研究生时经历过的几次论文投稿发表经验汇总
当年研究生在读学生一枚，今年 6 月份博士毕业，遗传学专业。导师算是本领域的小牛人一个吧，实验室平均每年 1-2 篇 9 分以上的文章，4-5 篇 5 分左右的文章。我的专业是医学遗传学，做精神疾病的遗传学研究，大部分是目前引人争议的 SNP 研究，当然还有后续的功能实验，主要是体外水平的细胞实验。从 2011 年到现在，经历过几次投稿，和大家分享一下经历。本人系天天论文网就职11年的资深论文编辑；工作中与各大医学期刊杂志社进行学术交流过程中建立了稳定的编辑朋友圈，系多家医学杂志社的特约编辑，常年为医学期刊杂志供稿，负责天天论文网医学论文·分检·编校·推送·指导等工作！行内人称：杜老师论文
在园子里也混迹了几年时间，大部分时间在看帖，偶尔回帖，求助过园友，请教过园友，也帮助过园友，鼓励过园友，还刺激过园友，嘲讽过园友，当然，一切都无恶意，只是就事论事，还是希望大家能够投稿顺利，多多发文章。
Nature&Science：这两个杂志我都没有中稿过，只是有幸投过一次 Nature，一个星期编辑部拒稿。我的导师对这两个杂志充满了热情，实验室几乎有点水准的文章老板都要从这两个杂志开始投，无一例外全部拒稿，虽然很多文章最后也中了 Genome Research、American Journal of Human Genetics 等级别的杂志，但是在这两个杂志连送审的机会都没有，这也导致我在看其它人投这两个杂志时一般都充满了悲观情绪，虽然文章的创新性很重要，但是我感觉那是要建立在扎实强大的工作基础之上，“拍脑袋”想出来的科研去试这两个杂志，难。
Molecular Psychiatry（IF>12）：精神病学领域的“老大”，近几年影响因子蹿升很快，在 2011 年甚至达到了 15 以上，我做的每一个结果比较好的课题文章几乎都要从这个杂志开始投稿。一个字，难，似乎主编对中国人的文章有些保留意见，当然我没有证据这样说。送审过三次，两次是原创性研究的 letter to the editor，编辑部对这种格式的文章处理速度很慢，一般都要在编辑部放一个月左右才决定是否送审，审稿速度也不快，都是一个 positive 意见一个 negative 意见，主编拒稿；目前还有一篇 original article 的文章在这个杂志审稿，一审两个审稿人，都是很 positive 的意见，提了几个小问题，但是主编只给了 reject and resubmit 的机会，连 major revision 都不是，目前正在等待二审结果中。哎，投这个杂志的经历全是心酸。
American Journal of Psychiatry（IF>12）：精神病学领域的“老二”，这个杂志相比较 molecular psychiatry 要 nice 许多了，虽然它主要收
录临床文章，偶尔也有 genetics 方面的，我们的一篇文章在 molecular psychiatry（letter to the editor）拒稿后，我们把文章扩展成 article，改投到这个杂志，1 月半月，一审结束，major revision，再过一个月，接收，这是我第一次投这个杂志，就有幸中稿。这个杂志的审稿速度快，编辑很 nice，一般会选一个你推荐的审稿人审稿，但是不代表这个杂志不 critical，我们也发生过投稿该杂志，两个审稿人意见很 positive，编辑部直接拒稿的事情。这个杂志也收录 letter to the editor 格式的文章（原创性研究和 comment），但是对字数要求极为严格，算上参考文献不能多于 500 字。在 2012 年的时候我投过一篇原创性的 letter 到该杂志，一审是 minor revision，结果修改后被拒，主编在 decision letter 里面一再解释，说你们的文章很好，按照审稿人意见修改的也很好，但是非常抱歉我们的杂志空间有限，不能接收你们的文章。我的导师知道之后只说 this is life，这样的结果连 argue 的机会都没有。在去年年底，做了一篇目前正流行的核磁共振影像学的研究，论文咨询工作QQ1：258347976 以 letter 格式投到该杂志，40 天审稿结束，major revision，修改后没几天就接收了。随后没几天，我在阅读这个杂志某一期发表的 article 时，觉得有一点问题，就连夜写了个 comment 给该杂志，也是 40 天的时间，编辑部通知我直接接收；在这里不禁要感叹下编辑部真是很 nice，这篇 comment 接收后我跟编辑部联系问能否再加一个作者，本以为会遇到点麻烦的，结果主编直接问我要了姓名和邮箱，甚至没有提出疑问。
American Journal of Human Genetics（IF>10）：遗传学领域的“老二”。投过两次这个杂志，一次送审，两个审稿人，一个 positive，一个中性意见，编辑部拒稿，我们写了封反驳信，无果。我的导师从 2003 年建立实验室以来中过两次该杂志，都是在 2009 年以前，研究内容是进化和人类迁徙方面的。在近两年，似乎 AJHG 的主编换了，杂志收录的文章风格也变了，大部分都是疾病的家系研究加上后续功能研究，少数的 GWAS 文章，其它类型的文章很少见了。在 2011 年年底，我们实验室投过一篇藏族高原适应的文章到 AJHG，一审 major revision，按照审稿人的意见修改后，结果拒稿，在一审中没提什么问题的第二个审稿人结果在二审的时候重新提了很多问题，甚至包括了一些政治敏感问题，我记得好像是说“西藏是一个国家，虽然中国政府认为它隶属于中国，但是美国不这样认为，作者想把文章投到美国的杂志，就要遵循美国的规矩”，还说了很多类似的话，由此可见，中国人在投稿的时候还是会受到歧视的。提一个
小插曲，我曾经跟一个台湾同行寻求合作，他回邮件说很乐意合作，但是在他的 affiliation 中只能是 Taiwan，而不能是 Taiwan，China。。。不过也并不是经常会遇到这种情况，在我们实验室近两年在这个领域发的文章越来越多，和国外同行的交流也越来越多，在最近的发表和待发表的几篇文章中都有很多国外的同行参加了我们的研究。不知是不是主观意向，我们去年开始投的文章遇到的审稿压力比以前小多了，经常是审稿人提几个小问题，然后文章接收。
Human Molecular Genetics（IF>7）：遗传学领域的经典杂志。我的导师在建立实验室后中过几篇该杂志文章，最晚一篇是在 2008 年。在近两年，感觉 HMG 跟 AJHG 一样，杂志收录的文章风格有所改变，功能研究的文章逐渐增多，大多是转基因动物文章，遗传学分析和进化分析的文章开始减少。不过该杂志收录的功能研究文章仍显得粗糙，与专业的功能杂志文章仍有不少差距。遗传学分析文章目前只看到过全基因组关联分析研究（GWAS）和大样本量的大范围 marker 的 meta-analysis。我们实验室（包括我）在近两年投到该杂志的文章均未送审，且都是在编辑部放了超过 20 天之后才通知拒稿的。
Molecular Biology and Evolution（IF>5）：我并未投过该杂志，但是这却是我们实验室最经常投稿的杂志，我的导师目前也是该杂志的副主编。由于 MEGA4 文章引用量巨大的原因，MBE 杂志在 2010 年的影响因子达到 9.8，一举超过 PNAS。随后 MBE 对文章的要求比之前要提高很多，单基因的进化分析文章相比之前已很难在上面发表，编辑一般会要求补功能实验，估计也是想借此之机提高杂志的档次吧。不过在随后的一年（2011），MBE 的影响因子又降到 5.5 分，并且在 2012 年仍未升上去，去年 MBE 又发表了 MEGA5，不知道这篇文章对 MBE 的影响因子会有多大影响，今年 7 月份就可以看到了。我们实验室藏族高原适应的文章被 AJHG 拒稿后，改投到 MBE，主编给了大修机会，目前仍在修改中，不知道能否最终中稿。。。
Schizophrenia Research（IF>4）：一个专门研究精神分裂症的杂志，影响因子常年在 4-5 分之间，对文章的质量要求没有那么高。我目前已经在该杂志发表过三篇文章，2011 年第一次在这个杂志投稿，一审 4 个半月，8 个审稿人，均是 positive 意见，不知道主编怎么想的；论文咨询工作QQ2：2035204840 第二篇文章一审 4 个月，1 个审稿人；第三篇文章一审 5 个月，一个审稿人。几乎每一篇文章我们都要催稿，不过催也没用，感觉主编不是特别热情，只是让我们 be patient。如果不是逼不得已，不会投该杂志。
PLoS Genetics（IF>8）：我的导师经常
说这个杂志很 picky，我有幸以第二作者身份投过一次该杂志，一审两个月时间，三个审稿人，两个 positive 意见，一个中性意见，主编给了大修的机会，但是需要补实验。结果二审的时候第三个审稿人，就是一审时中性意见的那个人，提了很多意见，甚至提出我们的研究没有 biology significance，结果编辑部讨论后拒稿。负责我们文章的副主编是我导师的熟人，他和我的导师说这文章没有 argue 的机会了，编辑部其它人都同意第三个审稿人的意见，只能拒稿。
PLoS One（IF>4）：相信很多园友都有投稿该杂志的经历吧，我就说说我所知道的。这个杂志投稿过程中需要填写的要求相对其它杂志要多一些，例如 ethnic assessment 等，另外，因为投稿量巨大的原因，文章在投到该杂志之后要等 20 天左右才能 invited editor，但是在开始审稿后速度则相对快一点，一般主编要求审稿在 10 天内审稿结束，所以文章投到 PLoS One 后如果没有意外，在 40 天内都能收到审稿结果了。我的导师是 PLoS One 的 academic editor，也认识很多 PLoS One 的其它副主编，在投稿时会推荐自己认识的副主编。我在去年有一篇文章投到 PLoS One，是我导师的朋友负责该文章，两个审稿人也是我们推荐的，所以从投稿到接收都非常顺利。PLoS One 的投稿量巨大，academic editor 的数量也很多，也包括很多中国人，即便如此，每个 academic editor 的工作量也是相当大，我登陆我的导师的 PLoS One 账号，发现几乎每天都有新文章的 invitation。
Biological Psychiatry（IF>8）：影响因子在近几年都在 8-9 之间，文章的质量相对于 MP 和 AJP 有一定差距。在投稿时需要 Manuscript Submission Form，每个作者都要纸质签名然后扫描合并成一个文件由通讯作者上传。编辑部对文章的初筛并不十分严格，一般会送审。审稿速度很快，一般一审最多 45 天就有消息了，我经历过几次审稿最少的是送了三个审稿人，最多是五个审稿人，估计是主编一次性同时送了几个审稿人。但是在做根据审稿人意见做决定时则相对严格很多，我最近的一次投稿是三个审稿人，一个没有意见，建议直接接收，一个建议小修，一个建议拒稿，主编直接拒稿。遗憾的是，到目前为止都没有在这个杂志上发表过文章。
Schizophrenia Bulletin（IF>8）：一个研究精神分裂症的小众杂志，每年收录的文章不多，投稿也不算多，我在 12 月份投稿时看编号应该一年投稿不超过 600 篇，主要收录精神分裂症的临床研究，其它方面的研究并不多。投稿状态一般是先 awaiting editor assignment，然后就是 under review 了，没有 with editor 这一阶段，所以在投稿前期文章是否送审并不清楚，但是这
个杂志效率很快，从投稿到一审回来一般是 40 天，最长不会超过 2 个月。提前跟天天论文网https://www.doczj.com/doc/0918832184.html,约定这个杂志编辑部对文章的要求跟 biological psychiatry 差不多。比较新奇的是这个杂志给修改机会的状态是 Acceptable Only If Adequately Revised & Requiring Rereview，而不是 major revision，minor revision 或者 reject and resubmit。遗憾的是，我曾经有一次投稿得到修改的机会，但是二审被拒了，第一个审稿人在一审时要求我们加一篇 Genome Research 上的文章，只告诉了第一个作者的名字，我们在 Genome Research 上并未搜到审稿人要求加的文章，审稿人也以这个理由拒稿了，后来我们重新搜索这个作者的文章，发现是发表在 PLoS Biology 上的文章，而不是 Genome Research，不过为时已晚。
American Journal of Medical Genetics Part B: Neuropsychiatric Genetics（IF>3）：医学遗传学的经典杂志，影响因子不高，对文章的要求也相对低一点。我在 2012 年投过一次该杂志，审稿 40 天，major revision，第一个审稿人提了 5 个 minor comments，很容易回答；第二个审稿人只提了英语语法问题，总的来说都不算很难回答，最后接收也没遇到太大问题。这个杂志收录 review，article，brief communication，letter to the editor 格式的文章，有时候也收录较系统的阴性结果文章，对于文章有一定质量，又急于发表的，这个杂志是个不错的选择。
The World Journal of Biological Psychiatry（IF>2）：一个小众杂志。影响因子从 2008 年 1 分多逐渐增长到 2010 年 5 分多，我有一篇文章在 2010 年投到这个杂志，审稿时间巨长，一审 5 个多月，开始送了两个审稿人，第一个审稿人两个小问题，第二个审稿人就比较复杂了，在开始说文章做的很好，但是提了巨多的问题，A4 版的 word 足足有 4 页多！所以主编又送了第三个审稿人，也没有意见，因此给了大修的机会，二审一个月后文章接收。这个杂志的投稿让我后悔不已，不仅审稿时间长，而且影响因子在 2011 年降到了 2 分！我的文章在 8 分多的杂志（schizophrenia bulletin）获得了修改的机会，因为某些原因被拒稿，却没想到最后只投到了一个 2 分多的杂志上。更可笑的是，在 2011 年影响因子出来之后，在之后的半年里该杂志在主页上还挂着 2010 年的影响因子（5 分多），然后说自己的杂志在 psychiatry 领域排名第 7。到 2012 年了，还在挂着 2010 年的影响因子就有些不像话了，没想到杂志居然把影响因子这一版块取消了，不在主页显示影响因子和杂志排名是多少了。在可以预见的将来，我都不会再投稿该杂志。
PNAS（IF>9）：非常遗憾我目前还没有在该杂志发表文章的经历，只投稿过一次，并未送审，主
编本人提了点建议，说增加转基因动物模型可以考虑送审。所以对这个杂志的审稿要求并不十分清楚，不过很奇怪，我们实验室前阵子投的两篇文章到 PNAS，均未送审，但是投稿到影响因子更高的 AJHG 杂志，则均送审。我们实验室去年投的藏族迁徙的文章到 PNAS，送审，一个月审稿意见就返回来了，一个 positive 一个 negative，主编拒稿。不知道文章中有大牛（美国科学院院士？）是否更有利投稿，不过在 2009 年，我们隔壁实验室的老板做的一篇转基因动物的文章，准备投到 PNAS，之前联系了一个美国科学院院士让他当共同通讯作者，由他来推荐，文章最后接收。
不知是不是主观感觉，从 2012 年开始，投文章的难度相对以前要明显大很多了。这一年，实验室经历过三次修稿（两次大修，一次小修）后被拒，直接拒稿的次数更是多很多。编辑部根据审稿意见的决定比之前更加的 critical，可能是因为现在好文章的产量相对以前明显增多的原因，另外，有人说因为这两年国外的科研形势也不好，经费不好拿，所以审稿人和主编的心情也相对差一些，对待其它人的文章也更加挑剔一些，哈哈，无论如何，做出好的无可挑剔的文章才是王道。
合作：我现在所做的课题是在我进实验室之后才慢慢开展的，主要是做中国人群中精神分裂症的遗传学研究，而目前搞这些研究的主要是国外的科研人员，国内主要集中在上海交通大学、清华大学和四川大学。在我们开始研究的初期，样本量小，也不认识很多其它的国内国外同行，所以投出去的文章有时候会很波折，经常是改了又改，这样的情况持续了两年多，慢慢发了几篇 4 分左右的文章，又因为运气好发了一篇 10 分多的文章，反响很好。后来开始慢慢意识到合作的重要性，尤其是和国外实验室的合作，所以开始逐渐联系国外的实验室。我的导师为了锻炼我，并不亲自联系合作，而是让我自己来操作。我在平时阅读文献时就慢慢了解到哪些国家有哪些实验室有样本，有 GWAS 数据，就会给他们写邮件，他们当中有一些人回邮件了，但是很多都先问我们有没有研究基础，以前发表过哪些文章，看了我们发表的文章之后才决定给我们数据。就这样，通过几次合作，慢慢认识了越来越多的国内国外的合作者，在我现在的一篇正在审稿的文章，有超过 50 个来自国外的共同作者，超过 40 家的合作单位，美国，德国，英国，法国，瑞典等，其中有很多是大牛级别的人物。
也是在这篇文章中，我的导师第一次跟我提到 "suggested reviewers" 对文章审稿的重要性，他让我问问国外合作者的意见，问问他们有哪些建议的审稿
人，虽然不一定会送到他们手中审稿。在我询问过国外合作者之后，他们也表示同意我导师的说法，"suggested reviewers" 非常重要，并给我推荐了几个国外的审稿人，就这样，我们总共推荐了 6 个审稿人，其中只有一个审稿人是中国人，还是在国外工作的。幸运的是，在我们投稿后，主编真的选择了一个我们推荐的审稿人，别问我们怎么知道的。。。除了这篇正在审稿的文章，从去年年底开始我的文章都由自己投稿，在填写 suggested reviewers 也更加认真，没有想到，在最近投的 4 篇文章中有 2 篇文章都送到我推荐的审稿人手上，还是我刚毕业两年的师兄手上（目前在美国做博后），这两年，我和我师兄也一起发表了很多文章。虽然很多杂志在投稿须知里说不要推荐近期和你有合作关系的科研人员，但是似乎也有一些杂志并不在意，估计主编在送审的时候也没有自己查我们推荐的审稿人的背景。
说个题外话，在近两年的合作中，除了给我的文章带来了很多益处之外，我在前段时间申请博后时也有一位德国的老板给我写了推荐信，虽然我们并未谋过面，也未通过电话，只是通过邮件联系，但是真的很感谢这位导师。而我即将工作的博后的老板，一位在霍普金斯的美国医学科学院院士，也曾经跟我们有过两次合作经历（文章已发表），而我之前提到那篇目前正在审稿的文章，也是在我们写完初稿后让我的博后老板帮忙阅读修改（那时他还没有给我博后 offer），并提了一些很好的意见。
Journal of Psychiatric Research（IF>4）：由于近年来做 psychiatry 研究方面的人逐渐增多，很多这个方面的杂志的影响因子都有所提高，JPR 在去年的时候影响因子还没有达到 4，今年的影响因子已升到 4.6。我和我的师兄有一篇共享一作的文章，投过几个杂志（影响因子从 12 到 8 到 4），均被拒，包括其中一次小修被拒，再上一次被拒稿之后，我放弃了这篇文章，于是我师兄开始单独投这篇文章，我也从共同第一作者变成其它作者（我自愿的）。我师兄将文章投到 Journal of Psychiatric Research，审稿两个月，昨天刚刚将审稿意见发过来，编辑给了修改的机会。这是一篇阴性结果的文章，两个个审稿人，都提了技术上的问题，我把编辑发的邮件和部分审稿人的意见贴出来，和大家分享一下。
Journal of Medical Genetics（IF>6）：医学遗传学的经典杂志，比 Human Molecular Genetics 稍微低半个档次吧，但是近两年收录的文章的档次也提高很多，很多是 GWAS 研究，涉及的后续功能研究不多。我师兄在 2008 年有一篇精神分裂症的候选基因相关性分析的研究文章，被 Schizophrenia Reseach 拒稿后，改
投该杂志，一审一个月多一点（37 天），两个审稿人都只提了一些小问题，二审 10 天后接收。但是在我 2010 年开始投稿后，投过两次该杂志，均未送审（不到 10 天时间拒稿），那时 GWAS 研究开始逐渐增多，我后来和一个日本同行交流过，他说现在的 JMG 对于 psychiatry 的遗传学有很大成见，因为目前 psychiatry 的疾病诊断标准并不明确（即由于目前诊断的局限，精神分裂症并不一定真的是精神分裂症，可能是由很多亚型疾病混合在一起的，或者甚至是其它精神疾病如双向情感障碍等），所以遗传学分析存在很大问题。不知他说的是否正确，不过在这三年 JMG 收录的 psychiatry 方面的遗传学分析文章确实寥寥无几，大部分是 cancer 的遗传学研究和某种罕见疾病的 case report。
一篇 meta 分析文章的悲催投稿经历
我们实验室截止到目前一直在做某个基因在精神分裂症发病中的作用，包括遗传学分析和现在的动物模型研究，这个基因的一个 SNP（用 rs1234 表示）在欧洲的 GWAS 研究中首次被报道。我们遗传学分析的文章已经发表在 American Journal of Psychiatry 和 American Journal of Medical Genetics，其中发表的数据大部分都是我们自己产生的中国人群的 original data。截止到 2012 年的 7 月份，在中国人群已有超过 10 份样本产生了 rs1234 的 data（超过 20000 份样本），但是结果却严重不一致，我们的前期研究结果支持 rs1234 在中国人群中并不与精神分裂症相关，而有一些研究小组则报道了显著结果，为了系统的证实 rs1234 在中国人群是否与精神分裂症相关，我们利用中国所有可以利用的 data 做了 meta-analysis，结果也支持 rs1234 并不与精神分裂症相关，但是 p=0.10。
这篇文章的意义：我和我的导师都认为该文章的意义并不是特别大，但是为了科学的严谨性，以及为以后实验室（包括自己和其它实验室）的研究提出指引方向，我们还是决定将这篇 meta-analysis 文章投出去。我们第一次以 letter to the editor 的格式投 molecular psychiatry，精神病学的旗舰杂志，审稿 50 天（9 月 22 日 -11 月 12 日），拒稿，两个审稿人的意见如下：
Reviewer #1 (Comments to the Author):
This report of no association of rs1234 in china is credible, although I find the final recommendation less so. If it is associated with endophenotypes that are true intermediate phenotypes for SZ, then the failure to find association to SZ becomes simply one of power. So the final conclusions contradict the primary conclusions. I think the primary conclusion is more strongly supported.
Meta analyses on the scale conducted are fairly trivial. I would not think molecular psychiatry is the correct place for them.
Reviewer #2 (Comments to the Author):
This ma
nuscript describes a meta-analysis of rs1234 in Chinese samples. The marker was reported to be associated with schizophrenia in European populations in a large association study. Overall, the method used in this paper is appropriate, but I feel that the authors might have over-interpreted their results. The appropriate conclusion is that the analysis did not provide clear evidence, one way or the other. The reasons are below:
1. In association studies, a replication study normally requires much larger sample size. In this case, the original study was done with 7,308 cases and 12,834 controls, the reported OR is 1.12. This meta analysis collected a sample of 8,460 cases and 11,549 controls. Given the winner's curse, we would expect a smaller effect size, therefore, for a direct replication, this sample size is marginal, as shown in their own power calculation with an OR of 1.1. If we use the actual OR of 1.06 to do the calculation, the power may be less than 80%.
2. For this analysis, it is a test if A allele is a risk factor for schizophrenia, so it can be interpreted as a one-tailed test. Under this circumstance, a p value of 0.12 can be interpreted as significant, supporting the association of A allele with the risk to schizophrenia. While this interpretation may be liberal, interpreting this as evidence of no association is also problematic.
A minor issue is the use of image data. I think it is unnecessary in this manuscript. A negative association of this SNP with those brain structural phenotypes should not be interpreted as no association of the marker with the disease, or vice versa.
这次投稿的时候在 meta-analysis 还包括了 brain imaging 的 data，但是两个审稿人的意见并不 positive，因此主编拒稿，也在我们的情理之中，后来我们又将该文章扩写成 article，改投到 schizophrenia bulletin，审稿 26 天（11 月 19 日 -12 月 15 日），拒稿，审稿人的意见如下：
Referee: 1-----Comments to the Author
In this study the authors examine the effect of the putative schizophrenia risk SNP rs1234, by a meta-analysis of previous studies in Chinese. They further also study the effect of this SNP on brain structures in healthy Chinese subjects.
The study of risk variants for schizophrenia in populations other than that of Western European decent is very important and interesting, and the methodology of the paper seems sound.
However, my major concern is that in my opinion the present paper does not add enough to what is currently already known about the subject (and for example presented in the individual studies that are part of the meta-analysis). The additional analysis of brain structures also seems a bit "forced", as this analysis was only performed on healthy controls, not on patients with schizophrenia. In previous studies, effects of rs1234 on (functioning of the brain) were sometimes present in schizophrenia patients while absent in healthy controls.
Othe
r more minor concerns:
- Spelling and grammar is sometimes poor and this should be corrected.
- The authors should go into a bit more detail in the analysis of brain structurs, for example in the results section. It would also be more correct to speak of "association with volumes of brain structures" instead of "association with brain structures".
- The title does not reflect the brain structure analysis, as this analysis has nothing to do with rs1234 and schizophrenia risk in Chinese.
- At the end (page 25), after the Supplementary Material, there is a second list of References. This seems to be a mistake, as the references are not corresponding to the right numbers in the manuscipt or the Supplementary Material.
Referee: 2-----Comments to the Author
The article described a meta-analaysis of rs1234 association with schizophrenia in Chinese samples. With a reasonable combined sample size, the analysis did not find evidence to support the association. As acknowledged by the authors, the sample size was underpowered given the observed OR. Based on these analyses, I would suggest that the authors revise their conclusion to "collectively, this analysis did not find evidence ...", because the lack of association may be due to the sample size, and further analyses may be necessary.
Minor suggestions:
1. The discussion of CMYA5 and other genes is not relevant to this article, because a smaller or larger OR at a unlinked locus has no bearing on this SNP.
2. Please drop the word "strong" in the description of association, since an OR of ~ 1.1 is not really strong.
根据第一个审稿人的意见，我们在文章中细致的描述了纳入的样本的特征（包括年龄、性别比例等），并加入了一些 meta-analysis 的必要分析，另外，我们将 brain imaging data 从文章中移除，该文章彻底变成了一篇 meta-analysis，随后又将文章改投到 biological psychiatry，审稿 40 天（12 月 19 日 -1 月 29 日），拒稿，三个审稿人的意见如下：
Reviewer #1: In this study, the authors conducted extensive meta-analysis of schizophrenia association studies in Chinese populations for SNP rs1234. They did not show an overall significant association. This is an important negative study, showing that despite numerous replications in European population, this SNP does not appear to increase risk for schizophrenia in Chinese people. The study is well done and very clearly written. The number of subjects included in this meta-analysis is large (total ~20,000), and the number of studies examined sufficiently big (11). The authors are cautious in the interpretation of their findings. I have no other comments.
Reviewer #2: This is an important study and the results are potentially very timely and meaningful. It is a very carefully done meta-analysis. They show convincingly that the European GWAS positive SNP is of much smaller if of no risk effect in Chinese samples. The problem with t
his study is that while they show that this SNP is not associated with risk at an acceptable level of significance, they do not show that ** is not a risk associated gene in these samples. As there are other SNPs that have shown association in other samples to risk and to expression of the gene, for this study to be really conclusive. they should also look at other genotypes of interest in this gene, at least to the extent that there are other SNPs that have been genotyped in these samples. If there are not enough studies with other typed SNPs, then this should be noted and explained.
Reviewer #3: This is a fine meta-analysis. But, the additional data produced results very similar to what the authors have already published in AJMG 2012, which concluded "Here, we studied rs1234 and schizophrenia susceptibility in multiple Asian case-control samples (10 Chinese and 2 Japanese samples; N?=?21,062), and the meta-analyses indicated non-significant association of rs1234 with schizophrenia (P?=?0.26), suggesting the same SNP identified in European samples is not predisposing risk in Asians." I did not see much new information from this study.
面对第三个审稿人的意见，我们也很无奈，这是一个 update 的 meta-analysis，但是审稿人揪住这一点提问，拒稿也很正常，只能改投。我们随后将文章重投回 schizophrenia bulletin，但是这次主编没有选择送审，并提出：
One senior editor notes: "Recommend rejection because (i) Chinese meta analysis sample is smaller than the Caucasian samples, (ii) it still finds a suggestive trend for association, (iii) this association has been superseded by recent GWAS studies, reducing interest in this gene."
其实关于这个 SNP 的分析在我们之前的文章中已经包含过一次，并且包含了该基因的其它 SNP（fine-mapping analysis），样本量超过 10000 份，但是因为整体是一个 negative 结果，所以在投稿时屡屡被拒，最后只投到 3 分多的杂志上，审稿人不断提出我们的样本量没有欧洲的分析样本量大，虽然我们做了 power 分析（>80%），要知道，欧洲和美国的研究小组组成了一个 consortium，几十个国家的样本，超过了 50000 份，所以审稿人屡屡说我们的样本没达到 50000 份，虽然我们在文章中做了很详细的解释并且提出了可能的原因，但是仍然无效，真是无奈啊。。。
前两天，我的导师要将该文章投到 Journal of Medical Genetics，我对此并不乐观，因为我感觉 JMG 的主编对 psychiatry 遗传学研究尤其是中国人群的研究存在偏见，果不其然，不超过 3 天就编辑部拒稿了，但是 JMG 杂志的投稿状态很有意思，投稿状态的变化是 with editor---awaiting reviewer selection---awaiting EIC decision---rejected without review，状态显示是在等待选择审稿人，但是其实这只是杂志社一个状态的自动变化，只有出现 awaitin
g reviewer assignment---under review 才表明已经送外审了。
今天，我的导师问我联系天天论文网的杜老师论文咨询QQ：258347976 她这篇文章投哪里？确实是有点累了，在我毕业之前这篇文章可能没有希望接收了，我跟我的导师说不行就投 PLOS ONE 吧，虽然它的影响因子可能会跌破 4。。。哎，一个苦逼研究生的苦逼投稿经历，希望大家能从中借鉴经验，也希望大家新年能够投稿顺利！
第一次帮我的导师审稿文章
前几天，我的导师发给我一篇文章，投稿到 NeuroImage 杂志上面的，主编邀请我的导师审稿，我的导师因为比较忙，直接让找杜老师论文QQ：2035204840让先帮他看一遍文章，提出点审稿意见。其实我们实验室并不太涉及神经影像学的研究，只是在今年发表了一两篇这方面的文章，但也还没有 Online，仍处在 in proof 阶段。不过该文章研究的基因（SNP）与我们实验室前年发表的一篇文章一样，而作者也在文章中多次提到了我们的研究。所以我猜想，会不会是作者建议我的导师作为审稿人了。
从 title page 上面看，该文章是澳洲那边的研究单位完成的，并且作者没有一个是我们熟识的。不过该文章也进一步支持了我们的之前的研究，我在帮导师写审稿意见的时候都倾向于 positive 的，提了 8 个不算难回答的问题，不知道我的导师会采纳几个又是否会再添加一些审稿意见。不过说实话，如果我是这篇文章的作者，我是没有信心将文章投到 NeuroImage 上面的，虽然该研究没有明显的缺陷，但是却算不上新颖，如果审稿人很 critical，那这篇文章被拒稿也很正常。天天论文网专业论文编撰杜老师论文！由于工作的需要我们和多家杂志社建立了良好的合作关系，为你们提供论文方面的服务！另外我们和出版社也有合作，需要出书的，可以联系我，单书单号 国家级出版社，价格优惠！代办专利申请科研基金挂名论文投稿邮箱：zzsztc@https://www.doczj.com/doc/0918832184.html, 虽然我们实验室近些年在精神疾病遗传学相关领域发表了一些文章，不过并没有这方面的杂志邀请我的导师（包括我）审稿，这也是我第一次帮我的导师审稿别人的文章，在经验上难免会很欠缺，如果有这方面经验很丰富的战友，还望多多指导和帮助。