用MEGA2做进化树的步骤(图示)
Fasta—alignment—clustal—create a new alignment—data—open—retrieve sequences from file—alignment—align by clustalW—ok—ok—export alignment—mega format
Click me to activate a data file—mega file—phylogeny—bootstrap test of phylogeny—UPGMA—compute—修改参数即可(options)--一般tree width改为800
1、打开程序
如下图所示:
2、MEGA2只能打开meg格式的文件,但是它可以把其他格式的多序列比对文件转换过来,我们在
这里用aln格式(Clustal的输出文件)转换meg文件。点File:Convert to MEGA Format...打开转换文件对话框
如下图所示:
3、选择文件和转换文件对话框,选择aln文件,点OK
如下图所示:
4、转换好的meg文件,点存盘保存meg文件,meg文件会和aln文件保存在同一个目录如下图所示: