猪伪狂犬病病毒PCR-LFD检测方法的建立及应用
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猪流行性腹泻病毒与猪伪狂犬病病毒二重 RT-PCR 检测方法的建立及应用孙彦琴;马震原;闫若潜;王东方;曹伟伟;郭育培【摘要】为建立猪流行性腹泻病毒(PEDV)与猪伪狂犬病病毒(PRV)的快速鉴别检测方法,本研究根据 GenBank已登录的 PEDV 膜蛋白 M 基因和 PRV gE 基因保守区域序列设计了2对特异性引物,以 PRV 和 PEDV 混合总RNA 为反转录模板,初步建立了 PRV 和 PEDV 的二重 RT-PCR 检测方法,并进行了特异性、敏感性、重复性验证和临床应用检测。
结果显示,该方法对两种病毒的最低检测限均为10 TCID50/mL 病毒含量,重复性好,特异性强,可特异性地扩增 PEDV 和 PRV 细胞培养物,但对其他7种病原对照扩增不出任何条带,对26份临床疑似 PEDV和PRV 感染样品检测结果与测序鉴定结果完全一致。
本研究成功建立了 PEDV 和PRV 的二重 RT-PCR 检测方法,为临床上猪流行性腹泻和猪伪狂犬病的快速鉴别诊断提供了方法。
%In order to establish an assay for detecting porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)and pseudorabies virus (PRV),two pairs of primers were designed basing on the M gene of PEDV and gE gene of PRV,respectively.The total RNA of standard PEDV and PRV strains were used as templates to establish the duplex RT-PCR assay.Thespecificity,sensitivity,repetition and clinic detection of the established assay were tested.The result revealed that the threshold of duplex RT-PCR was10 TCID50/mL of PEDV and PRV,and no products were amplified from the cell or the nucleic acid of other 7 kinds of pathogenic viral or bacterial microorganism.The detection re-sults for 26 clinical suspicious PEDV or PRV infected pigs were consistent with the results tested bysequencing.This study suggested that the duplex RT-PCR method was highly specific,repeat-able and sensitive,and was suitable for clinic rapid differential diagnosis of PEDV and PRV.【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2016(043)009【总页数】6页(P2455-2460)【关键词】猪流行性腹泻病毒;猪伪狂犬病病毒;二重 RT-PCR【作者】孙彦琴;马震原;闫若潜;王东方;曹伟伟;郭育培【作者单位】河南省动物卫生监督所,郑州 450008;河南省动物疫病预防控制中心,郑州 450008;河南省动物疫病预防控制中心,郑州 450008;河南省动物疫病预防控制中心,郑州 450008;河南省动物疫病预防控制中心,郑州 450008;河南省动物疫病预防控制中心,郑州 450008【正文语种】中文【中图分类】S858.28猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的猪急性、高度接触性传染病,可引起初生仔猪以呕吐、腹泻、脱水为主要特征的消化道症状,各年龄段猪均易感,对10日龄内产房仔猪危害最为严重[1-2]。
应用PCR检测猪伪狂犬病毒野毒的研究张婕;李增奎【摘要】[目的]对猪伪狂犬病毒野毒进行检测.[方法]根据已发表的猪伪狂犬病病毒gE基因核苷酸序列,设计合成1对引物,扩增片段长度为276 bp,优化PCR反应条件,建立检测PRV野毒的PCR方法.[结果]利用建立的PCR方法检测疑似PRV野毒感染的临床送检组织病料34份,阳性样品18份,阳性率达52.94%(18/34),选取6份阳性病料PCR产物送生工生物工程(上海)股份有限公司进行序列鉴定,测序结果表明均为PRV gE基因特异性序列.[结论]该方法敏感、特异、可靠,可用于PRV野毒感染的快速诊断和流行病学调查.【期刊名称】《安徽农业科学》【年(卷),期】2014(000)009【总页数】3页(P2548-2549,2553)【关键词】猪伪狂犬病毒;gE基因;PCR;检测【作者】张婕;李增奎【作者单位】青海省大通县东峡镇畜牧兽医站,青海大通810104;青海省畜牧兽医科学院,青海西宁810003【正文语种】中文【中图分类】S852.65+1猪伪狂犬病(pseudorabies,PR)是由猪伪狂犬病毒(pseudorabies virus,PRV)引起的猪的一种急性、热性、败血性传染病[1-2]。
PRV属疱疹病毒科(Herpesvifidae)a-疱疹病毒亚科(Alpha-herpesvirinae),具有疱疹病毒的典型特征,可引起猪的潜伏感染[3-4]。
PRV的潜伏感染并不使感染猪表现临床症状,但可使感染猪终身带毒并排毒,增加了PR预防控制的难度,故对PRV潜伏感染猪的筛查至关重要[5]。
目前,世界各国广泛应用PRV gE基因缺失疫苗进行PR的防控,且欧美等发达国家应用PRV gE基因缺失弱毒疫苗与其配套的鉴别诊断方法已经实现了PRV的净化[6]。
我国自20世纪70年代中期以来,广泛使用gE基因缺失弱毒疫苗,其对PR的防控起到了重要的作用,但同时也给PRV野毒感染和疫苗接种的鉴别诊断带来了较大困难,尤其是2011年以来我国多个使用gE基因缺失弱毒疫苗免疫的规模化猪场出现了PRV野毒的感染与流行[7],亟待建立可以准确诊断PRV强毒和疫苗毒敏感、特异的鉴别检测方法。
猪伪狂犬病诊断技术研究进展随着养殖业的发展和城市化进程的加快,猪伪狂犬病的防控成为了一个重要的课题。
猪伪狂犬病是由伪狂犬病病毒引起的、猪类特有的一种病毒性传染病,具有潜伏期短、传播速度快、死亡率高等特点,给猪养殖业造成了严重的经济损失。
因此,研究猪伪狂犬病诊断技术对于疫情的防控和养殖业的可持续发展具有重要意义。
目前,国内外对猪伪狂犬病诊断技术的研究主要集中在以下几个方面。
首先,分子生物学技术在猪伪狂犬病的诊断中发挥着重要的作用。
PCR技术能够快速、准确地检测出病原体DNA,为病毒的早期检测提供了重要手段。
而实时荧光定量PCR技术则可以定量检测病毒的数量,并可以与临床症状进行相关分析,有助于病情监测和疫情防控。
其次,免疫学技术在猪伪狂犬病的诊断中也占据重要地位。
酶联免疫吸附试验(ELISA)可以检测病原体抗原或抗体水平,是一种高通量、高灵敏度的检测方法,常用于大规模筛查和疫情监测。
而免疫荧光技术(IF)和免疫组织化学(ICH)则可以直接观察病原体在组织中的分布情况,为病程和病理研究提供了重要依据。
第三,生物学方法可以有效地进行猪伪狂犬病的诊断。
传统的生物学方法包括病毒分离、培养和鉴定。
虽然这些方法具有一定的局限性,但是仍然是确诊猪伪狂犬病的重要手段。
此外,近年来,猪伪狂犬病的新型诊断技术如核酸酶链以及间接免疫电镜技术也在逐渐应用于临床实践中。
最后,生物信息学和大数据技术的发展为猪伪狂犬病的诊断提供了新的思路。
通过对病毒基因组序列进行比对和分析,可以找到特异性的靶基因,研发高灵敏、高特异的诊断试剂。
而利用大数据技术,可以快速、准确地分析病情,为防控措施的制定提供科学依据。
综上所述,猪伪狂犬病诊断技术的研究进展包括了分子生物学技术、免疫学技术、生物学方法以及生物信息学与大数据技术等多个方面。
这些技术的应用,使得猪伪狂犬病的早期预防和监控成为可能,对于病情的控制和猪养殖业的可持续发展具有重要意义。
预计在不久的将来,随着技术的进一步发展和完善,猪伪狂犬病的诊断将更加准确、快速和低成本。
检测伪狂犬病病毒的交叉引物扩增方法的建立和评价检测伪狂犬病病毒的交叉引物扩增方法的建立和评价引言:伪狂犬病病毒是引起家养犬类和猫等动物发生急性中枢神经系统感染的病原体,具有高度的致病性和传染性。
为了快速、准确地检测和诊断伪狂犬病病毒感染,本研究旨在建立一种基于交叉引物扩增的检测方法,并对其进行评价。
材料与方法:1. 病毒标本采集与预处理从疑似患有伪狂犬病的动物中采集脑组织标本,按照常规方法进行处理,提取病毒核酸。
2. 引物设计根据伪狂犬病病毒的基因序列,设计一对特异性引物,分别位于病毒基因组内的两个保守区域,以提高检测的灵敏度和特异性。
3. RT-PCR体系的建立根据之前的研究经验,优化反转录和聚合酶链反应(RT-PCR)的体系,确定最适合该方法的反应条件。
4. 交叉引物扩增实验将病毒核酸模板与交叉引物的反应体系加入RT-PCR体系中,进行扩增实验。
同时,利用传统的PCR检测方法作为对照。
5. 评价指标的确定评价指标包括灵敏度、特异性和重复性。
通过检测不同浓度的病毒标本和无关病毒标本,以及重复检测同一标本来评价该方法的准确性和可靠性。
结果与讨论:1. 引物设计与RT-PCR体系的建立通过基因序列比对和生物软件的辅助,成功设计了一对特异性的引物,并优化了RT-PCR反应体系,确保扩增反应的高效和选择性。
2. 交叉引物扩增实验在扩增实验中,交叉引物能够成功扩增出伪狂犬病病毒的特异性片段,在电泳结果中能够明确检测到目标片段的存在。
同时,传统的PCR方法也能够成功检测到目标片段,说明交叉引物扩增方法的结果是可靠的。
3. 评价指标的确定通过对不同浓度的病毒标本进行扩增实验,发现交叉引物扩增方法对不同浓度的病毒标本的灵敏度较高,能够检测到低至10个病毒拷贝的标本。
同时,对于无关病毒标本的检测,交叉引物扩增方法显示了较高的特异性。
此外,重复实验的结果也表明了交叉引物扩增方法的重复性良好。
结论:本研究成功建立了一种基于交叉引物扩增的检测伪狂犬病病毒的方法,并对其进行了评价。
猪细小病毒、伪狂犬病病毒和猪圆环病毒2型多重PCR检测方法的建立及应用孙黎;郭抗抗;王静;刘伟;曹伟伟;吕其壮;张彦明【期刊名称】《动物医学进展》【年(卷),期】2011(032)008【摘要】根据猪细小病毒(PPV)、伪狂犬病病毒(PRV)和猪圆环病毒2型(PCV-2)的基因序列,分别选取各自的保守区段设计引物,通过反应条件的优化,建立了检测PPV、PRV和PCV-2的多重PCR方法.用建立的方法对采自陕西省部分猪场的286份病料及血样进行检测,从对临床健康猪全血样品中PPV、PRV和PCV-2的检测结果看,PCV-2在正常猪群中有一定比例的存在,同时在个别猪场也存在PRV 和PCV-2双重感染的现象;从临床患病猪病料中检测发现,PRV和PCV-2混合感染较严重,并有PPV+ PRV+ PCV-2三重感染发生;多重PCR检测结果与单项PCR检测结果的符合率达99%以上,说明建立的多重PCR检测方法可用于临床样品的检测,为疾病诊断提供参考.【总页数】7页(P25-31)【作者】孙黎;郭抗抗;王静;刘伟;曹伟伟;吕其壮;张彦明【作者单位】西北农林科技大学动医学院,陕西杨陵712100;西北农林科技大学动医学院,陕西杨陵712100;西北农林科技大学动医学院,陕西杨陵712100;西北农林科技大学动医学院,陕西杨陵712100;西北农林科技大学动医学院,陕西杨陵712100;西北农林科技大学动医学院,陕西杨陵712100;西北农林科技大学动医学院,陕西杨陵712100【正文语种】中文【中图分类】Q789;S858.28【相关文献】1.多重PCR方法用于检测猪圆环病毒2型、猪细小病毒、猪伪狂犬病病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒诊断方法的建立 [J], 岳丰雄;崔尚金;冉多良;戚亭;周盛华2.细小病毒、猪伪狂犬病病毒和猪圆环病毒2型多重PCR检测方法的建立与应用[J], 王娟萍;姚敬明;赵喜有;吴忻;孟帆;刘文俊;樊振华;米瑞娟3.猪圆环病毒2型、猪伪狂犬病病毒、猪细小病毒多重PCR检测方法的建立 [J], 赵彦宗;贺东生;张艳萍;苏丹萍4.猪圆环病毒2型猪伪狂犬病病毒和猪细小病毒三重PCR检测方法的建立 [J], 方立;徐辉;陈伟杰;赵灵燕;倪柏锋;方维焕5.同时检测猪圆环病毒2型、猪细小病毒、猪伪狂犬病病毒和猪细环病病毒1型和2型的多重SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR方法的建立[J], Pérez L J;刘丹因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
动物医学进展,2018,39(11):35G40P r o g r e s s i nV e t e r i n a r y Me d i c i n e 猪伪狂犬病病毒P C R GL F D 检测方法的建立及应用㊀收稿日期:2018G01G24㊀基金项目:天津市科技计划支撑项目(18Y F Z C N C 01110);天津市农业科技成果转化与推广项目(201601070);天津市生猪产业技术体系项目(I T T P R S 2017003);中国农业科学院重大平台推进计划(Y 2017P T 50)㊀作者简介:张㊀莉(1979-),女,河北邢台人,副研究员,硕士,主要从事畜禽疾病研究.∗通讯作者张㊀莉,任卫科,李秀丽,路㊀超,王利丽,郑㊀丽,池晶晶,田向学,韩㊀伟,鄢明华∗(1.农业部兽用药物与诊断技术天津科学观测实验站,天津300381;2.天津市畜牧兽医研究所,天津300381)㊀㊀摘㊀要:旨在将P C R 技术与可视化的横向流动试纸条(l a t e r a l f l o wd i p s t i c k ,L F D )相结合,建立猪伪狂犬病病毒野毒株的P C R GL F D 快速检测技术.依据猪伪狂犬病病毒g E 基因保守区域设计2条特异性引物和对应的特异性探针,其中下游引物和探针分别标记了荧光素(F I T C )和生物素(B i o t i n ).通过对P C R 退火温度㊁引物浓度㊁探针杂交温度的筛选,确定P C R GL F D 方法的最佳反应条件,并对其敏感性㊁特异性和重复性进行检测.结果显示,所建立的检测方法能够特异性的检测出猪伪狂犬病病毒野毒株,与猪伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株㊁6种对照病毒和3种对照细菌均无交叉反应,其最低检测限为100TC ID 50/100μL .该方法对同批次和不同批次猪伪狂犬病病毒D N A 分别进行5次重复检测,结果完全一致.该方法对50份临床样品进行检测,P C R GL F D 方法和病毒分离培养法检测出16份阳性样品,常规P C R 检测出14份阳性样品,P C R GL F D 方法的敏感性高于P C R ,但两者间差异不显著P >0.05.以上结果表明,所建立的方法具有良好的特异性㊁敏感性和重复性,且不需要琼脂糖凝胶电泳可直接判读结果,适合养殖场㊁基层实验室的现场检测.㊀㊀关键词:猪伪狂犬病病毒;聚合酶链反应;横向流动试纸条中图分类号:S 852.65文献标识码:A文章编号:1007G5038(2018)11G0035G06㊀㊀猪伪狂犬病(P s e u d o r a b i e s ,P R )是由疱疹病毒科㊁αG疱疹病毒亚科的伪狂犬病病毒(P s e u d o r a b i e sv i u r s e ,P R V )引起的多种动物的一种高度接触性传染病[1].猪是自然宿主.该病可导致怀孕母猪的流产㊁死胎㊁木乃伊胎和种猪不育等症状;哺乳仔猪常出现神经症状和死亡;成年猪一般呈亚临床或隐性感染,成为病毒的贮存宿主,长期排毒,但是自2011年后,我国多地区猪场中出现伪狂犬病病毒变异毒株,一些成年猪也出现神经症状和高病死率等情况[2G3].猪伪狂犬病流行状况的变化给养猪业带来了巨大损失,因此,特异㊁敏感㊁快速的诊断方法对该病的防控至关重要.目前,伪狂犬病的诊断方法有很多种,其中g E GE L I S A 方法和g B GE L I S A 常用于猪群的免疫抗体监测和预警,P C R 方法和荧光定量P C R 则是病原学诊断的主要方法[4].P C R GL F D 技术是将P C R 技术㊁核酸探针杂交技术与横向流动试纸条(l a t e r a lf l o wd i p s t i c k ,L F D )三项技术相结合,应用试纸条直接检测P C R 扩增产物的技术.此项技术已在结核分支杆菌[5]㊁甲型H 1N 1病毒[6]㊁乙型肝炎病毒[7]㊁转基因黑曲霉[8]㊁口蹄疫病毒[9]等方面有了成功应用的报道.本研究根据猪伪狂犬病病毒的g E 基因设计一套引物和探针,建立了猪伪狂犬病病毒的P C R GL F D 特异性检测方法,为伪狂犬病的诊断提供了一种更为便捷的病原检测方法.1㊀材料与方法1.1㊀材料1.1.1㊀供试病毒株和菌株㊀猪伪狂犬病病毒(P R V )S C 株,由中国农业科学院哈尔滨兽医研究所猪烈性传染病创新团队赠送;猪圆环病毒2型(P C V G2)㊁猪繁殖与呼吸综合征病毒(P R R S V )㊁猪细小病毒(P P V )㊁猪流感病毒(S I V )㊁猪伪狂犬病病毒(P R V )R 13028株㊁猪伪狂犬病病毒(P R V )R 13139株㊁猪肺炎支原体(M P )㊁副猪嗜血杆菌(H ps )均由天津市畜牧兽医研究所实验室保存;猪链球菌2型(S S 2)㊁猪伪狂犬病病毒(P R V )M i n A 株购自国家兽医微生物菌种保藏管理中心;猪伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株(P R V g E 基因缺失株)㊁日本脑炎病毒(J E V )㊁猪瘟病毒(C S F V )疫苗株为市售疫苗.1.1.2㊀主要试剂㊀r T a q DN A 聚合酶㊁d N T P ㊁2X G C b u f f e r I ㊁D N A M a r k e rD L2000,宝生物工程(大连)有限公司产品;核酸提取试剂盒,金瑞鸿捷生物科技有限公司产品;横向流动试纸条,杭州忧思达生物技术有限公司产品.1.2㊀方法1.2.1㊀引物设计与合成㊀根据G e n B a n k 数据库中猪伪狂犬病病毒g E 基因(G e n B a n k :A Y 173124)中的一段保守核苷酸序列,采用P r i m e rP r e i m e r 5.0软件设计特异性P C R 引物和探针,由宝生物工程(大连)有限公司合成(表1).表1㊀引物序列T a b l e 1㊀P r i m e r s e qu e n c e s 项目I t e m引物名称P r i m e r n a m e s序列(5ᶄG3ᶄ)S e qu e n c e s (5ᶄG3ᶄ)5ᶄ标记5ᶄL a b e l 扩增片段/b pA m p l i f i c a t i o n f r a gm e n t P C R P R V g E 247(上游)C C G G C C C A T C T G G T G A A C G T337P r i m e r sP R V g E 623(下游)C C C A C C G C C A C A A A G A A C A C GF I T CP C RP r o b eP r v GT Gb i oG A C C T G G T G C T G G G C C G C G C C T B i o t i n1.2.2㊀P C R GL F D 方法的建立㊀1.2.2.1㊀P C R 反应条件优化㊀P C R 反应体系为20μL :10μL2ˑG Cb u f f e r I ,0.5μLr T a q D N A 聚合酶(8U /μL ),2μL d N T P s (2.5mm o l /L ),1μL P R V g E 247(10μm o l /L ),1μL P R V g E 623(10μm o l /L ),5.0μL 模板D N A ,0.5μL 超纯水.P C R 反应程序为:95ħ5m i n ;94ħ30s ,53ħ至60ħ30s ,72ħ30s ,进行30个循环;72ħ延伸5m i n ,4ħ5m i n.1.2.2.2㊀退火温度的优化㊀固定其他条件不变,设定53㊁54㊁55㊁56㊁57㊁58㊁59㊁60ħ共8个温度梯度,分别进行扩增,同时设立空白水对照.P C R 反应结束,取8μLP C R 扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,在凝胶成像仪上观察并记录结果.1.2.2.3㊀引物浓度的优化㊀经上述筛选出最佳退火温度后,固定反应体系其他试剂的添加量,对引物浓度用量设定为0.5μL ㊁1μL ㊁1.5μL ㊁2μL ,并设立空白水对照.反应结束,用琼脂糖凝胶电泳检测结果.1.2.2.4㊀探针杂交反应条件优化㊀P C R 反应结束后,开盖加入1μLP r v GT Gb i o (10μm o l /L ),增加一步杂交反应,94ħ30s ,54ħ至60ħ30s ,4ħ5m i n .复性温度选择54㊁55㊁56㊁57㊁58㊁59㊁60ħ分别进行杂交,摸索最佳反应条件.1.2.2.5㊀L F D 试纸条检测P C R 产物㊀杂交反应结束后,取P C R 产物10μL 加入到100μL 缓冲液,混合均匀;将L F D 试纸条插入缓冲液3m i n ;取出将试纸条水平放置,5m i n ~10m i n 内读取结果.判定标准:质控线和检测线显现棕红色条带,为阳性;只有质控线显现棕红色条带,为阴性;只出现检测线为无效.1.2.3㊀特异性试验㊀用已优化的P C R 反应体系检测伪狂犬病病毒(P R V )S C 株㊁伪狂犬病病毒(P R V )R 13028株㊁伪狂犬病病毒(P R V )R 13193株㊁伪狂犬病病毒(P R V )M i n A 株㊁猪伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株(P R V g E 基因缺失株)㊁猪瘟病毒(C S F V )㊁猪圆环病毒2型(P C V G2)㊁猪猪繁殖与呼吸综合征病毒(P R R S V )㊁猪细小病毒(P P V )㊁日本脑炎病毒(J E V )㊁猪流感病毒(S I V )㊁猪肺炎支原体(M P )㊁副猪嗜血杆菌(H ps )㊁猪链球菌2型(S S 2).探针杂交后,用琼脂糖凝胶电泳法和L F D 分别检测扩增产物,确定所建立方法的特异性.1.2.4㊀敏感性试验㊀将已知T C I D 50的伪狂犬病病毒稀释为105~101个T C I D 50,按常规方法提取D N A ,分别取5μL 作为模板,其他反应条件不变进行P C R扩增.探针杂交后,用琼脂糖凝胶电泳法和L F D 分别检测扩增产物,确定所建立方法的敏感性.1.2.5㊀琼脂糖凝胶电泳法和L F D 试纸条灵敏度比较㊀以伪狂犬病病毒S C 株D N A 为模板,按照优化后的P C R 条件进行扩增,反应结束后,测定P C R 扩增产物的核酸含量,并用纯水做10倍㊁100倍㊁1000倍稀释.分别取出20μL 稀释产物,加入1μL 核酸探针,探针杂交反应后,用琼脂糖凝胶电泳法和L F D 试纸条分别检测扩增产物,比较两种方法的差异.1.2.6㊀重复性试验㊀采用同一批次和不同批次提取的猪伪狂犬病病毒D N A 作为模板分别进行5次P C R 扩增,用琼脂糖凝胶电泳法和L F D 法检测扩增产物,确定所建立P C R GL F D 方法的重复性.1.3㊀临床样品的检测从养殖场采集50份病料样品,用病毒分离培养法和P C R GL F D 方法同时进行检测,比较两种方法的符合率.63动物医学进展㊀2018年㊀第39卷㊀第11期(总第305期)2㊀结果2.1㊀退火温度的优化选择53ħ~60ħ8个复性温度进行扩增,结果显示56ħ和55ħ均能扩增出特异的目的条带,而且56ħ亮度最强,因此,最终确定56ħ为最适反应温度(图1).1~8.60ħ㊁59ħ㊁58ħ㊁57ħ㊁56ħ㊁55ħ㊁54ħ㊁53ħ;9.阴性对照;M.D N A 标准D L20001G8.60ħ,59ħ,58ħ,57ħ,56ħ,55ħ,54ħ,53ħ;9.N e g a t i v ec o n Gt r o l ;M.D N A M a r k e rD L2000图1㊀复性温度优化F i g .1㊀O p t i m i z a t i o no f t h e a n n e a l i n g t e m pe r a t u r e 2.2㊀引物浓度的优化固定P C R 体系中其他试剂的添加量,将引物浓度用量设定为0.5㊁1㊁1.5㊁2μL 分别进行P C R 扩增,结果显示,加入0.5μL 引物时,扩增条带稍浅;加入1㊁1.5㊁2μL 引物时,扩增条带均清晰,无明显引物二聚体,因此,1μL 为最佳引物添加量(图2).1.2μL 引物(阳性对照);2.2μL 引物(阴性对照);3.1.5μL 引物(阳性对照);4.1.5μL 引物(阴性对照);5.1μL 引物(阳性对照);6.1μL引物(阴性对照);7.0.5μL 引物(阳性对照);8.0.5μL 引物(阴性对照);M.D N A 标准D L20001.2μL p r i m e r (p o s t i v e c o n t r o l );2.2μL p r i m e r (n e g n a t i v ec o n t r o l );3.1.5μL p r i m e r (p o s t i v e c o n t r o l );4.1.5μL (n e g n a t i v ec o n t r o l );5.1μL p r i m e r (p o s t i v ec o n t r o l );6.1μL (n e g n a t i v ec o n t r o l );7.0.5μL p r i m e r (p o s t i v ec o n t r o l );8.0.5μL (n e g n a t i v ec o n t r o );M.D N A M a r k e rD L2000图2㊀引物浓度优化F i g .2㊀O pt i m i z a t i o no f t h e p r i m e r c o n c e n t r a t i o n 2.3㊀探针杂交反应条件优化P C R 反应液中加入标记B i o t i n 的探针,复性温度选择54㊁55㊁56㊁57㊁58㊁59㊁60ħ分别进行杂交,然后用L F D 试纸条检测,结果54㊁59㊁60ħ试纸条检测线未出现阳性条带,55㊁56㊁57ħ时检测线有明显阳性带,但55ħ和56ħ的检测线较浅,57ħ检测线最为明显,因此认为94ħ30s ,57ħ30s ,4ħ5m i n为最佳的探针杂交反应程序(图3).1~7.54ħ㊁55ħ㊁56ħ㊁57ħ㊁58ħ㊁59ħ㊁60ħ;8.阴性对照1G7.54ħ,55ħ,56ħ,57ħ,58ħ,59ħ,60ħ;8.N e gn a t i v e c o n t r o l 图3㊀探针杂交温度筛选试验结果F i g .3㊀T e m p e r a t u r e s c r e e n i n g te s t r e s u l t s of p r o b eh yb r i d i z a t i o n r e ac t i o n 2.4㊀特异性试验本试验建立的猪伪狂犬病病毒P C R GL F D 检测方法检测伪狂犬病病毒(P R V )S C 株㊁伪狂犬病病毒(P R V )R 13028株㊁伪狂犬病病毒(P R V )R 13193株㊁伪狂犬病病毒(P R V )M i n A 株㊁猪伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株(P R V g E 基因缺失株)㊁猪瘟病毒(C S F V )㊁猪圆环病毒2型(P C V G2)㊁猪繁殖与呼吸综合征病毒(P R R S )㊁猪细小病毒(P P V )㊁日本乙型脑炎病毒(J E V )㊁猪流感病毒(S I V )㊁猪肺炎支原体(M P )㊁副猪嗜血杆菌(H p s )㊁猪链球菌2型(S S 2).从图4可见所建立的P C R GL F D 方法只能检测到伪狂犬病病毒S C 株㊁R 13028株㊁R 13139株㊁M i n A 株,伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株和其他对照菌毒株均为阴性,采用琼脂糖凝胶电泳和试纸条方法观察的检测结果完全一致.2.5㊀敏感性试验从图5可见,所建立的P C R 方法的最低检测病毒滴度为102T C I D 50/100μL ,且采用琼脂糖凝胶电泳和试纸条方法的检测结果完全一致.2.6㊀琼脂糖凝胶电泳法和L F D 试纸条灵敏度比较用核酸蛋白测定仪测定伪狂犬病病毒P C R 扩增产物的核酸含量为482.5n g /μL ,将其稀释10倍㊁100倍㊁1000倍后,用琼脂糖凝胶电泳和L F D 试纸73张㊀莉等:猪伪狂犬病病毒P C R GL F D 检测方法的建立及应用条分别检测,结果见图6.从图中可看出当P C R 产物稀释100倍后,已很难通过琼脂糖凝胶电泳观察到阳性结果,但是L F D 试纸条仍可见较为清晰的红色检测线.说明L F D 试纸条的灵敏度是琼脂糖凝胶电泳的10倍.A.琼脂糖凝胶电泳检测;B .L F D 试纸条检测;1.伪狂犬病病毒S C 株;2.伪狂犬病病毒M i n A 株;3.伪狂犬病病毒R 13028株;4.伪狂犬病病毒R 13139株;5.伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株(g E );6.猪圆环病毒2型;7.猪瘟病毒;8.日本乙型脑炎病毒;9.细小病毒;10.猪繁殖与呼吸综合征病毒;11.猪流感病毒;12.猪肺炎支原体;13.副猪嗜血杆菌;14.猪链球菌2型;15.空白对照;M.D N A 标准D L2000A.A g a r o s e g e l e l e c t r o p h o r e s i s ;B .L F Ds t r i p s ;1.P R VS Cs t r a i n ;2.P R V M i n As t r a i n ;3.P R V R 13028s t r a i n ;4.P R V R 13139;5.P R VB a r t h a GK 61s t r a i n (g E G);6.P C V G2;7.C S F V ;8.J E V ;9.P P V ;10.P R R S V ;11.S I V ;12.M P ;13.H p s ;14.S S 2;15.N e gn a t i v e c o n t r o l ;M.D N A M a r k e rD L2000图4㊀P C R 特异性试验F i g .4㊀S p e c i f i c i t y te s t of P CR A.琼脂糖凝胶电泳检测;B .L F D 试纸条检测;1.阴性对照;2~6.101T C I D 50~105T C I D 50;M.D N A 标准D L2000A.A g a r o s e g e l e l e c t r o p h o r e s i s ;B .L F Ds t r i p s ;1.N e g n a t i v e c o n t r o l ;2G6.101T C I D 50G105T C I D 50;M.D N A M a r k e rD L2000图5㊀P C R GL F D 方法敏感性试验F i g .5㊀S e n s i t i v i t y te s t of P C R GL F D m e t h od A.琼脂糖凝胶电泳检测;B .L F D 试纸条检测;1.阴性对照;2~4.103,102,10稀释的P C R 产物;5.原倍P C R 产物;M.D N A 标准D L2000A.A g a r o s e g e l e l e c t r o p h o r e s i s ;B .L F Ds t r i p s ;1.N e g n a t i v e c o n t r o l ;2G4.P C R p r o d u c t s d i l u t e d 103,102,10t i m e s ;5.T h e o r i gi n a l t i m eP C R p r o Gc u c t s ;M.D L2000D N A M a r k e r图6㊀琼脂糖凝胶电泳法与L F D 试纸条法灵敏度比较试验F i g .6㊀T h e s e n s i t i v i t y c o m p a r i s o no f a g a r g e l e l e c t r o p h o r e s i s a n dL F Ds t r i p s a n a l ys i s 83动物医学进展㊀2018年㊀第39卷㊀第11期(总第305期)2.7㊀重复性试验取同一次和不同时间提取的猪伪狂犬病病毒D N A各5份,将其作为模板进行5次P C R扩增,用L F D试纸条和琼脂糖凝胶电泳法检测扩增产物,两种方法结果完全一致,说明所建立的P C RGL F D方法具有良好的重复性.2.8㊀临床样品的检测对养殖场送检的50份病料样品用P C R㊁病毒分离培养法和P C RGL F D方法同时进行检测,结果P C R检测到14份阳性,而病毒分离培养法和P C RGL F D方法为16份,P C RGL F D方法的敏感性要高于常规P C R方法.从表2可见P C RGL F D方法与病毒分离培养法的符合率为100%,与常规P C R方法的阳性符合率为100%,阴性符合率为94.4%.用S P S S17.0软件对结果进行评估,P C RGL F D方法与P C R的χ2为0.1904,P>0.05,两种方法无显著差别.表2㊀两种方法检测结果比较T a b l e2㊀C o m p a r i s o n r e s u l t s o f t w om e t h o d s检测方法D e t e c t i o nm e t h o d s P C RGL F D P C R病毒分离培养法V i r u s i s o l a t i o nm e t h o d 阳性数P o s t i v e s a m p l e s161416阴性数N e g a t i v e s a m p l e s343634阳性符合率/%P o s t i v e c o i n c i d e n c e r a t e100100100阴性符合率/%N e g a t i v e c o i n c i d e n c e r a t e10094.41003㊀讨论猪伪狂犬病是危害养猪业发展的重要传染病之一.对猪伪狂犬病病毒进行快速㊁及时㊁准确的诊断,是有效防控该病的重要前提.伪狂犬病病毒g E 基因是其主要毒力决定因子,为病毒复制的非必需基因,也是世界动物卫生组织(O I E)所规定基因缺失疫苗的缺失基因.以g E序列作为靶序列建立的诊断技术,能够区分基因缺失疫苗接种与野毒感染[3].王香玲等[10]根据猪伪狂犬病病毒g E基因序列保守区段,设计一对特异性引物,通过优化反应条件,建立了可区分猪伪狂犬病病毒野毒株与基因缺失疫苗株的P C R检测方法,该方法的敏感性为1.1p g,有较高的特异性.张志等[11]建立了能够特异性检测P R V野毒株的套式P C R方法,该方法检测极限可达10个病毒拷贝/μL.田云等[12]建立检测伪狂犬病病毒野毒的荧光定量P C R方法,该方法的灵敏度可达4拷贝.常规P C R方法检测成本低,但需要琼脂糖凝胶电泳观察结果,且有时会出现假阳性结果.荧光定量P C R虽然敏感性高于P C R,可实时观看检测结果,但是需要昂贵的设备和试剂成本,不适用于基层实验室和规模化猪场使用.本研究建立了一种基于猪伪狂犬病病毒g E基因的P C RGL F D检测方法,该方法是将P C R技术与L F D试纸相结合的一种可视化检测方法,在引物设计时将一条引物标记了异硫氰酸荧光素(F I T C),在P C R反应后,体系中加入了一条标记生物素(B i oGt i n)的探针,只有目的基因的P C R扩增产物才能与探针结合.采用试纸条对P C R扩增产物进行检测,杂交形成的复合体带有B i o t i n和F I T C两种标记,用试纸条检测时检测线和质控线均出现棕红色条带.阴性P C R产物㊁假阳性P C R和引物二聚体不具有双重标记,不能与检测线结合,检测线不显色.该方法在P C R扩增后15m i n内即可目测判定结果,与传统凝胶电泳法相比更快速,且避免使用溴化乙锭(E B)等核酸染料造成的环境污染[8].为了避免P C R结果出现假阳性,本研究在P C R扩增完成以后,增加了特异性探针杂交反应,进一步提高了该方法的特异性.试验结果表明,该方法可特异性检测猪伪狂犬病病毒野毒株,与缺失g E基因的B a r t h aGK61株和其他9种猪病病原无交叉反应.此外,对比L F D试纸条法和琼脂糖凝胶电泳法对P C R扩增产物检测结果的灵敏度发现, P C RGL F D方法的最低检测限度为100T C I D50/100μL,其敏感性比应用琼脂糖凝胶电泳方法高10倍.针对2011年以来流行的猪伪狂犬病病毒变异株分子特征发生变化的特点,在试验中分别对伪狂犬病病毒经典强毒双城株(S C株)和闽A株(M i n A 株),新分离的猪伪狂犬病变异强毒R13139和R13028株,以及猪伪狂犬病病毒缺失g E基因的疫苗株B a r t h aGK61进行了检测,结果仅B a r t h aGK61株检测结果为阴性,其他4株P R V检测结果均为阳性,表明建立的方法适用于P R V经典强毒和变异的强毒株的检测.以上结果表明,本研究建立的伪狂犬病病毒P C RGL F D检测方法具有敏感㊁快速㊁特异等特点,且操作简便㊁无需电泳可直接观察结果,可用于实验93张㊀莉等:猪伪狂犬病病毒P C RGL F D检测方法的建立及应用室㊁养殖场和基层兽医部门对伪狂犬病的诊断和监测预警,具有广阔的应用前景.参考文献:[1]㊀A nTQ,P e n g JM,T i a nZ J,e t a l.P s e u d o r a b i e s v i r u s v a r i a n t i nB a r t h aGK61Gv a c c i n a t e d p i g s,C h i n 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dD i a g n o s i sT e c h n o l o g y,T h eM i n i s t r y o fA g r i c u l t u r e o f t h eP e o p l e̓sR e p u b l i c o f C h i n a,T i a n j i n,300381,C h i n a;2.T i a n j i nI n s t i t u t e o f A n i m a l S c i e n c e a n dV e t e r i n a r y M e d i c i n e,T i a n j i n,300381,C h i n a)A b s t r a c t:T h e e x p e r i m e n tw a s a i m e d t oe s t a b l i s ha r a p i dP C RGL F D m e t h o d f o r t h ed e t e c t i o no f p s e u d o r aGb i e s v i r u sw i l dGt y p e s t r a i n s b a s e d o n t h e P C R m e t h o d a n d v i s u a l i z a t i o nb y a l a t e r a l f l o wd i p s t i c k(L F D).I n t h i s s t u d y,t w os p e c t i f i cP C R p r i m e r s a n do n en u c l e i c a c i d p r o b ew e r ed e s i g n e db a s e do n t h e c o n s e r v a t i v e r e g i o n s o f g E g e n eo f p s e u d o r a b i e sv i r u s,d o w n s t r e a m p r i m e ra n dn u c l e i ca c i d p r o b e w e r er e s p e c t i v e l y l a b l e db y f l u o r e s c e i ni s o t h i o c y a n a t e(F I T C)a n db i o t i n.T h eo p t i m u m r e a c t i o nc o n d i t i o n so fP C RGL F D m e t h o dw e r e d e t e r m i n e db y s c r e e n i n g t h e a n n e a l i n g t e m p e r a t u r e o f P C R,t h e c o n c e n t r a t i o no f p r i m e r s a n d t h eh y b r i d i z a t i o n t e m p e r a t u r e o f t h e p r o b e,w h i l e i t s s p e c i f i c i t y,s e n s i t i v i t y a n d r e p r o d u c i l b i l i t y w e r e t e s t e d.T h e r e s u l t s s h o w e do n l yp s e u d o r a b i e s v i r u sw i l dGt y p e s t r a i n sw e r e p o s i t i v e,a n dn o c r o s sGr e a c t i o nw e r e o bGs e r v e dw i t ht h eP R VB a r t h aGK61s t r a i na n do t h e rs i xc o n t r o lv i r u ss t r a i n sa n dt h r e ec o n t r o lb a c t e r i a l s t r a i n s.T h e s e n s i t i v i t y o f t h ea s s a y w a s100TC I D50/100μL.T h i s m e t h o dh a df i v er e p e a t e dt e s t sf o r t h e s a m eb a t c ha n dd i f f e r e n t b a t c ho f p s e u d o r a b i e sv i r u sD N A,a n d t h e r e s u l t sw e r e i d e n t i c a l.F o r t h e50s u sGp e c t e d s a m p l e s,16p o s i t i v e s a m p l e sw e r e i d e n t i f i e d b y P R V i s o l a t i o n a n d t h e P C RGL F Ds t r i p m e t h o d,w h i l e 14p o s i t v e s a m p l e sw e r e i d e n t i f i e db y r e g u l a rP C R.T h eP C RGL F D m e t h o dh a dh i g h e r s e n s i t i v i t y t h a nt h e P C R,b u t P>0.05,t h a tw a sn o t i ns i g n i f i c a n t l e v e l.T h ea b o v e r e s u l t s i n d i c a t e dt h a t t h em e t h o do fP C RGL F Df o rd e t e c t i n gp s e u d o r a b i e sh a s g o o ds p e c i f i c i t y,s e n s i t i v i t y a n dr e p e a t a b i l i t y,a n d i td o e sn o t r e q u i r ea g a r o s e g e l e l e c t r o p h o r e s i s t o r e a d t h e r e s u l t s,w h i c h i s s u i t ab l e f o r f i e l d t e s t i n g o f f a r ma n db a s i cGl e v e l l aGb o r a t o r y.K e y w o r d s:P s e u d o r a b i e s v i r u s;P C R;L F Ds t r i p04动物医学进展㊀2018年㊀第39卷㊀第11期(总第305期)。