（生物科技行业）功能基因的克隆及生物信息学分析
功能基因的克隆及其生物信息学分析 摘要：随着多种生物全基因组序列的获得，基因组研究正从结构基因组学（structuralgenomics）转向功能基因组学(functionalgenomics)的整体研究。功能基因组学利用结构基因组学研究获得的大量数据与信息评价基因功能(包括生化功能、细胞功能、发育功能、适应功能等)，其主要手段结合了高通量的大规模的实验方法、统计和计算机分析技术[1]，它代表了基因分析的新阶段，已成为21世纪国际生命科学研究的前沿。功能基因组学是利用基因组测序获得的信息和产物，发展和应用新的实验手段，通过在基因组或系统水平上全面分析基因的功能，使生物学研究从对单一基因或蛋白的研究转向多个基因或蛋白同时进行系统的研究，是在基因组静态的组成序列基础上转入对基因组动态的生物学功能学研究[2]。如何研究功能基因，也成为我们面临的一个课题，本文就克隆和生物信息学分析在研究功能基因方面的应用做一个简要的阐述。 关键词：功能基因、克隆、生物信息学分析。 1.功能基因的克隆 1.1图位克隆方法 图位克隆又称定位克隆，它是根据目标基因在染色体上确切位置，寻找与其紧密连锁的分子标记，筛选BCA克隆，通过染色体步移法逐步逼近目的基因区域，根据测序结果或用BAC、YAC克隆筛选cDNA表达文库寻找候选基因，得到候选基因后再确定目标基因。优点是无需掌握基因产物的任何信息，从突变体开始，逐步找到基因，最后证实该基因就是造成突变的原因。通过图位克隆许多
控制质量性状的单基因得以克隆，最近也有报道某些控制数量性状的主效基因（控制蕃茄果实大小的基因克隆[3]、控制水稻成熟后稻谷脱落基因克隆[4]以及小麦VRN2基因克隆[5]等）也通过图位克隆法获得。 1.2同源序列克隆目的基因 首先根据已知的基因序列设计PCR引物，在已知材料中扩增到该片段，并经克隆测序验证，利用放射性同位素标记或其他非同位素标记该PCR片段作为探针，与待研究材料的cDNA文库杂交，就可以获得该基因cDNA克隆，利用克隆进一步筛选基因组文库，挑选阳性克隆，亚克隆并测序，从中就可以筛选到该基因的完整序列。 1.3结合连锁和连锁不平衡的分析方法 结合连锁和连锁不平衡的分析方法是未知基因克隆研究领域发展的新方向[6]。(Linkagedisequilibrium,LD)。与连锁分析不同,连锁不平衡分析可以利用自然群体中历史发生的重组事件。历史上发生的重组使连锁的标记渐渐分布到不同的同源染色体上,这样就只有相隔很近的标记才能不被重组掉,从而形成大小不同的单倍型片段(Haplotypeblock)。这样经过很多世代的重组,只有相隔很近的基因,才能仍处在相同的原始单倍型片段上,基因间的连锁不平衡才能依然存在。所以基于连锁不平衡分析,可以实现目的基因的精细定位。林木大多为自由授粉的异交物种,所以连锁不平衡程度很低,林木基因组中的LD可能会仅局限于非常小的区域,这就为目的基因的精细定位提供了可能,结合SNP检测技术,科学家甚至可以将效应位点直接与单个的核苷酸突变关联起来,进行数量性状寡核苷酸
七年级生物上册期末考试试卷分析 1 2018-2019学年度第一学期 2 一、试卷内容分析 3 （一）试题命题分析 4 5 本次试卷的命题依据是《初中生物课程标准》，在试题结构、题量、6 取材、情景、命题思路等方面都体现了新课标的理念，试卷的难易度适中，基础知识占主导地位。 7 8 1、试题量方面：题量比较适宜，试卷共两大题。选择题20小题（50分），9 填空题（50分），满分100分。 2、三维目标方面：①主要考查主干知识，全卷所涉及的知识点均为课本 10 11 中的核心内容；②注重知识理解能力和生物技能的考查；③关注学生情感态度 价值观方面的发展情况。 12 （二）试题特点 13 1、关注对生物学基础知识的考查 14 从试题来看没有怪题、难题和偏题，难易适中，主要考查生物15 常识，注重对学生生物文化素养的考查。但在往年的基础上略有变化，16 有所创新。选择题占50分，涵盖了全书的方方面面。 17 填空题中，绿色植物依然是作为一个重要的知识点来考查。 18 2、关注社会热点，突出对学生情感态度与价值观的考查。 19 试卷关注社会热点，如选择题第14题对国家政治的关注，使学20 生意识到生物就在我们的生活中。 21
二、答卷分析 22 1、存在的问题 23 （1）学生对基础知识掌握还不够十分地牢固，比如光合作用的反应24 式出错较多，动物在生物圈中的作用大部分学生写不下来，有些基本25 概念和理论分辨不清，差异较小处往往会迷惑，学生对多个知识点联26 系的考查不知从何处入手； 27 28 29 30
31 （2）分析理解能力欠缺，对问题理解得较为肤浅，审题能力较弱，32 简答题回答不全或“跑题”现象严重，识图能力差，名称与序号明显33 不符，说明这方面的能力训练不够； 34 35 （3）实验技能和实验操作考查上失分较多，部分同学对科学探究的36 过程不够理解； 37 38 （4）语言组织混乱，文字表达不清，错字严重，如肱二头肌的肱将39
七年级生物期中考质量分析 时光流逝，我们迎来了全市期末统考，并顺利完成了全市统评。统考统评让我们更标准的了解到我们平时教学中的不足，并及时改正来年新学期的教学。下面通过对这份试卷的分析来了解学生的掌握情况。现将统考统评情况分析如下： 一、全年段考试成绩分析： 全年段参考人数为396人，平均分为63.2分。其中80分以上为总体成绩不够理想，有待进一步改进教学方式方法及落实学生的学习情况。 二、试卷分析： 这份试卷难度适中，紧扣中考考试大纲及教材的要求来出题。但由于七年级学生刚接触生物学，且本学期的知识以植物学为主，而学生平时生活中较少了解植物，导致整体答题得分不理想。 主要失分点和原因分析： 第一部分：选择题 第7、11、12、13、15、24、25题 以上7题错误较多，其中第7题错误率最高，此题选项C的描述不清楚，导致学生错选。第11、12、13题错误的原因是对知识点掌握不熟而造成的。第24、25题错误的原因是学生在生活中对这些接触较少，导致易记错而造成的。 第二部分：非选择题 第26题学生失分率较高，主要是平时教学中少接触及学生对题目的不理解。 第27题学生得分率较高，学生基本都有掌握生物的四个特征。 第28题：（1）学生基本上都能分辨出动植物细胞。 （2）失分原因主要是：学生审题问题，题目要求填写字母代号学生多数写出结构名称，写字母的也出现多写、少写。 （3）出现错别字失分较多，如“遗传”→“遣传”，“移传”。 （4）很多学生知识点记错，多数填写为调焦距的粗准焦螺旋和细准焦螺旋。
第29题：（1）错别字，如“气孔”→“气孙”，“保卫细胞”→ “保护细胞”，“叶绿体”→“叶粒体”、“场所”→“产所”； （2）知识记忆错误，如“保卫细胞”→“保卫组织”，“叶绿体”→“叶绿素”、“线粒体”，“场所”→“车间”、“加工厂”等。 （3）知识掌握不熟及审题不够细心，使得第4小题多将“D”选为“C”。 第30题（总分6分）：多数学生得分在3~4分，序号对换或不懂。空白的也有个别，全对的学生也不少。 第31题（总分2分）：多数学生满分。一部分同学审题不严，答光合作用，呼吸作用被扣分，少部分同学是不懂概念及应用。 第32题（总分8分）：多数学生得分在3~6分，错在图的结构名称混淆。 第33题（总分2分）：失分较多，不能准确回答。 第34、35题：总体答题情况较好，涉及教材中的知识要点，答的较好。但有两极分化倾向，相当部分学生几乎满分，而也有相当部分学生得0分，甚至完全空白。主要问题集中在以下方面： （1）错别字，语病较严重。 （2）答题不规范，不严谨。 （3）审题不够细心，如第35题，将“湿度”看成“温度”。 （4）探究题的解题要领未完全把握，表述不清楚。 （5）部分学生答案不符合材料分析题题意，知识面较窄。 三、教学建议： 根据以上学生答题情况，提出以下教学建议； 1、在教学中应加强学生的基本知识的掌握，多强调学生知识点的记忆落实。 2、在教学中应对学生加强生物学专业术语的要求；加强生物学与其他学科的联系，应多重视培养学生严谨的科学态度；多训练学生审题细致，提高理解题意的能力。 3、在教学中相关的知识点应多引深，多理论联系实际，且及时传递社会热点信息，扩大学生知识面。
2019-2019 学年度七年级生物质量分析报告七年级生物质量分析报告上学期末考试教学工作已完成，现将七年级生物期末考试成绩做如下总结： 一、本学期教学成绩： 七年级 总分人数平均分最高分最低分及格人及格率优秀人数 优秀路率1 班2538 44 57.68 95 17 22
50 4 9 2 班264 3 46 57.46 87 15 22 47.8 5 10.9 3 班2429 45 53．98 90 20 18 40 3
4．4 总评 7610 135 56．4 95 15 62 45．9 4 8．1 二、检测情况分析。 1、选择题：30 分。考查学生对生物生命现象、结构特点、 生理等基础知识的掌握，侧重于对基础知识的识记。其中第 3、5、8、11、17、19、2 4、26、36、40 小题失分较多，其次是第1、13、15 小题。 2、读图分析题：8 分。考查学生的读图识图技能及植物细胞和动物细胞各结构的功能。此题学生对基础知识掌握较好，失分较少。 3、实验分析题：22 分。考查学生： （1）探究实验五个步骤的设置及对照实验的设置。学生不能正确的作出假设。 2）对照实验中对变量的控制不能准确的找出 （3）部分学生还不能准确的画曲线图。
4、资料分析题：30 分。 （1）对蒸腾作用、光合作用、呼吸作用的考查。学生基本能掌握。 （2）生态系统中的食物链和食物网知识的考查。学生基本能掌握。 （3）可持续发展中提倡绿色生活中，衣、食、住、行，学生所提的建议可行性不够强。 三、教师教学情况分析： 1、教师目前对于课标，教材的理解和把握处于学习与研究 阶段，对于七年级新旧教材和教学理念的对比已有一定认 识，但对于教学方法和学法指导还在进行积极的探索过程中。2、教师的角色有了一定的改变：逐渐由教学的主体转变为教学的组织者，引导者，参与者。 3、对于学生个体的学习基础、家庭教育情况了解地不够，师生配合还存在一定差距，对学生的分层次教学和要求还需改进。 4、教学中对学生掌握知识的期望值过高，有时比学生还着急，对学生的分析不到位。 5、与学生的相互配合处于磨合与适应阶段。 6、对新知识、信息、技能的储存不够，教学中难以信手拈 来。 7、课堂气氛活跃，但程度还应加强，尽量激发学生的学习兴趣。 8、教学中对学生的良好学习习惯培养不够。
JMJD2B基因的生物信息学分析 2006级本硕一班谢泽飞 指导老师：吴炳礼，许丽艳，李恩民 一对该基因的初步认识 JMJD2B基因是JMJB2基因家族中的一员，而说到该基因的来龙去脉还得从它的家族谈起。JMJD2家族是通过体外克隆的方式从一个编号为KIAA0867的人脑分粒cDNA文库中获得的，而且通过与JMJD1C基因的比较,更加明确了该基因家族的结构特点。该基因家族主要含有一个JmjN，JmjC,JD2H功能域，两个TUDOR功能域。有趣的是在该基因家族的C端末尾的第二个TUDOR功能域上有一个双向的出核入核定位信号，而这似乎提示了某些问题。现在我们对这整个家族有了一个初步的认识，再来看JMJD2B这个基因： 定位：19p13.3 全长：1096 AA 分子量：121896 Da 等电点：6.79 含有2个锌指结构，均为PHD型： 731-789 MCFTSGGENT EPLPANSYIG DDGTSPLIAC GKCCLQVHAS CYGIRPELVN EGWTCSRCA 851-907 KCVYCRKRMK KVSGACIQCS YEHCSTSFHV TCAHAAGVLM EPDDWPYVVS ITCLKHK 在15-57 处含有JmjN功能域，146-309含有JmjC功能域. 二该基因的主要生物学功能 第一点，通过进化树的分析，显示该基因在马这一动物中高度保守。
通过分析该基因的序列，在数据库中查找其同源序列，进而选取不同物种的代表基因进行进化树分析，我们可以看到，马这个物种的被归到了低等的昆虫中去了，按照进化的理论，应该不会出现这种情况的，于是，我们推断，该基因在马这个物种中特别保守，所以进化中的变异非常的小。再进一步想，该基因对马这个物种可能是很重要的，那么为什么这个基因会如此重要呢？通过查找文献，我得出下面的另一个结论，就是该基因的生物学功能：该基因具有去甲基化作用。当然，由于实验不是在马身上做的，我们也就只能得出一般性的结论。 第二点，参与组蛋白去甲基的作用，主动且有普遍特异性。 很显然，越来越多的研究表明，在真核细胞中组蛋白的甲基化修饰水平是该细胞的表观遗传的活跃程度的一个很重要指标。而JMJD2B的这个功能的意义是重大的,其能够使染色体核周异染色体的核周组蛋白去甲基化，进而对细胞的遗传进行表观遗传的调控。研究人员利用间接荧光免疫法进行追踪发现，在两组对照的雌鼠JMJD2B-GFP底物系统中，JMJD2B基因过度表达的一组，H3K9me3水平明显低于另外正常的那一组，都转变为H3K9me1的构型，这说明了JMJD2B 的特异去甲基作用，而且这一过程是主动的，都发生在细胞染色体复制前的一瞬间，速度非常快。但是，在巨大组蛋白中，该基因有表现出可以同时参与H3K9me3和H3K9me2的去甲基作用。
七年级生物试卷分析 本次初一生物期中质量检测主要考查学生基础知识和基本 技能。试卷题目比较灵活，突出考查了学生在具体的环境中，进行思维的能力，内容丰富，难易适中（知识与技能并重，较好地体现了新课程倡导的评价体系）。与生活联系：大多数题与生活 紧密相连，试题共四个大题，现将试题、试卷具体情况分析如下：一、试题、试卷分析 第一大题：选择题，20小题，共20分。题型合理，既考查基 础知识的掌握情况，又考查学生应用知识的能力。从答题情况来看，出错率较高的是第7、11,13小题，尤其是第13小题出错率最高。学生获得的最高分是17分最低分是6分。初一的学生大 部分还没有摆脱小学学习知识死记硬背的模式，不会自己去学习、分析问题，具体表现在：对知识的掌握不牢固；对较活的题应变能力较差；不会将学到的知识应用到实际；不会对问题进行分析。第二大题：非选择题，5个小题，共30分。题量、难易度合适，涉及面广。既有基础试题，又有灵活性强的试题。（1）小题知识的掌握较差。（主要是字写错）（5）题错的较多，综合性强，学 生有的理解不透（13）题学生因没有记住而导致出错。实验题难度不大，85%的学生都掌握的不错、从整体来看，学生对试题中 的知识掌握比较好，但同时试题也有一定的不足，如题量比较小，灵活性不强，希望以后注意。 二、教学反思
从学生试卷可看出，初中生物教学还存在许多问题值得研究与反思 1、加强教研。不要继续深入钻研课标，断提高教育教学水平。 2、狠抓基础。把书本知识与日常的生产、生活紧密联系，教师认为学生会的学生不一定会，要用生活中鲜活的事例使书本知识常识化，寓教于乐。 3、了解学生。关心他们的学习、生活，了解他们的学习需求，方可按需而教，提高课堂教学效率。 三教学措施： 今后努力做到： 1、一定让学生牢固掌握基础知识。 2、教师一定加强训练，进而提高学生的运用知识能力。 3、抓重点知识、难点知识。一定要讲清，落实到位。 4﹑强化书写要求。对于关键字词不仅要求记会，记准，更要会写，写对。 七年级生物试卷分析（二） 期末考试已经落下帷幕，为了更好地总结工作中的经验教训，特对本次的生物试卷进行全面的分析，以期在今后的工作中取得更好地成绩！ 本次试卷共分五个大题，满分一百分。 一、试卷总体印象 本次初一生物期末考试主要考查学生基础知识和基本技能。部
生物信息学考试试卷 WEIHUA system office room 【WEIHUA 16H-WEIHUA WEIHUA8Q8-
一、名词解释(每小题4分,共20分) 1、生物信息学 广义：生命科学中的信息科学。生物体系和过程中信息的存贮、传递和表达；细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程的中各种生物信息。 狭义：生物分子信息的获取、存贮、分析和利用。 2、人类基因组计划 人类基因组计划准备用15年时间，投入30亿美元，完成人类全部24条染色体的3×109脱氧核苷酸对(bp)的序列测定，主要任务包括作图(遗传图谱、物理图谱的建立及转录图谱的绘制)、测序和基因识别。其中还包括模式生物(如大肠杆菌、酵母、线虫、小鼠等)基因组的作图和测序，以及信息系统的建立。作图和测序是基本的任务，在此基础上解读和破译生物体生老病死以及和疾病相关的遗传信息。 3、蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构是指多肽链中氨基酸的序列 4、基因 基因--有遗传效应的DNA片断,是控制生物性状的基本遗传单位。 5、中心法则 是指遗传信息从传递给，再从RNA传递给，即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA，即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。 6 、DNA序列比较 序列比较的根本任务是：（1）发现序列之间的相似性；（2）辨别序列之间的差异 目的： 相似序列相似的结构，相似的功能 判别序列之间的同源性 推测序列之间的进化关系 7、一级数据库 数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释 8、基因识别 基因识别，是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和调控因子。 9、系统发生学 系统发生学(phylogenetics)——研究物种之间的进化关系。 10、基因芯片 基因芯片（gene chip），又称DNA微阵列（microarray），是由大量cDNA或寡核苷酸探针密集排列所形成的探针阵列，其工作的基本原理是通过杂交检测信息。
温泉县 2014年秋季学期期末考试生物学科质量分析报告 一、考试基本情况： 本次期末考试试卷是县教育局统一订购的、由新疆教研室出题的试卷，考试由学校教务处安排按照期中考试成绩分考场单人单桌的方式进行，阅卷由学校统一组织，召集本校理化生组及其他教师进行流水阅卷，从而保证了良好的考风考纪，公平、公正、如实地反映了学生的考试成绩。 二、考试成绩统计： 三、试题评价： 本次试题具有权威性、科学性、合理性的特点。具体说来：1、试卷结构合理，试题容量适当，试题具有较强的合理性和逻辑性。全卷由两大板块组成，即选择题和非选择题部分。其中此次单项选择题共40小题，题目都很基础，不算很难，也易得分；非选择题共4道大题。2、注重基础知识的掌握和理解。试卷考查的内容基本覆盖了八年级一至六单元的主干知识，紧扣新修订的“初中生物课课程标
准”。非选择题部分试题题型都是书上基础知识，也同是要求学生牢固掌握的基础知识，最后的大体也很贴近学生生活。3、注重能力的考查。考查学生通过运用基础的知识来分析问题、解决问题。4、试题选材贴近学生生活，符合学生的认知规律，也是基本知识。让学生运用所学有关基础生物知识进行判断和分析，有针对性地做题。 四、学生答题情况分析： 1、客观题答题概况：单项选择得分率较低，由于难度不大，只要细心，认真作答，学生一般均可取得较高的分数。可是实际却是得分不理想，可以看出大部分学生对基础知识理解掌握不到位，判断分析问题的能力差。 2、非选择题（二）本题主要考查的是学生对基础知识的识记掌握情况，从卷面可以看出四分之一的学生答题非常准确，还有一部分学生基础知识的掌握几乎空白，书写凌乱，概念模糊。 3、非选择题（三、四、五）考察学生运用所学知识分析解决问题的能力（情感态度价值观）。三是判断题三分之一的准确率不错，但一部分学生对基础知识掌握不牢，失分率较高。四是连线题学生有部分同学都能做对，但还有一部分显示知识缺乏，连得错误比较多。对于第五题的第二题学生解题能力薄弱，答题规范不严谨，同时得分率比较低，学生审题不严谨是最大的问题，回答的不是很准确。 五、改进与建议 1、抓全体学生，面向大多数。由于生物学科的特点，它可以在比较在一定时期内有效提高学生的成绩，因此我们要对每个学生负责，即使无升学希望，也要让他们了解一定的基础知识，当有些学生结束学生生活后，了解一定的生物知识，能有一定的生物素养。我们不但要提高成绩，更要对学生的终身发展负责。 2、加强开放性试题的训练。每次复习时都要拿出专门课时进行训练，教给学生答实验问题的方法和要求，尤其是得分点。对知识点中运用、体会、懂得类要求，自己抓常考题目题型，大胆对学生进行训练，尤其要以运用放在首位。 3、加强习题的筛选。我们能接触的到好的辅助材料不多，很多学校用的其中一本不错，但不能完全满足复习需要。因此，教师不能拿一本习题集从头做到尾，要从几本中选择针对性强的试题给学生。复习课一定要做到复习与练习并重，这样才能实现有效的复习。
2016——2017学年度上学期期中考试 初中生物试卷分析 一、试卷总体评价 1、知识的覆盖面广，其中考试内容既包括考纲要求的内容又包括考纲没有要求但是对学生生活知识有拓展的内容。 2、试卷考试题型难易结合，考试既有的送分题目又有需要学生思考的题目，保证所有学生能做，都能得一定的分数。 3、注重能力考查，要求学生对所学的课程内容融会贯通，在理解的基础上利用必要的基础知识，基本技能进行综合分析，主要考查学生的理解能力、综合运用能力等。 二、具体分析 选择题部分学生答得较好，一部分学生读题不仔细，如2题、第10题，导致失分较多，反映出对基本概念的理解不够。整个非选择题部分反映出学生对基础知识点的掌握不够扎实，同时还有一个严重的问题错别字很多，特别是水分的分字和鳃，很多同学都失分了。另外31（5）题反映出学生对知识只知其然，不知其所以然，没有深刻理解知识，不能灵活运用，对教材知识不能分析延伸。 三、对今后复习的建议 （一）关注全体学生，注意调动学生学习积极性 教师要关注全体、尊重每一名学生，相信学生的能力，对学生抱有良好的期望。教学上应多激励，少指责，更不能贬低学生的学习能力，学生回答问题时，教师应认真倾听，并耐心引导学生思考。教师要根据学生思想变化的具体情况，选择最恰当的时机，结合具体的学习内容激励学生，使他们自觉自愿努力学好生物学。 (二)注重学法指导，强化训练教学规范性 在教学中教师不仅要注重教法得当，更要注重对学生学法的研究。教师要利用教材中设置的讨论指导学生读书思考，挖掘教材中隐藏的信息，指导学生会预习教材，会列举内容提要，启发学生的思维。在训练教学中，必须加强规范化训练，注意多给学生留有消化的余地，做到稳扎稳打，狠抓知识和能力双落实；注重强化训练；加强语言表达能力的训练；创设情境，让学生有机会充分暴露错误和薄弱环节，使学生在知错、纠错过程中达到规范训练的目的。 （三）重视基础知识，提高做题准确性 刚接触生物很多同学图新鲜感，能好感兴趣的学好老师所教授的内容，很多东西都知道，但是一到答题时马上就错误百出，要么是字写错，要没是没达到点
常用数据库 在DNA序列方面有GenBank、EMBL和等 在蛋白质一级结构方面有SWISS-PROT、PIR和MIPS等 在蛋白质和其它生物大分子的结构方面有PDB等 在蛋白质结构分类方面有SCOP和CATH等 生物信息学的主要研究内容 1、序列比对（Alignment） 基本问题是比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性。序列比对是生物信息学的基础，非常重要。两个序列的比对有较成熟的动态规划算法，以及在此基础上编写的比对软件包BLAST和FASTA，可以免费下载使用。这些软件在数据库查询和搜索中有重要的应用。 2、结构比对 基本问题是比较两个或两个以上蛋白质分子空间结构的相似性或不相似性。已有一些算法。 3、蛋白质结构预测，包括2级和3级结构预测，是最重要的课题之一 从方法上来看有演绎法和归纳法两种途径。前者主要是从一些基本原理或假设出发来预测和研究蛋白质的结构和折叠过程。分子力学和分子动力学属这一范畴。后者主要是从观察和总结已知结构的蛋白质结构规律出发来预测未知蛋白质的结构。同源模建（Homology）和指认（Threading）方法属于这一范畴。虽然经过30余年的努力，蛋白结构预测研究现状远远不能满足实际需要。 4、计算机辅助基因识别(仅指蛋白质编码基因)。最重要的课题之一 基本问题是给定基因组序列后，正确识别基因的范围和在基因组序列中的精确位置.这是最重要的课题之一，而且越来越重要。经过20余年的努力，提出了数十种算法，有十种左右重要的算法和相应软件上网提供免费服务。原核生物计算机辅助基因识别相对容易些，结果好一些。从具有较多内含子的真核生物基因组序列中正确识别出起始密码子、剪切位点和终止密码子，是个相当困难的问题，研究现状不能令人满意，仍有大量的工作要做。 5、非编码区分析和DNA语言研究，是最重要的课题之一 在人类基因组中，编码部分进展总序列的3~5%，其它通常称为“垃圾”DNA，其实一点也不是垃圾，只是我们暂时还不知道其重要的功能。分析非编码区DNA 序列需要大胆的想象和崭新的研究思路和方法。DNA序列作为一种遗传语言，不仅体现在编码序列之中，而且隐含在非编码序列之中。 6、分子进化和比较基因组学，是最重要的课题之一 早期的工作主要是利用不同物种中同一种基因序列的异同来研究生物的进化，构建进化树。既可以用DNA序列也可以用其编码的氨基酸序列来做，甚至于可通过相关蛋白质的结构比对来研究分子进化。以上研究已经积累了大量的工作。近年来由于较多模式生物基因组测序任务的完成，为从整个基因组的角度来研究分子进化提供了条件。 7、序列重叠群（Contigs）装配 一般来说，根据现行的测序技术，每次反应只能测出500或更多一些碱基对的序列，这就有一个把大量的较短的序列全体构成了重叠群（Contigs）。逐步把它们拼接起来形成序列更长的重叠群，直至得到完整序列的过程称为重叠群装配。拼接EST数据以发现全长新基因也有类似的问题。已经证明，这是一个NP-完备
七年级2018-2019生物期末考试质量分析 期末考试已结束，回顾这次考试，总体感觉不够理想。本学期我教的七年级11，12，13，14四个班，4个班是普通班。这次期中考试的基本情况如下下面就这一次考试对教与学作一下总结与反思。 一、试题总体分析 1.七年级生物上的内容是初中阶段相对来说较简单的内容，本次七年级生物的期中考试的内容是第五单元第一至三章内容，主要涉及动物的类群，考点内容相对来说较简单。 2.本次期中考试选择题较容易，50分的选择题很多学生可以得到40分以上。非选择题的难度则有所提高，如第27题考到了细胞的结构示意图，涡虫的结构往年考得不多，没有给学生复习造成和一部分学生失分。第31题和32题都考到了实验探究难度较大。 3.本次考试的题目在考前复习的单元测试题中有一些类似题型，如选择题3、5、25；非选择题28题第（1）小题和29题第（5）小题。大多数学生都能够把握完成的良好。但是仍然有一小部分学生没有认真听讲，没有把握住已经复习过的类似体型。 二、学生答题情况分析 1.学生读题粗心，做题马虎。本次试题在较难的题目上都给了信息提示，但很多学生只顾做题，没有认真的读完题目，导致忽略了很多提示信息。如27题；28题的第（2）小题。 2.学生提取题目信息，了解题目要求的能力不足。如31题第（4）小题答非所问，也无法理解题中所给材料和所要求探究间的关系，把帮助理解的材料中写到了探究的提出问题中。 3.学生答题的错别字多，答题用词不规范。本次期中考试试卷上已有有些学生常写错的字，如：囊。但还是有学生写错。 4.部分学生看图能力弱，没有掌握关节中的相关内容，导致第29题不会做。 5.学生的实验思维能力弱，没有形式实验思维，无法理解生物对照实验的关键。不懂答31题的第三小题，答出了也没有进行对照试验。
四坝镇九年制学校2011－2012学年第一学期期末检测 七年级生物学科质量分析报告 一、学科成绩统计 （一）成绩统计表（保留一位小数） （二）分数段统计表（单位：人） 三、对本次质量检测成绩的分析说明 （一）选择题： 大多数在25-30分之间。其中2、3、6、9、12、15错误的较多。说明了在这部分的基础上，同学们掌握较差.对一些灵活的题型的训练还不够。
（二）判断题 2、5题丢分比较多。主要原因是审题较差，知识点没有掌握清楚，今后应加强这方面训练。 （三）简答题 失分较严重，一是审题能力差；二是识图能力欠缺；三是基本的基本的生物概念理解不到位；在今后教学中一定要加强这几方面的训练。 四、存在的问题分析 （一）低分过多，相当一部分学生对生物学科失去兴趣和信心，部分学生已不仅仅是生物知识没有掌握，而是基本丧失了学生物的兴趣，从他们的答卷就可看出这一点。因为很多同学，除了选择题和少量简答题外，其它题目他们是不会动笔的，选择题又含有许多猜测的成分，那么，这样少得可怜的考分中有多少是他们掌握的东西就可以想象了。 （二）基本的生物概念理解不到位。 基本的概念理解不透彻往往表现在无法准确识别、判断那些似是而非的问题。 （三）学生的分析理解能力水平较低。 “三维一体”的新课程目标在冲击着我们脑海中传统的教学观念，但传统的东西根深蒂固，在教学实践中我们的生物教学总是不经意地固守着那个“旧阵地”，重知识轻能力，重结论轻过程，重理论轻实践，重教师的教学生的学，结果仅仅是把学生培
养成了一个个知识的容器，无法将自己学过的知识转化成解决生物问题的能力。 五、改进措施及办法 （一）初中生物教学应关注每一个学生的发展，注重培养学生学习生物的兴趣。 初中是学生学习生物的启蒙阶段，从某种意义上讲，培养学生对生物的兴趣比传授给学生生物知识更重要。部分学生对生物学科已没有了兴趣。如果我们的教师不能正确对待这种现象，不讲究教学方法，一味地埋怨学生、责备学生，最后放弃这部分学生，必然会导致这些学生厌恶生物教师、厌学生物这门功课。 （二）重视基本知识的教学。 新的课程改革提出了“改变课程过于注重知识传授的倾向”、“从单纯注重传授知识转变为引导学生学会学习”的要求，这并不是说基本知识的学习已变得无足轻重，而是要让学生经历观察生物现象，产生生物知识的过程，通过生物基础知识的学习养成良好的思维习惯，把知识的学习作为培养能力的途径和载体。因此，对生物基本知识的教学不是削弱而是加强了，要求更高、更科学了。 （三）重视实验教学。 实验在生物学科中的地位与作用任何一个生物教育工作者都十分清楚，不必在此赘述。但是，无论是此次考试，还是以前通过其他的老师的了解，都显示出实验教学是我校生物教学的薄弱环节。在生物教师中不能准确理解生物实验教学的目的；片面强
4、生物信息学分析 通过核苷酸序列数据库和基因序列同源性在线分析途径初步对Rv2029c基因进行分类整理。由于结核分枝杆菌耐利福平野生株与核苷酸序列数据库KEGG GENES中的结核分枝杆菌标准株H37Rv的匹配率为100%，以下对基因的分析按照结核分枝杆菌标准株H37Rv的数据库信息进行，即完全匹配的1020bp长度序列（本次提取基因中包含上下游引物等序列，较长，1346bp）。 4.1基本信息 表1 基因基本信息 4.2基因组信息 表2 基因组信息
5、PLN02341（PfkB型碳水化合物激酶家族蛋白），位点208-294 6、PTZ0029（核糖激酶），位点205-301 药物靶点1、同源基因没有药物靶点 2、非同源但序列相似基因没有药物靶点 图3 蛋白结构域 4.3蛋白表达 4.3.1 二级结构分析 预测结果显示，PfkB蛋白的二级结构中β转角占46.61%，α螺旋占33.63%，β折叠占19.76%。转角结构和螺旋结构构成了结核分枝杆菌PfkB蛋白二级结构的骨架。
图4 蛋白二级结构 4.3.2 跨膜区分析 Tuberculist跨膜蛋白预测结果表明：蛋白长度339aa，预测跨膜蛋白数0。 图5 蛋白跨膜区分析 4.3.3 信号肽预测 Predict Protein分析表明PfkB蛋白氨基酸残基没有信号肽，由此推断此蛋白不包含信号肽，不是分泌型蛋白质。
图6 蛋白信号肽预测 4.3.4 疏水性分析 分析结果显示，蛋白最大疏水指数为2.411，最小疏水指数为-2.372。
图7 蛋白疏水性分析 4.3.5 DNA同源性分析 表3 基因同源性分析 菌株序列覆盖 率 E值一致性 Mycobacterium tuberculosis strain Beijing-like, complete genome 100% 0.0 100% Mycobacterium bovis subsp. bovis AF2122/97 complete genome 100% 0.0 100% Mycobacterium tuberculosis 18b genome 100% 0.0 100% Mycobacterium tuberculosis H37RvSiena, complete genome 100% 0.0 100% Mycobacterium tuberculosis str. Kurono DNA, complete genome 100% 0.0 100% Mycobacterium tuberculosis 49-02 complete 100% 0.0 100%
七年级初一生物考试试卷分析 本次初一生物期中质量检测主要考察学生基础知识和基本技能。考试试卷习题目比较灵敏，突出考察了学生在详细的环境中，进行思维的能力，内容丰富，难易适中（知识与技能并重，较好地体现了新课程倡导的评价体系）。与生活联络：大多数习题与生活严密相连，试习题共四个大习题，现将试习题、考试试卷详细情况分析如下： 一、试习题、考试试卷分析 第一大习题：选择习题，20小习题，共20分。习题型合理，既考察基础知识的掌握情况，又考察学生应用知识的能力。从答习题情况来看，出错率较高的是第⑺11,13小习题，尤其是第13小习题出错率最高。学生获得的最高分是17分最低分是6分。初一的学生大部分还没有摆脱中小学学习知识死记硬背的模式，不会自己去学习、分析问习题，详细表现在：对知识的掌握不结实；对较活的习题应变能力较差；不会将学到的知识应用到实际；不会对问习题进行分析。 第二大习题：非选择习题，5个小习题，共30分。习题量、难易度适宜，涉及面广。既有基础试习题，又有灵敏性强的试习题。（1）小习题知识的掌握较差。（主要是字写错）（5）习题错的较多，综合性强，学生有的理解不透（13）习题学生因没有记住而导致出错。实验习题难度不大，85%的学生都掌握的不错、从整体来看，学生对试习题中的知识掌握比较好，但同时试习题也有一定的不足，如习题量比较小，灵敏性不强，希望以后注意。
二、教学反思 从学生考试试卷可看出，重点初中生物教学还存在许多问习题值得研究与反思 ⑴加强教研。不要继续深入钻研课标，断提高教育教学水平。 ⑵狠抓基础。把书本知识与日常的生产、生活严密联络，教师认为学生会的学生不一定会，要用生活中鲜活的事例使书本知识常识化，寓教于乐。 ⑶了解学生。关心他们的学习、生活，了解他们的学习需求，方可按需而教，提高课堂教学效率。 三教学措施： 今后努力做到： ⑴一定让学生结实掌握基础知识。 ⑵教师一定加强训练，进而提高学生的运用知识能力。 ⑶抓重点知识、难点知识。一定要讲清，落实到位。 4﹑强化书写要求。对于关键字词不仅要求记会，记准，更要会写，写对。 七年级初一生物考试试卷分析（二） 期末考试已经落下帷幕，为了更好地总结归纳工作中的经验教训，特对本次的生物考试试卷进行全面的分析，以期在今后的工作中获得更好地成绩！ 本次考试试卷共分五个大习题，满分一百分。 一、考试试卷总体印象
2012-----------2013学年八年级生物教学质量分析报告 ---------------张秀兰本学期我担任的是八年级三个班的生物教学工作；从学生期末考试的总体情况看大部分学生的成绩比平时的都有所提高，都发挥到平时的水平；现结合具体情况对八年级三个班生物考试情况做如下评析。一、试卷特点 试卷在平时基础上做了较大的调整，难度有所下降。对学生的考察更细更彻底总的情况是：注重对基础知识的考查，体现“能力立意”的命题指导思想、加强生物与生活实际的联系，加大了考查生物实验教学的力度。本试卷从总的来看，难度适中。考查的内容没有脱离书本，贴近生活实际，而且遵循了现在的课程标准。另外，这套试卷在考查学生的生物知识的同时，还在识图和综合分析能力上给予了考查，这也是近来考试发展的一个方向，比如最后一题，是日常生活中所运用的常识及探究实验；比较贴近生活。它考查了同学们要善于在复杂的文章中抓住有用的信息给予归纳，在基础上也考得比较得体，难易也有序。 二、学生答题的情况 三、教学当中我们存在的问题。
1、低分过多，相当一部分学生对生物学科失去兴趣和信心部分学生已不仅仅是生物知识没有掌握，而是基本丧失了学生物的兴趣，从他们的答卷就可看出这一点。因为很多同学，除了选择题和少量填空题外，其它题目他们是不会动笔的，而填空题则多为乱填一气，选择题又含有许多猜测的成分那么这样少得可怜的考分中有多少是他们掌握的东西就可以想象了。 2，学生的基础知识不扎实。“三维一体”的新课程目标在冲击着我们脑海中传统的教学观念，但传统的东西根深蒂固，在教学实践中我们的生物教学总是不经意地固守着那个“旧阵地”，重知识轻能力，重结论轻过程，重理论轻实践，重教师的教学生的学，结果仅仅是把学生培养成了一个个知识的容器，无法将自己学过的知识转化成解决生物问题的能力。学生的理解能力不够，读不懂题目的含义，使得有些题目不知道该如何作答。 四、今后教学的建议 1、注重培养学生学习生物的兴趣。初中是学生学习生物的启蒙阶段从某种意义上讲，培养学生对生物的兴趣比传授给学生生物知识更重要。在现实的教学中经常听到教师埋怨学生“差”、“蠢”、“懒”，老师讲的记不住，要求的做不来，布置的学习任务不完成，有的甚至干脆不做。归结为一个原因就是这些学生对生物学科已没有了兴趣。如果我们的教师不能正确对待这种现象，不讲究教学方法，一味地埋怨学生、责备学生，最后放弃这部分学生，必然会导致这些学生厌恶生物教师、厌学生物这门功课。
xx县第x中学20xx-2xx学年第二学期生物考试质量分析 一、试卷结构及特点： 本次七年级考试题，是以义务教育《生物课程标准》和七年级生物（下）的有关教学内容为依据，力图体现课程标准所倡导的“面向全体学生”、“提高生物科学素养”、“探究性学习”“课堂三为主”的教学理念，同时考虑到学生的年龄特点及初中生物教学的实际，命题以检测学生了解或掌握的基础知识和应具备的基本能力为主，兼顾对学生的情感态度和价值观的发展状况的评价，主要考查学生基础知识和基本技能。题型新颖，部分题目比较灵活，突出考查了学生在具体的题意环境中进行思维的能力，内容相对比较丰富，难度适中。 本次考试命题实行百分制，考时60分钟。试卷结构与特点：设有（ａ）、选择题---30个小题，每小题2分，计60分，比较全面地考查了学生对教材的一些重点内容的了解或掌握情况，涉及识记、理解和应用三个层次和知识与能力、过程与方法、情感态度与价值观三维目标。（ｂ）、填空题---共4小题，每空1分，计25分，考查的内容也较广，重点是考查学生对一些生物学基础知识和基本规律的识记和理解，例如识图-共2小题，计11分，对学生能力的考察就基础性比较强。其中第43、44小题属于分析理解题，以考查学生的知识应用能力，是要求较高的题,试题的设置注重考察学生对知识的理解和应用而不是死记硬背。 二、学生成绩状况：
三、学生答卷分析： 从成绩统计中可以看出，本次考试的成绩不太理想，优秀率较低，班级间成绩不平衡，有一定差异。从统计数据来看，学生个体差异很大，学生两极分化较严重。这也证明学生不能够很好的对生物课产生兴趣。绝大部分知识和技能在课堂上或实验室都强调过、训练过，但大部分学生不能把大部分分数拿下，学生完成情况不好。 第一大题：单项选择（共30题 60分）。考察的是学生对基础知识的掌握情况，本题题型较活，注重基础，学生获得的最高分是58 分最低分是8分。七年级的学生大部分还不能摆脱小学生学习知识死记硬背的方法和模式，不会自主去学习、思考、分析问题。大体问题如下：1、大部分学生对知识的掌握虽然牢固，学生对灵活的题应变能力不好，不能将学到的知识应用到实际中去从而对问题进行分析。2、不能够很好的应用平时训练的各种解题方法来解答一些新情景、开放性的题目。 失分率较高的题目：11、13、14、15、24、25、28主要集中在呼吸系统和神经系统的有关题型。 第二大题：判断题，学生总体做的较好。但许多同学对血液循环
七年级生物上册期中测试质量分析七年级生物上册期中测试质量分析 一．试卷特点： 七年级试卷的结构由选择题、解答题两大题型构成。试题遵循此次命题的原则，本次试题有如下特点: 1、题量适度，覆盖面大，重点突出 七年级的选择题、解答题比较全面的考查学生对整本教材的一些重点内容的了解或掌握情况，涉及识记、理解和应用三个层次的知识、能力、情感态度与价值观三维目标；有的侧重考查学生对有关 知识的理解；有的考查内容也较广，重点是考查学生对一些生物学 基础知识和基本规律的识记和理解；比如看图分析填空，既考查了 学生的识图能力，又考查了学生对知识之间的内在联系。试题的设 置注重考察学生对知识的理解和应用而不是死记硬背。 2、立足教材，考查主干知识，试题基本上源于课本 考虑生物学课本内容有些复杂，知识点多，特别是七年级学生学起来困难较大，有的知识不好接受；同时也考虑当前的教学实际情 况（学生在思想上不是很重视这一学科），所以试题尽量降低了难度，考查的所有的基础知识点基本都可以在课本中找到明确的答案，没有一道偏、难、怪题。比如七年级的试图分析题七道题都是课本 原文重点内容内容，这样的内容在各小体中还有很多。这样命题的 意图意识为了降低试题的难度，同时也是为了使命题起到导向作用，引导教师课堂授课时抓住课本的基础知识，真正把知识落到实处， 在此基础上去训练学生的能力，通过考试也可以增强学生学习本学 科的信心。 3、联系实际，注重知识运用，激发学生兴趣
起来进行教学，把枯燥的知识变得生动鲜活起来，以达到激发学生学习生物学知识的兴趣，提高课堂教学效率，进而提高教学质量 的目的。选择题里还有许多题属于联系生活的应用题型。 三、试卷内容分析： 第一大部分：单项选择（共25题50分）。 本题考察的是基础知识，内容丰富，难易适中。重在考察学生的分析问题解决问题的能力。因此对我们农村的普通学生来说有一定 难度，但是整体不会很难，在课堂上该强调的都有强调。而且在复 习的时候抓的比较到位，因此失分率不是很高。除了个别学生不去 认真消化，导致不能灵活应用。 失分率较高的题目：26（把鲸和鱼没有正真的区分开来），28（把生理盐水和稀碘液的作用没有区分开），34（把草履虫的结构 及其作用没有正真的掌握）四、今后生物教学的建议： 根据对这次考试结果的分析及本校七年级生物教学的现状，提出下列几点建议。1、要准确把握主干知识，对教材的知识点通过不同 的方式，加强基础知识训练，加强学习实效，以干带支，融会贯通。 2、课堂传授知识、落实知识时，尽量多联系贴近学生生活实际 的实例，潜移默化的训练学生运用知识的能力。 3、课堂加强学生语言表达能力的训练，教师引导多让学生表达。有的问题，简单的问题，学生可能都明白，都会。要真正落到实处，让他们真正说出来或写出来，慢慢的养成表达的习惯。 4、针对当前的状况，学生不重视生物学科，多与学生沟通，运 用灵活多样的教学方法，使其逐渐产生兴趣。包括对学科的兴趣也 包括老师的教学魅力。最后达到学生能正确认真对待生物学科的目的。 5、重视平时的练习和测试 没有练习，学生的技能和知识的掌握就成了一句空话，没有练习，就无法让学生产生一种学习上的刻痕，学生就容易遗忘。因此，平