医药文献检索与利用（zll） 一、检索总论 信息及信息素养 信息：是普遍存在的，是物质的一种基本属性，是物质存在方式及其运动规律、特点的外在表现。 信息定义：事物的运动状态和状态变化的方式。 信息与知识的区别：信息是大家的，独立于行为和决策，独立于环境存在，容易转让，可复制。 情报：传递有特定效用的知识（知识性，传递性，效用性）。 文献：以文字、图形、符号、声频、视频等手段记录和传播知识的载体。 （知识内容、信息符号、载体材料、记录方式） 文献按加工层次划分： 一次文献（原始论文——期刊论文、学位论文、研究报告、专利说明书）； 二次文献（目录、索引、文摘，pubmed、web of science、sinomed）； 三次文献（综述、年度总结、年鉴、指南、百科全书、annual reviews）； 零次文献（未被正式发表的，书信、手稿、笔记、口头交流） 文献按载体形式划分：印刷型、电子数字型、缩微型、声像/视听型 文献按出版类型划分：图书（ISBN号 10位，4段——地域号、出版社号、书号、校验号；本馆订购的电子图书：apabi，超星、读秀、elsevier、karger、Springer）、期刊（ISSN 号 8位，前七位是刊名代号，末位是计算机校验号）、特种文献 整个信息行为：信息需要、信息检索、信息选择、信息利用
信息素养定义：人们在工作中运用信息、学习信息技术、利用信息解决问题的能力。 信息素养的构成要素：信息意识；信息能力；信息道德。 ACRL信息素养能力的评价标准：（5个一级指标，24个二级指标）。 医学文献检索相关概念 指从文献信息集合中查找所需文献或文献中包含的信息内容的过程 计算机检索原理概述 检索提问字符串匹配数据库中特征标识字符串 数据库的构成：文档、记录、字段 常见字段：TI（题目）、AB（文摘）、AU（作者）、MESH（主题词）、 SO（期刊名称）、 AD （作者单位）、DT（文献类型）、PY（出版年） 检索语言 文献外部特征的检索语言：题名、著者、文献序号、引用序号 文献内容特征的检索语言：分类检索、主题检索、代码检索 （1）分类检索：美国国立图书馆图书分类法，杜威十进制、国际十进制、中国图书馆分类、国际疾病分类。 （2）主题检索：是以规范化的词汇来表达文献内容的主题；主题词（叙词）、副主题词（限定词）、关键词。 （3）代码检索：化合物分子式索引等 计算机检策略与步骤 （1）布尔逻辑检索：NOT >AND> OR，括号优先 （2）截词检索：代表一个字母，必须以半角状态输入 %或*代替任意个字符 （3）位置运算检索：（W）、（nW）、（N）、（nN）、（F）、（S）、（L） （4）字段限定检索：“=”或“in” （5）计算机检索的一般步骤：（大题） 分析检索课题（课题所属的学科范围、要求的文献类型、年限、语种、需要的文献量等）选择检索工具（数据库的选择） 确定检索途径（首先选择基本检索方式全字段检索）
生物质谱技术在蛋白质组学中的应用（北京大学药学院 杨春晖 学号：10389071） 一、 前言[1，2] 基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道，也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量、蛋白质翻译后加工和修饰的情况、以及它们的亚细胞分布等等，因此在整体水平上研究蛋白质表达及其功能变得日益显得重要。这些在基因组中不能解决的问题可望在蛋白质组研究中找到答案。蛋白质组研究的数据与基因组数据的整合，将会在后基因组研究中发挥重要作用。 目前蛋白质组研究采用的主要技术是双向凝胶电泳和质谱方法。双向凝胶电泳的基本原理是蛋白质首先根据其等电点，第一向在pH梯度胶内等电聚焦，然后转90度按他们的分子量大小进行第二向的SDS-PAGE分离。质谱在90年代得到了长足的发展，生物质谱当上了主角，蛋白质组学又为生物质谱提供了一个大舞台。他们中首选的是MALDI-TOF，其分析容量大，单电荷为主的测定分子量高达30万，干扰因素少，适合蛋白质组的大规模分析。其次ESI为主的LC-MS 联机适于精细的研究。本文将简介几种常用的生物质谱技术，并着重介绍生物质谱技术在蛋白质组学各领域的应用。 二、 生物质谱技术[3，4] 1．电喷雾质谱技术（ESI）[5] 电喷雾质谱技术( Electrospray Ionization Mass Spectrometry , ESI - MS) 是在毛细管的出口处施加一高电压,所产生的高电场使从毛细管流出的液体雾化成细小的带电液滴,随着溶剂蒸发,液滴表面的电荷强度逐渐增大,最后液滴崩解为大量带一个或多个电荷的离子,致使分析物以单电荷或多电荷离子的形式进入气相。电喷雾离子化的特点是产生高电荷离子而不是碎片离子, 使质量电荷比(m/ z)降低到多数质量分析仪器都可以检测的范围,因而大大扩展了分子量的分析范围,离子的真实分子质量也可以根据质荷比及电荷数算出。 2．基质辅助激光解吸附质谱技术（MOLDI）[5-7] 基质辅助激光解析电离（MOLDI）是由德国科学家Karas和Hillenkamp发现的。将微量蛋白质与过量的小分子基体的混合液体点到样品靶上，经加热或风吹烘干形成共结晶，放入离子源内。当激光照射到靶点上时，基体吸收了激光的能力跃迁到激发态，导致蛋白质电离和汽化，电离的结果通常是基体的质子转移到蛋白质上。然后由高电压将电离的蛋白质从离子源转送到质量分析器内，再经离子检测器和数据处理得到质谱图。TOF质量分析器被认为是与MALDI的最佳搭配，因为二者都是脉冲工作方式，在质量分析过程中离子损失很少，可以获得很高的灵敏度。TOF质量分析器结果简单，容易换算，蛋白质离子在飞行管内的飞行速度仅与他的(m/z)-1/2成正比，因此容易通过计算蛋白质离子在飞行管内的飞
学高身正明德睿智 云南省唯一的省属重点师范大学 学校：云南师范大学 学院：生命科学学院 专业：生物科学10级B班 姓名： 学号： 学制: 四年
浅谈现代生物技术发展历史 摘要：现代生物技术是通过生物化学与分子生物学的基础研究而快速发展起来的。医药生物技术起步最早、发展最快，目前世界已有2000多家生物技术公司，其中70%从事医药产品的开发。生物技术工业总体日趋成熟，正在由风险产业变成以商业为动力，以市场为中心的产业。应用生物技术已有可能产生几乎所有的多肽和蛋白质，基因工程技术的应用已使新药研究方法和制药工业的生产方式发生重大变革。 关键字：现代生物技术历史现状研究 导言科学家们认为，20世纪的科学技术是以物理学和化学的成就占主导地位，而21世纪的科学技术是以生物学的成就占主导地位。21世纪称为生命科学的世纪，生物技术称为21世纪的朝阳产业。生命科学的新发现，生物技术的新突破，生物技术产业的新发展将极大地改变人类及其社会发展的进程。在生物技术领域取得的突破性进展可以彻底消除营养不良，改善食品的生产方式，消除各种污染，延长人类寿命，提高生命质量等。一些成果还可以帮助人类加速植物和动物的人工进化以及改善生态环境对人类的影响等。 一．分类 生物技术的发展可分为三个阶段，即传统生物技术、近代生物技术和现代生物技术。 （一）传统生物技术阶段 指19世纪末到20世纪30年代前，以发酵产品为主干的工业微生物技术体系。这一时期的生物技术主要是通过微生物的初级发酵来生产食品，其应用仅仅局限在化学工程和微生物工程的领域，通过对粗材料进行加工、发酵和转化来生产纯化人们需要的产品，如乳酸、酒精、面包酵母、柠檬酸和蛋白酶等。 （二）近代生物技术阶段 近代生物技术是以20世纪4O年代抗菌素的提取，50年代氨基酸的发酵到60年代酶制剂工程为线索，仍以微生物发酵技术为技术特征的。这一时期抗生素工业、氨基酸发酵和酶制剂工程相继得到发展，细胞工程相关技术日臻完善，但从技术特征上看还不具备高新技术诸要素，因此只能被视为近代生物技术。 （三）现代生物技术阶段 现代生物技术以20世纪70年代DNA重组技术的建立为标志，以世界上第一家生物技术公司——Gene-Tech的诞生（1976）年为纪元。此后，越来越多的科学
2016年级科学学位硕士研究生班作业 1、对照ACRL2006年《科学、工程和技术领域信息素养标准》写出自己目前具备的信息素养，哪些是本次课程学习需要达到的信息素养。 （对照三级指标每小项分别注明具备、课堂或者长期学习） 标准一：有信息具有信息素养的学生能确定所需信息的性质和范围 1、定义和描述信息需求： a. 识别并／或能对研究课题或其他信息需求（如指定的实验室活动或项目）进行关键词重述或转换。（课堂学习） b. 向教学人员或专家咨询研究主题、研究项目或实验等问题的合理性。（具备） c. 草拟一个论题或假设，并根据信息需求列出相关问题。（具备） d. 通过浏览广泛的信息源来熟悉课题。（具备） e. 限定或修改信息需求以抓住重点。（具备） 2、可找到多种类型和格式的信息来源： a. 确定信息源的目标和受众。（例如：大众信息 vs.学术信息、当前信息 vs.历史信息、外部信息v s.内部信息、一次文献v s.二次文献vs.三次文献）。（课堂学习） b. 将专家和其他研究者作为信息源。（具备） c.识别并区分各种格式（例如多媒体、数据库、网站、数据集、专利、地理信息系统、三维技术，公开文件报告，音视频报告、书籍、图表、地图等）存在的潜在信息源的价值和不同之处。（课堂学习） d.认识到信息可能需要从一次文献或实验的原始数据中析出。（具备） e.认识到各种潜在有用的信息数据可能属于保密的、限制访问的或在线免费使用的。（具备） f. 认识到这些潜在有用的信息可能需要特定的数据管理经验并了解生产信息的组织结构。（课堂学习） 3、具备学科领域文献的应用知识并了解其产生过程: a.了解科技相关信息是如何正式或非正式一产生、组织以及传播的。（课堂学习） b.认识到学科中一次、二次、三次文献源的不同重要性。（课堂学习） c.知晓该领域的行业协会及其产生的文献。（长期学习） d.了解本学科领域的特殊文献源知识，如手册、小册子、专利、标准、材料/设备规格说明，当前的规章制度，工业常用参考资料、工业生产方法及实践手册、产品资料等。（长期学习） e.认识到知识可按学科分类，并考虑到复合学科可能会影响到信息获取方式，同时，其它学科文献也可能与信息需求相关。（具备） f. 认识到档案信息的价值以及在不同学科专业中的用途和重要性，并认识到信息长期保存的重要性。（具备） 4、权衡获取所需信息的成本与收益： a.确定所需信息的可用性，并决定是否扩大检索范围以查寻本地馆藏以外的信息。如咨询同事、独立信息经纪人、行业专家或顾问，以及利用馆际互借服务或附近的图书馆或信息中心等。（课堂学习） b.认识到获取信息需要付出的时间和费用。（具备） c.拟定一份现实可行的信息获取总体规划和时间表。（长期学习）
2019山东继续医学教育《医学文献检索》答案 （）全文浏览器是中国知网的专用全文格式浏览器E、caj （）是北京爱琴海软件公司开发的一款专业级别的文献检索与管理系统D、NoteExpress （）是北京金叶天盛科技有限公司开发的国内第一款医学文献管理软件B、医学文献王（）是构成数据库中记录的基本单元B、字段 （）是记录有知识的一切载体B （）是记录有知识的一切载体B、文献 （）是目前唯一国际通用的专利文献分类工具A、国际专利分类法 （）是人们用来反映客观事实而记录下来的可以识别的物理信号A、数据 （）是人们在认识和改造客观世界的实践中所获得的认识和经验的总和B、知识 （）是物质存在的一种方式、形态或运动状态，是事物的一种普遍属性A、信息 《美国生理学杂志》现分（）个分册出版D、7 《默克诊疗手册》是（）提供的非营利性医疗服务C、默沙东 《中国标准文献分类法》目前有（）个一级大类组成E、24 《中国图书馆分类法（第四版）》的“自然科学”大类中涉及医/药学的分类除了“医药卫生（R）”之外，还有（）C、生物科学(Q) 《中国图书馆分类法（第四版）》将中医药、卫生大类分为（）个二级类目B、17 《中国学术期刊网络出版总库》收录了下列哪一年以来的中国生物医学期刊（）C、1915 《中国学术期刊网络出版总库》数据更新频率是（）A、每日更新 A near B表示A、B之间允许插入几个其他单词（）A、0 CBM采用下列哪种词表对文献进行分类标引（）A、《中国图书馆分类法-医学专业分类表》CNKI的概念是由（）在1998年提出的B、世界银行 CNKI的中文全称是（）B CNKI是一种（）C、全文数据库 CNKI收录的文献数据库不包括（）B、外文文献数据库 CNKI提供的全文格式有（）A、CAJ格式 CNKI中可实现一个检索项包含多个检索词以及多个检索项之间组配的检索是（）C、高级检索 DOI是指（）B、数字对象唯一标识符 EndNote是以（）为核心进行管理B、题录 EndNote提供的导入题录的方式不包括（）B EndNote题录管理操作可通过菜单栏（）操作B、reference ICD-10是一种（）B、疾病分类法 JAMA是（）C、医学期刊缩写Medical matrix分类目录搜索按各种医学信息分为（）个大类C、8 Medical matrix分类目录搜索按各种医学信息分为（）个大类C、8 NCBI的全称是（）B、美国国家生物技术信息中心 pubmed常用检索字段含义错误的一项是（）E、volume-期刊 PUBMED的数据库主要来源是（）B、medline PUBMED数据库检索结果输出的方式不包括（）B PubMed中可检索的字段没有（）C、age PubMed中与“infection*”截词检索匹配的是（）E、infections Science Direct是（）公司提供的全学科的全文数据库B、Elsevier
生命科学被誉为２１世纪的最前沿科学之一，随着人类第一张基因序列草图的完成和发展，生命科学的研究也将进入一个崭新的后基因组学，即蛋白质组学时代。正如基因草图的提前绘制得益于大规模全自动毛细管测序技术一样，后基因组研究也将会借助于现代生物质谱技术等得到迅猛发展。本文拟简述生物质谱技术及其在生命科学领域研究中的应用。 １．质谱技术 质谱（ＭａｓｓＳＰｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）是带电原子、分子或分子碎片按质荷比（或质量）的大小顺序排列的图谱。质谱仪是一类能使物质粒子高化成离子并通过适当的电场、磁场将它们按空间位置、时间先后或者轨道稳定与否实现质荷比分离，并检测强度后进行物质分析的仪器。质谱仪主要由分析系统、电学系统和真空系统组成。 质谱分析的基本原理 用于分析的样品分子（或原子）在离子源中离化成具有不同质量的单电行分子离子和碎片离子，这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能并形成一束离子，进入由电场和磁场组成的分析器，离子束中速度较慢的离子通过电场后偏转大，速度快的偏转小；在磁场中离子发生角速度矢量相反的偏转，即速度慢的离子依然偏转大，速度快的偏转小；当两个场的偏转作用彼此补偿时，它们的轨道便相交于一点。与此同时，在磁场中还能发生质量的分离，这样就使具有同一质荷比而速度不同的离子聚焦在同一点上，不同质荷比的离子聚焦在不同的点上，其焦面接近于平面，在此处用检测系统进行检测即可得到不同质荷比的谱线，即质谱。通过质谱分析，我们可以获得分析样品的分子量、分子式、分子中同位素构成和分子结构等多方面的信息。 质谱技术的发展 质谱的开发历史要追溯到２０世纪初Ｊ．Ｊ．Ｔｈｏｍｓｏｎ创制的抛物线质谱装置，１９１９年Ａｓｔｏｎ制成了第一台速度聚焦型质谱仪，成为了质谱发展史上的里程碑。
生物技术地发展和应用 自2001年初，生物技术产业便显现出一片诱人地前景。人类基因组草图地即将完成，带动各生物技术地不断飚升。人们普遍认为这将导致医学与药物研究地繁荣，并会带来滚滚地财富。随着基因组测序地完成，许多科学家和投资者开始把目光投向生物技术向个学科地渗透，如今生物技术已经在芯片、医学等领域都取得丰硕地成果。下面对生物芯片、基因治疗及微生物地研究地基本问题作简单地介绍。 （一）生物芯片 20世纪90年代初开始实施地人类基因组计划取得了人们当初意料不到地巨大进展，而由此也诞生了一项类似于计算机芯片技术地新兴生物高技术———生物芯片。 生物芯片主要是指通过微加工和微电子技术在固体芯片表面构建微型生物化学分析系统，以实现对生命机体地组织、细胞、蛋白质、核酸、糖类以及其他生物组分进行准确、快速、大信息量地检测。目前常见地生物芯片分为三大类：即基因芯片、蛋白芯片、芯片实验室或称微流控芯片等。生物芯片主要特点是高通量、微型化和自动化。生物芯片上高度集成地成千上万密集排列地分子微阵列，能够在很短时间内分析大量地生物分子，使人们能够快速准确地获取样品中地生物信息，检测效率是传统检测手段地成百上千倍。使用基因芯片分析人类基因组，可找出癌症、
糖尿病由遗传基因缺陷引起疾病地致病地遗传基因。生物医学研究人员可以在数秒钟内鉴定出导致癌症地突变基因。借助一小滴测试液，医生们能很快检测病菌对人体地感染。利用基因芯片分析遗传基因，可以使糖尿病地确诊率达到50％以上。生物芯片在疾病检测诊断方面具有独特地优势，它可以在一张芯片上同时对多个病人进行多种疾病地检测。仅用极小量地样品，在极短时间内，向医务人员提供大量地疾病诊断信息，这些信息有助于医生在短时间内找到正确地治疗措施。对肿瘤、糖尿病、传染性疾病、遗传病等常见病和多发病地临床检验及健康人群检查，具有十分重要地应用价值。 （二）基因治疗 众里盼她千百度，如今，基因治疗已近走出实验室，进入实践阶段，如：癌症地基因治疗，肿瘤地基因治疗属于一种生物治疗手段，是一大类治疗策略地总称。根据治疗机理不同，目前至少可以分为以下几方面： （1）免疫基因治疗：指地是通过基因修饰地瘤苗或抗原呈递细胞体内回输，或者免疫基因地直接体内导入，激发或增强人体地抗肿瘤免疫功能，达到治疗肿瘤地目地，它也是一大类治疗地总称。治疗基因包括肿瘤相关抗原基因、细胞因子基因或者MHC基因等。
论文题目： 光电技术在生物医学中的应用——现状与发展 学院 专业名称 班级学号 学生 2013年12月19日
摘要： 简要介绍光电技术在生物医学应用中的发展概况，从基因表达与蛋白质——蛋白质相互作用研究方面，重点讨论了生物分子光子技术的特点与优势，阐明基于分子光学标记的光学成像技术是重要的实时在体监测手段，最后简要讨论了医学光学成像技术在组织功能成像和脑功能成像中的应用原理。 关键词：光电技术，医学诊断与治疗，分子光子学，医学成像
1.生物医学光子学发展简介 光电技术在生物医学中的应用实质上就是生物医学光子学的研究畴。生物医学光子学是近年来受到国际光学界和生物医学界广泛关注的研究热点。在国际上一般称为生物医学光子学或生物医学光学。 光子学以量子为单位，研究能量的产生、探测、传输与信息处理。光子技术在生物与医学中的应用即定义为生物医学光子学，其相应产业涉及人类疾病的诊断、预防、监护、治疗以及保健、康复等。研究容包括:光子医学与光子生物学，X-射线成像，MRI ，PET等。近年来，生物医学光子学在生物活检、光动力治疗、细胞结构与功能检测、对基因表达规律的在体观测等问题上取得了可喜研究成果，目前正在从宏观到微观多层面上对大脑活动与功能进行研究。美国《科学》杂志在最近儿年已发表相关论文近20篇。随着光子学技术的发展，生物医学光子学将在多层次上对研究生物体特别是人体的结构、功能和其他生命现象产生重要影响。 在国际上已经成立了国际生物医学光学学会(International Biomedical Optics Society)，简称IBOS。IBOS每年与国际光学工程学会(SPIE)联合举办学术会议。国外 学术交流方面，作为生物医学工程和光学工程领域重要国际会议的“生物医学光学国际学术研讨会”(International BiomedicalOptics Symposium，简称BIOS)每年在美国和欧洲各举办一次。在国，国家自然科学基金委员会生命科学部与信息科学部联合发起并承办的全国光子生物学与光子医学学术研讨会已经举办了六届。在第六届学术会议上发表学术论文75篇，论文摘要27篇。 从光电技术(或光子技术)在生物医学中的应用现状可以看到，光子医学与光子生物学的研究和应用围是广泛而且深入的，并正在形成有特色的学科和产业。例如，由于生物超微弱发光与生物体的细胞分裂、细胞死亡、光合作用、生物氧化、解毒作用、肿瘤发生、细胞和细胞间的信息传递与功能调节等重要的生命过程有着密切的联系，基于生物超微弱发光的生物光子技术在肿瘤诊断、农业、环境监测、食品监测和药理研究等方面己经得到应用。 下面主要从生物分子光子技术和医学光学成像技术两个方面介绍当前的研究现状 与发展趋势。
实验三数据库搜索—BLAST 1. Nucleotide BLAST 在Nucleotide中输入登录号搜索人类MAPK9（NM_139069.2）基因，send to 为coding sequences，作为Query 序列，或者下载complete sequences，在Blastn 中限制序列搜索范围为272-1420（编码区）。分别用megablast, discontiguous megablast 和 blastn 进行搜索。 这三个搜索的参数不同之处，主要体现在单词单位，megablast的单词单位默认为28，可选范围从16-256， discontiguous megablast的单词单位默认为11，可选为11和12， blastn单词单位默认为11，可选范围为7,11和15。Megablast 可以快速搜索到与query 高度相似的序列；discontiguous megablast用于寻找与 query 高度相似的序列; blastn则用于寻找与 query 有一定相似度的序列。单词单位越小，敏感度越高，也就是说，Megablast敏感度最差，discontiguous megablast 居中，blastn 最高。 Megablast的搜索速度最快，discontiguous megablast居中，blastn最差。三个搜索所搜索到的相似序列的数量，相似性范围和分值范围都有很大差异，具 Methods Number Identity（%）Max score Megablast154172-10073.1-2122 discontiguous megablast652763-10044.6-2073 blastn116676310044.6-2073 截取30bp的片段进行blastn搜索，默认参数设置如下图： 搜索后，实际参数如下图，主要对word size, expect value进行了调整，这是因为我们了选中automatically adjust parameters for short input sequences，在所搜索的片段长度比较小时，数据库中随机情况下找到高度相似甚至相同的局部比对（HSPs）的可能性非常高，系统自动将 word size 调小，
现代生物技术的应用与展望 姓名：班级：学号： 摘要：参阅大量文献资料对近年来生物技术在农业、医药业、社会科学等中的应用进展进行了综述。从改革传统农业结构，解决食品短缺问题的应用、深入基因研究，解决健康长寿问题、运用现代生物技术，解决环境污染问题等内容出发，指明了生物技术现代科学发展中的应用前景。 关键词：生物技术基因医学健康农业 Abstract: a large number of literature on recent biotechnology in agriculture, medicine and industry, social science and application were reviewed in this paper. From the reform of traditional agriculture structure, to solve food shortage problem, in-depth application of genetic research, solve the longevity and health problems, use of modern biological technology, solve the problem of environmental pollution and other content, pointed out the biological technology of modern science and application prospects. 现代生物技术也可称之为生物工程，是以重组DNA技术和细胞融合技术为基础，利用生物体(或者生物组织、细胞及其组分)的特性和功能，设计构建具有预期性状的新物种或新品系，以及与工程原理相结合进行加工生产，为社会提供商品和服务的—个综合性技术体系。其内容包括基因工程、细胞工程、酶工程、发酵工程和蛋白质工程。现代生物技术的诞生以2O世纪7O年代初DNA重组技术和淋巴细胞杂交瘤技术的发明和应用为标志，迄今已走过了30多年的发展历程。实践证明现代生物技术对解决人类面临的粮食、健康、环境和能源等重大问题方面开辟了无限广阔的前景，受到了各国政府和企业界的广泛关注，与微电子技术、新材料技术和新能源技术并列为影响未来国计民生的四大科学技术支柱，是2l世纪高新技术产业的先导。可以预测，生物技术的应用与发展将导致生产体系与经济结构的飞跃变化，甚至可能引发一次新的工业革命，对人类社会的生产、生活各方面必将产生全面而深刻的影响。 1 改革传统农业结构，解决食品短缺问题 现代生物技术在农业中最突出的应用是利用转基因技术，将目的基因导入动、植物体内，对家畜、家禽及农作物进行品种改良，从而获得高产、优质、抗病虫害的转基因动植物新品种，达到充分提高资源利用效率，降低生产成本的目的。经过长期不断的努力，现代农业生物技术已取得重大突破，不仅从根本上改变了传统农作物的培育和种植，也为农业生产带来了新一轮的革命，并将在解决目前人类所面临的粮食危机、环境恶化、资源匮乏、效益衰减等方面发挥巨大作用。 1．1 提高农产品的产量与质量农作物病虫害是造成农业产量下降的主要原因之一，因而利用转基因技术把抗病、抗虫基因导入农作物中，使之可避免或减少病虫害。近年来，抗黄杆菌的水稻、抗除草剂的大豆、抗病毒病的甜椒、抗腐能力强与耐贮性高的番茄等转基因植物开始进入市场，提高了产量，增加了效益；根据人类的需要，还可把特定基因导入植物体，可达到改良农产品品质的目的，如高含量必需氨基酸的马铃薯，高蛋白质含量的大豆等；此外还可利用生物技术破坏水果细胞壁纤维酶，保证猕猴桃、桃、西红柿等水果成熟但不变软而提高水果的保鲜度，便于水果的运输。从1996年到2o02年，转基因农作物在全球的种植面积从170万ha扩大到5810万ha，即增加35倍，显示了现代农业生物技术强大的生命
医学文献检索复习题 一、填空题(20分，每空1分) 1.按文献的加工层次分，《中国医院管理年鉴》为 3 次文献。 2.一条题录至少应包含的文献信息有____标题_____、__作者___、__出处___。 3.引文追溯法中的“引文”指的是_文后的参考文献_，此方法是常在缺乏__检索工具__时使用。 的英文全称是__Medical subject Headings______。 5.计算机检索的核心是__数据库___，其基本信息单元是 _字段__ 。 的中文全称为_中国生物医学文献数据库___。 7.规范化的检索语言主要有_主题语言___语言和分类语言语言两种。 8.用Ｍedline 检索Mark Eric Wolfe教授所著的文章，在基本检索状态下检索，其检索表达式为：Wolfe ME_。 9. CBMdisc光盘检索时，检索式“肝炎 in ti”可检出在_标题__中含有_肝炎__的文献。 10.计算机检索的三个基本逻辑运算符按照其运算优先级别由高到低应排列为： NOT 、AND 、 OR 。 11．CBMdisc使用___MESH____和《中医药学主题词表》进行主题标引，使用__《中图法》___进行分类标引。 二、判断题（10分，每题1分。正确的请打“√”，错误的请打“×”） 1．按照检索的内容分，google是专业性的搜索引擎。（×） 2．用“马红 in au”检索CBMdisc数据库，可检出作者为马红或马红梅、马红艳、张马红等的文章。（√） 3．主题词规范化的目的是扩大检索范围。（√） 4．CBMdisc和VIPdata均采用MeSH进行主题标引。（×） 5．PubMed不是文摘数据库。（×） 6．布尔逻辑运算可用于手工检索。（×） 7．硕士论文是一次文献，搜索引擎是二次文献。（√）
生物技术的发展和应用 自2001年初，生物技术产业便显现出一片诱人的前景。人类基因组草图的即将完成，带动各生物技术的不断飚升。人们普遍认为这将导致医学与药物研究的繁荣，并会带来滚滚的财富。随着基因组测序的完成，许多科学家和投资者开始把目光投向生物技术向个学科的渗透，如今生物技术已经在芯片、医学等领域都取得丰硕的成果。下面对生物芯片、基因治疗及微生物的研究的基本问题作简单的介绍。 （一）生物芯片 20世纪90年代初开始实施的人类基因组计划取得了人们当初意料不到的巨大进展，而由此也诞生了一项类似于计算机芯片技术的新兴生物高技术———生物芯片。 生物芯片主要是指通过微加工和微电子技术在固体芯片表面构建微型生物化学分析系统，以实现对生命机体的组织、细胞、蛋白质、核酸、糖类以及其他生物组分进行准确、快速、大信息量的检测。目前常见的生物芯片分为三大类：即基因芯片、蛋白芯片、芯片实验室或称微流控芯片等。生物芯片主要特点是高通量、微型化和自动化。生物芯片上高度集成的成千上万密集排列的分子微阵列，能够在很短时间分析大量的生物分子，使人们能够快速准确地获取样品中的生物信息，检测效率是传统检测手段的成百上千倍。使用基因芯片分析人类基因组，可找出癌症、糖尿病由遗传基因缺陷引起疾病的致病的遗传基因。生物医学研究人员可以在数秒钟鉴定出导致癌症的突变基因。借助一小滴测试液，医生们能很快检测病菌对人体的感染。利用基因芯片分析遗传基因，可以使糖尿病的确诊率达到50％以上。生物芯片在疾病检测诊断方面具有独特的优势，它可以在一芯片上同时对多个病人进行多种疾病的检测。仅用极小量的样品，在极短时间，向医务人员提供大量的疾病诊断信息，这些信息有助于医生在短时间找到正确的治疗措施。对肿瘤、糖尿病、传染性疾病、遗传病等常见病和多发病的临床检验及健康人群检查，具有十分重要的应用价值。 （二）基因治疗 众里盼她千百度，如今，基因治疗已近走出实验室，进入实践阶段，如：癌症的基因治疗，肿瘤的基因治疗属于一种生物治疗手段，是一大类治疗策略的总称。根据治疗机理不同，目前至少可以分为以下几方面： （1）免疫基因治疗：指的是通过基因修饰的瘤苗或抗原呈递细胞体回输，或者免疫基因的直接体导入，激发或增强人体的抗肿瘤免疫功能，达到治疗肿瘤的目的，它也是一大类治疗的总称。治疗基因包括肿瘤相关抗原基因、细胞因子基因或者MHC基因等。 （2）抑癌基因治疗：抑癌基因的失活是肿瘤发生过程中重要的分子事件，研究证明，体导入野生型抑癌基因，替代缺失或异常的抑癌基因表达，可以达到抑制肿瘤细胞增殖的效果。目前研究较为深入的抑癌基因治疗主要运用P53、P16、RB基因等，其中又以P53基因应用最广泛，许多治疗方案已进入临床试验阶段。 （3）反义癌基因治疗：癌基因是一类细胞增殖调控正信号基因，具有促使细胞增殖，阻止细胞分化的特点，癌基因的激活是肿瘤发生过程中另一重要的分子事件。通过人工合成的寡核苷酸与癌基因编码的mRAN互补结合，可以抑制mRNA
现代生物技术产业化发展的现状与趋势 摘要：综述了现代生物技术的发展现状，介绍了农业生物技术的疫苗、工业生物技术、医药生物技术及其在生物技术领域中的应用情况，介绍了生物技术领域重点攻关课题研究进展，展望了今后的发展方向。 关键词：现代生物技术产业化现状与趋势 1 前言 生物技术也称生物工程，它是在分子生物学基础上建立的、为创建新的生物类型或新生物机能的实用技术，是现代生物科学和工程技术相结合的产物。具体而言，生物工程技术包括转基因植物、动物生物技术、农作物的分子育种技术、医药生物技术、纳米生物技术、重要疾病的生物治疗等。当前，世界生物技术发展已进入大规模产业化的起始阶段，蓬勃兴起和迅猛发展的生物医药、生物农业、生物能源、生物制造、生物环保等领域，正在促使生物产业成为世界经济中继信息产业之后又一个新的主导产业[1]。 现代生物技术以20世纪70年代DNA重组技术的建立为标志，以世界上第一家生物技术公司——Gene-Tech的诞生（1976）年为纪元[2]。此后，越来越多的科学家投身于分子生物学研究领域，并取得了许多重大的进展。至此，以基因工程为核心的技术上的革命带动了现代发酵工程、酶工程、细胞工程以及蛋白质工程的发展，形成了具有划时代意义和战略价值的现代生物技术。生物技术的最大特点是具有再生性，可以循环利用生物体为操作对象，在节约原材料和能源方面有巨大的潜力，而且投资少、周期短、经济效益大，并且没有污染。他是推动经济发展、社会进步的一项关键技术，在解决人类社会面临的一系列重大问题，如粮食、健康、环境和能源方面已经取得并将取得更大进展，对促进社会经济诸领域的发展有着不可估量的影响。 2 全球现代生物技术的发展现状 产值继续增长 2013年，全球生物工程药品市场规模为2705亿美元，2014年增长至3051亿美元。基于疾病诊断和治疗对重组技术、医药生物技术以及DNA测序技术等的需求不断增加，全球生物技术市场预计以%的年复合增长率增长，至2020年全球
世界著名的质谱方面网站清单 质谱技术在蛋白鉴定等实验中具有不可忽视的作用，但是，目前的应用还不是特别广泛。那么，有问题了怎么解决呢?本文收集整理了相关的网站，包括世界著名的质谱学会、质谱研究组、质谱软件等。 美国质谱学会(ASMS, American Association for Mass Spectrometry) https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/ 南非质谱协会(SAAMS) http://www.saams.up.ac.za/ 欧洲质谱学会(ESMS) https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/esms/ 岛津公司：Koichi Tanaka (2002年诺贝尔化学奖获得者) https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/about/nobel/ ***高纯度化学研究所 http://www1m.mesh.ne.jp/kojundo/e/index.htm ***质谱学会(MSSJ) http://www.mssj.jp/ 瑞典质谱学会(SMSS) http://www.smss.uu.se/ 瑞士质谱组(SGMS) http://www.sgms.ch/ 生物技术中的质谱仪器相关资源 https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/ 以色列巴依兰大学：化学系 http://www.biu.ac.il/ESC/ch/ 印度质谱学会(ISMAS) https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/ 英国表面分析论坛 https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html, 英国伦敦大学比克贝克学院生物与化学学院：分析科学研究小组 https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/~chm_tgc/ 英国曼彻斯特理工大学化学系：J. Philip Day的研究小组 https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/people/academic/jpd.html 英国质谱学会(BMSS) https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/index.html 质谱:Mass Spectrometry Database,American Academy of Forensic Sciences (免费) http://www.ualberta.ca/~gjones/mslib.htm
现代生物技术的发展 姓名：王利新 学号： 学院：
摘要：现代生物技术是通过生物化学与分子生物学的基础研究而快速发展起来的。医药生物技术起步最早、发展最快，目前世界已有2000多家生物技术公司，其中70%从事医药产品的开发。生物技术工业总体日趋成熟，正在由风险产业变成以商业为动力，以市场为中心的产业。 应用生物技术已有可能产生几乎所有的多肽和蛋白质，基因工程技术的应用已使新药研究方法和制药工业的生产方式发生重大变革。该文对现代生物技术在医药和基因工程现代化的应用进行了全面、深入的论述。 【关键词】生物技术；医药；基因工程技术； 率高近十几年来，在利用生物技术制取新药方面取得了惊人的成就，已有不少药物应用于临床。例如人胰岛素、人生长激素、干扰素、乙肝疫苗、人促红细胞生成素（Epo）、GM－集落刺激因子（GM－CSF）、组织溶纤酶原激活素、白细胞介素－2及白介素－11等。正在研究的有降钙素基因相关因子、肿瘤坏死因子、表皮生长因子等140多种。随着生物技术药物的发展，多肽与蛋白质类药物的研究与开发，已成为医药工业中一个重要的领域，同时给生物制剂带来了新的挑战。在实际应用中，基因工程药物受到一定限制，如口服应用时生物利用度低，会受到消化酶的破坏，在胃酸作用下不稳定，在体内半衰期较短等，因此只能注射给药或局部用药。为了克服这些缺陷，已开始改为合成这些天然蛋白质的较小活性片段，即所谓“多肽模拟”或“多肽结构域”合成，又叫“小分子结构药物设计”。这类药物可口服，有利于由皮肤、粘膜给药，用于治疗免疫缺陷症、HIV 感染、变态反应性疾病、风湿性关节炎等，其制造成本也更低。这种设计思想也已应用于多糖类药物、核酸类药物和模拟酶的有关研究。小分子药物设计属于第二代结构相关性药物设计，所设计的分子能替代原先天然活性蛋白与特异靶相互作用。 在给药方式的研究方面，对注射用溶液和注射用无菌粉末（目前上市的多肽蛋白质类药物多为此种剂型），除了继续改进其稳定性外，还通过一些其他技术手段，研制出了化学修饰型、控释微球型和脉冲式给药系统。在非注射途径的给药系统，即包括鼻腔、口服、直肠、口腔、肺部给药方面也已取得重大进展。国内市场上主要有基因工程乙肝疫苗、干扰素、重组人白介素-2、G-CSF（增白细胞）、重组人红细胞生成素（EPO）等15种自己生产的基因工程药品。已经批准
1、以下说法不正确的是（）。?*??A.中国生物医学文献数据库（CBM）可以用near、with等位置算符进行检索。 ??B.中国生物医学文献数据库（CBM）的高级检索可以进行第一作者检索。 ??C.主题词检索除了可以进行扩展检索和加权检索外,还可以匹配副主题词进行检索。 ??D.《中国图书馆分类法-医学专业分类表》是中国生物医学文献数据库（CBM）进行分类标引的依据。 2、在中国生物医学文献数据库（CBM）中，检索结果的聚类不包括以下哪项？（）?* ??A.基金 ??B.主题 ??C.学科 ??D.期刊 3、《中国中医药学主题词表》由哪个单位研发？（）?* ??A.中国医学科学院医学信息研究所 ??B.北京大学医学图书馆 ??C.解放军医学图书馆 ??D.中国中医科学院中医药信息研究所 4、以下说法正确的是（）。?* ??A.中国生物医学文献数据库（CBM）和CNKI都有主题词表。 ??B.中国生物医学文献数据库（CBM）和Pubmed数据库均可利用截词符“*”代表任何字符串或空格。 ??C.中国生物医学文献数据库（CBM）和PubMed均采用医学主题词表和中医药学主题词表进行主题标引。 ??D.在中国生物医学文献数据库（CBM）高级检索的检索入口中，常用字段是中文标题、摘要、关键词、主题词的组合项。 5、中国生物医学文献数据库（CBM）中除了可以利用基金名称或者基金项目（“项目名称”或“项 目编号”）直接查找基金，也可通过以下哪项逐级查找浏览？（）?* ??A.期刊分类导航 ??B.主题分类导航 ??C.基金分类导航 ??D.分类号 6、中国生物医学文献数据库（CBM）的检索有关某个课题“病例报告”方面的文章可以从以下哪类 限定里选择？（）?* ??A.年代范围 ??B.文献类型
学院：______ 班级:_______ 学号:_________ 姓名:__________ 成绩：______ 实验一常用生物数据库及数据库的查询与搜索 目的： 1、了解常用生物数据库的内容及结构，理解各数据库注释的含义。 2、掌握 NCBI Entrez系统的使用，根据需要在 NCBI 的各类数据库中搜寻信息。 二、核酸序列信息查询 1、登录NCBI网站主页（https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/），点击页面上部的链接（about the NCBI），了解NCBI网站的相关介绍；继续点击链接（databases and tools）了解NCBI网站的数据库相关信息。回答以下问题： （1）NCBI GenBank数据库中近两年的数据量分别是多少？最近一次的数据统计截止到什么时间？ （2）NCBI Entrez系统是否包括EST（Expressed Sequence Tags）数据库？EST 数据库中收集什么数据？ 7）这条序列编码的蛋白质在数据库中的序列名称是什么？ （8）该记录的FASTA格式文件第一行内容为： 三、蛋白质序列数据库查询 登录NCBI网站主页（https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/）。参照第四章生物信息数据库的基本应用课件，选择protein数据库，以ABR19831为检索词，查询数据库，分别以GBFF格式、FASTA格式打开该记录，查看相关信息，回答下列问题：（1）这条序列包括多少氨基酸残基？ （2）这条序列的最新更新日期是什么时间？ （3）这条蛋白质序列的名称是什么？
（4）这条序列来源于什么物种？ （5）这条序列是由哪里的研究者提交的？ （6）编码这条序列的基因是什么基因？ （7）该记录的FASTA格式文件第一行内容为： 四、NCBI数据库搜索 利用NCBI网站的BLAST软件包（https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/BLAST/ 2、登录NCBI网站主页（https://www.doczj.com/doc/7b18710961.html,/），熟悉网页上的查询栏。参照第四章生物信息数据库的基本应用课件，选择nucleotide数据库，以BT073138为检索词，查询数据库，分别以GBFF格式、FASTA格式打开该记录，查看相关信息，回答下列问题： （1）这条序列的分子类型是什么？ 1、通过阅读学术期刊Nucleic Acid Research了解目前生物信息数据库的数量及分类。 2、登录NCBI网站，了解NCBI网站内容及结构，按要求查询核酸序列记录，读取核酸序列，熟悉数据库记录的GBFF（GenBank Flat File）格式，看懂其中的注释。熟悉数据库记录的FASTA格式，将序列以FASTA格式进行保存。 3、登录NCBI网站，按要求查询蛋白质序列记录，读取蛋白质序列，熟悉数据库记录的GBFF（GenBank Flat File）格式，看懂其中的注释。熟悉数据库记录的FASTA格式，将序列以FASTA格式进行保存。 4、利用NCBI的BLAST程序对给定的序列进行数据库搜索，熟悉搜索结果界面，理解搜索结果各部分内容的含义。