第一章绪论
☐DNA重组技术和基因工程技术。
DNA重组技术又称基因工程技术，目的是将不同DNA片段（基因或基因的一部分）按照人们的设计定向连接起来，在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达，产生影响受体细胞的新的遗传性状。
DNA重组技术是核酸化学、蛋白质化学、酶工程及微生物学、遗传学、细胞学长期深入研究的结晶，而限制性内切酶DNA连接酶及其他工具酶的发现与应用则是这一技术得以建立的关键。
DNA重组技术有着广泛的应用前景。首先，DNA重组技术可以用于大量生产某些在正常细胞代谢中产量很低的多肽，如激素、抗生素、酶类及抗体，提高产量，降低成本。其次，DNA重组技术可以用于定向改造某些生物的基因结构，使他们所具有的特殊经济价值或功能成百上千倍的提高。
☐请简述现代分子生物学的研究内容。
1、DNA重组技术(基因工程)
2、基因表达调控(核酸生物学)
3、生物大分子结构功能(结构分子生物学)
4、基因组、功能基因组与生物信息学研究
第二章遗传的物质基础及基因与基因组结构
☐核小体、DNA的半保留复制、转座子。
核小体是染色质的基本结构单位。是由H2A、H2B、H3、H4各两分子生成八聚体和由大约200bp的DNA构成的。核小体的形成是染色体中DNA压缩的第一步。
DNA在复制过程中，每条链分别作为模板合成新链，产生互补的两条链。这样新形成的两个DNA分子与原来DNA分子的碱基顺序完全一样。因此，每个子代分子的一条链来自亲代DNA，另一条链则是新合成的，这种复制方式被称为DNA的半保留复制。
转座子是存在染色体DNA上的可自主复制和移位的基本单位。转座子分为两大类：插入序列和复合型转座子。
☐DNA的一、二、三级结构特征。
DNA的一级结构是指4种脱氧核苷酸的连接及其排列顺序，表示了该DNA分子的化学构成。
DNA的二级结构是指两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构。分为左手螺旋和右手螺旋。
DNA的高级结构是指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。超螺旋结构是DNA高级结构的主要形式，可分为正超螺旋与负超螺旋两大类。
☐DNA复制通常采取哪些方式？
1、线性DNA双链的复制：复制经过起始、延伸、终止和分离三个阶段。复制是从5’端向3’端移动，前导链的合成是连续的，后随链通过冈崎片段连接成完整链。
2、环状DNA双链的复制
(1)θ型：是一种双向复制方式。复制的起始点涉及DNA的结旋和松开，形成两个方向相反的复制叉，复制从定点开始双向等速进行。
(2) 滚环型：是单向复制的一种特殊方式，发生在噬菌体DNA和细菌质粒上，首先对正链原点进行专一性的切割，形成的5’端被单链结合蛋白所覆盖，3’端在DNA聚合酶的作用下
不断延伸。
(3) D-环复制：也是单向复制的一种方式。是在线粒体DNA中发现的。两条链的合成是高度不对称的，最初只以一条母链为模版合成，迅速合成互补的新链，另一条则成为游离的单链环（即D环）。
☐真核生物DNA的复制在哪些水平上受到调控？
1、细胞生活周期水平调控：决定细胞停留在G1期还是进入S期。
2、染色体水平调控：决定不同染色体或同一染色体不同部位的复制子按一定顺序在S期起始复制。
3、复制子水平调控：决定复制的起始与否，并且是高度保守的。
☐DNA 修复包括哪几种？
1、错配修复：识别新合成链中的错配并加以校正，保证子链的正确性。
2、切除修复
1）碱基切除修复：切除突变的碱基
2）核苷酸切除修复：修复被破坏的DNA
3、DNA直接修复：修复嘧啶二聚体或者甲基化DNA
第三章生物信息的传递--RNA转录与加工
☐定义：Pribnow box，编码链，上升突变，增强子。
在原核生物启动子被保护区内有一个由5个核苷酸组成的保守序列TATATT，是聚合酶结合位点，称为Pribnow区，其中央大约位于起点上游10bp处，所以又称为–10区。
在DNA的两条链中与mRNA序列相同的那条DNA链是编码链或称有意义链。
如果增加Pribnow区的共同序列，将乳糖操纵子的启动子中的TATGTT变成TA TATT，就会提高启动子的效率，称为上升突变。
在一些转录单元上发现其转录起始位点上游约200bp处有两段72bp长的重复序列，它们不是启动子的一部分，但能增强或促进转录的起始，因此，称这种能强化转录起始的序列为增强子或强化子
☐简述生物体内RNA的种类和功能。
生物体内拥有三种RNA，即：
编码特定蛋白质序列的mRNA；
能特异性解读mRNA 中的遗传信息并将其转化成相应氨基酸后加入多肽链中的tRNA；
直接参与核糖体中蛋白质合成的rRNA。
☐什么是DNA模板与mRNA及蛋白质产物之间的共线性关系？
核苷酸特异性的组成和排列顺序决定了贮存在DNA上的遗传信息，并通过转录mRNA传递遗传信息，此过程是从起始核苷酸开始，一个脱氧核苷酸对应一个核苷酸，不重叠，不跳跃，一一对应。mRNA上每3个核苷酸翻译成蛋白质多肽链上的一个氨基酸，这个过程也是连续的，而且没有发生重叠现象。因此，什么是DNA模板与mRNA及蛋白质产物之间的共线性关系。
☐转录一般被分为哪几个步骤？
无论是原核还是真核细胞，转录的基本过程都包括：
1、模板识别：模板识别阶段主要指RNA聚合酶与启动子DNA双链相互作用并与之相结合的过程。
2、转录起始：转录起始就是RNA链上第一个核苷酸键的产生。
3、通过启动子：RNA聚合酶成功地合成9个以上核苷酸并离开启动子区，转录就进入正常的延伸阶段。
4、转录的延伸和终止：RNA聚合酶离开启动子，沿DNA链移动并使新生RNA链不断伸长的过程就是转录的延伸。当RNA链延伸到转录终止位点时，RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯键，RNA-DNA杂合物分离，
☐转录终止子与翻译终止密码的结构特点？
转录终止子：1、不依赖于ρ因子的终止
终止位点上游一般有一个富含GC碱基的二重对称区，由这段DNA转录产生的RNA容易形成发夹式结构。新生RNA中出现发夹式结构会导致RNA聚合酶的暂停，破坏RNA-DNA 杂合链5’端的正常结构。
在终止位点前面有一段由4-8个A组成的序列，所以转录产物的3’端为寡聚U，这种结构特征的存在决定了转录的终止。寡聚U的存在使杂合链的3’端部分出现不稳定的rU•dA区域，两者共同作用使RNA从三元复合物中解离出来。
2、依赖ρ因子的终止
ρ因子：六聚体蛋白, 水解各种核甘三磷酸，通过催化NTP的水解促使新生RNA链从三元转录复合物中解离出来，从而终止转录。
翻译终止密码：肽链延伸过程中，终止密码子出现在核糖体A位时，没有相应的AA-tRNA 与之结合，而释放因子能识别这些终止密码子并与之结合，水解P位上多肽链与tRNA之间的二脂键。接着，新生的肽链和tRNA从核糖体上释放出来，核糖体大小亚基解体，蛋白质合成结束。
☐什么是RNA编辑？其生物学意义？
编辑（editing）是指转录后的RNA特别是mRNA在编码区发生碱基的突变、加入或丢失等现象。
RNA编辑的生物学意义
校正作用：RNA的编辑可以恢复丢失的遗传信息。
调控翻译：构建或者去除起始密码子和终止密码子，是基因表达调控的一种方式。
扩充遗传信息：使基因产物获得新的结构和功能，有利于生物进化。
第四章生物信息的传递--蛋白质的翻译
☐定义：SD序列，信号肽。
SD序列：存在于原核生物起始密码子上游7-12个核苷酸的一段富含嘌呤保守区域，它与16SrRNA3‘端反向互补，在mRNA与核糖体结合中起重要作用。
信号肽：在蛋白质多肽链的氨基端，有一段疏水性氨基酸序列，它负责把蛋白质引导到细胞内不同膜结构的亚细胞器内。
☐简述tRNA 的结构。
tRNA一级结构是四种核糖核苷酸的组成和排列顺序，单链。
tRNA二级结构是三叶草形的，由于小片段碱基互补配对所形成。三叶草形的tRNA分子上有4条根据它们的结构或功能命名的手臂。
tRNA的三级结构，都呈L形折叠式，而这种结构是靠二级结构中未配对碱基间所形成的氢键来维持的。tRNA的三级结构与氨酰-tRNA合成酶对tRNA的识别有关。
☐简述核糖体的组成及其功能。
核糖体是由几十种蛋白质和几种核糖体RNA（ribosomal RNA，rRNA)组成的亚细胞颗粒。
