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pubmed攻略

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1. PubMed概况

从字面上看,PubMed(PubMed=Public+Medicine)这一名称,源自“Public”和“Medline”两个英语单词,顾名思义,意味着面向公众的、免费的医药信息检索服务。Pubmed是美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)所属的国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)建立的生物医学文献检索系统,使用NCBI 的Entrez检索平台。是检索全世界生物医学期刊论文的重要工具。基于互联网,提供免费检索服务,部分文献(约5%)可免费下载全文。美国国家健康研究所(院)(National Institutes of Health,NIH)、美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)、美国的国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, 简称NCBI) 是美国国家健康研究院(NIH)所辖美国国家医学图书馆(NLM)的一部分,NIH--->NLM—>NCBI

2. 网址(见图1)

PubMed是美国国立医学图书馆下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。你打开浏览器,在地址栏内键入所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。

无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:https://www.doczj.com/doc/552804759.html,/,https://www.doczj.com/doc/552804759.html,/, https://www.doczj.com/doc/552804759.html,/, https://www.doczj.com/doc/552804759.html,/, 就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。

在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。

在检索框中输入查询词,然后单击"go"按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。

3. 收录范围(见图2)

PubMed 是美国国立医学图书馆最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。PubMed覆盖了全世界80多个国家和地区的5000余种8主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到1950s,现有书目文摘条目2100万条,PubMed 网上更新速度是每周一次。

PubMed数据库收录的文献大多数(75%~85%)原始语种是英语,或有英文摘要(70%~80%),但1975年以前的文献无英文摘要。5%文献有免费全文,大部分文献有全文链接。国际上公认的最具权威免费的生物医学文献检索系统。

4. PubMed数据库可使用的运算符号

4.1 截词符*

允许使用“*”号作为截词符进行截词检索。如:键入“physi*”,系统会找到那些前一部分是physi的单词(如phsics,physical,physiology等),并对其分别进行检索。如果派生的词超过600个,PubMed会提出敬告如下:Wildcard search for '*' used only the first 600 variations.Lengthen the root word to search for all endings. 那么就要延加长检索词根,所以要进行后截断时,一定要注意词根的位置,不要截得太短。

截词功能只限于单词,对词组无效。

使用截词检索功能时,PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。

4.2 强制检索符“”

4.3 布尔逻辑运算符

PuMed检索系统允许使用布尔逻辑检索,但要在提问框中键入布尔逻辑运算符(AND,OR或NOT)。如:#1 AND #2。而且运算符号AND 、OR、NOT 。

4.4 检索字段标识符:[tag] ,tag为字段名称。

[ti]标题,[au]作者,[ta]期刊,[la],[pt]综述文章。

5. 基本检索、限定检索、高级检索功能(图3)

5.1如何进行基本检索?(图4)

登录PubMed主页,直接在检索提问输入框中输入检索词。在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。在检索框中输入检索词,然后单击“Search”按钮或敲回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。

5.2如何进行条件限定检索(limits)(图5)

登录PubMed主页,点击“Limits”链接,切换到条件限定检索得页面,进行检索。其中,“Entrez Date”指录入系统的日期;“Publication Date ”指出版日期;还有三个选项要注意“Links to full text(链接到全文), Links to free full text(连接到免费的全文), Abstracts(连接到文摘)”,但是1975年前出版的文章的记录中没

有文摘。右下端还可以在下拉菜单中选择字段,进行限定检索。

5.3高级检索功能(图6)

所要检索的问题相对较为复杂的时候,仅仅靠初级检索就远远达不到需求了。为了使得我们的检索更为准确、高效,我们可以充分利用PubMed所提供的高级检索功能。在你进入PubMed首页之后,在检索框的上方,有PubMed所提供的Advanced Search功能按钮。如果你能够充分的利用好这个功能按钮,那你的检索则很有可能事半功倍。

登录PubMed主页,点击“Advanced search”链接,切换到高级检索页面,有上下两个检索提问输入框,下面的输入框是“编辑框”,上面的输入框是“检索框”。

6. 如何进行主题词检索?(图7-10)

登录PubMed主页,点击“MeSH Database ”链接,切换到主题词检索页面。主题词是经过规范化处理的词汇,是受控词汇。

7. 词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping )(图11)

在PubMed 主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。

7.1 MeSH转换表(MeSH Translation Table)

MeSH 转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和全字段词进行检索。例如:键入“Pancreatic cancer”,系统将其转换成:

“"pancreatic neoplasms" [MeSH Terms] OR ("pancreatic"[All Fields] AND "neoplasms" [All Fields]) OR "pancreatic neoplasms"[All Fields] OR ("pancreatic" [All Fields] AND "cancer"[All Fields]) OR "pancreatic cancer" [All Fields]”后进行检索。

7.2 刊名转换表(Journal Translation Table)

包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如:在检索提问框中键入:“New England journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med" [Journal]后进行检索。

7.3 短语表

7.4 作者索引

8. 如何查看检索History(历史)(图12)

PubMed主页不显示检索历史,点击“Advanced search”链接,切换到高级检索页面,查看检索历史,再进行布尔逻辑运算。

检索历史显示格式:检索序号、检索式、检索时间和检索记录数。要查看检索到的记录,直接点击检索结果数(Result)按钮即可。在【History】状态下,可以将检索式用逻辑运算符连接起来后再检索。如在提问框中键入#1 AND #2,

然后点击【GO】。要清除检索史,请点击Clear History键。

注意事项:PuMed最多可保留100个检索式,超过100个时自动删除最早的检索式;进行布尔逻辑运算“AND”、“OR”、“NOT”运算。History有效保存时间是8小时。

9.Clinical Queries(临床查询)(图13-14)

临床咨询(Clinical queries)是pubMed设立的一个专供临床医生查找与临床有关的数据库系统。PubMed采用过滤器(filters)技术,当输入一个检索提问词时,系统只检索与有关该提问词的治疗(Therapy)、诊断(Diagnosis)、病因(etiology)、预后(Prognosis)和clinical prediction guides(临床预测指南)等5个方面与临床密切相关的文献,用户只能在这五方面进行选择检索。此外,还设有“Emphasis”的两个选项:“broad, sensitive search ”(灵敏度)和“narrow, specific search”(专指度)。选择“Sensitivity”项,系统会强调“查全”,检出的文献会多些;选择“Specificity”,系统会强调“查准”,检出的文献会少一些,但与检索提问词的相关性要大一些(精确些)。

10. 如何输出检索结果?(图15)

10.1 显示检索结果

显示检索结果(Displaying)其默认Summary格式。命中记录按该记录被输入pubMed 时间排序输出,最新的排在最前面。每页显示记录数默认值为20,“Show”功能键所带的下拉菜单可以更改每页显示记录数,可选项从5条到500条不等。

10.2 保存检索结果

保存检索结果(Saving)PuMed系统允许最多可保存5000条记录。存盘时PubMed 默认文件名为“query . fcgi”。该文件名可以修改,文件格式也可在“. Fcgi”和“.txt”中选择。选择.txt格式,便于用文字处理软件和文本编辑器打开所存文件。如果想存为超文本格式,则需要使用Web浏览器的“另存为...”功能,并选择“.html”格式后再存盘。

10.3 打印检索结果(printing)

10.4 订阅文献全文(Ordering)

点击【Order】按钮,即可订阅全部检索记录的文献全文;要订阅部分记录的文献全文时,对选定的记录予以标记后,再点击【Order】按钮。如果检索过程中已进行过多次检索,可将每次检索结果添加到粘贴板后,再从粘贴板中集中订取文献全文。该项服务为收费项目。

10.5 发送到Clipboard(粘贴板)

在检索过程中将选中的检索结果暂时保存在Clipboard,以便于集中处理(存盘、

打印、发送到E-Mail、订购原文)结果。粘贴板最多能存放500条记录,有效保存时间为8个小时。

新版Pubmed检索攻略

新版Pubmed检索攻略 ——日读一帖,解螺旋大V团队伴你科研路 【科研热点】让你时间比别人花的少、知道的比他早!【基金专栏】国自然等各项基金独到经验见解【SCI 专栏】从开始到接收全程tips【实验技能】这么棒快告诉你老板!关注我们,为您的科研路提速 第一章PubMed概述 笔者最近接到很多同学的微信,说希望看到pubmed的搜索教程,然后就在网上进行了检索,发现网上的教程都是老版的pubmed,比如还有limit按钮等等,其实pubmed改版之后已经变得更加简洁,就行百度搜索框一样,只有一个框和go。而以前的5个功能按钮早早已经删除,在你搜索结果中才可以显示,在我们搜索的左侧。那么下面我们就开始学习学习pubmed的搜索技巧吧! 我看到很多人用了几年的PubMed,还是只知道在检索框里输入一个关键字,然后按一下'Go'按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况,这样的操作就足以得到令人满意的信息,但对于另一半情况,就没有那么幸运了,要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的'无用'信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。 令人费解的是,很多医务工作者宁可在每次检索时都花

上成倍的时间,却不愿花上几个小时的时间去认真研究PubMed。'君欲善其事,必先利其器',PubMed就好像一 把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到及至。 在以后的章节中,我们将逐步深入地了解PubMed,相信通过这些章节的学习,我们可以真正熟练掌握PubMed,从而使自己的工作事半功倍。 第二章PUBMED简单检索技巧 一.在这一章里,我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献,作以简单介绍。 1.直接检索。当你打开浏览器,在地址栏内键入 https://www.doczj.com/doc/552804759.html,/PubMed/ 或是百度pubmed,就进入了PUBMED检索系统主页。在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。这就是改版之后的pubmed,是不是非常简洁?在检索框中输入查询词,然后单击'go'按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面,你还可以选定所要检索内容的数据库范围,除NCBI的数据库以外,可供选择的还有:PROTEIN、STRUCTURE、POPSET等等。 说到这里,很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符

NCBI之PubMed完全攻略

PubMed完全攻略 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:https://www.doczj.com/doc/552804759.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed 的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。 进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。

papers 使用教程

Papers 帮助

从事科研工作的人,很多时间是花在看文献上。文献有不同的来源、不同的主题、对自己科研工作的贡献也不一样。我们经常遇到的问题是,似乎记得曾经下载了某一篇文献,等到要用的时候怎么也想不起放到哪了 在Mac电脑上有一个极富特点的文献管理软件Papers,把文献有关的各项活动流畅的组织在一起。 主要功能包括包文献导入、组织、阅读(注释)、自动匹配参考条目、搜索、在文档中插入引用、评点交流等。 今天抽点时间介绍一下如何导入文献,并进行参考条目匹配。 Papers2支持多种文件格式,如pdf,word、txt等,导入的方式是一样的。 以最常见的pdf文件为例,假设你已经下载了一篇论文或多篇论文,有了相应的pdf文件。 最简单的方式是把文件向papers图标上拖放即可。 或者打开Papers ,选择菜单项File--Import--Pdf Files, 注意你可以一次导入一篇,也可以选取所在目录下的所有文献。

完成后就可以看到该文献已经加入到papers 文献库中。 该文献的条目一般是根据文件名创建的,我们更希望得到是如论文题目、刊物名称、年、卷、期等这些的引文信息。这些在过去经常需要自己敲进去,或者从数据库下载参考信息再导进来。 Papers强大之处在于,它可以自动查找相关的引用信息。当然前提是联网

这一功能称为“match”.如何 Match? 在刚导入的文献上条目上点右键,出现右键菜单,其中一项是“Match to repository”,就是它了 然后进入match界面,Papers可以从许多数据库查找引文信息,例如Google scholar, google books, pubmed,airXiv等。搜索依据可以是 Doi,标题、作者,...

pubmed教程

PubMed 检索系统 PubMed 检索系统 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆 (U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据,这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明,并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送,但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围,将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代,例如在综合性的科学杂志(Science或Nature)上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 PubMed 检索 Details 键的用法 存储检索策略--URL 键的用法 特征栏(Feature Bar)介绍 检索结果的显示、存盘、打印 PubMed 详解 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping)在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。 (1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘词)进行检索。例如:键入“Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 (2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal

PubMed检索步骤

PubMed检索步骤 1、PUBMED 词汇自动转换功能:例如:在键入“Vitamin c",点击"Go",再点击"Details"显示("ascorbic acid"[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word]),看一下主题词是什么?所用词汇是否合适?然后点击“Preview/Index”显示你所用的检索词、检中的篇数、所用时间。也可点击“limit"进行检索。检索时可以使用通配符"*"进行截词检索或用双引号进行强制检索词检索。 2、著者强制检索:作者用双引号括起来"zhang y" [au];比较一下分别输入zhang yun ;yun zhang,zhang y; zhang y [au];"zhang y" [au] 检索结果的区别。 3、刊名检索:可用刊名全称或缩写、ISSN号,再加上刊名子段限定符,如:输入J Tradit Chin Med [ta] ,然后敲回车或点击Go,系统将在刊名子段中检索,并显示检索结果。点击“History”可以查看检索历史。 4、布尔逻辑检索:系统允许使用布尔逻辑检索,布尔逻辑运算符要大写(AND、OR或NOT)。 5、剪贴板:使用"send to Clipboard",可把检索结果存入剪贴板,剪贴板最多可存放500条记录。只要剪贴板中有记录,就可点击Clipboard查看其中的记录(记录为summary格式),粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录题录。 6、当前页显示篇数默认为20篇,如果需要可调整当前页的篇数“5、10、20、50、100、200、500”篇。检索结果默认summary格式(题录格式),可以选择display下拉菜单中的Abstract(文摘),以文摘格式显示。 (一)基本检索 1. 检索2000年以来收录我院孙保亮老师作为第一作者的论文数量 2.检索PubMed收录山东大学姓王的作者所有的文献 3. 字段限制检索:检索作者Jone W Smith发表的论文标题中含癌症治疗方面的文献。 提示:smith jw[AU] AND (cancer[TI] OR tumor[TI] OR neoplasms[TI] ) AND (treatment[TI] OR therapy[TI]) 4. 利用PubMed检索检索作者 Bishop B近5年来发表在J Biol Chem 期刊上的文献。请写出检索步骤。 5. 检索期刊N Engl J Med的全称,并通过济南泉方网站或Medsci网站查到2012年SCI的影响因子。 6.自己的名字在英文杂志上的书写格式? 7. 利用PubMed检索J Allergy Clin Immunol期刊近五年来非综述性文献。 8. 检索PubMed收录《中华内科杂志》(zhonghua nei ke za zhi)的论文有多少篇? 9.请利用PubMed检索2008年11月以来发表在BMC Public Health上的文献中,由Free full article免费全文文献有几条?请写出以Ahonkhai VI为最后一名作者的文献篇名。 10. 德国科学家哈拉尔德?楚尔?豪森(Harald zur Hausen)因发现导致宫颈癌的HPV(人乳头状瘤病毒)而获得2008年诺贝尔生理学或医学奖。请利用PubMed 回答该作者2008年是否发表了有关HPV的文章?如有,请写出该文的出处。

PubMed使用指南

PubMed使用指南 PubMed简介 PubMed是美国国家医学图书馆(NLM) 所属的国家生物技术信息中心(NCBI) 开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。该系统通过网络途径免费提供包括MEDLINE在内的自1950年以来全世界70多个国家4300多种主要生物医学文献的书目索引和摘要,并提供部分免费和付费全文链接服务。 PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。 PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。 PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE 是一个拥有1亿字条以上的巨大数据库。 PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。 PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。PubMed使用指南 1,PubMed使用指南之:如何获取PubMed全文? 当很多人开始了解PubMed,并且逐渐得心应手的时候,都会面临一个棘手的问题,即如何获取全文?的确,PubMed真正向公众(public)免费开放的只是摘要部分,而绝大部分文章都没有全文提供。其实,只要我们掌握一些技巧,还是有可能获得一些文章的全文的。 一、PubMed PubMed上约有5%的文献是可以免费看到全文的,通常这些文献的左上角会有一个Free Full Text的小标记()。你只要点击这个图标,系统就自动链接入该文献的全文。但有两点值得注意的是,第一,很多时候,这个图标在PubMed处于显示简要(summary)状态下并不出现,而只有在选择显示摘要(abstract)时才出现。因此,如果你不只是泛泛浏览,而希望看到全文的话,我强烈建议你在display下拉菜单中选择摘要(abstract)状态。第二,有些时候,小图标上仅标着Full Text,而并没有Free字样,但仍然可以链接入全文,你不妨试一试()。 二、免费提供全文的期刊 有些期刊就提供全文免费检索。比如著名的美国Science(科学)杂志。 方法如下: (1)先登录Science网址:https://www.doczj.com/doc/552804759.html, 。注意,不是https://www.doczj.com/doc/552804759.html,,否则你得不到全文。 (2)点击中间那个SEARCH按钮,就进入查询页了。你可以选择简单检索还是复杂检索。(3)输入您要找的关键词(不一定是MESH标准主题词),再点击search就可以了。(4)找出文章后,点击标题后的Full Text,就可以浏览原文了。 除了Science,其他一些期刊如美国科学院院报(PNAS),Genetics等都可以在网上获取全文,甚至能够下载文献的pdf格式,这样就和真正在期刊上的排版形式一模一样了。一般而言,那些相应期刊的网址是以org为域名的,往往提供免费的全文。例如上面提到的两家期刊的

Pubmed全攻略使用教程

PubMed检索系统简介 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据,这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明,并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送,但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围,将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代,例如在综合性的科学杂志(Science 或Nature)上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping) 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。 (1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord 词(题名词和文摘词)进行检索。例如:键入“Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 (2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN 号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如:在检索提问框中键入:“new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。 (3)短语表(Phrase list)。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS: Unified Medical Language System)和补充概念(物质)名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短词表。 (4)著者索引(Author Index)。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语,PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词,PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词,单个词会被联一起(用AND)在全部字段中检索。 如:"single cell",系统就会自动将其分成两个词:“single“和“cell”检索,其检索表达式为:“single AND cell”。要查验检索词的转换情况,可点击“Details”键。

PubMed检索完全攻略

PubMed检索完全攻略(1) 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入: https://www.doczj.com/doc/552804759.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI) 开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当

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