《中国生物医学文献数据库》的检索与利用
解放军医学图书馆杜永莉
一、数据库概况
CBM 数据库共收录了 1978 年以来国内出版的 160 多种中国生物医学期刊以及汇编、会议论文的文献题录。截至到 2009 年底已累积了 530 余万篇文献，年增长量约 40 万篇，数据库每月都要更新。 CBM 数据库还具有收录广泛、数据规范、具有多种词表辅助检索的特点。它的全部题录都是美国国立医学图书馆最新版的医学主题词表，也就是 mesh 词表。
2004 年 CBM 实现了与数据库全文的链接功能，在检索结果中，可以查找 1989 年以
来的所有全文。它的版本也不断更新， 1994 年 CBM 出版的 dos 版， 2000 年 CBM 改版为 CBMwin 版， 2004 年 CBM 出版了 CBM web 版， 2009 年又推出了 SinoMed ，中国生物医学文献辅助系统。
CBM 数据库对两个以上的检索词提供三种逻辑算符，分别为 AND 、 OR 、 NOT ，代
表逻辑与、逻辑或和逻辑非。 AND 表示检索记录中同时有检索词 A 和检索词 B ； OR 表示检索记录中含有检索词 A 或者检索词 B ； NOT 表示在检索词 A 的记录中去掉检索词
B 的记录。另外， CBM 数据库还提供了通配符，主要的通配符有两个：一个是“？”，代表一个单字；“ % ”代表任何字符，如：输入“血 ? 动力”，可检索出含有：血液
动力、血流动力字符的文献；输入“肝炎 % 疫苗”，可检索出：肝炎疫苗、肝炎病毒基因疫苗、肝炎减毒活疫苗、肝炎灭活疫苗等字符的文献。
二、主要检索途径
CBM 数据库的主要检索途径有：基本检索、主题检索、分类检索、期刊检索和作者检索。
（一）基本检索
默认状态是基本检索，基本检索主要包括题目、英文标题、摘要、作者、地址、关键词、主题词、特征词、基金、参考文献、刊名、出版年、分类号等，默认为缺省。例如检
索 SARS 病理学方面的文献，我们可以在检索框中输入 SARS 病理，或 SARS and 病理，
点击检索。注意，智能检索不识别逻辑与、逻辑或的检索，只对单个词组进行检索。所以
在这个情况下，不能选择智能检索。
（二）主题检索
主题检索也就是说采用规范化的主题词进行检索，主题词检索与关键词检索相比，能
够有效的提高查全率和查准率。
1. 实例分析：
例 1 ：要查找“先天性心脏病的手术治疗”，我们先用自由词（关键词）进行检索，再用主题词进行检索，然后将二者的检索结果进行对比，通过实例我们可以了解主题词和
自由词检索的作用与区别。
例 2 ：要查找“阿司匹林诱发哮喘”，我们先用主题词阿司匹林进行检索，再用主题词哮喘进行检索，然后将二者检索结果进行组配，通过实例我们可以了解主题词之间的组配检索，同时了解主题词和副主题词之间的组配检索。
例 3 ：查找主要研究“IL2”的文献，首先用主题词“ IL2 ”进行检索，然后在主题词状态下选用“加权”进行检索。其目的是了解主题词加权的概念和作用。
例 4 ：查找“急性心肌梗死的治疗”，首先用主题词“心肌梗塞”检索，再用自由词“急性”进行检索，然后将二者检索结果进行组配。其目的是了解主题词和自由词之间的组配检索。
2. 主题词检索特点
主题词是规范化检索语言，可检索出语言表达不同但概念相同的文献；主题词有扩展功能，能迅速检索出主题树型结构中所有下位主题的文献；单选某一主题词树型的下位主题词，可以使检索结果更加专指；主题词的加权功能，可检索出主要论述该主题的文献；主题词设有英文主题词对照，与 MeSH 词表一致，可进一步查询相关外文数据库；主题词和主题词进行组配，能表达较复杂概念，而且关系明确；主题词栏目中提供的相关参见，可扩大检索思路和范围；主题词中有概念定义及概念范围，可以避免检索时的概念混淆和误用。
3. 如何查找主题词呢？
我们可以在题名中检索含有该主题的文献，然后看它的标引词，再用规范性的主题词来进行查找。
4. 主题词和其他检索词的转换
（ 1 ）从轮排表中的款目词进行转换，包括同义词和准同义词之间的转换，如 mesh 词表中所有的癌都用肿瘤这个词；化学疗法见药物疗法； IL2 见白细胞介素 2 。
（ 2 ）主题词中有些词与我们在文献中常见的形式和习惯不同，如：维生素 C 正式的主题词是抗坏血酸；艾滋病正式的主题词是获得性免疫缺陷综合征；肺结核的正式主题词采用的是倒装形式“结核，肺”。
（ 3 ）没有完全对应的主题词或副主题时可以用其他相关词转换，如：血清、血浆和血液进行转换；肺炎的血清学检测可以采用肺炎（主题词） / 血液（副主题词）进行转换。
（ 4 ）一些病名及诊断技术简称，如：艾滋病、甲亢、乙肝、 B 超、 CT 等应转换为全称主题词。
（ 5 ）部位肿瘤用顺装，组织类型肿瘤一般为倒装，如：胃肿瘤、肺肿瘤、乳腺肿瘤一般都用顺装，而结缔组织肿瘤用“肿瘤，结缔组织”，神经组织肿瘤用“肿瘤，神经组织”。
（ 6 ）化学物质和药物名称的转换：化学物质和药品一般按药典名称，药物的商品名或俗称一般不做为主题词，如：寿比山用吲达帕胺；灭滴灵用甲硝唑。
5. 主题词检索的一般原则
（ 1 ）有先组的主题词用先组：如一氧化碳中毒，我们要用一氧化碳中毒这个先组的主题词进行检索，而不用一氧化碳 / 中毒或一氧化碳 + 中毒（主题词）。
（ 2 ）无先组的用组配检索：如有两个以上并列概念的主题要分别进行检索，如肝
胆疾病用“肝疾病 + 胆道疾病”进行检索。
（ 3 ）组配检索：要选用适合的主题词或自由词组配。例如急性心肌梗塞用心肌梗
塞（主题词） + 急性（自由词），但有先组词时不需组配，如慢性肾功能衰竭用“肾功能衰竭，慢性（主题词）”。
（ 4 ）主题概念交叉要分开检索：如食管鳞状细胞癌，需要查食管肿瘤 AND 癌，鳞
状细胞。
6. 主题词和关键词检索比较
关键词主题词
必须是录入的文本词文献主要概念，不一定出现
以词的拼写相同为查找目标以主题词相同为查找目标
要用全同义词单个主题词可集中同义词
不需要查词表可直接键入需查词表
不能直接与副主题词组配能与副主题词组配
不能扩展检索可扩展检索
不能加权可加权
复杂关系表达不明确复杂关系可明确表达
常出现虚假命中不会出现虚假命中
多自由词短语要逐一查找主题词和副主题词同时检出
不能提供相关提示提供相关检索
（三）分类检索
分类检索实际上是从文献所属的学科角度来进行检索，如果想查某个学科主题的文献，可以通过两种方法来实现：一个是在检索入口直接输入分类名或分类号来实现。另外还可
以通过分类导航逐级展开来实现。
（四）期刊检索
期刊检索是直接在检索入口处选择刊名、出版地、出版单位、期刊的主题词或 ISN
号直接查明期刊就可以了。也可以通过期刊的分类导航或首字母的导航来逐级查找浏览期刊。在期刊检索中，我们可以查找期刊编辑部的信息，以便投稿、利用。
（五）作者检索
新推出的 CBM 增加了第一作者检索的检索途径。可以直接输入作者名后，勾选第一
作者查找。
三、检索结果处理
首先可以对检索结果进行排序，排序的方式主要包括按年代排序、按作者排序、按期
刊排序、按相关度排序。文献的显示格式有三种，它默认的是题录格式、文摘格式和详细
格式。我们还可以对检索结果进行标记，标记记录十分简单。就是在每一条检索结果前面
的标记框直接勾选就可以了。文献输出可以选择全部记录、标记记录、当前页记录以及记
录号。 CBM 数据库还可以对检索结果进行分析，在检索结果状态下点击右侧的检索结果链接表，就进入检索结果分析页面，可以对检索结果的作者、出版时间、作者单位、来源期
刊、加星主题词及文献类型等进行结果分析。在检索结果页面还可以进行多种链接，包括作者、来源期刊、主题相关的链接，以及全文的链接。
四、个性化服务功能
要使用个性化服务功能，首先要登陆我的空间。第一次使用时需要注册，然后进入到我的空间后可以制订检索策略，并且保存。另外，可以定期调用检索策略获取最新信息。同时，也可以把你感兴趣的文献存在我的数据库中，以供随时调用和选择。
医药文献检索与利用（zll） 一、检索总论 信息及信息素养 信息：是普遍存在的，是物质的一种基本属性，是物质存在方式及其运动规律、特点的外在表现。 信息定义：事物的运动状态和状态变化的方式。 信息与知识的区别：信息是大家的，独立于行为和决策，独立于环境存在，容易转让，可复制。 情报：传递有特定效用的知识（知识性，传递性，效用性）。 文献：以文字、图形、符号、声频、视频等手段记录和传播知识的载体。 （知识内容、信息符号、载体材料、记录方式） 文献按加工层次划分： 一次文献（原始论文——期刊论文、学位论文、研究报告、专利说明书）； 二次文献（目录、索引、文摘，pubmed、web of science、sinomed）； 三次文献（综述、年度总结、年鉴、指南、百科全书、annual reviews）； 零次文献（未被正式发表的，书信、手稿、笔记、口头交流） 文献按载体形式划分：印刷型、电子数字型、缩微型、声像/视听型 文献按出版类型划分：图书（ISBN号 10位，4段——地域号、出版社号、书号、校验号；本馆订购的电子图书：apabi，超星、读秀、elsevier、karger、Springer）、期刊（ISSN 号 8位，前七位是刊名代号，末位是计算机校验号）、特种文献 整个信息行为：信息需要、信息检索、信息选择、信息利用
信息素养定义：人们在工作中运用信息、学习信息技术、利用信息解决问题的能力。 信息素养的构成要素：信息意识；信息能力；信息道德。 ACRL信息素养能力的评价标准：（5个一级指标，24个二级指标）。 医学文献检索相关概念 指从文献信息集合中查找所需文献或文献中包含的信息内容的过程 计算机检索原理概述 检索提问字符串匹配数据库中特征标识字符串 数据库的构成：文档、记录、字段 常见字段：TI（题目）、AB（文摘）、AU（作者）、MESH（主题词）、 SO（期刊名称）、 AD （作者单位）、DT（文献类型）、PY（出版年） 检索语言 文献外部特征的检索语言：题名、著者、文献序号、引用序号 文献内容特征的检索语言：分类检索、主题检索、代码检索 （1）分类检索：美国国立图书馆图书分类法，杜威十进制、国际十进制、中国图书馆分类、国际疾病分类。 （2）主题检索：是以规范化的词汇来表达文献内容的主题；主题词（叙词）、副主题词（限定词）、关键词。 （3）代码检索：化合物分子式索引等 计算机检策略与步骤 （1）布尔逻辑检索：NOT >AND> OR，括号优先 （2）截词检索：代表一个字母，必须以半角状态输入 %或*代替任意个字符 （3）位置运算检索：（W）、（nW）、（N）、（nN）、（F）、（S）、（L） （4）字段限定检索：“=”或“in” （5）计算机检索的一般步骤：（大题） 分析检索课题（课题所属的学科范围、要求的文献类型、年限、语种、需要的文献量等）选择检索工具（数据库的选择） 确定检索途径（首先选择基本检索方式全字段检索）
医学文献信息的获取与利用3 1、CAJViewer浏览器是下列哪个数据库专用全文格式阅读器？（A）* https://www.doczj.com/doc/5411074792.html,KI B.维普科技期刊全文数据库 C.万方全文数据库 D.SinoMed 2、我校图书馆图书分类使用的是（A）* A.中国图书馆分类法 B.杜威十进制分类法 C.美国国会图书馆图书分类法 D.中科院图书分类法 3、检索工具按照对文献揭示的程度可分为目录、索引和（A）* A.文摘 B.全文 C.期刊 D.图书 4、（D）是经过优选和规范化处理的词汇，由主题词表来控制* A.关键词 B.分类号 C.索引号 D.主题词 5、下列哪个数据库属于事实数据库（C）* A.中国生物医学文献服务系统（SinoMed） B.PubMed C.MICROMEDEX D.SCI 6、参考数据库中一般使用的信息检索技术不包括（C）* A.限定检索 B.扩展检索 C.纹理特征提取 D.加权检索 7、中国生物医学文献数服务系统（SinoMed）是（A）* A.参考数据库 B.全文数据库 C.事实数据库 D.数值数据库 8、中国生物医学文献数服务系统（SinoMed）与下列哪个数据库进行了全文链接?（B）* A.中国知网CNKI B.维普 C.万方全文 D.超星 9、引文检索途径是利用（C）作为检索入口查找文献的途径* A.关键词 B.分类号 C.引文 D.主题词 10、以下哪种检索技术可以使检索结果更加精确？（A）* A.字段限定 B.截词检索 C.逻辑或 D.模糊检索 11、在图书馆查找某一本图书时读者需要使用的是（A）* A.馆藏机读目录数据库 https://www.doczj.com/doc/5411074792.html,KI C.SCI D.CBM 12、下列不属于三次文献的是（A）* A.文摘 B.综述 C.述评 D.百科全书 13、全文检索技术会直接提高（B）*
医学文献信息检索 第一章绪论 1.一个国家的综合国力在一定程度上将体现为信息的拥有量、处理能力和利用水平，即信 息水平、信息能力、信息素质、信息潜能的总和。 2.NIQ-----国家信息化指标（国家智商） 3.医学生信息素养：个体能够认识到何时需要信息，能够检索、评估和有效利用信息的综 合能力。包括：信息意识、信息知识、信息能力、信息道德 4.信息能力：活动+积累+表达+甄别+利用（终极目的） 5.信息意识是前提，信息能力是核心，信息道德是方向。 6.文献信息检索：教会医学生查找文献信息，提高检索、筛选、分析、评价、管理和综合 利用文献信息的能力，最终使文献信息为我所用。包括信息存储和信息检索两个环节。 7.手工检索：常用法、追溯法、浏览法 计算机检索：浏览法、搜索法、技术法 8.外表特征途径：题名、著者、机构名、编号 内容特征途径：分类、主题、代码 第二章文献信息检索基础 （二）文献信息的类型 1.按载体形式：印刷型+非印刷型（缩微型+声像型+电子型） 2.按内容的表现形式：文献型+数据型+多媒体型 3.按出版类型：图书+期刊（利用率最高）+特种文献信息 4.按获取的难易程度：白色文献（正式出版）+灰色文献（未完全公开）+黑色文献（完全不公开）（三）文献信息级别
位论文、会议文献 二次文献将大量无序、分散的一次文献收集、整理、加工，著录其外部或内容特征。目录、索引、文摘、网络检索工具（baidu、Yahoo） 三次文献科技人员围绕某一专题，借助二次文献，在充分研究与 利用大量一次文献的基础上撰写成的新的文献。 综述、述评、进展、百科全书 零次文献未经加工、直接记录在载体上的原始信息。私人笔记、会议记录 （四）分类语言 1.分类语言：类号+类名（医药、卫生---R） 2.《中国图书馆分类法》（《中图法》）划分为5个基本部类，22个基本大类。 （五）主题语言 1.主题语言：以规范化或未经规范化的名词术语为基本词汇，以概念间的形式逻辑作为语 法和构词法形成的词语为检索标识的一种人工语言。包括标题词+关键词+单元词+叙词2.关键词：那些出现在文献的标题、摘要或正文中对表达文献主题具有一定实质意义的词 和词组。（未经过规范化） 3.叙词（主题词）：经过规范化处理的，以基本概念为基础的表达文献信息主题的词和词 组。具备了概念性、描述性和组配性。 副主题词：与主题词组配，对主题词进行修饰限定的词。 4.MeSH词表：目前最具代表性，使用最为广泛的受控医学叙词表。由主题词变更表+字顺 表+范畴表+副主题词表构成。 5.数据库＞文档＞记录＞字段 （六）检索技术 1.布尔逻辑检索：（）＞NOT（-）＞AND（*）＞OR（+） 不同检索系统使用的运算符不同：表“与”CBM---AND，VIP---*，PubMed---空格/AND 2.限定检索：将检索词限定在文献特定字段中检索。 常用字段标识符：[ALL]全部字段；[AU]作者；[TA]期刊名称；[LA]原文语种；[MH]主题词；[TI]文献标题；[TIAB]标题/文摘 3.截词检索：使用特定截断符后对检索词的局部进行检索。通常“”表单一字符，“%”表 任意字符。 4.加权检索：对检索词赋予一个值表示重要程度后进行检索。可缩小检索范围提高查准率。（七）检索程序 分析检索需求→选择检索工具→确定检索方法或途径→编辑提问式→获取文献线索与原文（八）检索效果 1.查全率= 2.查准率= 第三章中文期刊数据库检索（CBM+CNKI+VIP+万方） （一）CBM（中国生物医学文献数据库） 1.CBM属于SinoMed（中国生物医学文献服务系统） 2.CBM收录自1978年以来1800余种中国生物医学期刊，是检索国内医学文献的权威。 3.题录依据：《MeSH》、《中国中医药学主题词表》、《中图法·医学专业分类表》 4.检索方法：快速检索+主题检索+分类检索+期刊检索+作者检索 （1）高级检索：CBM提供18个检索字段。
国际医学文献数据库检索网站 Medline世界上最著名的医学文献检索系统之一 AIDS Databases有关艾滋病的临床实验、药物研制以及相关文献数据库 CANCERLIT 癌症数据库(National Cancer Institute) CHID online综合卫生信息数据库，提供有关卫生、卫生教育资源的题录、文摘等信息https://www.doczj.com/doc/5411074792.html,向医患人员提供的临床实验信息数据库 DIRLINE收集美国约17,000个政府机构、研究机构、公司、学术机构等信息 药物信息库包含有9,000余种美国处方与非处方药物信息 HSTAT包括有健康指南、评价、和消费者指南信息的全文数据库 NCCAM Resources补充和替代医学资源 Dietary Supplements提供维生素、矿物质、植物等信息 畸形、智力迟缓数据库提供先天畸形、智力发育迟缓信息 LOCATORplus杂志、书籍和视听教材目录数据库 Chemical Abstract覆盖化学、化工、医学、生物学、环境、食品等多学科的科技文献系统Dialog 联机检索系统世界上最大的文献检索系统 Biomedicine荷兰医学文摘，世界权威性的医药文献数据库。 RHO生殖健康展望，由William H .Gates 基金会的基金资助 Out Look有关生殖健康的论题，由 PATH 出版，联合国人口基金资助，可免费索取医药信息网有药品数据库、疾病数据库、新药数据库、医药市场等主要数据库 MEDLINE Search最权威的生物医学文献数据库，可获取全球范围内的4300种期刊的文献Consensus Statements提供对医生、患者有重要意义的有争议医学问题一致性见解 Cancer net Database综合癌症信息数据库 Rare Diseases Database罕见疾病临床研究数据库 Visible Human Project可视人计划数据库 TOXNET Databases毒理学数据库，将有关毒理和有害物质信息分为八个文档 FDA最新的有关食品、药物、生物制剂、美容品、医学装置等通过、调整等信息Guideline Clearinghouse提供临床医疗指南，汇总美国各权威协会和学术机构制定的各种指南性文件Women's Health & Environme妇女卫生与健康研究信息数据库
获取医学文献全文的方法和网上资源 丁六松1 张宇伟 2 中图分类号:G 255;R1 文献标识码:C 文章编号:100720931(2004)0520057202 作者单位: 1.浙江大学图书馆,浙江杭州 310031;2.浙江大学医学院 随着信息时代的到来,网络资源日益丰富。文献的出版媒体也由原来的印刷为主,向电子化、网络化发展(如文献的WE B 版、光盘版等)。获取文献原文的方式由原来单一、原始的复印与借阅渐渐被方便、快捷的网络传递、来源丰富的全文数据库检索所代替。大学的研究生和科研工作者原则上应阅读全文以获得所需的完整的信息。 科技期刊全文的获取 现从获取期刊全文文献的方便、快捷、经济的角度对各种方法依次介绍如下:1 通过单位局域网查找本单位订购(或免费试用)的电子全文文献。 一些学校与研究机构往往订购一些与自己教学研究领域密切相关的全文电子文献(包括WE B 版、光盘版)。目前这些数据库不下百种。有些出版商还经常提供有限时间的部分数据库免费试用。常见的全文电子资源有: 国内: 中文科技期刊数据库(全文库):收录约12000期刊,几乎全部医学期刊(1400种); C A J (中国学术期刊全文数据库):含5300余种中国期刊; 万方数据库:约3500种中国期刊,医学刊约500种;国外: High Wire Press :http :∥167.216.165.85/收录4500种医学期刊的全文,其中340多种是免费的; E BSC O :收全文刊1200种,医学刊554种; E lsevier Science Direct On 2site (S DOS ):http :∥elsevier 1lib 1sjtu 1edu 1cn/收1349种,与医学相关约700种; Academic Search Premier :http :∥search 1china 1epnet ,com 收录3288种全文刊; OC LC First Search :http :∥firstsearch 1global 1oclc 1org ΠFSIP 收录全文医学刊约300种,可检索多个数据库(包括ME D LI NE )并链接到全文; John Wiley :http :∥w w w 1interscience 1wiley 1com 收录400余种,医学约150种; K luwer online :http :∥kluwer 1calis 1edu 1cn/收录600多种,医学84种; OVI D 全文期刊数据库:http :∥gateway 2di 1ovid 1com/收录期刊800种,医学约300种; S pringer:http :∥springer 1lib 1tsinghua 1edu 1cn/收400余种,医学刊约160种; UMI Medical Library :http :∥proquest 1umi 1com/pqdweb 收220多种医学刊; Natrue :http :∥w w w 1nature 1com 包括《Nature 》出版集团的7种刊; Science :http :∥china 1sciencemag 1org/《科学》周刊;英国Maney 出版公司和英国皇家学会的网络版全文期刊数据库:http :∥china 1catchw ord 1com/ 其它收录有医学期刊的还有Uncover 、In fotrieve 、Ontario Scholars P ortal (OSP )、G eorg Thieme Verlag S tuttgart ,New Y ork (Thieme )、W 1B 1Saunders (W BS )、Catch W ord Ltd (CatchW ord )、Harcourt Health Sciences UK (hhsuk )、MetaPress 1com (MetaPress )、Blackwell Science (Blackwell )等。 值得指出的是:以上这些国外全文数据库均可以通过其它Web 版二次文献数据库如Pubmed ,Web of science 、BI OSIS Previews 等的检索结果直接链接(或Link Out )到全文。2 直接查找网上免费的全文文献(注:对于小单位或个人用户为首选方式)。 对于医学期刊全文最有名的免费资源网站是“WWW 1freemedical journals 1com ”。目前该网站收集的免费期刊有1100余种,并不断更新。免费从出版后1月开始,有的要一年后才免费。 国内主要有:37度医学网:http :∥w w w 137c 1com 1cn/提供国内主要医学期刊的全文。 好医生网站:http :∥w w w 1haoyisheng 1com/提供的英文的期刊有100种左右,多为核心经典期刊,而且摘要是中英文对照的。3 到单位图书馆复印或借阅印刷型文献。这是最原始的方法,但还占重要地位。对于网络不熟悉、或没有上网条件的人不失为最经典的途经。4 向著者本人索取。一般二次文献数据库都有包含有著者的通讯地址,有的还有E 2mail 地址和个人WE B 网址。直接向著者索取,也是一个很简捷的方法,同时还可以咨询一些专业问题。5 通过国内外馆际互借得到。目前国内已经有一个较为完善的馆际互借体系。可以先到以下联合目录检索网站检索(也可查图书馆的印刷型期刊联合目录),确定馆藏情况,通过馆际互借得到。也可以委托本单位图书馆通过馆际互借得到。 医学相关的主要联合目录检索网址:511 全国西文文献联合目录: 上海图书馆:http :∥w w w 11ibrary 1sh 1cn/chinese/search Πx w wx 1htm
医学文献信息的获取与利用 1、下列哪个数据库收录了中华医学会系列期刊2008年以后的全文？（） * ? A.中国生物医学文献数据库（CBM） ? B.维普科技期刊全文数据库 ? C.万方全文数据库 ? https://www.doczj.com/doc/5411074792.html,KI 2、下列哪个不属于布尔逻辑运算符( ) * ? A.AND ? B.OR ? C.NOT ? D.IF 3、维普数据库不能实现以下哪个功能?（） * ? A.查看同义词 ? B.查看基金 ? C.查看相关机构 ? D.同名/合著作者 4、下面哪项功能是PubMed数据库不具备的( ) * ? A.提供部分免费全文的链接 ? B.对输入的检索词进行词语自动匹配转换功能 ? C.可以输入化学物质结构式进行检索 ? D.MY NCBI的定题跟踪功能 5、万方数据库中检索文献导出功能表示导出（） * ? A.全文 ? B.题录 ? C.题名
? D.摘要 6、下列不属于检索途径的是（） * ? A.关键词 ? B.主题词 ? C.索引号 ? D.浏览 7、PubMed数据库检索结果的显示格式不包括( ) * ? A.Summary ? B.Abstract ? C.EndNote ? D.MEDLINE 8、查找某高校全部学者发表的文献应使用（）检索途径 * ? A.关键词 ? B.分类 ? C.索引号 ? D.机构 9、中国生物医学文献数服务系统（SinoMed）采用下列哪种词表对文献进行分类标引? （） * ? A.《中国图书馆分类法'医学专业分类表》 ? B.《杜威十进分类法》 ? C.《医学主题词表》 ? D.《中医药学主题词表》 10、主题词是一种（）语言，即用自然语言中的名词、名词性词组描述文献所论述的事 物的概念 * ? A.陈述性 ? B.数学性
住院医师课程医学文献信息的获取与利用、其他信息资源检索答案
课程名称：《医学文献信息的获取与利用》、《其它信息资源检索》，找不到的选D 4、中国生物医学文献数服务系统（SinoMed）采用下列哪种词表对文献进行分类标引?（a ） A.《中国图书馆分类法'医学专业分类表》 B.《杜威十进分类法》 C.《医学主题词表》 D.《中医药学主题词表》 6、以下哪个数据库属于中文参考数据库？（a ）* A.中国生物医学文献数服务系统（SinoMed） B.维普期刊数据库 C.万方数据库 D.ScienceDirect 7、如要检索的关键词并不确定其拼写中的几个字母时能够使用哪种检索技术（ a） * A.截词检索
B.邻近检索 C.精确检索 D.模糊检索 8、维普中文科技期刊数据库的检索途径不包括（a ） * A.引文检索 B.快速检索 C.高级检索 D.分类检索 2、下列不属于检索途径的是（ d） * A.关键词 B.主题词 C.索引号 D.浏览 10、查找“胰岛素治疗糖尿病”的文献，其检索式应为（ a） * A.胰岛素 AND 糖尿病 B.胰岛素 OR 糖尿病
C.胰岛素 NOT 糖尿病 D.胰岛素 13、利用CNKI检索题名中出现帕金森病的学位论文应该选择（a ） * A.博硕士学位论文单库检索 B.会议论文单库检索 C.跨库检索 D.期刊单库检索 14、美国国立医学图书馆《医学主题词表（MeSH）》、《中国中医药学主题词表》是中国生物医学文献数服务系统（SinoMed）进行主题标引和（a）的依据 * A.主题检索 17、在PubMed数据库中对检索结果不能进行哪个方面的过滤？（a ） * A.Fund B.Age C.Publication dates D.Article types 19、下面哪个数据库能够实现原貌打印封面、目
医学文献英文翻译 原文：皮质下缺血性脑血管疾病（subcortical ischemic vascular disease,SIVD）是一组以小血管病变为主要病因、以皮质下多发性腔隙性梗死和脑白质病变为主要脑部损害的缺血性脑血管病，是引起血管性认知功能损害（vascular cognitive impairment，VCI）最常见的亚型。SIVD可引起步态障碍，如帕金森样步态、共济失调性步态、走路不稳或无明显诱因的频繁跌倒，有研究表明，步态异常可能是血管性痴呆的早期标志。本文将从SIVD导致步态障碍的病理机制、步态障碍类型、步态障碍与认知损害关系、步态障碍的分析与评价、治疗等方面进行综述。 翻译：皮质下缺血性脑血管疾病（subcortical ischemic vascular disease,SIVD）是一组以小血管病变为主要病因、以皮质下多发性腔隙性梗死和脑白质病变为主要脑部损害的缺血性脑血管病，是引起血管性认知功能损害（vascular cognitive impairment，VCI）最常见的亚型。 Subcortical ischemic vascular disease（SIVD）is a case of ischemic cerebrovascular disease, the leading cause of which is small vessel lesions, and the subsequent main damages to the brain are subcortical multiple lacunae infarct and leukodystrophy; it is the most common subtype that causes vascular cognitive impairment (VCI). SIVD可引起步态障碍，如帕金森样步态、共济失调性步态、走路不稳或无明显诱因的频繁跌倒，有研究表明，步态异常可能是血管性痴呆的早期标志。本文将从SIVD导致步态障碍的病理机制、步态障碍类型、步态障碍与认知损害关系、步态障碍的分析与评价、治疗等方面进行综述。 SIVD can induce gait disorder, such as Parkinson gait, ataxic gait, ataxia or frequent tumbles without obvious causes; research shows that abnormal gait may be early signs of vascular dementia. From the pathological mechanism of gait disorder caused by SIVD, this paper describes the types of gait disorder, the relationship between gait disorder and cognitive impairment and the analysis, evaluation as well as the treatment of gait disorders.
《中国生物医学文献数据库》的检索与利用 解放军医学图书馆杜永莉 一、数据库概况 CBM 数据库共收录了 1978 年以来国内出版的 160 多种中国生物医学期刊以及汇编、会议论文的文献题录。截至到 2009 年底已累积了 530 余万篇文献，年增长量约 40 万篇，数据库每月都要更新。 CBM 数据库还具有收录广泛、数据规范、具有多种词表辅助检索的特点。它的全部题录都是美国国立医学图书馆最新版的医学主题词表，也就是 mesh 词表。 2004 年 CBM 实现了与数据库全文的链接功能，在检索结果中，可以查找 1989 年以 来的所有全文。它的版本也不断更新， 1994 年 CBM 出版的 dos 版， 2000 年 CBM 改版为 CBMwin 版， 2004 年 CBM 出版了 CBM web 版， 2009 年又推出了 SinoMed ，中国生物医学文献辅助系统。 CBM 数据库对两个以上的检索词提供三种逻辑算符，分别为 AND 、 OR 、 NOT ，代 表逻辑与、逻辑或和逻辑非。 AND 表示检索记录中同时有检索词 A 和检索词 B ； OR 表示检索记录中含有检索词 A 或者检索词 B ； NOT 表示在检索词 A 的记录中去掉检索词 B 的记录。另外， CBM 数据库还提供了通配符，主要的通配符有两个：一个是“？”，代表一个单字；“ % ”代表任何字符，如：输入“血 ? 动力”，可检索出含有：血液 动力、血流动力字符的文献；输入“肝炎 % 疫苗”，可检索出：肝炎疫苗、肝炎病毒基因疫苗、肝炎减毒活疫苗、肝炎灭活疫苗等字符的文献。 二、主要检索途径 CBM 数据库的主要检索途径有：基本检索、主题检索、分类检索、期刊检索和作者检索。 （一）基本检索 默认状态是基本检索，基本检索主要包括题目、英文标题、摘要、作者、地址、关键词、主题词、特征词、基金、参考文献、刊名、出版年、分类号等，默认为缺省。例如检 索 SARS 病理学方面的文献，我们可以在检索框中输入 SARS 病理，或 SARS and 病理， 点击检索。注意，智能检索不识别逻辑与、逻辑或的检索，只对单个词组进行检索。所以 在这个情况下，不能选择智能检索。 （二）主题检索 主题检索也就是说采用规范化的主题词进行检索，主题词检索与关键词检索相比，能 够有效的提高查全率和查准率。 1. 实例分析： 例 1 ：要查找“先天性心脏病的手术治疗”，我们先用自由词（关键词）进行检索，再用主题词进行检索，然后将二者的检索结果进行对比，通过实例我们可以了解主题词和 自由词检索的作用与区别。
选项A 1、中国生物医学文献数据库（CBM）中，可以设定研究对象性别的检索方法是（）。* A.限定检索 B.分类检索 C.作者检索 D.主题检索 7、中国生物医学文献数据库（CBM）采用下列哪种词表对文献进行分类标引？* A.《中国图书馆分类法-医学专业分类表》 B.《杜威十进分类法》 C.《医学主题词表》 D.《中国中医药学主题词表》 8、中国生物医学文献数据库（CBM）现使用哪两个通配符？* A.%和？ B.*和？ C.$和？ D.$和% 10、在中国生物医学文献数据库（CBM）中，检索结果的聚类不包括以下哪项？（）* A.国家 B.主题 C.学科 D.期刊 12、中国生物医学文献数据库（CBM）联机主题词表以下哪个是正确的？（）* A.MESH词表和中医药学主题词表 B.EMTREE C.中国图书馆分类法-医学专业分类表 D.汉语主题词表 13、在中国生物医学文献数据库（CBM）中检索首都医科大学王辰教授发表的文献，下列哪个检索方法是正确的？（）* A.选择作者检索，作者姓名输入王辰，作者列表中选择王辰，点查找，在结果界面选作者单位，输入首都医科大学，选二次检索，点检索。 B.选择作者检索，作者姓名输入王辰，作者列表中选择王辰，点完成，在结果界面选作者单位，输入首都医科大学，点检索。 C.高级检索界面，选作者，输入王辰，点检索，回到高级检索界面选作者单位，输入首都医科大学，点检索，点检索史进行逻辑“或"检索。 D.高级检索界面，选作者，输入王辰，点检索，在结果界面输入首都医科大学，点检索。 14、中国生物医学文献数据库（CBM）的智能检索包括（）。* A.在高级检索中实现检索词及其同义词(含主题词)的扩展检索。 B.在分类检索中实现检索词及其同义词(含主题词)的扩展检索。 C.在期刊检索中实现检索词及其同义词(含主题词)的扩展检索。 D.在作者检索中实现检索词及其同义词(含主题词)的扩展检索。 17、中国生物医学文献数据库（CBM）中的“二次检索”相当于下列哪一个逻辑运算检索？（） A.AND B.OR C.NOT D.NEAR 18、中国生物医学文献数据库（CBM）中，检索作者李坤成发表的“脑缺血的磁共振成像”方面的文献，用到的检索方法有（）。* A.主题检索和作者检索 B.期刊检索和作者检索 C.期刊检索和限定检索 D.主题检索和限定检索 21、在中国生物医学文献数据库（CBM）中检索首都医科大学学报上关于糖尿病的研究的文献，下列哪个检索方法是正确的？（）* A.期刊检索刊名输入“首都医科大学学报”，查找得到该刊，在本刊中检索，输入“糖尿病”，点浏览本刊 B.高级检索选择检索入口作者单位，输入“首都医科大学”，检索结果界面输入“糖尿病”，点二次检索 C.高级检索选择检索入口刊名，输入“首都医科大学学报”，检索结果界面输入“糖尿病”，点检索 D.主题检索输入糖尿病,检索结果界面选择检索入口刊名，输入“首都医科大学学报”，点检索 30、中国生物医学文献数据库（CBM）中在检索结果的范围内输入检索词进行进一步检索，两个检索词之间的逻辑关系相当于"and"操作，称作（1）。* A.二次检索 B.主题检索 C.限定检索 D.高级检索
2016年级科学学位硕士研究生班作业 1、对照ACRL2006年《科学、工程和技术领域信息素养标准》写出自己目前具备的信息素养，哪些是本次课程学习需要达到的信息素养。 （对照三级指标每小项分别注明具备、课堂或者长期学习） 标准一：有信息具有信息素养的学生能确定所需信息的性质和范围 1、定义和描述信息需求： a. 识别并／或能对研究课题或其他信息需求（如指定的实验室活动或项目）进行关键词重述或转换。（课堂学习） b. 向教学人员或专家咨询研究主题、研究项目或实验等问题的合理性。（具备） c. 草拟一个论题或假设，并根据信息需求列出相关问题。（具备） d. 通过浏览广泛的信息源来熟悉课题。（具备） e. 限定或修改信息需求以抓住重点。（具备） 2、可找到多种类型和格式的信息来源： a. 确定信息源的目标和受众。（例如：大众信息 vs.学术信息、当前信息 vs.历史信息、外部信息v s.内部信息、一次文献v s.二次文献vs.三次文献）。（课堂学习） b. 将专家和其他研究者作为信息源。（具备） c.识别并区分各种格式（例如多媒体、数据库、网站、数据集、专利、地理信息系统、三维技术，公开文件报告，音视频报告、书籍、图表、地图等）存在的潜在信息源的价值和不同之处。（课堂学习） d.认识到信息可能需要从一次文献或实验的原始数据中析出。（具备） e.认识到各种潜在有用的信息数据可能属于保密的、限制访问的或在线免费使用的。（具备） f. 认识到这些潜在有用的信息可能需要特定的数据管理经验并了解生产信息的组织结构。（课堂学习） 3、具备学科领域文献的应用知识并了解其产生过程: a.了解科技相关信息是如何正式或非正式一产生、组织以及传播的。（课堂学习） b.认识到学科中一次、二次、三次文献源的不同重要性。（课堂学习） c.知晓该领域的行业协会及其产生的文献。（长期学习） d.了解本学科领域的特殊文献源知识，如手册、小册子、专利、标准、材料/设备规格说明，当前的规章制度，工业常用参考资料、工业生产方法及实践手册、产品资料等。（长期学习） e.认识到知识可按学科分类，并考虑到复合学科可能会影响到信息获取方式，同时，其它学科文献也可能与信息需求相关。（具备） f. 认识到档案信息的价值以及在不同学科专业中的用途和重要性，并认识到信息长期保存的重要性。（具备） 4、权衡获取所需信息的成本与收益： a.确定所需信息的可用性，并决定是否扩大检索范围以查寻本地馆藏以外的信息。如咨询同事、独立信息经纪人、行业专家或顾问，以及利用馆际互借服务或附近的图书馆或信息中心等。（课堂学习） b.认识到获取信息需要付出的时间和费用。（具备） c.拟定一份现实可行的信息获取总体规划和时间表。（长期学习）
国际医学文献数据库检索网站
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国际医学文献数据库检索网站 Medline 世界上最著名的医学文献检索系统之一 AIDS Databases 有关艾滋病的临床实验、药物研制以及相关文献数据库 CANCERLIT 癌症数据库(National Cancer Institute) CHID online 综合卫生信息数据库，提供有关卫生、卫生教育资源的题录、文摘等信息 https://www.doczj.com/doc/5411074792.html, 向医患人员提供的临床实验信息数据库 DIRLINE 收集美国约17,000个政府机构、研究机构、公司、学术机构等信息 药物信息库包含有9,000余种美国处方与非处方药物信息 HSTAT 包括有健康指南、评价、和消费者指南信息的全文数据库。 NCCAM Resources补充和替代医学资源 Dietary Supplements提供维生素、矿物质、植物等信息
畸形、智力迟缓数据库提供先天畸形、智力发育迟缓信息LOCATORplus杂志、书籍和视听教材目录数据库 Chemical Abstract 覆盖化学、化工、医学、生物学、环境、食品等多学科的科技文献系统 Dialog 联机检索系统世界上最大的文献检索系统 Biomedicine 荷兰医学文摘，世界权威性的医药文献数据库。 RHO 生殖健康展望，由William H .Gates 基金会的基金资助。 Out Look 有关生殖健康的论题，由 PATH 出版，联合国人口基金资助，可免费索取。 医药信息网有药品数据库、疾病数据库、新药数据库、医药市场等主要数据库。 MEDLINE Search 最权威的生物医学文献数据库，可获取全球范围内的4300种期刊的文献。 Consensus Statements 提供对医生、患者有重要意义的有争议医学问题一致性见解 Cancer net Database综合癌症信息数据库。
免费生物医学期刊全文检索与获取方法 王敏许培扬 （中国医学科学院/中国协和医科大学医学信息研究所） 关键词：生物医学免费期刊免费全文文献检索 中图分类号：R 文献标识码： 文章编号：1009-0878（2006）04-0000-00 随着Internet的迅猛发展，生命科学研究作为人类科学最活跃的领域，生物医学资源已占整个网络资源的30%，如何方便、快捷的获取免费生物医学期刊全文成为科研人员、临床医生、教师学生的迫切需求。目前从网上获取免费全文的方法主要有二种：一是通过网络数据库提供的全文链接；二是登录提供免费期刊索引的网站。下面具体介绍免费生物医学期刊全文检索与获取方法。 1 网络数据库提供的全文链接 1.1 PubMed: https://www.doczj.com/doc/5411074792.html, PubMed是美国医学图书馆下属国家生物技术信息中心开发的基于Web的检索系统，是NCBI Entrez目录式检索系统中的重要组成部分。该系统收录了1950以来16,000,000条生物医学文献记录，并且提供部分文献的全文链接以及相关资源的链接站点，是国际上公认的最具权威的生物医学文献检索系统。 PubMed提供的文献题录类型有四种，具体见表1 PubMed中有5156种期刊提供网络版全文，其中800种期刊提供免费全文（期刊部分免费或全部免费），这些免费期刊来源于140多个出版社或供应商，PubMed central中的免费全文仅是PubMed免费全文中的一部分。 在PubMed中获取免费全文有两种方法，下面以检索有关“aids vaccine”的免费全文为例进行介绍： (1) 利用“Limit”标签中的“Links to free full text”进行限定，见图1
生物医学期刊投稿的统一要求（温哥华格式第五版） 国际医学期刊编辑委员会 1978年，一些综合性医学期刊编辑在加拿大不列颠哥伦比亚省温哥华市非正式集会，制定了向这些编辑所属期刊投稿格式的标准。后来，该小组以温哥华小组（）著称于世。温哥华小组制定的投稿要求，包括由美国国立医学图书馆提供的参考文献著录格式，于1979年首次发表。温哥华小组经不断扩大，逐渐发展成为国际医学期刊编辑委员会（,）。该委员会每年召开会议，不断充实投稿要求的内容。国际医学期刊编辑委员会已经制定了“生物医学期刊投稿的统一要求”（，简称“统一要求”）第5版。许多年来，委员会讨论的议题已经大大超出稿件准备这一范畴。因此，“生物医学期刊投稿的统一要求”第5版分为“统一要求”和“补充说明”两大主体部分，这些内容已刊登在某些科技期刊上。 “统一要求”第5版（1997）是对第4版的重新组织和阐述，其全文更为清楚，并提出了版权、隐私、方法学描述和其他有关问题。只要为了教育、而非赢利目的，“生物医学期刊投稿的统一要求”无版权问题，可以全文复制。国际医学期刊编辑委员会希望“统一要求”得到广泛的传播。同意采用“生物医学期刊投稿的统一要求”的期刊（已超过500种），应在其“投稿须知”中引述1997年第5版。重要的是正确理解该要求： 第一，“统一要求”是指导作者准备稿件的指南，而不是编辑的出版格式（但许多期刊已将该要求作为其出版格式的要素）。 第二，如果作者按“统一要求”的格式准备稿件，同意采用该要求的期刊编辑在考虑文章发表前决不会因稿件格式不当而退稿。然而，在出版过程中，各期刊编辑可能会对已接受稿件作一些修改，以使其格式合乎各刊物的特殊要求。 第三，作者向同意采用“统一要求”的期刊投稿时，不一定非按该刊的出版体例准备稿件，而只需遵循“生物医学期刊投稿的统一要求”。 但文章的选题及类型仍应遵照拟投期刊的“投稿须知”，如论著、综述、病例报告。另外，应注意各期刊“投稿须知”中其他方面的特殊要求，如所投稿件的份数、文种、文章篇幅及允许使用的缩写词。 希望同意采用“统一要求”的期刊在“投稿须知”中声明，其投稿要求依照“生物医学期刊投稿的统一要求”，并引用已出版的“统一要求”的印刷版文本。 投稿前应考虑的问题 一、重复发表 重复发表指与已发表文章实质上内容相同的文章发表。除非明确声明该文章由作者和编辑选择，属于再次发表，否则源期刊的读者应该相信他们所读的文章是首次发表的作品。此观点的基础是国际版权法、伦理道德和资源的有效利用原则。 多数期刊不愿意接收文章所涉及的大部分内容已在其他已经发表的文章中报道过，或包含在已投给其他刊物或已被某刊物接受并正在印刷中的印刷版或电子版文章中。该政策不包括已被其他期刊退稿的稿件或仅发表过初步研究结果（摘要或专业学术会议墙报）的完整报告。学术会议报告论文，未以全文发表或未
如何利用美国《科学引文索引》查找医学文献 1科学引文索引的一般概况美国科学引文索引(ScienceCitationlnsex)，简称S CI，1961年创刊，由美国lnsti：uteForScientificInformation(科学情报研究所，简称Isl)编辑出版，1961/1964为年刊，1965／978为季刊，1979年至今为双月刊。引文索引(CITATIONINDEX)就是用来查找引文著者的论文被人引用情况的一种索引；引文(Citation)是被引用的文献，即原始论文后所附的参考文献(REFERENC E)，科学引文索引主要是报导生命科学、医学、行为科学、物理、化工、工程技术、天体地学等科学领域的引文著者(参考文献的著者)的论文被引用情况和来源著者发表论文情况的一套检索工具。根据1998年对1997年以前文献数量的统计，1997年 SCI收录来源出版物3453种(包括125种专题论文集)共有32634期，摘录来源文献74 万余条(其中著名1．1万余条，署名著者73万余条)，74万余条来源文献的类型主要有：期刊论文、会议摘要、技术札记、新闻、通、编辑材料、综述、勘误、讨论、书评(仅限于在SCIENCE和NATURE两刊中摘录)、书目(以往在综述中反映)、记、年表、重新打印等。1998年收录引文文献1617余万条。1997年收录生物医学及药学期刊1343余种，与美国《医学索引)重复收录的有1121种，占83．5％；收录中文期刊10种，而1993年则收录中文13种(其中收录湾期刊4种)，见以下目录：科学引文索引的独特作用SCI最显著的特点是反映了论文的引用和被引用关系，其作用主要有如下几点： 2．1对引文的评价作用读者可以通过引文索引揭示被引论文产生的社会效益的作用，具体是：①某篇论文被多少人引用，从而可就该论文(尤指被多人引用的论文)对科技发展所产生的影响和社会价值作出评价；②研究人员也可通过引文索引了解自己的研究成果所产生的社会效益及价值。2．2 对引文著者的评价作用通过检索某引文著者的全部论文，得以从文献数量上对该著者出书论文发表球球2043944129的专业特长和学术造诣及其对科技发展所作的贡献作出客观的评价。2．3在相近课题同行之间的桥梁作用通过检索其著者的某篇论文被哪些人引用，然后通过来源索引可了解到来源著者的单位和地址，这种引证和被引证的关系揭示了信息的交流与反馈，从而了解相同或相近课题研究者的分布和在同行之间架起了相互交流的桥梁。2．4对科研动态的分析作用通过团体索引对大到国冢、小至单位科室所发表的论文的统计分析，从而可以了解国家或单位科室的科研成就和科技发展动向，便于对口学习。 3.SCI的编排结构及查找途径3．1编排结构SCI收录文献范围广、检索途径多、编排体例独特，在了解查找方法之前先介绍一下SCl的编排结构，SCI目前每年出6期，每期分为A，B，C，D，E，F六个分册，1997年以前是A ，B，C，D，E五个分册，1988年第4期
生物信息学在生物医学文献中自动提取疾 病基因点突变信息的运用 生物信息学(Bioinformatics)一词由美籍学者林华安博士(Hwa A．Lim)首先创造和使用。生物信息学是多学科的交叉产物，涉及生物、数学、物理、计算机科学、信息科学等多个领域。狭义的讲，生物信息学是对生物信息的获取、存储、分析和解释；计算生物学则是指为实现上述目的而进行的相应算法和计算机应用程序的开发。这两门学科之间没有严格的分界线，统称为生物信息学。生物医学研究的重要目标就是找到突变和相应的疾病表型。但是大多数的疾病相关的突变数据都以文本的形式埋藏在生物医学文献之中，缺乏必要的结构来便于检索和查找。 信息的快速更新和持续增长的文献储存使得提取这些突变信息变得困难。蛋白质和DNA的突变信息储存在像Mendelian inheritance in man(OMIM)和Swiss-Prot 等数据库中。数据挖掘的方法从这些数据库中提取突变信息可以达到0.98的准确性，但是还没有正确的自动转到疾病相关的突变的方法。现有算法可以实现鉴定点突变（比如MutationFinder）或者突变和其相关的基因以及蛋白质的名称（比如MEMA和MuteXe）。大多数“突变+基因”的方法可以通过各自不同的界面和算法来实现对点突变信息的表述和文本数据收集。比如：Mutation Grab采用基于图表的（Graph based）的方法，而MutationMiner采用结构可视化的方法来表现。但是所有方法都关注于提取点突变和相关基因的正确性。 新的高效的从生物医学文献中鉴别点突变以及他们和疾病表型的关系。结合了数据挖掘（data mining）和序列分析（sequence analysis）来鉴定点突变和相关疾病。采用PubMed引擎来从MEDLINE中检索一系列摘要。将词汇索引控制在MEDLINE's Medical Subject Heading (MeSH)。根据MeSH提交一个简单的查询“mutation"然后下载所有可用的摘要，为XML格式。用MetaMap来鉴定疾病 状态。在生物领域中，最大的词汇资源为United Medical Language System （UMLS）Metathesaurus。MetaMap是专门发现Metathesaurus中的生物医学实体的软件。用MetaMap来鉴定题目和摘要中的疾病的名称。其方法如下：（1） EMU突变抽取工具被用来从突变疾病相关的文库中来鉴定和检索突变。同时也从文本中识别基因的名称。（2）应用一个过滤器(SEQ_Filter)来排除所有氨基酸和报道的相关蛋白序列中的不同的突变。（3） SEQ前后的结果可以人为建立一个全注释的疾病突变数据库。 首先，用EMU来鉴定基因信息。在生物医学文献中，基因和蛋白质的记录没有一个标准的形式。所以自动抽取基因和蛋白质信息是在数据挖掘上的一个很大的挑战。我们采用在内部词典中来进行字串查找(string look up)来确的基因的名字。使用Human Gnome Organization(HUGO)和National Center for Biotechnology Information (NCBI)的数据库来进行。所有和密码子一样的基因名称被除去了。其次，用SEQ_Filter来过滤氨基酸位置上不一致的突变。对于在摘要中鉴定的基因名称和突变，都可以在NCBI中查找了相应的蛋白质信息。对于每个蛋白质，根据相应位置上的突变来确定野生型的氨基酸。如果在突变位置的野生型氨基酸（或者突变型）至少有一个相关的蛋白质，那么基因和突变之间的联系证明是有效的。最后，建立黄金标准(gold standards)。和疾病基因相