鸽过氧化物还原酶基因的克隆与进化分析
- 格式:pdf
- 大小:441.54 KB
- 文档页数:2
1,3-丙二醇氧化还原酶基因的克隆与序列分析
郑艳;管艺飞;刘长江
【期刊名称】《安徽农业科学》
【年(卷),期】2006(034)012
【摘要】以肺炎克雷伯氏菌的基因组DNA为模板,通过PCR扩增得到了目的基因dhaT,并将该基因克隆到pMD19-T Simple载体.基因序列分析表明,dhaT基因全长为1 158bp,与GenBank上已发表基因序列的同源性达99%,氨基酸同源性为100%.
【总页数】2页(P2650-2651)
【作者】郑艳;管艺飞;刘长江
【作者单位】沈阳农业大学食品学院食品生物技术实验室,辽宁,沈阳,110161;沈阳农业大学食品学院食品生物技术实验室,辽宁,沈阳,110161;沈阳农业大学食品学院食品生物技术实验室,辽宁,沈阳,110161
【正文语种】中文
【中图分类】Q554
【相关文献】
1.编码1,3-丙二醇氧化还原酶同工酶基因yqhD的克隆与高效表达 [J], 张晓梅;唐雪明;诸葛斌;沈微;饶志明;方慧英;诸葛健
2.1,3-丙二醇氧化还原酶同工酶基因yqhD的克隆与原核表达 [J], 李红梅;陈佳;李琳;徐斐
3.丁酸梭菌1,3-丙二醇氧化还原酶基因dhaT的克隆及在大肠杆菌中的表达 [J],
杨登峰;韦宇拓;黄日波
4.克雷伯氏菌1,3-丙二醇氧化还原酶基因在大肠杆菌中的克隆与表达 [J], 周文广;黄日波
5.克雷伯肺炎杆菌1,3-丙二醇氧化还原酶基因克隆及表达条件研究 [J], 曲荟锦;王凤寰;田平芳;谭天伟
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
某大学生物工程学院《细胞生物学》课程试卷(含答案)__________学年第___学期考试类型:(闭卷)考试考试时间:90 分钟年级专业_____________学号_____________ 姓名_____________1、判断题(50分,每题5分)1. 钙泵即钙通道蛋白,可以对生物膜内外Ca2+进行跨膜转运。
()答案:错误解析:钙泵介导直接消耗ATP的主动运输,逆浓度梯度将Ca2+由胞质(低浓度)泵入内质网或者细胞外(高浓度)。
而钙通道介导是被动运输,不消耗能量,顺浓度梯度协助扩散Ca2+进入胞质。
2. 为了使光学显微镜或电子显微镜标本的反差增大,可用化学染料对标本进行染色。
()答案:错误解析:电子显微镜可采用负染色,只染背景而不染样品,光学显微镜可以对标本进行化学染色使反差增大。
3. 磷脂极性头部是带正电荷的,因此它可以直接与带负电荷的氨基酸残基直接相互作用。
()答案:错误解析:磷脂极性头部是带负电荷的,它可以直接与带正电荷的氨基酸残基直接相互作用,与带负电荷的氨基酸残基作用时,需通过Ca2+、Mg2+等阳离子为中介。
4. 单细胞生物不存在细胞分化的现象。
()答案:错误解析:同多细胞生物一样,单细胞生物也存在细胞分化现象,也涉及一系列基因的特异表达。
5. P选择蛋白与P钙黏蛋白中的P的含义是相同的。
()[中山大学2008研]答案:错误解析:P选择蛋白的P表示的是血小板,P钙黏蛋白的P源自于胎盘。
这些命名表示了最初发现它们的细胞类型。
6. 溶酶体发挥活性的最pH范围是5~6。
()[北京师范大学2007研]答案:错误解析:溶酶体发挥活性的最pH范围是5左右。
7. 动物细胞胞质中一般具有中间丝蛋白库。
()答案:错误解析:中间丝蛋白位于细胞核内。
8. 将光驱动的质子泵噬盐菌菌紫质(bacteriorhodapsin)与ATP合成酶置于同一脂质体中,在光照下可由ADP和磷酸产生ATP。
()[南京师范大学2008研]答案:正确解析:9. 叶绿体的核酮糖二磷酸羧化酶是由16个亚基组成的聚合体,其中8个大亚基是核基因编码的。
植物过氧化物酶同工酶的研究进展顾雯雯;胡亚婷;韩英;卞涵佳;罗兵;孙海燕;万能;杨志刚;沈宗根【摘要】过氧化物酶(Peroxidase,POD)是植物体内广泛存在的氧化还原酶,在植物体内具有多种同工酶.POD同工酶具有种属、器官以及发育阶段特异性.它作为遗传标记广泛应用于植物的品种鉴定、遗传多样性分析、植物抗病性分析等方面.该研究综述了植物POD同工酶检测技术的研究进展以及POD同工酶的应用,提出进一步研究植物POD同工酶的建议.【期刊名称】《安徽农业科学》【年(卷),期】2014(000)034【总页数】3页(P12011-12013)【关键词】植物;过氧化物酶同工酶;研究进展【作者】顾雯雯;胡亚婷;韩英;卞涵佳;罗兵;孙海燕;万能;杨志刚;沈宗根【作者单位】常熟理工学院生物与食品工程学院,江苏常熟215500;苏州市五月田有机农业科技有限公司,江苏吴江215216;吴江市平望战友葡萄专业合作社,江苏吴江215221;苏州市五月田有机农业科技有限公司,江苏吴江215216;常熟理工学院生物与食品工程学院,江苏常熟215500;常熟理工学院生物与食品工程学院,江苏常熟215500;常熟理工学院生物与食品工程学院,江苏常熟215500;常熟理工学院生物与食品工程学院,江苏常熟215500;常熟理工学院生物与食品工程学院,江苏常熟215500【正文语种】中文【中图分类】S188过氧化物酶(Peroxidase,POD)是植物体内广泛而大量存在的、活性较高的一种氧化还原酶。
它能催化植物体内多种反应,参与光合作用、呼吸作用、抗病作用、植物生长等众多生理活动。
POD在植物体内具有多种同工酶。
在植物不同的组织器官、不同的生长发育时期、不同的生理状态(如病虫害、逆境胁迫等)和不同品种中,POD同工酶的活性和数目变化都很大。
POD同工酶能够在很大程度上反映植物生长发育的特点、生物代谢状况、适应外界环境能力以及品种之间的遗传差异[1]。
超氧化物歧化酶的研究进展学生:杨青青生命科学院10级研究生摘要:超氧化物歧化酶是一种广泛存在于生物体内各个组织中的重要金属酶,是一种能够特异性清除机体代谢过程中产生的自由基的抗氧化酶,近年来成为化学、生物学、医学、日用化工、食品科学和畜牧兽医学等多个学科领域研究的热点。
深入研究SOD及其与机体内铜、锌、铁、锰等元素代谢的关系,不仅有着重要的理论意义,而且具有重要的实用价值。
本文将从其来源、种类和分布、结构和理化特性、作用机理及生理功能、SOD基因的克隆和表达、分离纯化、制备开发应用等方面进行综述,并探讨和分析了目前存在的问题及应用前景,旨在为超氧化物歧化酶的研究、开发、应用提供参考。
关键词:超氧化物歧化酶;基因克隆;蛋白表达;分离;纯化;应用Research Advances in Superoxide DismutaseStudent: Yang Qing-Qing10 graduate student, School of life science, Shanghai University Abstract:Superoxide dismutase is an importance metal enzyme of widely various tissues in vivo, which is an antioxidant enzymes can specifically remove free radicals produced during metabolism and has been an inquiring hot spots in many fields such as chemistry, biology, medicine, daily chemical industry, food science and animal husbandry and veterinary science and so on in recent years. It not only has an important theoretical significance but is of an important practical value to study the relationship between SOD and the elementary metabolism of cup rum (Cu), zine (Zn), ferrum (Fe) and manganese (Mn). This article will not only summarize from its source, type and distribution, structure and physicochemical properties, function mechanisms and physiology functions, SOD gene cloning and expression, purification development applications but also analyze and discuss the problems and prospects of the future aiming at providing reference for the research, development and application of SOD.Key words: Superoxide dismutase; Gene cloning; Protein expression; Isolation; Purification; Application前言氧的某些代谢产物及其衍生的含氧物质都是直接或间接由氧转化而成的。
中国水产科学 2016年7月, 23(4): 791-799 Journal of Fishery Sciences of China研究论文收稿日期: 2015-10-26; 修订日期: 2015-12-16.基金项目: 国家863计划项目(2012AA10A411); 国家自然科学基金项目(41176151, 41276177); 福建省种业创新与产业化工程资助项目(2014S1477-10); 福建省自然科学基金项目(2014J05041, 2014J07006).作者简介: 张晗晗(1991–), 女, 硕士研究生, 主要从事坛紫菜遗传育种研究. E-mail: zhanghanhan9213@ 通信作者: 谢潮添, 教授. E-mail: ctxie@DOI: 10.3724/SP.J.1118.2016.15403坛紫菜谷胱甘肽过氧化物酶基因的克隆及表达特征张晗晗, 徐燕, 纪德华, 陈昌生, 许凯, 谢潮添集美大学 水产学院, 福建 厦门 361021摘要: 谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase, GPX)是植物活性氧(ROS)清除酶促系统的重要成员之一, 在植物逆境胁迫应答中发挥着重要作用。
本研究以坛紫菜(Pyropia haitanensis )为研究材料采用RACE 技术克隆获得了一条坛紫菜的GPX 全长基因序列, 命名为PhGPX (GenBank 收录号: JX673908)。
该基因序列全长1027 bp, 包含555 bp 的开放阅读框, 所编码的多肽包含184个氨基酸, 分子量为19.9 kD, 等电点为8.76。
多序列比对和系统进化树分析结果表明PhGPX 属于植物GPX 基因家族成员。
基因表达水平的qPCR 分析结果表明PhGPX 基因在坛紫菜叶状体和丝状体世代中的表达水平没有显著差异; 高温胁迫不同时间水平下, PhGPX 基因的表达水平呈现为先上调后下调的趋势; 不同失水胁迫条件下, PhGPX 基因的表达不受低水平的失水胁迫影响, 但可被高水平(>40%)的失水胁迫所抑制, 且在复水30 min 后仍然无法恢复失水胁迫前的水平。
江苏农业学报(JiangsuJ.ofAgr.Sci.)ꎬ2024ꎬ40(1):39 ̄46http://jsnyxb.jaas.ac.cn唐跃辉ꎬ赵雨凡ꎬ蒋心言ꎬ等.麻风树JcHDZ28基因克隆与功能分析[J].江苏农业学报ꎬ2024ꎬ40(1):39 ̄46.doi:10.3969/j.issn.1000 ̄4440.2024.01.004麻风树JcHDZ28基因克隆与功能分析唐跃辉ꎬ㊀赵雨凡ꎬ㊀蒋心言ꎬ㊀张英颖ꎬ㊀王㊀寒ꎬ㊀包欣欣ꎬ㊀范雨杰ꎬ㊀李㊀彤(周口师范学院生命科学与农学学院ꎬ河南周口466001)收稿日期:2023 ̄09 ̄02基金项目:河南省高等学校重点科研项目(24A180029)ꎻ河南省周口师范学院大学生创新创业训练计划项目(202210478038㊁202210478040)作者简介:唐跃辉(1985-)ꎬ男ꎬ河南许昌人ꎬ博士ꎬ副教授ꎬ主要从事植物基因克隆与功能研究ꎮ(E ̄mail)yhtang2005@163.com㊀㊀摘要:㊀HD ̄Zip家族基因与植物的生长和对环境胁迫的抗性密切相关ꎬ被认为是作物改良的关键因子ꎮ在本研究中ꎬ我们通过RT ̄PCR技术从麻风树中克隆了1个HD ̄Zip家族基因ꎬ命名为JcHDZ28ꎮJcHDZ28基因包含1个882bp的开放阅读框ꎬ编码1个含有293个氨基酸的蛋白质ꎮ氨基酸序列分析结果表明ꎬJcHDZ28含有高度保守的同源结构域和亮氨酸拉链(LZ)基序ꎮ表达模式分析结果表明ꎬJcHDZ28基因在种子中的相对表达量最高ꎬ且盐胁迫下调该基因的表达ꎮ亚细胞定位分析结果表明ꎬJcHDZ28基因编码1个核定位蛋白ꎮ过表达JcHDZ28基因增加了转基因拟南芥对盐胁迫的敏感性ꎬ且在盐胁迫条件下ꎬ转JcHDZ28基因拟南芥叶片脯氨酸含量显著低于野生型拟南芥ꎬ相对电导率显著高于野生型拟南芥ꎬ非生物胁迫相关基因在转JcHDZ28基因拟南芥中的表达也显著低于在野生型拟南芥中的表达ꎮ本研究结果可以为进一步阐明HD ̄Zip转录因子基因JcHDZ28在麻风树生长发育和响应非生物胁迫中的功能提供理论依据ꎮ关键词:㊀麻风树ꎻJcHDZ28ꎻHD ̄Zipꎻ盐胁迫ꎻ转基因拟南芥中图分类号:㊀S511㊀㊀㊀文献标识码:㊀A㊀㊀㊀文章编号:㊀1000 ̄4440(2024)01 ̄0039 ̄08CloningandfunctionanalysisofJcHDZ28genefromJatrophacurcasL.TANGYue ̄huiꎬ㊀ZHAOYu ̄fanꎬ㊀JIANGXin ̄yanꎬ㊀ZHANGYing ̄yingꎬ㊀WANGHanꎬ㊀BAOXin ̄xinꎬ㊀FANYu ̄jieꎬ㊀LITong(SchoolofLifeSciencesandAgronomyꎬZhoukouNormalUniversityꎬZhoukou466001ꎬChina)㊀㊀Abstract:㊀ThegenesofHD ̄Zipfamilyarecloselyrelatedtoplantgrowthandresistancetoenvironmentalstressꎬandareconsideredtobekeyfactorsincropimprovement.InthestudyꎬweclonedaHD ̄ZipfamilygenefromJatrophacurcasL.usingRT ̄PCRtechnologyꎬandnamedJcHDZ28.TheJcHDZ28genecontainedanopenreadingframeof882bpꎬandencodedaproteinwith293aminoacids.AminoacidsequenceanalysisshowedthatJcHDZ28containedahighlyconservedhomologusdomainandleucinezipper(LZ)motif.ExpressionprofileanalysisshowedthattherelativeexpressionofJcHDZ28genewasthehighestinseedsꎬandsaltstressinhibitedtheexpressionofthisgene.SubcellularlocalizationanalysisshowedthatJcHDZ28geneencodedanuclearlocalizationprotein.OverexpressionofJcHDZ28geneincreasedthesensitivityoftransgenicArabidopsistosaltstress.Undersaltstressꎬtheprolinecontentoftransgenicplantswassignificantlylowerthanthatofwildtypeꎬandtherelativeconductivitywassignificantlyhigherthanthatofwildtype.Theexpressionofabioticstress ̄relatedgenesinJcHDZ28transgenicplantswasalsosignificantlylowerthanthatinwildtype.TheresultsofthisstudycanprovideatheoreticalbasisforfurtherelucidatingthefunctionofHD ̄ZiptranscriptionfactorgeneJcHDZ28inthegrowthꎬdevelopmentandresponsetoabioticstressinJatrophacur ̄casL.Keywords:㊀JatrophacurcasL.ꎻJcHDZ28ꎻHD ̄ZipꎻsaltstressꎻtransgenicArabidopsis93㊀㊀非生物胁迫如干旱㊁高温㊁低温㊁氧化胁迫㊁高盐等都会降低作物产量ꎬ给农业生产造成重大的经济损失ꎮ为了适应这些极端环境条件ꎬ植物在生理㊁代谢㊁形态和分子水平上进化出复杂的调控机制ꎬ通过激活或者抑制胁迫相关基因的表达使得植物在这些极端条件下能够更好地生存[1]ꎮ研究结果表明ꎬ一些转录因子如MYB㊁NAC㊁HD ̄Zip㊁AP2/ERF㊁WRKY㊁bZIP等家族成员参与调控植物生长发育和逆境胁迫的调控[1 ̄6]ꎮHD ̄Zip蛋白是植物特异性转录因子ꎬ具有1个由61个氨基酸组成的高度保守的同源结构域(HD)ꎬ以及1个与HD的羧基端紧密相连的亮氨酸拉链(LZ)元件ꎮHD负责特异性DNA序列结合ꎬ调控下游基因的转录ꎮLZ元件协助HD ̄Zip蛋白特异性识别目标DNA序列ꎬ起到二聚化的作用[1ꎬ7]ꎮ植物HD ̄Zip转录因子最先在玉米中被发现ꎬ编码1个涉及叶片发育的HD ̄ZipI类的转录因子[7]ꎮ之后ꎬHD ̄Zip基因在不同的植物中被发现ꎬ并通过构建这类基因的功能缺失突变体或功能获得突变体对其功能进行了研究ꎬ结果表明HD ̄Zip蛋白在植物生长发育和逆境胁迫的调控中扮演重要的角色[6 ̄8]ꎮ例如ꎬTaHDZipl ̄2正调控小麦花期和穗的发育[9]ꎻoshox33突变体通过改变GS1和GS2的表达呈现出叶片衰老的表型[10]ꎻAtHB12是一种潜在的关键调节因子ꎬ参与植物叶片发育的调节[11]ꎮ除此之外ꎬ许多研究结果表明HD ̄Zip蛋白也参与调节植物对非生物胁迫的响应[12 ̄13]ꎮ提高TaHDZipI ̄5基因的表达水平增强了转基因小麦对干旱胁迫和冷胁迫的抗性[12]ꎻ提高OsHOX24基因的表达水平增强了转基因水稻抗旱㊁抗盐能力[13]ꎻ玉米HD ̄Zip家族基因Zmhdz10通过调控干旱胁迫相关基因的表达正调控转基因拟南芥对干旱胁迫的响应[14]ꎮ尽管许多物种HD ̄Zip基因家族成员已被克隆并进行功能分析ꎬ然而ꎬ麻风树中参与生长发育和胁迫调控的HD ̄Zip基因仍然有待挖掘和进一步研究ꎮ麻风树又名小桐子ꎬ由于其具有生长快㊁适应性强㊁耐贫瘠㊁耐干旱㊁耐盐碱㊁种仁含油量高等特点成为生产生物柴油的明星物种ꎬ越来越引起科学家的重视[15]ꎮ因此ꎬ本研究拟从麻风树中挖掘响应盐胁迫的HD ̄Zip家族基因并对其调控的分子机制进行研究ꎬ以期为麻风树耐盐品种的培育提供理论依据ꎮ1㊀材料与方法1.1㊀植物材料与胁迫处理试验材料为麻风树自交系品种GZQX0401和拟南芥Columbia ̄0ꎮ选取6叶期麻风树的根㊁茎㊁叶㊁花和授粉后35d的种子进行JcHDZ28基因组织特异性表达分析ꎮ盐胁迫试验ꎬ对6叶期麻风树直接浇灌150mmol/L的NaCl溶液ꎬ选取胁迫处理0h㊁2h㊁6h㊁12h和24h的第4片叶ꎬ-80ħ保存备用ꎮ1.2㊀JcHDZ28基因序列分析麻风树JcHDZ28序列和该基因在别的物种中的同源基因均来自于NCBI(美国国立生物技术信息中心)ꎬJcHDZ28在拟南芥中的同源基因来自TAIR数据库ꎮ采用DNAMAN9.0软件进行蛋白质氨基酸序列分析ꎮ1.3㊀JcHDZ28基因亚细胞定位以麻风树叶片cDNA为模版ꎬ通过RT ̄PCR技术克隆获得不含终止密码子的JcHDZ28编码序列ꎬ随后将其连接到pBWA(V)HS ̄GLosgfp载体构建pBWA(V)HS ̄JcHDZ28 ̄GLosgfp融合表达载体ꎮ将构建好的pBWA(V)HS ̄JcHDZ28 ̄GLosgfp载体和pBWA(V)HS ̄GLosgfp载体通过聚乙二醇(PEG)介导转入拟南芥原生质体细胞ꎬ在共聚焦扫描显微镜(LeicaTCSSP8)上获得定位样品的荧光图像ꎮ聚乙二醇介导的转化和原生质体制备参照文献[16]的方法进行ꎮ1.4㊀基因克隆与转基因植株构建以麻风树叶片cDNA为模版ꎬ通过RT ̄PCR技术克隆获得JcHDZ28基因的全长编码序列ꎬ测序后ꎬ将测序正确的序列连接到p1301载体KpnI和XbaI的酶切位点之间ꎬ构建35S::JcHDZ28 ̄p1301植物表达载体ꎮ然后通过GV3101介导的花序浸染法将35S::JcHDZ28 ̄p1301载体转化到拟南芥中获得转基因植株[14]ꎮ通过潮霉素㊁β ̄葡萄糖苷酸酶(GUS)染色和RT ̄PCR确定有效JcHDZ28转基因植株用于后续试验研究ꎬ以期为麻风树耐盐品种的培育提供理论依据ꎮ1.5㊀转JcHDZ28基因植株盐胁迫分析首先用潮霉素将野生型拟南芥和转JcHDZ28基因植株种子消毒ꎬ4ħ暗处理2d后ꎬ将拟南芥Columbia ̄0(WTꎬ野生型)和转JcHDZ28基因植株种04江苏农业学报㊀2024年第40卷第1期子点播到1/2MS和含有100mmol/LNaCl的1/2MS培养基中ꎬ置于22ħ生长间中生长(16h光照/8h黑暗)ꎬ20d后观察表型ꎮ1.6㊀生理指标分析选用盐胁迫处理15d的野生型拟南芥和转JcHDZ28基因植株叶片进行相对电导率和脯氨酸含量测定ꎮ相对电导率的测定方法参照文献[14]ꎬ脯氨酸含量测定方法参照文献[17]ꎮ1.7㊀RNA提取和定量PCR分析RNA采用TRIzol试剂进行提取ꎬ采用InvitrogenSuperScriptIII逆转录酶试剂盒合成第一链cDNAꎬ具体操作方法参照试剂盒使用说明书进行ꎮ采用SYBRPremixExTaqTMII试剂盒和LightCycler480定量PCR仪进行qRT ̄PCR检测ꎮ基因相对表达量采用2-әәCt方法进行计算ꎮ本研究所用引物信息见表1ꎮ表1㊀本研究所用引物Table1㊀Primersusedinthisstudy基因㊀㊀㊀㊀㊀引物序列(5ᶄң3ᶄ)㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀目的JcHDZ28F:GTGAGCGTGTTGCGGTCCCR:CGAACGGTCCTGGTGTGATG基因表达量检测P5CS1F:GCCGGATAGACAGGAGAGGTR:TCTTCACATGCTTGGCTTCA基因表达量检测SNAC1F:GTCAAGACTGATTGGATCATGCR:CCAATCATCCAACCTGAGAGA基因表达量检测AtCATAF:TGGAGCTACTAGAGCTCAATCAACTGR:TGGCATCGGAAGCCAGAA基因表达量检测LEA3F:AGTGTAAGTTTCGGTGGGATCR:CACGCATGTTTACGGGTTTC基因表达量检测JcActinF:TAATGGTCCCTCTGGATGTGR:AGAAAAGAAAAGAAAAAAGCAGC内参基因AtActin2F:GCACCCTGTTCTTCTTACCGR:AACCCTCGTAGATTGGCACA内参基因JcHDZ28F:ATGATGGTTGAGAAAGAAGATTR:TTACGATCGAGGACGGAGG编码区序列片段克隆JcHDZ28F:ATGATGGTTGAGAAAGAAGATTR:CGATCGAGGACGGAGGGC亚细胞定位片段克隆2㊀结果与分析2.1㊀JcHDZ28基因的生物信息学分析设计特异性引物ꎬ以麻风树叶cDNA为模版ꎬ通过RT ̄PCR克隆获得JcHDZ28基因编码区序列ꎬ测序并通过NCBI比对ꎬ结果表明ꎬJcHDZ28基因编码区序列(CDS)全长882bpꎬ编码293个氨基酸ꎮ我们进一步通过DNAMAN软件对JcHDZ28及其与在别的物种中的同源基因的相似性进行了分析ꎬ结果表明ꎬ麻风树JcHDZ28蛋白与拟南芥㊁玉米和水稻中的HD ̄Zip家族成员高度同源ꎬ且均含有高度保守的HD和LZ基序(图1)ꎮ2.2㊀JcHDZ28基因的表达模式分析为了进一步研究JcHDZ28在植物生长发育中的作用ꎬ我们使用qRT ̄PCR分析了JcHDZ28基因在根㊁茎㊁叶㊁花和种子中的表达模式ꎬ结果表明ꎬ在所有被检测的器官中都检测到JcHDZ28的表达ꎬ且JcHDZ28基因在生殖器官(花和种子)中的相对表达量较高(图2a)ꎮ我们进一步检测了JcHDZ28基因在盐胁迫下的表达模式ꎬ结果表明ꎬJcHDZ28基因在盐胁迫2h㊁6h㊁12h和24h的相对表达量均显著低于盐胁迫0h的相对表达量ꎬ且盐胁迫24h的相对表达量相比盐胁迫6h㊁12h有所提高(图2b)ꎮ该结果进一步表明ꎬJcHDZ28基因也许在植物响应盐胁迫中起重要的调控作用ꎮ2.3㊀JcHDZ28蛋白的亚细胞定位为了检测JcHDZ28蛋白的亚细胞定位ꎬ我们构建了35S::JcHDZ28 ̄GLosgfp融合表达载体ꎮ随后将构建好的质粒连同35S::GFP质粒一起转化到拟南芥原生质体细胞ꎬ在共聚焦扫描显微镜上获得定位样品的荧光图像ꎮ结果(图3)表明ꎬ35S::GFP质粒在所有细胞中都可以检测到荧光信号ꎬ然而ꎬ14唐跃辉等:麻风树JcHDZ28基因克隆与功能分析35S::JcHDZ28 ̄GFP质粒只在细胞核中检测到了明亮的绿色信号ꎮ这些结果表明ꎬJcHDZ28蛋白定位于细胞核中ꎮOshox1表示水稻中的HD ̄Zip家族蛋白ꎻZmhdz25表示玉米中的HD ̄Zip家族蛋白ꎻAtHB2表示拟南芥中的HD ̄Zip家族蛋白ꎮ图1㊀JcHDZ28蛋白质氨基酸序列分析Fig.1㊀AminoacidsequenceanalysisofJcHDZ28proteina:JcHDZ28基因组织特异性表达ꎻb:JcHDZ28基因在盐胁迫条件下的表达模式分析ꎮ∗∗表示在盐胁迫2h㊁6h㊁12h㊁24h与0h相比差异极显著(P<0 01)ꎮ图2㊀JcHDZ28基因表达模式分析Fig.2㊀AnalysisofJcHDZ28geneexpressionprofile2.4㊀转JcHDZ28基因拟南芥表型分析为了进一步研究JcHDZ28基因的功能ꎬ我们构建了过表达转JcHDZ28基因拟南芥植株ꎮRT ̄PCR结果表明ꎬ检测到JcHDZ28基因在转基因株系中高表达ꎬ在野生型中没有检测到表达(图4a)ꎮ表型分析结果表明ꎬ过表达JcHDZ28不影响拟南芥地上部分生长发育(图4b)ꎮ开花时间统计结果表明ꎬ转JcHDZ28基因植株开花时间与野生型相比没有显著差异ꎬ表明过表达JcHDZ28不影响拟南芥开花时间(图4c)ꎮ这些结果表明ꎬJcHDZ28基因不影响转基因拟南芥地上部分的生长和发育ꎮ2.5㊀转JcHDZ28基因拟南芥盐胁迫抗性分析qRT ̄PCR结果表明盐胁迫抑制JcHDZ28基因的表达(图2b)ꎬ因此我们推测JcHDZ28也许参与植物对盐胁迫的响应ꎮ为了证明这个假设ꎬ我们进24江苏农业学报㊀2024年第40卷第1期图3㊀JcHDZ28蛋白亚细胞定位分析Fig.3㊀SubcellularlocalizationanalysisofJcHDZ28proteina:JcHDZ28基因在野生型拟南芥和转基因拟南芥中的表达情况ꎻb:转JcHDZ28基因植株表型分析ꎻc:转JcHDZ28基因植株开花时间统计ꎮWT:野生型ꎻOE1:转JcHDZ28基因植株1号株系ꎻOE2:转JcHDZ28基因植株2号株系ꎻOE3:转JcHDZ28基因植株3号株系ꎮ图4㊀转JcHDZ28基因拟南芥表型分析Fig.4㊀PhenotypeanalysisofJcHDZ28transgenicArabidopsis一步检测了野生型和转基因植株对盐胁迫的抗性ꎮ我们将消毒后的野生型和转JcHDZ28基因植株直接点播到1/2MS和含有100mmol/LNaCl的1/2MS培养基中生长20dꎮ结果表明ꎬ在盐胁迫条件下ꎬ转基因拟南芥植株大小明显小于野生型拟南芥植株大小ꎬ叶片白化更严重(图5a)ꎬ存活率极显著低于野生型拟南芥(图5b)ꎮ生理指标测定结果表明ꎬ在盐胁迫条件下ꎬ转基因拟南芥植株叶片相对电导率极显著高于野生型拟南芥(图5c)ꎬ脯氨酸含量极显著低于野生型拟南芥(图5d)ꎮ这些结果表明ꎬ过表达JcHDZ28降低了转JcHDZ28基因植株对盐胁迫的抗性ꎮ2.6㊀盐胁迫条件下非生物胁迫相关基因表达为了进一步阐明JcHDZ28调控拟南芥响应盐胁迫的分子机理ꎬ我们通过qRT ̄PCR技术检测了SNAC1㊁AtCATA㊁LEA3㊁P5CS1等胁迫相关基因的表达ꎮ结果表明ꎬ在正常生长条件下ꎬSNAC1㊁AtCA ̄TA㊁LEA3㊁P5CS1在野生型拟南芥和转JcHDZ28基因拟南芥植株中的相对表达量没有显著差异ꎬ然而ꎬ在盐胁迫条件下ꎬ这些基因在转JcHDZ28基因拟南34唐跃辉等:麻风树JcHDZ28基因克隆与功能分析芥植株中的相对表达量显著低于在野生型拟南芥中的相对表达量(图6)ꎮ这些结果表明ꎬ盐胁迫条件下ꎬ过表达JcHDZ28增加转基因拟南芥对盐胁迫的敏感性也许是通过改变这些非生物胁迫相关基因的表达引起的ꎮa:野生型拟南芥和转JcHDZ28基因拟南芥在正常生长和盐胁迫(100mmol/LNaCl)条件下的生长分析ꎻb:成活率分析ꎻc:相对电导率分析ꎻd:脯氨酸含量分析ꎮWT:野生型ꎻOE1:转JcHDZ28基因植株1号株系ꎻOE2:转JcHDZ28基因植株2号株系ꎻOE3:转JcHDZ28基因植株3号株系ꎮ∗∗表示在盐胁迫条件下转基因植株与野生型植株相比差异极显著(P<0 01)ꎮ图5㊀转JcHDZ28基因拟南芥对盐胁迫的抗性分析Fig.5㊀ResistanceanalysisofJcHDZ28transgenicArabidopsistosaltstressWT:野生型ꎻOE1:转JcHDZ28基因植株1号株系ꎻOE2:转JcHDZ28基因植株2号株系ꎻOE3:转JcHDZ28基因植株3号株系ꎮ图6㊀盐胁迫条件下相关基因的表达水平Fig.6㊀Expressionlevelsofrelatedgenesundersaltstressconditions44江苏农业学报㊀2024年第40卷第1期3㊀讨论HD ̄Zip基因是植物特异性转录因子基因ꎬ这些转录因子基因在植物生长发育(如胚胎发生㊁分生组织调控等)和非生物胁迫(如高盐㊁干旱等)过程中发挥重要的作用[1]ꎮ尽管许多HD ̄Zip转录因子基因在拟南芥㊁水稻和别的物种中的功能已经被阐述ꎬ但是HD ̄Zip基因在大戟科尤其是麻风树中的研究较少ꎮ在本研究中ꎬ我们克隆了麻风树JcHDZ28基因(1个HD ̄Zip家族基因的成员)并分析了该基因的功能ꎬ在拟南芥中超表达JcHDZ28增加了转基因植物对盐胁迫的敏感性ꎮ前人研究结果表明ꎬ超表达HD ̄Zip家族基因能够改变转基因植物对非生物胁迫的抗性[12 ̄15]ꎮ在水稻中ꎬ过表达HD ̄Zip家族基因增加了转基因水稻对非生物胁迫的敏感性[15]ꎮ与此相似ꎬ在本研究中ꎬ转JcHDZ28基因拟南芥在盐胁迫条件下的植株大小和存活率均低于野生型拟南芥ꎮ前人研究结果表明ꎬ当植物遭遇非生物胁迫的时候ꎬ其体内的一些生理指标迅速变化使得植物能够更好地应对这些极端环境条件[12 ̄14]ꎮ因此ꎬ生理指标可以用来衡量植物对非生物胁迫的抗性ꎮ相对电导率是植物遭受逆境胁迫时其细胞膜损伤程度的重要评价因子[15]ꎮ本研究结果表明ꎬ转JcHDZ28基因拟南芥在盐胁迫条件下的相对电导率极显著高于野生型拟南芥ꎬ该结果进一步表明ꎬ盐胁迫对转JcHDZ28基因拟南芥细胞膜的破坏程度显著高于野生型拟南芥ꎮ脯氨酸能够用来作为稳定剂降低高盐㊁干旱等极端环境胁迫对植物的危害[16 ̄17]ꎮ本研究结果表明ꎬ在盐胁迫条件下ꎬ转JcHDZ28基因拟南芥叶片脯氨酸的含量显著低于野生型拟南芥ꎬ该结果进一步表明ꎬ在盐胁迫条件下ꎬ脯氨酸也许是一个导致转JcHDZ28基因拟南芥具有更高敏感性的因子ꎮ以上结果进一步表明ꎬ盐胁迫对转基因拟南芥的破坏程度显著高于野生型拟南芥ꎮ除了上述生理指标外ꎬ转基因植物对盐胁迫敏感性的增加也归因于非生物胁迫响应基因的下调表达[18]ꎮ例如ꎬHsfA3s通过降低非生物胁迫响应基因的表达增加了转基因植物对盐胁迫的敏感性[18]ꎮ与此类似ꎬ在我们的研究中ꎬ在盐胁迫条件下ꎬ一些非生物胁迫应答基因(SNAC1㊁AtCATA㊁LEA3和P5CS1)在转基因拟南芥中的相对表达量显著低于在野生型拟南芥中的相对表达量ꎮ综上ꎬ过表达JcHDZ28降低了转基因拟南芥对盐胁迫的抗性可能是因为降低了非生物胁迫相关基因的表达ꎮ本研究结果将有助于我们进一步了解HD ̄Zip转录因子基因JcHDZ28在麻风树中的生理功能ꎮ参考文献:[1]㊀LIYXꎬYANGZRꎬZHANGYYꎬetal.TherolesofHD ̄ZIPproteinsinplantabioticstresstolerance[J].FrontiersinPlantSci ̄enceꎬ2022ꎬ13:1027071.[2]㊀沈㊀丹ꎬ杨㊀莉ꎬ胡㊀威ꎬ等.柑橘胁迫响应基因WRKY47的克隆与表达分析[J].江苏农业学报ꎬ2021ꎬ37(1):129 ̄138. [3]㊀董舒超ꎬ凌嘉怡ꎬ赵丽萍ꎬ等.转录因子调控番茄抗旱性研究进展[J].江苏农业科学ꎬ2023ꎬ51(9):9 ̄16.[4]㊀JIAOMYꎬZHANGJꎬCHENGWWꎬetal.IdentificationoftheAP2/ERFtranscriptionfactorfamilyofEleutherococcussenticosusanditsexpressioncorrelationwithdroughtstress[J].3Biotechꎬ2023ꎬ13(7):259.[5]㊀WANGHLꎬCHENGXꎬYINDMꎬetal.Advancesinthere ̄searchonplantWRKYtranscriptionfactorsresponsivetoexternalstresses[J].CurrentIssuesinMolecularBiologyꎬ2023ꎬ45(4):2861 ̄2880.[6]㊀JOOHꎬBAEKWꎬLIMCWꎬetal.Post ̄translationalmodifica ̄tionsofbZIPtranscriptionfactorsinabscisicacidsignalinganddroughtresponses[J].CurrentGenomicsꎬ2021ꎬ22(1):4 ̄15. [7]㊀ARIELFDꎬMANAVELLAPAꎬDEZARCAꎬetal.ThetruestoryoftheHD ̄Zipfamily[J].TrendsinPlantScienceꎬ2007ꎬ12(9):419 ̄426.[8]㊀LIZQꎬZHANGCꎬGUOYHꎬetal.Evolutionandexpressiona ̄nalysisrevealthepotentialroleoftheHD ̄Zipgenefamilyinregu ̄lationofembryoabortioningrapes(VitisviniferaL.)[J].BMCGenomicsꎬ2017ꎬ18:744.[9]㊀KOVALCHUKNꎬCHEWWꎬSORNARAJPꎬetal.Thehome ̄odomaintranscriptionfactorTaHDZipI ̄2fromwheatregulatesfrosttoleranceꎬfloweringtimeandspikedevelopmentintransgenicbar ̄ley[J].NewPhytologistꎬ2016ꎬ211(2):671 ̄687.[10]LUANWJꎬSHENAꎬJINZPꎬetal.KnockdownofOsHox33ꎬamemberoftheclassⅢhomeodomain ̄leucinezippergenefamilyꎬacceleratesleafsenescenceinrice[J].ScienceChina ̄LifeSci ̄encesꎬ2013ꎬ56(12):1113 ̄1123.[11]HURYSꎬUMJHꎬKIMSꎬetal.Arabidopsisthalianahomeobox12(ATHB12)ꎬahomeodomain ̄leucinezipperproteinꎬregulatesleafgrowthbypromotingcellexpansionandendoreduplication[J].NewPhytologistꎬ2015ꎬ205(1):316 ̄328.[12]YANGYFꎬLUANGSꎬHARRISJꎬetal.OverexpressionoftheclassIhomeodomaintranscriptionfactorTaHDZipI ̄5increasesdroughtandfrosttoleranceintransgenicwheat[J].PlantBiotech ̄nologyJournalꎬ2018ꎬ16(6):1227 ̄1240.54唐跃辉等:麻风树JcHDZ28基因克隆与功能分析[13]TANGYHꎬWANGJꎬBAOXXꎬetal.Genome ̄wideidentifica ̄tionandexpressionprofileofHD ̄ZIPgenesinphysicnutandfunctionalanalysisoftheJcHDZ16geneintransgenicrice[J].BMCPlantBiologyꎬ2019ꎬ19:298.[14]BHATTACHARJEEAꎬKHURANAJꎬJAINM.CharacterizationofricehomeoboxgenesꎬOsHOX22andOsHOX24ꎬandover ̄expressionofOsHOX24intransgenicArabidopsissuggesttheirroleinabioticstressresponse[J].FrontiersinPlantScienceꎬ2016ꎬ7:627. [15]ZHAOYꎬMAQꎬJINXLꎬetal.Anovelmaizehomeodomain ̄leucinezipper(HD ̄Zip)IgeneꎬZmhdz10ꎬpositivelyregulatesdroughtandsalttoleranceinbothriceandArabidopsis[J].PlantCellandPhysiologyꎬ2014ꎬ55(6):1142 ̄1156.[16]ABDULLARꎬCHANESꎬRAVINDRAP.BiodieselproductionfromJatrophacurcas:acriticalreview[J].CriticalReviewsinBi ̄otechnologyꎬ2011ꎬ31(1):53 ̄64.[17]LIUKQꎬTANGYHꎬTANGYYꎬetal.EctopicexpressionofWRINKLED1inriceimproveslipidbiosynthesisbutretardsplantgrowthanddevelopment[J].PLoSOneꎬ2022ꎬ17(8):e0267684. [18]WUZꎬLIANGJHꎬWANGCPꎬetal.OverexpressionoflilyHs ̄fA3sinArabidopsisconfersincreasedthermotoleranceandsaltsen ̄sitivityviaalterationsinprolinecatabolism[J].JournalofExperi ̄mentalBotanyꎬ2018ꎬ69(8):2005 ̄2021.(责任编辑:陈海霞)64江苏农业学报㊀2024年第40卷第1期。
《白花丹参HDR基因的克隆和功能分析及无抗生素筛选标记转化体系的建立》一、引言白花丹参是一种重要的药用植物,具有广泛的药理作用和医疗价值。
随着分子生物学技术的发展,基因克隆和功能分析成为了研究白花丹参的重要手段。
本文旨在探讨白花丹参中过氧化氢酶(过氧化氢分解还原酶,HDR)基因的克隆与功能分析,以及无抗生素筛选标记转化体系的建立,以期为白花丹参的遗传改良提供理论基础和实践依据。
二、材料与方法1. 材料本实验所使用的白花丹参材料采自自然环境下的野生植株。
实验中使用的试剂、酶、载体等均为市售产品,符合实验要求。
2. 方法(1)HDR基因的克隆通过PCR技术,从白花丹参基因组DNA中扩增出HDR基因,使用引物设计软件设计特异性引物,然后利用琼脂糖凝胶电泳及测序验证基因序列。
(2)HDR基因的功能分析采用生物信息学方法,对HDR基因的编码序列进行预测,分析其结构域、功能域及保守序列等。
同时,通过构建过表达和沉默载体,在植物细胞中进行功能验证。
(3)无抗生素筛选标记转化体系的建立采用基因枪法或农杆菌介导法将目的基因导入白花丹参中,建立无抗生素筛选标记的转化体系。
通过观察转化后植株的生长状况、基因表达情况等,筛选出稳定遗传的转基因植株。
三、实验结果1. HDR基因的克隆与序列分析成功克隆出白花丹参HDR基因,经测序验证,其序列正确。
生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白质具有典型的过氧化氢酶结构域,具备过氧化氢分解还原酶活性。
2. HDR基因的功能分析通过对HDR基因进行过表达和沉默处理,发现该基因在植物抗逆、抗病等方面具有重要作用。
过表达HDR基因的植株表现出较强的抗逆性,沉默该基因的植株则表现出对逆境的敏感性。
这表明HDR基因在白花丹参中具有重要功能。
3. 无抗生素筛选标记转化体系的建立通过基因枪法或农杆菌介导法将目的基因导入白花丹参中,成功建立了无抗生素筛选标记的转化体系。
在转化后的植株中,观察到部分植株表现出稳定的遗传性状和良好的生长状况。