第一章绪论
生物化学：简单来讲，研究生物体内物质组成(化学本质）和化学变化规律的学科。生物化学的研究内容：生物分子的结构与功能（静态生化）；
物质代谢及其调节（动态生化）；
生命物质的结构与功能的关系及环境对机体代谢的影响（功能生化）。
第二章糖类化学
一、糖的定义及分类
糖类是一类多羟基醛（或酮），或通过水解能产生这些多羟基醛或多羟基酮的物质。糖类分类：（大体分为简单糖和复合糖）
单糖：基本单位，自身不能被水解成更简单的糖类物质。最简单的多羟基醛或多羟基酮的化合物。Eg:半乳糖
寡糖：2～10个单糖分子缩合而成，水解后可得到几分子单糖。Eg:乳糖
多糖：由许多单糖分子缩合而成。如果单糖分子相同就称为同聚多糖或均一多糖；由不同种类单糖缩合而成的多糖为杂多糖或不均一多糖。
复合糖：是指糖和非糖物质共价结合而成的复合物，分布广泛，功能多样，具有代表性的有糖蛋白或蛋白聚糖，糖脂或脂多糖。
二单糖
1、单糖的构型：在糖的化学中，采用D/L法标记单糖的构型。单糖构型的确定以甘油醛为标准。距羰基最远的手性碳与D-(+)-甘油醛的手性碳构型相同时，为D型；与L-(-)-甘油醛构型相同时，为L型。
2、对映异构体：互为镜像的旋光异构体。如：D-Glu与L-Glu
3、旋光异构现象：不对称分子中原子或原子团在空间的不同排布对平面偏振光的偏正面发生不同影响所引起的异构现象。
4、差向异构体：具有两个以上不对称碳原子的的分子中仅一个不对称碳原子上的羟基排布方式不同。如：葡萄糖与甘露糖；葡萄糖与半乳糖。
5、环状结构异构体的规定：根据半缩醛羟基与决定直链DL构型的手性碳上羟基处于同侧为α，异侧为β。（只在羰基碳原子上构型不同的同分异构体）
6、还原糖：能还原Fehling试剂或Tollens试剂的糖叫还原糖。分子结构中含有还原性基团（如游离醛基半缩醛羟基或游离羰基）的糖，还原糖是指具有还原性的糖类，叫还原糖。
1)单糖和寡糖的游离羰基，有还原性。
2)以开链结构存在的单糖中除了二羟丙酮外均具有游离羰基。
3)环式结构可通过与开链结构之间的平衡转化为后者，有半缩醛羟基的为还原糖。
4)非还原性双糖相当于由两个单糖的半缩醛羟基失水而成的，两个单糖都成为苷，
这样的双糖没有变旋现象和还原性。如：蔗糖）
7、糖含量的测定：蒽酮测糖。
三寡糖
麦芽糖：两分子葡萄糖通过α-1，4-糖苷键连接而成
纤维二糖：两分子葡糖糖通过β-1，4-糖苷键连接
乳糖：一分子葡萄糖和一分子β半乳糖通过β-1，4-糖苷键连接而成
蔗糖：一分子葡糖糖和一分子果糖通过脱水缩合而成
常见单糖和寡糖的结构：葡萄糖、甘露糖、半乳糖、核糖；麦芽糖、蔗糖、乳糖。
四多糖：同聚多糖及杂聚多糖
同聚多糖：（均有旋光性，但无还原性，都是葡聚物，只是形成的糖苷键不同。）淀粉：直链淀粉是葡萄糖以α-1，4糖苷键结合成的链状化合物，可被α-淀粉酶水解为麦芽糖。支链淀粉葡萄糖分子间除以α-1，4糖苷键相连外，还有以α-1，6糖苷键相连的。支链淀粉带有分支，大约相隔11-12个葡萄糖单位有一个分支，支链平均长度为24-32个葡萄糖残基。
一个直链淀粉有两个末端：一端由于有游离的半缩醛羟基，具有还原性，称为还原端；另一端为非还原端。支链淀粉有一个还原端，有n+1个非还原端。直链淀粉遇碘变蓝色；支链淀粉遇碘变红色。降解在非还原端。
糖原：糖原也是由葡萄糖组成的，结构与支链淀粉相似，但分支程度比支链淀粉要高。每隔3-5个葡萄糖基就有一个分支，支链一般10-14个葡萄糖单位。碘染呈红色。
纤维素：纤维素与直链淀粉相似，是没有分支的链状分子；连接葡萄糖单位的是β（1→4）糖苷键，它不卷成螺旋状。8000个单糖左右。碘染不显色。
五、复合糖类糖蛋白：由比较短的、往往是有分支的寡糖链与蛋白质以共价键相连的缩合物。
糖脂：由糖和脂质部分组成的，糖给予分子以“亲水极”。
可分为甘油糖脂和鞘糖脂两类。
第三章脂类和生物膜化学
一、脂类：由脂肪酸与醇作用所形成的酯类及其衍生物。特点：不溶于水，溶于乙醚，三氯甲烷、苯等有机溶剂。
脂类的分类：甘油+脂肪酸---三酰甘油（TG）
单纯甘油酯混合甘油酯
二、乳化作用：油脂在乳化剂作用下，可变成很细小的颗粒，均匀分散在水中而形成稳定的乳状液，乳化作用。（肥皂去污是脂肪的乳化作用）
三、类脂包括磷脂和胆固醇
1、甘油磷脂类
组成：磷酸化的头部 + 三碳的甘油骨架 + 两条脂肪酸链
2、生物膜的基本结构
胆固醇对生物膜的生理作用：调节膜的流动性，增加膜的稳定性，降低水溶性物质的通透性。
第四章蛋白质化学
1、蛋白质：由许多氨基酸通过肽键相连形成的高分子含氮化合物。各种蛋白质
含氮元素量恒定，平均为16％， N为蛋白质的特征性元素。
定氮法：100克样品中蛋白质的含量(g%) = 每克样品含氮克数× 6.25×100
2、蛋白质的分类：
按形状可分为球状蛋白和纤维状蛋白
按组成可分为简单蛋白质和结合蛋白质
3、氨基酸：是含有氨基的羧酸，即羧酸的α-碳原子上的一个氢原子被氨基取代而
生成的化合物。
除甘氨酸外，氨基酸都有旋光活性。
4、记忆氨基酸的三字符及结构式，知道常见的氨基酸属于的类别。
①极性带正电氨基酸（碱性氨基酸）；His、Arg、Lys
②极性带负电氨基酸（酸性氨基酸）；Glu、Asp
③极性不带电氨基酸；
④非极性氨基酸。
几种特殊氨基酸：含芳香族：Phe、Tyr 、Trp （在280处有明显吸收）
含羟基：Ser、Thr、Tyr Pro：为环状亚氨基酸
含酰基：Asn、Gln Cys：可形成二硫键
含巯基：Cys Gly：无手性碳原子
5、氨基酸的性质
1）在溶液、晶体及反应中，氨基酸常以两性离子形式存在。（既可接受质子，
也可给出质子）
2）等电点pI：氨基酸在溶液中净电荷为零时的pH值(偶极离子--净电荷为零)（由于静电作用，等电点时，氨基酸的溶解度最小，容易沉淀）
3)氨基酸具有旋光性（除甘氨酸），立体异构体：L、D型，天然只存在L型异构体。
4)茚三酮反应：氨基酸的定性定量分析。
6、肽：氨基酸通过肽键连接形成的链状化合物。（肽和氨基酸的区别在于：离子化程度）
肽键：是由一个氨基酸的a-羧基与另一个氨基酸的a-氨基脱水缩合而形成的化学键寡肽
多肽
氨基酸残基
氨基末端
羧基末端
7、蛋白质的结构与功能
1）一级结构：多肽链中氨基酸的排列顺序。多肽链数目；每条链中氨基酸的数目、种类及排列顺序；链间或链内键的位置和数目。其中最重要的是多
肽链的氨基酸顺序，一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。
维持一级结构的化学键：共价键、肽键、二硫键。
2）二级结构：多肽链借助氢键排列成沿一个方向具有周期性结构的构象。
如α-螺旋、β-折叠片段。二级结构不涉及氨基酸的残基的侧链构象。
α-螺旋要点:①多肽链主链围绕中心轴形成右手螺旋，侧链伸向螺旋外侧。
②每圈螺旋含3.6个氨基酸，螺距为0.54nm。
③每个肽键的亚氨基氢和前面第四个肽键的羰基氧形成的氢键
保持螺旋稳定。氢键与螺旋长轴基本平行。
β-折叠要点：①多肽链充分伸展，相邻肽单元之间折叠成锯齿状结构，
侧链位于锯齿结构的上下方。
②两链间可顺向平行，也可反向平行。反向平行更为稳定。
③两链间的肽键之间形成氢键，以稳固β-折叠结构。氢键与长轴垂直。
α-螺旋与α-折叠的本质区别：链内氢键和链间氢键的差别。
影响二级结构形成的因素：α-螺旋：氨基酸侧链所带电荷、大小及形状，脯氨酸为其终结者。β -折叠形成条件：要求氨基酸侧链较小。
α-螺旋与β-折叠的互变。
3）三级结构：多肽链借助各种次级键盘绕成特定的不规则球状结构的构象。整条
肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位
置。生物活性的特征构象。
稳定存在的作用力：疏水作用力
1 三级结构是指多肽链中所有原子和基因的构象。它是在二级结构的基础上进一步盘曲
折叠形成的，包括所有主链和侧链的结构，不包括肽链的相互作用关系。
2 三级结构多肽链的盘曲折叠是分子中各氨基酸残基的侧链相互作用来维持的。
3 二硫键是维持三级结构的唯一的一种共价键，能把肽链的不同区段牢固地连接在一
起，而疏水性较强的氨基酸则借疏水力和范德华力聚集成紧密的疏水核，有极性的残基
以氢键和盐键相结合。非共价键虽然微弱，但数目庞大，是维持三级结构的主要力量。
4 水溶性蛋白中，极性基团分布在外侧，与水形成氢键，使蛋白溶于水。
5 三级结构是蛋白中发挥生物活性所必需的，但不是蛋白中具有活性的充分条件。
6 较大蛋白的三级结构往往由几个相对独立的三维实体构成，这些三维实体称为结构
域。结构域是在三级结构与超二级结构之间的一个组织层次。
4）四级结构：寡聚蛋白中个亚基之间排布上的相互关系或结合方式。
亚基：蛋白质分子中每条具独立三级结构的多肽链称为。
亚基单独存在时没有生物活性，只有聚合成四级结构才具有完整的生物活性。
四级结构涉及亚基的种类和数目以及各亚基在分子中的空间排布，包括亚基间的接触位点和相互作用关系，而不包括亚基本身的构象。
维持四级结构的化学键，主要是疏水作用力，还有氢键、离子键、范德华力。
结构域：大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区
域，折叠得较为紧密，各行其功能，称为结构域。
模体：蛋白质分子中，二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个具有特殊功能的空间构象。
最简单的具有四级结构的蛋白质是血红蛋白。
5）一级结构→空间构象→功能
8、蛋白质的性质
变构现象:指一个蛋白质与其配体(或其它蛋白)结合后，引起蛋白质的
构象发生改变，并伴随其活性发生改变，以适应生理功能的需要。
协同效应:一个亚基与其配体结合后，能影响此寡聚体中另一亚基与配体的结合。
如血红蛋白与氧结合的效应。
蛋白质变性的本质：破坏非共价键和二硫键，不改变蛋白质的一级结构
蛋白质胶体稳定的因素：水化层：亲水基团作用，与水分子结合。
带电层：可解离基团在一定pH下解离产生。
盐析：在蛋白质溶液中加入大量中性盐，使蛋白质沉淀析出的作用。（常用硫酸铵）原理：中性盐既中和了蛋白质所带的电荷，又破坏了其水膜。
即破坏了蛋白质的水化层和带电层。
9、分离纯化及测定
凝胶过滤---相对分子质量不同
四蛋白质的理化性质：
当蛋白质溶液处于某一pH时，蛋白质解离成正、负离子的趋势相等，即成为兼性
离子，净电荷为零，此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。在不含任何盐的纯水中
进行蛋白质等电点测定时，所得的等电点为等离子点。
蛋白质胶体稳定的因素：水化层：亲水基团作用，与水分子结合；带电层：可解离
基团在一定pH下解离产生。
盐析：由于在蛋白质溶液中加入大量中性盐，使蛋白质沉淀析出的作用。常用硫酸
铵进行盐析。原理：中性盐既中和了蛋白质所带的电荷，又破坏了其水膜，即破坏
了蛋白质的两个稳定因素。
盐溶：在蛋白质水溶液中，加入少量的中性盐，如硫酸铵、硫酸钠、氯化钠等，会
增加蛋白质分子表面的电荷，增强蛋白质分子与水分子的作用，从而使蛋白质在水
溶液中的溶解度增大。这种现象称为盐溶。
蛋白质沉淀：在一定条件下，蛋白疏水侧链暴露在外，肽链便会相互缠绕继而聚集，
从溶液中析出。变性的蛋白质易于沉淀，有时蛋白质发生沉淀，但并不变性。
蛋白质的变性(denaturation)：在某些物理和化学因素作用下，蛋白质分子的特定
空间构象被破坏，从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。变性的本质：破坏
非共价键和二硫键，不改变蛋白质的一级结构。
蛋白质变性后的性质改变：溶解度降低、粘度增加、结晶能力消失、生物活性丧失
及易受蛋白酶水解。变性蛋白质常常相互凝聚成块，这种现象称为凝固。凝固是蛋
白质变性深化的表现。
双缩脲反应(biuret reaction)：蛋白质和多肽分子中肽键在稀碱溶液中与硫酸铜
共热，呈现紫色或红色，此反应称为双缩脲反应，双缩脲反应可用来检测蛋白质水
解程度。
蛋白质的紫外吸收：由于蛋白质分子中含有共轭双键的酪氨酸和色氨酸，因此在
280nm波长处有特征性吸收峰。蛋白质的OD280与其浓度呈正比关系，因此可作蛋
白质定量测定。
第五章核酸化学
要点：核酸的结构与性质；核酸的构象与功能；双螺旋结构特征与生理功能。
核酸(nucleic acid)是生物体内含磷酸基团的重要生物大分子，担负着生命信息
的储存和传递功能，是生物化学研究中的一个重要领域。DNA：90%以上分布于细胞
核，其余分布于核外如线粒体，叶绿体，质粒等。携带遗传信息，决定细胞和个体
的基因型(genotype)。RNA：分布于胞核、胞液。参与细胞内DNA遗传信息的表达。
某些病毒RNA也可作为遗传信息的载体。
一核苷酸的组成与结构
一级结构：核苷酸之间以磷酸二酯键连接形成多核苷酸链。核酸中核苷酸的排列顺序。由于核苷酸间的差异主要是碱基不同，所以也称为碱基序列。
二级结构：DNA双螺旋结构模型要点
1. 两条链反向平行，围绕同一中心轴构成右手双螺旋 (double helix)。螺旋直径2nm，表面有大沟和小沟。
2. 磷酸-脱氧核糖骨架位于螺旋外侧，碱基垂直于螺旋轴而伸入内侧。每圈螺旋含10个碱基对 (bp)，螺距为
3.4nm。3. 两条链通过碱基间的氢键相连，A对T有两个氢键，C对G有三个氢键，这种A-T、C-G配对的规律，称为碱基互补规则。
4. 维持双螺旋稳定的因素：横向为氢键，纵向为碱基间的堆积力。
三级结构：DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。正超螺旋：形成超螺旋时的旋转方向与DNA双螺旋方向相同，结果加大了DNA分子内部张力，具有紧旋效应。负超螺旋：形成超螺旋时，旋转方向与DNA的双螺旋方向相反，使DNA分子内部张力减小，具有松旋效应。所有生物的DNA几乎有5%为负超螺旋，其与调控、复制起始和mRNA的合成有关。
高级结构：真核中染色体结构。
二核酸的理化性质
DNA变性：指DNA分子由稳定的双螺旋结构松解为无规则线性结构的现象。
DNA变性的本质：维持双螺旋稳定性的氢键断裂，碱基间的堆积力遭到破坏，但不涉及到其一级结构的改变。导致DNA变性的因素：凡能破坏双螺旋稳定性的因素，如加热、极端的pH、有机试剂甲醇、乙醇、尿素及甲酰胺等，均可引起核酸分子变性。
变性DNA的特征：1）溶液粘度降低：DNA双螺旋是紧密的刚性结构，变性后转化成柔软而松散的无规则单股线性结构，因此粘度明显下降。2）旋光性发生变化：变性后整个DNA分子的对称性及分子构型改变，使DNA溶液的旋光性发生变化。3）紫外吸收增强
增色效应(hyperchromic effect)：指DNA变性后其紫外吸收明显增强的效应。DNA 分子中碱基间电子的相互作用使DNA分子具有吸收260nm波长紫外光的特性。在DNA 双螺旋结构中碱基藏入内侧，变性时DNA双螺旋解开，于是碱基外露，碱基中电子的相互作用更有利于紫外吸收，故而产生增色效应。
DNA复性：在适当条件下，变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象，这一现象称为复性。热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性，这一过程称为退火(annealing) 。减色效应：DNA复性时，其溶液OD260降低。
第六章酶
重点：酶的结构与功能；影响酶促反应的各种因素；酶促反应的机制；米氏方程。酶的化学本质：蛋白质性质
一酶的催化特性：1. 高效性；2. 专一性---酶对底物具有选择性
酶的分类：单纯酶；结合酶。几个概念：全酶、酶蛋白、辅助因子。
辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合比较疏松（一般为非共价结合），并可用透析方法除去辅酶。
辅基 (prosthetic group):与酶蛋白结合牢固（有共价键结合，也有非共价键结合），不能用透析方法除去的是辅基。
酶蛋白决定酶促反应的特异性；辅助因子决定酶促反应的种类与性质
酶的三种不同形式：单体酶(monomeric enzyme)：仅具有三级结构的酶。寡聚酶(oligomeric enzyme)：由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶（四级结构）。多酶体系(multienzyme system)：由几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。
二酶的结构与功能的关系
酶的必需基团(essential group) ：酶分子中与酶的催化活性直接相关的基团。它们在一级结构上可能相距很远，但在空间结构上彼此靠近。
酶原激活和共价修饰作用的发生方式。
酶的活性中心(active site)，指必需基团在空间结构上彼此靠近，组成具有特定空间构象、与酶的活性直接相关的结构区域。对结合酶来说，辅酶或辅基参与酶活性中心的组成。
酶促反应特点：
1.高效性
2.高度的特异性：①绝对特异性(absolute specificity)：只能作用于特定结构的底物，进行一种专一的反应，生成一种特定结构的产物。②相对特异性(relative specificity)：作用于一类化合物或一种化学键。③立体结构特异性(stereo specificity)：作用于立体异构体中的一种。
3. 酶促反应的可调节性
酶促反应受多种因素的调控，以适应机体对不断变化的内外环境和生命活动的需要。其中包括三方面的调节。对酶生成与降解量的调节；酶催化效力的调节；通过改变底物浓度对酶进行调节。
三酶促反应机制
中间产物学说---酶的工作方式
在酶促反应中，底物先与酶结合成不稳定的中间物，然后再分解释放出酶与产物。底物具有一定的活化能，当底物和酶结合成过渡态的中间物时，要释放一部分结合能，这部分能量的释放，使得过渡态的中间物处于比E+S更低的级别，因此整个反应的活化能降低，使反应大大加速。酶与底物的结合，是非共价结合。
诱导契合假说(induced-fit hypothesis)：酶与底物相互接近时，其结构相互诱导、相互变形和相互适应，催化基团转入了有效的作用位置，进而相互结合。
四酶促反应动力学：
米氏方程：体现酶促反应初速度与底物浓度之间的关系。
Km值：Km等于酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度。
意义 1) Km是酶的特征性常数；其大小与酶的浓度无关，而与酶的性质有关，且随着温度、pH和离子强度而改变。
2）当k2＞＞k3时， Km可近似表示酶对底物的亲和力。
3）同一酶对于不同底物有不同的Km值。
4）可用来确定酶活性测定时所需的底物浓度：当CS=10Km时，ν= 91%Vmax，此时即为最合适的测定酶活性所需的底物浓度。
5）Km可用来判断酶的最适底物：当酶有几种不同的底物存在时，通过测定酶在不同底物存在时的Km值，Km值最小者，即为该酶的最适底物。
Vmax：Vmax是酶完全被底物饱和时的反应速度，与酶浓度成正比。
酶促反应速度与温度、pH值、酶浓度、激活剂之间的关系。
酶的抑制剂(inhibitor)：凡能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白变性的物质统称为酶的抑制剂。
可逆抑制中的三种抑制方式机理与动力学特点：
竞争性抑制 (competitive inhibition) I与S结构类似，竞争酶的活性中心；抑制程度取决于抑制剂与酶的相对亲和力及Cs；动力学特点：Vmax不变，表观Km↑。非竞争性抑制 (non-competitive inhibition) 抑制剂与酶活性中心外的必需基团结合；抑制程度取决于Ci；动力学特点：Vmax↓，表观Km不变。
反竞争性抑制 (uncompetitive inhibition) 抑制剂只与ES结合；抑制程度取决与Ci及Cs；动力学特点：Vmax↓，表观Km↓。
第八章能量代谢与生物能的利用
氧化磷酸化 (oxidative phosphorylation)是指在呼吸链电子传递过程中偶联ADP 磷酸化，生成ATP，又称为偶联磷酸化。
氧化磷酸化的作用机制
底物水平磷酸化 (substrate level phosphorylation) 是底物分子内部能量重新分布，生成高能键，使ADP磷酸化生成ATP的过程。
生物氧化的特点：1、生物氧化是在细胞内温和的环境下（体温，pH接近中性）由酶催化逐步进行的反应过程。2、产生CO
2
的方式是脱羧，代谢物脱下的氢在呼吸链
上与氧结合产生H
2
O。3、生物氧化时，能量逐步释放，因此有利于机体捕获能量，提高ATP生成的效率。4、生物氧化的速率受体内多种因素的影响。
第九章糖代谢
要点：糖的分解代谢；糖的有氧氧化（酵解途径、三羧酸循环）；磷酸己糖途径（或称磷酸戊糖途径）；糖的异生作用
一糖的吸收与转运；糖的来源与去路
二糖的分解代谢
糖的分解代谢类型---需氧分解占主导：（1）无氧呼吸：酵解、发酵；（2）需氧
分解：生产CO
2、H
2
O、ATP
糖分解代谢的重要途径包括：酵解途径（EMP)、三羧酸循环（TCA)、磷酸戊糖途径（HMS）。
糖酵解(glycolysis)：在缺氧情况下，葡萄糖生成乳酸(lactate)的过程称之为糖酵解。发生部位：胞浆中。生理意义：（1）机体缺氧时的主要供能方式。（2）机体供氧充足情况下少数组织的能量来源。如成熟红细胞、神经、白细胞、骨髓、肿瘤细胞等。产能的方式和数量
方式：底物水平磷酸化，净生成ATP数量：从G开始2×2-2= 2ATP；从Gn开始2×2-1= 3ATP
区分糖酵解与酵解途径的概念
糖的有氧氧化：葡萄糖在有氧条件下，彻底氧化成水和CO
的反应过程称为有氧氧
2
化。发生部位：部位：胞浆及线粒体。能量计算。
三羧酸循环(tricarboxylic acid cycle)：由乙酰CoA与草酰乙酸（OAA)缩合成柠檬酸开始，经反复脱氢、脱羧再生成草酰乙酸的循环反应过程。又称柠檬酸循环和Krebs循环。
三羧酸循环的要点：经过一次三羧酸循环，消耗一分子乙酰CoA，经四次脱氢，二次脱羧，一次底物水平磷酸化。生成1分子FADH2，3分子NADH+H+，2分子CO2， 1分子GTP。关键酶有：柠檬酸合酶；α-酮戊二酸脱氢酶复合体；异柠檬酸脱氢酶。三羧酸循环的生理意义：1、三大供能营养素氧化供能的共同途径。 2、糖、脂肪和氨基酸代谢联系的中心枢纽。 3、循环中某些成分可用于合成其他物质，如琥珀酰CoA生成血红素。 4、为呼吸链提供 H + e。
磷酸戊糖途径：（一）第一阶段：6-磷酸葡萄糖生成 5-磷酸核酮糖 1.两次脱氢均由NADP+接受，一次脱羧； 2.生成5-磷酸核糖，为合成核糖的原料。3.整个代谢途径在胞液(cytoplasm)中进行。 4.关键酶是6-磷酸葡萄糖脱氢酶（二）第二阶段：系列基团转移反应生成磷酸己糖。生理意义：1. 是体内生成NADPH的主要代谢途径；2. 是体内生成5-磷酸核糖的唯一代谢途径，磷酸戊糖途径是体内糖代谢与核苷酸及核酸代谢的交汇途径。
糖原的合成与分解
糖异生：由非糖物质转变为葡萄糖或糖原的过程称为糖异生(gluconeogenesis)。糖异生原料：乳酸、丙酮酸、甘油、生糖氨基酸等。糖异生主要器官：肝、肾
第十章脂类代谢
要点：脂类的分解代谢：β-氧化及其计算
甘油三酯→甘油+脂肪酸
一甘油的分解----从磷酸丙糖进入EMP途径
二脂肪酸β-氧化
组织：除脑组织外,大多数组织均可进行，其中肝、肌肉最活跃。（脂肪酸不能通过血脑屏障。酮体可以）部位：胞浆→线粒体
肝和肌肉是进行脂肪酸氧化最活跃的组织，其最主要的氧化形式是β-氧化。此过程可分为活化，转移，β-氧化共三个阶段。（p193-196）
1. 脂肪酸的活化
和葡萄糖一样，脂肪酸参加代谢前也先要活化。其活化形式是硫酯——脂肪酰CoA，催化脂肪酸活化的酶是脂酰CoA合成酶(acyl CoA synthetase)。
2. 脂酰CoA进入线粒体
催化脂肪酸β-氧化的酶系在线粒体基质中，但长链脂酰CoA不能自由通过线粒体内膜，要进入线粒体基质就需要载体转运，这一载体就是肉毒碱(carnitine)，即3-羟-4-三甲氨基丁酸。
3. β-氧化的反应过程
脂酰CoA在线粒体基质中进入β氧化要经过四步反应，即脱氢、加水、再脱氢和硫解，生成一分子乙酰CoA和一个少两个碳的新的脂酰CoA。第一步脱氢(dehydrogenation)反应由脂酰CoA脱氢酶活化，辅基为FAD，脂酰CoA在α和β碳
原子上各脱去一个氢原子生成具有反式双键的α,β-烯脂肪酰辅酶A。第二步加水（hydration)反应由烯酰CoA水合酶催化，生成具有L-构型的β-羟脂酰CoA。第三步脱氢反应是在β－羟脂肪酰CoA脱饴酶（辅酶为NAD+）催化下，β-羟脂肪酰CoA脱氢生成β酮脂酰CoA。第四步硫解（thiolysis)反应由β－酮硫解酶催化，β-酮酯酰CoA在α和β碳原子之间断链，加上一分子辅酶A生成乙酰CoA和一个少两个碳原子的脂酰CoA。
长链脂酰CoA经上面一次循环，碳链减少两个碳原子，生成一分子乙酰CoA，多次重复上面的循环，就会逐步生成乙酰CoA。
脂肪酸β-氧化是体内脂肪酸分解的主要途径，脂肪酸氧化可以供应机体所需要的大量能量，以十六个碳原子的饱和脂肪酸硬脂酸为例，其β-氧化的总反应为：CH3(CH2)14COSCoA+7NAD++7FAD+HSCoA+7H2O——→8CH3COSCoA+7FADH2+7NADH+7H+
7分子FADH2提供7×2=14分子ATP，7分子NADH+H+提供7×3=21分子ATP，8分子乙酰CoA完全氧化提供8×12=96个分子ATP，因此一克分子软脂酸完全氧化生成CO2和H2O，共提供131克分子ATP。软脂酸的活化过程消耗2克分子ATP，所以一克分子软脂酸完全氧化可净生成129克分子ATP。脂肪酸氧化时释放出来的能量约有40%为机体利用合成高能化合物，其余60%以热的形式释出，热效率为40%，说明机体能很有效地利用脂肪酸氧化所提供的能量。
脂肪酸的其他氧化方式：
1．不饱和脂肪酸的氧化，也在线粒体进行，其与饱和脂肪酸不同的是键的顺反不同，通过异构体之间的相互转化，即可进行β-氧化。
2．丙酸的氧化：人体含有极少量奇数碳原子脂肪酸氧化后还生成1分子丙酰CoA，丙酰CoA经羧化及异构酶作用转变为琥珀酰CoA，然后参加三羧酸循环而被氧化
第十一章核酸代谢
要点：DNA复制
DNA复制：亲代双链DNA分子在DNA聚合酶的作用下，分别以每条单链 DNA分子为模板，聚合与自身碱基可以互补配对的游离的dNTP, 合成出两条与亲代DNA分子完全相同的子代DNA分子的过程。
DNA复制的体系：底物: dNTP (dATP、dGTP 、dCTP 、dTTP) ；聚合酶: 依赖DNA 的DNA聚合酶(DNA-pol) ；模板: 解开成单链的DNA母链；引物: 提供3'-OH末端的寡核苷酸；其他酶和蛋白质因子: 拓扑异构酶、解螺旋酶、单链DNA结合蛋白、引物酶、连接酶
聚合反应的特点：以单链DNA为模板；以dNTP为原料；引物提供3'-OH；聚合方向为5' →3'；遵守碱基互补规律。
DNA复制相关的蛋白
解链酶(Helicase)：解链酶可以和单链DNA结合促使DNA在复制叉处打开双链，ATP为能量。目前，大肠杆菌有两种，一种称为螺旋酶Ⅱ或螺旋酶Ⅲ，与滞后链的模板DNA结合沿5'→3'方向运动;第二种称为Rep蛋白，和前导链的模板DNA结合沿3'→5'方向运动。
单链DNA结合蛋白(SSB)：解链酶沿复制叉方向向前推进产生了一段单链区，DNA不会长久存在，会很快重新配对形成双链DNA或被核酸酶降解。这时细胞内有大量DNA单链结合蛋白(single strand DNA binding protein SSBP)能很快地和单链DNA结合，防止其重新配对形成双链DNA或被核酸酶降解。SSB存
在协同效应。SSBP结合到单链DNA上后，使其呈伸展状态，没有弯曲和结节，有利于单链DNA作为模板。SSB可以重复使用。
DNA拓扑异构酶(DNA Topisomerase)：DNA在细胞内往往以超螺旋状态存在，
拓扑酶催化同一DNA分子不同超螺旋状态之间的转变。DNA拓扑异构酶有两类，大肠杆菌的ε蛋白(MW-110000)就是一种典型的拓扑异构酶Ⅰ.它的作用是暂时切断一条DNA链，形成酶-DNA共价中间物而使超螺旋DNA松弛化，然后再将切断的单链DNA连接起来，而不需要任何辅助因子。而大肠杆菌中的DNA旋转酶(DNAgyrase)则的典型的拓扑异构酶Ⅱ，能将负超螺旋引入DNA分子，该酶能暂时性地切断和重新连接双链DNA，同时需要ATP水解为ADP以供能。
引物酶(Primase)和RNA聚合酶(RNA Polymerase) 引物酶由一条多肽链组成，
dnaG基因编码。引物酶催化引物RNA分子的合成，但它和传统的RNA 聚合酶不一样。但在单链噬菌体M13DNA和质粒Co1E1DNA复制时，引物的合成是由RNA聚合酶催化的。注意引物酶和RNA聚合酶的区别。
连接酶：3’-OH 5’-P相邻并且各自的碱基处于配对状态时连接。真核中以
为能量而原核中以NAD为能量。
大肠杆菌中聚合酶I和聚合酶III的区别：两者均有5’→3’聚合酶活性，3’
5’外切核酸酶活性，5’→3’外切核酸酶活性。1)两者功能不同：聚合酶起I 替代RNA引物和DNA修复的作用，聚合酶III在复制中聚合作用。2）5’→3’外切酶作用方式不同：I作用于配对的双链中的单链，可用于切刻平移（nick translation）,它还同样具有5’→3’内切酶活力；III则只在不配对的单链中起作用 ,不能用于切刻平移。3）两者都有填补缺口的作用I可以填补很大的缺口，而III只能在小缺口处起作用。4）聚合酶I由一条肽链构成，而聚合酶III由多种亚基构成。5）III的聚合速度非常快60000/min。
DNA复制的起始、延伸和终止
大肠杆菌的复制过程1）转录激活：RNA酶转录激活，使双链模板产生单链区域
AT，呼吸作用强烈，易形成单链泡状结构。另外有拓扑异构酶促进复制起点处产生负超螺旋。2) 解链酶结合单链区域，消耗ATP扩大单链区域。SSB结合单链，保护单链并有助于加快复制速度，形成一个很高的迁移复制形式RFI。3）预引发前体形成：引发酶结合复制起点，合成RNA引物。4） DNA合成：DNA聚合酶Ⅲ（替换掉SSB在其他的单链处SSB仍结合着）以RNA引物暴露出的3’-OH 末端起始，完成DNA合成，3’-5’外切酶活性完成校正。复制中形成的正超螺旋由拓扑异构酶消除。5）复制中，去除RNA引物，DNA聚合酶Ⅰ填补切口。连接酶连接片段。6）复制中先导链连续合成，后随链不连续合成，引物周期性起始。最终由拓扑异构酶完成子链分子的分离，DNA以半保留的方式由亲代传递到子代。
第十三章代谢调控
要点：代谢之间的联系及代谢调节
相互转变、相互制约、殊途同归
相互转变：指糖类、脂肪、蛋白质代谢通过共同的代谢中间产物丙酮酸、乙酰辅酶A、α-酮戊二酸等相互联系起来，可以相互转变。
相互制约：指生物体内脂类、蛋白质代谢的强度主要由糖类的代谢强度决定。当糖类供应充足时，糖类在体内大量氧化分解供能，这时脂肪、蛋白质的分解就受到一定的制约。糖类供应短缺时，脂类可大量分解供能，蛋白质也有供能作用。正常情
况下，蛋白质的代谢主要用于蛋白质的不断自我更新，只有当机体能源物质糖类、脂类严重消耗时，蛋白质才表现为大量分解供能。
殊途同归：三大物质代谢分解途径虽不相同，但彻底氧化为水和二氧化碳最终汇合到TCA循环中，所以TCA循环是糖类、脂肪、蛋白质彻底分解氧化的一条共同途径。
糖类和脂类间的转化过程
代谢调节的三大水平：
细胞水平代谢调节：细胞区隔；酶的活性和酶量的调节。活性调节：共价修饰、别构调节；量的调节：合成与分解的影响。
激素水平代谢调节：高等生物在进化过程中，出现了专司调节功能的内分泌细胞及内分泌器官，其分泌的激素可对其他细胞发挥代谢调节作用。
整体水平代谢调节（神经系统调节）：在中枢神经系统的控制下，或通过神经纤维及神经递质对靶细胞直接发生影响，或通过某些激素的分泌来调节某些细胞的代谢及功能，并通过各种激素的互相协调而对机体代谢进行综合调节。