放线菌新种分类鉴定-文档资料
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1.碳源利用采用无碳源培养基作为基础培养基,加入0.5%的不同糖醇类物质作为碳源,接种待测放线菌,观察放线菌生长情况,以无碳源培养基作为阴性对照判断放线菌利用碳源的能力。
糖醇类物质遇高温可能分解转化,用乙醚消毒灭菌碳源利用试验基础培养基:硫酸铵2.64 g,磷酸二氢钾2.38 g,磷酸氢二钾5.65 g,硫酸镁1 g,硫酸铜0.0064 g,硫酸亚铁0.0011 g,氯化锰0.0079 g,硫酸锌0.0015 g,蒸馏水1000 mL,pH 7.2-7.4。
2.氮源利用采用无氮源培养基作为基础培养基,加入0.1%的不同氮源,接种待测放线菌,以无氮源培养基作为阴性对照判断放线菌利用碳源的能力防止氮源遇高温分解转化,用乙醚消毒灭菌氮源利用试验基础培养基:葡萄糖1 g,磷酸氢二钾1 g,硫酸镁0.5 g,氯化钠0.5 g,硫酸亚铁0.01 g,蒸馏水1000 mL,pH 7.0。
3.温度耐受及最适生长温度将待测放线菌接种到最适的生长培养基上,分别放置4℃,8 ℃,12 ℃,16℃,20℃,25℃,28℃,32 ℃,37℃,40 ℃,45℃,50 ℃和55℃温度条件下培养,根据菌株的生长状态确定放线菌的温度生长范围和最适生长温度。
4.盐度耐受及最适生长盐浓度在待测放线菌的最适生长培养基中添加0,5%,10%,15%,20%,25%浓度的氯化钠。
接种待测放线菌,根据放线菌的生长情况确定放线菌的盐度耐受范围和最适生长盐浓度。
5.pH耐受及最适生长pH的确定配制待测放线菌最适生长的培养基,用缓冲液调节培养基pH至4,5,6,7,8,9,10,11。
接种待测放线菌,根据放线菌在不同pH培养基上的生长情况确定待测放线菌的pH耐受范围和最适生长pH。
注:配制低pH的培养基时应适当增加琼脂的用量6.黑色素产生采用黑色素产生培养基,接种待测放线菌,观察菌落周围琼脂是否有黑色素产生黑色素产生培养基培养基:蛋白胨20 g,酵母粉1 g,柠檬酸铁0.5 g,磷酸氢二钾1 g,硫代硫酸钠0.08 g,蒸馏水1000 mL,pH 7.07.硫化氢产生将待测放线菌接种硫化氢产生验证培养基,如果菌株周围的培养基变成黑色,则说明有硫化氢产生硫化氢产生验证培养基:蛋白胨10 g,柠檬酸铁0.5 g,蒸馏水1000 mL,pH 7.08.明胶液化将待测放线菌接种于明胶培养基表面,28℃培养,观察明胶液化程度。
海洋放线菌的分类鉴定一、放线菌㈠、放线菌的分布放线菌常以孢子或菌丝状态极其广泛地存在于自然界。
不论数量和种类,以土壤中最多。
河流和湖泊中,放线菌数量不多,大多为小单孢菌、游动放线菌和孢囊链霉菌,还有少数链霉菌。
海洋中的放线菌多半来自土壤或生存在漂浮海面的藻体上。
海水中还存在耐盐放线菌。
放线菌有一种土霉味,使水和食物变味,有的放线菌也能和霉菌一样使棉毛制品或纸张霉变。
放线菌主要能促使土壤中的动物和植物遗骸腐烂,最主要的致病放线菌是结核分枝杆菌和麻风分枝杆菌,可导致人类的结核病和麻风病。
放线菌最重要的作用是可以产生、提炼抗生素,目前世界上已经发现的2000多中抗生素中,大约有56%是由放线菌(主要是放线菌属)产生的,如链霉素、土霉素、四环素、庆大霉素等都是由放线菌产生的。
此外有些植物用的农用抗生素和维生素等也是由放线菌中提炼的。
㈡、放线菌的形态与结构放线菌菌体为单细胞,大多由分枝发达的菌丝组成,最简单的为杆状或具原始菌丝。
放线菌是一种革兰氏阳性菌。
放线菌菌丝细胞的结构与细菌基本相同。
根据菌丝形态和功能可分为营养菌丝、气生丝和孢子丝三种。
⑴营养菌丝匍匐生长于培养基内,主要生理功能是吸收营养物,故亦称基内菌丝。
营养菌丝一般无隔膜;直径0.2-0.8微米,但长度差别很大,短的小于100微米,长的可达600微米以上;有的无色素,有的产生黄、橙、红、紫、蓝、绿、褐、黑等不同色素,若是水溶性的色素,还可透入培养基内,将培养基染上相应的颜色,如果是非水溶性色素,则使菌落吨呈现相应的颜色。
色素是鉴定菌种的重要依据。
⑵气生菌丝长出培养基外并伸向空间的菌丝为气生菌丝。
它叠生于营养菌丝上,以至可覆盖整个菌落表面。
在光学显微镜下,颜色较深,直径比营养菌丝粗,约1-1.4微米,其长度则更悬殊。
直形或弯曲而分枝,有的产生色素。
⑶孢子丝气生菌丝上分化出可形成孢子的菌丝即孢子丝。
孢子丝的形状和在气生菌丝上的排列方式,随菌种而异。
孢子丝的形状有直形、波曲和螺旋形。
2012届本科毕业论文(设计)放线菌的分类方法姓名: __ __ __________系别:__ 生命科学学院_____专业:___ 生物工程_________学号:_ _ _指导教师:____ ____ ____2012年5 月9日目录摘要 (1)1 放线菌的分类研究意义与方法 (2)1.1放线菌 (2)2放线菌的分类方法的发展历程与意义 (3)2.1形态学与培养特征上的分类与鉴定 (3)2.2数值分类方法 (3)2.3化学分类 (3)3 放线菌的分子生物学分类的发展情况 (4)3.1.DNA碱基组成分析: (4)3.2.DNA-DNA同源性分析: (4)3.3.DNA-rRNA同源性分析: (4)3.4.核酸的一级结构的分析: (5)3.5.16S rRNA基因序列分析: (5)3.7.PCR-RFLP分析: (5)3.8.rep-PCR指纹分析技术: (5)3.9.RAPD分析: (6)3.10.AFLP指纹分析技术: (6)4放线菌的分类在未来发展的方向及意义 (6)参考文献 (6)致谢................................................................ 错误!未定义书签。
放线菌的分类方法摘要:放线菌是原核生物的一个类群,相关分类学经历了早期的形态学上的经典分类(主要从其形态结构来进行分类),数值分类(运用计算科学与技术对放线菌进行描述分类),化学分类(运用化学分析的方法对放线菌的细胞壁和组成成分进行分析归类),直至今天的分子分类。
通过对放线菌的分类进而建成系统进化树,更加方便了放线菌的研究与应用。
由于科学进步的发展放线菌在分子分类中又有了不同的研究方法,由(G+C)mol%的差别而分析的物种亲缘关系的远近形成的DNA碱基组成分析发展到在DNA杂交中的DNA序列互补程度来推断它们的的DNA-DNA同源性分析,从核酸的一级结构上的分析到RNA的二级结构上的分析等方法。
除细菌外其他原核微生物放线菌蓝细菌支原体立克次氏体衣原体放线菌放线菌是具有菌丝、以孢子进行繁殖、陆生性较强的一类革兰氏阳性原核微生物。
一类主要呈丝状生长和孢子繁殖的革兰氏阳性细菌单细胞,大多由分枝发达的菌丝组成菌丝直径与杆菌类似,约1mm 细胞壁组成与细菌类似,革兰氏染色阳性(少数阴性)细胞的结构与细菌基本相同按形态和功能可分为营养、气生和孢子丝三种(一)放线菌的形态、大小和繁殖特征:丝状分枝多核、单细胞(细胞核之间没有分隔)孢子繁殖→无性繁殖孢子是放线菌的“种子”(无性)。
孢子对于不良的外界环境有较强的抵抗力。
散落的孢子遇到适宜条件就萌发长出菌丝。
菌丝分枝再分枝,最后形成网状的菌丝体。
通过分生孢子或孢囊孢子繁殖,也可以一段营养菌丝繁殖(二)、鉴定特征及生理特性菌落特征(与细菌特征正好相反)表面常呈粉末状或皱褶状(?) ,有的则呈紧密干硬的圆形,有些为糊状。
颜色各异,正反不同(?) ,质地紧密,菌落不易用接种环挑起(?),较小。
②液体培养特征静置培养:培养基不混浊膜状附壁,或沉降于底部。
震荡(或摇床)培养:短的菌丝体构成球状颗粒③生理特性大多数好氧,最适宜的pH值7~8,嗜中温蓝细菌(一)蓝细菌—蓝藻或蓝绿藻(blue-green algae)革兰氏阴性,无鞭毛,含有光合色素(不形成叶绿体),能进行光合作用并产氧的原核生物。
1、结构和形态比一般细菌大,通常直径为3~10μm,最大达60μm 蓝藻有单细胞球状、杆状、长丝状、分枝丝状单细胞体的、群体的和丝状体的。
丝状体:是由于细胞分裂按同一个分裂面反复分裂、子细胞相接而形成的群体:丝状体可以连成群体,包在公共的胶质鞘膜中特殊结构异形胞—固氮的场所静息孢子—休眠体2、营养类型—光能自养3、繁殖—无性生殖单细胞:二分裂、多次分裂、顶端释放(芽殖)丝状体:中间分裂、无规则分裂、顶端释放(芽殖4、分类蓝藻门分为两纲:色球藻纲和藻殖段纲(一)色球藻纲藻体为单细胞体或群体。
放线菌分类-完整精选.放线菌分类一、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1 酸微菌目(Acidimicrobiales)酸微菌亚目(Acidimicrobineae)酸微菌科(Acidimicrobiaceae)酸微菌属(Acidimicrobium)典型种:氧化亚铁微酸菌(Acdimicrobium ferrooxidans)二、红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1 红色杆菌目(Rubrobacterales)红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)红色杆菌科(Rubrobacteraceae)红色杆菌属(Rubrobacter)2 土壤红杆菌目(Solirubrobacterales)土壤红杆菌科(Solirubrobacteraceae)扩展杆菌科(Patulibacteraceae)康奈斯氏杆菌科(Conexibacteraceae)康奈斯氏杆菌属(Conexibacter)3 嗜热油菌目(Thermoleophilales)嗜热油菌科(Thermoleophilacceae)嗜热油菌属(Thermoleophilum)三、红蝽杆菌亚纲(Coriobacteride)1 红蝽杆菌目(Coriobacteriales)红蝽杆菌科(Coriobacteriaceae)红蝽杆菌属(Coriobacterium)阿托波菌属(Atopobium)扣林氏菌属(Collinsella)神秘杆菌属(Cryptobacterium)反硝化杆菌属(Denitrobacterium)伊格尔兹氏菌属(Eggerthella)欧陆森氏菌属(Olsenella)斯莱克氏菌属(Slackia)非消化糖杆菌属(Asccharobacter)肠杆菌属(Enterorhabdus)戈登氏杆菌属(Gordonibacter)类伊格尔兹氏菌属(Paraeggerthella)四、腈基降解菌亚纲(Nitriliruptoride)1 腈基降解菌目(Nitriliruptorales)腈基降解菌科(Nitriliruptoraceae)腈基降解菌属(Nitriliruptor)2尤泽比氏菌目(Euzebyales)尤泽比氏菌科(Euzebyaceae)尤泽比氏菌属(Euzebya)五、放线菌亚纲(Actinobacteridae)1 放线菌目(Actinobacterales)放线菌亚目(Actinomycineae)放线菌科(Actinomycetaceae)放线菌属(Actinomyces)放线杆菌属(Actinobaculum)隐秘杆菌属(Arcanobacterium)动弯杆菌属(Mobiluncus)弯曲短杆菌属(Varibaculum)链霉菌亚目(Streptomycineae)链霉菌科(Sterptomycetaceae)链霉菌属(Streptomyces)北里孢菌属(Kitasatospora)链嗜酸菌属(Streptacidiphilus)链孢囊菌亚目(Streptosporangineae)链孢囊菌科(Streptosporangiaceae)链孢囊菌属(Streptosporangium)小双孢菌属(Microbispora)小四孢菌属(Microtetraspora)野野村氏菌属(Nonomuraea)游动单孢菌属(Planomonospora)游动双孢菌属(Planobispora)草孢菌属(Herbidospora)游动四孢菌属(Planotetraspora)高温多孢菌属(Thermopolyspora)果实包囊菌属(Acrocarpospora)球状包囊菌属(Sphaerisporangium)拟诺卡氏菌科(Nocardiopsaceae)拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)高温双岐菌属(Thermobifida)链单孢菌属(Streptomonospora)盐放线孢菌属(Haloactinospora)海洋放线孢菌属(Marinactinospora)高温单孢菌科(Thermomonosporaceae)高温单孢菌属(Thermomonospora)马杜拉放线菌属(Actinomadura)螺孢菌属(Spirillospora)珊瑚放线菌属(Actinocorallia)高温双孢菌属(Thermobispora)小单孢菌亚目(Micromonosporineae)小单孢菌科(Micromonosporaceae)小单孢菌属(Micromonospora)游动放线菌属(Actinoplanes)指孢囊菌属(Dactylosporangium)发仙菌属(Pilimelia)短链孢菌属(Catellatospora)短链游动菌属(Catenuloplanes)库奇游动菌属(Couchiolanes)螺旋游动菌属(Spirilliplanes)疣孢菌属(Verrucosispora)杆状孢囊菌属(Virgisporangium)长孢菌属(Longispora)阿森诺氏菌属(Asanoa)盐孢菌属(Salinispora)放线短链孢菌属(Actinocatenispora)多形态孢菌属(Polymorphospora)克拉西利尼科夫菌属(Krasilnikovia)卢得曼氏菌属(Luedemannella)假孢囊菌属(Pseudosporangium)游动孢囊菌属(Planosporangium)短链球孢囊菌(Catelliglobosispora)滨田氏菌属(Hamadaea)植物放线孢囊菌(Plantactinospora)皱纹单孢菌属(Rugosimonospora)植物栖居菌属(Phytohabitans)放线橘橙孢菌属(Actinaurispora)异短链球孢菌属(Allocatelliglobosispora)糖霉菌亚目(Glycomycineae)糖霉菌科(Glycomycetaceae)糖霉菌属(Glycomyces)斯塔堪布瑞德氏菌属(Stackebrandtia)盐糖霉菌属(Haloglycomyces)细链孢菌亚目(Catenulisporineae)细链孢菌科(Catenulisporaceae)细链孢菌属(Catenulispora)丛生放线菌科(Actinospicaceae)丛生放线菌属(Actinospica)放线多孢菌亚目(Actinopolysporineae)放线多孢菌科(Actinopolysporaceae)放线多孢菌属(Actinopolyspora)动球菌亚目(KIneococcineae)动球菌科(KIneococcaceae)动球菌属(KIneococcus)动孢菌属(Kineosporia)四折叠球菌属(Quadrisphaera)假诺卡氏亚目(Pseudonocardineae)假诺卡氏菌科(Pseudonocardiaceae)假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)异壁放线菌菌属(Actinoalloteichus)拟无枝酸菌属(Amycolatopsis)克洛斯氏菌属(Crossiella)拟孢囊菌属(Kibdelosporangium)库兹涅尔氏菌属(Kutzneria)古德飞罗氏菌属(Goodfellowia)普劳斯氏菌属(Prauserella)糖单孢菌属(Saccharomonospora)糖多孢菌属(Saccharopolyspora)异壁链霉菌属(Streptoalloteichus)放线孢菌属(Actinomycetospora)异库兹涅尔氏菌属(Allokutzneria)南海海洋所菌属(Sciscionella)束丝放线菌科(Actinosynnemataceae)束丝放线菌属(Actinosynnema)列舍瓦列氏菌属(Lechevalier)伦兹氏菌属(Lentzea)糖丝菌属(Saccharothrix)动孢放线菌属(Actinokineospora)梅泽宾夫氏菌属(Umezawaea)弗兰克氏菌亚目(Frankineae)弗兰克氏菌科(Frankiaceae)弗兰克氏菌属(Frankia)热酸菌科(Acidothermaceae)热酸菌属(Acidothermus)隐孢囊菌科(Cryptosporangiaceae)隐孢囊菌属(Cryptosporangium)矿生菌属(Fodinicola)地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)地嗜皮菌(Geodermatophilus)芽生球菌属(Blastococcus)贫养杆菌属(Modestobacter)中村氏菌科(Nakamurellaceae)潮湿球菌属(Humicoccus)鱼孢菌科(Sporichthyaceae)鱼孢菌属(Sporichthya)棒杆菌亚目(Corynebacterineae)棒杆菌科(Corynebacteriaceae)棒杆菌属(Corynebacterium)苏黎世菌属(Turicella)迪茨氏菌科(Dietziaceae)分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)分枝杆菌属(Mycobacterium)诺卡氏菌科(Nocardiaceae)诺卡氏菌属(Nocardia)戈登氏菌属(Gordonia)红球菌属(Rhodococcus)斯科曼氏菌属(Skermania)威廉姆斯氏菌属(Williamsia)米利斯氏菌属(Millisia)慢反应脂肪酸菌科(Segniliparaceae)慢反应脂肪酸菌属(Segniliparus)冢村氏菌科(Tsukamurellaceae)冢村氏菌属(Tsukamurella)微球菌亚目(Micrococcineae)微球菌科(Micrococcaceae)微球菌属(Micrococcus)螨共生菌属(Acaricomes)节杆菌属(Arthrobacter)柠檬球菌属Citricoccus)考克氏菌属(Kocuria)涅斯捷连科氏(Nesterenkonia)肾杆菌属(Renibacterium)罗氏菌属(Rothia)志恒刘菌属(zhihengliuella)中国单孢菌属(Sinomonas)口腔球菌属(Stomatococcus)布登堡菌科(Beutenbergiaceae)布登堡菌属(Beutenbergia)乔治菌属(Georgenia)萨勒河菌属(Salana)博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)博戈里亚湖菌属(Bogoriella)短杆菌科(Brevibacteriaceae)短杆菌属(Brevibacterium)纤维单孢菌科(Cellulomonadaceae)纤维单孢菌属(Cellulomonas)光柱菌属(Actinotalea)去甲基醌菌属(Demequina)厄氏菌属(Oerskovia)吸收不良菌属(Tropheryma)皮杆菌科(Dermabacteraceae)皮杆菌属(Dermabacter)短状杆菌属(Brachybacterium)皮生球菌科(Dermacoccaceae)皮生球菌属(Dermacoccus)肥沃菌属(Demetria)皮革球菌属(Kytococus)嗜皮菌科(Dermatophilaceae)嗜皮菌属(Dermatophilus)动球菌属(Kineosphaera)间孢囊菌科(Intrasporangiaceae)间孢囊菌属(Intrasporangium)砒酸球菌属(Arsenicicoccus)两面神菌属(Janibacter)诺尔士菌属(Knoellia)鸟氨酸球菌属(Ornithinicoccus)鸟氨酸微球菌(Ornithinimicrobium)稻田土壤菌属(Oryzihumus)丝氨酸球菌属(Serinicoccus)地杆菌属(Terrabacter)土壤球菌属(Terracoccus)四球菌属(Tetrasphaera)潮湿芽孢杆菌属(Humibacillus)韩国生工所菌属(Kribbia)矿杆菌属(Fordinibacter)小石球菌属(Lapillicoccus)海藻球菌属(Phycicoccus)海居菌属(Marihabitans)潮湿居菌属(Humihabitans)琼斯菌科(Jonesiaceae)琼斯菌属(Jonesia)微杆菌科(Microbacteriaceae)微杆菌属(Microbacterium)阿格雷氏菌属(Agreia)壤球菌属(Agrococcus)壤霉菌属(Agromyces)棍状杆菌属(Clavibacter)喜冷杆菌属(Cryobaterium)短小杆菌属(Curtobacterium)冷杆菌属(Frigoribacterium)叶居菌属(Frondihabitans)喜珍品杆菌属(Gulosibacter)拉贝达氏菌属(Labedella)利夫森氏菌属(Leifsonia)无色杆菌属(Leucobacter)微孢菌属(Microcella)小土居菌属(Microterricola)栖霉菌属(Mycetocola)奥卡河杆菌属(Okibacterium)盐水杆菌属(Salinibacterium)栖地下菌属(Subtercola)假棍状杆菌属(Pseudoclavibactet)植物杆菌属(Plantibacter)拉氏杆菌属(Rathayibacter)赤球菌属(Rhodoglobus)朴勇河氏菌属(Yonghaparkia)舒曼氏菌属(Schumannella)海藻菌属(Phycicola)克鲁格氏菌属(Klugiella)潮湿杆菌属(Humibacter)冰伽杆菌属(Glaciibacter)齐默曼氏菌属(Zimmermannella)原小单孢菌科(Promicromonospore)原小单孢菌属(Promicromonospora)纤维微菌属(Cellulosimicrobium)栖白蚁菌属(Isoptericola)产丝菌属(Myceligenerans)解木聚糖杆菌属(Xylanibacterium)解木聚糖微菌属(Xylanimicrobium)解木聚糖单孢菌属(Xylanimonas)稀有杆菌科(Rarobacteraceae)稀有杆菌属(Rarobacter)血杆菌科(Sanguibacteraceae)血杆菌属(Sanguibacter)阎氏菌科(Yaniellaceae)阎氏菌属(Yaniella)阮氏菌科(Ruaniaceae)阮氏菌属(Ruania)嗜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项目一微生物形态结构观察放线菌(Actinomycetes)是丝状原核微生物,因菌丝是放射性生长而得名。
它是介于细菌和真菌之间的单细胞微生物,其细胞结构和化学成分与细菌相似,属于原核微生物;而其菌体呈丝状,有分支,以孢子繁殖,这些特征与霉菌相似。
至今已发现的80余属放线菌几乎都呈革兰氏染色阳性。
放线菌与人类的关系极为密切,绝大多数属有益菌,放线菌的产品多种多样,特别突出的是产抗生素,至今已报道通过的近万种抗菌素中,约70%由放线菌产生。
放线菌还是许多酶、维生素等的产生菌。
此外,放线菌在甾体转化、石油脱蜡和污水处理中也有重要应用。
一、放线菌的形态1、放线菌的菌丝链霉菌菌体细胞为单细胞,大多由分枝状菌丝(mycelium)组成,菌丝直径很细,与细菌相似,一般在0.5~1.0µm。
放线菌为原核生物,细胞核无核膜,细胞壁内含胞壁酸和二氨基庚二酸,在营养生长阶段,菌丝内无隔膜,故一般呈多核的单细胞状态。
放线菌的菌丝分为基内菌丝、气生菌丝和孢子丝。
(1)基内菌丝(Substrate mycelium)当放线菌孢子落在固体培养基表面并发芽后,就不断伸长、分枝并以放射状向培养基表面和内层扩展,形成大量具有吸收营养和排泄代谢废物功能的基内菌丝,又叫营养菌丝或一级菌丝。
(2)气生菌丝(Aerial mycelium)营养菌丝体发育到一定阶段,向空间方向分化出颜色较深、直径较粗的分枝菌丝,称为气生菌丝,又称二级菌丝。
(3)孢子丝(Reproductive mycelium)放线菌生长到一定阶段,在成熟的气生菌丝上分化出可形成孢子的菌丝,称为孢子丝,又名产孢丝或繁殖菌丝。
孢子丝长到一定阶段可形成孢子,或称分生孢子,孢子形态多样。
二、放线菌的繁殖多数放线菌借形成各种无性孢子进行繁殖的,无性孢子主要有分生孢子和孢囊孢子。
1、分生孢子(Conidium)2、孢囊孢子3、菌丝片段繁殖二、放线菌的群体特征1、在固体培养基上放线菌的菌落一般为圆型,表面光滑或有皱褶、毛状、绒状、或粉状,光学显微镜下观察,可见菌落周围有辐射状菌丝,菌落较小,类似细菌或略大于细菌,菌落形状随菌种不同而不同。