增刊张华等:萝卜叶片总RNA提取方法比较377
为了检验以上三种方法所制备的RNA的完整
性,我们将有关的RNA样品用1%非变性琼脂糖电泳
进行检测,结果(图1)显示Trizol法提取的.趋.RNA中
28S条带都清晰,18S条带有稍微拖尾,5.8S条带清
晰完整,同时还有一条叶绿体转录产物条带也清晰完
整(图1一a),说明提取的总RNA较好。改进异硫氰酸
带28S和18S,并且28S的亮度约是18S条带亮度的2
倍(图1.b),说明在提取过程中没有发生RNA降解,图1三种DNA提取方法提取的多卜叶片的
完整性好。SDS一酸酚法提取的RNA条带很清晰,不总DNA电泳图谱
但28S和18S条带清晰完整,而且还有其他叶绿体转用浓度为2×107efu/rnl的十字花科黑腐病菌
录产物的条带也很清晰(图1一c),说明提取的总RNAL^“聃啪“甜∞砷耐rispv.似mp甜tri“m‘J
苎苎烹,翼复发生旺璺,竺芋竺兰一酸曼薏鼍鼍筻R望全改进霎蓑篡嚣慧墨嚣摅髫爹怒凑:
中基因组总DNA污染较为严重,而且从条带上看改聂。i£磊i蕃嘉;1磊磊变性磊磊磊鼋篆釜藉蓉测
进SDS一酸酚法提取的总RNA电泳条带比其他两个
M:100bpLadd。,PIu。,。:T,i。ol法提取的总RNA,方法提取的总RNA电泳速度要慢(图1一c),这可能是b:改进异硫氰酸胍法提取的总RNA㈣改进sDs一酸酚法因为含有较多的基因组总DNA的缘故,干扰到其提取的总RNA
RNA的迁移速度。从三种方法提取的总RNA样品的
电泳图中可以得出,异硫氰酸胍法提取的总RNA质
量高,完整性好,可用于下一步的小RNA的分离。
2.2不同方法提取的总RNA样品纯度和得率分析
测定RNA样品的A:∞/A:。。和A:。。/A:。。的比值是判断RNA的纯度常用方法。纯的RNA样品的A。。。/A:。。的比值是(2.04-0.1),不管是RNA还是DNA,A。。。/A:。。的比值应大于2.0但小于2.4。通常A。。。/A:。。的比值低,表明分离的RNA有蛋白质污染或RNA发生降解。A。。。/A:。。的比值不在这个范围的说明样品有污染,必须采取一些纠正措施。A。。。/A:。。的比值低则可能有胍盐(来自细胞裂解缓冲液)或卢一巯基乙醇污染。如果A:。。/A:。。的比值大于2.4,应用乙酸钠和乙醇重新沉淀RNA,然后用70%乙醇洗沉淀2~3次,如果是植物RNA,低于A:。。/A。。。的比值可能表明有多聚糖的污染[111。
为了检测以上三种方法所制备的总RNA的纯度,我们测定了它们的A。。。/以。。。和A。。。/A:a。的比值,结果(表1)表明,Trizol法提取的总RNAAz∞/A。。。为1.87,A:。。/A:。。的值为1.15,两者的比值均小于2.0,说明用Trizol法提取的总RNA样品中有大量蛋白质污染。改进的异硫氰酸胍法和改进的SDS一酸酚法提取的总RNA,A姗/A:。。的比值在2.O~2.1之问,A250/AⅢ的比值在2.O~2.2之间,说明这两中方法提取的总RNA质量和纯度都较好,样品中的蛋白质和其他杂质较少。
表l不同提取方法所得的RNA的纯度和得率
Tab.1YieldandpurityofRNAsisolatedusingdifferentmethods
3讨论
由于不同的生物材料的内含物组成及RNA含量的不同,使得用不同的RNA提取方法提取同一生物材料所得的RNA的质和量会出现很大差别‘州‘。。为了寻找一种高得率、高质量的萝卜叶片总RNA提取方法,本工作通过分析RNA的电泳图谱、得率和纯度,比较了用Trizol法、改进的异硫氰酸胍法和改进的SDS一酸酚法提取的萝卜叶片总RNA的质量,发现用改进的异硫氰酸胍法提取所得的总RNA得率高、纯
萝卜叶片总RNA提取方法比较
作者:张华, 韦香, 陈相妤, 唐纪良, 唐东阶
作者单位:广西大学生命科学与技术学院,广西,南宁,530004
刊名:
广西大学学报(自然科学版)
英文刊名:JOURNAL OF GUANGXI UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION)
年,卷(期):2009,34(z1)
被引用次数:1次
参考文献(13条)
1.SAMBROOK J;FRITSCH E F;MANIATIS T M Molecular cloning:a laboratory manual
2.侯义龙;张开春;吴禄平果树组织中总RNA提取的新方法[期刊论文]-沈阳农业大学学报 2002(02)
3.KATIYAR-AGARWAL S Discovery of Pathogen-Regulated Small RNAs in Plants 2007
4.ZHOU J H;PESACRETA T C;BROWN R C RNA isolation without gel formation from oligosaccharide rich epidermis 1999
5.CHOMCAYNSKI P;SACCHI N Single-step method of RNA by acid guanidinium thicoyanate-phenol-chloroform extraction 1987(01)
6.夏海武;吕柳新;陈桂信羊蹄甲果荚中总RNA提取的新方法[期刊论文]-分子植物育种 2006(01)
7.张玉进;孟祥春;潘瑞炽非洲菊总RNA提取方法的改进[期刊论文]-植物学通报 2001(06)
8.ROBERT E;FARRELL J RNA分离与鉴定实验指南:RNA研究方法 2008
9.秦伟闻;哈斯阿古拉;潮沼蒙转基因河套蜜瓜新品系育种过程的方法及其生态适应性[期刊论文]-华北农学报2005(z1)
10.BEKESIOVA I;NAP J;MLYNAROVA L Isolation of high quality DNA and RNA from leaves of the carnivorous plant Drosera rotundifolia 1999
11.刘志;杨永华CTAB法提取中草药材滇紫草细胞的总RNA[期刊论文]-生物技术通报 2004(04)
12.王友华;卢孟柱;段留生棉花幼苗根总RNA提取的改进酸酚法方法[期刊论文]-西北植物学报 2005(04)
13.卢圣栋现代分子生物学实验技术 2001
引证文献(1条)
1.吴成就.伍贤进.魏麟.刘选明.黄星群鱼腥草叶片总RNA提取方法研究[期刊论文]-安徽农业科学 2010(29)
本文链接:https://www.doczj.com/doc/1917291839.html,/Periodical_gxdxxb2009z1112.aspx