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DNA甲基化相关的IncRNAs在原发性肝癌发生过程中的功能及机制研究

第二军医大学硕士学位论文

AY927547wereoverexpressedanddownregulatedbysiRNAmvitro.Theresults

showedthatAY927547Caneffectivelyinhibittheproliferationandmigrationof

hepatomacells.Meanwhile,晰mRNA-pulldownandRNAimmunoprecipitation

M2weredetected.AY927547couldcombine谢tllPKM2analysis,pyruvatekinase

proteinandinhibititsactivity.

OurresultsconfirmedthatIncRNAAY927547wereregulatedbymodificationofDNAmethylationandplaycrucialroleinhepatocarcinogenesis.ItisanimportantsupplementtothemechanismsofHBV-HCCtumorigenesisandtransfernetwork.ThisallowingUStobetterclarifytheoccuranceofHCC,SOastogetearlyfinding,earlydiagnose,andearlypreventiontoimprovethesurvivalrateofHCC.Furthermore,thetumorsuppressorroleoflncRNA—AK927547inhepatomagrowthandmetastasis

andtargetforthetreatmentHCC.TheresultsofthisstudyprovidesUSnewideas

providearationalsupportfortreatmentofHBV-relatedHCCwithepigenetic

therapiesofsyntheticlncRNAs.

KEYWORDS:epigenetics,DNAmethylation,longnon-codingRNA,PKM2

.4-

DNA甲基化相关的lncRNks在原发性肝癌发生过程中的功能及机制研究

2)肝脏原位种植瘤模型:将皮下荷瘤模型小鼠的肿瘤取出后,实验组与对照组分别切取约为22lmm3肿瘤小块,保存于添加了抗生素的生理盐水中备用。另取10只4周龄雄性BALB/e免疫缺陷鼠,随机分为两组(5只/组)。将小鼠以戊巴比妥纳腹腔注射麻醉,固定于动物手术台(已消毒、铺巾),各皮消毒,取上腹部正中切口打开腹腔,暴露肝脏,将肝脏划一小口(以出血为标记),将已备好的肿瘤小块塞入切开的小口中,加压止血片刻,于腹腔滴加抗生素防止感染。关腹,依次缝合腹膜、皮肤,并消毒。术后裸鼠继续生长8周,随时观察腹部肿瘤生长情况。48周后处死裸鼠并解剖,观察腹腔脏器和远处器官的肿瘤转移情况,统计转移灶数量及发生转移的小鼠数量,取肝脏组织(包括肿瘤组织和瘤旁正常组织)及疑似转移的脏器组织进行相关病理分析。

11.RNApull.down

1)表达载体的构建:

首先将lncRNA.AY927547全长的cDNA序列构建到质粒载体pSPTl8载体上,即pSPTl8.AY927547。eDNA序列两端分别为EeoRI和HindlII的限制性酶切位点。}一2)RNA生物素标记:

使用德国Roche公司的BiotinRNALabelingMi)【试剂盒及SP6、T7RNA聚合酶体外转录生物素标记的IncRNA。

3)单链IncRNA.AY927547模板的制备:

IncRNA.AY927547正链模板:EcoRI单酶切,pSPTl8.AY927547质粒,3小时。

阴性对照链模板:HindIII单酶切,pSPTl8-AY927547质粒,3小时。,

产物回收:使用QIAGEN公司的QIAquiekNucleotideRemovalKit试剂盒分别回

收正反义链单酶切后的DNA模板。依照说明书操作,过程中注意RNase.free操作。Nanodrop检测单链DNA浓度与质量。

4)l斟A聚合反应:

IncRNA.AY927547反应体系如下:37℃,反应2小时。

TranscriptionBuffer2m

BiotinRNAlabelingMix2“l

RNA酶抑制剂l“l

单链pSPTl8.AY927547模板1烬

SP6RNA聚合酶1Ill

、,0l20pl

‘阴性对照反应体系如下:37℃,反应2小时。

TranscriptionBuffer2山

-l5-

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