生命科学专用数据库

生命科学学院生物技术与应用系10基地班曾钰尧10350102

ISI Web of knowledge（综合性数据库，可查找文献）: /

Biosis:（通过ISI平台使用）

世界上最大的关于生命科学的文摘和索引数据库

Nature:/

Cell:/

Cliniweb:/xd/about/news_events/news/index.cfm

生物谷（收藏了大量数据库链接）：/bioline/biosite.htm

SDSPB：/main/c n/index.do（中文网站）

EMBL数据库：http://www.embl.de/

DDBJ数据库:http://www.ddbj.nig.ac.jp/

GSDB基因组序列数据库：/gsdb/gsdb.html（通过NCGR使用）

EBI数据库：/

EBI将SWISS-PROT和TrEMBL数据库合并，构成一个较全面的并且只有最低限度冗余的数据库

NRL-3D：已被PDB取代。

PDB（蛋白质数据库）：/pdb/home/home.do

NCBI（综合性数据库，可查找文献）：

以下是关于NCBI数据库内包涵的数据库集的介绍（/?p=20049）以下列出的数据库均可以通过NCBI使用.

GenBank数据库：/genbank/index.html（通过NCBI使用）

UniGene数据库：从属于GeneBank，试图通过计算机程序对GeneBank中的序列数据进行适当处理，剔除冗余部分，将同一基因的序列，包括EST序列片段搜集到一起，以便研究基因的转录图谱。

Entrez数据库：Entrez数据库是一个整合了多个数据库的综合检索系统，它包含了35个不同数据库的信息，共收录有超过350,000,000条记录

PubMed Central：PubMed Central是一个收录生命科学领域同行评审期刊（Peer Reviewed Journals）文献的数据库

Entrez Gene数据库：Entrez Gene数据库为用户提供基因序列注释和检索服务，收录了来自5300多个物种的430万条基因记录。

HomoloGene数据库HomoloGene数据库是一个在20种完全测序的真核生物基因组中自动检索同源基因的系统，包括直系同源与旁系同源。

Reference Sequences（RefSeq）数据库：Reference Sequences（RefSeq）数据库是一个收录注释过的非冗余转录体、蛋白质和基因组序列数据库。

基因型和表型数据库（dbGaP; /sites/entrez?db=gap）：

负责管理与可见特征（表型）相关的遗传特征（基因型）。

dbSNP数据库：（通过NCBI使用，需进入其FTP）

收录单核苷酸多态性信息

dbLRC数据库：全面收录白细胞受体复合物（LRC）等位基因信息，主要关注LRC中的KIR基因。

dbMHC数据库：有关主要组织相容性复合体（MHC）的数据库。

dbRBC数据库：收录与红细胞抗原或血型有关的基因及其序列信息。

OMIM：是Entrez的一个组成部分，主要收录人类基因和遗传病相关信息。

OMIA（动物在线孟德尔遗传）数据库：是一个有关动物（除了人类和小鼠）基因和遗传病的数据库。

GEO（基因表达精选集）：是一个储存高通量功能基因组学数据的数据库。

GENSA T：是有关小鼠中枢神经系统基因表达谱的数据库。

NCBI Probe database（探针数据库）：是一个公共的核酸试剂数据库，它可以提供试剂信息、销售厂家信息、探针有效性信息，还可以计算序列相似性。

MMDB数据库：收录了Protein Data Bank数据库中经试验验证过的数据信息，包括蛋白质结构域注释信息、与相关文献的链接信息、蛋白质和核酸序列信息、PDB异基因（PDB heterogens）信息、CDD中的保守结构域信息和经V AST算法计算出的结构邻域（structural neighbors）信息。

HIV-1/Human Protein Interaction Database（HIV-1/人类蛋白相互作用数据库）：

/RefSeq/HIVInteractions/index.html

用来记录HIV-1病毒蛋白和人类宿主细胞蛋白之间的相互作用。

dbEST数据库：/dbEST/

PubChem：是NIH设立分子图书馆以及开展研究小分子化学、结构和生物学特性工作的基础。