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萝卜叶片总RNA提取方法比较

增刊张华等:萝卜叶片总RNA提取方法比较377

为了检验以上三种方法所制备的RNA的完整

性,我们将有关的RNA样品用1%非变性琼脂糖电泳

进行检测,结果(图1)显示Trizol法提取的.趋.RNA中

28S条带都清晰,18S条带有稍微拖尾,5.8S条带清

晰完整,同时还有一条叶绿体转录产物条带也清晰完

整(图1一a),说明提取的总RNA较好。改进异硫氰酸

带28S和18S,并且28S的亮度约是18S条带亮度的2

倍(图1.b),说明在提取过程中没有发生RNA降解,图1三种DNA提取方法提取的多卜叶片的

完整性好。SDS一酸酚法提取的RNA条带很清晰,不总DNA电泳图谱

但28S和18S条带清晰完整,而且还有其他叶绿体转用浓度为2×107efu/rnl的十字花科黑腐病菌

录产物的条带也很清晰(图1一c),说明提取的总RNAL^“聃啪“甜∞砷耐rispv.似mp甜tri“m‘J

苎苎烹,翼复发生旺璺,竺芋竺兰一酸曼薏鼍鼍筻R望全改进霎蓑篡嚣慧墨嚣摅髫爹怒凑:

中基因组总DNA污染较为严重,而且从条带上看改聂。i£磊i蕃嘉;1磊磊变性磊磊磊鼋篆釜藉蓉测

进SDS一酸酚法提取的总RNA电泳条带比其他两个

M:100bpLadd。,PIu。,。:T,i。ol法提取的总RNA,方法提取的总RNA电泳速度要慢(图1一c),这可能是b:改进异硫氰酸胍法提取的总RNA㈣改进sDs一酸酚法因为含有较多的基因组总DNA的缘故,干扰到其提取的总RNA

RNA的迁移速度。从三种方法提取的总RNA样品的

电泳图中可以得出,异硫氰酸胍法提取的总RNA质

量高,完整性好,可用于下一步的小RNA的分离。

2.2不同方法提取的总RNA样品纯度和得率分析

测定RNA样品的A:∞/A:。。和A:。。/A:。。的比值是判断RNA的纯度常用方法。纯的RNA样品的A。。。/A:。。的比值是(2.04-0.1),不管是RNA还是DNA,A。。。/A:。。的比值应大于2.0但小于2.4。通常A。。。/A:。。的比值低,表明分离的RNA有蛋白质污染或RNA发生降解。A。。。/A:。。的比值不在这个范围的说明样品有污染,必须采取一些纠正措施。A。。。/A:。。的比值低则可能有胍盐(来自细胞裂解缓冲液)或卢一巯基乙醇污染。如果A:。。/A:。。的比值大于2.4,应用乙酸钠和乙醇重新沉淀RNA,然后用70%乙醇洗沉淀2~3次,如果是植物RNA,低于A:。。/A。。。的比值可能表明有多聚糖的污染[111。

为了检测以上三种方法所制备的总RNA的纯度,我们测定了它们的A。。。/以。。。和A。。。/A:a。的比值,结果(表1)表明,Trizol法提取的总RNAAz∞/A。。。为1.87,A:。。/A:。。的值为1.15,两者的比值均小于2.0,说明用Trizol法提取的总RNA样品中有大量蛋白质污染。改进的异硫氰酸胍法和改进的SDS一酸酚法提取的总RNA,A姗/A:。。的比值在2.O~2.1之问,A250/AⅢ的比值在2.O~2.2之间,说明这两中方法提取的总RNA质量和纯度都较好,样品中的蛋白质和其他杂质较少。

表l不同提取方法所得的RNA的纯度和得率

Tab.1YieldandpurityofRNAsisolatedusingdifferentmethods

3讨论

由于不同的生物材料的内含物组成及RNA含量的不同,使得用不同的RNA提取方法提取同一生物材料所得的RNA的质和量会出现很大差别‘州‘。。为了寻找一种高得率、高质量的萝卜叶片总RNA提取方法,本工作通过分析RNA的电泳图谱、得率和纯度,比较了用Trizol法、改进的异硫氰酸胍法和改进的SDS一酸酚法提取的萝卜叶片总RNA的质量,发现用改进的异硫氰酸胍法提取所得的总RNA得率高、纯

萝卜叶片总RNA提取方法比较

作者:张华, 韦香, 陈相妤, 唐纪良, 唐东阶

作者单位:广西大学生命科学与技术学院,广西,南宁,530004

刊名:

广西大学学报(自然科学版)

英文刊名:JOURNAL OF GUANGXI UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION)

年,卷(期):2009,34(z1)

被引用次数:1次

参考文献(13条)

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引证文献(1条)

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本文链接:https://www.doczj.com/doc/1917291839.html,/Periodical_gxdxxb2009z1112.aspx

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