7216-87 【189】磷共晶数量…GB 7216-87 自动评级
西北农林科技大学 2009级硕博连读研究生学位论文开题报告 黄牛、水牛和牦牛Y染色体分子遗传多样性与起源研究Y-chromosome Molecular Genetic Diversity and Origins in Cattle, Buffalo and Yak 学院：动物科技学院 学科、专业：动物遗传育种与繁殖 研究方向：动物遗传学 研究生：XX 指导教师：雷初朝教授
黄牛、水牛和牦牛Y染色体分子遗传多样性与起源研究 一、选题的目的与意义 黄牛、水牛和牦牛是我国3个重要的牛种，具有对周围环境的高度适应性、耐粗放管理、抗病力强、繁殖力高、肉质好等特点。这些地方牛种本身就是一座天然的基因库，正是进行杂种优势利用和进一步培育高产品种的良好原始材料。在当今世界畜禽品种资源日趋匮乏，品种逐步单一化的情况下，对我国这些牛种遗传资源的保护将对今后的育种工作产生很大的影响，起到难以估量的作用[1]。 中国黄牛的起源进化与遗传多样性一直是国内外动物遗传学家感兴趣的课题之一。一般认为，中国黄牛是多元起源的，并主要受普通牛和瘤牛的影响，但究竟起源于哪几个牛种，观点不一[2, 3]。在黄牛遗传多样性方面，自二十世纪八十年代以来，众多研究者分析了中国地方黄牛的核型，发现不同黄牛品种的Y 染色体形态具有明显的多态性，普通牛为中着丝粒或亚中着丝粒，瘤牛为近端着丝粒[4-6]。常振华等发现中国黄牛Y染色体主要属于Y2（普通牛）和Y3（瘤牛）单倍群[7]，但事实上黄牛的每种Y染色体单倍群下都可细分为多种单倍型，而中国黄牛由哪些Y染色体单倍型组成，有无优势单倍型以及单倍型的品种分布有无地理特点，与国外黄牛品种有何不同，这些问题都亟待阐明，以期为黄牛品种资源保护和杂交育种工作提供参考依据。 中国也拥有丰富的水牛资源。水牛的驯化时间，地点尚无定论，国内一些学者在形态学和考古学方面进行了一些研究，给中国水牛的驯化历史提供了一些参考[8, 9]，但仅靠形态学和考古学的研究是远远不够的，还需要分子遗传学的更多证据。目前国内外对水牛的起源研究主要是在线粒体DNA的母系起源方面，认为水牛有两个母系起源（A支系和B支系）[10-12]，近年来，也有中国学者对水牛的常染色体微卫星多态性进行了研究，其结果都表明中国水牛的遗传多样度丰富，倾向于支持中国水牛的本土起源假说[13, 14]。对Y染色体遗传多样性的研究，将提供更多的分子遗传学信息，会有助于评估水牛的遗传资源状况，也有助于阐明中国水牛的驯化历史。 牦牛主要分布于我国的青藏高原，俗称“万能种”，通常皆为兼用，如乳、肉、毛、皮、役力，是经济价值极高的珍贵畜种[1]。家牦牛是在青藏高原驯化的，藏族自古以来生息于西藏，是驯化牦牛之主，因此牦牛的驯化始终与藏族文化的发展休戚相关，是当地人民不可分离的生产和生活资料[15]。从牦牛生活的特定气候地带的适应性和生态地理、生理特征的表现看，牦牛是地球之巅特有的高寒环境中生存的一个宝贵的特化种，牦牛的驯化与繁衍有着与其他牛种极其不同的种类特点，牦牛对高寒山区的气候和贫瘠的草地所具有的特殊的适应性也是世界
中国主要东方蜜蜂种群的遗传多样性分析 任勤1，曹联飞2，赵红霞3,，王瑞生1，程尚1，罗文华1,曹兰1，姬聪慧*1 （1.重庆市畜牧科学院，重庆 402460；2.浙江省农业科学院，浙江杭州 310021；3. 广东 省生物资源应用研究所，广东广州 510260） 摘要：对中国具代表性的东方蜜蜂遗传资源中7个种群的线粒体DNA tRNA leu～ CO Ⅱ基因进行扩增和测序,并进行遗传多样性比较及亲缘关系分析。结果表明，共发现43个单倍型，其中10个单倍型在GenBank数据库对比确认属于新发现单倍型；7个群体中，阿坝中蜂、滇南中蜂和海南中蜂遗传多样性水平较高，长白山中蜂遗传多样性水平较低，其他群体遗传多样性居中；不同种群间遗传距离变化较大，其中海南中蜂与滇南中蜂、阿坝中蜂间的遗传距离最大，长白山中蜂与云贵中蜂、北方中蜂、华南中蜂间的遗传距离最小；聚类分析显示7个种群可聚为4个类群。 关键词：东方蜜蜂；遗传多样性；线粒体DNA 中图分类号：文献标志码：A Analysis of genetic diversity of Apis cerana populations in China REN Qin1, CAO Lianfei2,ZHAO Hongxia3,WANG Ruisheng1,CHENG Shang1,LUO Wenhua1,CAO Lan1, JI Conghui*1 （1.Chong Qing Academy of Animal Science，Chongqing 402460，China；2.Zhejiang Academy of Agricultural Sciences，Zhejiang 310021，China; 3.Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangdong 510260, China） Abstract:The mitochondrial DNA tRNA leu～CO II genes in 7 populations of Apis cerana Fabricius in China were amplified and sequenced, and their genetic diversity and phylogenetic relationships were analyzed. The results showed that a total of 43 haplotypes were identified, of which 10 haplotypes were identified new haplotypes in the GenBank database, Among 7 populations, Aba bee, Hainan bee and Yunnan bee have higher level of genetic diversity, Changbai Mountain bee has lower level of genetic diversity, other populationswere intermediate; The genetic distances between different populations varied greatly, of which Hainan bee andhave maximum genetic distance with Yunnan bee and Aba bee, The genetic distances between Changbai mountain bee and Yunnan bee, Middle China bee, Northern bee and Southern bee were small.; Cluster analysis showed that the 7 populations could be clustered into 4 taxa. Key words:Apis cerana Fabricius; genetic diversity; mitochondrial DNA 收稿日期： 基金项目:国家蜂产业技术体系基金项目（CARS-45SYZ15）;重庆市畜牧科学院基金项目(16421). 作者简介：任勤(1979-), 男, 宁夏固原人，助理研究员, 硕士研究生，主要从事蜜蜂方面的研究。 通信作者：姬聪慧(1980-)，女，河南平顶山人，助理研究员，硕士研究生。
NTSYS-PC使用说明 1 数据的录入方法： 1.1 利用Ntedit直接录入数据 0、1二元数据中的数据缺失记为2。其中列标可以写为样品编号，在No.rows 栏中写入0、1数据总数，No.cols 栏中写入样品总数。文件另存为*.nts格式。 1.2 从excel表中直接读入数据 Excel表中输入数据格式如下图。A1必须为1，B1为0、1数据总数，C1为样品总数。 打开Ntedit程序，选择从Excel表输入，结果见上图。文件另存为*.Nts格式 1.3 Ntsys-pc可以直接运行*.phy格式的文件（由phylip和phytool产生） 1.4 DNA序列数据Ntsys-PC也可以分析，但好像用的人较少。建议大家使用phylip或者其他的软件。DNA序列数据在Excel 中输入格式如下：
1.5 其他数据的Excel输入如下： 2 聚类分析 Ntsys-pc2.02界面如下： 以下以图中数据为例介绍聚类过程： 2.1 首先用similarity程序组中的SimQual计算形似系数矩阵。Coefficient通常选用SM 或DICE，结果输出到另一文件
2.2 以上步的结果作为input file利用Clustering程序组中的SHAN或者Njoin进行计算，聚类分法选用UPGMA，ties选用FIND，Maximum no. tied trees至少大于样品数。 Njoin程序组界面如下，rooting method可以选用Outgroup，但需输入外元。 2.3 将SHAN或NJoin方法得到的tree file文件输入到Graphics程序组中的tree plot程序中计算
SPAGeDi1.3 a program for S patial P attern A nalysis of Ge netic Di versity by Olivier J. H ARDY and Xavier V EKEMANS with the contribution of Reed A. C ARTWRIGHT Copyright (c) 2002-2009 Olivier Hardy and Xavier Vekemans User’s manual Address for correspondence: Service Eco-éthologie Evolutive, CP160/12 Université Libre de Bruxelles 50 Av. F. Roosevelt B-1050 Brussels, Belgium e-mail: ohardy@ulb.ac.be Last update: 22 March 2009
Contents 1. Note about SPAGeDi 1.3 and installation 2. What is SPAGeDi ? 2.1. Purpose 2.2. How to use SPAGeDi – short overview 2.3. Data treated by SPAGeDi 2.4. Three ways to specify populations 2.5. Statistics computed 3. Creating a data file 3.1. Structure of the data file 3.2. How to code genotypes? 3.3. Example of data file 3.4. Note about distance intervals 3.5. Note about spatial groups 3.6. Note about microsatellite allele sizes 3.7. Using a matrix to define pairwise spatial distances 3.8. Defining genetic distances between alleles 3.9. Defining reference allele frequencies for relatedness coefficients 3.10. Present data size limitations 4. Running the program 4.1. Launching the program 4.2. Specifying the data / results files 4.3. Selecting the appropriate options 4.4. Information displayed during computations 5. Interpreting the results file 5.1. Basic information 5.2. Allele frequency analysis 5.3. Type of analyses 5.4. Distance intervals 5.5. Computed statistics 5.6. Permutation tests 5.7. Matrices of pairwise coefficients/distances 6. Technical notes 6.1. Statistics for individual level analyses 6.2. Statistics for population level analyses 6.3. Inference of gene dispersal distances 6.4. Estimating the actual variance of pairwise coefficients for marker based heritability and Q ST estimates 6.5. Testing phylogeographic patterns 7. References 8. Bug reports
金相图像分析软件 使用手册
1、系统安装 1.1系统组成 *金相显微镜 *数字摄像头或数码照相机 *显微镜接口 *金相图像分析软件 *PC品牌计算机（中文WINDOWS/XP操作系统） *打印机 *使用手册 1.2软件安装 *将USB密码狗插在计算机USB插口上 *通过接口将摄像头与显微镜相连(或用数码相机采集金相图象后存入计算机) *打开计算机，在我的电脑中打开优盘，首先安装密码狗驱动程序：双击‘dogdrive’再点击 狗头图标，安装完毕后退出；双击金相软件 ?setup?根据提示安装，会在桌面自动生成快捷方式。 1.3打开软件 用鼠标在桌面上点击?金相分析软件?图标，进入软件界面： 2、图像采集 2.1 图像采集 鼠标点击‘摄像头’-‘预览’则显微图像实时显示在计算机屏幕上，调整显微镜载物台，选择最佳视场，调整显微镜焦距，使图像清晰。此时图像处于活动状态，点击‘图像采集’图像自动定格在软件界面上。 2.2图像保存 在?文件?菜单选择?保存图像?，或按下?保存?图标，在文件对话框中选择合适的路径，输入正确的文件名，则将当前显微图像以256色BMP位图像格式保存到电脑磁盘中存盘。 2.4打开图像 在?文件?菜单中选择?打开?，或按下工具栏中?打开?图标，在文件对话框中选择 要打开的 图像文件，将磁盘中图像调出以便处理。 3、 3.1名词解释 灰度象点的明暗程度，最亮（白）为255，最暗（黑）为0。 图像处理通过特定的数学模型计算，改善图像的质量。
3.2亮度对比度调整 在?处理?菜单中选择?灰度变换?，在下一级菜单中选择?亮度对比度?，在对话框中移动滚动条或直接输入一个从-50-50之间的数字，正数加大亮度对比度，负数减小亮度对比度。按下确认按钮开始执行。 3.3滤波 3.3.1平滑滤波 平滑滤波可以消除或减弱图像中的污点、水渍、划痕、空洞等 噪音，有效改善图像质量，操作方法为在?处理?菜单上选择?滤波?，在下一级弹出菜单中选择?平滑滤波?。 3.3.2锐化滤波 锐化滤波的目的在于增强图像上如晶界、相界、夹杂等细节， 操作方法为在?处理?菜单上选择?滤波?，在下一级弹出功能 表中选择?锐化滤波?，在滤波对话框中选择滤波操作数的模式， 然后按下?确定?按钮。不同的滤波操作数对不同的图像有效，实践中可试用不同的操作数处理比较，选择适宜的操作数。 3.4图像分割 图像分割的目的在于将特征物与背景分离，将原始灰度图像变换为便于处理的黑白二色图像。如将球墨铸铁的石墨与基体分离，石墨用黑色表示，基体用白色表示。图像分割是图像识别的关键步骤。操作步骤为：在?处理?菜单中选择?图像分割?，则系统对当前图像自动进行分割，并在分割对话框中给出当前灰度图像的直方图和最佳分割阈值，操作者可以根据经验和实验适当调整阈值的大小。按下?确定?按钮将图像变换为黑白二值图像。 3.5图像反视 图像反视目的在于将灰度图像黑白反置。操作方法为在?处理?菜单中选择?图像反视?。3.6图像融合：打开?处理-图像融合?，打开一幅图，点击源图像，再打开另一幅图，点击融合既可。 3.7各处理方法功能简介 腐蚀沿特征物周围剥掉一圈，利用此功能可以消除小的噪音颗粒和麻点。 膨胀沿特征物周围扩展一圈，利用此功能可以填充小的空洞。 开相当于先进行腐蚀运算，然后再进行相同次数的膨胀运算，利用此 功能可以实现相连颗粒的分离。 闭相当于先进行膨胀运算，然后再进行相同次数的腐蚀运算，利用此 功能可以实现分离特征物的连接。如可实现断开晶界的连接重建。 提取边界提取颗粒的边界图像。 提取骨架提取颗粒的骨架，如可以将晶界提取为单线宽。 4.图像编辑 4.1设置窗口 默认状态下，图像处理和编辑的对象为整个图像，要对局部区域的图像进行处理，应该设置 图像窗口。 操作步骤：在软件界面右上角选择窗口形状，将鼠标光标移动到欲设窗口的图片上， 按下左键移动光标到欲设窗口右下角。在状态区中显示窗口的左上和右下坐标。 4.2取消窗口 在在软件界面右上角选择三角图标级即可。
Matlab图形图像处理在定量金相分析中的应用 摘要：本文讨论了Matlab的图形图像处理功能如何应用到定量金相分析研究中，并通过晶粒度测定和两相合金中第二相颗粒几何尺寸测量两个实例进行了验证。结果表明采用该软件可以高效、方便地实现定量金相分析功能。 关键词：Matlab 图形图像处理定量金相分析 1. 引言 1.1 定量金相分析和体视学 金相分析是材料科学中的一项重要技术，其实质是观察金属材料微观结构的图像并做出分析和判断的过程。在这个过程中，金属材料微观结构图像是核心。通过显微镜的观察，可以鉴别各种组织，观察其组织特征，并建立起组织和性能间的定性关系。这对于材料的研究、生产和使用无疑具有极大的理论意义和实际意义。而定量金相正是通过测定显微组织的各种特征参数，在材料的微观组织和它的宏观性能间建立起定量关系的一种分析测试方法。 我们研究的材料通常是不透明的，因此不能直接观察组织的三维立体图像，只能在二维金相试样磨面或薄膜透射投影图上对材料组织进行测量，然后去推断三维图像。这种从二维图像直接去推断三维组织图像的科学就叫体视学，把体视学应用于金相学研究的科学就叫定量金相学。 定量分析中常用的体视学基本方程有： 1.2 Matlab简介 Matlab是由MathWorks公司开发的一种主要用于数值计算及可视化图形处理的工程语言。它将数值分析、矩阵计算、图形图像处理、信号处理和仿真等诸多强大的功能集成在较易使用的交互式计算机环境之中，为科学研究、工程应用提供了一种功能强、效率高的编程工具。Matlab图形处理工具箱有一百多种工具函数，包括图像类型转换、图像文件I/O和显示、线性滤波、图像统计分析、图像增强、图像的形态学分析、二值图像处理等多个方面。可见Matlab图形图像处理功能完全能够胜任定量金相分析工作。 2. 定量金相分析的Matlab实现 基本思路：原始图像读入→图像预处理（直方图均衡化、图像增强、平滑滤波）→图像二值化→二值图像形态学处理（腐蚀、膨胀、开运算、闭运算）→图像分割及特征提取（边缘检测、面积提取）→利用体视学公式计算所需的三维组织特征参数。 2.1 图像读入 可用工具箱中的imread函数读入图像，Matlab支持以下几种图像文件格式：BMP、GIF、TIFF、JPEG、HDF、PCX、XWD、PNG、ICO、CUR、PGM、PPM和RAS等类型，imshow函数显示图像，imwrite函数保存图像。 2.2 图像预处理 对于一幅图像如果整体进行处理，不仅浪费时间，而且图像其他部分可能会影响处理效果，可以先通过图象剪切函数imcrop剪切下我们所关心的、特征明显的一部分图像，然后再对这部分图像进行相关处理。 图像预处理是相对于图像识别、图像理解的一种前期处理。通常图像会出现边缘过于模糊；图像上出现一些不知来源的黑点或白点；图像失真、变形等，因而要进行图像增强，按特定需要突出一幅图像中的某些有用信息，同时，削弱或去除某些不需要的信息，改善图像质量。如改变图像对比度、去除噪声或强调边缘等处理。 图像增强主要包含灰度变换增强、图像平滑处理、图像锐化处理等。 灰度变换增强主要用的是直方图均衡化histeq和对比度增强imadjust。 图像平滑主要目的是减少图像噪声。Matlab提供的图像平滑函数主要有wiener2、medfilt2和ordfilt2。wiener2用于实现线性平滑滤波；medfilt2用于实现中值滤波；ordfilt2是二维统计顺序滤波，它是中值滤波的推广。 图像锐化的目的就是使边缘和轮廓线模糊的图像变得清晰，并使其细节清晰。因锐化会使噪声受到比信号还强的增强，故一般是先去除或减轻干扰噪声后才能进行锐化处理。可以用laplacian算子锐化和prewitt模板锐化。 2.3 图像二值化 Matlab提供了多种图像类型转换函数，其中二值化图像函数主要有dither和im2bw。函数dither通过颜色抖动来达到转换图像的目的，函数im2bw通过设置阈值将灰度及真彩图像转换成二值图像。 2.4 二值图像数学形态学处理 数学形态学运算主要包括膨胀运算imdilate、腐蚀运算imerode、开运算imopen与闭运算imclose，以及利用形态学运算族bwmorph 对图像进行多种处理。 2.5 特征提取及特征参数计算 特征提取就是给出某一具体图像中与其它图像相区别的特征，如描述物体外形的形状特征等。Matlab提供的edge函数用于灰度图象边缘检测，bwperim函数用于二值图像边缘提取，bwarea用于二值图像面积测量，bwlabel实现连接成分标记等。 3. 实例分析 3.1 晶粒度的测定 材料的晶粒的大小叫晶粒度。它直接影响着材料的相关力学性能，因而测量晶粒度具有十分重要的实际意义。材料的晶粒度一般是以单位测试面积上晶粒的个数来表示。目前世界上统一使用的是美国ASTM推出的计算晶粒度的公式：
遗传多样性分析的方法与步骤 摘要：本文对生物的遗传多样性进行阐述，并综述了检测遗传多样性的形态学标记、细胞学标记、生物化学标记和分子标记4种遗传标记的发生与发展过程,并比较了各自的优缺点及其应用。 关键词：遗传多样性；形态学标记；细胞学标记；生物化学标记；DNA分子标记Genetic Diversity Analysis Method and Steps Abstract:In this paper, the biological genetic diversity were summarized, and elaborates the detection of genetic diversity morphology mark, cytology mark, biochemical markers and molecular marker and genetic markers of the occurrence and development of the process, and compare their advantages and disadvantages and application. Keywords:genetic diversity; Morphological markers; Cytology mark; Biochemical markers; DNA molecular markers 前言遗传多样性是生态系统多样性和物种多样性的基础,任何物种都有其独特的基因库或遗传组织形式[1]。广义的遗传多样性是指地球上所有生物所携带的遗传信息的总和,但通常所说的遗传多样性是指种内的遗传多样性,即种内不同种群之间或一个种群内不同个体的遗传变异[2]。遗传多样性的表现形式是多层次的,可以从形态特征、细胞学特征、生理特征、基因位点及DNA序列等不同方面来体现,其中DNA多样性是遗传多样性的本质[3]。通常,遗传多样性最直接的表现形式就是遗传变异水平的高低。然而,对任何一个物种来说,个体的生命是短暂的、有限的,而由个体构成的种群或种群系统(宗、亚种、种)在自然界中具有其特定的分布格局,在时间上连续不断,是进化的基本单位。因此,遗传多样性不仅包括变异水平的高低,而且包括变异的分布格局,即种群的遗传结构。种群遗传结构上的差异是遗传多样性的重要体现,一个物种的进化潜力和抵御不良环境的能力既取决于种内遗传变异的大小,也有赖于种群的遗传结构[4]。 1 遗传多样性的意义 根据联合国5生物多样性公约，生物多样性是指所有来源的活的生物体中的变异性, 包括陆地、海洋和其它水生生态系统及其所构成的生态综合体[ 1-7]。遗传多样性作为生物多样性的重要组成部分, 是生态系统多样性和物种多样性的基础方面, 任何物种都有其独特的基因库和遗传组织形式, 物种的多样性也就显示了基因的多样性。因此, 广义的遗传多样性是指地球上所有生物所携带的遗
PMG3型光学金相显微镜与金相图像分析系统使用规则 主要技术参数： OLYMPUS PMG3型倒置式光学金相显微镜同自动显微摄影系统PM20型的曝光控制装置一起使用，除可完成不同倍率的金相组织观察与用大版照相机背或35mm照相机背显微摄影外，还可与北京中科科仪计算技术有限责任公司开发的SISC IAS.V8.0金相图像分析系统配套使用。 SISC IAS.V8.0金相图像分析系统拥有通用图像分析模块和专用定量金相分析模块。其功能可分为基本功能、主要功能、辅助功能和专用功能。 基本功能包括图像的采集、存取及打印等。 主要功能包括图像标尺的标定、原始图像的阈值分割、原始图像的校正增强处理等。 辅助功能包括各项参数、属性的设定、操作过程控制、编辑等。 专用功能①比较图法一即人工评定法，是把金相标准图谱与当前采集图像以相同倍率在同一个屏幕上显示，由人眼对照标准图谱确定当前图像的组织级别；②定量金相分析法一是使用图像测量技术测量金相图像得出定量化数据，从而评定组织级别的方法，如晶粒度测量、夹杂物评定、深度测量、球墨铸铁金相检验和粒度分析等。 主要技术规格： 放大倍数：物镜10X、40X 目镜10X (其中一个待测维尺） 照明系统：6V、20W卤素灯，亮度可调电源电压：交流220V，50HZ 载物台尺 寸：200X 152mm 载物台移动范围：15X15mm 瞳距调节范围：53?75mm 使用范围： 适于一般的金相组织观察及简单的定量测量（如渗碳层深度）。 使用规则： 使用前必须熟悉使用说明及显微镜各部分的作用。 保持显微镜及实验桌的清洁，样品在全部干燥后方可放在显微镜的载物台上，使用前必须将手洗净擦干。 清洁显微镜应先用驼毛刷再用擦镜纸。 不得在显微镜上任何部分使用酒精，清除浸油物镜上的油时只能用二甲苯或笨。 除驼毛刷或擦镜纸外，禁止任何物品接触物镜和目镜，不得用手触及其玻璃部分。 显微镜筒上必须放置镜头或套帽，以免灰尘进入其内部。
BJ4XC-W金相分析仪 一、概述 铂鉴牌金相分析仪用于鉴别和分析各种金属和合金材料的组合结构，广泛应用在工厂或实验室进行铸件质量的鉴定；原材料的检验或材料处理后的金相组织分析；以及对表面喷涂等一些表面现象进行研究工作。是钢铁、有色金属材料、铸件、镀层的金相分析；地质学的岩相分析；以及工业领域对化合物、陶瓷等进行微观研究的有效手段，是金属学和材料学研究材料组织结构的必备仪器，也广泛应用于生物、医学和教学等领域。 越来越多的研究已不满足常规的金相显微及照相方式，将显微成像输入微机，由微处理器对图像作各种后期处理，是同步于当今世界在显微领域新技术。图像金相显微镜，接入了高清晰度的CCD摄像系统，由计算机对图像进行处理、编辑、保存和输出（如打印等）或进入多媒体系统及电子信箱。 如果进一步接入图像分析计算机操作系统，还可以进一步对金相图谱进行研究分析，或对图像作精密测量，及多功能的图像形态分析、统计及输出图文报告。 《金相自动分析系统2012》是为从事金相检验的单位或个人专门开发的一套计算机软件系统，它的基本原理是：用视频采集卡或数码相机等硬件设备，采集到金相显微镜中的金相图片，再对该图片进行处理和分析，得到相关检验结果。 二、图像金相显微镜BJ4XC-W配置 1、金相显微镜BJ4XC 2. 图像适配镜 3. 图像传感摄像机 4. 金相分析软件（选配） 5、电脑和打印机 三、主要功能： ◇图像编辑软件：图像采集，图像存储等十多种功能； ◇图像软件：影像增强，图像叠加等十多种功能； ◇图像测量软件：周长、面积、百分含量等几十种测量功能； ◇输出方式：数据表格方式输出，直方图输出，图像打印输出。
金相分析技术及其应用 金属的性能取决于它的成分和微观组织，其中微观组织对金属性能的影响最为直接，因此我们可以通过对金属微观组织的观察和分析（即金相分析技术）来预测和判断金属的性能，并分析其失效破坏的原因。金相分析技术是根据有关的标准和规定来评定金属材料内在质量的一种常规检验方法，并可用来判断零件生产工艺是否完善，有助于寻求零件产生缺陷的原因，因此它是涉及金属材料生产、使用和科研中一种必不可少的手段。 进行金相分析，首先应根据各种检验标准和规定制备试样（即金相试样），若金相试样制备不当，则可能出现假象，从而得出错误的结论，因此金相试样的制备十分重要。通常，金相试样的制备步骤主要有：取样、镶嵌、标识、磨光、抛光、浸蚀，但并非每个金相试样的制备都必须经历上述步骤，如果试样形状、大小合适，便于握持和磨制，则不必进行镶嵌；如果仅仅检验金属材料中的非金属夹杂物或铸铁中的石墨，就不必进行浸蚀。总之，应根据检验的目的来确定制样步骤。 一、金相试样制备与观察 1、取样 取样是金相试样制备的第一道工序，若取样不当，则达不到检验目的。因此，取样的部位、数量、磨抛光面方向等应严格按照相应的标准规定执行。 （1）取样部位和磨面方向的选择
取样部位必须与检验目的和要求相一致，使所切取的试样具有代表性。必要时应在检验报告单中绘图说明取样部位、数量和磨抛光面方向。 图1-1表示轧制型材金相试样的切取方位，一般纵断面（图1-1中的1、2、4、5）主要用于：1）检验非金属夹杂物的数量、大小和形状；2）检验晶粒的变形程度；3）检验钢材的带状组织，以及通过热处理对带状组织的消除程度。横断面（图1-1中的3）主要用于：1）检验从表面到中心金相组织变化情况；2）检验表层各种缺陷，如氧化、脱碳、过烧、折叠等；3）检验表面热处理结果，如表面淬火的淬硬层，化学热处理的渗碳层、氮化层、碳氮共渗层以及表面镀铬、镀铜层等；4）检验非金属夹杂物在整个断面上的分布；5）测定晶粒度等。 （2）取样方法 金相试样一般为φ12×12mm的圆柱体或12×12×12mm的立方体。
目录 引言 (3) 第一章概述 (4) 1.1量测软件的特点 (5) 1.2 量测软件简介 (5) 1.3安装量测软件 (6) 1.4量测软件卸载 (13) 第二章仪器连线设定 (14) 2.1 CCD连线设定 (15) 第三章量测功能使用 (16) 3.1 线 (17) 3.2点线距 (17) 3.3平行线距 (18) 3.4度 (19) 3.5弧 (19) 3.6回归圆 (19) 3.7圆心距 (20) 第四章汇出功能使用 (21) 4.1 汇出到Word (22) 4.2 汇出到Excel (22) 4.4 直接打印 (23) 第五章校正 (24) 5.1 表头设定 (25) 5.2 语言的切换 (25)
5.3 帮助文件 (26) 5.4 玻璃尺校正 (26) 第六章其它功能的使用 (27) 6.1 单位切换 (28) 6.2 量测及影像图片保存 (28) 第七章SPC统计功能的使用 (29) 7.1 数据收集 (30) 7.2SPC图表介绍 (31) 7.3Excel汇出 (32)
引言 本量测软件专门为你的精密光学测量仪器的量测效率、检测精度，快速提供你待测工件的尺寸及坐标关系而设计的。配合影像系统，精准的协助你撷取影像、寻找工件的边缘为你的光学检测设备提供一套超精密的量测软件。 本量测软件拥有超强的几何量测功能，用于解决大量的工件或复杂尺寸的检测。本软件以学习方便、操作简单为设计理念。让使用者能在最短的时间内，灵活的运用，充分的发挥软件功能，增加投资的效益。 本操作手册包含了金相量测所有的版本，所以用户看操作说明书时请参照不同版本的功能（量测软件版本简介）来看此操作说明书。如有问题请与软件商洽谈。 本软件的使用权以本公司的加密狗为依据。你在购买或使用时如没有加密狗则视为盗版。本电脑程序受著作权法和国际公约的保护。未经授权擅自复制或传播本程序的部分或全部，可能受到严厉的民事及刑事制裁，并将在法律许可的范围内受到最大可能的起诉。
金相学和材料显微组织定量分析技术 摘要：金相学被认为是金属学的先导，是金属学赖以形成与发展的基础，亦曾 被用作早期金属学的代名词；金属材料与热处理专业在过去相当一段时期内则被 简称为“金相专业”。同样，光学显微镜技术对于无机非金属材料学和其它材料分 支学科的重要作用亦类同于其对于金属学；国际上亦有建议采用材相学（materia lography）取代金相学之称，以反映其研究对象已从金属材料拓展到无机非金属 材料和高分子材料、复合材料这一现实。 关键词：金相学；图像分析；计算机仿真；材料显微组织； 介绍了材料显微组织几何形态的定量表征与分析技术及其标准化、显微组织 仿真及设计、以及金相研究时应注意的材料显微组织的若干特性等内容。对金相学、材相学、体视学、图像分析、虚拟金相学、显微组织仿真及其相互关系亦予 以讨论。 一、材料显微组织的计算机仿真与虚拟金相学 光学金相技术可以提供材料制备、加工和热处理过程中相变和显微组织演变 的许多定性和定量信息。然而，由于不透明材料三维微观组织的不直接可视性， 许多涉及三维显微组织的材料理论模型的验证，难以实际实现的显微组织演变过 程研究。基于模型的材料体视学研究、显微组织的三维可视化研究、材料显微组 织的虚拟设计等仍然需要寻求新的辅助研究方法。材料显微组织结构的计算机辅 助模型化与仿真设计即这样一种方法。利用这些既遵从材料显微组织形成和演变 规律，又已数字化且可视化的显微组织仿真的静态或动态模型，可以进行晶粒或 任何组织组成物及其动态演变过程的直观分析和定量研究（将其称为“ 虚拟金相学”），获得若干真实金相学所无法获得的组织表征信息和含时间变量的动力学显微组织数据，将有助于我们对真实材料显微组织及其各种演变过程的进一步了解，是近年来材料显微组织学的一个前沿研究方向。目前需要解决的技术问题是实现 仿真的实时间化和实尺寸化，以便将仿真模型用于实际材料及实际过程。 二、金相技术、图像分析和体视学应用的标准化 美国材料试验学会（ASTM）最早确认光学显微镜是研究和检验金属材料组织 的有效手段，并一直极为重视金相检测标准的制定，对世界各国（包括我国）金 相标准的制定和实施产生的影响非常大。以下给出与金相检测和显微组织观察相 关的一些ASTM标准供读者参考。例如，ASTM StandardE3-95为金相样品的标准 制备操作规程；E7-99a为金相学标准术语；E807-96为金相实验室评估标准操作 规程；E1351-96为现场金相复膜的制作和评价的标准操作规程；E1558-99为金相 样品电解抛光的标准指南；E1920-97为热喷涂层金相制备的标准指南；E1951-98 为标度线和光学显微镜放大倍数标定的标准指南；E2014-99为金相实验室安全标 准指南；E2015-99为显微组织观察用塑料和高分子样品制备的标准指南；等等。 在相应的科学研究与材料金相检测中，建议对这些标准以及本国的相应标准予以 高度重视。目前国际上已存在一系列利用体视学和图像分析方法进行材料 显微组织或非金属夹杂物定量分析的标准。例如，ASTM Standard E112为 确定平均晶粒尺寸的标准操作规程；E562为采用系统人工计点法确定体积分数的 标准操作规程；E768为钢中夹杂物自动评定用样品的制备与测定的标准操作规程；E930为估计金相磨面上观察到的最大晶粒的标准测定方法；E1122为采用自动图 像分析获得JK夹杂物级别的标准操作规程；E1181为表征双重晶粒尺寸的标准操 作规程；E1245为采用自动图像分析确定钢和其它金属中夹杂物数量的标准操作
一、系统简介 ㈠基本功能： 《金相检验软件系统》是为从事金相检验的单位或个人专门开发的一套计算机软件系统，它的基本原理是：用视频采集卡或数码相机等硬件设备，采集到金相显微镜中的金相图片，再对该图片进行处理和分析，得到相关检验结果。该软件的主要功能如下： ⒈自动评级： 本软件以检验标准为依据，开发出了百余个类别两百余种软件功能模块，用户可根据需要，选择检验项目，在本软件的帮助下，完成检验工作。目前本系统的软件模块清单见附件。本软件模块的评级方式有以下三种： 自动评级：软件可自动得出最终分析结果； 辅助评级：软件可得出和分析结果有一定联系的参数； 比较评级：将采集下来的试样图像和标准图库进行比较，人工作出结果判断。 ⒉新建报告： 可按用户需求制作报告文档的录入界面、软件可自动生成电子报告文档，并提供报告的保存和打印功能。 ⒊打开报告： 打开并浏览已经保存的报告文件。 ⒋几何测量： 本软件提供了“直线”、“矩形”、“圆”、“多边形”、“角度”等多种测量工具及测量方法，可完成长度、面积、角度等测量工作。 ⒌查看图库： 用户可选择查看本软件收录的所有金相图谱，本软件金相图谱由用户提供原始资料，由我方录入。 ⒍定倍打印： 可一次装入多副图片，并可对其进行图像处理，设置说明文字和打印版面，进而生成一份适合各种行业特殊要求的报告文件。 ⒎脱机拼图 将多张图片拼接在一起(要求具体见图像拼接),图像拼接有“自动”和“手动”两种方式，如采用“自动”方式，则被拼接图像需要有重合部分； ⒏动态测量 在DirectX支持的采集卡和摄像头的视频影像上进行测量！无需将图片采集过后，可以直接在画面上进行实时、动态的测量，与静态测量相比较，增加了方便性和实用性！ ㈡系统组成：