医学信息数据库的建立与数据挖掘
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基于大数据技术的医学知识图谱构建方法随着大数据技术的快速发展,医学领域也逐渐开始应用大数据技术进行医学知识图谱的构建。
医学知识图谱是一种根据医学领域的知识和数据构建而成的结构化知识库,可以帮助医生在诊断、治疗和研究中更好地利用医学知识和数据。
本文将介绍基于大数据技术的医学知识图谱构建方法,包括知识图谱的构建过程、技术工具和应用前景。
一、医学知识图谱的构建过程1. 数据收集医学知识图谱的构建首先需要收集大量的医学数据,包括病例数据、治疗方案、药物信息、疾病信息等。
这些数据可以来源于医院的电子病历系统、医疗保险数据、科研机构的研究成果等。
还可以利用互联网上的开放数据集和医学文献数据库进行数据收集。
2. 数据清洗与整合在收集到数据后,需要对数据进行清洗和整合,去除重复数据和错误数据,将不同来源的数据进行整合,构建统一的数据模型。
还需要对数据进行标注和加工,使其能够被计算机理解和分析。
3. 知识表示与建模在整合好的数据基础上,需要对医学知识进行表示和建模。
这包括医学实体的抽取和医学关系的建模,将医学领域的实体如疾病、症状、药物等进行抽取并构建实体间的关系模型,以及利用知识图谱技术将这些实体和关系进行表示。
4. 知识推理与应用在构建完知识图谱后,可以利用知识图谱进行知识推理和应用。
通过对知识图谱进行查询和推理,可以帮助医生进行疾病诊断、治疗方案选择、药物作用预测等。
二、技术工具1. 数据挖掘技术数据挖掘技术可以帮助挖掘医学数据中的隐藏信息和规律,包括聚类、分类、关联规则挖掘、文本挖掘等。
这些技术可以帮助医学知识图谱的构建和知识的挖掘。
2. 自然语言处理技术自然语言处理技术可以帮助对医学文本进行语义理解和信息抽取,包括命名实体识别、关系抽取、实体链接等。
这些技术可以帮助将医学文本中的信息转化成结构化的知识图谱。
3. 图数据库技术图数据库技术是知识图谱的核心技术之一,可以帮助存储和查询大规模的图数据,包括知识表示、图匹配、图查询等功能。
数据挖掘及其在中医药现代化研究中的应用一、本文概述随着信息技术的快速发展,数据挖掘作为一种高效的信息处理技术,已经在各个领域展现出其独特的优势。
在中医药现代化研究领域,数据挖掘技术的运用更是为传统中医药的现代化发展提供了新的视角和工具。
本文旨在探讨数据挖掘技术在中医药现代化研究中的应用,以期推动中医药领域的科技进步和创新发展。
本文将首先介绍数据挖掘技术的基本概念、原理和方法,然后重点分析数据挖掘技术在中医药现代化研究中的应用案例和效果。
我们将从中药材的种植、采摘、炮制、配伍、药效评价等多个环节入手,详细阐述数据挖掘技术在这些方面的具体应用,以及所带来的实际效果和潜在价值。
本文还将对数据挖掘技术在中医药现代化研究中面临的挑战和问题进行深入探讨,包括数据挖掘技术的局限性、中医药数据的复杂性、数据挖掘与中医药知识的融合等问题。
通过这些问题的分析,我们希望能够为数据挖掘技术在中医药现代化研究中的进一步应用提供有益的思考和建议。
本文旨在全面、系统地探讨数据挖掘技术在中医药现代化研究中的应用,以期为中医药领域的科技进步和创新发展贡献一份力量。
二、数据挖掘技术概述数据挖掘(Data Mining)是一门新兴的交叉学科,它融合了数据库技术、机器学习、统计学等多个学科的理论和方法。
数据挖掘的主要目的是从大量的、不完全的、有噪声的、模糊的、随机的实际应用数据中,提取隐含在其中的、人们事先不知道的、但又是潜在有用的信息和知识。
这些信息和知识可以表示为概念、规则、规律、模式等形式,它们可以用于决策支持、过程控制、信息查询、科学研究等多个领域。
数据挖掘的过程通常包括数据预处理、数据挖掘、结果解释和评估等步骤。
数据预处理是对原始数据进行清洗、转换和整合的过程,以消除噪声、处理缺失值、标准化数据等,使得数据更适合于挖掘。
数据挖掘阶段则利用各种算法和工具,如聚类分析、决策树、神经网络、关联规则挖掘等,来发现数据中的模式和关联。
医疗大数据的采集与分析研究随着科技发展和医疗技术的不断提高,医疗服务日益精细化。
而医疗大数据的采集与分析,已成为未来医疗服务转型升级的重要推动力。
一、医疗大数据的意义医疗大数据的意义在于其能够收集和整合大量的医疗信息,如患者基本信息、疾病诊断和治疗方案、医疗机构和医生信息等,形成系统化、标准化的数据库,为医疗服务提供更为精准、有效的指导和决策。
其中,数据挖掘与分析技术,可对医疗大数据中的科学规律及潜在价值进行有效的发掘,得到更深层次的知识和见解,为未来的医学科研和创新提供有力的支持。
二、医疗大数据的采集方式医疗大数据的采集方式多种多样,如:患者诊疗记录、医疗机构管理记录、电子健康记录、医保事务记录、实时监测数据等。
这些数据来源的质量和数量自然相差巨大,因此,采用适当的数据整合和分析方法,进行质量控制和优化处理,是提高数据价值和可靠性的重要一环。
三、医疗大数据的分析技术医疗大数据的分析技术主要包括:数据清洗、数据挖掘、数据建模等,在不同的医疗应用场景下,还有各种贴合的新技术和方法。
例如,机器学习、人工智能、自然语言处理等,这些技术手段可以帮助医学界更全面高效地挖掘数据,形成新的概念、新的视角、新的思维方式,以及未来研究和创新的动力。
四、医疗大数据的应用领域医疗大数据的应用领域十分广泛,其中医学和公共卫生领域是最重要的部分。
医学领域,如:机器人手术、基因研究、个性化药物研发等,都需要大数据的支持和参考;公共卫生领域,如传染病爆发控制、药物管理、诊疗方案评估等,也需要大数据技术的支持和参考。
此外,医疗健康管理、医疗质量监管、医保管理等,也能通过大数据技术实现更为精细化和可持续的发展。
五、医疗大数据的未来发展趋势医疗大数据的未来发展趋势,可以预见有以下几个重要方向:1、更深入的数据挖掘和分析技术的研究;2、更严密的数据安全保障和隐私保护机制;3、更好的数据共享与交流平台的建设;4、更广泛的医学交叉学科合作和合作研究等。
医学信息学知识点医学信息学是医学科学与计算机科学的结合,旨在利用信息技术和计算机科学的方法来解决医学领域的问题。
它涵盖了信息处理、数据库管理、数据分析、人工智能等方面的知识。
本文将介绍医学信息学的几个主要知识点。
一、医学数据库医学数据库是医学信息学的重要组成部分,它存储和管理了大量的医学数据,包括病人的个人信息、临床数据、实验数据等。
常见的医学数据库包括临床数据库、基因组数据库、药物数据库等。
医学数据库的设计和维护需要考虑数据的准确性、安全性和可靠性,同时还要保证数据的易访问性和易使用性。
二、医学图像处理医学图像处理是医学信息学中的一个重要领域,它涉及图像获取、预处理、分析和解释等过程。
医学图像可以来自于X射线、CT扫描、MRI等各种医学设备,通过图像处理技术可以实现对图像的增强、分割、配准等操作,进而提取有用的医学信息。
医学图像处理在临床诊断、疾病监测和治疗过程中发挥了重要作用。
三、医学数据挖掘医学数据挖掘是通过从大量医学数据中挖掘隐藏的模式和知识,帮助医生做出准确的诊断和治疗决策的过程。
医学数据挖掘可以应用于分析病历数据、基因组数据、生物标志物数据等,通过统计学、机器学习和人工智能等技术来发现数据中的规律和关联性。
它可以帮助医生预测疾病风险、诊断疾病和制定个性化治疗方案。
四、医学人工智能医学人工智能是近年来医学信息学领域的新兴研究方向,它利用机器学习、深度学习和自然语言处理等技术来构建医学决策支持系统、智能诊断系统等。
医学人工智能可以自动分析医学影像、解读医学文献、辅助医生制定治疗方案等,提高医疗效率和准确性。
然而,医学人工智能也面临着数据隐私和伦理等问题,需要进行深入的研究和探索。
五、医学信息安全医学信息安全是保护医学数据和信息系统免受未经授权的访问、使用和破坏的过程。
医学信息安全包括网络安全、数据加密、访问控制、身份认证等措施,目的是确保医学数据的隐私和机密性。
随着医疗信息化的深入发展,医学信息安全变得越来越重要,需要医学信息学专家不断研究和提供安全的解决方案。
第1篇一、自我介绍与职业规划1. 题目:请您简单介绍一下自己,并谈谈为什么选择医学信息专员这个职业?解析:- 考察目的:了解应聘者的基本情况和职业兴趣,以及选择该职位的原因。
- 回答要点:- 自我介绍:包括姓名、教育背景、工作经验等。
- 选择原因:可以提及对医学领域的兴趣、对信息工作的热情,以及认为自己具备的相关技能和知识。
2. 题目:您认为成为一名优秀的医学信息专员需要具备哪些素质?解析:- 考察目的:考察应聘者对医学信息专员角色的认知和自身素质的评估。
- 回答要点:- 知识储备:医学、信息技术、数据处理等相关知识。
- 沟通能力:与医疗人员、研究人员、患者等进行有效沟通。
- 分析能力:对医学信息进行分析、整理和解读。
- 严谨性:对医学信息的准确性和完整性负责。
二、专业知识与技能1. 题目:请简述医学信息的基本概念及其在医疗领域的作用。
解析:- 考察目的:考察应聘者对医学信息基本概念的理解。
- 回答要点:- 定义:医学信息是指与医疗、健康、疾病等相关的信息。
- 作用:支持医疗决策、促进医学研究、提高医疗服务质量等。
2. 题目:请举例说明如何利用信息技术提高医学信息的获取和处理效率。
解析:- 考察目的:考察应聘者对信息技术在医学信息领域的应用能力。
- 回答要点:- 数据库建设:建立医学信息数据库,实现信息检索和共享。
- 信息集成:将分散的医学信息进行整合,提高信息利用率。
- 数据挖掘:从海量医学数据中挖掘有价值的信息。
三、案例分析1. 题目:假设您所在的公司正在开发一款针对慢性病患者的健康管理平台,请您谈谈如何从医学信息专员的角度参与该项目。
解析:- 考察目的:考察应聘者对医学信息在项目中的应用能力。
- 回答要点:- 需求分析:了解慢性病患者需求,确定平台功能。
- 信息收集:收集慢性病相关医学信息,为平台开发提供数据支持。
- 用户培训:对慢性病患者进行平台使用培训,提高平台使用率。
2. 题目:请举例说明在处理医学信息过程中,如何确保信息的准确性和完整性。
医疗健康大数据挖掘与分析一、背景与概念医疗健康大数据是指一个国家或地区医疗机构和计算机公司在诊疗、科研和管理等活动中产生的海量的数据,这些数据包括病人的病历、医生的诊断、药品的销售、医疗设备的使用等信息。
数据挖掘是从海量数据中发现隐藏知识的过程。
与传统的统计分析不同,数据挖掘侧重于通过模式识别、协同过滤等技术,挖掘数据背后的隐藏规律。
医疗健康大数据挖掘与分析,就是通过对大数据进行有效的分析和挖掘,发现其中的规律和价值,从而为医学研究、医疗管理和临床实践提供支持。
二、数据采集和预处理1.数据来源医疗健康大数据的来源非常广泛,包括病院信息系统、医生诊疗记录、药品销售记录、医疗保险记录等等。
医院是医疗健康大数据的主要来源,而医保数据和药品销售数据一般来自于政府部门或药企。
2.数据预处理由于医疗健康大数据规模庞大,而且多源异构,因此在挖掘和分析前需要对数据进行预处理。
预处理的步骤包括:(1)数据清洗:去除无效记录、处理缺失值、处理数据异常等。
(2)数据集成:将来自不同来源、不同数据库、不同格式的数据进行整合。
(3)数据转换:将数据进行归一化、标准化、离散化等转换操作。
(4)数据规约:对数据进行抽样、筛选等操作,以减少数据量和降低计算复杂度。
三、数据挖掘和分析应用医疗健康大数据挖掘与分析的应用非常广泛,主要涉及以下几个方面:1.疾病分类和风险评估通过数据挖掘技术,可以对疾病进行分类和归纳,从而为临床诊疗提供支持。
同时,还可以基于大数据,进行风险评估和预测,帮助医生更好地指导病人进行防范和治疗。
2.医疗资源管理通过对医疗健康数据的分析和挖掘,可以更加准确地评估医疗资源的利用情况和需求情况。
这对于医院和政府部门的资源配置和优化非常重要。
3.医疗诊疗指导基于医疗健康大数据的挖掘和分析,可以为医生提供更加准确的诊疗指导,以提高医疗水平和病人满意度。
4.新药研发和临床试验医疗健康大数据挖掘和分析,可以为新药研发提供支持和指导。
医学信息检索的主要方法
一、传统检索方法
传统检索方法主要是基于文献索引,通过查阅文献索引手册或检索数据库中的索引词,找到相关文献信息。
该方法耗时长、工作量大,但检索结果可靠、准确度高。
二、网络检索方法
网络检索方法主要是基于互联网搜索引擎进行检索,例如百度、谷歌等。
搜索引擎可快速提供大量关键词相关的信息,但检索结果存在一定误差和偏差,需多参考多验证。
三、语义检索方法
语义检索方法是基于自然语言处理技术,根据检索者输入的关键词,通过与事先建立好的知识库进行语义匹配,得到与关键词相关联的文献信息。
该方法可提高检索的准确度和效率。
四、知识图谱检索方法
知识图谱检索方法是基于知识图谱技术,对医学领域的知识进行建模和抽取,通过关联实体、属性和关系,实现自动化和精确化的信息检索。
该方法可大幅提高检索效率和准确度。
五、数据挖掘方法
数据挖掘方法是基于大量数据的建模和分析,通过统计学、机器学习等技术,发现数据中的隐藏模式和规律,实现精准的信息检索。
该方法需有大量的数据支撑,需花费大量的时间和精力建立相应的手动或自动化工具。
综上所述,医学信息检索的主要方法既有传统方法,又有基于互联网的网络检索方法,还有各种高新技术的应用。
在医学信息检索中,选择合适的检索方法有助于提高检索效率和准确度。
医学科研资料库近年来,随着医学科研的不断进步和发展,科研人员对于医学资料的需求也越来越大。
为了方便科研工作者获取和管理医学文献、研究数据以及其他相关资料,医学科研资料库应运而生。
本文将探讨医学科研资料库的定义、功能、建设和未来发展趋势。
一、医学科研资料库的定义医学科研资料库是指集中存储、整理和管理医学科研相关资料的数据库。
它可以包括医学文献数据库、研究数据数据库、临床试验数据库等多种类型的资料。
医学科研资料库的主要目标是提供科研人员快速、准确地检索和获取所需资料,促进科研工作的开展和进展。
二、医学科研资料库的功能1. 文献检索功能:医学科研资料库提供全面的文献检索功能,科研人员可以根据关键词、作者、期刊等多种检索方式,快速找到所需文献。
同时,还可以提供文献的全文下载或者链接,方便用户获取详细信息。
2. 数据管理功能:医学科研资料库可以帮助科研人员管理和整理研究数据。
科研人员可以将自己的研究数据上传到数据库中,方便后续的数据分析和共享。
同时,数据库还可以提供数据的备份和恢复功能,确保数据的安全性和完整性。
3. 学术交流功能:医学科研资料库可以促进科研人员之间的学术交流和合作。
科研人员可以通过数据库发布自己的研究成果,与其他人分享和交流。
此外,数据库还可以提供在线讨论和问答平台,方便用户之间的互动和交流。
三、医学科研资料库的建设1. 数据采集和整理:医学科研资料库的建设首先需要进行大量的数据采集和整理工作。
科研人员可以通过与出版社、研究机构等合作,收集和整理医学文献和研究数据。
同时,还可以利用数据挖掘和自然语言处理等技术,提高数据的质量和准确性。
2. 数据存储和管理:医学科研资料库需要建立高效、稳定的数据存储和管理系统。
科研人员可以选择使用云计算和大数据技术,搭建分布式存储和处理平台,提高数据的存储能力和处理速度。
同时,还需要建立完善的权限管理机制,确保数据的安全性和隐私保护。
3. 用户界面设计:医学科研资料库的用户界面设计需要简洁、直观。
大数据在免疫学研究中的数据挖掘应用大数据技术的飞速发展正在深刻改变科学研究的面貌,而免疫学作为生命科学的一个重要分支,正逐渐融入这一技术革命之中。
通过海量数据的整合与深入挖掘,大数据为免疫学研究提供了前所未有的视角与工具,推动着我们对免疫系统的理解达到新的高度。
以下是大数据在免疫学研究中的六点数据挖掘应用概述。
一、高通量数据分析,揭示免疫细胞多样性随着单细胞测序技术的成熟,免疫学研究进入了单细胞分辨率时代。
大数据技术在此发挥了关键作用,能够处理海量的单细胞转录组数据,揭示不同状态下免疫细胞的基因表达模式及其多样性。
通过聚类分析、差异表达基因检测等数据挖掘方法,科研人员能够识别出新的免疫细胞亚群,理解其功能和调控机制,为疾病诊断和治疗策略的开发奠定基础。
二、免疫组库分析,理解免疫应答的动态变化免疫组库是指一个个体所有B细胞和T细胞受体的总和,反映了个体内免疫反应的多样性。
大数据技术在免疫组库分析中的应用,使得科学家能够监测个体随时间的免疫应答变化,特别是在感染、自身免疫疾病及癌症等情况下。
通过对大量序列数据的深度挖掘,研究人员能解析免疫细胞克隆扩增的规律,预测疫苗接种效果,或追踪疾病进展与治疗响应,为精准医疗提供依据。
三、生物信息学与机器学习,预测免疫原性免疫原性是决定抗原能否激发免疫反应的关键属性。
大数据技术结合生物信息学工具和机器学习算法,可以对蛋白质序列、结构特征等进行综合分析,预测哪些抗原具有较强的免疫原性,从而加速疫苗设计和药物筛选进程。
这种基于数据驱动的方法不仅提高了预测准确性,还大大缩短了研发周期,为应对突发疫情等公共卫生事件提供了快速响应的能力。
四、多组学数据整合,揭示免疫与疾病的复杂关联免疫系统与多种疾病的发生发展密切相关。
大数据平台能够整合基因组学、转录组学、蛋白组学等多维度数据,通过系统生物学方法,揭示免疫功能失调与疾病状态之间的复杂网络关系。
例如,在肿瘤免疫学中,通过分析肿瘤微环境中的免疫细胞组成和分子表达谱,科学家可以识别免疫逃逸机制,指导免疫治疗策略的制定。
第1篇随着科技的飞速发展,大数据技术在医疗领域的应用越来越广泛。
癌症作为一种严重威胁人类健康的疾病,其治疗和预防研究一直是医学研究的热点。
本文旨在探讨癌症医疗大数据解决方案,从数据采集、存储、处理、分析到应用,全面阐述如何利用大数据技术提高癌症诊疗水平。
一、数据采集1. 电子病历(EMR)电子病历是癌症医疗大数据的重要组成部分,包括患者的基本信息、病史、检查结果、治疗方案、药物使用情况等。
通过整合各级医疗机构电子病历系统,实现数据互联互通,为癌症诊疗提供全面的数据支持。
2. 生物样本库生物样本库是癌症研究的重要资源,包括患者的组织样本、血液样本、细胞株等。
通过对生物样本库的数据采集,可以深入了解癌症的发病机制、基因突变、药物敏感性等信息。
3. 医学影像数据医学影像数据是癌症诊断和评估的重要依据,包括X光、CT、MRI、PET-CT等。
通过整合各级医疗机构医学影像数据,可以实现远程诊断、病例讨论等功能。
4. 流行病学数据流行病学数据包括癌症发病率、死亡率、生存率等,有助于了解癌症的流行趋势和分布特征。
通过对流行病学数据的采集,可以为癌症预防提供科学依据。
5. 药物临床试验数据药物临床试验数据是癌症治疗研究的重要来源,包括药物疗效、安全性、不良反应等。
通过整合临床试验数据,可以评估新药的治疗效果和安全性。
二、数据存储1. 分布式存储分布式存储系统具有高可靠性、可扩展性、高性能等特点,适用于大规模数据存储。
在癌症医疗大数据中,采用分布式存储可以有效解决数据量庞大、访问速度快等问题。
2. 云计算平台云计算平台提供强大的计算能力和存储空间,有助于实现数据的高效处理和分析。
通过云计算平台,可以实现癌症医疗大数据的集中存储和统一管理。
3. 数据库技术数据库技术是实现数据存储、查询和管理的基础。
在癌症医疗大数据中,采用关系型数据库或非关系型数据库,可以满足不同类型数据的存储需求。
三、数据处理1. 数据清洗数据清洗是数据处理的第一步,包括去除重复数据、纠正错误数据、填补缺失数据等。
数据挖掘技术在中医药研究中的应用随着医学机构积累的数据越来越多,促进了医学信息包括中医药信息的数字化;如何利用海量信息为防控疾病提供科学依据,总结优化各种诊治方案,已引起业内专家的高度关注。
于是数据挖掘技术在中医药研究被日益重视,它将有力促进中医药的现代化进程。
1 数据挖掘的概念、步骤及常用方法1.1 数据挖掘概念、步骤数据挖掘(Data mining,DM)即数据库中的知识发现,是从大型数据库的海量数据中提取人们感兴趣的知识,这些知识是隐藏的、事先未知的、潜在有用的信息,挖掘的知识表现为概念、规则、规律、模式等形式[1]。
数据挖掘的目的在于使用所发现的模式帮助解释当前的行为或预测未来的结果[2]。
挖掘步骤大致有:问题定义、数据提取、数据预处理、数据挖掘、知识评估、结果应用这六步。
1.2 数据挖掘常用方法1.2.1 描述统计数据总结的目的是对数据进行从低层次抽象、浓缩到高层次,得出它的紧凑描述。
最简单的数据总结方法是描述统计,它包括平均数、中位数、分位数等,它常和统计图配合应用。
1.2.2 关联规则关联规则从本质上讲是条件概率,即当A发生时、B同时出现的概率有多大?只要B离50%较远就有意义。
数据关联是数据库中存在的一类重要的可被发现的知识。
若两个或多个变量的取值之间存在某种规律性,就称为关联。
关联包括简单关联、时序关联、因果关联。
关联分析的目的是找出数据库中隐藏的关联网。
有时我们并不知道数据库中数据的关联函数,即使知道也不确定。
因此关联分析生成的规则带有可信度。
1.2.3 分类和聚类这是最常用的技术。
分类方法主要有:回归、决策树、神经网络。
分类分析在数据挖掘中是一项重要任务。
分类器的构造方法有统计方法、机器学习方法、神经网络方法等。
聚类是根据事物本身潜在的特性研究对象分类的方法。
通过聚类把一个数据集合中的个体按照相似性归成若干类别,使其“物以类聚”,将数据库中的记录划分为一系列有意义的子集。
聚类要解决的就是实现满足这种要求的类的聚合。
医学信息数据库的建立与数据挖掘 【关键词】 医学信息 关键词: 医学信息;数据仓库;数据挖掘;数据组织
0 引言 计算机和信息技术在医学领域中的应用,形成了现代医学中一个新的边缘学科 医学信息学或医药信息学(medical informatics),进而成为生物医学工程学的重要支柱.医学信息涵盖了医学活动中产生的文字、图像、声音以及电磁波、光波、压力、温度等多媒体物理数据,这些数据在计算机和数据库技术的支持下,已成为医学技术领域实施科学管理和科学研究的重要资源.数据仓库(data warehouse,DW)与数据挖掘(data mining,DM)技术的出现[1] ,为医务管理人员、科研工作者分析、利用这些数据资源进行科学管理、决策和开展大规模、高水平医学研究提供了有力的技术工具.数据仓库与数据挖掘技术已在国外一些大型企业中得到了成功应用,国内一些企业也已开始着手这方面的投资,有的并得到了可喜的回报.由于医学技术具有很强的实践性、实验性、统计性,是一门验证科学,浩瀚的医学资源要用现代技术去组织、去分析、去利用,因此,探索数据仓库与数据挖掘技术在医学信息方面的应用就具有更重要的实用价值和广阔的发展前景.
1 问题的提出 目前,医学信息的处理大多停留在基于数据库技术支持的操作型事务处理的水平上,如数据的查询、修改等,是为特定的应用服务的.而建立在数据库技术之上的分析型信息处理最典型的应用是一些医学诊断方面的专家系统(expert system,ES),其数据资源仅仅是某一方面的专家知识,涉及的数据量很小,覆盖面也很窄.那么,摆在我们面前这个巨大的医学资源宝库究竟能为我们做些什么呢?例如,医院信息系统(hospital information system,HIS),它是医学信息学的一个分支,分为管理信息系统(management informa-tion system,MIS)和临床信息系统(clinical information sys-tem,CIS).前者主要处理医院内部管理方面的信息如人事、财务和设备管理等,而后者是以处理患者为中心的信息系统,如患者入院、住院、治疗、检查、病历、出院等一系列与患者有关的信息.那么,这两类系统能否满足下列要求呢?①如果医院明年利润目标要增长5%,哪些前提条件变化才能达到这一目标?此外还需采取哪些措施来实现这些变化?②未来某段时间内哪些药品使用的频度最高或最低?以及与治疗疾病间的关系?③未来某段时间内哪些疾病是常发病或发病率最高?使用的药物主要有哪些?如何组织急需药品的供应?④环境、气候、地理位置与流行病间的关系?利用现有信息系统要回答这些问题是困难的,有些甚至是不可能的.然而,利用数据仓库与数据挖掘技术就可以轻而易举地找到问题的答案.因此,建立数据仓库与利用数据挖掘技术对于开展科学研究,提高医学技术水平是很有必要的. 2 数据仓库的建立 所谓数据仓库是支持管理决策过程的、面向主题的、集成的、与时间有关的、持久的数据集合,它以传统的数据库技术作为存储数据和管理资源的基本手段,以统计分析技术作为分析数据和提取信息的有效方法,以人工智能技术作为挖掘知识和发现规律的科学途径,是与网络通信技术、面向对象技术、并行技术、多媒体技术、人工智能技术等相互浸透、互相结合与综合应用的技术.
创建基于HIS的数据仓库,是从已有数据出发的数据仓库的设计方法,称之为“数据驱动”的系统设计方法联系重新考虑,组织数据仓库中的主题,利用数据模型有效地识别数据和数据仓库中的主题,它的基本思路是:利用以前建设的数据库系统的数据,按照分析领域对数据及数据之间的的数据的“共同性”(即建立主题间相互联系的属性).其创建的基本方法如Fig1所示 [2] .
图1 略 从图中看出,数据仓库的设计是一个动态的、循环的过程,在系统设计初级阶段,人们对系统的分析需求不能预先作出规范说明,只能给出一个抽象的模糊的描述,数据仓库的内容、结构、粒度、分割以及其他物理设计根据用户反馈信息再不断地调整和完善.
2.1 主题抽取 数据仓库中数据的组织是面向主题的[3] .它是在较高层次上对分析对象的数据的一个完整的、一致的描述,能完整、统一地刻画各个分析对象所涉及的各项数据以及数据之间的关系.可以说,主题定义的过程就是数据仓库模型建立的过程.
2.1.1 系统边界确定 由于数据仓库建立初期很难获得明确而又详细的需求,系统设计人员只能得到一些基本的方向性的需求信息,如决策的类型、决策者感兴趣的问题、解决这些问题需要哪些信息,这些信息需要包含原有数据库系统的哪些部分的数据等等.这就是数据仓库设计过程中的需求分析,称之为系统边界界定,以此作为确定主题的基本依据.
2.1.2 主题的确定 根据有关军卫1号工程设计思想和实施细则的报道,HIS几乎涵盖MIS和CIS的方方面面,涉及范围广泛,内容丰富全面,可以从管理角度、从科学研究的角度,确定若干个主题如患者、药品、门诊、检验等,作为管理决策和科研分析的数据来源.例如:患者:患者固有信息:患者标识号,住院号,姓名,性别,出生年月,文化程度,身份证号,住址,电话…… 患者住院信息:患者标识号,入院科室、职业、身份、费别、在职标志、医保类别、医疗保险号、工作单位、门诊医师……药品: 药品固有信息:药品编码,药品名称,规格、单位、剂型、毒理分类、标准剂量、材质分类、用药梯次、价格系数…… 药品采购信息:药品编码、药品名称、规格、单位、剂型、市场批发价、市场零售价、货源足缺、包装规格……
2.2 数据组织 数据仓库中的数据分为早期细节级、当前细节级、轻度综合级和高度综合级4个级别,各个级别的数据根据需要划分为不同的粒度 [4] .所谓粒度是对数据仓库中数据的综合能力的度量,它既影响仓库中数据量的多少,也影响数据仓库所能回答的问题多少,粒度越小,细节程度越高,综合程度越低,回答查询的种类越多.
各个级别的数据是随着时间的变化而变化的,也就是以时间段来区分不同的细节.当数据按照时间段划分完成后,无论是主题还是主题之间的联系,都用关系来表示,也就是说数据仓库的数据最终也表现为关系,其数据的组织通过关系数据库实现,因此,数据仓库的逻辑模型就是关系模型,即用二维表表示一个主题或者说一个关系,表中的一行称为一个元组,一列称为属性,每列的名字即为属性名,某个可以唯一地标识一个元组的属性称其为主码或关键字.
实际上,数据组织中的关键问题是数据仓库的物理模型设计,一是采用哪种数据库管理系统以及存储结构和存取方法;二是如何在庞大的数据仓库中建立索引以提高数据的存取效率;三是根据主题的重要程度、使用频率选择不同的存储媒体以提高系统响应速度和降低系统硬件费用.
2.3 数据获取与集成 在数据仓库的逻辑模型和物理模型建立后,紧接着是建立数据仓库与传统数据库之间的接口,即将操作型环境下的数据装载进入数据仓库环境,这是一个所需数据的抽取与不同环境或异构数据库的集成的过程[5] ,它完成了由操作型环境生成完整数据、基于时间的数据转换、数据的凝聚、异构数据库的集成以及数据的时标设定等任务[6] .接口设计就是要选择合适的软件开发平台如PB,VB,VC,Delphi等设计数据提取与集成的接口程序,完成数据的装入以及异构数据库的访问等任务,达到数据获取与集成的目的.
2.4 建立应用 数据装入仓库后,为进一步开发决策支持系统DSS以及其他联机分析处理[7] (online analytical process-ing,OLAP)准备了充分的数据资源.在DSS和OLAP开发 中需要采用软件工程中的原型法开展应用系统研究,即在初步建立系统的基础上,尽快地让系统运行起来,近早产生效益,在系统运行中不断地理解需求,改善、完善系统性能.
3 数据挖掘 随着时间的推移,数据仓库的数据量在急剧增长,这些日积月累的数据中是否存在着某种关系、模式或者趋势,是很难一眼就看得出来的,或者知道有某种关系,但必须进一步加以证明或修正,这时,数据挖掘DM技术就有用武之地了.
数据挖掘是基于人工智能(artificial intelligence,AI)、机器学习、统计学等技术,高度自动化地分析原有数据,作出归纳性的推理,从中挖掘出潜在的模式或行为,以帮助决策者作出正确决策的过程.也就是说为了寻找未知的模式或趋势而在细节数据中进行搜索的过程,从而生成新的信息和知识[8] .数据挖掘利用人工智能中的一些成熟的算法和技术作为发现知识的方法,如人工神经网络、遗传算法、决策树、邻近搜索算法、规则推理等,利用关联分析、序列模式分析、分类分析、聚类分析作为数据挖掘的分析方法. 例如,采用关联分析方法可以从业务系统如CIS的数据库或为此建立的数据仓库、数据商店的细节或事务中寻找出重新出现概率很高的模式.具体的说,从CIS的数据库中分析某种疾病治疗过程中诱发其他疾病的概率以及与时间的关系等.
结束语 伴随着数据库技术的发展,数据仓库与数据挖掘技术作为一种解决方案,成为医学信息技术领域重要的研究方法,必将为管理决策、科学研究带来很大的方便和可观的效益.
参考文献: [1]关 俐,梁洪峻.数据仓库与数据挖掘[J].微型电脑应用,1999;15(9):17-20. [2]王 珊.数据仓库技术与联机分析处理[M].北京:科学出版社,1999:1-2. [3]杨 森,王翰虎.面向主题的数据仓库体系结构[J].计算机应用,1999;19(10):104-105. [4]乔 颖,须 德.多重粒度数据仓库的存储新策略[J].北方交通大学学报,1997;21(6):684-689.
[5]王 宁,陈 滢,俞本权.一个基于Corba的异构数据库集成系统设计[J].软件学报,1998;9(5):378-382.
[6]胡 华,高 济,何志均.基于主动规则对象的分布式多数据库系统集成[J].小型微型计算机系统,1999;20(7):526-530.
[7]姚宇蓉,何厚存.数据仓库中的信息存取分析技术的研究[J].计算机应用研究,1999;16(8):54-58.
[8]Joyce Bischoff,Ted Alexander著.成 栋,魏立原译.数据仓库技术[M].北京:电子工业出版社,1998:212-213.
编辑 何扬举 第四军医大学生物医学工程系计算机应用教研室,陕西西安710033 作者简介: 屈景辉(1954-),男(汉族),陕西省蒲城县人.教授.Tel.(029)3374840(O) Email.Qujh@fmmu.edu.cn