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.基础实验诊断研究.
调节高致病力CA.MRSAOt一毒素表达的
基因筛选及功能研究
李敏胡锦辉李茹张心菊阮斐诒吕元
【摘要】目的从CA?MRSA全基因组水平筛选出除域值感知(quorum
sensing)基因系统以外对a一毒素表达有明显调节作用的基因,并研究其调
节机制。方法使用本实验室构建并已申请国家专利的真核转座酶为基
础的转座系统构建CA-MBSA转座子,并随机插入突变文库。通过用5%
羊血平板筛选出与野生株相比溶血明显改变的克隆,接着用定量RT-PCR
以及WB等实验筛选出a一毒素表达明显下降的突变菌株,运用随机引物
反向PCR和测序等方法鉴定出突变基因。通过基因互补表达实验、小鼠
菌血症与皮肤脓肿模型实验以及荧光定量RT—PCR等方法对目标基因以
及其编码蛋白的功能进行研究。结果在CA-MRSA中建立了一个库容
量约为104个克隆的转座子随机插入突变库,最终筛选出25株仅一毒素表
达明显下降的突变菌株。CA.MRSA野生株溶血直径平均为212mm,而其中AraC转录调节子突变株
(AraC-)几乎无溶血,当将AraC基因互补回突变株(AraC—pTl81araC)后,其溶血直径平均为197mill,
部分恢复到野生株溶血水平。荧光定量RT—PCR结果显示。与CA—MRSA野生株(PSMa为257.30±
37.33,agr为115.60±O.81,d.毒素为3.23±0.21)相比,在AraC冲Ot-毒素、PSMa以及agr表达均
明显下调(叶毒素1.09±0.01:t=10.18,P<0.01;PSMa34.85±2.15:£=5.95,P<0.05;agr35.19
±1.72:t=42.33,P<0.01)。小鼠菌血症模型实验结果为CA—MRSA野生株与AraC.(露±5)差异具
有统计学意义(,=21.34,P<0.01)。AraC-pTl81araC中PSMa、a乳a-毒素(—‰)表达(分别为
PSMa:180.10±15.29,agr:101.50±8.96,Ct.毒素:2.59±0.26)均部分恢复到野生株表达水平,与
CA-MRSA野生株相比,差异无统计学意义(PSMa:t=1.914,P>0.05;agr:t=1.563,P>0.05;Ct一毒
素:t=1.923,P>0.05)。ClpP在AraC-(0.21±0.01)和AmC-pTl81araC(0.17±0.03)中的表达与
CA-MRSA野生株(0.204-0.01)相比,差异无统计学意义(t=O.555,P>0.05和t=0.851,P>
0.05)。小鼠皮肤脓肿模型结果显示,CA.MRSA野生株接种的小鼠皮肤表面脓肿面积为(136.54-
21。45)mm2,AraC-接种的小鼠皮肤表厩脓肿面积(55。69±13.81)1111112,cA—MRSA野生株与AraC-
DOI:10.3760/cms.j.i眦1009-9158.2010.07.019
基金项目:上海市浦江人才计划(A)类资助项目(09PJl402300);国家自然基金资助项目(30900026)
作者单位:200040上海,复旦大学附属华山医院检验医学科(李敏、胡锦辉、李茹、阮斐诒、吕元),中心实验室
(张心菊)
通信作者:吕元,电子信箱:yuanh@lash.stn.sh.cn
作者简介:李敏,女,1975年1月出生。2005年毕业于复旦大学上海医学院临床检验诊断学专业,获博士学
位。2008年于美国NationalInstituteofHealth(NIH)博士后出站回国。复旦大学附属华山医院副研究员,硕士生导
师。主要从事重要病原微生物致病机理的研究。
注:本文在第六次全国中青年检验医学学术会议暨第三届中国检验医学中青年论坛阳普优秀论文奖评选活动
中荣获一等奖。
本文直接使用的缩略语:CA-MRSA(community-associatedmethicillin-resistantStaphylococcm口啪瑚),社区获得
性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌;HA.MRSA(hospital.a啪ciatedmethicillin-resistants蠡叩锄【D。occ郴㈣艘u)。医院
获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌;RT-PCR(mvenm4ranscdpfionpolymenmech茸in地acli帆),逆转录聚合酶链
反应;PSMq(phen01.solublemodulinn),酚溶调控蛋白a;aF(accessory8eriemgIllalor),附属基因调节子;
ClpP(ATP-dependentClpprotease),ATP依赖性Clp蛋白酶;WB(Westernblot)。免疫印迹法
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DNA污染的去除以及逆转录成cDNA按Qiagen公司QuantiTecti陀vei'BetranscriptionKit说明书进行。定量PCR按Qiagen公司QuantiTectSYBRgreenPCRKit说明书在ABI7000荧光定量PCR仪上进行,定量PCR引物见表l,每一基因的标准曲线用0.005-50彬L金黄色葡萄球菌基因组DNA作为模板获得。gyrB为内参,每次实验至少重复3次。
8.统计学分析:采用GraphPadPrism4.0统计软件进行统计分析。RT.PCR检测毒力因子表达值各组间比较采用t检验,小鼠菌血症体内模型的死亡曲线各组间比较采用生存曲线(survivalcurve)的r分析,小鼠皮肤脓肿模型脓肿面积各组间比较采用t检验。P<0.05为差异有统计学意义。
结果
1.红霉素抗性基因er?n插入到CA-MRSA基因
组的单一随机性鉴定:通过随机选取50个阳性克隆,通过PCR以及序列测定方法确定嗍插入位点。结果显示,随机插入率为86%(43/50),无明显插人热点。以珂7,l为探针进行的SoutlIemblot结果显示所有克隆基因组DNA中erm均为单一性插入。
2.对CA—MRSA仅一毒素表达有明显调节作用的基因鉴定:初步筛选出25株理一毒素表达与野生株相比明显下降的突变菌株,这些突变菌株被佩破坏的基因功能预测发现对ot?毒素表达有明显调节作用的蛋白有些为调节蛋白:SAUSA300—2326(AraC-typetranscriptionalregulator)、SAUSA300—0209;有些为膜蛋白:SAUSA300—2057、SAUSA300—2282;有些蛋白与代谢有关:SAUSA300—1676、SAUSA300—0483;有些蛋白功能未知:SAUSA300—1720、SAUSA300_2056。
3.AraC一与野生株及araC基因互补株(AraC.pTl81araC)表型的异同点:与CA—MRSA野生株相比,AraC一在5%羊血平板上几乎无溶血(图1),而AraC—pTl81araC能恢复到与野生株相似的溶血能力。图2是AraC-、野生株及AraC—pTl81araC的生长曲线,AraC一生长比野生株略慢一些,但当将araC基因互补回AraC.后,AraC—pTl81araC生长可以恢复到与野生株相似的速度。
4.AraC转录调节子基因特点及册插入部位:CA.MRSA的AraC转录调节子是含有包括AraC结构域在内的多结构域蛋白,由701个氨基酸组成,AraC结构域位于整个蛋白C端(从第150到250个氨基酸),约由100个氨基酸组成。对AraC转录调节子突变株进行测序发现佩插入部位位于编码AraC结构域基因中部,在AraC结构域第185个氨基酸处,破坏了AraC结构域的结构,使其无法发挥功能。
注:CA—MRSA野生株溶血直径平均为212衄,而AraC一几乎
无溶血,当将AraC基因互补回突变株后(AmC?pTl81araC)
其溶血直径平均为197mm,部分恢复到野生株溶血水平
田1CA?MRSA野生株、AtaC一以及AraC—pTl81araC在5%
羊血平板上的溶血情况
注:AmC.在培养4h末A值为2.07±O.04,在培养8h
末A值为3.57±o.11;CA—MRSA野生株在培养4h末
A值为2.61土O.10。在培养8h末A值为4.12土o.03;
AmC-pTl81araC在培养4h末^值为2.54±0.04,在
培养8h末A值为4.01±O.02。AmC-生长略慢于CA—
MRSA野生株。当将AmC基因互补回突变株后(AmC?
pTl81araC)生长速度与野生株相似
圈2CA—MRSA野生株、AraC一以及AmC?pTl81口waC的
生长曲线
5.AraC转录调节子对CA.MRSA毒力的调节(体内实验结果):通过小鼠菌血症模型和皮肤脓肿模型进一步研究AraC转录调节子对CA.MRSA毒力的影响。图3为小鼠菌血症模型结果,我们连续观察7d,PBS对照组小鼠活动良好,无死亡;CA-MRSA野生株7d末小鼠的存活率只有10%;MaC一7d末小鼠的存活率为50%,小鼠菌血症模型实验结果CA—MRSA野生株与AraC.存活率(孑4-s)差异具有统计学意义(X2=21.34,P<O.01)。图4为小鼠皮肤脓肿模型结果,连续观察14d,PBS对照组小鼠皮肤表面未见脓肿产生,CA—MRSA野生株接种的小鼠皮肤表面脓肿面积为(136.54-21.45)mm2,MaC.接种的小鼠皮肤表面脓肿面积(55.694-
13.81)mm2,CA—MRSA野生株与AraC?小鼠皮肤脓
肿面积差异具有统计学意义(t=3.169,P<O.05)。
图3小鼠菌血症模型实验结果
圈4小鼠皮肤脓肿模型实验结果
6.AraC转录调节子对CA.MRSA重要毒力因子的表达调控:通过定量RT—PCR方法在转录水平分析AraC转录调节子对目前已知的重要的毒力因子如PSMa、agr、a毒素(h/a)以及ClpP的表达调控。表2为AraC转录调节子对CA.MRSA重要毒力因子的表达调控结果,检测结果采用相对定量(检测基因的拷贝数/内参基因gyrB的拷贝数),RT—PCR检测结果各组间比较采用t检验。与CA-MRSA野生株相比,在AraC-中PSMa、agr、Ot.毒素表达明显降
低(PSMa:t=5.949,P<o-05;agr:t--42.33,P<0.01;Ot一毒素:t=10.18,P<0.01),AraC—pTl81araC中
PSMa、agr、仅-毒素(hla)表达均部分恢复到野生株表达水平,与CA.MRSA野生株相比差异无统计学
意义(PSMa:t=1.914,P>0.05;agr:t=1.563,
P>0.05;Ot.毒素:£=1.923,P>0.05)。ClpP也是目前已知的CA.MRSA的毒力因子,实验结果显示,ClpP在AraC-和AraC-pTl81araC中的表达与CA-
MRSA野生株相比差异无统计学意义(t分别为
0.555和0.850.P均>0.05)。
讨
论
MRSA是目前医院感染最常见的病原体之一,MRSA的感染症状轻重不一,严重时可致败血症、心内膜炎等[2]。最近的研究发现与HA-MRSA相比,CA—MRSA的致病力更强,预后差,传播速度更快,其毒力因子及致病机制更是目前国际各研究部门研究热点。2006年CA—MRSA克隆株USA
300一FPR3757
的全基因组测序已完成,从而将对CA—MRSA的致病因子的研究推向高潮…。
从基因组水平筛选自己感兴趣的基因比较有效而可行的方法是利用有效的转座系统构建转座子突变文库。从目前发表的文章看用于构建转座子突变文库的转座系统主要为Tn551或Tn917【sJ,但从我们实验室以及目前发表文献的研究结果发现这种转座系统用于革兰阳性菌后往往插入到几个特定的基因位点,不具有随机性插入到基因组的特点。为了解决这一问题,本实验室构建了新的真核转座酶为
基础的转座系统,研究结果证实真核转座酶为基础的转座系统具有良好的随机性、单一性、稳定地插入到革兰阳性菌基因组的特点,无明显基因的插入热点。这样建立的转座子突变文库具有非常高的随机性和实用性。目前我们已为该转座系统申请了专利(《一种用于革兰阳性菌的高效转座系统》,专利申请号:200910054031.4)。
我们用已申请专利的真核转座酶为基础的转座系统建立了CA—MRSA转座子突变文库。初步筛选出25株Ot一毒素表达明显下降的突变菌株,这些Ot.毒素表达明显下降的突变株elr/R插入到基因编码的蛋白包括有调节蛋白、膜蛋白、与代谢有关的蛋白等。其中erm,插入到AraC转录调节子基因后该突变株与野生株相比几乎无溶血,而将该基因互补质粒转入突变株后可以恢复其溶血功能。AraC转录调节子是由701个氨基酸组成的、由多个功能域组成的调控蛋白,它包含一个保守结构.AraC结构域。对AraC转录调节子家族分子功能的研究在各类原
表2
AraC转录调节子调节毒力因子表达的RT-PCR结果(检测基因拷贝数/内参基因gyrB拷贝数)
调节高致病力CA-MRSA α-毒素表达的基因筛选及功能研究
作者:李敏, 胡锦辉, 李茹, 张心菊, 阮斐诒, 吕元, LI Min, HU Jin-hui, LI Ru,ZHANG Xin-ju, RUAN Fei-yi, L(U) Yuan
作者单位:李敏,胡锦辉,李茹,阮斐诒,吕元,LI Min,HU Jin-hui,LI Ru,RUAN Fei-yi,L(U) Yuan(复旦大学附属华山医院检验医学科,上海,200040), 张心菊,ZHANG Xin-ju(复旦大学附属华山医
院中心实验室,上海,200040)
刊名:
中华检验医学杂志
英文刊名:CHINESE JOURNAL OF LABORATORY MEDICINE
年,卷(期):2010,33(7)
参考文献(14条)
1.Hart E;Yang J;Tauschek M RegA,an AraC-Like protein,is a global transcriptional regulator that controls virulence gene expression in Citrobacter rodentium[外文期刊] 2008(11)
2.唐江涛;何勇强;唐纪良细菌转座子Tn5转座机理的研究进展[期刊论文]-广西农业生物科学 2003(4)
3.Diep BA;Gill SR;Chang RF Complete genome sequence of USA300,an epidemic clone of community-acquired meticillinresistant Staphylococcus aureus 2006
4.Miskey C;Izsvak Z;Plasterk RH The Frog Prince:a reconstructed transposon from Rana pipiens with high transpositional activity in vertebrate cells[外文期刊] 2003(23)
5.Michel A;Agerer F;Hauck CR Global regulatory impact of ClpP protease of Staphylococcus aureus on regulons involved in virulence,oxidative stress response,autolysis,and DNA repair 2006
6.Coburn PS;Baghdayan AS;Dolan GT An AraC-type transcriptional regulator encoded on the Enterococcus faecalis pathogenicity island contributes to pathogenesis and intracellular macrophage survival 2008
7.Nakata M;Podbielski A;Kreikemeyer B MsmR,a specific positive regulator of the Streptococcus pyogenes FCT pathogenicity region and cytolysin-mediated translocation system genes 2005
8.Cotter PA;DiRita VJ Bacterial virulence gene regulation:an evolutionary perspective 2000
9.Gallegos MT;Schleif R;Bairoch A Arac/XylS family of transcriptional regulators[外文期刊] 1997(4)
10.Xiong YQ;Willard J;Yeaman MR Regulation of Staphylococcus aureus alpha-toxin gene (hla) expression by agr,sarA,and sae in vitro and in experimental infective endocarditis[外文期刊] 2006 11.Li M;Diep BA;Villaruz AE Evolution of virulence in epidemic community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus 2009
12.Otto M Community-associated MRSA:a dangerous epidemic 2007
13.Kennedy AD;Otto M;Braughton KR Epidemic community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus:recent clonal expansion and diversification 2008
14.Diep BA;Otto M The role of virulence determinants in community-associated MRSA pathogenesis[外文期刊] 2008(8)
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1.王军华.权春善.郑维.李巍.范圣第.WANG Jun-hua.QUAN Chun-shan.ZHENG Wei.Li Wei.FAN Sheng-di金黄色葡萄球菌附属基因调节系统[期刊论文]-中国生物工程杂志2008,28(6)
2.李敏附属基因调节系统(agr)-Ⅰ型对表皮葡萄球菌生物膜形成调节关系的研究[学位论文]2005
本文链接:https://www.doczj.com/doc/027553417.html,/Periodical_zhyxjy201007019.aspx